04/05/2022

Departamento de Ciencias Básicas

Biología Celular

Proteínas

Natalia Moreno Castellanos

MsC, PhD Biomedicina

Las proteínas

Constituyen las unidades estructurales a partir de

las cuales se ensamblan las células (Representan
2
la mayor parte de su masa seca)

Porcentaje de proteínas

3 1
3
 04/05/2022

Funciones

 Forma y estructura
 Catalítica
 Canales transportadores
 Mensajes entre células
 Receptoras
 Motoras
 Defensa
 Deposito
 Reguladoras génicas

Ejemplos
Las proteínas realizan diferentes actividades-porque pueden formar gran variedad de estructuras.
Mantener el orden y la complejidad de los seres vivos-función específica

Luciferina Hemoglobina Queratina

Los aminoácidos aa
Grupo carboxilo

Grupo amino Hidrógeno

Metionina

Grupo radical (R) Valina

Glicina

2
6
 04/05/2022

Los 20 aminoácidos (aa)

Esenciales No esenciales
Isoleucina (Ile) Alanina (Ala)
Leucina (Leu) Tirosina (Tyr)
Lisina (Lys) Aspartato (Asp)
Metionina (Met) Cisteína (Cys)
Fenilalanina (Phe) Glutamato (Glu)
Treonina (Thr) Glutamina (Gln)
Triptófano (Trp) Glicina (Gly)
Valina (Val) Prolina (Pro)
Histidina (His) Serina (Ser)
Arginina (Arg) Asparagina (Asn)

Los aminoácidos esenciales son aquellos que el

propio organismo no puede sintetizar por sí mismo
7

Los 20 aminoácidos (aa)

Forma molecular

Forma iónica
8

Características de los aminoácidos (aa)

 Bajo peso molecular
 Solubles en H2O
 Cristalizables (por el grupo COO y NH3) los iones pueden formar
enlaces hasta convertirse en cristales.
 Por su estructura (diferentes enlaces químicos-determina estructura
y función de las proteínas)
 Actividad óptica (desvían los rayos de actividad polarizada).
 Anfóteros (equilibrio de ionización entre NH3+ y COO-,
dependiente del pH)
 El Cα es asimétrico: isomeria o esteroisomeria espacial.

9 3
9
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pH ácido pH básico

Los aa modificaran su carácter anfótero dependiendo del ph al que se encuentren

10

10

Esteroisomería en los “aa”

L-alanina D-alanina
11

11

Síntesis de proteínas

12 4
12
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Código genético

Los aa se forman por la unión de 3 nucleótidos-se lee con el código genético y esos codones o
13 tripletes dan lugar a los aa

13

Del grupo radical

14

14

“aa” no polares (hidrofóbicos)

-No forman
puentes de
hidrógeno

Glicina Alanina Valina

Leucina Isoleucina Metionina

15
Deben su hidrofobicidad al tamaño de la cadena lateral, entre más grande la cadena
lateral más hidrofóbico será
5
15
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“aa” no polares

Prolina

Fenilalanina
Triptófano

16

16

“AA” Polar con R no cargado o sin

carga

Serina
Treonina Cisteína

Tirosina

Todos éstos pueden formar puentes de Aspargina

hidrógeno, son polares pero no generan carga Glutamina

17

17

“AA” con R positivo o básicos

Cadena lateral con carga positiva: pueden cargarse positivamente

Histidina
Lisina
Arginina

18 6
18
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“AA” polares con R negativo o ácidos

Tienen carga negativa en su grupo R

Ácido aspártico

Ácido Glutámico

19

19

Péptidos y proteínas

Moléculas formadas por la unión de varios

Péptidos aminoácidos mediante enlaces peptídicos

Son moléculas formadas por la unión

Oligopéptidos de no más de diez aminoácidos

Formados por la unión de más diez

Polipéptidos aminoácidos

Formados por la unión de más de 10 aminoácidos y

Proteínas tiene una funcionalidad
(el tamaño de una proteína se expresa en Daltons-1
unidad de masa atómica)
20

20

Proteínas
Macromoléculas formadas por la union de monomeros
(amino ácidos) a traves de enlaces químicos

Growing polymer

Polymerization
(bonding together
of monomers)

21 7
21
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Proteínas
Polimerización
Requiere energía
No es espontáneo
Los monómeros se polimerizan a través de
reacciones de condensación (deshidratación)
Al ocurrir la condensación, se libera una molécula
de agua.

La hidrólisis es la reacción inversa-rompe polímeros

al agregar una molécula de agua.

22

22

(a) Condensation reaction:

monomer in, water out

(Water)

(b) Hydrolysis:
water in, monomer out (Water)

23

23

Enlaces peptídicos

Las proteínas tendrán

flexibilidad debido a la La pareja de e-
presencia de los compartidos-enlace doble
carbonos quirales que parcial

24
posee cada aminoácidos
8
24
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Uniones peptídicas
Grupo amino terminal y al grupo carboxilo terminal hace que los péptidos y las proteínas conserven las
propiedades anfóteras de los aa

Amino terminal Carboxilo

terminal

25

25

(a) Peptide chain

Amino acids joined by peptide bond
N-terminus C-terminus
Peptide-
bonded
backbone

Amino Carboxyl
group group
Side chains

(b) Numbering system

N-terminus C-terminus

1 2 3 4 5 6 7 8

BLAST Animation: Building Proteins

26

26

Características de las proteínas

 Dentro del polipéptido, los enlaces peptídicos forman una
columna vertebral con tres características:
Orientación del grupo R
 Las cadenas laterales pueden interactuar entre sí o con
el agua.
Direccionalidad
 El grupo amino libre, a la izquierda, se llama N-terminal
 El grupo carboxilo libre, a la derecha, se llama C-terminal
Flexibilidad
 Los enlaces simples a ambos lados del enlace peptídico
pueden rotar
 Estos enlaces hacen que toda la estructura sea flexible.
27 9
27
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Amino
group One of the nine
amino acids in Carboxyl
this peptide group

Peptide
bond

Peptides flex because groups on

either side of each peptide bond
can rotate about their single bonds

28

28

Enlaces hidrógeno

29

29

Plegamiento de las proteínas

30 10
30
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Figure 3.8

(a) TATA box–binding protein (b) Porin (c) Trypsin

Saddle-shaped; Doughnut-shaped; Globular;
binds DNA forms a pore binds Target
substrates peptide

DNA

(d) Collagen Fibrous; provides structural support

Triple strands

31

Estructuras de las proteínas

32

32

Estructura primaria

Aminoácidos

Es la secuencia de aa de una cadena polipeptídica, es

especificada por la información genética
Es la disposición covalente lineal
33 11
33
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Estructura primaria
Aminoácidos

Carboxilo
Amino terminal terminal

Es la secuencia de aa de una cadena polipeptídica, es especificada

34 por la información genética

34

Diagrama Ramachandrán
Sólo para algunos valores
de psi y fi, las estructuras
secundarias son estables.
Combinaciones de
ángulos que eran
estables.
Entre más azul mayor
estabilidad.
Si no hay estabilidad no
son seleccionadas como
proteínas posibles

35

35

Estructura secundaria
-Estructuras estables que se mantienen unidas por puentes de
hidrógeno e involucran patrones estructurales repetitivos
-Nivel de organización mas alto que la primaria
-Depende de la secuencia de aa que la conforma
- Puede tener diferentes conformaciones las cuales están
dictadas por la rigidez del enlace peptídico.
- -Un polipéptido puede adoptar varios tipos de estructura
secundaria
- Gracias a la capacidad de giro de los enlaces móviles e
interacción de los radicales de los aa entre sí puede formar una
estructura helicoidal-
- Se pliega de la forma más favorable desde el punto de vista
energético para evitar las repulsiones electrostáticas.

Primer grado de plegamiento estable en el espacio.

Implica el plegamiento de las cadenas (hélice α y lámina
36
β) 12
36
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Ejemplo de una hélice α

-Dextrógira: gira a la derecha mirándolo desde el amino terminal
-Dan sostén interno
-Se forma por el gran número de puentes de hidrógeno entre un aa y el 4to detrás de éste
-Cada vuelta de un enlace tiene 3.6 aa y una distancia de 0.54nm por vuelta
-Los grupos radicales sobresalen de forma perpendicular a la hélice para interactuar con moléculas
de H2O

37

37

Ejemplo de una lámina β

-Hebras unidas lateralmente
Forma de zigzag
-Formada por la rigidez de los
enlaces peptídicos y la
apolaridad de los radicales de
los aa
-Se estabiliza creando puentes
de Hidrógeno entre distintas
zonas de las moléculas
(paralelos o anti paralelos)
-Los radicales están
alternándose hacia arriba o
debajo de la cadena plegada
en zigzag

38

38

Colágeno
-Cada una de las tres
cadenas es una cadena
pro –alfa

Cada una de las

hélices es levógira-
(por le contenido de
prolinas e
hidroxiprolinas) pero
el conjunto
(procolágeno) de tres
dextrógiro

39 13
39
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Giros β
-Compuestos por 4 residuos
-Estructura de un giro β. Compuesto
por cuatro residuos, los giros β invierten
la dirección de una cadena polipeptídica
(giro U 180º). Los carbonos Cα del
primer y cuarto residuo, habitualmente
están a una distancia < 0,7 nm y aquellos
residuos con frecuencia se encuentran
unidos mediante un puente de
hidrógeno.
El giro β facilita el plegamiento de
polipéptidos largos en estructuras
compactas.

40

40

Figure 3.10
(a) Hydrogen bonds can form between nearby amino
and carbonyl groups on the same polypeptide chain.
Hydrogen bond

Hydrogen bond

(b) Secondary structures of proteins result. (c) Ribbon diagrams of secondary structure

Arrowheads
point toward
the carboxyl end
of the primary
structure

-helix -pleated sheet

-helix -pleated sheet

41

42 14
42
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Estructura terciaria -Globular o fibrilar

-La estructura terciaria no es rígida (sufre
fluctuaciones mínimas.
-Está dictada por la estructura primaria
-La conformación globular facilita la
solubilidad en H2O y así puede realizar sus
funciones (transporte, enzimáticas,
hormonales .
-Es estabilizada por diferentes tipos de
enlaces.
-Los aa hidrófobos se orientan hacia el
interior y los hidrofílicos orientados al
exterior

Está determinada por la forma que adopta cada

cadena polipeptídica en relación a las
interacciones entre los grupos R
43

43

Estructura terciaria
Interacciones entre los grupos radicales:
Puentes de hidrógeno:
• Entre los radicales de los aminoácidos.
• Entre hidrógeno y átomos cargados negativamente en cadenas
laterales
Interacciones hidrofóbicas-dan estabilidad
• Moléculas de agua circundantes aumentando los enlaces de
hidrógeno
• Grupos R que son no polares que tienen de huir del exterior de la
proteína y evitar contacto con agua
Interacciones de van der Waals
• Interacciones eléctricas débiles entre cadenas laterales hidrofóbicas
Puentes disulfuro-covalente
• Entre grupos R que contienen azufre
Enlaces iónicos
• Entre grupos que tienen cargas completas y opuestas

44

44

Figure 3.11
(a) Interactions that determine the tertiary structure of proteins

Hydrogen bond between

side chain and carbonyl
group on backbone
Ionic bond

Hydrogen bond Hydrophobic Disulfide bond

between two side chains interactions

van der Waals
interactions

(b) Tertiary structures are diverse.

A tertiary
structure
composed
mostly of
-pleated
sheets

A tertiary
A tertiary structure
structure rich in
composed disulfide
mostly of bonds
-helices

15
45
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Ejemplo de terciaria
Mioglobina:
153 residuos de aa (Kendrew)
Ocho segmentos en hélice alfa con el
70% de aa
Proteína transportadora de oxígeno en el
músculo del cachalote (que pasan mucho
tiempo sumergidos y requieren del
oxígeno en los músculos para mantener
tiempo en inmersión), está formada por
una sola cadena de globina con su
correspondiente grupo hemo y su oxigeno.

46

46

Estructura cuaternaria

Muchas proteínas contienen varias

subunidades polipeptídicas distintas que
interactúan para formar una sola estructura.

La unión de dos o más subunidades

polipeptídicas distintas produce una
estructura cuaternaria

47

47

Proteína supresora de tumores (P300) Cada región con su conformación espacial

4 regiones en 4 colores diferentes se denomina dominio
Cada uno con una forma globular concreta

Dominios son regiones globulares con su forma espacial propia

dentro de una proteína, pero formando parte de la cadena
polipeptídica única de la proteína
48 16
48
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Dominio de proteína

Se refieren a una región espacialmente compacta

de una proteína que está relacionada con una
49 función determinada

49

Son combinaciones de Motivos

estructuras
supersecundarias o de
más de dos estructuras
secundarias
Los motivos con disposiciones
muy estables de varios
elementos de estructura
secundaria y las conexiones
entre ellos, han sido recogidos
por la naturaleza y aparecen
en diferentes proteínas
Se han asociado con una
función específica

50

50

Figure 3.12

(a) Cro protein, a dimer (b) Hemoglobin, a tetramer

1 2

1 2

17
51
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Estructura cuaternaria

Ig: formada por 4 cadenas en azul y 2 en

verde
- Formadas por enlaces covalentes
- Hay dominios (regiones que
pueden plegarse de manera
independiente y estable) y motivos.
Hemoglobina: Dos cadenas alfa (141aa) y dos
cadenas beta (146aa), un grupo prostético hemo con
un átomo de hierro

Proteínas que están compuestas por dos o más cadenas de

polipéptidos adquieren una estructura cuaternaria (son
52 oligoméricas)

52

Ejemplo de cuaternaria

Cada átomo de hierro transportará una molécula de oxigeno

Una molécula de hemoglobina puede transportar hasta 4 átomos de oxigeno
53 El átomo de hierro esta relacionado con las histidinas de cada una de las moléculas de globina

53

Asociaciones de proteínas y otras

biomoléculas
Las proteínas se pueden
asociar:
· Con azúcares
· Con lípidos
· Con ácidos nucleicos

54 18
54
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Asociaciones entre proteínas y

azúcares
Cuando las proteínas se asocian con azúcares pueden originar asociaciones
supramoleculares como los proteoglicanos o los peptidoglicanos.

Un núcleo proteico que se encuentra unido covalentemente a un tipo especial de polisacáridos

denominados glicosaminoglicanos (GAG). Estas cadenas de glicosaminoglicanos (GAG) son largos
polímeros de carbohidratos lineales que están cargados negativamente bajo condiciones
fisiológicas,

55

55

Asociaciones entre proteínas y

azúcares
Cuando las proteínas se asocian con azúcares pueden originar asociaciones
supramoleculares como los proteoglicanos o los peptidoglicanos.

Tetra péptido unido a N acetil glucosamina (derivado de la glucosa) y ácido N-acetil murámico

Importante en la pared bacteriana-tinción de Gram.

56

56

Asociaciones entre proteínas y lípidos

Cuando las proteínas se asocian con lípidos pueden originar asociaciones
supramoleculares como las lipoproteínas del plasma sanguíneo y las
membranas biológicas.

son complejos macromoleculares compuestos por proteínas y lípidos que transportan masivamente
las grasas por todo el organismo. Son esféricas, hidrosolubles, formadas por un núcleo de lípidos
apolares (colesterol esterificado y triglicéridos) cubiertos con una capa externa polar de 2 nm
formada a su vez por apoproteínas, fosfolípidos y colesterol libre.
EJ: LDL (Lipoproteína de baja densidad)-transporta colesterol del hígado a tejidos HDL
57(lipoproteína de alta densidad)- recogen el colesterol de las arterias VLDL (lipoproteínas de muy baja
densidad)-transportan TGC
19
57
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Asociaciones entre proteínas y

ácidos nucleicos
Cuando las proteínas se asocian con ácidos nucleicos pueden originar
asociaciones supramoleculares como los ribosomas, nucleosomas.

Los ribosomas son complejos

macromoleculares de proteínas y ácido
ribonucleico (ARN).

Los nucleosomas están formados por un

octámero de proteínas histonas y
aproximadamente 147 pares de bases
58 nitrogenadas de ADN.

58

Plegamiento mediado
por chaperonas:
Las chaperonas se unen a un
segmento corto de un
sustrato proteico y estabilizan
las proteínas desplegadas o
parcialmente desplegadas
evitando que se degraden o
agreguen.
Ej: Hsp70 (citosolica)
Naranja: dominio que une
sustrato

59

59

CICLO DE LA ATPasa groEL

Plegamiento mediado por chaperoninas:

Forman pequeñas cámaras plegadas dentro de las cuales puede quedar secuestrada la totalidad o una
parte de la proteína no plegada, dando tiempo y un medio adecuado para que se pliegue
adecuadamente
CHAPERONINA PROCARIONTE DEL GRUPO I (GroEL)-complejo con forma de barril de 14
subunidades
60 20
60
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Desnaturalización

-Si se cambian
condiciones
fisicoquímicas
-Se pierde la actividad
biológica
-Se puede replegar

61

61

62

62

63 21
63
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Proteómica de humano y chimpancé

64

64

Espectrometría de masas

65

65

66 22
66
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67

67

Funciones a nivel celular

 Uniones en células adyacentes

 Transporte de membrana

 Aceleradores de reacciones (enzimas)

 Señales químicas (hormonas)

 Proteínas de defensa (anticuerpos)

68

68

Departamento de Ciencias Básicas

Biología celular

Proteínas:
Relación estructura-actividad

Natalia Moreno Castellanos

69 MsC y Doctor en Biomedicina 23
69
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CARACTERISTICAS
Relación estructura-actividad

Las proteínas están entre las macromoléculas con

70 mayor diversidad estructural

70

Versatilidad de las proteínas

Pueden formar diversas estructuras de acuerdo a

71 la variedad de cadenas laterales de los “aa”

71

Clasificación y estructura

 Primaria

 Secundaria  Simples

 Terciaria  Conjugadas

 Cuaternaria

72 24
72
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Proteínas conjugadas

A diferencia de la simples, al hidrolizarse además de

“aa”, tendrán otros componentes no proteicos en su
73 radical [grupo prostético]

73

Ejemplo de proteínas conjugadas

 Nucleoproteínas
 Lipoproteínas
 Fosfoproteínas
 Metaloproteínas
 Glucoproteínas
 Flavoproteínas
 Hemoproteínas

74

74

Proteínas simples

Son aquellas que al hidrolizarse producen

únicamente “aa”, pues no tienen otros
75
componentes 25
75
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Globulares y Fibrosas

• Tienen forma esferoidal y generalmente • Tienen generalmente mayor proporción

son hidrosolubles y poco rígidas
• Masas moleculares variables
• Solubilidad en agua relativamente
elevada
• Variedad de roles (catalizadores,
transportadores, reguladores de rutas
metabólicas y expresión génica)
76
de estructura secundaria
• Son rígidas y con frecuencia alargadas
• Forma cilíndrica alargada (tipo bastón)
• Baja solubilidad en agua
• Un papel más estructural que dinámico
en la célula o el organismo o participan
en movimientos celulares (G-actina)
• Tienen subunidades de aa repetidas
• Ejemplos, colágeno, elastina, α -
queratina y tropomiosina

76

Clasificación de proteínas de acuerdo a

su función
 Estructural (colágeno)

 Transportadora (hemoglobina)

 Defensa (inmunoglobulinas)

 Catalíticas (enzimas)

 Integrales (acuaporinas)

77

77

Proteína con función estructural

Son proteínas fibrosas. No son

globulares y presentan una baja
solubilidad en agua:
Son el tipo de proteínas más abundantes en nuestro organismo ,
constituyen muchas estructuras de los seres vivos
78 26
78
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Ejemplos: de proteínas fibrosas

 Colágeno (abundante en vertebrados, forma estructuras como

el cartílago, hueso, etc)
 Elastina (se halla en los tejidos cartilaginoso, óseo y conjuntivo,
cuya función es la de hacer que, tras realizar un esfuerzo, los tejidos
recuperen su tamaño normal)
 α- queratina (Proteína rica en azufre que constituye la parte
fundamental de las capas más externas de la epidermis y de tejidos
como las uñas, el pelo, las plumas, las pezuñas o los cuernos)
 Tropomiosina (Regula, junto con la tropina, las interacciones
de la actina y miosina en la contracción muscular)

79

79

El colágeno ME: matriz extracelular

Contienen en su
estructura primaria
repeticiones de glicina
(en las regiones
internas), Prolina
(facilita que se pliegue
la hélice), aa
hidroxilados que
mantienen la estabilidad

Proteína estructural principal de la matriz extra celular (conjunto de materiales

extracelulares de un tejido donde se encuentran inmersas las células) y la más
abundante en los tejidos animales. Los dominios de la triple hélice de los
colágenos consisten en repeticiones de las secuencias Glicina – Prolina (x)-
Hidroxiprolina (y)
80

80

Distribución del colágeno en el hombre

 Hígado 4%

 Pulmón 10%

 Aorta 12-24%

 Cartílago 50%

 Cornea 64%

 Hueso cortical entero 23%

 Piel 74%

Se encuentra distribuido en todos los tejidos vivos y órganos a los

que proporciona el armazón que les da forma y resistencia
81 estructural 27
81
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Síntesis de colágeno

- Síntesis en Ribosomas del RER de

células especializadas en la
elaboración de tejido cartilaginoso.
- Complejo de Golgi es modificado
pos-traduccionalmente
- Secretado al espacio extracelular
- Ensamblado en fibras de colágeno

82

Ensamble de las fibrillas de colágeno

Se ensamblan por medio de enlaces covalentes transversales entre

las cadenas laterales de los restos de lisina o hidroxilisina en una
83 formación discontinua regular para constituir fibrillas

83

Clasificación de lo tipos de colágeno

84 28
84
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Síntesis anormal del colágeno

 Disfunciones de los órganos cardiovasculares
(aneurisma aórtico y arterial, y mal
funcionamiento de las válvulas cardiacas)

 Huesos (fragilidad y propensión a las fracturas)

 Piel (cicatrización defectuosa y distensión inusual)

 Articulaciones (hipermovilidad y artritis)

 Ojos (dislocación del cristalino)

 Enfermedades como: síndrome de Ehlers-Danlos

(Daño en la síntesis), la osteogénesis imperfecta
(Alteración en Colágeno Tipo I)
85

85

Proteína con función transportadora

Son proteínas globulares. Actúan como transportadores

de CO2 y de protones desde los tejidos a los pulmones,
además, transportan y liberan óxido nítrico (NO)
86

86

Ejemplos: Hemoglobina y mioglobina

Las hemoproteinas son un grupo de proteínas que contienen un grupo hemo. La función del
grupo hemo dependen del ambiente creado por la estructura tridimensional de la proteína. En
87
la hemoglobina y mioglobina, el grupo hemo sirve para fijar el oxigeno.
29
87
 04/05/2022

Estructura de la mioglobina del

cachalote

-Una de las primeras proteínas de la

que se conoció su estructura terciaria.
-Transporta oxígeno en el músculo
-Consta de 143 aa y un grupo
prostético denominado grupo hemo
-Posee un ión de hierro en su parte
central (le ayuda a fijar mejor el
oxígeno)
-Tiene una sola cadena de globina

88

88

Complejo “hemo” de la mioglobina

89

89

Estructura de la hemoglobina
-Formada por 4 cadenas ó subunidades de
globina unidas de 2 en dos formando dos
cadenas α y dos cadenas β.
-Cada cadena tiene su grupo prostético
hemo al que se une el Oxígeno.
-Por una parte ayuda a capturar el Oxígeno y
por otra lo libera en momentos específicos
-Una vez se une una vez el oxígeno hay más
probabilidad de que se una a los otros grupos
hemo.
-El oxígeno se libera por inhibición
alostérica: el dióxido de carbono inhibe a
la hemoblogina impidiendo que el oxigeno
se mantenga unido y sea liberado.
-Los eritrocitos pueden llegar a contener
270 hemoglobinas en su interior (por ello no
tienen núcleo)

90 30
90
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Estados: Desoxihemoglobina
(Reducida) y hemoglobina

Cuando no esta unida la HG

a el oxígeno tiene una
configuración espacial
diferente

91

91

Curva de unión del oxígeno a la hemoglobina

-A valores bajos de la presión parcial de oxígeno
(Po2) la mioglobina tiene mayor afinidad por el
oxígeno que la hemoglobina
-El efecto alostérico de unión del oxígeno a la
hemoglobina (cada unión de un O2 al grupo
Porcentaje de saturación del O2

hemo en una subunidad acelera la unión de

otro O2 al grupo hemo de la siguiente
subunidad) hace factible que la saturación de la
hemoglobina en los capilares pulmonares sea muy
elevada.
-A presiones bajas de oxígeno la hemoglobina es
mas eficiente que la mioglobina para captar
oxígeno
-La hemoglobina es muy eficiente a mayor presión
de oxígeno en los capilares
-La hemoglobina aumenta su eficiencia en los Presión parcial de O2
tejidos.
92

92

Hemoglobinoptias

93 31
93
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Eritrocitos humanos

94

94

Proteínas con función de defensa

Son proteínas que actúan como discriminadoras de

sustancias extrañas al organismo (patógenos). Se unen a
la molécula nociva para facilitar su destrucción por las
95 células del sistema inmunitario

95

Ejemplo: inmunoglobulina o anticuerpos

96 32
96
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Estructura de la inmunoglobulina IgG

-Formadas por 4 cadenas proteínicas (2 pesadas-
externas y 2 ligeras-pequeñas en los bordes)
-2 Regiones o zonas (constante-regíon
conservada que diferencia a los Acs y variable-se
unirá al Ag, da especificidad por el Ag)
-Desde el punto de vista de dominios VL (variable
ligera) VH variable pesada, región constante CH1,
CH2 y CH3.
-Esos dominios se unen por puentes disulfuro
intercatenarios (dentro de las cadenas) y puentes
disulfuro intercatenarios (entre 2 cadenas distintas
ej: cadena ligera y pesada-Dan movilidad –
región bisagra-permite que el Ac se una o
adapte mejor al Ag, aumentando la afinidad del Ac
por el Ag
-Ac tratado con papaina: se separa en fragmentos
Tienen regiones variables que se Fab-o sitios de unión al Ag. Fragmento Fc o
formaron como producto de la fragmento cristalizable, sitio en que se pueden
evolución unir glúcidos e hidratos de carbono y permite su
unión a membranas de LB
97

97

Lugar de unión del antígeno

La Reacción Ag-Ac es importante
para defendernos contra el medio
ambiente.
La unión Ag-Ac es reversible, es
decir, el Ac puede separarse del Ag
en cualquier momento

98

98

Sitios de unión de la proteína

-Puentes de hidrógeno
-Fuerzas electrostáticas
-Fuerzas de Van der Waals
-Fuerzas hidrofóbicas

-Sitio dónde se une el Ag-Ac se llama determinante antigénico

-Unión Ag-Ac se da por enlaces de diversa naturaleza
-La velocidad con que ocurra la reacción depende de la afinidad que tenga el Ac
por el Ag, de la concentración de Ag y de la concentración de Ac.
Tipos de unión:
Precipitación: se da cuando el Ag es una macromolécula soluble que viaja por plasma, los
Acs la rodean y la precipitan
Aglutinación: El Ag no es soluble, molécula que está en la superficie de una membrana
99 (bacterias o células dañadas), los Acs envuelven esa molécula y producen agregados 33
99
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Mecanismo de eliminación del antígeno

- Neutralización: contra virus
especialmente, disminuye la
capacidad de infección
- Opsonización: El macrófago está
más estimulado de lo habitual por
el Ag, los Acs cuando se unen al Ag
se unen a la membrana del
macrófago por la fracción FC
(cristalizable), permitiendo una
digestión más eficaz.

100

100

Clases de inmunoglobulinas

101

101

Proteínas integrales de membrana

Son las proteínas de la membranas de la célula que

102 transportan moléculas de agua 34
102
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Nomenclatura y distribución

103

103

Estructura molecular

104

104

Ejemplo

105 35
105
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Patologías
asociadas con
las
acuaporinas

106

106

Enzimas
Las reacciones celulares son tan lentas que no podrían
contribuir para la vida, a menos se haga algo para
acelerarlas

Las enzimas son, en general, proteínas globulares que actúan

catalizando los procesos químicos que se dan en los seres vivos.
Esto es, actúan facilitando las transformaciones químicas;
acelerando considerablemente las reacciones y disminuyendo la
energía de activación que muchas reacciones requieren.

Son la mayoría de proteínas que actúan como catalizadores

biológicos (porque es de naturaleza orgánica, es especializado en
aumentar la velocidad de la reacción, especifico)
107

107

Menor energía de activación

Como se disminuye la Ea:

-Atrayendo los sustratos (Aumenta la
probabilidad de que se encuentren
-Debilitando los enlaces del sustrato (la
energía que se emplea es menor para
obtener un estado activado

Las reacciones celulares son tan lentas que no podrían

contribuir para la vida, a menos se haga algo para
108 acelerarlas 36
108
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Tipos de Enzimas
 Proteínas simples globulares
 Holoenzimas (Enzima activa) que poseen:
Una parte proteica (apoenzima) y una parte no proteica, (cofactor)
que puede estar formada por iones (cationes de hierro, calcio, etc), o
moléculas orgánicas (coenzima)

HOLOENZIMA = APOENZIMA + COFACTOR

109

109

Enzima y substrato
SITIO ACTIVO TIENE:
SITIO DE FIJACION: establece enlaces de
diferente naturaleza
SITIO CATALITICO: Sitio que facilita que ocurra
la reacción

La unión de un sustrato al sitio activo de una enzima

genera un complejo enzima-sustrato (ES)
110

110

Sitio Activo
Es una concavidad de la enzima formada por unos determinados
segmentos de la cadena de aminoácidos de la enzima (E) que determina
una superficie complementaria a la molécula del reactivo o sustrato (S).
El centro activo se une al sustrato mediante interacciones débiles,
formándose así el complejo enzima-sustrato (ES). Esta unión cambia el
sustrato y el complejo ES se transforma en el complejo enzima-
producto (EP). A continuación se separan enzima y producto

111 37
111
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COMPLEJO E-S

Sitio activo
flexible

112

112

Características generales
 Las enzimas se unen a los reactivos
(sustratos) reduciendo la energía
de activación
 Cada enzima tiene una forma única
con un sitio o centro activo en el que
se une al sustrato
 Después de la reacción, enzimas y
productos se separan
 Las moléculas enzimáticas no han
cambiado después de participar en
la reacción
 Altamente específicas
 Tienen la terminación «asas»
113

113

Clasificación

114 38
114
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Clasificación

115

115

Propiedades
Localización: muchas enzimas se
encuentran en orgánulos específicos, lo
que permite un ambiente favorable para
cada tipo de reacción metabólica y
evitando interferencias de moléculas con
estructuras similares.
Las enzimas presentan saturación
por el sustrato: la velocidad de una
reacción enzimática crece con la
concentración de sustrato de forma
asintótica hasta un límite denominado
velocidad máxima

116

116

Propiedades
La actividad enzimática depende de
factores como el pH y la
temperatura. Las enzimas tienen una
temperatura óptima y un pH
óptimo. Al aumentar la temperatura, la
actividad enzimática también aumenta,
pero hasta un límite, ya que los enzimas,
como proteínas que son, se
desnaturalizan a elevadas temperaturas.
Por otra parte, el pH, al influir sobre
las cargas eléctricas, podrá alterar
la estructura del centro activo y
por lo tanto también influirá
sobre la actividad enzimática.

117 39
117
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Inhibición
Son compuestos químicos
que se unen al enzima, en
distintos puntos del mismo
y disminuyen o incluso
impiden su actividad. A la
acción que realizan se la
denomina inhibición, que
puede ser:

Inhibición irreversible: Cuando el inhibidor impide permanentemente la

actividad enzimática, bien porque se une de forma permanente con grupos
funcionales importantes del centro activo o bien porque altera su estructura. Ej. La
penicilina que inhibe las enzimas que sintetizan la pared bacteriana.
Inhibición reversible: El inhibidor se une al enzima de forma temporal
mediante enlaces débiles e impide el normal funcionamiento del mismo, pero
no la inutiliza permanentemente.

118

118

Tipos de Inhibición
Competitiva: El inhibidor es similar al sustrato y se puede unir al centro activo del enzima
impidiendo que lo haga el sustrato. Es decir ambos, inhibidor y sustrato compiten por unirse
al centro activo del enzima.

119

119

Tipos de Inhibición
Los inhibidores competitivos son sustancias, muchas veces similares químicamente a
los sustratos, que se unen al centro activo impidiendo con ello que se una el sustrato. El
proceso es reversible y depende de la cantidad de sustrato y de inhibidor, pues ambos
compiten por la enzima.
sustrato

inhibidor

Enzima
Enzima

Sin inhibidor
con inhibidor

120 40
120
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Tipos de Inhibición
No competitiva: El inhibidor no compite con el sustrato, puede actuar de 2
formas:
Sobre el enzima, uniéndose a el en un lugar diferente al centro activo y
modificando su estructura lo que dificulta que el enzima se pueda unir con
el sustrato.
Sobre el complejo E-S, uniéndose a él y dificultando su desintegración y por lo tanto la
formación de los productos.

121

121

Enzimas alostéricas
Estas enzimas poseen además del centro activo, otro centro llamado centro regulador o
alostérico donde se puede unir un modulador o regulador alostérico que, puede ser un
activador o un inhibidor de la enzima:
Si el centro regulador esta vacío la enzima actúa a velocidad normal;
Si está ocupado por el regulador se producen cambios en la conformación y dependiendo
de que sea activador o inhibidor adoptara una forma más o menos activa.

122

122

Ejemplo: enzimas de la glucolisis

123 41
123
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METABOLISMO

124

124

METABOLISMO
Conjunto de reacciones bioquímicas que ocurren dentro de
una célula. Dichas reacciones se agrupan en vías
metabólicas.
Este conjunto de reacciones proporcionan a los seres vivos la
materia y la energía que necesitan para realizar sus
funciones vitales

125

125

METABOLISMO
En el metabolismo las reacciones
químicas están encadenadas, de
forma que el producto de una
reacción es el sustrato o metabolito
de la siguiente. Cada uno de los
conjuntos de reacciones
encadenadas que constituyen el
metabolismo se denomina ruta o
vía metabólica.

126 42
126
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METABOLISMO SE DIVIDE EN:

Anabolismo: Parte
constructiva del metabolismo. Se
forman moléculas complejas a
partir de moléculas más
sencillas. Requiere aporte de
energía en forma de ATP.
Catabolismo: Parte
destructiva del metabolismo.
Forma moléculas sencillas a
partir de moléculas más
complejas. Pueden producir
energía en forma de ATP
127

127

METABOLISMO SE DIVIDE EN:

128

128

ATP
El Adenosín Trifosfato (ATP) es un nucleótido que actúa almacenando y
transportando energía libre en los procesos metabólicos de todas las células.
Es la moneda de intercambio energético que permite todas las funciones
celulares.

Está formado por una base nitrogenada (adenina) unida al carbono 1 de un azúcar de

129
tipo pentosa, la ribosa, que en su carbono 5 tiene enlazados tres grupos fosfato
43
129
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ATP
La energía liberada en las reacciones catabólicas se usa para fosforilar ADP,
generando ATP. La energía almacenada en el ATP se utiliza en la mayoría de
los trabajos celulares. Por lo tanto, el ATP acopla los procesos productores
de energía de la célula a los consumidores de energía.

La energía en el ATP se guarda en el enlace fosfodiéster entre los grupos fosfato

130 La energía que lleva el ATP se utiliza en las reacciones catabólicas

130

Los sistemas no solo intercambian energía en forma

de ATP, también cambian electrones
Los polímeros (proteínas, lípidos etc,
deben ser unidos por algo; lo hacen
moléculas transportadores de
electrones
Como unos elementos tendrán que
unirse y otros tendrán que romperse,
algunos agentes inducirán la oxidación
de compuestos y otros la reducción.
-leyes de la termodinámica: la energía
(electrones) de A pasa a B (la energía no
se destruye)

Las reacciones de oxidación y reducción (REDOX) están acopladas en una reacción redox,
el reactante A se oxida al ceder electrones y el reactante B se reduce al ganar
electrones. Un protón puede ser transferido con un electrón, de modo tal que en realidad
lo que se transfiere es un átomo de hidrógeno.
131

131

FADH2 y NADH, equivalente al ATP para reacciones

REDOX-transportadores de electrones
Flavin adenosin dinucleotido (FAD) y Nicotinamida adeninina dinucleotido
(NAD) actúan como portadores de electrones en las reacciones REDOX. Al igual que el
ATP estas moléculas pueden sufrir transformaciones y ayudar a realizar otras reacciones
acopladas.
Pasa de estado oxidado a estado reducido.

Extremo que
se oxida o se
reduce

Nucleósido: 1 riboflavina (vitamina B2), unida a

pirofosfato (PPi), éste unido a una ribosa y ésta Pasa de estado oxidado a estado reducido.
132 unida a una adenina.
Al igual que el ATP forma enlace fosfodiéster.
44
132
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METABOLISMO
Las rutas metabólicas están interconectadas entre
Lípidos GLUCÓLISIS
sí, un metabolito intermediario puede ser el Glucosa
sustrato de otra vía. Polisacáridos
Algunos
(almidón)
aminoácidos
Glicerol
Ej: Plato de arroz (almidón=mucha glucosa) –la
Piruvato
energía se que se libera al romper enlaces se
almacena en forma de forma de ATP, NAD y OXIDACIÓN DEL
PIRUVATO
NADH. El almidón se convierte en glucosa y el
almidón pasa a ser energía. Almidón se ha Ácidos grasos Acetil CoA

oxidado.
Pirimidina Purinas
ácidos ácidos
-Yo no empleo toda la energía en las funciones nucleicos nucleicos
CICLO DEL Algunos
básicas, mucha se dejará como reserva para: Algunos
aminoácidos
ÁCIDO aminoácidos
CÍTRICO
regenerar membranas celulares, en forma de
glucógeno en el hígado, etc. CADENA
Cuando se requiera esa energía los ATP y NADH TRANSPORTADORA
DE ELECTRONES
se oxidarán y se gastará la energía almacenada.
Proteínas
Es un proceso cíclico donde se gasta y se gana Tomado de Vida, la ciencia de la Biología , Sadava et al. 2009
energía de manera constante

Lípidos y polisacáridos degradados en moléculas más pequeñas

133 (Acetil CoA y piruvato)

133

Errores innatos del metabolismo

Los EIM son trastornos bioquímico de origen genético,

que, causan un defecto específico en la estructura o
función de las moléculas proteicas involucradas en una
vía metabólica

134

134

Modo de acción

135 45
135