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PARA EL VIRUS
DEL PAPILOMA
HUMANO
2022/23
MEDAC Formacciona
PRUEBAS DE ADN PARA EL VIRUS DEL PAPILOMA HUMANO
LOS NUEVOS RETOS EN LA TAMIZACIÓN DEL CÁNCER DE CUELLO UTERINO
Resumen
El virus del papiloma humano (VPH) es una familia de virus responsable de numerosas
patologías tanto en mujeres como en hombres. A partir de los años 80 se estableció la
asociación del VPH con procesos neoplásicos que tienen lugar en el cuello uterino y en otras
partes del aparato genitourinario. Existen aproximadamente 200 tipos de VPH clasificados en
dos categorías: los VPH de bajo riesgo oncogénico (LRHPV) y los de alto riesgo oncogénico
(HRHPV). La importancia de conocer el genotipo del VPH que afecta al cuello uterino es
fundamental para la prevención y pronóstico tempranos, así como para su epidemiología.
La técnica de Papanicolaou, es la más utilizada de manera habitual, pero presenta como
gran inconveniente una limitada sensibilidad de detección del posible riesgo oncogénico de una
lesión. Con las nuevas técnicas de biología molecular en cambio, esta sensibilidad puede
resultar absoluta para la detección de lesiones de alto grado.
Desarrollaremos el protocolo completo, desde la obtención de la muestra del paciente,
hasta la interpretación de los resultados obtenidos por el método INNO-LiPA Genotyping Extra
Abstract
The human papillomavirus (HPV) is a family of viruses responsible for numerous diseases
in women and men. Since the 1980s, the association of HPV with the cervix and other
genitourinary system neoplastic processes was established. Approximately 200 types of HPV
are classified into two categories: low oncogenic risk (LR-HPV) and high oncogenic risk (HR-
HPV). Knowing the genotype of HPV affecting the cervix is essential in the prevention and
early diagnosis, as well as for its epidemiological understanding.
The Papanicolaou staining technique is the most commonly used even though it shows a
limited sensitivity for the detection of the possible oncogenic risk of a lesion. With the new
molecular biology techniques, on the other hand, this sensitivity may be absolute for the
detection of high-grade lesions.
We will develop the complete protocol, from obtaining the patient's sample to the
interpretation of the results obtained by the INNO-LiPA Genotyping Extra method.
PRUEBAS DE ADN PARA EL VIRUS DEL PAPILOMA HUMANO
LOS NUEVOS RETOS EN LA TAMIZACIÓN DEL CÁNCER DE CUELLO UTERINO
Índice
Resumen 2
Abstract 2
1.1. Historia 1
3.1. introducción 8
4.4.2. La PCR 17
5. Conclusión 22
6. Bibliografía 23
Anexo I 25
PRUEBAS DE ADN PARA EL VIRUS DEL PAPILOMA HUMANO
LOS NUEVOS RETOS EN LA TAMIZACIÓN DEL CÁNCER DE CUELLO UTERINO
PRUEBAS DE ADN PARA EL VIRUS
DEL PAPILOMA HUMANO
El virus del papiloma humano (VPH) son un grupo de virus que están relacionados entre
sí, que pertenecen a la familia Papillomaviridae y tienen en común la característica de infectar
principalmente los epitelios.
Los VPH considerados de bajo riesgo, suelen infectar la piel y las mucosas de los genitales
o la zona bucal provocando verrugas, las cuales son lesiones benignas que en determinadas
ocasiones pueden transformarse y evolucionar a lesiones de alto riesgo y producir determinados
tipos de cáncer.
El VPH es el causante de la mayor parte de los cánceres de cuello de útero, por lo que
resulta imprescindible conocer su biología para poder entender la carcinogénesis de cérvix.
Entre el VPH que termina derivando en carcinoma cervical y sus precursores, lesiones más
leves que pueden llevar años de evolución, existe una marcada relación. Esta relación puede
demostrarse mediante estudios epidemiológicos y moleculares, haciendo de suma importancia
el diagnóstico de las infecciones por VPH a través de las técnicas de ADN.
1.1. Historia
Ya en 1949, Ayre hizo las primeras descripciones, pero no fue hasta 1956 Koss y Durfee
establecieron el término “atipia coilocítica” donde se describían los cambios en las células
escamosas que presentaban alguna anormalidad. Se determinó la presencia de coilocitos en las
citologías de cérvix de pacientes que presentaban displasia y carcinoma invasor. En 1976
Meisels y Fortín establecieron la descripción citológica de lesiones condilomatosis asociadas a
VPH y que las partículas virales compatibles con VPH eran idénticas a los coilocitos que Koss
y Durfee habían propuesto con anterioridad, y en 1977 Zur Hausen sugirió la asociación entre
VPH y cáncer cervical.
1
PRUEBAS DE ADN PARA EL VIRUS DEL PAPILOMA HUMANO
LOS NUEVOS RETOS EN LA TAMIZACIÓN DEL CÁNCER DE CUELLO UTERINO
En 1983 se establece de manera definitiva la infección por VPH como causa de cáncer
cérvico uterino. El VPH16 fue aislado en la mayoría de las muestras que el equipo de Herald
Zur Hausen había examinado años antes.
Las aplicaciones de biología molecular y genética han hecho posible la caracterización
molecular del virus (Ochoa-Carrillo, páginas 308-315, 2014.)
Al secuenciar los genomas de los papilomavirus se observa que, aunque tienen una
organización genética semejante a los poliomavirus, su transcripción es diferente: es
bidireccional en los poliomavirus, mientras que los papilomavirus tienen una transcripción
unidireccional. El Comité Internacional de Taxonomía de los virus decidió englobar los
papilomavirus en una familia distinta, denominada Papillomaviridae.
Los papilomavirus son virus pequeños cubiertos por una cápside de proteína, y de un
tamaño de 45 nm hasta 55 nm de diámetro. Tienen un genoma de ADN circular de doble hélice
de aproximadamente 8,000 pares de bases de longitud y contiene varias regiones codificantes
que se llaman marcos de lectura abiertos (ORFs por sus siglas en inglés).
Las ORFs son secuencias de nucleótidos en las que sucede una sobreposición de genes, es
decir, codifican enzimas que participan en la regulación de las funciones, y proteínas
estructurales que forman parte de la producción de las diferentes partículas del virus. Los genes
tempranos o E (early) codifican proteínas no estructurales tempranas en el momento de infectar
las células y los genes tardíos o L (late) que codifican proteínas estructurales de las partículas
virales. En el VPH, siete u ocho de los marcos de lectura codifican para genes tempranos y
únicamente dos para genes tardíos.
Tiene además una región no codificante (región reguladora principal), que es la encargada
de regular la expresión de todos sus genes, tanto de las regiones temprana como tardía.
Hay genotipos que no son oncogénicos, y que ni siquiera tienen la capacidad de
transformar en tumorales las células normales, son los VPH de bajo riesgo (LR) como los VPH
6, 11, 13, 44 74.
Por otro lado, los genotipos VPH 16, 8, 26, 31 33, 35, etc. Están completamente asociados
a diversos tipos de cáncer, particularmente al cáncer de cérvix. Son los denominados genotipos
de alto riesgo (HR) (Figura 1del Anexo I). (Silvia de San José Llongueras)
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LOS NUEVOS RETOS EN LA TAMIZACIÓN DEL CÁNCER DE CUELLO UTERINO
• Infección latente o pasiva: la infección se produce en las células basales del epitelio
escamoso. El ADN viral se queda dentro de la célula en su forma circular libre y
no se replica. Citológicamente no pueden verse cambios morfológicos por lo que
la infección únicamente se detecta utilizando métodos moleculares.
Hay identificados más de 200 tipos de VPH distintos, los cuales se manifiestan en un gran
espectro de lesiones que proliferan en la piel (VPH cutáneo) y en la mucosa oral (VPH
mucosal), en la laringe y en el tracto anogenital.
El grupo de VPH que se desarrolla en las mucosas es el que detallaremos con más interés.
El riesgo de evolucionar a cáncer se subdivide en dos grupos:
• VPH de bajo riesgo (LR) o no oncogénico, que provocan lesiones benignas
denominadas condilomas o verrugas genitales. Son los VPH 6, 11, 42, 43 y 44. El
90% de estas verrugas son causadas por el VPH 6 y el VPH 11
• VPH de alto riesgo (HR) u oncogénicos, que como su nombre indica son capaces
de derivar en cáncer. Las lesiones que provocan se denominan malignas o
preneoplásicas, y están asociadas a todas las lesiones intraepiteliales invasoras
tanto de las células epiteliales escamosas como de las células epiteliales
glandulares que se verán detalladamente en apartados posteriores. Son los VPH 16,
18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 67 y 68. Aproximadamente el 75% de los
cánceres de cérvix son causadas por el VPH 16 y el VPH 18 (Tabla 2 del Anexo
I). (Silvia de San José Llongueras)
No es posible cultivar in vitro los virus que provocan el VPH, por lo que su detección
dependerá de analizar, mediante técnicas de biología molecular, la secuencia de ADN del
mismo.
En la actualidad existen diferentes técnicas moleculares con gran sensibilidad y
especificidad para detectar el VPH. El citodiagnóstico permite visualizar en un microscopio las
extensiones celulares teñidas para observar as anomalías nucleares que permitan identificar
lesiones cervicales. Las técnicas moleculares, como la hibridación in situ (ISH), que permite
detectar secuencias específicas de ADN utilizando sondas, la reacción en cadena de la
polimerasa (PCR), el Southern Blot y la captura de híbridos son las que presentan los mejores
avances y mayor precisión en la tamización para el cáncer de cuello de útero.
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Las células infectadas por el VPH presentan unos cambios muy característicos. Se produce
un fenómeno denominado coilocitosis, que consiste en que las células escamosas superficiales
adquieren una forma redondeada u ovoide, con la cavidad débilmente teñida, traslúcida y de
bordes irregulares. El citoplasma aparece denso, eosinófilo y basófilo. El núcleo presenta un
aspecto variable, con cromatina borrosa, hipercromático, agrandado, la membrana nuclear no
es visible, binucleación y en ocasiones multinucleación
También aparece disqueratosis, que son células pequeñas con citoplasma orangófilo y
núcleos hipercromáticos, característicos de VPH (Figura 3 del Anexo I).
Las células epiteliales presentan patrones anormales que indican la presencia de células
malignas que pueden derivar a carcinomas.
Se deberá evaluar estos tipos celulares según sus características morfológicas y tener en
cuenta los criterios de malignidad que aseguren al citopatólogo la interpretación adecuada de
la muestra.
La última clasificación de Bethesda resume todas las lesiones precursoras de carcinoma
escamoso de cérvix en dos términos:
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• Lesión intraepitelial pavimentosa (LIP o SIL) de bajo grado que incluye los
cambios debidos al VPH y los de displasia leve/ CIN I.
• Lesión intraepitelial pavimentosa (LIP o SIL) de alto grado que incluye a los de
displasia moderada/ CIN II y displasia severa y carcinoma in situ/ CIN III.
En una citología cervical se observan tanto el epitelio escamoso del exocérvix como el
epitelio cilíndrico, columnar o glandular de las células glandulares.
El diagnóstico citológico de las lesiones del epitelio glandular ha cobrado interés debido
al aumento en la incidencia del adenocarcinoma endocervical y el uso de nuevo métodos de
toma celular en el canal endocervical.
Aun así, existen dudas sobre la precisión diagnóstica de dichas lesiones mediante la
citología exfoliativa. En la nomenclatura Bethesda 2001, se introduce el término células
glandulares atípicas (AGC):
3.1. introducción
Actualmente, el VPH está considerado una de las ITS más relevantes y que se transmite
con mayor frecuencia. Provoca normalmente crecimientos en la piel o las mucosas, causando
verrugas muy contagiosas que se transmiten por contacto. Cuando la infección es genital, la
transmisión se produce mediante relaciones sexuales, el sexo anal y otro tipo de contacto en la
región genital, algunas infecciones por VPH que causan lesiones respiratorias orales o
superiores se contraen a través de sexo oral. La infección por VPH es más común ente las
personas que presentan VIH (virus de inmunodeficiencia humana) y en hombres que tienen
actividad sexual con otros hombres. (Alcalde, 2022)
Se considera que los hombres actúan como reservorio del virus, estando especialmente
localizado en los genitales externos. La sintomatología clínica es menos frecuente que en las
mujeres y suele conllevar la aparición de infecciones múltiples. Se han comunicado frecuencias
de detección del VPH del 65,5% en hombres asintomáticos, habiéndose detectado genotipos
muy variados.
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Existen numerosos tipos de virus de VPH diferentes. Las cepas o genotipos de bajo riesgo
están asociadas a la aparición de papilomas o verrugas genitales, y los de alto riesgo se asocian
a una mayor probabilidad de desarrollar cáncer de pene, la mayor parte de ellos causados por
VPH 16 y 18 combinados, siendo los más prevalentes de los 150 genotipos existentes.
En el estudio que nos ocupa se analiza la presencia de los 32 subtipos de HPV de bajo y
alto riesgo más frecuentes, incluyendo los siguientes:
• VPH (HR): VPH 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66 y 68.
• VPH (LR): VPH 6, 11, 40, 42, 53, 54, 55,61, 62, 64, 67, 69, 70, 71, 72, 81, 83, 84,
89, y IS39
especialmente alta para cualquier VPH y en concreto para las cepas de alto riesgo 16 y 18, no
habiéndose encontrado diferencias significativas en la especificidad de los análisis realizados
a partir de los distintos tipos de muestra.
Este es el motivo por el que se recomienda el análisis a partir de una muestra de auto toma
de orina por parte del paciente, evitando una toma de muestra invasiva.
La prevención primaria del cáncer de pene o del canal anal en varones se realiza
administrando vacunas que protegen frente a los tipos de VPH que causan casi el 90% de los
cánceres. Se recomienda esta vacunación antes de la exposición al virus, previo a tener
relaciones sexuales. La prevención secundaria consiste en un diagnóstico precoz mediante
cribado poblacional a mujeres y hombres sexualmente activos.
Tal es la frecuencia de transmisión del VPH actualmente, que se ha estimado que hasta el
80% de mujeres sexualmente activas se infectan por este virus en algún momento de sus vidas.
(Alcalde, 2022)
Las infecciones por VPH son la principal causa de cáncer de cuello de útero, aunque el
cáncer puede tardar veinte años o más en desarrollarse después del primer contacto con el virus.
Es la presencia de manera crónica de VPH en el cérvix la que se ha asociado a un riesgo 80
veces superior a desarrollar displasia y cáncer de cuello de útero, vagina, vulva, canal anal, asi
como a otras lesiones orofaríngeas y cutáneas, incluso cáncer de la cavidad oral. Esta
asociación es más fuerte para determinados genotipos del virus, algunos con características
oncogénicas, por lo que resulta muy importante no solo la detección sino el genotipado exacto
del VPH presente en la paciente.
Tanto la infección por VPH como el cáncer de cuello de útero en estadio temprano no
causan síntomas, por lo que es de vital importancia que las mujeres se sometan a análisis
regulares para detectar cualquier cambio precanceroso en el cuello uterino que pueda derivar
en cáncer. (Burroni E & Hpv ScreeVacc Working Group, 2014)
Existen numerosos tipos de virus de VPH diferentes. Las cepas o genotipos de bajo riesgo
están asociados a la aparición de papilomas o verrugas y los de alto riesgo se asocian con una
mayor probabilidad de desarrollar cáncer de cuello uterino. Aproximadamente el 70% de todos
los casos de cáncer de cuello uterino en el mundo son causados por los VPH 16 y 18
combinados, siendo los más prevalentes de los 150 genotipos existentes.
En el estudio que nos ocupa se analiza la presencia de los 32 subtipos de HPV de bajo y
alto riesgo más frecuentes, incluyendo los siguientes: 6, 11, 16, 1, 26, 31, 33, 35, 39, 40, 42,
43, 44, 45, 51, 53, 54, 56, 58, 59, 61, 62, 66, 67, 68, 69, 70, 73, 81, 82, 83 y 89 (de Sanjose S,
2010)
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Este es el motivo por el que se recomienda una muestra de auto toma de orina por parte de
la paciente, favoreciendo el acceso a la prueba apacientes jóvenes, evitando la toma de muestra
invasiva que debe ser realizada r un especialista y permitiendo un cribado poblacional.
El hecho de poder genotipar las infecciones por VPH a partir de una muestra de orina
que el propio paciente recoge con una auto toma, de manera cómoda, privada y nada invasiva,
es previsible que un futuro próximo aumenten de manera importante los ensayos sobre el VPH,
valorando del mismo modo la eficacia de las actuales vacunas , con la finalidad de poder salvar
cada vez más vidas.
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Una vez recibida la muestra de orina del paciente, será evaluada por el personal técnico
del laboratorio según el procedimiento de preanalítica vigente (OPPR) y como mínimo debe
presentar un volumen de 350µl útil para proceder a la extracción.
Es importante saber que la extracción de DNA, dado que pertenece a muestras biológicas,
se lleva siempre a cabo en áreas especialmente delimitadas para ello que son las salas de
extracción.
Para preparar una muestra de orina se deberán llevar a cabo los siguientes pasos:
Una vez escaneado todo el material necesario en el interior del equipo, y habiéndonos
asegurado que el reactivo es suficiente para procesar todas las muestras que tenemos, se
introduce el rack de elución para tubos de 1.5 ml en el slot de refrigeración. Estos tubos irán
rotulados con el numero de la muestra a la que corresponden, y en ellos al finalizar el proceso,
tendremos el ADN extraído de cada una de las muestras.
Los reactivos deben mantenerse siempre en los viales originales y su temperatura opima
de conservación es de 2–8 ºC. hay que tener en cuenta que tanto si son nuevos, como si ya han
sido abiertos, en estas condiciones permanecerán en condiciones estables hasta su fecha de
caducidad, pero nunca deben ser congelados.
Su uso óptimo es a temperatura ambiente, por lo que una hora antes de que vayan a ser
utilizados, deben estar a 20-25 ºC, para ser refrigerados de nuevo inmediatamente tras su uso.
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Para usar con seguridad los reactivos y el resto de componentes potencialmente peligrosos,
es imprescindible consultar la ficha de datos de seguridad (FDS)y el etiquetado del producto.
La proteína L1, es una de las proteínas específicas que forman la estructura de la cápside
en los distintos tipos de virus del papiloma humano. La técnica que utiliza el INNO-LiPA HPV
Genotyping Extra II, está basada en el principio de hibridación reversa. La región SPF10 de la
proteína L1 del genoma del VPH es amplificada mediante una reacción en cadena de la
polimerasa con cebadores específicos del virus y los ampliaciones que se han obtenido como
resultado de esa PCR se desnaturalizan para después ser hibridados mediante sondas de
oligonucleótidos específicas.
Por último, se incuban las tiras con cromógeno BCIP /NBT, que produce un precipitado
púrpura de tal forma que resultados se interpretarán de modo visual. (Figura 4 del Anexo I).
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Es fundamental que los distintos pasos del ensayo se realicen en salas independientes en
el laboratorio con el fin de evitar la contaminación de muestras y el resultado de falsos
positivos. Cada una de estas dependencias, debe contar con su propio suministro de pipetas,
gradillas, recipientes de residuos y resto de materiales. Todo el material debe de mantenerse en
la sala a la que corresponde y no trasladarse de una a otra. Es imprescindible una sala para la
extracción de ADN donde se manejan todo tipo de muestras biológicas, y que al ser considerada
una “sala sucia”, debe tener presión negativa para evitar que el aire contaminado salga al
exterior. Esta sala debe estar siempre libre de amplicones, y el cuidado en el tratamiento de las
muestras debe de ser muy concienzudo pues es donde más contaminación se produce. Por otra
parte habrá una “sala limpia” para la preparación de reactivos, donde no debe haber nunca
ningún tipo de muestra biológica, es decir, debe mantenerse siempre libre de ADN. Es una sala
que se va a utilizar para preparar los reactivos de la PCR y una tercera donde se realicen la
amplificación y la detección de aplicaciones. (Casares, 2020)
4.4.2. La PCR
Todos los reactivos que se necesitan para cada reacción deben estar conservados en un
tubo de 0,2 ml en congeladores situados en la zona libre del laboratorio. Por cada muestra se
utilizaran 20µl del Reaction mix de INNO-LiPA más 5µl del ADN de la muestra, obteniendo
un total de 0.25µl de volumen final.
En un gel de agarosa al 2% hay que cargar 10µl , teniendo en cuenta que el amplicón de
esta reacción tiene un tamaño muy pequeño, únicamente 65 pares de bases, por lo que puede
contaminarse con mucha facilidad y comprobar la amplificación.
Durante la incubación del lavado astringente hay que preparar la solución de lavado y
conjugado y a partir de aquí todo se realiza a temperatura ambiente.
10- Retirar la solución anterior y lavar las tiras con 1 ml de solución de lavado
diluida durante un minuto (repetir dos veces).
11- Retirar la solución anterior y añadir 1 ml de conjugado preparado e incubar
durante 30 minutos. Unos diez minutos antes de que acabe el periodo de
incubación de conjugado hay que preparar la solución de sustrato.
12- Retirar el líquido anterior y lavar con 1 ml de solución de lavado diluida durante
un minuto (repetir dos veces).
13- Retirar el líquido anterior y lavar con 1 ml de tampón de sustrato durante un
minuto.
14- Retirar la solución anterior y añadir 1 ml de sustrato preparado e incubar
durante 30 minutos.
15- Parar la reacción retirando la solución anterior y lavando dos veces con agua
destilada durante al menos 3 minutos.
16- Coger las tiras con pinzas y dejarlas secar durante un papel absorbente.
17- Una vez secas pegar en la hoja de registro de datos para su lectura
Las tiras están diseñadas para ser usadas solo una vez. Si no son usadas, deben mantenerse
protegidas de la luz y el calor, y preferiblemente colocadas en posición vertical. Es importante
manipularlas siempre con pinzas y no con las manos, y nunca identificarlas escribiendo sobre
ellas, sino por encima de la línea de marca de las mismas.
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Las tiras de ensayo deben colocarse en las cubetas y con la membrana recubierta en
posición superior ya que es el lado que está marcado para su correcta interpretación y durante
todos los pasos de la incubación, deben estar siempre en la misma cubeta (estas cubetas nunca
deben ser reutilizadas).l
Todas las bandas visibles, deben identificarse con la tarjeta de lectura (Figura 5 del Anexo
I ), alineando la línea azul de la tira con la línea de marca de la tarjeta. Una banda se considera
positiva si aparece una banda de color marrón o gris al finalizar el procedimiento.
La primera que aparece bajo la línea de marca es la banda de Control de Conjugado. Debe
ser siempre positiva y debe de tener la isma intensidad en todas las tiras que se hayan procesado
en una misma cubeta, ya que controla la incorporación de la solución de conjugado y de sustrato
durante el proceso de detección. En caso de un resultado negativo en esta banda de control, el
resultado debe de considerarse invalido, lo que implica la repetición de todo el ensayo.
Una muestra se considera positiva para HPV cuando por lo menos una de las bandas
específicas de tipo es positiva o si una de las bandas de control de VPH es positiva.
Las muestras que no generan ninguna banda específica de tipo positiva de las bandas 1 a
la 32 pero tienen al menos una banda de control de HPV positiva deben clasificarse como
positivas para HPV de tipo no identificable (HPVX)
Si aparece más de una banda de genotipo de VPH significa que está presente una mezcla
de esos genotipos de VPH.
Una muestra se considera negativo para VPH si la banda de control hADN humano es
positiva y todas las bandas específicas de tipo VPH (incluidas las bandas de control) son
negativas
Los fragmentos de SPF10 de los 32 genotipos de HPV presentes en las tiras han sido
clonados en plásmidos, que son moléculas circulares de ADN bicatenario que tiene origen
bacteriano y capacidad de replicación autónoma, y todos los genotipos de VPH han sido
detectados de forma específica por sus respectivas sondas.
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5. Conclusión
El cáncer de cuello de útero provocado por virus del papiloma humano, es una neoplasia
maligna que se produce en la zona de transformación del cérvix, en la unión de los epitelios
escamosos y columnar, y que en la población femenina tiene un impacto negativo a nivel
mundial, siendo especialmente relevante en los países en vías de desarrollo.
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Anexo I
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