FUNDACIÓN UNIVERSIDAD DE AMÉRICA

TALLER TERCER CORTE

Asignatura: Bioquímica.
Fecha: mayo de 2021.
Docente: David Leonardo Sotelo.
Valor en el segundo corte: 30 %

Nombre: Juan Diego Walteros Martin Código

I. Identificación de una proteína.

1. Empleando el archivo fasta correspondiente su último número de código y marcado como proteína principal, llene la
información de la siguiente tabla:

Nombre de la proteína Pyruvate Kinase Isoform L-type with phosphorylated Ser12 (pS12) in complex with FBP
Longitud de cadena 550
Organismo Rattus norvegicus
% de cobertura en Blast 100%
e-value 0.0
Código PDB 6ECH

Estructura 3D

Estructura secundaria Alfa hélices

predominante
Ubicación celular Citosol, membrana plasmática, citoplasma
Número de subunidades 4
Describa la función de la
proteína Esta proteína está involucrada en el paso 5 de la subvía que sintetiza piruvato a partir de D-gliceraldehído 3-fosfato.
por similitud Esta subvía forma parte de la vía de la glucólisis, que a su vez forma parte de la degradación de los
hidratos de carbono.

Vea todas las proteínas de este organismo que se sabe que están involucradas en la subvía que sintetiza piruvato a partir
D-gliceraldehído 3-fosfato , la vía de la glucólisis y en la degradación de carbohidratos .
 2. Empleando el archivo fasta correspondiente su último número de código y marcado como proteína secundaria, llene
la información de la siguiente tabla:

Nombre de la proteína La estructura del piruvato quinasa hepática humana, hLPYK-S531E

Longitud de cadena 543
Organismo Homo sapiens
% de cobertura en Blast 100%
e-value 0.0
Código PDB 6NN8_A

Estructura 3D

Estructura secundaria Alfa hélices

predominante
Ubicación celular Citosol, citoplasma
Número de subunidades 4

Esta proteína está involucrada en el paso 5 de la subvía que sintetiza piruvato a partir de
D-gliceraldehído 3-fosfato.1 publicaciónEsta subvía forma parte de la vía de la glucólisis,
que a su vez forma parte de la degradación de los hidratos de carbono.
Describa la función de la
proteína Vea todas las proteínas de este organismo que se sabe que están involucradas en
la subvía que sintetiza piruvato a partir de
D-gliceraldehído 3-fosfato , la vía de la glucólisis y en la degradación de carbohidratos .
II. Identificación de homología.

1. Consulte el termino homología, busque asociarlo a la comparación de dos proteínas.

Homología: el termino quiere decir que es el estudio comparativo de secuencias según la proteína la cual plantea
que es la relación de dos organismos distintitos pero que tienen similitudes genéticas de la misma raíz de la
evolutiva.

2. Realice un alineamiento de ambos archivos fasta y determine si existe homología o no entre ambos organismos.

Clustal Omega realiza la comparación de secuencias de estas dos proteínas la cual se determina que hay homología
entre ambos organismos esto quiere decir que mantenemos un ancestro en común a raíz evolutiva.

Bases de datos usadas

https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi

https://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo/