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1. Laboratorio in silico
1.1 En la base de datos Genoma de NCBI busque el genoma de 4 especies forestales y determine:
a) Número de cromosomas
1.2 Lea la información del genoma que aparece en el recuadro y en base a esta información seleccione uno de los
cromosomas, consulte la secuencia y en ella identifique la primera región codificadora en la hebra molde de DNA
(ATG), una vez identificada, copie la secuencia (5 líneas o renglones) en word. A partir de esta secuencia:
2. Lea el artículo Claves moleculares de la variación somática en la vid de Carbonel et al., 2017 y diga:
a) Cuáles son las principales causas moleculares de la variación somática en vid y en qué consisten estas variaciones,
qué cambios generan en el fenotipo?
b) ¿Qué es una quimera?
3. Represente los tipos de mutación génica: sustituciones, inserciones y deleciones, escriba un ejemplo para cada tipo,
así: Cadena de ADN, ADN mutado, ARNm y secuencia de aminoácidos (ver diapositiva 11 del Tema 3).
1. Laboratorio in silico
a. Número de cromosomas: 22
b. Tamaño del genoma: 1094.45 Mb
c. Recuento de proteínas: 67222
1.2. Datos de Cromosoma escogido:
Nombre: 2e, RefSeq: NC 039901.1, INSDC: CM011109.1, Tamaño: 71.63, GC%: 36.7, Proteina: 6.341ARNt: 72.
Secuencia Molde:
ATG-AAT-TTA-CAA-TTT-AAC-TCC-TAT-TCT-TTG-CTA-ACT-CAA-TAA-TTT-TGA-TAT-TTC-ATT-ACA-TCT-
TTT-CTA-TAT-ATC-ATC-GCA-CAC-GAA-GCT-TAT-AGT-TAT-TTT-TTT-GTA-TGC-CAT-TCT-TTG-TAA-TAT-
TTG-TTT-CTA-CTT-AGT-AAT-ATT-AAT-CGA-AAT-GTT-ACA-TTA-GCT-ATT-ACT-CGC-GAT-ACT-TTT-GCA-
TTG-AGG-TAA-GTG-ACG-CCA-TCA-GAT-TGG-GTC-AAG-AGT-CAA-GGT-GTC-CAT-ATC-ACA-TTT-TTC-TTT-
CTT-CAT-CAA-CGT-AAA-CAA-TAT-TTT-TCT-CAC-TTA-TCC-CAA-GTG-TGT-TCT-TAT-GAA-AAA-TCA-AAC-
ATT-ATA-TTC-AAT-TAG-GAG-CAT-CCA-CTT-CGA-CTC
a. Secuencia replica complementaria: (Adenina por Timina, Timina por Adenina, Guanina por Citosina, Citosina por
Guanina)
TAC-TTA-AAT-GTT-AAA-TTG-AGG-ATA-AGA-AAC-GAT-TGA-GTT-ATT-AAA-ACT-ATA-AAG-TAA-
TGT-AGA-AAA-GAT-ATA-TAG-TAG-CGT-GTG-CTT-CGA-ATA-TCA-ATA-AAA-AAA-CAT-ACG-GTA-
AGA-AAC-ATT-ATA-AAC-AAA-GAT-GAA-TCA-TTA-TAA-TTA-GCT-TTA-CAA-TGT-AAT-CGA-TAA-
TGA-GCG-CTA-TGA-AAA-CGT-AAC-TCC-ATT-CAC-TGC-GGT-AGT-CTA-ACC-CAG-TTC-TCA-GTT-
CCA-CAG-GTA-TAG-TGT-AAA-AAG-AAA-GAA-GTA-GTT-GCA-TTT-GTT-ATA-AAA-AGA-GTG-AAT-
AGG-GTT-CAC-ACA-AGA-ATA-CTT-TTT-AGT-TTG-TAA-TAT-AAG-TTA-ATC-CTC-GTA-GGT-GAA-
GCT-GAG
Met,Asp,Leu,Gln,Phe,Asp,Ser,Tyr,Ser,Leu,Leu,Thr,Gln,STOP
El codón UAA nos indica un alto en la síntesis de aminoácidos, no se puede continuar con la síntesis debido a que no
se encuentra de nuevo un codón de inicio.
a. Número de cromosomas: 13
b. Tamaño del genoma: 665.888 Mb
c. Recuento de proteínas: 28320
ATG-ATT-ACC-TGA-GGG-TAT-GAC-TAC-ATG-GTT-ACA-AGA-GAA-AAA-AGT-TAA-TAA-CCA-AGT-
TGT-ATT-TAA-TTT-GTT-TCA-GTA-CAA-ATA-AAT-TAA-ATA-TTT-TTC-CTT-TAG-AAT-TGA-AAT-
CCC-TGA-TTT-GCC-GAT-AAG-TTA-GTA-TTG-AAG-AAC-TAT-TTA-GTT-ATG-TAT-TAT-TGA-CGG-
ATT-CAT-GCA-ACA-AAC-ATT-TTA-AAA-ATC-TCT-TTT-CTT-CCT-GAA-AAG-CTT-CAA-CAA-TCC-
ATC-AGG-ATG-TTT-GGA-GGA-AAG-CAT-GGT-TTT-TGT-TTG-GAC-ATT-GAC-TCA-GTT-CCC-TGA-
TGG-GAT-TGT-CAA.
a. Secuencia replica complementaria: (Adenina por Timina, Timina por Adenina, Guanina por Citosina, Citosina por
Guanina)
TAC-TAA-TGG-ACT-CCC-ATA-CTG-ATG-TAC-CAA-TGT-TCT-CTT-TTT-TCA-ATT-ATT-GGT-TCA-
ACA-TAA-ATT-AAA-CAA-AGT-CAT-GTT-TAT-TTA-ATT-TAT-AAA-AAG-GAA-ATC-TTA-ACT-TTA-
GGG-ACT-AAA-CGG-CTA-TTC-AAT-CAT-AAC-TTC-TTG-ATA-AAT-CAA-TAC-ATA-ATA-ACT-GCC-
TAA-GTA-CGT-TGT-TTG-TAA-AAT-TTT-TAG-AGA-AAA-GAA-GGA-CTT-TTC-GAA-GTT-GTT-AGG-
TAG-TCC-TAC-AAA-CCT-CCT-TTC-GTA-CCA-AAA-ACA-AAC-CTG-TAA-CTG-AGT-CAA-GGG-ACT-
ACC-CTA-ACA-GTT.
El codón UGA nos indica un alto en la síntesis de aminoácidos, no se puede continuar con la síntesis hasta que se
encuentra de nuevo un codón de inicio. Las líneas rojas significan que estos codones no se pueden sintetizar, hasta
que encuentre el respectivo codón de inicio.
a. Número de cromosomas: 10
b. Tamaño del genoma: 335.437 Mb
c. Recuento de proteínas: 37.520
Nombre: Theobroma cacao cultivar B97-61/B2 chromosome 1, Criollo_cocoa_genome_V2, whole genome shotgun
sequence
Secuencia Molde:
ATG-ATG-ATG-AGA-TCA-TTG-CTC-TTG-CAC-AGC-CAT-TTA-AAC-ATT-CCA-TGG-TAG-GAA-
AGT-TTT-CAC-GTA-TGC-CCC-GGT-TGA-ATG-ACA-TTA-GGG-TTG-CTT-TCA-AAG-GAA-TCG-
GGC-TAG-TGG-GTG-CAT-ATG-AAA-TTC-GTT-GGT-TGG-ATT-ATA-AGC-ACA-TCC-TGA-TTC-
ATT-TAT-CTA-ATG-AGC-AAG-ATC-TGA-ATC-ATT-TAT-GGA-TGC-GTC-AAG-CAT-GGT-TCA-
TTG-CAA-ACC-AGA-AGA-TGA-GAG-TCT-TTA-AGT-GGA-CTC-CGG-ATT-TCC-AAT-CGA-AAA-
GGG-AAT-CCT-TCT-TGG-TTC-CCG-TTT-GGG-TCT-CAT-TTT-CGA-ACC-TGC-GGG-CTC-ATC-
TAT-ATG-AAA-AAT-CGA-CAC-TTC-CGA-TGA-TTG-CTA-AGT-CGG-TGG-GGA-GAC-CAC-TTT-
TTA-TTG-ATG-AAG-CTA-CGG-CAA-ATG-
a. Secuencia replica complementaria: (Adenina por Timina, Timina por Adenina, Guanina por Citosina, Citosina por
Guanina)
TAC-TAC-TAC-TCT-AGT-AAC-GAG-AAC-GTG-TCG-GTA-AAT-TTG-TAA-GGT-ACC-ATC-CTT-TCA-
AAA-GTG-CAT-ACG-GGG-CCA-ACT-TAC-TGT-AAT-CCC-AAC-GAA-AGT-TTC-CTT-AGC-CCG-ATC-
ACC-CAC-GTA-TAC-TTT-AAG-CAA-CCA-ACC-TAA-TAT-TCG-TGT-AGG-ACT-AAG-TAA-ATA-GAT-
TAC-TCG-TTC-TAG-ACT-TAG-TAA-ATA-CCT-ACG-CAG-TTC-GTA-CCA-AGT-AAC-GTT-TGG-TCT-
TCT-ACT-CTC-AGA-AAT-TCA-CCT-GAG-GCC-TAA-AGG-TTA-GCT-TTT-CCC-TTA-GGA-AGA-ACC-
AAG-GGC-AAA-CCC-AGA-GTA-AAA-GCT-TGG-ACG-CCC-GAG-TAG-ATA-TAC-TTT-TTA-GCT-GTG-
AAG-GCT-ACT-AAC-GAT-TCA-GCC-ACC-CCT-CTG-GTG-AAA-AAT-AAC-TAC-TTC-GAT-GCC-GTT-
TAC-
Ser,Lys,Glu,Ser,Gly,STOP,-----------Met,Lys,Phe,Val,Gly,Try,Iso,
Iso,Ser,Thr,Ser,STOP,---------------Met,Ser,Lys,Iso,STOP,----------------------
-------------------------------------------------------------------------------
-------------------------------------------------------------------------------
--------------Met,Lys,Asn,
Arg,His,Phe,Arg,STOP,---------------------------------------------
Met,Lys,Leu,Arg,Gln,Met,
El codón UGA y UAG nos indica un alto en la síntesis de aminoácidos, no se puede con la síntesis hasta que se encuentra
de nuevo un codón de inicio. Las líneas rojas significan que estos codones no se pueden sintetizar, hasta que encuentre
el respectivo codón de inicio.
a. Número de cromosomas: 13
b. Tamaño del genoma: 290.265 Mb
c. Recuento de proteínas: 0
Nombre: Ficus carica cultivar Dottato isolate GU2019 chromosome 1, whole genome shotgun sequence
Secuencia Molde:
ATG-TTC-GTA-GTT-GCA-TCG-CTT-TCT-TAC-TCT-TTT-TCC-CAC-CAA-AAT-CTT-CTA-GTC-ATT-
AAG-TGC-CCT-AAT-AAT-TTA-ACA-AAG-TTC-AAA-ACA-TTT-AAA-ACA-AGA-ATA-ATG-TAA-TGT-
CAA-ATT-ACA-ATT-TTG-AAC-ATA-AAA-ATA-TAC-TTA-TAA-CTT-AAT-TGG-GTC-TTC-AAA-ATC-
ATC-ACC-CGG-TTC-GTT-TCC-TGG-AGA-ATT-AAA-ATA-CAT-GAC-TGA-GTC-ATC-CCA-CAG-ATC-
AAT-AAC-TGC-CAC-GAT-CCA-ATG-TTT-CCC-GTT-GTT-ATA-TGG-CAT-TAG-AAA-CAA-CTT-TCC-
TTT-CAG-TGC-ATT-TGT-TAA-GAT-CCG-TAA-AAT-ATT-GTT-GGC-
a. Secuencia replica complementaria: (Adenina por Timina, Timina por Adenina, Guanina por Citosina, Citosina por
Guanina)
TAC-AAG-CAT-CAA-CGT-AGC-GAA-AGA-ATG-AGA-AAA-AGG-GTG-GTT-TTA-GAA-GAT-CAG-TAA-
TTC-ACG-GGA-TTA-TTA-AAT-TGT-TTC-AAG-TTT-TGT-AAA-TTT-TGT-TCT-TAT-TAC-ATT-ACA-
GTT-TAA-TGT-TAA-AAC-TTG-TAT-TTT-TAT-ATG-AAT-ATT-GAA-TTA-ACC-CAG-AAG-TTT-TAG-
TAG-TGG-GCC-AAG-CAA-AGG-ACC-TCT-TAA-TTT-TAT-GTA-CTG-ACT-CAG-TAG-GGT-GTC-TAG-
TTA-TTG-ACG-GTG-CTA-GGT-TAC-AAA-GGG-CAA-CAA-TAT-ACC-GTA-ATC-TTT-GTT-GAA-AGG-
AAA-GTC-ACG-TAA-ACA-ATT-CTA-GGC-ATT-TTA-TAA-CAA-CCG-
El codón UGA, UAA y UAG nos indica un alto en la síntesis de aminoácidos, no se puede con la síntesis hasta que se
encuentra de nuevo un codón de inicio. Las líneas rojas significan que estos codones no se pueden sintetizar, hasta
que encuentre el respectivo codón de inicio.
2. Lea el artículo Claves moleculares de la variación somática en la vid de Carbonel et al., 2017 y diga:
a) Cuáles son las principales causas moleculares de la variación somática en vid y en qué consisten estas variaciones,
qué cambios generan en el fenotipo?
Inserción de elementos transponibles: Esta mutación es el resultado de secuencias génicas que se pueden mover a
través del genoma, lo pueden hacer autónomamente o semiautónomamente. Las consecuencias que se pueden llegar
a generar son tales como: meristemos reproductivos que muestra un gran incremento del tamaño de inflorescencias,
zarcillos y racimos. Esto se ascia a la hiperexpresión de un gen que determina el crecimiento y ramificación de
inflorescencias en las plantas, también debido a una inserción de un elemento trasnponible en la proximidad del gen
que provocaría dicha hiperexpresión.
Variación estructural:
Una mutación particular en la cual la síntesis de antocianinos que son los que le dan el color a la uva está regulada por
2 genes que codifican proteínas reguladoras y se localizan en una zona del cromosoma 2, dicha mutación depende de
la variedad de uva, hay algunas que no poseen copia funcional de ninguno de los 2 genes (color blanco), otras
presentan una copia funcional de cada uno de los 2 genes (heterocigotas) y otras dos copias funcionales de cada gen
(homocigotas). Se da por la Deleción en una célula de la capa meristematica o en las copias funcionales de los 2 genes
mencionados anteriormente, esto genera reorganizaciones del genoma más complejas. Genera una variación de color
de la uva.
El entrecruzamiento se produce durante la profase I, donde se genera el intercambio de material genético entre las
cromatidas no hermanas de cromosomas homologas. Es importante recordar que en la profase I, los cromosomas
homólogos se alinean en parejas, de forma gen por gen, a lo largo de toda su longitud, formando así una configuración
con cuatro cromatidas. Aquí ya podemos encontrar a las cromatidas muy cerca una a la otra, además de material de
dos cromatidas que cambian cromosomas, rompiéndose y uniéndose en la posición del mismo cromosoma homólogo
(Imagen 1). Este intercambio de material genético se puede dar varias veces en el mismo par de cromosomas
homólogos, dando origen a combinaciones únicas de genes. A todo esto también lo podemos llamar como
recombinación. (CK-12, 2020)
Imagen 1. Proceso de entrecruzamiento de cromosomas homólogos.
Bibliografía
CK-12, F. (2020). ck12.org. Obtenido de https://www.ck12.org/book/ck-12-conceptos-
biolog%c3%ada/section/2.39/
Franco, g., Vega, K., Aguirre, R., & Valencia, S. (2016). Hibridación y poliploidía en plantas. Mexico.
Roncalo. (2013). Poliploidia en plantas. Peru.
Sañudo, A., & Ruiz, M. (1975). Sobre la naturaleza autoploide de algunas plantas silvestres.