Evolución de los antepasados a partir del RESULTADOS:

análisis de ADN con bioinformática.

A partir de los siguientes resultados se pudo obtener
Argote Rosero N T 1 Caicedo Ayala DM 1, Caicedo análisis de la secuenciación de nucleótidos en el ADN de
Ceballos JA 1, Camués Tonguito GK1. diferentes especies al igual que la formación de árboles
1
Estudiantes de medicina, Facultad de salud, filogenéticos.
Universidad de Nariño.
Imagen 2: Secuencias utilizadas para la obtención del
INTRODUCCIÓN: árbol filogenético. En estas secuencias encontramos 4
secuencias de Homo sapiens y 1 secuencia Xenopus
El análisis de ADN ha revolucionado y se ha convertido Tropicalis. Archivo txt.
en una herramienta de suma importancia ya que
surgieron circunstancias que han llevado a la necesidad
de identificar diferentes especies(1), por lo que ha sido
posible analizarlas por medio de la secuenciación de
nucleótidos y la incorporación de cada nucleótido se
registra en un pirograma en el cual se puede leer la
secuencia del ADN sintetizado, observando en la altura
de los picos de cada pirograma siendo proporcional al
número de nucleótidos presentes en la secuencia. (2) Por
medio de la secuencia de estos nucleótidos se pueden Imagen 3: Secuencias Copiadas en BioEdit. Llamada
ILB1 en formato Fasta
también crear arboles filogenéticos y su evolución
incrementara en el estudio de diferentes especies
reflejándose los verdaderos eventos evolutivos que
ocurrieron en estas, esencialmente al considerar la
diversidad de los organismos, la evolución de genes y
familias génicas. (3)
METODOLOGIA:
Para el desarrollo de esta práctica de bioinformática,
respecto al análisis de secuencias de ADN en diferentes
especies que permite identificar por medio de un proceso
de secuenciación las características genéticas que se
Imagen 4: Classifier de las secuencias, descargado en
deseen analizar, seguida de una serie de pasos txt y pasado a Excel.
especificados en el siguiente diagrama de flujo.

Imagen 1: Diagrama de flujo. Análisis de secuencias de

ADN usando los programas BioEdit RDP ii y Mega 5.0

Imagen 5: Secuencia 1LB1 pasada a formato

seqtmatch, descargarda en txt resiltados reflejados en
Excel

Huertas M, Álvarez S, Solarte C, Guerrero M, Souza G, Lagos J, LagosL.

Manual de laboratorio de biología molecular [Internet] 2017(4)
Imagen 6: Descomposición de nucleótidos. Estas Imagen 10: Árbol filogenético construido con los datos
graficas nos indica el porcentaje de cada nucleótido (T, de estudio Parsimonia usando Mega
A, C, G) que tiene cada especie.

Imagen 7: Visualización del resultado de acuerdo con Imagen 11: Árbol filogenético construido con los datos
el número de KNN Matches que fue escogido. de estudio Mínimum Evolution usando Mega.

Imagen 12: Árbol filogenético construido con los datos

de estudio UPGMA usando Mega.
Imagen 8: Secuencias de interés y secuencia genbank.

Imagen 13: Árbol filogenético construido con los datos

Imagen 9: Obtención de secuencias para leer en Mega de estudio Neiborg Joining usando Mega.
y así poder formar el árbol filogenético.

DISCUCIÓN:

Un árbol filogenético es un esquema que muestra las

relaciones evolutivas entre varias especies u otras entidades
que se cree que tienen una descendencia en
común, también nos indica cuales son las distancia entre ellas.
Para los análisis de los árboles filogenéticos podemos
encontrar diferentes métodos entre ellos el UPGMA este
método asume que las especies son grupos de sí mismos, luego
relaciona los grupos más cercanos fundamentados en la matriz
de distancias, el Neighbor Joining es un método basado en el
criterio en el que denomina evolución, por lo que en este se
procura minimizar la longitud de las ramas y finalmente el
método de parsimonia explica la filogenia de un grupo con el
menor número de cambios evolutivos, su premisa básica es
que los taxa comparten una similitud y lo hacen porque
heredaron esa característica de un ancestro en común.(5)
Es importante abarcar cual es la diferencia entre una
similaridad genética y una homología genética para entender
el resultado de un árbol filogenético. La homología genética se
refiere a las secuencias de proteínas o ácidos nucleicos que
tiene un gran parentesco debido a un mismo origen evolutivo o
un antepasado en común, para determinar la homología de
secuencias es necesario llevar un alineamiento, ya que esto nos
ayuda a comparar las secuencias en las que se resaltan zonas
de similitud las cuales determinan las relaciones entre los
genes. En cambio, la similaridad genética nos indica que las
secuencias de nucleótidos tienen una gran semejanza, pero
más sin embargo no poseen un antepasado en común.
Por ende, es necesario e importante definir los criterios
técnicos que simbolizan la raíz interna y externa en un proceso
investigativo de alguna especie, con el objetivo que en los
resultados de la investigación sean válidos a nivel
interpretativo y de aplicabilidad externa, de esta maneras los
resultados que se obtengan expliquen a la realidad por lo cual
la raíz interna busca la coherencia técnica entre lo explicativo
y su dependiente, mientras que la externa mide la capacidad
que tienen los resultados para poder adaptarse a la realidad
pudiendo clasificar así diferencias entre nuevas especies. (6)
Por otro lado, es de gran importancia la edición de
cromatogramas para obtener buenos resultados, por medio de
un buen procedimiento de separación en propiedades físicas de
ciertos materiales, sometidas a interacciónes con sustancias
químicas, siendo asi posible analizar sus constituyentes en un
proceso llamado cromatografía, los compuestos eluidos pasan
a través de los detectores donde son registrados como picos y
le dan la identidad como cromatograma, donde se realizan las
representaciones gráficas con respecto a la concentración de
los resultados obtenidos por la técnica usada como una medida
de concentración en función del volumen de este o del tiempo.
Para la edición de los cromatogramas se debe tener en cuenta
que el tiempo de retención se mantenga constante bajo
condiciones cromatográficas idénticas y así este poder ser
usado para la identificación de compuestos, al igual que la
temperatura es importante en la resolución de estas, la
velocidad del flujo u partícula; el cromatograma es usado para
evaluar la eficiencia en la separación y la eficiencia de la
columna. (7)
La sistemática filogenética, al estudiar la historia evolutiva de
los organismos, trata de identificar esos grupos monofiléticos
y la taxonomía los usa para establecer los diferentes taxones u
especies por lo que es posible diferenciar y conocer más de sus
ancestros y generaciones actuales o pasadas; su morfologia es
de gran importancia en el estudio de la biologia molecular por
lo cual se puede reconocer la estructura y función de estos
organismos buscando mutaciones que se pueden dar durante
su evolución, estas filogenias son plasmadas en arboles
filogeneticos que para su creacion es muy importante tener en
cuenta una especie determinada al igual que sus antepasados y
el que implique menor número de pasos para establecer las
relaciones de parentesco, por lo cual la construccion del arbol
filogenetico más sencillo será la reconstrucción más probable.
(8)
BIBLIOGRAFIA
1. García L. Genes y evolución el delgado hilo que nos
conecta por miles de millones de años. [Internet]
2011 (28 junio 2011); 71-87 (18). Disponible en:
https://www.redalyc.org/pdf/3190/
2. Posik D, Drummond M, Dalsecco L, Pimenta D,
Andrade D, Giovambattista G. Identificación especie-
específica en animales domésticos. [Internet] 2015;
163-185 (23). Disponible en:
https://ri.conicet.gov.ar/bitstream/handle/11336/
3. Aviles G. Análisis filogenético de las especies.
[Internet] 2017 (28 junio 2017); 1-68(83). Disponible
en: https://cicy.repositorioinstitucional
4. Huertas M, Álvarez S, Solarte C, Guerrero M, Souza
G, Lagos J, Lagos L. Manual de laboratorio
debiología molecular [Internet] 2017 Disponible
en:https://sired.udenar.edu.
5. Bear R, Rintoul D, Snyder B, Smith-Caldas M,
Herren C, Horne E. Taxonomía y filogenia. (26 de
Julio de 2013) Disponible en:
https://cnx.org/contents/24nI-KJ8@24.18:Ey
6. Freire C. La validez interna y externa de una
investigación cualitativa. [Internet] 2015 (27 marzo
2015); 35-38(4). Disponible en: file:///C:/Users/Asus-
Pc/Downloads/Dialnet-
7. Passaro C, Rivera C, Roman M, Cardona L, Muñoz
L, Quiceño J. [Internet] 2016 (octubre 2016) 1-50
(50). Disponible en:
https://repositorio.sena.edu.co/bitstream/handle/
8. Arija C. Taxonomía, Sistemática y Nomenclatura,
herramientas esenciales en Zoología. [Internet] 2012
(22 junio 2012) 1-10 (10). Disponible en:
https://www.redalyc.org/pdf/636/63624404021.p