EXAMEN UNIDAD 1

BIOQUÍMICA

Daniel Andrés García, David Zuluaga, Sara Gineth Aguirre Guarín

*Departamento de Ingeniería Química, Facultad de Ingeniería y Arquitectura, Universidad Nacional de Colombia

Manizales, Colombia

FUNCIONAMIENTO DEL SISTEMA Y POSIBLE SECUENCIA DE ADNds

1. PROPUESTA DEL SISTEMA

Se propone un sistema inducible con control negativo:

Inicialmente, el microorganismo expresa tanto el gen que contiene la información genética de la permeasa,
como el de la hidrolasa y la proteína reguladora.
La hidrolasa generada, se encarga de fragmentar el hidrocarburo que se encuentra fuera de la membrana
celular; posteriormente, la permeasa permite el paso de los fragmentos de hidrocarburo al interior de la célula.

5’ 3’
P1 O
Gen PM Gen HL P1 Gen PR Gen HC1 Gen HC2 Gen HC3
P2
3’ 5’

Proteína reguladora activa Hidrocarburos

fragmentados (Sustrato)

Inicialmente, la proteína reguladora se encuentra activa e impide la transcripción del DNA, ya que se ‘adhiere’
a la región operadora.
5’
3’
Gen HC3
3’P1 Gen PM Gen HL P1 Gen PR
P2 O
Gen HC1 Gen HC2
5’

Proteína reguladora
inactiva
 Parcial I.

Posteriormente, el sustrato se une con la proteína reguladora, formando así un complejo, y la separa de la
cadena de DNA; de esta manera, la proteína reguladora se inactiva. Como consecuencia de esto, la región
operadora quedará ‘descubierta’ y la RNA polimerasa podrá transcribir el DNA.

5’ 3’

3’ 5’
RNA polimerasa

Gracias al paso de la RNA polimerasa, se lleva a cabo la transcripción de los genes HC1, HC2 y HC3.
Posteriormente se traduce el RNAm, que fue producido en la transcripción, en el ribosoma.

RNA mensajero

Ribosoma

Una vez que se ha realizado la traducción, las proteínas producidas son sometidas a un proceso de corrección
post-traduccional, con el fin de que queden disponibles en el medio las enzimas HC1, HC2 y HC3. Dichas
enzimas serán las catalizadoras de las siguientes reacciones bioquímicas:

Sustrato HC 1 Producto 1Producto 1 HC 2 Producto 2Producto 2 HC 3 Potencialis

→ → →

Dado que el sustrato inicial va a ir disminuyendo a medida que las reacciones avanzan, se llega a un punto en
el cual el sustrato desaparece del medio; por esta razón, la proteína reguladora volverá activarse y por ende, se
posicionará nuevamente en la región operadora, impidiendo la transcripción del fragmento de DNA que tiene
la información genética de las enzimas HC1, HC2 y HC3. Como consecuencia de esto, no habrá producción
de dichas enzimas.

2. SECUENCIA DE DNAds

Composición de los aminoácidos de las proteínas:

Permeasa: METE

Abreviatura de M E T E Codón
 Parcial I.

una letra parada

Abreviación de Met Glu Thr Glu -
tres letras
Fragmento en el AUG GAA ACU GAA UAA
RNAm (codón)
(5’-3’)
Fragmento en el TAC CTT TGA CTT ATT
ADN (3’-5’)

Hidrolasa: CLIVA

Abreviatura de Codón C L I V A Codón

una letra de de
inicio parada
Abreviación de - Cys Leu Ile Val Ala -
tres letras
Fragmento en el AUG UGU UUA AUU GUU GCU UAA
RNAm (codón)
(5’-3’)
Fragmento en el TAC ACA AAT TAA CAA CGA ATT
ADN (3’-5’)

Proteína reguladora: MIDE

Abreviatura M I D E Codón de
de una letra parada
Abreviación Met Ile Asp Glu -
de tres
letras
Fragmento AUG AUU GAU GAA UAA
en el
RNAm
(codón) (5’-
3’)
Fragmento TAC TAA CTA CTT ATT
en el ADN
(3’-5’)

HC1: TRATA

Abreviatura Codón T R A T A Codón

de una letra de de
inicio parada
Abreviación - Thr Arg Ala Thr Ala -
de tres
letras
Fragmento AUG ACU CGU GCU ACU GCU UAA
en el
RNAm
 Parcial I.

(codón) (5’-
3’)
Fragmento TAC TGA GCA CGA TGA CGA ATT
en el ADN
(3’-5’)

HC2: CREMA

Abreviatura Codón C R E M A Codón

de una letra de de
inicio parada
Abreviación - Cys Arg Glu Met Ala -
de tres
letras
Fragmento AUG UGU CGU GAA AUG GCU UAA
en el
RNAm
(codón) (5’-
3’)
Fragmento TAC ACA GCA CTT TAC CGA ATT
en el ADN
(3’-5’)

HC3: PELA

Abreviatura Codón de P E L A Codón

de una letra incio de
parada
Abreviación - Pro Glu Leu Ala -
de tres letras
Fragmento en AUG CCU GAA CUU GCU UAA
el RNAm
(codón) (5’-
3’)
Fragmento en TAC GGA CTT GAA CGA ATT
el ADN (3’-
5’)

Ahora, se representa la cadena de ADN completa:

5’ 3’
G C G A T A A T G G A A A C T G A A T A A A T G T G T T T A A
3’ 5’
Parcial I.