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ELECTROFORESIS
Consiste en la separación de macromoléculas en un campo eléctrico. Se están explotando las
características de carga que tienen las macromoléculas. Se separan fragmentos de ácido nucleico
de diferente tamaño.
En este caso, cualquier ácido nucleico (de cualquier tamaño) tiene carga neta negativa (tienen un
grupo fosfato libre en el extremo 5', lo que le da la carga negativa).
Al existir un campo eléctrico, los electrodos están separados para que los electrones comiencen a
migrar al momento de pasar corriente eléctrica. Cercano a donde se deposita la muestra se encuentra
el electrodo negativo y lejano (en el otro extremo) está el electrodo positivo.
Al estar las moléculas de carga negativa cercanas al polo negativa habrá repulsión (las va a empujar
al lado contrario) y el polo positivo jala a las macromoléculas a su cercanía (movimiento
unidireccional, de donde se deposita la muestra al otro extremo del gel)
Gel de agarosa/poliacrilamida: Genera una malla tridimensional con poros en diferentes
direcciones y en diferentes planos. Cuando las macromoléculas migran, atraviesan esos poros. La
molécula presenta una torsión flexionando ligeramente la cadena de ácido nucleico para cada uno
de los poros para poder desplazarse. Sigue el camino de los poros irregulares (de diferente tamaño y
forma)
La torsión depende del tamaño de las macromoléculas
Entre más grandes sean las macromoléculas, mayor dificultad para tener ese plegamiento y
adaptación para dirigirse al nuevo poro. Tienen un tránsito lento y están en la parte superior
del gel, se retienen. Friccionan con la malla.
Entre más pequeñas, mayor flexibilidad y más rápido redirigen su camino, migración más
fluida. Se encuentran en la parte inferior del gel, no friccionan con la malla.
Todo esto es para visualizar los amplicones obtenidos por PCR (se observa como una banda
intensa de material genético aglutinada en una parte muy estrecha del gel)
DETERMINACIÓN DEL SEXO (ORGANISMOS UNICELULARES)
En organismos unicelulares que tienen reproducción sexual, existe un dimorfismo sexual (no se ve a
simple vista).
Sexo: A y α. (ej: saccharomyces)
El dimorfismo en estas células son dos alelos diferentes para dos genes:
Sox9: Presente en el cromosoma 11, codifica para el desarrollo del sexo masculino
(encargado de producir testosterona)
WT1: Presente en el cromosoma 9. Es un factor de represión para genes en X que producen
estrógenos.
Depende de la hormona que se acumule, se establecerá el sexo.
Hermafroditismo: Hay vestigios de ambos sexos, no hay especificación de uno u otro. No producen
gametos.
ABERRACIONES CROMOSÓMICAS EN EL PAR CROMOSÓMICO SEXUAL
En estos cromosomas, se presentan aneuploidías, no hay euploidías.
Cromosomas convencionales: XX/XY
X0 → Monosomía Y0 → Incompatible con la vida (no se ha visto)
Biparental: Las células A y α al combinarse, ponen sus mitocondrias para el fenotipo. Los
dos parentales ponen mitocondrias.
Uniparental: El ADN mitocondrial es únicamente dado por el óvulo. En nuestra especie, lo
dona un solo parental.
Las mutaciones mitocondriales son frecuentes. Si se cruzan individuos con mitocondrias dañados y
uno con mitocondrias sanas (normal X petit):
Material genético del núcleo: Si se daña, se puede reparar (se regenera a wild type)
Material genético extranuclear: Si se dañan, se generan mutaciones y no se reparan (hay
daño permanente)
Las mitocondrias tienen aproximadamente 80 copias del DNA mitocondrial. Por lo tanto, el
impacto de esa acumulación de mutaciones será mínimo y poco notable en el fenotipo gracias a la
gran cantidad de mitocondrias en el cuerpo (cambios en el genoma mitocondrial)
*En organismos unicelulares sí se aprecia la mutación y los cambios en el genoma mitocondrial.
Los radicales libres son clave para el envejecimiento.
Una alta cantidad de radicales libres de oxígeno provoca daños a las mitocondrias de los
espermatozoides lo que provoca que no se puedan mover, por lo tanto, hay infertilidad (este daño
puede ser reversible)
La mitocondria no tiene un sistema de reparación. Altas probabilidades de que mute el DNA
mitocondrial.
PATÓGENOS HEREDABLES
Algunos patógenos pueden ser heredables. No cualquier patógeno se hereda como herencia
infecciosa. Tiene la intención de cambiar al fenotipo.
Son patrones de herencia extranucleares
Cambian el fenotipo del sistema
Parmesium (protozoario de vida libre): Organismo ciliado común en aguas de panteón.
Organismo eucariote de 4 núcleos, algunos están infectados con virus.
Paramecina: Toxina que infecta a otros paramecios. Se produce gracias los corpúsculos Kapa.
Resulta agresiva para otros Parmesium
EFECTO MATERNO
Impacto en el fenotipo de los RNAs de vida media larga cuando los aporta la mamá en el
organismo. Cambio en el fenotipo por elementos citoplasmáticos,
Heterocigoto materno: SIEMPRE van a haber alelos dominantes.
Heterocigoto paterno: 50% dominante y 50% recesivo. Va a ser recesivo debido a que el producto
del alelo dominante se queda como RNA en el citoplasma.
Mecanismos de transferencia horizontal de genes
Transformación
Adquiere material genético del exterior. Alternativa de las bacterias para tener variabilidad genética.
“canibalismo” de otras bacterias.
* Un fragmento de ADN de una bacteria muerta y degradada ingresa a una bacteria receptora
competente y se intercambia por un trozo de ADN de su receptor. Una célula bacteriana toma ADN
del ambiente libre
Transducción
Paso de material genético por medio de un bacteriófago. Se da entre virus. Tienen que ser
filogenéticamente parecidos.
*Intercambio de información entre dos bacterias mediante un bacteriófago. Designa el proceso
mediante el cual el ADN exógeno es introducido en una célula mediante un vector viral.
Es el resultado de 2 organismos con cambio en su genoma.
Conjugación
Ocurre cuando un plásmido (bacterias +) atrae a otras bacterias (bacterias -) para el intercambio de
material genético, por el contacto célula-célula. Está codificada por plásmidos (una bacteria donante
con plásmido a una receptora que no)
Es muy restringido.
AGENTES MUTAGENICOS
Agentes mutagénicos dentro de la célula (intracelulares): DNA polimerasa, tautomerismo de
bases nitrogenadas, oxidación, desaminación y depurinización.
DNA POLIMERASA
La DNA polimerasa tiene un rango de error alto. Cuando se equivoca, se producen mutaciones sin
causar daños a la célula o al DNA.
Principal agente mutagénico (Rango de error 10 9-1010), puede generar 3 errores en la replicación del
genoma.
Sistema: Coloca un nucleótido y vuelve. Avanza un lugar y regresa para verificar si todo está
correcto. Si coloca el nucleótido incorrecto, el movimiento retrógrado será más difícil
3´-5´exonucleasa: Corta los extremos del ácido nucleico de 3’-5’
Actividad editora (Proof Reading)
Hay 5 tipos de DNA polimerasa en eucariontes
Actividad promutagenica:
Común en bacterias, ya que las mutaciones son su única fuente de variabilidad genética. No tiene
actividad editora, solo catalítica.
TAUTOMERISMO DE BASES NITROGENADAS
Capacidad de formar diferentes especies químicas en solución acuosa. Nuestro sistema biológico
está hecho a base de agua.
Tautomerismo: Los hidrógenos se pueden pegar al nitrógeno de las bases nitrogenadas (en
ambiente acuoso) y esto afecta a los puentes de hidrógeno
Estado anhidro → Forma ceto
Estado acuoso → Forma enol
Se forman apareamientos aberrantes T/A-G
OXIDACIÓN/DESAMINACIÓN también generan malos apareamientos.
DEPURINIZACIÓN
Eliminación de purinas. Un pH ácido destruye el enlace glicosídico de bases a la cadena. Se
eliminan bases de la cadena, lo que produce un estancamiento de replicación cuando entra la
DNA polimerasa.
Cuando no están las bases, se recluta de forma aleatoria los nucleótidos en donde están los sitios
vaciós.
Cuando hay un sitio apurínico, hay 75% de probabilidad de insertar una mutación, ya que solo 1 de
4 bases será la correcta.
Agentes mutagénicos extranucleares: Análogos de bases, agentes alquilantes, agentes
intercaladores y luz UV
ANÁLOGOS DE BASES
Parecen bases, pero no se comportan como ellas. Son sintetizadas por el mismo sistema con el afán
de dañar (un patógeno o entre nosotros). No tienen tautomerismo.
TE AMOOOOO <3
Yo massss <3