Documentos de Académico
Documentos de Profesional
Documentos de Cultura
MICROBIOLOGÍA
2º FARMACIA (GRADO)
Tema 1.- “Introducción”.........................................................................................3
Tema 2.-“Mutagénesis”…………………………………………………………10
2
Tema 1.-“ Introducción”:
3
-“Cepa o Clon”: población bacteriana que procede enteramente de una célula original,
en la que todas las células son genotípicamente idénticas.
Se puede asimilar al concepto de “colonia aislada”.
Flujo de información genética en las células:
El ADN tiene que pasar a la descendencia, las células se dividen mediante un
proceso de fisión binaria. Son idénticas. No se diferencia entre célula hija y célula
madre. Cada una tiene que recibir una copia del ADN → Replicación.
La Replicación la lleva a cabo una serie de enzimas, incluyendo la ADN-
Polimerasa.
ADN ADN
Replicación
ADN Polimerasa
Dentro de las células, los Genes se tienen que expresar para la síntesis de
Proteínas. Los genes se tienen que transcribir para dar lugar a ARNm, y este es
traducido en los ribosomas para dar lugar a la síntesis de Proteínas:
Replicación
ADN ADN
ADN-Pol.
Transcripción
ARN-Pol.
Traducción
PROTEÍNAS
En el Proceso de Replicación, la ADN-Polimerasa utiliza cómo molde una de
las cadenas de ADN para sintetizar la cadena complementaria a través de un mecanismo
conocido como “Horquilla de Replicación”. La descendencia recibe una copia del
cromosoma que contiene una cadena original y una cadena de nueva síntesis. Es un
proceso de Replicación Semiconservativa.
4
Origen
De
Replicación HORQUILLA DE
REPLICACIÓN
ADN ARNm
Transcripción
(ARN-Pol.)
5’ 3’
3’ 5’
5’ 3’
3’ 5’
5
El Código Genético es un código de tres letras a las que se denomina “Codones”
y cada uno de estos Codones codifica un aminoácido, un Gen es una secuencia de bases
nitrogenadas organizadas en tripletes (Codones).
-“Traducción”: lectura de los tripletes de la secuencia del mensajero, para dar lugar a
la síntesis de la cadena de aminoácidos que constituye la proteína.
Características del código genético:
- Es Universal: es compartido por todos los seres vivos.
Ej.: El Codón ATG (AUG en el mensajero) en el ADN codifica siempre Metionina en
virus, bacterias, hongos, plantas y animales.
Existen excepciones muy ligeras.
Ej.: En Mitocondrias y Cloroplastos, existen Codones que no tienen el mismo
significado para otros organismos.
- Es Degenerado: existen un total de 4 bases nitrogenadas (ATGC –
AUGC) y el código genético esta organizado en tripletes, si calculamos las
combinaciones posibles son 64. Es decir pueden codificar a 64 aminoácidos diferentes,
pero en la naturaleza sólo existen 20 aminoácidos diferentes, como consecuencia hay
más de un triplete que codifica para el mismo Aminoácido, y a este fenómeno se le
conoce cómo “Degeneración”.
Hay Tripletes con funciones específicas:
- Triplete de Iniciación: es el primer triplete del gen es ATG – AUG
(Metionina), pero puede haber tripletes ATG que no sean de
iniciación.
- Tripletes de terminación: no codifican ningún aminoácido, son tripletes
sin sentido
TAA; TAG; TGA Estos Tripletes cuando pasan por los Ribosomas, la maquinaria
UAA; UAG; UGA traduccional no es capaz de producir ningún aminoácido,
terminando así la traducción y liberando la cadena terminada.
6
1) En los Procariotas el cromosoma es único, compuesto por una doble cadena
circular y cerrada
2) Carece de Intrones.
INTRONES: son secuencias no codificantes, que interrumpen la pauta abierta de
lectura (PAL) de los genes Eucariotas.
Terminación
Natural
Iniciación
EXON INTRON EXON INTRON EXON
ATG TAA
TAC ATT
Se interrumpe
la PAL
Zonas Codificantes
Eucariotas
ATG TAA
TAC ATT
Iniciación Zona Codificante Terminación
Natural
7
- β-GALACTOSIDASA: rompe el disacárido, liberando Glucosa y
Galactosa.
- TRANSACETILASA: modifica la Galactosa de forma que puede ser
metabolizada, en otra ruta metabólica.
El OPERÓN-LAC agrupa los 3 genes que codifican estos 3 enzimas:
PROMOTOR
ATG TAA-ATG TAA-ATG TAA
TAC ATT-TAC ATT-TAC ATT
Triplete Terminador
Lactosa en el
Medio Triplete iniciación
OPERÓN-LAC
El que todos los genes de una vía metabólica estén juntos, y bajo el control de una
misma región reguladora, permite la expresión simultánea y equimolecular de todos los
genes que participan en dicha vía metabólica.
El PROMOTOR del OPERÓN-LAC se activa solamente cuando existe lactosa en el
medio de cultivo y cuando no existe glucosa, es decir, la expresión de estos genes sólo
ocurre cuando es necesario.
La presencia de Lactosa en el medio y la ausencia de glucosa, actúa sobre el
PROMOTOR que induce la expresión de los 3 genes a la vez, dando lugar a un único
mensajero, que codifica los 3 Enzimas, y que es POLICISTRÓNICO (codifica a más de
1 Proteína). Este mensajero es traducido, y da lugar a la síntesis de β-Galactosidasa,
Permeasa, Transacetilasa, de forma secuencial, desprendiéndose cada una de las
proteínas cuando la traducción alcanza su correspondiente triplete de terminación.
8
ARNm Policistrónico
TRADUCCIÓN
El Operón garantiza que el grupo de genes sólo se exprese cuando sea necesario, y
cuando lo hace, se expresan todos los genes a la vez y en la misma proporción, por tanto
es un sistema muy eficiente de regulación de la expresión génica, y es característica de
las células Procariotas.
La célula Eucariota no presenta esta organización, en el genoma Eucariota los
genes que forman parte de una misma vía metabólica no solamente no están juntos, sino
que pueden estar en cromosomas diferentes, por lo que la regulación de la expresión
génica es mucho más compleja.
9
Tema 2.- “Mutagénesis”:
“Mutantes Nutricionales”: son cepas que al contrario que las cepas salvajes de las que
proceden, necesitan de la presencia de un factor de crecimiento en el medio de cultivo.
Ej.: Mutaciones nutricionales que hacen que la cepa que las ha sufrido requiera la
presencia de un aminoácido, en el medio de cultivo (Leu, Lis, His, Ala).
La cepa que no crece, a menos que este aminoácido se encuentre en el medio de cultivo,
se dice que es una Cepa Auxótrofa para ese aminoácido.
10
Ej.: La Cepa Mutante auxótrofa para la leucina, mientras que la cepa silvestre o salvaje
de la que procede es protrótrofa para la leucina.
Los mutantes nutricionales han sufrido una mutación en uno de los genes que codifica
una de las enzimas que participan en la vía metabólica de la síntesis del factor de
crecimiento, por ejemplo en la vía metabólica de la síntesis de la Leucina”.
El mutante nutricional no sobreviviría en la naturaleza, la mayoría de las mutaciones de
este tipo no son viables, ya que el factor de crecimiento no se encuentra normalmente en
el habitat natural, las mutaciones suelen ser perjudiciales (“deletereas”).
Obtención de mutantes:
Tomamos un cultivo y lo sometemos a la acción de un mutágeno, por ejemplo
radiación ulravioleta o nitrosoguanidina, un mutageno químico, obteniendose mutantes
de todos los tipos a los que después tendremos que someter a un proceso de selección:
U.V.
CEPA SELECCIÓN
SALVAJE MUTANTES
11
Método de Réplica en Placa
Utilidad de los mutantes nutricionales: son herramientas básicas para estudiar la vía de
biosíntesis de un determinado metabolito, como puede ser un determinado amino ácido.
12
Mutantes resistentes a antibióticos y sustancias químicas:
La Cepa Mutante al contrario que la Cepa Salvaje, es capaz de resistir la acción
de un determinado antibiótico o sustancia química. En muchos casos la diana de los
antibióticos son Proteínas específicas, si una mutación afecta al gen que codifica la
proteína diana, el antibiótico dejará de ser efectivo, y la Cepa Mutante será resistente a
dicho antibiótico.
Obtención de mutantes resistentes:
MEDIO COMPLETO
Réplica en Placa
Réplica en Placa
MEDIO COMPLETO
+
ANTIBIÓTICO
13
Se utiliza de nuevo el Sistema de Réplica en Placa, se replica la placa con los mutantes
en una placa con medio completo, y otra réplica en una placa con medio completo y
antibiótico o agente químico añadido, y después de cultivar, los que crezcan en esta
segunda placa, serán los mutantes resistentes a ese antibiótico o agente químico.
Utilidad de los Mutantes Resistentes:
Estudiar específicamente las dianas, el mecanismo de acción del antibiótico, y
los mecanismos de resistencia frente al antibiótico o sustancia química, por parte del
microorganismo.
Este tipo de mutaciones son beneficiosas para el microorganismo, ya que le
permite sobrevivir a la acción de Quimioterápicos.
14
ante el calor, variando enormemente el rango de temperaturas a las que la Proteína es
estable, desnaturalizándose y dejando de ser funcional.
Ej.: CEPA
CEPA U.V MUTANTE
SALVAJE LETAL
CONDICIONAL
DNA Polimerasa
Estable a 60ºC DNA Polimerasa
Se desnaturaliza
a partir de 42ºC
(Por el cambio
de un
Aminoácido)
Réplica en Placa
Mutantes
Letales
Réplica en Placa Condicionales
Tª 42ºC
15
BASES MOLECULARES DE LAS MUTACIONES:
¿En qué consisten las mutaciones, a nivel de la secuencia de ADN?.
Se pueden dividir las mutaciones a este nivel en:
-Puntuales
-Delecciones e Inserciones
-Causadas por elementos móviles
Mutaciones Puntuales:
Aquellas que implican el cambio de una base por otra, en la secuencia del ADN.
Éstas a su vez pueden subdividirse en 3 subtipos según el efecto fenotípico:
Mutaciones Silenciosas: cambio de una base, sin dar lugar al cambio de
un aminoácido. Pueden ocurrir debido a que existe más de un triplete de bases que
codifica el mismo aminoácido por la degeneración del código genético:
Ej.: …..CGG ATC GGA ATC…. (Original)
Arg Ile Gly Ile
…..CGG ATC GGC ATC…. (Mutado)
Arg Ile Gly Ile
Cambio de base con cambio de aminoácido en la proteína Mutada:
Este cambio puede tener una mayor o menor repercusión, ya que todos los
aminoácidos no son igualmente importantes. Por ejemplo, si se cambia un aminoácido
del centro activo de un enzima, el enzima dejará de ser funcional. Si por el contrario el
aminoácido que cambia no se encuentra en una región importante para la función de la
proteína, esta seguirá siendo funcional. Pueden también darse casos intermedios, en los
que el cambio de aminoácido provoque un aumento de la sensibilidad de la proteína
ante la temperatura, por el cambio estructural producido, por lo que ante un aumento o
disminución de la temperatura, se produciría su desnaturalización, se trata de
Mutaciones Condicionales.
Ej.: a 37ºC el enzima funciona, pero con un aumento o una disminución significativa de
la temperatura el enzima dejará de ser funcional (Mutante Condicional), si además el
enzima es imprescindible, dará lugar a una Mutación Letal Condicional.
CGG ATC GGA ATG
Arg Ile Gly Ile
CGG ATC AGA ATG
Arg Ile Arg Ile
16
Cambio de base que da lugar a un Triplete de Terminación:
La mutación da lugar a una Proteína truncada, la traducción se para antes de
tiempo, y en el 99’9% de los casos la Proteína no será funcional, y por tanto la mutación
tendrá consecuencias fenotípicas.
Ej.: …..CGG ATC GGA ATC…..
….. Arg Ile Gly Ile …...
Delecciones o Inserciones:
Implica Quitar o Añadir 1 o más bases a la secuencia de ADN. Las Inserciones
y las Delecciones, siempre tienen consecuencias fenotípicas, porque suponen un
corrimiento de la pauta abierta de lectura, lo que dará lugar a una Proteína aberrante.
Consecuencia: el código genético, es un lenguaje que utiliza palabras de tres
letras, y hay una frase que lo representa perfectamente.
Ej.: UNO MAS UNO SON DOS → Proteína funcional y Correcta
UNO MAU NOS OND OS → Proteína aberrante, no tiene sentido.
Por ello las Inserciones y Delecciones, siempre tienen consecuencias fenotípicas.
17
“¿Cómo Revierten los diferentes tipos de mutaciones?”:
Mutación Puntual:
Revierte mediante otra mutación puntual.
Ej.: …..GGA…… (Cepa Salvaje)
…..Gly…….
Mutación (U.V.)
…..GCA…… (Cepa Mutante)
……Ala…….
Reversión (U.V.)
…..GGA….. (Cepa salvaje)
….. Gly ….. Vuelve al fenotipo original
La Reversión de las mutaciones puntuales, puede ocurrir de forma espontánea.
Mutaciones por Inserciones y Delecciones:
Una Inserción puede revertir mediante una Delección, y por el contrario una
Delección puede revertir mediante una Inserción. Pero este fenómeno ocurre raras
veces.
Mutaciones por elementos móviles:
Revierten de forma espontánea, en el momento que el Transposón salta, se
inutiliza el gen en el que se inserta, y cuando vuelve a saltar deja el gen intacto, tal
cómo se encontraba antes de la inserción del Transposón.
EJEMPLOS DE MUTÁGENOS:
“Mutágeno”: cualquier agente físico o químico, capaza de causar un cambio en la
secuencia de ADN. En seres superiores Mutágeno es equivalente a Carcinógeno.
Veremos únicamente dos ejemplos:
-Análogos de bases nitrogenadas
-Radiación U.V.
Análogos de bases nitrogenadas:
Se trata de compuestos químico, cuya molécula es muy similar a la de una base
nitrogenada.
Ej.: “5-BromoUracilo”: es un análogo de la Timina. La única diferencia que existe es
que en la posición 5 la Timina tiene un CH3 y el 5-BromoUracilo tiene un Br.
Si añadimos al medio de cultivo 5-BromoUracilo, la maquinaria de replicación
puede utilizarlo en lugar de la Timina.
18
Las mutaciones ocurren porque, a diferencia de la Timina, el 5-BromoUracilo
puede aparearse indistintamente con Guanina o con la Adenina.
1ºCiclo
GC GC
CG CG
GC Replicación GC
AT 5BU A5BU
GC GC
GC GC
2ºCiclo
GC GC
CG CG
GC Replicación GC
A5BU G5BU
GC GC
GC GC
3ºCiclo
GC GC
CG CG
GC Replicación GC
G5BU GC
GC GC
GC GC
/UV
…..AGCGGCCGGTTAGCAGA…..
…..TCGCCGGCCAATCGTCT…..
/Respuesta SOS
(1)
…..AGCG AGA…..
…..TCGCCGGCCAATCGTCT…..
/(2/3)
…..AGCGGCAGGTTAGCAGA…..
…..TCGCCGGCCAATCGTCT…..
/Replicación
19 …..AGCGGCAGGTTAGCAGA…..
…..TCGCCGTCCAATCGTCT…..
La energía de la radiación U.V. es utilizada por las 2 Timinas para formar un
enlace covalente adicional, lo que crea rigidez en la cadena del ADN, que dificulta la
separación de las cadenas para la replicación, y desencadena una serie de mecanismos
de Reparación:
El más importante es la repuesta S.O.S., en el que participan tres enzimas que
son necesarios para la reparación:
-ENDONUCLEASA: corta el ADN y lo degrada. Degrada toda la zona
de DNA del dímero de Timina, por lo que esa cadena del cromosoma queda
interrumpida.
-ADN POLIMERASA: no es la que participa en la replicación del
cromosoma, actúa rellenando rápidamente la zona, lo que aumenta la probabilidad de
error, dando lugar a mutaciones.
-LIGASA: une los extremos de la nueva secuencia sintetizada por la
ADN Polimerasa reparadora.
La Respuesta S.O.S. puede tener que reparar miles de Dímeros de Timina, ya
que la radiación U.V. puede afectar a un gran número de las Timinas adyacentes que
puedan existir en la secuencia del cromosoma. Las mutaciones puntuales producidas por
la radiación U.V. son consecuencia de los mecanismos de reparación. Son mutaciones
puntuales introducidas por la ADN Polimerasa de reparación, que es capaz de actuar
rápidamente pero con una baja fidelidad.
La probabilidad de mutación es muy elevada, debido a que el sistema S.O.S.
tiene que reparar un elevado número de Dímeros de Timina.
TEST DE AMES:
Es una aplicación práctica de un mutante bacteriano, y sirve para determinar el
poder mutagénico de una sustancia química. Básicamente sirve para determinar si una
sustancia problema es un mutágeno o no.
Tomando en consideración que Mutágeno es sinónimo de Carcinógeno, es
obligatoria la realización de este test en cualquier compuesto químico nuevo antes de su
comercialización.
Cada año se obtienen nuevos compuestos químicos que se utilizarán cómo
colorantes, fármacos, detergentes, aditivos etc, y antes de su comercialización es
necesario confirmar que no son potencialmente carcinogénicos.
Hasta la década de los 60 del siglo pasado, los ensayos de actividad mutagénica
de compuestos químicos se realizaban por exposición de animales de experimentación,
20
en un proceso que era largo y costoso. Para simplificar el ensayo “Bruce Ames”
desarrolló el Test que lleva su nombre en la década de los 70.
Fundamento del Test de Ames:
Consiste en utilizar una cepa mutante de “Salmonella typhimurium” que ha
sufrido una mutación puntual, que la hace AUXÓTROFA para Histidina. El Test
consiste en medir la Tasa de Reversión de la mutación histidina (-) en este mutante,
inducida por el compuesto químico que se está ensayando. Si el compuesto químico que
se está ensayando es un mutágeno, aumentará la tasa de reversión espontánea.
Para realizar el ensayo, se siembra el mutante histidina (-) en dos placas con
muy poca histidina, en las que el mutante no es capaz de crecer. Por tanto, lo único que
crecerá en esas placas son las colonias de revertientes espontáneos.
Se añade en el agar de las placas, o bien en discos de cartón en la superficie del
agar, el compuesto químico a ensayar, de forma que una de las placas sea el control
negativo y la otra contenga el compuesto químico a ensayar. Al cabo de 24 horas se
observa el número de colonias en cada placa. En la placa control aparecerán cierto
número de colonias, que corresponderá a revertientes espontáneas. Si en la segunda
placa aparece un número mucho mayor de revertientes, esto nos estará indicando que el
compuesto químico problema ha incrementado la tasa de reversión y es un Mutágeno.
21
Ventajas:
-Se puede realizar en 24 horas.
-Sólo son necesarios dos discos de
cartón, dos placas y la cepa Histidina (-), es
decir el coste se reduce a una ínfima parte
de lo que supondría un ensayo con
animales.
22
Tema 3.-“Recombinación genética en Bacterias”
“Transformación”
23
Esta es la primera barrera que debe salvar el ADN exógeno. Las secuencias
reconocidas por los enzimas de restricción pueden aparecer también en el ADN propio.
Sin embargo, el ADN propio no es degradado por el enzima de restricción porque las
dianas que reconoce han sido modificadas por un Enzima de Modificación. El ADN de
la bacteria está modificado de tal forma que no puede ser digerido por los Enzimas de
Restricción propios. La modificación consiste en una metilación de una de las bases
que forman parte de la diana reconocida por el Enzima de Restricción. El ADN propio
está protegido, mientras que el ADN exógeno no lo está y por tanto es digerido por los
Enzimas de Restricción. Cuando el ADN proviene de otra bacteria de la misma especie,
éste se encuentra modificado y protegido contra los enzimas de restricción de esa
especie y no va a ser degradado. Por ello la recombinación es más frecuente entre las
bacterias de la misma especie.
2. NECESIDAD DE HOMOLOGIA PARA INTEGRACIÓN DEL
ADN DE LA BACTERIA DONADORA EN LA BACTERIA ACEPTORA:
Para que se dé integración, verdadera recombinación de ADN exógeno en el
cromosoma de la bacteria receptora, tiene que haber Homología entre parte de la
secuencia del ADN exógeno y la secuencia de una región del ADN del cromosoma de la
bacteria receptora. Solamente en este caso se produce integración.
-“Marcador Genético”: carácter fenotípico, cuyo cambio nos permite saber que se ha
producido un fenómeno de recombinación.
TRANSFORMACIÓN:
Consiste en el paso de ADN libre de una célula a otra. Fue el primer fenómeno
de recombinación genética que se descubrió en bacterias. Fue el británico Fred Griffith,
quien trabajando con Streptococcus pneumoniae, lo describió por primera vez en 1928.
En aquella época se conocía de la existencia de dos tipos de cepas de S.pneumoniae:
- L-Lisas: Dan lugar a colonias lisas, son capsuladas y virulentas.
-R-Rugosas: Dan lugar a colonias rugosas, no capsuladas y no virulentas.
24
“Experimento de Griffith”: Consistía en inyectar en ratones una mezcla de células vivas
de S.pneumoniae de una cepa-R y células muertas de una cepa-L. Contra lo que cabía
esperar, los ratones morían y en el cultivo realizado a partir de muestras de los ratones
muertos se recuperaban únicamente células de la cepa L.
Cepa-R (Vivas)
+ RATONES R.I.P. Cepa-L
Cepa-L (Muertas)
A raíz de este experimento, Griffith publica estos resultados y dice que las
células-R vivas habían sufrido un fenómeno de TRANSFORMACIÓN. Griffith dedujo
que había algo, en los restos de las células-L muertas, que era el “Factor de
Transformación”. Hoy se sabe que eran los fragmentos de ADN de las Células-L
muertas, que contienen la información genética necesaria para que las células-R sean
capaces de sintetizar la cápsula, y por tanto adquirir virulencia, pero en 1928 ni siquiera
se sabía que la información genética se encontraba codificada en el ADN.
Avery, McLeod, y McCarty en 1944 demostraron que el ADN era el responsable
de la Transformación en el experimento de Griffith, demostrando por primera vez que
la información genética reside en el ADN. Griffith tuvo una enorme suerte ya que
existen muy pocas especies bacterianas que sufran el fenómeno de Transformación de
forma natural, entre ellas “S.pneumoniae”. A la capacidad de un microorganismo para
sufrir un proceso de transformación se le conoce como “Competencia”. El Marcador
Genético en el experimento de Griffith es la virulencia, que deriva de la presencia o
ausencia de la cápsula.
25
Las Proteínas REC, se encargan de llevar a cabo la hibridación, y se encargan tanto de
cortar y degradar el cromosoma propio, cómo de empalmar este cromosoma con el
ADN exógeno. Las Proteínas REC intervienen en todos los procesos de recombinación,
independientemente del mecanismo por el que se hayan producido.
26
Tema 4.- “Transducción”:
TRANSDUCCIÓN:
-“Transducción”: es el paso de ADN de una célula bacteriana a otra en el interior de
una partícula vírica. Fue descubierto por Zinder y Lederberg en la década de 1950.
-“Virus”: partícula submicroscópica que, en forma libre, carece de actividad
metabólica. Son parásitos intracelulares estrictos. Solamente pueden replicarse
utilizando la maquinaria biosintética de la célula hospedadora.
Composición de un virus:
-“Cápsida”: cubierta Proteica que contiene el ácido nucleico.
-“Ácido Nucleico”: se encuentra en el interior de la cápsida y es el genoma del
virus.
Ciclo Replicativo Bacteriofago (Virus Bacteriano):
1º. Unión de la partícula vírica a la superficie de la célula.
2º. Inyección del ácido nucleico.
3º. Multiplicación de la copia del Ácido Nucleico vírico.
CICLO LÍTICO 4º. Síntesis de Proteínas que forman la cápsida.
5º. Ensamblaje de las copias de Ácido Nucleico con las cápsidas.
6º. Partículas víricas maduras.
7º. Liberación por lisis de la célula bacteriana.
27
Cómo las cápsidas son específicas de especie, el fragmento de ADN será
transportado (transducido) a otra bacteria de la misma especie. Este proceso se conoce
como:
28
ATT (lugar de integración)
-Desintegración
Anómala
-Desintegración
Normal
GAL BIO
29
Tema 5.-“Conjugación”:
CONJUGACIÓN:
-“Conjugación”: es el proceso por el que se transfiere ADN de una bacteria donadora a
una receptora por contacto directo entre ambas. Para que este proceso sea posible, la
bacteria donadora ha de contener un Plásmido conjugativo. La conjugación bacteriana
fue descubierta por Lederberg y Tatum en 1946.
-“Plásmido”: molécula de ADN de doble cadena circular cerrada que puede replicarse
autónomamente, independientemente del cromosoma. Es cómo un cromosoma en
miniatura, con un tamaño mil veces más pequeño que el cromosoma de la célula.
Hay diferentes tipos de plásmidos:
-Plásmidos conjugativos.
-Plásmidos no conjugativos.
Los implicados en la conjugación son los plásmidos conjugativos.
Otra clasificación es:
-Plásmidos integrativos: los que, en un momento dado, pueden integrarse
en el cromosoma de la bacteria.
-Plásmidos no integrativos: plásmidos que nunca se integran.
Para que se dé el proceso de conjugación, la bacteria donadora tiene que
contener en su citoplasma un Plásmido conjugativo.
¿Cómo determinan las plásmidos conjugativos la transferencia de
información genética de una célula a otra por un proceso de conjugación?
El ejemplo mejor estudiado es el del “Factor F” en Escherichia coli
F+ F+
X +
F- F+
30
F+: Células de E.coli que contienen el factor F.
F-: Células E.coli que no contienen el factor F.
El cruce de células F+ de E.coli con células F- da lugar a dos células de E.coli ambas F+.
Los Plásmidos conjugativos pueden transmitirse de una célula a otra sin que la célula
donadora los pierda.
Los “Plásmidos conjugativos” se transmiten de forma “infecciosa” en las poblaciones
bacterianas; si introducimos una célula F+ en un cultivo F- de E.coli, al cabo del tiempo
todas las células del cultivo pasarán a ser F+.
Proceso de conjugación:
El Plásmido conjugativo contiene genes que codifican proteínas que son las que
intervienen en el proceso de Conjugación. Por ejemplo, en el caso de E.coli, las células
F+ son capaces de formar un apéndice específico que se denomina “Pili sexual”.
1º. Etapa: la célula F+ de E.coli se une a través del Pili sexual a una célula F-.
Pili sexual
Conjugación Bacteriana
2º. Etapa: el Pili sexual se retrae y las dos células quedan unidas a través de lo que
se conoce con el nombre de puente sexual. Puente sexual
31
3ª Etapa: implica la transferencia del Factor F. Esta transferencia ocurre a través
de un mecanismo que se conoce cómo “Mecanismo de círculo rodante”, que comienza
con la rotura de una de las cadenas del Factor F en un punto específico que se conoce
cómo “origen de transferencia” (ORIT). A partir del ORIT, la cadena que se ha roto
empieza a pasar a la célula receptora. Este proceso de transferencia está facilitado por la
ADN Polimerasa de la célula donadora y de la célula receptora. La ADN Polimerasa de
la célula donadora utiliza cómo molde la cadena intacta del Factor F para sintetizar una
cadena complementaria y, al avanzar, va desplazando a la cadena rota hacía la célula
receptora. Cuando esta cadena entra en la célula receptora la ADN Polimerasa de la
célula receptora la utiliza cómo molde para sintetizar una cadena complementaria.
Es un mecanismo que facilita la transferencia de la cadena de abierta de ADN
del factor F, tanto por desplazamiento de la ADN Polimerasa de la célula donadora
cómo por tracción de la ADN Polimerasa de la célula receptora.
ORI T
32
La transmisión de un plásmido conjugativo, como puede ser el factor F en
E.coli, no constituye en sí misma un proceso de recombinación genética, ya que no se
transmiten genes del cromosoma de la célula donadora.
33
completo de la bacteria donadora, incluyendo el Factor F. Sin embargo, en la práctica
no ocurre así. El puente sexual es bastante inestable, y para la transmisión de todo el
cromosoma serían necesarios más de 70 minutos y el puente sexual sólo es capaz de
mantener su integridad durante unos pocos minutos, permitiendo el paso de,
únicamente, un trozo del cromosoma de la célula donadora a la célula receptora.
* Factor F’ en E.coli:
Como ya hemos dicho, el Factor F es un plásmido conjugativo e integrativo. De igual
forma que se puede integrar en el cromosoma de la célula, puede desintegrarse del
mismo, lo que en el 99% de los casos ocurre de forma limpia. Sin embargo, en el 1% de
34
los casos el Factor F al desintegrarse se lleva consigo un trozo del cromosoma de la
célula, que será el que más próximo se encuentre al lugar de integración.
Cromosoma
Bacteriano
Factor F
“Proceso de SEXDUCCIÓN”
35
Tipos De Plásmidos:
Una vez visto el concepto de Plásmido y como los plásmidos conjugativos
intervienen en la recombinación genética, vamos a hablar, a modo de ejemplo, de tres
tipos de plásmidos (hay muchos más) clasificados de acuerdo con las características que
confieren a las células que los contienen:
36
Por tanto, cada Factor R contiene:
a) RTF
b) uno o varios Determinantes R.
R1
R1 Resistencia a Sulfamidas
R2 R2 Resistencia a Cloranfenicol
RTF
37
la misma especie que no contengan el mismo factor Bacteriocinogénico. Son proteínas
tóxicas, producidas por las bacterias para competir con bacterias de la misma especie.
Los Factores Bacteriocinogénicos contienen el gen que codifica la Bacteriocina y,
obligatoriamente, deben contener un gen que codifica el supresor de la Bacteriocina,
que es una proteína que inhibe la acción de la bacteriocina. De otra manera las células
que produjesen la bacteriocina serían las primeras en morir.
3) Plásmidos Toxigénicos:
Son Plásmidos que contienen genes que codifican proteínas de secreción que son
tóxicas para el ser humano. Los Plásmidos Toxigénicos son factores de virulencia.
Dentro de una misma especie bacteriana, aquellas cepas que contengan un Plásmido
Toxigénico serán virulentas, de lo contrario no lo serán. Un buen ejemplo de esto son las
cepas enterotoxigénicas de E.coli. E.coli es habitante habitual del intestino, por lo que
normalmente no es un microorganismo virulento, pero existen cepas que si que lo son,
algunas de ellas debido a la presencia de Plásmidos Toxigénicos que contienen genes
que codifican una enterotoxina muy potente que cuando se libera en la mucosa intestinal
da lugar a un cuadro diarreico.
38
Tema 6.-“Ingeniería Genética”
39
Extremos romos, por ejemplo SmaI
......CCCGGG....... ......CCC GGG........
......GGGCCC....... ......GGG CCC........
2 - Ligasas
Son enzimas que se encargan de unir los extremos del ADN digeridos por los enzimas
de restricción, cuando estos extremos son compatibles. Las que se utilizan son de origen
vírico (T4DNA ligase).
3- Vectores de clonación
Son plásmidos artificiales, compuestos de fragmentos de ADN de distinto origen y que
permiten que el fragmento de ADN exógeno que contiene el gen que nos interesa sea
estable y se exprese en las células que actúan como hospedadoras. Un vector de
clonación típico para E.coli, por ejemplo pUC18/pUC19, consta de cuatro elementos
básicos.
a) Un origen de replicación (ORI R). Es lo que le confiere al plásmido la capacidad de
replicación autonoma de forma que cada vez que la célula se divida, cada una de las
células resultantes reciba copias del plásmido. El ORI R más utilizado para E.coli es
el del factor colicinogénico Col E1.
b) Un marcador de resistencia, es decir, un gen que confiera resistencia a un
determinado antibiótico. La resistencia al antibiótico nos permitirá diferenciar las
células de E.coli que contengan el vector de las que no lo contengan. Normalmente
se utiliza el gen AMP que codifica una -lactamasa que confiere resistencia a
Ampicilina. Este gen se ha obtenido de un factor R.
40
c) Un marcador de selección. Normalmente el gen LACZ, que se obtiene del operón
lac. Este gen confiere, a las células que contienen el vector, actividad -
galactosidasa.
d) Un sitio múltiple de clonaje (SMC). Es una secuencia de ADN de unas 60bp,
introducida artificialmente en el centro del gen LACZ, sin interrumpir su secuencia
codificante, que consiste en las dianas de restricción para una serie de enzimas de
restricción. La particularidad del SMC es que estas dianas son únicas en el vector.
Es decir tratando el vector con cualquiera de estos enzimas de restricción lo único
que se hace es abrir, linearizar el vector. Es en este SMC donde se introducen los
fragmentos de ADN exógeno, se digiere el vector con un enzima de restricción y se
liga el vector con un fragmento de ADN exógeno digerido con el mismo enzima
para que tenga extremos compatibles. La introducción de este ADN exógeno en el
SMC implica la inactivación del gen LACZ, por lo que las células que contengan un
vector con inserto no tendrán actividad -galactosidasa.
A modo de anécdota, se puede decir que la ingeniería genética, la metodología del ADN
recombinante, nació en 1972 a partir de una reunión entre Stanley Cohen, de la
Universidad de Stanford, y Herbert Boyer, de la Universidad de California en San
Francisco. El grupo de Cohen estudiaba los plásmidos bacterianos y el de Boyer
trabajaba en la caracterización de los enzimas de restricción. En un congreso en
Honolulu, en 1972 ambos coincidieron y se dieron cuenta del potencial de combinar el
uso de los enzimas de restricción para cortar fragmentos de ADN, con los plásmidos
bacterianos, para poder introducir estos fragmentos de forma estable en bacterias. La
41
colaboración entre ambos grupos dio lugar al nacimiento de la metodología del ADN
recombinante.
Una vez descritas las herramientas básicas necesarias vamos a ver las etapas de la
clonación de un gen eucariota en Escherichia coli. El objetivo último de este proceso
es el aislamiento de una colonia de E.coli que contenga un vector de clonación que lleve
insertado en el SMC un gen eucariota concreto.
1- Aislamiento de los genes eucariotas. Puesto que los genes están en el ADN de los
cromosomas, podría por ejemplo aislarse ADN cromosómico y trocearlo utilizando
enzimas de restricción para dar lugar a fragmentos que podrían insertarse en
vectores de clonación abiertos con el mismo enzima. Esta aproximación no puede
utilizarse en la práctica por dos razones: i) el enzima de restricción reconoce dianas
específicas que están distribuidas al azar, por tanto puede cortar por la zona
codificante de los genes. ii) los genes eucariotas tienen intrones. Para que un gen
eucariota pueda expresarse en una célula procariota tiene que estar libre de intrones.
Lo que se hace en la práctica es purificar el ARNm de las células. La transcripción
en eucariotas da lugar a la síntesis de un pre-ARNm que contiene todavía intrones,
pero antes de que este pre-ARNm abandone el núcleo, sufre un procesamiento por
nucleásas específicas que eliminan los intrones para dar lugar a un ARNm maduro
sin intrones. Por tanto, se purifica este ARNm y se convierte en ADN de doble
cadena en el tubo de ensayo añadiéndole transcriptasa inversa. A estas moléculas de
ADN de doble cadena que proceden de moléculas de ARNm se les denomina ADNc
(c de copia). De esta forma se consigue una colección de ADNcs que representan la
secuencia codificante, libre de intrones, de los genes más expresados en las células
de las que se ha aislado el ARNm. Estos ADNcs tienen extremos romos.
2- El vector de clonación se digiere por el SMC con un enzima de restricción que deje
extremos romos (por ejemplo SmaI). Esto da lugar a una población de moléculas de
vector abiertas y dispuestas a ligarse con las moléculas de ADNc.
3- Ligación de las moléculas de vector con las moléculas de ADNc en tubo de ensayo
en una reacción catalizada por la ligasa. De esta forma se obtiene una colección de
miles de moléculas de vector que contiene cada una de ellas un ADNc (que
corresponde a un gen eucariota) distinto insertado en su SMC. También, muchas
42
moléculas de vector no atrapan ningún ADNc y simplemente se vuelven a
recircularizar por efecto de la ligasa.
4- Transformación en células de E.coli, mediante un método de transformación
artificial. Generalmente tratar las células con CaCl2 en frío y ponerlas luego en
contacto con el ADN. Una parte de las células serán transformadas con moléculas de
vector que lleven un ADNc como inserto, otra parte lo serán con moléculas de
vector vacías (sin inserto) y otra parte no se transformarán.
5- Selección. La finalidad de esta última etapa es aislar una colonia de E.coli que
contenga un vector que lleve como inserto la molécula de ADNc correspondiente al
gen que nos interesa. Esta colonia será un clon y por tanto habremos conseguido el
clonaje de un gen eucariota en E.coli. Esta etapa tiene tres fases.
5.1- Seleccionar transformantes de no transformantes. Esto se consigue sembrando en
placas que contengan Ampicilina después de la transformación. Los transformantes
(independientemente de que el vector que lleven dentro lleve inserto o no) crecerán
puesto que la presencia del vector confiere resistencia a la Ampicilina.
5.2- Seleccionar transformantes que contengan vectores con inserto de los que solo
contengan el vector religado. Esto se consigue sembrando en placas que contengan un
sustrato cromogénico de la -galactosidasa. El más popular es el conocido como X-
GAL, que cuando es procesado por la -galactosidasa da lugar a un producto de color
azul que precipita alrededor de las colonias. Las colonias que contengan un vector con
inserto no cambiaran de color, puesto que el inserto habrá inactivado la -galactosidasa
al introducirse en el MCS (como es lógico se utilizan cepas de E.coli en las que el
operón Lac esta inactivado), mientras que las colonias que contengan el vector religado
sin inserto serán azules por encontrarse el gen de la -galactosidasa intacto. Las
colonias que interesan son las blancas que contienen insertos. Estas colonias se pasan a
otras placas. Los pasos 5.1 y 5.2 se hacen conjuntamente sembrando en placas que
contengan Ampicilina y X-GAL.
5.3- Seleccionar el transformante que contenga un vector que lleve como inserto el
ADNc que corresponde al gen que estamos buscando. Para conseguir esto hay dos
posibilidades.
5.3.1. Utilizar anticuerpos específicos que reconozcan la proteína codificada por el gen
que estamos buscando. La condición para esto es que el gen se exprese en E.coli. La
técnica consiste en transferir las colonias a nitrocelulosa e incubar la replica en
43
nitrocelulosa con el anticuerpo específico marcado colorimétricamente o
radiactivamente. El anticuerpo marcará específicamente la colonia que contenga el
vector que lleve como inserto el gen que estamos buscando. La colonia, el clon, podrá
aislarse de la placa original.
5.3.2. Utilizar un fragmento de ADN (sonda) que corresponda al gen. Esta sonda,
marcada colorimétricamente o radiactivamente, hibridará específicamente con la
colonia que contenga el gen que estamos buscando. Para ello, como en el caso anterior,
se transfieren las colonias a membranas de nitrocelulosa y se incuban con la sonda. La
colonia que sea marcada podrá recuperarse en la placa original.
De esta forma se obtienen colonias (clones) de E.coli que contienen en su interior genes
eucariotas concretos, se dice que se ha "clonado un gen".
Este proceso que acabamos de describir es un proceso “clásico”, en uso hasta mediados
de la década de los 90 del siglo pasado. A partir de ese momento, los programas de
secuenciación sistemática permitieron determinar la secuencia completa de los
genomas de una gran variedad de organismos: virus, bacterias, levaduras, plantas y
animales, incluyendo la secuencia completa del genoma humano. La posibilidad de
conocer de antemano la secuencia del gen que se quiere clonar permitió que, antes de
terminar el siglo, la mayor parte de los procesos de clonaje se hiciesen amplificando los
genes específicos mediante reacción en cadena de la polimerasa (PCR), utilizando
cebadores sintéticos (primers), que hibridan con las zonas 5´y 3´del gen a clonar.
Cuando se trataba de clonar genes eucariotas (con intrones), normalmente se combinaba
una etapa de transcripción inversa con la amplificación con PCR (RTPCR). Finalmente,
en los últimos años, la técnica más utilizada, si se conoce la secuencia de gen a clonar,
consiste en sintetizar los genes “in vitro” en un proceso totalmente automatizado que
realizan maquinas de síntesis, con un precio de unos 50 céntimos de euro por base.
44
era suficiente para dar lugar a reacciones inmunológicas. A partir de 1982 se comenzó a
comercializar insulina humana recombinante producida en E.coli. Otro ejemplo es la
hormona del crecimiento humana. Se utiliza para tratar niños con enanismo hipofisário.
Hasta 1985 la poca que podía obtenerse se extraía de la hipófisis de cadáveres. Esto hizo
que muchos niños tratados desarrollaran enfermedad de Creutzfeld Jakob, por
contaminación de la hormona con priónes. A partir de este año se comercializa la
hormona del crecimiento humana recombinante obtenida en E.coli. Desaparece el riesgo
de contaminación por priónes y se pueden obtener cantidades ilimitadas. Otras
hormonas recombinantes comercializadas son los factores de crecimiento óseo y
epidérmico.
1.2. Moduladores del sistema inmune. Interferones (alfa, beta, gamma) todos los que se
utilizan en clínica son recombinantes. Lo mismo ocurre con las interleucinas (IL1, IL2,
IL3) y el factor necrosante de los tumores.
1.3. Proteínas sanguíneas. Por ejemplo el activador tisular del plasminógeno, que es una
proteína que disuelve trombos y que se puede utilizar en la prevención y tratamiento del
infarto de miocardio. Se comercializó en 1987. Otro ejemplo son los factores de
coagulación, VII, VIII y IX, comercializados ya en su mayor parte, al igual que la
eritropoyetina y la seroalbúmina.
45
4. Terapia génica. También lejos de lo que se puede considerar Microbiología aunque
hay virus que se pueden utilizar como vectores. Hay muchas enfermedades que se deben
a mutaciones a veces hereditarias que inactivan determinados genes. La terapia génica
consiste en reemplazar el gen defectuoso por un gen funcional para curar la enfermedad.
Para ello hay que conseguir hacer llegar los genes hasta las células, pueden utilizarse
por ejemplo retrovirus o adenovirus como vectores. La primera aplicación de este tipo
ocurrió en 1992, consiguiendo curar a dos niñas deficientes en Adenosina Desaminasa,
un enzima cuya carencia produce inmunodeficiencia.
46