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ANÁLISIS DE HAPLOTIPOS DEL FACTOR

TRANSFORMADOR DE CRECIMIENTO TGF BETA EN


NEFROPATÍA DIABÉTICA

AUTORES.

Timana Moncayo Daniela Alexandra

Vivas Portillo Andres Felipe

Estudiantes de medicina, Universidad de Nariño

Pasto-Nariño-Colombia

INTRODUCCIÓN

La nefropatía diabética o comúnmente llamada


enfermedad renal, es una complicación que origina el Guerrero M. Burbano O. Manual de Prácticas de Bioinformática para Biología
daño de los vasos sanguíneos de los riñones, Molecular. Editorial Universitaria. Colombia, Nariño, Pasto: Universidad de
Nariño; 2014
encargados de purificar los residuos de la sangre. Cabe
recordar que, dicha complicación es atribuida por el RESULTADOS
padecimiento de Diabetes tipo 1 y 2 cuando son mal
controladas. Existe una proteína reguladora de Acontinuacion, se exponen cuatro ARNm que codifican
funciones que está implicada en dicha enfermedad, ella para TGFβ1; teniendo en cuenta que estos contienen
es la TGFβ1. Cuando hay una sobre expresión de esta diferentes cantidades de pares de bases en sus
(codificada por los genes TGFB1 y TGFB2), puede secuencias. Se realiza los respectivos mapas de
desencadenar en la enfermedad. (1) restriccion con el empleo de las mismas enzimas de
restricción en cada secuencia de ARNm (TGBR1,
Como lo refiere Guerrero et al. (1) Para el estudio y TGBR2, TGBR3 y TGBR4). Dicho prosediemiento se
determinaciones de alteraciones genéticas que realizo con ayuda de la biblioteca virtual “National
atribuyan a dicha enfermedad, son de gran apoyo la Library of Medicine” (para buscar las secuencias) y el
utilización de los mapas de restricción. Con ello se podrá programador “pDRAW32” (para realizar los mapas de
reconocer determinadas versiones de los genes que restricción).
codifican para ese tipo de proteínas y como esto puede
desencadenar en diferentes conformaciones de la TABLA No1.
enfermedad de una delimitada población.
TGBR1
OBJETIVOS GENERALES.

Valoración de las secuencias genómicas de los genes


TGFBR1 y TGFBR2, Identificación de variantes
genómicas con relación de la enfermedad renal y
comprensión y habilidad del manejo de las bases de
datos empleadas en la práctica.

METODOLOGÍA.

El desarrollo de esta práctica de laboratorio se basa en


el análisis de haplotipos del factor TGF Beta; práctica
que se pudo llevar a cabo, gracias a una serie de pasos Obtención de primera secuenciación de ARNm (TGBR1)
que están plasmados en el manual de laboratorio de la con el resultado de 6492bp. Resultado obtenido a partir
de intregar la secuencia “Nm_004612” en “pDRAW32”.
Universidad de Nariño. También, se realizó el respectivo
diagrama de flujo que se indica a continuación.

Imagen No 1: Diagrama de flujo, construcción de cDNA


silvestre de unc-22 y determinación de su ORF.
ANÁLISIS DE RESTRICCIÓN ANÁLISIS DE RESTRICCIÓN

Se observa el empleo de las enzimas de restricción


(AIwNI, BsaI y Tsp45I) las cuales contienen de 2 a 10bp. Se observa el empleo de las enzimas de restricción (AIwNI,
Dicho empleo demuestra los respectivos cortes de la BsaI y Tsp45I) las cuales contienen de 2 a 10bp. Dicho
secuencia. empleo demuestra los respectivos cortes de la secuencia.
ELECTROFORESIS ELECTROFORESIS

Se observa el resultado de los fragmentos de la


secuencia del ARNm obtenidos a partir de los corten
Se observa el resultado de los fragmentos de la secuencia
que se realizo con las enzimas de restricción. Dichos
del ARNm obtenidos a partir de los corten que se realizo
fragmentos estan expresados en electroforesis
con las enzimas de restricción. Dichos fragmentos estan
representados en bandas que los indican por sus
expresados en electroforesis representados en bandas que
correspondientes pesos moleculares.
los indican por sus correspondientes pesos moleculares.

TABLA No2
TABLA No3
TGBR2
TGBR3

Obtención de segunda secuenciación de ARNm (TGBR2)


con el resultado de 4530bp. Resultado obtenido a partir de
Obtención de la tercera secuenciación de ARNm (TGBR3)
intregar la secuencia “NM_003242” en “pDRAW32”.
con el resultado de 2583bp. Resultado obtenido a partir de
intregar la secuencia “NM_000660.5” en “pDRAW32”.
ANÁLISIS DE RESTRICCIÓN ANÁLISIS DE RESTRICCIÓN

Se observa el empleo de las enzimas de restricción (AIwNI, Se observa el empleo de las enzimas de restricción (AIwNI,
BsaI y Tsp45I) las cuales contienen de 2 a 10bp. Dicho BsaI y Tsp45I) las cuales contienen de 2 a 10bp. Dicho
empleo demuestra los respectivos cortes de la secuencia. empleo demuestra los respectivos cortes de la secuencia.
ELECTROFORESIS ELECTROFORESIS

Se observa el resultado de los fragmentos de la secuencia Se observa el resultado de los fragmentos de la secuencia
del ARNm obtenidos a partir de los corten que se realizo del ARNm obtenidos a partir de los corten que se realizo
con las enzimas de restricción. Dichos fragmentos estan con las enzimas de restricción. Dichos fragmentos estan
expresados en electroforesis representados en bandas que expresados en electroforesis representados en bandas que
los indican por sus correspondientes pesos moleculares. los indican por sus correspondientes pesos moleculares.

TABLA No4 DISCUSIÓN.

TGBR4 La nefropatía diabética es una enfermedad considerable


que está estrechamente relacionada con la diabetes tipo
1 y 2. Dicha enfermedad renal, interfiere en la función
principal de los riñones (eliminación de desechos), y en
la función de evacuar el exceso de liquido que se
encuentra en nuestro cuerpo. Debido a todo lo
mencionado anteriormente, se le considera de gran
severidad; por lo cual, cuando dicha severidad sigue en
progreso a lo largo de los años, puede desencadenarse
en una enfermedad renal crónica o también denominada
enfermedad renal de ciclo terminal. Esto originando a su
vez, síntomas como confusiones, sensación de falta de
aire, náuseas, vómitos, falta de apetito, fatiga, etc. Una
Obtención de la cuarta secuenciación de ARNm (TGBR4) forma de prevenir esta enfermedad es manteniendo un
con el resultado de 3183bp. Resultado obtenido a partir de
estilo de vida saludable, haciendo ejercicio, y
intregar la secuencia “NM_003239.2” en “pDRAW32”.
alimentándose adecuadamente.

Por otro lado, cuando la enfermedad está en progreso,


también existen afectaciones a niveles moleculares.
Para abarcar dichas afecciones, se deben tener en
cuenta conceptos que nos encaminen para la
compresión de la mencionada enfermedad.
Unas de las nociones a tener en cuenta, es la caracterizan principalmente por el desarrollo de
compresión de las diferencias de los conceptos que “enfermedades” que pueden desencadenar en la muerte
existen entre haplotipo, alelo, y la variante de un gen. En del paciente. A lo mencionado se le denomina
primer lugar, debemos saber que un “haplotipo” es una generalmente en la parte clínica y genética como
combinación de alelos distintos de un cromosoma en “mutaciones”, estas van a llevar a cabo un gran conjunto
común, que podrán ser transferidos juntos. En de enfermedades dadas por este tipo de variantes, por
resumidas cuentas, tenemos que un haplotipo será un lo cual, ha llevado a que la ciencia demasiadas
grupo de transformaciones del ADN que se realizaran a indagaciones. En muchas ocasiones de la vida
lo extenso de un “cromosoma”; por lo tanto, un cotidiana, estas variantes genómicas han causado
“haplotipo” hará referencia a una mezcla de un “alelo” de grandes variantes genéticas que han sido las causantes
tan solo un “gen” o también podría darse el caso de de impedir que un individuo nazca con todas las
“alelos” de muchísimos “genes” en particular. (2) capacidades para realizar un determinado trabajo a lo
largo de su vida. Pero, algo muy importante que
En contraste, tenemos que un “alelo” es cada una de las debemos saber es que no todas las variantes son
formas de elección que podrá tener el mismo “gen”, patógenas, sino que también hay variantes
además, debemos comprender que la expresión de un “probablemente patógenas” y algunas variaciones
gen va a dar lugar a la expresión de muchos alelos; con genéticas que podrán ser probablemente “benignas”
ello, se lograra determinar muchas características en el donde las variantes no serán las culpables de causar
individuo, como puede ser el color de ojos, color de ningún tipo de afección. (6)
cabello, etc. de tal manera que, esto conlleva a que
todos los seres humanos tengamos una variabilidad
genética distinta. (3)
REFERENCIAS BIBLIOGRAFICAS
Las enzimas de restricción son de una gran importancia
ya que están serán las encargadas de cortar el ADN 1. Guerrero M. Burbano O. Manual de Prácticas de
cuando reconocen una cierta secuencia especifica, y en Bioinformática para Biología Molecular. Editorial
la practica lo pudimos evidenciar ya que estas tenían un Universitaria. Colombia, Nariño, Pasto:
criterio el cual era cortar fragmentos de 2 a 10 partes, en Universidad de Nariño; 2014
las 4 cadenas de ARN con las cuales nosotros 2. Haplotipo [Internet]. Conogasi. 2016 [cited 2022
estábamos trabajando, como también se puede dar el Aug 28]. Available from:
caso que nosotros elijamos una enzima que tenga un https://conogasi.org/diccionario/haplotipo/
rango mas alto de corte, estas enzimas de restricción 3. alelo [Internet]. Enciclonet.com. [cited 2022 Aug
dentro de los laboratorios se las puede usar dentro de 28]. Available from:
toda la ingeniería genética para determinados métodos, https://www.enciclonet.com/articulo/alelo/
para realizar muchas modificaciones genéticas, y 4. ¿Qué tipos de variantes de genes son posibles?
también estas enzimas también podrán usarse para [Internet]. Medlineplus.gov. [cited 2022 Aug 28].
realizar distintos métodos de clonación. (4) Available from:
https://medlineplus.gov/spanish/genetica/entend
La explicación desde un punto de vista genético para er/variantesytrastornos/posiblesvariantes/
que sea posible la variabilidad genética se basa en que 5. ¿Qué es una variante genética y cómo ocurren
ocurre una afectación en la cadena de DNA que las variantes? [Internet]. Medlineplus.gov. [cited
conforma a un gen. Es decir, cuando se cambian 2022 Aug 28]. Available from:
ordenes, aumento o deleciones en las bases https://medlineplus.gov/spanish/genetica/entend
nucleotídicas de la cadena del DNA. Cuando lo er/variantesytrastornos/genvariante/
mencionado ocurre, se convierte en “mutaciones”; las 6. ¿Todas las variantes genéticas afectan la salud
cuales, no todas desencadenaran en patologías, pues y el desarrollo? [Internet]. Medlineplus.gov.
esas variaciones han generado la supervivencia y [cited 2022 Aug 28]. Available from:
adaptación de las especies. La afectación de la https://medlineplus.gov/spanish/genetica/entend
conformación de un gen puede ser transmitida por sus er/variantesytrastornos/variantesneutral/
descendientes, cuando hay variaciones de genes en
células sexuales, u ocurridas en el individuo por causas
externas (contaminación, nutrición, estrés, etc.),
recordando de que estas últimas no son transmitidas a
las siguientes generaciones, las primeras sí. (5) .

Para finalizar, debemos tener en cuenta que la


presencia de variantes génicas se va a poder catalogar
de muchas maneras. En primer lugar, se podrán
catalogar como: Variantes “patogénicas”, las cuales se

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