Informe sobre Bases de datos

Estudiante: Maria Ferrera

Asignatura: Bioinformática

Docente: Edian Franco

Santo Domingo, D. N., Rep. Dom

1/ Noviembre/ 2023
 Secuencias seleccionadas del archivo:

Secuencia #1

>SEq9

MGLSDGEWQLVLNIWGKVETDLAGHGQEVLIRLFKNHPETLDKFDKFKHLKT

EDEMKGSEDLKKHGNTVTALGGILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPVKYLE

FISDAIIQVLQSKHSGDFHADTEAAMKKALELFRNDIAAKYKELGFQG

Base de datos usadas: UniProt, InterPro, Prosite

Análisis en Uniprot

Identificación de la proteína: Mioglobina

Gen asociado: MEGABYTE

Estado: UniProtKB revisado (Swiss-Prot).

Organismo: Vulpes chama (Cape Fox)

Longitud de la proteína: 154 aminoácidos.

Existencia de proteínas: Evidencia a nivel de proteínas.

Puntuación de anotación: 3/5.

Función: Sirve como reserva de oxígeno y facilita el movimiento del oxígeno

dentro de los músculos.

Adhesión primaria: P02160

Familia a la que pertenece: Globinas

 Análisis en InterPro

Longitud: 153 aminoácidos

Clasificación de familia de proteína: Mioglobina.

Componente celular: Exosoma extracelular

Función molecular: Unión de oxígeno.

Análisis en Prosite

Familia: Globina

Longitud: 153 aminoácidos

Similitudes y diferencias: La longitud de la proteína es similar en el análisis de Prosite

e InterPro, en UniPro la diferencia es de 1 aminoácido. En InterPro nos especifica que la

familia a la que pertenece la proteína es la Mioglobina y el dominio es globina, sin

embargo, en los demás buscadores, por ejemplo, nos aparece que la familia es globina

Secuencia #2

>SEq14

Atgggcctgagcgatggcgaatggcagctggtgctgaacgcgtggggcaaagtggaagcggatgtggcgggccatggcc

aggaagtgctgattcgcctgtttaccggccatccggaaaccctggaaaaatttgataaatttaaacatctgaaaaccgaagcgg

aaatgaaagcgagcgaagatctgaaaaaacatggcaacaccgtgctgaccgcgctgggcggcattctgaaaaaaaaaggc

catcatgaagcggaagtgaaacatctggcggaaagccatgcgaacaaacataaaattccggtgaaatatctggaatttattagc

gatgcgattattcatgtgctgcatgcgaaacatccgagcgattttggcgcggatgcgcaggcggcgatgagcaaagcgctgg

aactgtttcgcaacgatatggcggcgcagtataaagtgctgggctttcatggc
 Análisis en Prosite

Proteína identificada: Unión de hierro-azufre de tipo Ferredoxina

Subfamilia de la proteína: Adrenodoxinas

Análisis en UniProt

Proteína: Mioglobina

Gen: Megabyte

Estado: UniProtKB revisado (Swiss-Prot)

Organismo: Bison bison (American bison) (Bos bison)

Longitud: 154 aminoácidos

Existencia de Proteínas: Evidencia a nivel de proteínas.

Puntuación de anotación: 3/5

Función: Sirve como reserva de oxígeno y facilita el movimiento de oxígeno dentro de

los músculos.

Análisis en InterPro

Longitud: 462 aminoácidos

Pertenencia a la familia de Proteínas: Ninguno previsto

Similitudes y Diferencias: La longitud correspondiente a los aminoácidos varió

considerablemente al realizar los análisis en las diferentes bases de datos, los nombres y

familias de las proteínas no correspondieron.

Secuencia #3

>pSEq5

MGLSDGEWQLVLNVWGKVEADVAGHGQEVLIRLFKGHPETLEKFDKFKHLKS

EDEMKASEDLKKHGNTVLTALGGILKKKGHHEAELTPLAQSHATKHKIPVKYL

EFISEAIIQVLQSKHPGDFGADAQGAMSKALELFRNDMAAKYKELGFQG

Análisis en Uniprot

Proteína: Mioglobina

Gen: MEGABYTE

Estado: UniProtKB revisado (Swiss-Prot)

Organismo: Sus scrofa (Pig)

Longitud: 154 aminoácidos

Evidencia de proteínas: Evidencia a nivel de proteínas

Puntuación de anotación: 3/5

Función: Sirve como reserva de oxígeno y facilita el movimiento del oxígeno dentro de

los músculos.

Identifica taxonómico: 9823 NCBI

Análisis en InterPro

Longitud: 154 aminoácidos

Pertenencia de familia de proteínas: Mioglobina

Dominio: Globina

Términos de InterPro Go:

Proceso biológico: Transporte de Oxígeno.

Función molecular: Unión de oxígeno, unión hemo.

 Componente celular: Ninguno.

Términos de Panther Go:

Proceso biológico: Transporte de Oxígeno

Función molecular: Unión de Oxígeno

Componente celular: Exosoma extracelular

Análisis en Prosite

Usuario: Globina

Longitud: 154 aminoácidos

Puntuación: 43.041