Marcadores moleculares

Un marcador es un carácter indicador.

Un gen de localización y efectos

conocidos que se utiliza por ejemplo
para seguir la herencia de otros genes
Marcadores cuya localización exacta aún no se
conoce.
 Gen, u otro fragmento de ADN
cuyas propiedades y a veces su
posición cromosómica, se
conocen.

Marcadores Se puede utilizar para identificar

genéticos células y organismos
particulares, o como punto de
referencia en experimentos de
cartografiado genético.
 Marcadores morfológicos
Color de capa

Ausencia/presencia de cuernos

Medidas esqueléticas
 Marcadores morfológicos

Color de grano
Forma de espiga

Albinismo
 Marcadores morfológicos

Albinismo

Pico de viuda Hoyuelo barbilla

Color de la
capa: base
genética
mutación
mshr: color
negro/rojo
 Polimorfismos de proteínas no enzimáticas;
variantes fisiológicas de determinadas proteínas
estructurales (revelados mediante electroforesis).

Isoenzimas o aloenzimas: formas moleculares de

una enzima con actividad catalítica común
(revelados mediante electroforesis o reacciones
de actividad enzimática).
Tipos de
marcadores Antígenos de superficie celular: polimorfismos de
proteicos los grupos sanguíneos y antígenos leucocitarios
(revelados mediante técnicas serológicas).
 ISOENZIMAS

• Las isoenzimas son distintas formas moleculares de una misma enzima que
presentan especificidad por el mismo sustrato.
• Las diferentes formas moleculares se distinguen por su peso molecular o por
su carga eléctrica.
 ISOENZIMAS

Patrones electroforéticos de Peptidadsa (PEP)

de músculo cardíaco de visón americano.

Fig 1.‐ Patrones de Peptidasa de músculo cardíaco de visón

americano. 1. Homocigoto para variante rápida F), 2 y 5.
Homocigotos para variante lenta (S), 3, 4 y 6 Heterocigotos FS.
La Peptidasa S no muestra variabilidad.
Polimorfismos proteicos
 Grupos sanguíneos
• Los glóbulos rojos de los animales presentan una serie de
antígenos en su superficie celular
• Estos antígenos son polimórficos y corresponden a diferentes
series alélicas en una serie de loci denominados como grupos
sanguíneos
• La determinación y el uso de estos polimorfismos como
marcadores genéticos de elección en humanos y animales ha
sido muy extensa desde 1902 hasta casi finales del siglo XX
 Sistema ABO
• Caracterizado por tres alelos lA, lB y l0
• A y B son codominantes mientras que 0 es recesivo y existen 4 fenotipos: A, B, AB y
0.
• La importancia transfusional de estos antígenos radica en que los individuos de un
grupo sintetizan anticuerpos frente a los oligosacáridos que no están en los
hematies.
• Estos anticuerpos, que se denominan isoaglutininas y que suelen ser IgM,
aparecen en grandes cantidades en circulación sin necesidad de exposición previa
a sangre de otros grupos. La razón parece estar en la reactividad cruzada de
sustancias presentes en bacterias de la flora intestinal
 Marcador molecular

Son fragmentos de ADN que manifiestan polimorfismo y que son heredables

¿Cómo se obtiene un
marcador genético?
Cariotipo Ovis aries
Ubicación del
cromosoma
portador del gen
de interés

2n= 54 Identificación de la región del

Identificación de
cromosoma donde se
los alelos
(variantes) del encuentra el gen
gen y establecer
Estudio de la
grados de
asociación de secuencia del gen de
cada alelo con el interés
carácter
evaluado
 Marcadores de ADN
• Se denominan en función de las técnicas que permiten visualizar
el polimorfismo del ADN.

• Marcadores de ADN más utilizados:

➢ Polimorfismos de la longitud de los fragmentos de restricción (RFLP).
➢ Minisatélites.
➢Microsatélites .
➢AFLP; RAPDs (plantas).
➢Polimorfismos de conformación de la cadena sencilla (SSCP) SNPs.
RAPD ( Random Amplified Polimorphism DNA)

Polimorfismo
de secuencia
en el sitio del
cebador
• Amplificación al azar de partes del genoma (utilización de primers universales
cortos al azar , 8 a 10 pb).
• Los polimorfismos son detectables sólo en donde no hay amplificación.
• Permite amplificar fragmentos entre 200 a 2000 pb.
 Microsatélites
Son secuencias simples repetidas en tándem (una detrás de otra) a
nivel del ADN sin función conocida y extremadamente variables.
Se repiten en tándem generalmente de 5 a 20 repeticiones.
También son conocidas como SSR ( Simple Sequence Repeats)
 SNP
(Single Nucleotide
Polymorphorphisms)

• Variaciones de la secuencia de ADN que

ocurre cuando se altera un nucleótido.
• Frecuencia elevada (1 cada 1000 bases en
el genoma humano)
• Se pueden identificar por PCR, “Real Time
PCR”, etc
 ● En un genoma animal hay un promedio de cerca de
2.300.000 SNPs (Brown 1999).
● El número de SNPs analizables por cada análisis ha ido
creciendo, pasando de los 15-20 marcadores por
ensayo/día de la técnica de primer extension, hasta los
50.000 SNPs simultáneos con las plataformas de Deep
Genotyping de Illumina y AffimetriХ.
Mapeo
Comparado

• Localización de genes
homólogos en especies distintas

• ¿Por qué?

• Comprensión de la evolución de
las diferentes especies

• Extrapolación de la información
genética de una especie a otra
cercana evolutivamente
 • Todos los mamíferos
existentes actualmente
conservan el mismo grupo
de genes heredados de un
“ancestro” común
• La distribución de estos
genes en los cromosomas
es muy diversa (diversidad
de cariotipos) con lo que a
lo largo del período
evolutivo han ocurrido
muchas reordenaciones

Premisas
Retos del Mapeo
comparado
▪ Establecer la homología de los genes:

– Genes Ortólogos
Misma función en especies diferentes

– Genes Parálogos
Familias génicas dentro de una especie

▪ Mapeo de genes en especies próximas

filogenéticamente (RUMIANTES)
Tipo de marcadores para el mapeo
comparado

• Tipo 1: Muy conservados entre especies.

Normalmente se trata de genes que codifican
para proteínas y no suelen ser muy
polimórficas.

• Tipo2. Marcadores muy polimórficos.

Suelen ser segmentos no codificantes y poco
conservados entre las especies.
Métodos utilizados en el mapeo
comparado

• ZooFISH (interspecific chromosome painting)

• Células somáticas híbridas
• Híbridos de radiación
• Análisis de ligamiento
- Retrocruzamiento con híbridos interespecíficos.
Chromosome painting
Aplicaciones

• •Estudio de anormalidades cromosómicas:

citogenética clínica.
• Detección de micro-reordenaciones cromosómicas
• Genética del cáncer: multiple ‘paints’ • SKY:
Cariotipo espectral
• Estudio del cariotipo completo en un único paso.
 Spectral
karyotypin
g
Chromoso
me
painting
and cancer
En espermatozoides está
indicado para hombres
con un cariotipo
somático anormal o
meiótico , así como
aquellos
con oligozoospermia, ya
que aproximadamente el
50% de los hombres
oligozoospermicos
tienen una mayor tasa de
anomalías cromosómicas
de esperma. El análisis de
los cromosomas 21, X, y Y
es suficiente para
identificar a los
individuos
oligozoospermicos en
riesgo.
 Muy útil en el
Primates
análisis de especies Bóvidos
relacionadas Équidos
filogenéticamente.

Zoo-FISH inter-
específico Humano &
Estudio de vacuno/cerdo

comparative evolución más Primates &

marsupial
alejada
chromosome Aves &
mamíferos

painting
● Use of human chromosome 17 probe on cattle chromosomes
Posible cariotipo ancestral de cetartiodáctilo y similitud
con cariotipo humano

•DOI:
•10.13187/ejmb.2015.9.118CrossRef
 Painting
cromosoma 1
humano con
otras especies
Painting camello-humano

•DOI:
•10.13187/ejmb.2015.9.118CrossRef
Mapa cromosómico comparativo entre cerdo, humano,
vacuno y camello

•DOI:
•10.13187/ejmb.2015.9.118CrossRef