Los genes son segmentos útiles del ADN El gen puede ser analizado desde 3 ángulos • El mendeliano • El molecular • El poblacional Nosotros enfocaremos el estudio del gen desde el ángulo “Molecular”
Prof. Gustavo Peralta
Definición de Gen: la secuencia de ADN cromosómico que contiene la información requerida para fabricar un ARN, que luego este ARN dará origen a una Proteína
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Esa porción útil de ADN tiene un lugar que se lo llama “Locus”. Al formar la cromatina un “lazo” corresponde un gen. Se estima que hay 100,000 genes; que eran el 10% de genoma, 13% de las secuencias únicas
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Prof. Gustavo Peralta No solamente los genes dan origen a ARN sino que se duplican y se reparten en células hijas con el fin de perpetuarse También constituyen entidades biológicas mediante el cual se transmite caracteres físicos Los genes con el tiempo acumulan mutaciones, muchas de ellas suelen ser perjudiciales y otras beneficiosas
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Prof. Gustavo Peralta Como el ADN se encuentra en el núcleo (excepto el ADN mitocondrial), y la síntesis proteica tiene lugar en el citoplasma, tiene que salir para producirse esto Para eso interviene un proceso en donde hay una molécula intermedia (ARNm) copia del ADN, una vez producida sale y se produce la síntesis proteica En el núcleo el ADN guía la síntesis de ARN En el citoplasma el ARNm dirige la síntesis de proteína
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Dogma central de la Biología
Transcripción
Traducción
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Prof. Gustavo Peralta Transcripción: copia literal de un original Traducción: escritura o expresión en un lenguaje de lo que antes ha sido escrito o expresado en otro Replicación: copia que reproduce con exactitud al original
Gen es una parte del ADN que genera un carácter
físico heredable, un gen da solo una clase de proteína. Hay ARNm que dan lugar a “poliproteinas” que son productos de que dan lugar a varias proteínas cada una determinante de un rasgo físico diferente
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Prof. Gustavo Peralta El transcripto primario esta integrado por intrones y exones
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La célula produce varios tipos de ARN • ARN mensajero • ARN de transferencia • ARN ribosómico La traducción se lleva acabo en el ribosoma que se encarga de ligar los aa, los ARNt actúan como adaptadores llevan a los distintos aa hacia el ribosoma en el orden marcado por el ARNm Existen tbn 2 tipos mas de ARN pequeños • ARNsc (citosol) forman parte de la PRS • ARNsn (nucleo): cumple un rol en el procesado de transcripto 1rio Ambos serian codificados por la Flia Alu Prof. Gustavo Peralta En síntesis… El genoma esta compuesto por los sgts tipos de GENES: los que determinan síntesis proteica, los que conducen la síntesis, los que guian la síntesis y los que dan lugar a pequeños ARN
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Cada aminoácido es codificado por un triplete de nucleótidos Un gen tiene información para generar un ARN o proteína, se dice que el gen codifica a uno de los 2, las traducciones trasladadas del ADN al ARN, del ARNm de este a la proteína son transmitidas por códigos A recordar: los ácidos nucleicos como las proteínas están constituidas por monómeros
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Si en el proceso de transmisión cada nucleótido representara una letra, el alfabeto que contiene el ADN y ARN seria de 4 letras nada mas, insuficiente para codificar los 20 aa que hay, la célula resolvió utilizando mezcla de 3 nucleótidos par codificar 1 aa 3 nucleótidos = 1 codón = 1 aminoácido Como hay 4 bases y 3 combinaciones posibles, el nro de tripletes es de 4³=64: 64 codones que se conocen como “Código genético”
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SEGUNDA BASE U C A G
UUUfenilalanina UCU serina UAU tirosina UGUcisteína U
UUC fenilalanina UCC serina UAC tirosina UGCcisteína C
U UUA leucina UCA serina UAA stop UGA stop A
UUG leucina UCG serina UAG stop UGG triptófano G
CUU leucina CCU prolina CAUhistidina CGUarginina U
CUC leucina CCC prolina CAChistidina CGCarginina C
C CUA leucina CCA prolina CAAglutamina CGAarginina A
CUG leucina CCG prolina CAGglutamina CGGarginina G
PRIMERA TERCERA BASE AUUisoleucina ACUtreonina AAUasparagina AGU serina U BASE
AUCisoleucina ACCtreonina AACasparagina AGC serina C
A AUAisoleucina ACAtreonina AAA lisina AGAarginina A
AUG metionina ACG treonina AAG lisina AGGarginina G
GUU valina GCUalanina GAUaspartato GGU glicina U
GUC valina GCCalanina GACaspartato GGC glicina C
G GUA valina GCAalanina GAAglutamato GGA glicina A Prof. Gustavo Peralta GUG valina GCGalanina GAGglutamato GGG glicina G Existen 61 codones para codificar los 20 tipos de aa Casi todos los codones(61 de 64) codifican aa Hay mas codones, entonces los aa pueden ser codificados por mas de un codón! Degeneración: aa codificados por mas de un codón Sinónimos: distintos codones que simbolizan a un aa
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Prof. Gustavo Peralta Solamente 2 aa no son “degenerados”: metionina y triptófano. Lo cual supone que hay codones que no tienen “sinonimia” con otros! UGG = Triptófano AUG = metionina Como 61 de 64 nomas codifican aa, los 3 restantes son señales de conclusión de síntesis proteica. Reciben el nombre de “codones de terminación” 1. UAA 2. UGA 3. UAG
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Entonces las instrucciones emanadas del código consisten en tripletes de nucleótidos de ADN, cuya secuencia determina la secuencia de codones en el ARN, que luego determina los aa. Debido a que parte de los transcriptos primarios existen tramos inútiles (intrones), estos no se hallan en la proteína.
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El gen posee varias partes “funcionales” Lo que vimos hasta ahora se trata del segmento “codificador”. Para que este segmento sea expresado es necesario que participen segmentos distintos a esta. Tales secuencias se dividen en 3 grupos: • Promotor: señala a partir de que nucleótido se debe comenzar a transcribirse, extremo 5’ del segmento codificador • Reguladoras: determina cuando y cuantas veces se transcribirá el gen, lejos del segmento codificador, hay amplificadores (+ mucho) e inhibidores. Cada gen suele tener varios de estos 2 • Secuencia de terminación: cerca del segmento 3’ del codificador, señala conclusión de transcripción Prof. Gustavo Peralta Regulador
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Prof. Gustavo Peralta Prof. Gustavo Peralta Composición de los genes Analizaremos los genes que codifican a los ARNm, a los ARNt y a los ARNr
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Estructura de los genes codificadores de ARNm
• Promotor: 2 elementos, secuencias denominadas
cajas; TATA y CAAT, situadas cerca del segmento codificador, la TATA unos 25 nucleótidos arriba del 1er nucleótido codificador y CAAT a 75 arriba del 1er nucleótido codificador (50 antes del TATA) • La secuencia común exhibida de la caja TATA es la TATAAAA; la CAAT suele ser GGCCAATCT, puede faltar uno de los 2 o ambos. En caso de ausencia de los 2 suele estar secuencia elevada de CG
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Promotor
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Reguladores Amplificadores o inhibidores, suelen estar en el extremo 5’, muuuy lejos del codificador (en miles de nucleótidos)
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Codificador Alternado entre intrones y exones, la mayoría de los genes de ARNm posee 60 intrones, pocos son los que no tienen.
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Secuencia de terminación No han sido identificadas, suele existir una secuencia compuesta por TTATTT, transcripta como AAUAAA, en el extremo 3’ del ARNm.
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Los genes que codifican a los ARNm constituyen copias únicas, la excepción son los genes de las “Histonas”, estos se hallan alineados uno detrás de otros, existen entre 20 a 50 copias de estos 5 histonas
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Estructura de los genes codificadores de ARN ribosómico 45s Los ribosomas se elaboran a partir de 2 subunidades de ARNr con proteínas. Existen 4 tipos de ARNr: 28S, 18S, 5,8S y 5S. Los 3 1ros derivan de un transcripto común: 45S. Entonces existen 2 genes codificadores de ARNr • 45S: 28S, 18S, 5,8S • 5S: 5S
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De este gen (45S) existen 200 copias, una detrás de otra, separadas por ADN espaciador. Estos genes se encuentran en las constricciones secundarias de cromosomas acrocentricos, en el nucléolo, dentro de cada copia hay espacios de ADN que separan cada ARNr, estos ADN espaciador son eliminados
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• Promotor: secuencia de 70 nucleótidos, 20 de ellos son los 1ros del codificador. 50 nucleótidos quedan “Antes” del codificador • Regulador: actua como amplificador, son 100 bases, se encuentra a 50 del promotor o 100 del codificador • Codificador: genera al 45S, que dara origen a los demás, tiene tramos espaciadores, no se habla de intrones ni exones • Secuencia de terminación: extremo 3’ del gen, 2000 nucleótidos después del segmento que codifica al ARNr 28S, tiene varias T
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TTTTTTTT PROMOTOR -200 -100 -50 +20
5’ 3’
REGULADOR CODIFICADOR
+1
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Estructura del gen codificador de ARNr 5S • Existen 2000 copias, una tras otra a lo largo del cromosoma, alternándose entre ADN espaciador, ninguna de sus copias están en el nucléolo • Promotor: se encuentra en el medio del codificador • Ademas hay una secuencia fuera del codificador, no se sabe si es reguladora o forma parte del promotor • Secuencia de terminación: extremo 3’, presenta varias T
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PROMOTOR TTTTTT
5’ 3’
CODIFICADOR
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Estructura de genes codificadores de ARNt Existen entre 10 a 100 copias cada uno en los diferentes genes que codifican a los distintos tipos de ARNt. El “Promotor” esta constituido por 2 secuencias separadas ambas en medio del segmento codificador, entonces el promotor tbn se transcribe. No se han descrito secuencias reguladoras Algunos de estos genes presentan 1 intron, por consiguiente 2 exones. La secuencia de terminación son varias T.