INFORMACIÓN OBTENIDA DE LA PLATAFORMA NCBI

I. Bacterias
a) Escherichia coli
Paso 1: Se coloca en el buscador del NCBI el nombre de la especie.

Paso 2: Nos mostrará un cuadro donde encontraremos el nombre científico y el

genoma de referencia.
Nombre científico

Nombre del genoma de

referencia

Paso 3: Luego se nos presentará un pequeño resumen taxonómico de la especie

como también la importancia que tiene esta. Por consiguiente, esta especie la
podemos hallar en el intestino inferior de los humanos formando parte de la
flora intestinal. También es una de las bacterias que se puede cultivar fácilmente
en los laboratorios y fácilmente manipulable. Por otro lado, también se hace
mención del modelo E. coli K-12, siendo este el más estudiado y considerado

como especie de referencia.

Resumen taxonómico

Importancia
 Paso 4: En esta sección se presentará un resumen donde nos dará a especificar
la cantidad de genomas ensamblados, el tamaño promedio del genoma, el
promedio de proteínas codificadas y el porcentaje de guanina y citocina del
genoma.

Paso 5: Aquí observaremos un cuadro resumen con información del tipo de cromosoma, el
tamaño del genoma, promedio de proteínas codificadas y el porcentaje de guanina y citocina;
también la cantidad de tipos de ARN ribosómicos (ARNr) , ARN de transferencia (ARNt) y el
de otros diversos tipos de ARN que puede sintetizar, por otro lado se muestra la cantidad de
genes y pseudogenes que tienen las dos cepas descritas en el cuadro.

Paso 6: Entrando en el enlace aportado en la secuencia de referencia nos conllevará a una

sección donde se observará el tipo y tamaño de genoma expresando en pares de bases(bp)

Cepas

Cuadro resumen

Enlaces aportados en la sección de referencia de secuencia

 Tipo del genoma
Tamaño del genoma

Tipo del genoma

Tamaño del genoma

Tipo del genoma

Tamaño del genoma

Tipo del genoma

Tamaño del genoma
II.

Archaeae
a)

Nanoarchaeum equitans
Paso 1: Se coloca en el buscador del NCBI el nombre de la especie

Paso 2: Nos mostrará un cuadro donde encontraremos el nombre científico, un

resumen taxonómico y una pequeña descripción

Resumen taxonómico
Nombre científico

Descripción

Paso 3: En esta sección no presenta datos como la morfología, el ambiente apto

para su supervivencia como también el tamaño de su genoma en Mega bases
(Mb), la cantidad de proteínas que puede sintetizar y el porcentaje de guanina y
citocina.

Morfología y ambiente

Tamaño del genoma en

Mega bases
 N° de proteínas

Porcentaje de guanina y
adenina

Paso 4: Aquí observaremos un cuadro resumen con información del tipo de

cromosoma, el tamaño del genoma, promedio de proteínas codificadas y el
porcentaje de guanina y citocina; también la cantidad de tipos de ARN
ribosómicos (ARNr), por otro lado se muestra la cantidad de genes que tiene.

Paso 5: Entrando en el enlace aportado en INSDC nos conllevará a una sección

donde se observará el tipo y tamaño de genoma expresando en pares de
bases(bp).

Tipo del genoma

Tamaño del genoma

CUADRO COMPARATIVO DE GENOMAS

Bacterias Archaeas
Escherichia coli Nanoarchaeum equitans
Escherichia coli calle. Nanoarchaeum equitans
Escherichia coli O157:H7 str. sakai
Sust. K-12 MG1655 Kin4-M
Tipo de molécula del Un cromosoma (Chr) Un cromosoma (Chr) y 2 clases de Un cromosoma (Chr)
DNA que forma el plásmidos (-, pOSAK1 y pO157)
genoma de las sepas
Tamaño del genoma 4.64 Mb - pOSAK1 pO157 0.49 Mb
(Mb) 5.5 0 0.9
%GC 50.8% 50.5% 43.4% 47.6% 31.6%

N° de proteínas 4,298 5,067 3 85 536

codificadas
N° de ARNr 22 22 - - 17
N° de ARNt 86 103 - - -
N° de genes 4,639 5,329 3 85 553
Tamaño del 5498578 bp 5498578 pb 3306 pb 92721 pb 490885 pb
genoma(bp)
Tipo y forma de ADN circular ADN ADN ADN circular ADN circular
material genético circular circular
N° de pseudogenes 145 138 - - -
Cuadro 1: Cuadro comparativo e genoma de especies de bacterias y archaeas

Comentarios:
- Podemos observar que Escherichia coli calle. Sust. K-12 MG1655 tiene un tamaño de
cromosoma de 4.64Mb a diferencia de Nanoarchaeum equitans Kin4-M con un tamaño de
cromosoma de 0.49 Mb. Siendo Escherichia coli calle. Sust. K-12 MG1655 la de mayor tamaño
cromosomal.
- Escherichia coli calle. Sust. K-12 MG1655 tiene mayor estabilidad, es decir mayor energía para
poder mantener unidas las dos ebras que conformas suDNA, esto es porque su %GC es de
50.8%, lo cual es considerado estable.
- Entre el cromosoma y los plásmidos de la sepa Escherichia coli O157:H7 str. Sakai, estos son
menos estables a diferencia del cromosoma; teniendo como %GC menor al del cromosoma.
Esto sucede porque los plásmidos se reproducen constantemente y esto ocasiona que las ebras
de DNA se rompan rápido. Por otro lado, el cromosoma solo llega a replicarse dentro de la
bacteria una sola vez.

Bibliografía

Vicente, M. (2008, 23 marzo). ¿Las bacterias son arcaicas o son modernas?: la

estructura de los tARNs revela una genealogía sorprendente. microbichitos.

https://www.madrimasd.org/blogs/microbiologia/2008/03/23/87138

Miranda, H. (2012). Estructura y función de la ATP sintasa de las arqueas aeróbicas.

Revista especializada en ciencias químico-biológicas, 15(2), 104–115.

http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1405-

888X2012000200004&lng=es&tlng=es.