EPIDEMIOLOGÍA MOLECULAR DEL VIH

Madrid, 2021
Dra. Africa Holguín

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 CAUSAS DE VARIABILIDAD
GENÉTICA EN EL VIH

RECOMBINACIÓN ENTRE CEPAS:

- Por superinfecciones
- Por coinfecciones

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CLASIFICACIÓN DE VARIANTES DEL VIH

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DIFERENCIAS BIOLÓGICAS ENTRE
VIH-1 y VIH-2

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 Grupo O VIH-1

ANÁLISIS FILOGENÉTICOS DE
SECUENCIAS DEL VIH
Grupo N VIH-1

SIV

Grupo M VIH-1

Método definitivo para identificar

tipos, grupos, subtipos y
recombinantes del VIH
VIH-1
Se pueden realizar empleando
VIH-2 secuencias de cualquier región del
genoma y en genomas completos

Laborioso y requiere personal

especializado

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 HERRAMIENTAS DE SUBTIPAJE RÁPIDO Y DETECCIÓN
DE RECOMBINANTES DISPONIBLES online

Stanford HIVdb (Universidad de Stanford, EE. UU.) https://hivdb.stanford.edu/hivdb/by-sequences/

NCBI Genotyping Tool http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/genotyping/formpage.cgi

(National Center for Biotechnology Information,
Bethesda, MD, EE.UU.)

jpHMM-HIV (Universidad de Gotinga) http://jphmm.gobics.de/submission_hiv.html

REGA v3.0 (Universidad de Leuven) http://dbpartners.stanford.edu:8080/RegaSubtyping/stanford-

hiv/typingtool/
http://engine.euresist.org/data_analysis/viral_sequence/new
EuResist Prediction System (Red Europea EuResist)

http://comet.retrovirology.lu/
COMET (CRP-santé) VIH-1: https://comet.lih.lu/index.php?cat=hiv1
VIH-2: https://comet.lih.lu/index.php?cat=hiv2

RIP (Recombinant Identification Program, Los Alamos http://www.hiv.lanl.gov/content/sequence/RIP/RIP.html

National Laboratory)

SIMPLOT http://sray.med.som.jhmi.edu/SCRoftware/simplot/

RDP (Recombination Detection Program) http://web.cbio.uct.ac.za/~darren/rdp.html

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IMPLICACIONES DE LA VARIABILIDAD DEL VIH

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EFECTOS DE LOS POLIMORFISMOS NATURALES EN
GENES DIANAS DE TERAPIA ANTIRRETROVIRAL

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CONCEPTOS A RECORDAR

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