Aminoácidos y Proteínas:

Aminoácidos: Sustancia química orgánica en cuya

composición molecular entra un grupo amino y otro
carboxilo.

o La forma Zwitterión o dipolar posee

igual número de cargas positivas y
negativas. En esta forma el grupo
carboxilo se encuentra disociado (-COO -) y
Forma Zwitterión el grupo amino protonado (-NH 3+), pero la
carga de la molécula es neutra. Un
Zwitterión puede actuar como un ácido o como una base cediendo o aceptando
protones (define su capacidad ácido-base).
o Punto isoeléctrico: punto donde la carga promedio es cero.

La protonación o desprotonación de los grupo amino y carboxilo depende del pH

Dado que los grupos ionizables de los aminoácidos son ácidos relativamente débiles
podemos aplicar la ecuación de Henderson-Hasselbalch para calcular la fracción de cada grupo
que se encuentra ionizada a un determinado pH.

pH= Dicarboxilico- pH=

Monoamino
Diamino-
Monocarboxilo

Monoamino-
Monocarboxilo

pH=

o Electroforesis: en un campo eléctrico a una disolución de iones la molécula

cargada se desplaza a través del mismo.
 Anfolito: grupo con valores de pKa acidos y básicos
(ionizables) que pueden poseer carga positiva, negativa o
cero dependiendo de la solución.
 Un anfolito no se mueve en ningún sentido cuando
está en el punto isoeléctrico.
 Clasificación de aminoácidos:
o Polaridad y esencialidad (negritas esenciales)
 Polares
1. Isoleucina
2. Leucina
3. Metionina
4. Fenilalanina
5. Triptófano
6. Valina
7. Alanina
8. Prolina
 Apolares
1. Arginina
2. Histidina
3. Lisina
4. Treonina
5. Ácido aspártico
6. Asparagina
 7. Cisteina
8. Ácido glutámico
9. Glutamina
10. Glicina
11. Serina
12. Tirosina

o Por sus sustituyentes:

 Alifática:
a. Glicina (Gly)
b. Alanina (Ala)
c. Leucina (Leu)
d. Valina (Val)
e. Isoleucina (Ile)
 Aromáticos:
a. Fenilalanina (Phe)-(Hidrofóbico)
b. Tirosina (Tyr)-(Hidrofílico)-(Más reactivo)
c. Triptófano (Trp)-(Hidrofóbico)
d. Prolina (Pro)
* En la α-hélice no se puede tener una prolina debido a que
la misma impide la formación de dicha hélice.
 Azufrados:
a. Cisteína (Cys)
b. Metionina (Met)
 Hidroxilados:
a. Serina (Ser)
b. Treonina (Thr)
 Ácidos y sus amidas:
a. Acido aspártico (Asp)-(Hidrofílico)
b. Ácido glutámico (Glu)-(Hidrofílico)
c. Asparagina (Asn)-(Hidrofílico)
d. Glutamina (Gln)-(Hidrofilico)
 Básicos:
a. Histidina (His)
b. Lisina (Lys)
c. Arginina (Arg)
Proteínas: Las proteínas son polímeros lineales de aminoácidos y desempeñan en los
seres vivos la mayor parte de las funciones: enzimáticas, de transporte, nutrientes y de
reserva, contráctiles o motiles, estructurales, de defensa, reguladoras, etc.

 Se unen a través de enlaces peptídicos, que es la unión covalente entre dos o más
aminoácidos por la formación de un enlace amida, el mismo se da entre el grupo
α-carboxilo y el grupo α-amino.
 Los enlaces son paralelos (o casi) y no se produce un giro
considerable.
 Los átomos C, O, N e H son casi coplanares porque el enlace
peptídico se asemeja a un doble enlace, por lo que sus enlaces son
más estables.
 Hay libre rotación alrededor del enlace C ∝−C y C ∝−N
 Se puede considerar un hibrido de resonancia

 Cuando son coplanares, el grupo de atomos alrededor del enlace

peptídico puede tener configuración trans (que es más estable
termodinámicamente debido a que es metaestable, es decir, la
reacción es más lenta a medida que avanza, además, solo se
hidrolizarán en condiciones extremas o si son catalizadas por
proteasas o enzimas proteolíticas) o cis.

 Nomenclatura:
 El C-terminal se escribe a la derecha.
 La N-terminal se escribe a la izquierda
 Sus productos de formación son péptidos y agua.
  Al añadir un AA a la cadena se elimina una molécula de agua.
 La proporción de cada AA que permanece en la cadena se
denomina “Residuo de aminoácido”
 La reacción es mediada por la peptidil transferasa.
 Oligopéptido: cadena con pocos residuos aminoacídicos.

 Polipéptido: cadena larga de aminoácidos

 Suelen tener AA con grupos ionizables en sus cadenas laterales.
 Poseen varios pKa pero son débilmente ácidos o básicos.

 Niveles de organización:
o Estructura Primaria: son polipéptidos de secuencia definida que
evolucionan mediante cambios en la secuencia de sus aminoácidos
 Conservadores: mantienen la naturaleza de la cadena lateral.
 No conservadores.
o Estructura secundaria y terciaria
 Desnaturalización: se pierde la estructura natural de las proteínas
junto con sus propiedades específicas.
 Interacciones carga-carga: puede producirse entre cadenas
laterales cargadas (+) y (-), a pH neutro, estas se cargan de modo
que existe una fuerza de atracción electrostática de atracción entre
ellos formando una especie de puente salino y se inestabiliza ante
los cambios de pH.
 Enlaces de hidrógenos internos:
 Enlaces entre grupos de cadenas laterales.
 Enlaces entre grupos de armazón.
 Enlaces entre un grupo de cadena lateral y un hidrogeno
amido o un oxígeno carbonilo del armazón.
 Chaperoninas: protegen la identidad de la proteína al
momento del plegamiento
o Estructura cuaternaria
 Asociación entre cadenas polipeptídicas idénticas o casi idénticas a
través de enlaces homotípicos como puentes salinos y enlaces de
hidrogeno
 Asociación entre cadenas polipeptídicas diferentes, sus enlaces son
heterotípicos (fuerzas no covalentes en las superficies proteicas
complementarias)
  Dominio: región compacta, plegada localmente de la estructura
terciaria, conectadas entre si por una cadena polipeptídica.
 Dominios múltiples: comunes en proteínas globulares
 Dominios funcionales: son regiones de la proteína donde
interactúan AA (estructuras primarias) se acercan al doblarse
la proteína.
 Conformación nativa: es la estructura tridimensional de una
proteína en condiciones fisiológicas, se considera la estructura más
estable de todas las posibles y esta será la forma funcional. Si se
cambian las condiciones del medio la estructura nativa se pierde es
decir, se desnaturaliza. Se presenta como un proceso reversible.

 Criterios de plegación de proteínas

o Los átomos no pueden acercarse el uno al otro a una distancia menor de
que permiten sus radios de Van del Waals.
o Solo se da la rotación alrededor de dos enlaces adyacentes al carbono α de
cada aminoácido.
o Es preciso algún tipo de enlace no covalente para estabilizar un plegado
regular. La posibilidad más evidente es el enlace de hidrogeno ente
protones amidos y los oxígenos carbonilos.

 Plegamiento de las proteínas:

o α-Hélice:
 Más frecuente
 Los enlaces de H están hacia adentro de la proteína y las cadenas R
hacia afuera del eje central.
 Fibrosa
 La cadena gira sobre su eje
 Los puentes de H se dan entre el grupo carboxilo y el grupo amino
situado 4 residuos adelante en la secuencia
 Por cada vuelta posee de 3-6 residuos de AA
 Enlaces intracatenarios, es decir, solo interactúan entre la misma
cadena
o β-Plegada:
 los elementos de la cadena se alternan por encima y por debajo de
la misma.
  Enlaces intercatenarios (pueden reaccionar con otras cadenas) que
requieren 20 o más cadenas para que se forme o bien, 1 sola
cadena plegada varias veces.
 En cada vuelta existen 4 AA.
 Se plegan gracias a puentes de H o interacciones iónicas.

 Papel de la mioglobina y la hemoglobina:

o Mioglobina: reservorio de oxígeno en músculo cardiaco y esquelético.
o Hemoglobina: transporta oxígeno a través de la sangre

 Cooperatividad en la cinética de asociación del oxígeno a la hemoglobina:

o Consiste en que las subunidades colaboran entre sí para la fijación del
oxígeno y consiste en que un grupo Hem fija una molécula de oxígeno, esto
aumenta la afinidad de los demás grupos Hem gracias a determinados
cambios estructurales (interacciones Hem-Hem o efectos alostéricos).
 Efecto alostérico: afecta la capacidad de fijación del oxígeno en la
hemoglobina, los factores que afectan dicha unión funcionan
alterando la misma en otro sitio de la molécula. La mioglobina no se
afecta.
 De no existir la Cooperatividad, el sistema no podría discriminar los
lugares donde existe alta pO2 de los que poseen una baja presión y
no existiría descarga ya que la afinidad entre la hemoglobina y el
oxígeno siempre seria elevada.
 Efectos de los cambios de pH y la presión de C O2 sobre la afinidad de la
hemoglobina por el oxígeno (EFECTO BOHR)

La descarga de hemoglobina se intensifica cuando el pH disminuye o cuando la p CO 2

se encuentra incrementada; si la descarga de oxigeno aumenta es porque disminuyó la
afinidad de la hemoglobina por este.

El efecto Bohr se ve por un desplazamiento de la curva por acción del pH, este efecto
se produce por una diferencia en la afinidad por los portones entre la forma oxigenada de
la hemoglobina (oxihemoglobina- menor afinidad a los protones) y la forma desoxigenada
(desoxihemoglobina); aquí participan los grupos ionizables, los αN-terminales y las
cadenas laterales específicas de la histidina. Entonces:

Histidina
Histidina pKadesoxi>pKaOxi

Mayor tendencia a permanecer protonados trayendo como

consecuencia la formación de puentes salinos que estabilizaran
la forma desoxi disminuyendo la afinidad por el oxigeno
 El efecto Bohr se representa por:
HbO2 + H +¿ →´ HbH +O ¿
2

 El aumento de H +¿¿ o pCO2 desplaza el equilibrio a la derecha o a la

forma desoxi.
 La disminución de H +¿¿ o pCO2 desplaza el equilibrio a la izquierda
o a la forma oxi.
 El CO 2 es transportado como carbamato fijo a grupos α-aminos sin
la carga dela hemoglobina (carbaminohemoglobina); dicha fijación
estabiliza la forma tensa de la hemoglobina disminuyendo su
afinidad por el oxigeno

 EFECTO DEL 2,3-Bifosfoacilglicerato sobre la afinidad de la hemoglobina por el

oxígeno.

Actúa como un efector alostérico, disminuyendo la afinidad de la hemoglobina por el

oxígeno al fijarse a la desoxihemoglobina, pero no a la oxihemoglobina, estabilizando asi la
forma rígida de la desoxihemoglobina. Representado por:

H b O 2+ 2,3−DFG →
´ Hb−2,3−DFG+O 2

Conociendo que la hemoglobina está compuesta por 2 cadenas α y 2 cadenas β, hay

que tomar en cuenta que las cadenas β forman una especie de saco redondeado de AA
con carga positiva, estos forman enlaces iónicos con los grupos fosfato de una sola
molécula de 2,3-DFG; dicha molécula es expulsada cuando el oxígeno se une a la
hemoglobina (dado que es muy afín al O2 por la misma salida del 2,3-DFG)

Si existe una elevada cantidad de 2,3-DFG en sangre, se reduce la afinidad de la misma

por el oxígeno; su importancia radica en que gracias a esta regulación, se distribuye el O2
según la pO2 en el tejido.

 Degradación proteolítica de las proteínas (proteólisis)

 Es el proceso de degradación de la proteína par las enzimas proteasas o por
digestión intramolecular. Los péptidos y los aminoácidos que resultan de la proteólisis
pueden ser reutilizados en la síntesis de proteínas.

o Las proteínas se degradan cuando se pliegan mal o presentan mutaciones

(presentan una secuencia de AA que son reconocidos como señales de
degradación).
o Las proteínas normales (cuando existe una alteración en la concentración en el
estado de la célula) son eliminados en respuesta a señales específicas.

 Diferencias entre proteínas globulares y fibrosas

o Forma:
 Fibrosas.
 Globulares.
o Solubilidad en agua: Globulares> Fibrosas.
o Función:
 Fibrosas: estructurales.
 Globulares: papel funcional.
o Estructura secundaria
 Fibrosas: poseen un solo tipo.
 Globulares: poseen varios tipos.

 Proceso de plegamiento:

Muchas proteínas solo adquieren la conformación correcta con la asistencia de una

o más proteínas chaperonas; un subgrupo de chaperonas, las Chaperoninas, son
estructuras tubulares formadas por componentes que requieren ATP.

Las chaperonas se unen reversiblemente a regiones hidrofóbicas de las proteínas

desplegadas y a los intermediarios de plegamiento, pueden estabilizar intermediarios,
mantener proteínas en estados desplegados para permitir el paso a través de la
membrana entre otras funciones. Todas estas actividades pueden contribuir a que la
proteína adquiera la conformación funcional que normalmente es la más compacta. El mal
plegamiento va seguido de la inmediata degradación, ya que la acumulación de proteínas
mal plegadas puede causar enfermedades.

o Proteína Disulfuroisomerasa: tiene la capacidad de romper puentes

disulfuro incorrectos y posibilitar la formación de nuevos enlaces correctos
que estabilizan la conformación nativa.
 o Peptidil prolinaisomerasa: puede realizar la transformación de un enlace
trans en uno cis, permitiéndole a la proteína alcanzar una conformación
correcta.

 Degradación de las proteínas- Ubiquitina proteosoma

o Es un proceso que explica el mecanismo del control de la semivida de las
proteínas.
o Este mecanismo de proteólisis no se cataliza solamente para las proteínas
funcionales que posean regulada su semivida, también es funcional para
proteínas con plegamiento incorrecto evitando así sus efectos tóxicos.
o Proteosoma: complejo de gran tamaño formado por una gran cantidad de
proteínas, muchas de ellas con actividad proteasa.
o Ubiquitina: polipéptido de 76 AA que se debe unir a las proteínas para que
puedan ser reconocidas por el proteosoma. Se necesitan las enzimas
E1 ; E2 ; E 3 que facilitan la unión de muchos restos de Ubiquitina a la
proteína.
o Proceso:
1. Formación (usa ATP) de un enlace triester entre un C-
terminal de la Ubiquitina y un tiol de cisteína.

E1 SH HOOC-Ubiquitina E1 S-CO-Ubiquitina
ATP
Figura A
Enzima activadora AMP
de Ubiquitina

2. Transferencia de Ubiquitina de E1 a E2 .

E2 S-CO-Ubiquitina
Figura A
HS-E2 E1-SH
Figura B
 3. Transferencia de la Ubiquitina a residuos de lisina en las
proteínas dionas
4. Proteólisis dependiente de ATP de las proteínas marcadas
por la Ubiquitina.
 Diferencias entre las curvas de presión de O2 vs. Saturación de hemoglobina y
mioglobina
o Mioglobina: posee una curva hiperbólica lo que indica que tiene gran
afinidad por el oxígeno (unión) ya que bastan pO2 bajas para que la
mioglobina alcance una alta saturación y así exista poca cantidad del mismo
en el medio
 Dicha afinidad es importante para la captación del oxígeno a la
célula.
o Hemoglobina: muestra una curva sigmoide que indica que la afinidad por el
oxígeno varía según sea la pO2 con respecto a la hemoglobina.
 A bajo pO2la Hb muestra poca afinidad por el oxígeno
 Al aumentar la pO2 la afinidad por el oxígeno aumenta debido a la
cooperatividad positiva
 Estructura de la hemoglobina y la mioglobina
o Mioglobina: es una proteína monomérica con un grupo hemo que
transporta oxígeno a los músculos.
o Hemoglobina: proteína tetramérica con 4 grupos hemo y transporta
oxígeno en sangre.
 Maduración de proteínas
1. Modificación de aminoácidos: es llevada a cabo por enzimas específicas que
modifican la funcionalidad o estabilidad de la proteína
a. Adición de pequeños grupos químicos:
i. Acetilación
ii. Fosforilación
iii. Metilación
iv. Carboxilación
v. Hidroxilación
b. Incorporación de lípidos
 Aumentan la hidrofobicidad de la proteína.
 Permite el anclaje de proteínas a la membrana.
► Prenilación o incorporación de prenilos.
► Acilación: incorpora ácidos grasos
c. Glucosilación
  Adición de glicanos a la cadena lateral
 Se lleva a cabo en el lumen del retículo endoplásmico y del
complejo de Golgi mediante glucosiltransferasa.
 Contribuye
► Establecer la conformación de la proteína.
► Aumentar la estabilidad, la solubilidad y la hidrofilicidad
de las proteínas
► Determinantes antigénicos.
d. Formación de puentes disulfuro
 Entrecruzamientos covalentes
 Se lleva a cabo mediante una reacción redox mediada por la
disulfuroisomerasa
 Pueden ser intra o intercatenarios
 Estabiliza la estructura nativa
 Protege de la desnaturalización.
e. Adición de grupos prostéticos: el componente no aminoacídico que
forma parte de la estructura de las heteroproteínas
2. Escisión proteolítica: ruptura especifica de proteínas inactivadas para activarlas
a. Pre-proteína: péptido líder + proteína inactivada.
b. Pro-proteína: proteína inactivada a la que se le añaden 3 puentes
disulfuro.
c. Proteína activa: se forma en el aparato de Golgi, proteasas prohormona
convertasas retiran el péptido central y las cadenas restantes
permanecen unidas por el puente disulfuro.
3. Splicing: proceso post-transduccional de corte y empalme de una proteína
precursora y conlleva a la eliminación de una secuencia de aminoácidos de la
cadena polipeptídica para originar una proteína madura
 Glutatión.

Es un tripéptido no proteínico que se deriva de los aminoácidos, este ayuda a proteger

las células de especies reactivas de oxígeno; este reduce cualquier enlace disulfuro
formado dentro de proteínas citoplasmáticas de cisteína al actuar como donante de
electrones. En el proceso, el glutatión se convierte en su forma oxidada: disulfuro de
glutatión (GSSG).

El glutatión se encuentra casi exclusivamente en su forma reducida, la glutatión

reductasa (la enzima que vuelve su forma oxidada) es constitutivamente activa e inducible
al estrés oxidativo
  Síntesis

L-Cisteína

Sintetizado a
partir de Glicina
Nutriente no
esencial
Activador Factor limitante de
Ácido L-Glutámico
biologico del la sintesis del
(dona electrones) glutatión
glutatión

 Pasos de la síntesis:
1. La γ-Glutamilcisteina se sintetiza a partir del L-Glutamato y la cisteína
a través de la Glutamato-Cisteina Ligasa (GCL)
2. La glicina se añade al C-terminal de la γ-Glutamilcisteina a través de la
enzima glutatión transferasa.
 Función: el glutatión existe en su estado reducido (GSH) y en su forma oxidada
(GSSG), en el estado reducido es capaz de donar un equivalente de reducción
a otras moléculas inestables. En la donación de un electrón, el glutatión se
convierte en reactivo pero reacciona rápidamente con otro glutatión reactivo
para formar disulfuro de glutatión (GSSG); el GSH puede regenerarse a partir
del GSSG por la enzima glutatión reductasa.
a. Antioxidante endógeno que participa en la neutralización de
radicales libres y compuestos de oxigeno reactivo así como el
mantenimiento de antioxidantes exógenos en sus formas activas
b. A través de la conjugación directa, desintoxica muchos compuestos
extraños, haciéndolo esencial para el sistema inmune
c. Afecta el sistema inmune, nervioso, gastrointestinal y los pulmones