Universidad Autónoma de Querétaro

Ingeniería en biotecnología

Laboratorio de Bioinformática
REPORTE 6
Identificación de secuencias genéticas reguladoras y codificantes

Dra. en C. Ana Gabriela Hernández Puga

Juárez Solís Rubén Alexis
 1. INTRODUCCIÓN
Un marco abierto de lectura, en lo que se refiere a la genómica, es una porción de una secuencia de
ADN que no incluye un codón de terminación (que funciona como una señal de detención). Un codón
es una secuencia de ADN o ARN de tres nucleótidos (un trinucleótido) que forma una unidad de
información genómica que codifica para un aminoácido determinado o señaliza la terminación de la
síntesis de una proteína (codón de terminación). Hay 64 codones diferentes: 61 especifican
aminoácidos y 3 se usan como codones de terminación. Un marco abierto de lectura largo es, con
frecuencia, parte de un gen (es decir, una secuencia que directamente codifica una proteína).

2. OBJETIVO

• Identificar los marcos abiertos de lectura en una secuencia genética.

• Interpretar la información obtenida en un contexto biológico.

3. RESULTADOS
Evidencia 2.
Investiga los ORF´s de la siguiente secuencia
ATCCTCCGTCTGGATCTGGCTGGCCGTGACCTGACGGACTACCTCATGAAGATCCTGACAGAGAGAGGCTACA
GCTTCACCACCACAGCCGAGAGAGAAATTGTGCGTGACATCAAGGAGAAGCTGTGCTACGTCGCACTGGATTT
CGAGCAGGAGATGGCCACAGCTGCCTCTAGCTCTTCCCTGGAGAAGAGCTATGAACTCCCTGATGGTCAGGTC
ATCACCATTGGCAATGAGAGGTTCAGGTGCCCCGAGGCCCTCTTCCAGCCATCTTTCTTGGGTATGGAGTCCT
GTGGTATCCATGAAACTACCTTCAACTCCATCATGAAGTGTGATGTGGATATCCGTAAGGATCTGTATGCCAA
CACAGTGCTGTCTGGTGGTACCACAATGTACCCTGGCATTGCTGACAGGATGCAGAAGGAGATCACAGCCCTG
GCACCTAGCACAATGAAAATCAAGATCATTGCCCCACCTGAGCGCAAGTACTCTGTCTGGATTGGAGGCTCTA
TCCTGGCCTCCCTGTCCACCTTCCAGCAGATGTGGATCAGCAAGCAGGAGTACGATGAATCCGGACCCTCCAT
TGTCCACCGCAAATGCTTCTAA

Realiza una comparación con las secuencias reportadas (SmartBLAST) de los diferentes ORFs. De
acuerdo con tu razonamiento científico, identifica la proteína con la que tiene mayor identidad o
parecido estructural

ORF name Strand Start Stop Lenght Proteína de

mayor
homología
ORF 1 + 46 606 561 / 186 actin,
cytoplasmic 2
isoform 2 [Mus
musculus]
 Evidencia 3.
Investiga los posibles ORF´s de los genes de interés y reporta lo siguiente:

NC_011604
Gen ORF name Strand Start Stop Lenght Proteína de
mayor
homología
ORF 17 + 5841 6767 927/308 beta-
NC_011604 lactamase
Salmonella precursor
(putative
enterica hydrolase)
plasmid [Bacillus
subtilis subsp.
subtilis str.
168]
83%

4. Conclusión
El buscador de marcos de lectura abiertos (ORF) en la secuencia de DNA que ingresa. El programa
analiza el rango de cada ORF, junto con su traducción de proteínas. Este buscador de ORF nos sirve
para buscar segmentos de codificación de proteínas potenciales en el DNA de interes, y también
podemos verificar las proteínas con la función SMART BLAST.