Regulación de los niveles de proteínas dentro de las células

En las células eucariotas, dos vías principales (la vía ubiquitina - proteosoma y la proteólisis
lisosomal) median en la degradación de proteínas.

1. La vía ubiquitina-proteasoma
Utiliza la ubiquitina como marcador que se dirige a las proteínas citosólicas y nucleares
para una proteólisis rápida. Las proteínas están marcadas para su degradación
mediante la unión de la ubiquitina al grupo amino de la cadena lateral de un residuo
de lisina. Luego se añaden ubiquitinas adicionales para formar una cadena de
multiubiquitina. Estas proteínas poliubiquinadas son reconocidas y degradadas por un
gran complejo de proteasas de múltiples subunidades, llamado proteosoma. La
ubiquitina se libera en el proceso, por lo que puede reutilizarse en otro ciclo. Es de
destacar que tanto la unión de ubiquitina como la degradación de proteínas marcadas
requieren energía en forma de ATP.
2. Proteólisis lisosomal
Implica la absorción de proteínas por los lisosomas. Los lisosomas son orgánulos
rodeados de membranas que contienen una variedad de enzimas digestivas,
incluidas varias proteasas. Para ser degradadas por proteólisis lisosomal, las
proteínas celulares primero deben ser absorbidas por los lisosomas. Una vía para
esta captación de proteínas celulares, la autofagia, implica la formación de vesículas
(autofagosomas) en las que pequeñas áreas de citoplasma u orgánulos
citoplasmáticos están encerradas en membranas derivadas del retículo
endoplásmico. Para ser degradadas por proteólisis lisosomal, las proteínas celulares
primero deben ser absorbidas por los lisosomas. Una vía para esta captación de
proteínas celulares, la autofagia, implica la formación de vesículas (autofagosomas)
en las que pequeñas áreas de citoplasma u orgánulos citoplasmáticos están
encerradas en membranas derivadas del retículo endoplásmico.
Vida media de las proteínas
Con base en los cambios en la abundancia de proteínas medidos mediante el experimento
de proteómica multiplexada, podemos calcular con confianza las vidas medias de 803
proteínas. RALB es una GTPasa y participa en una variedad de procesos celulares que
incluyen la expresión genética, la migración y proliferación celular y el tráfico de
membranas. En este trabajo se midió que la vida media era de 9,4 horas. IGFBP1 es la
proteína 1 de unión al factor de crecimiento similar a la insulina, que es una proteína
secretada bien conocida. Tiene una vida media muy corta de 0,3 horas dentro de la célula
porque se secreta después de la síntesis. El contenedor a las 9 horas (vida media entre 8 y
10 h) contiene la mayor cantidad de proteínas. La mayoría de las proteínas cuantificadas
tienen vidas medias dentro del rango de 4 a 14 horas.
F5 (factor V de coagulación) tiene una vida media de 0,8 horas y APOB tiene una vida media
de 1,3 horas. Entre las proteínas de vida larga (vida media > 15 horas), los tres principales
grupos de proteínas enriquecidos se ubicaron en la mitocondria, el nucléolo y el
cromosoma.
Las histonas son otro ejemplo de proteínas típicamente de larga vida, y aquí se identificaron
varias histonas con vidas medias de más de 10 horas.
La vida media media de las proteínas ubicadas en la mitocondria es de 16,9 horas.
Al combinar este método con técnicas de proteómica cuantitativa múltiple, se cuantificaron
los cambios de abundancia de estas proteínas recién sintetizadas en la fase S después de
separarlas selectivamente en seis puntos temporales diferentes y se calcularon sus vidas
medias. La vida media media de más de 800 proteínas cuantificadas fue de 8,7 horas, lo
que se corresponde muy bien con la vida media media de 8,2 horas para 100 proteínas en
investigaciones anteriores. Las proteínas con vidas medias más cortas en las células suelen
ser secretadas, mientras que las de la mitocondria y el núcleo son de vida larga.
Diferencias entre miRNA y siRNA

siRNA miRNA

son muy específicos con un solo objetivo de

tienen múltiples objetivos
ARNm

miARN precursor (pre-miARN) que

ARN bicatenario que contiene 30 a más de contiene entre 70 y 100 nucleótidos con
100 nucleótidos desajustes intercalados y estructura en
horquilla

Dúplex de ARN de 21-23 nucleótidos con 2 ARN dúplex de 19 a 25 nucleótidos con 2

nucleótidos salientes en 3' nucleótidos salientes en 3’

Herramienta de diagnóstico y
biomarcadores

estabilidad genómica y defensa contra virus regular la expresión génica

Cooper GM. La célula: un enfoque molecular. 2da edición. Sunderland (MA): Sinauer
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