Planeación del Docente en línea

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Bioinformática
Unidad 1. Introducción a la Bioinformática

Ingeniería en Biotecnología
Bloque 1 Semestre 2022-2

Unida

Universidad Abierta y a Distancia de México | DCSBA 3

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Nombre del docente: DR Jonathan Puente Rivera

Correo del docente: jonathan.puenteriv@nube.unadmexico.mx

Matrícula: DL21PURJ00071

Asignatura:Bionformática
Unidad: U.1
Competencia general de asignatura: Desarrollar las técnicas de adquisición, manipulación, comparación y
análisis de secuencias de nucleótidos y de proteínas mediante el empleo de software basado en algoritmos de
búsqueda y comparación, con el fin de interpretar la información biológica y aplicarla en la producción de
proteínas o metabolitos con potencial biotecnológico.

Competencia específica de la unidad: Analizar la utilidad del uso de recursos informáticos actuales para
almacenar, acceder y obtener información biológica del gran número de datos generados en los últimos años, a
partir del estudio del contexto histórico

Secuencia de trabajo:
1. Leer contenido de unidad 1
2. Revisar la planeación docente de la unidad 1
3. Entrar al Foro de Dudas
4. Revisar materiales y recursos (tanto los de los contenidos como los propuestos por el docente)
5. Participar en el foro de la Actividad 1. “Foro de construcción del conocimiento”
6. Elaborar y enviar Actividad 2.
7. Elaborar y enviar la Evidencia de Aprendizaje.
8. Elaborar y enviar Autorreflexión de la U1.

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Actividad 1. Foro. Bases de datos de la Bioinformática

Fecha de entrega: viernes 15 de junio de 2022 (23:50)

Instrucciones
1. Lee el contenido de la unidad 1.
2. Publica una participación en el foro “Foro de construcción del conocimiento”, que incluya:
a). Respuesta a la pregunta:
 ¿Por qué son importantes las bases de datos para la Bioinformática?
 Apóyate de fuentes confiables para responder, pero redacta la información con
tus propias palabras, emplea al menos 200 palabras para responder.
1. Cuida la redacción, gramática y ortografía.
2. Retroalimenta de manera enriquecedora la participación de al menos a uno de tus
compañeros. No se permiten citas literales de texto, pero si tienen que señalarse las
fuentes consultadas, NO utilizar como fuente bibliográfica principal el material de la
UnADM y tampoco se tomarán como participaciones válidas comentarios sencillos
como: “estoy de acuerdo contigo compañero”, “me parece muy interesante”, “opino lo

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mismo que mi compañero”. Es importante seguir estas recomendaciones.

3. Argumenta tu participación en el foro y refuerza con fuentes confiables.
4. Cita las referencias en formato APA. No utilizar material de apoyo de la UnADM como
fuente de referencia bibliográfica.
NOTA: NO SE ACEPTAN LAS RESPUESTAS EN ARCHIVO ADJUNTO. No adjuntar archivos de
ningún tipo.
*Cualquier actividad en la que se detecte plagio será penalizada.
**Recuerda ser respetuoso y seguir las normas de convivencia del foro.
IMPORTANTE: Para que tu aportación en el foro sea evaluada esta deberá estar escrita dentro del
foro, NO se evaluarán respuestas enviadas como archivos adjuntos (Word, pdf, ppt, etc).
La retroalimentación a esta actividad será de manera grupal en el mismo foro una vez concluida
la unidad.

Criterios de evaluación
Criterio valor
Responde correctamente la pregunta planteada empleando al menos 200
palabras de tus propias palabras, no citando literalmente información 70 %
pero si utilizando referencias bibliográficas.
Retroalimenta de manera enriquecedora a al menos a 1 de sus
compañeros, de forma respetuosa, haciendo énfasis en los aspectos 20 %
mencionados.
Ortografía y sintaxis correctas 5%
Incluye las referencias bibliográficas en formato APA y no utiliza
5%
material de la UnADM.
Total 100%
Materiales de apoyo
1. Bioinformática: una oportunidad y un desafío
https://revistas.unal.edu.co/index.php/biotecnologia/article/viewFile/1403/2089
2. Introducción a la informática:
http://biolab.uspceu.com/aotero/recursos/docencia/TEMA%201.pdf

Software de apoyo
No aplica

Actividad 2. Bases de datos Bioinformáticas

Fecha de entrega puntual: viernes 22 de julio de 2022 (23:50)
Fecha de entrega tardía: viernes 29 de julio de 2022 (23:50)

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Instrucciones
Lee los contenidos de la unidad 1.
Elabora un tríptico en el que presentes que son las Bases de Datos Bioinformáticas. Tu tríptico debe
incluir la siguiente información:
a). Concepto de Bioinformática.
b). Concepto de Base de datos bioinformática.
c). Utilidad de las bases de datos.
d). Clasificación de las bases de datos bioinformáticas.
e). Descripción de algunos ejemplos de bases de datos bioinformáticas.
• Apóyate con imágenes, gráficos, esquemas, etc. para elaborar tu tríptico.
El tríptico lo deberás realizar mediante la herramienta gratuita de VENNGAGE disponible en internet:
https://infograph.venngage.com/signin
1. Una vez que terminaste tu tríptico en Venngage, integra un documento de Word con lo
siguiente:
a. Portada con los siguientes elementos: Nombre de la universidad, carrera,
nombre de la asignatura, grupo, nombre de la unidad, nombre de la actividad,
nombre del alumno, matrícula y fecha en que se entrega la actividad. NO
AÑADIR LOGO DE LA UnADM.
b. Inserta la imagen de tu tríptico, En caso de que el programa no te permita
exportarla como imagen, utiliza impresión de pantalla con una resolución
adecuada.
c. Cita las referencias bibliográficas en formato APA. No utilizar material de
la UnADM como fuente bibliográfica.
2. Guarda la actividad en un documento PDF (.pdf) con la nomenclatura
BIIN_U1_A2_XXYZ. (Sustituir las “XX” por las dos primeras letras de tu primer nombre, la “Y” por
la inicial de tu primer apellido y la “Z” por la inicial de tu segundo apellido).
3. Envía tu documento a la sección correspondiente en el aula virtual. IMPORTANTE: NO se
evaluaran actividades entregadas en cualquier otro formato diferente a PDF.
4. De ser necesaria, espera una realimentación de parte docente. En caso de que éste lo solicite,
ajusta tu documento y vuélvelo a enviar.

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5. Revisa la rúbrica de evaluación de esta actividad incluida en este documento, para que
identifiques la totalidad de elementos que serán valorados en tu trabajo.
6. Actividades entregadas después de la fecha indicada se calificarán con 0.0.
NOTA: Apóyate de fuentes confiables de información, pero debes redactar con tus propias palabras.
Recuerda que tu documento no deberá pesar más de 5 MB. Cualquier actividad en la que se detecte
plagio será penalizada. NO se permite solo colocar enlaces en el documento hacia programas
donde se realizó la infografía.

Criterios de evaluación
Criterio Puntaje
La portada contiene los datos requeridos, sin logo de la UnADM. 10 %
Realiza tríptico en Venngage 10 %
Comparte enlace para visualizar tríptico en línea y este es funcional 10 %
El tríptico presenta la siguiente información:
-Concepto de Bioinformática.
-Concepto de Base de datos bioinformática.
-Utilidad de las bases de datos. 50 %
-Clasificación de las bases de datos bioinformáticas.
-Descripción de algunos ejemplos de bases de datos
bioinformáticas.
Utiliza imágenes, gráficas, cuadros, esquemas 10 %
Ortografía y sintaxis correctas. 5%
Incluye la(s) referencia(s) bibliográfica(s) en formato APA y no cita 5%
material de apoyo de la UnADM como fuente bibliográfica.
Total 100%
Materiales de apoyo
1. Bioinformática: tecnologías de la información al servicio de la biología y otras ciencias:
https://dialnet.unirioja.es/descarga/articulo/5665689.pdf

Software de apoyo:
Venngage
https://infograph.venngage.com/signin

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Evidencia de aprendizaje: Búsqueda de secuencias de interés

Fecha de entrega puntual: viernes 29 de julio de 2022 (23:50)
Fecha de entrega tardía: viernes 05 de agosto de 2022 (23:50)

Instrucciones

La búsqueda de secuencias de interés en diferentes bases de datos es una tarea común en

Bioinformática. Prácticamente, consiste en recuperar una secuencia de nucleótidos o de aminoácidos
de una base de datos.
En esta actividad, recuperaremos la información que ofrece GenBank sobre el gen PFK1 de
Saccharomyces cerevisiae (NM_001181369.1)
1. Ingresa a la página web de National Center for Biotechnology Information:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
2. Busca la secuencia de nucleótidos identificada como NM_001181369.1. Para realizar esta
búsqueda te puedes apoyar en el microtutorial, https://www.youtube.com/watch?v=axcAutNQ4CY .
No olvides tomar impresión de pantalla del proceso de búsqueda.
3. Guarda la secuencia de nucleótidos encontrada en un fichero de texto en formato FASTA.
Para generar el fichero de texto apóyate en el microtutorial,
https://www.youtube.com/watch?v=AQdfOWBSJjw .
4. Elabora un documento de texto (.docx), en letra Times new roman 12 que incluya:
a). Portada con los siguientes elementos: Nombre de la universidad, carrera, nombre de la asignatura,
grupo, nombre de la unidad, nombre de la actividad, nombre del alumno, matrícula y fecha en que se
entrega la actividad. NO AÑADIR LOGO DE LA UnADM.
b). Impresiones de pantalla del proceso de búsqueda de nucleótidos que realizaste (Indica con
subtítulos a qué corresponde cada impresión).
c) Secuencia de nucleótidos en formato FASTA.
d) Una vez que has realizado y documentado la búsqueda de la secuencia de nucleótidos es momento
de analizar los resultados obtenidos, para lo cual deberás completar la información de la siguiente
tabla.

Nombre del campo Tipo de información que proporciona Resultado en nuestra búsqueda

Locus
Definition
Accesion

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Version
Keywords
Source
Organism
Reference
Comment

e). En la sección FEATURES encontraras la descripción de las regiones del gen y las propiedades
biológicas que se han identificado en la secuencia de nucleótidos. De acuerdo con los resultados de la
búsqueda completa la siguiente tabla.

Campo Tipo de información que proporciona Resultado de la búsqueda

Source
Gene
CDS

5. Realiza una conclusión de la actividad.

6. Cuida ortografía, redacción y cita las fuentes en formato APA. No utilizar ni citar material de
apoyo de la UnADM como fuente bibliográfica principal.
7. Guarda la actividad en formato PDF (.pdf) con la nomenclatura BIIN_U1_EA_XXYZ.
(Sustituir las “XX” por las dos primeras letras de tu primer nombre, la “Y” por la inicial de tu primer
apellido y la “Z” por la inicial de tu segundo apellido).
8. Envía tu documento a la sección correspondiente en el aula virtual. IMPORTANTE: NO se
evaluaran actividades entregadas en cualquier otro formato diferente a PDF.
9. De ser necesaria, espera una realimentación de parte docente. En caso de que éste lo solicite,
ajusta tu documento y vuélvelo a enviar.
10. Revisa los criterios de evaluación de esta actividad incluida en este documento, para que
identifiques la totalidad de elementos que serán valorados en tu trabajo.
11. Actividades entregadas después de la fecha indicada se calificarán con 0.0.
NOTA: La materia de Bioinformática tiene la particularidad de que la mayoría de los recursos de
trabajo se encuentran en inglés. Evita utilizar la traducción automática (del navegador o traductores en
línea) pues los resultados que te muestra no son precisos ni especializados en el tema, hay términos
que se muestran con significados diferentes y ajenos a este campo de conocimiento, que pudieran
distorsionar tu conocimiento de los mismos, por lo que es indispensable que te familiarices con la
terminología en inglés. Cualquier duda en conceptos pueden consultarme por los medios que ya les

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proporcioné.
IMPORTANTE: Apóyate de fuentes fidedignas de información, pero debes redactar con tus propias
palabras. Recuerda que tu documento no deberá pesar más de 5 MB. Cualquier actividad en la que se
detecte plagio será penalizada con calificación 0.0 y sin derecho a segundo intento de envío.

Criterios de evaluación
Criterio Puntaje
La portada contiene los datos requeridos. No utiliza logo de la 10 %
UnADM.
Se presentan todas las capturas de pantalla con la información 20 %
solicitada.
Presenta la secuencia correcta de nucleótidos. 30 %
Completa la información de las tablas correctamente 20 %
Conclusión de la actividad 10 %
Ortografía, sintaxis correctas 5%
Incluye la(s) referencia(s) bibliográfica(s) en formato APA y 5 %
no cita material de la UnADM.
Total 100%
Materiales de apoyo

1. https://www.youtube.com/watch?v=axcAutNQ4CY
2. https://www.youtube.com/watch?v=AQdfOWBSJjw .

Software de apoyo
1. Bases de datos del National Center for Biotechnology Information:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/

Autorreflexión Unidad 1
Fecha de entrega: 31 de julio de 2022 (23:50)

Instrucciones

1. Elabora un documento, en letra Times new roman 12 (de máximo 2 cuartillas con la portada
incluida), que incluya:
a). Portada con los siguientes elementos: (Nombre de la universidad, , carrera, nombre de la
asignatura, grupo, nombre de la unidad, nombre de la actividad, nombre del alumno, matrícula y fecha
en que se entrega la actividad.

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b) Respuesta a la pregunta: ¿Por qué considero que es importante el estudio de la bioinformática

para la Biotecnología?
c). Respuesta a la pregunta: ¿Cuál es la importancia de saber utilizar las bases de datos
Bioinformáticas?
2. Cuida ortografía, redacción y citar las fuentes en formato APA. No utilizar material de la UnADM.
3. Guarda la actividad en formato de texto PDF (.pdf) con la nomenclatura BIIN_U1_ATR_XXYZ.
(Sustituir las “XX” por las dos primeras letras de tu primer nombre, la “Y” por la inicial de tu primer
apellido y la “Z” por la inicial de tu segundo apellido).
4. Envía tu documento a la sección correspondiente en el aula virtual. IMPORTANTE: NO se
evaluaran actividades entregadas en cualquier otro formato diferente a PDF.
5. De ser necesaria, espera una realimentación de parte docente. En caso de que éste lo solicite, ajusta
tu documento y vuélvelo a enviar.
6. Revisa los criterios de evaluación de esta actividad incluida en este documento, para que
identifiques la totalidad de elementos que serán valorados en tu trabajo.
7. Actividades entregadas después de la fecha indicada se calificarán con 0.0.
IMPORTANTE: Apóyate de fuentes fidedignas de información, pero debes redactar con tus propias
palabras. Recuerda que tu documento no deberá pesar más de 5 MB. Cualquier actividad en la que se
detecte plagio será penalizada con calificación 0.0 y sin derecho a segundo intento de envío.

Criterios de evaluación
Criterio Puntaje
La portada contiene los datos requeridos. No incluye logo de la 10 %
UnaDM.
Da una respuesta reflexiva a la pregunta: ¿Por qué considero que es 30 %
importante el estudio de la bioinformática para la Biotecnología?
Da una respuesta reflexiva a la pregunta: ¿Cuál es la importancia de 30 %
saber utilizar las bases de datos Bioinformáticas?
Utiliza letra TNR 12, Máximo 2 cuartillas (incluyendo portada),
formato texto (.pdf). 10 %

Ortografía, sintaxis correctas 10 %

Incluye la(s) referencia(s) bibliográfica(s) en formato APA. 10 %
Total 100%

Verifica Los lineamientos de entrega semanal en la siguiente liga:

https://unadmex.sharepoint.com/sites/reglamentogral

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