Codones de terminacion (ocre, ambar, opalo)

CARACTERÍSTICAS DEL CÓDIGO GENÉTICO

El código está organizado en tripletes o codones: cada tres nucleótidos (triplete)

determinan un aminoácido.

El código genético es degenerado: existen más tripletes o codones que aminoácidos,

de forma que un determinado aminoácido puede estar codificado por más de un
triplete.

El código genético es no solapado o sin superposiciones: un nucleótido solamente

pertenece a un único triplete.

La lectura es "sin comas": el cuadro de lectura de los tripletes se realiza de forma

continua "sin comas" o sin que existan espacios en blanco.

El código genético nuclear es universal: el mismo triplete en diferentes especies

codifica para el mismo aminoácido. La principal excepción a la universalidad es el
código genético mitocondrial.

En genética se denomina codón de terminación, codón de parada, codón sin

sentido o codón stop a aquel codón que no determina ningún aminoácido según
el código genético.
Su función es acotar el mensaje cifrado por el ADN que dará lugar al ARN
mensajero; de este modo, limita en el extremo 3' el marco abierto de lectura de los
genes.

Existen tres codones de terminación, que reciben distintos nombres. «UAG», el

primero descubierto, se conoce como «codón ámbar»; «UGA», como «codón
ópalo»; y «UAA», como «codón ocre».
El mecanismo de terminación se da de la siguiente manera: primero, RF1 o
RF2 reconocen el codón de paro, luego, activan al ribosoma para hidrolizar
el enlace entre el RNAt y el polipéptido. Posteriormente, RF1 o RF2 son
liberados del ribosoma por la acción de RF3, el cual utiliza el mismo sitio
de unión que los factores de elongación.

Una vez desacoplado el ribosoma, cada subunidad esta lista para unirse
nuevamente al sitio de inicio de la traducción y así comenzar con un nuevo
ciclo de traducción. Esto continúa mientras el RNAm se encuentre
disponible y depende de la estabilidad del mismo Con esto terminamos el
proceso de traducción en procariotas. En la siguiente sección se abordará
el proceso en eucariotas.

Al ser el código genético degenerado, significa que vamos a tener más de un

RNAt para cada aminoácido o un RNAt puede unirse con más de un codón
 Edición del ARNm.

El ARN mensajero (ARNm) funciona como molde para la síntesis

proteica; transporta la información genética desde el ADN hasta un
ribosoma y ayuda a ensamblar los aminoácidos en el orden
correcto.Para que el ARNm pueda tener la capacidad de sintetizar
proteínas es necesario que transcurra por distintas etapas

siete etapas: Pretranscripcional, transcripcional, edición, maduración.

Sin embargo, existen otras 4 etapas como el transporte del ARNm al

citoplasma, la traducción, la degradación y por último las
modificaciones postraduccionales.

Una vez que la fibra de 30 nanómetros se relaja y el nucleosoma

donde se encuentra el sitio de inicio de la transcripción se
desensambla, la cadena de ADN se separa para que la ARN
polemizaras II se instale sobre la cadena templada. Esta cadena sirve
de molde para sintetizar una cadena complementaria del ácido
ribonucleico (ARN), que incluye el UTR 5' y todos los expones e
intrones, así como buena parte del UTR 3'.

Cabe destacar que ese proceso anteriormente mencionado forma

parte de los procesos pretranscripcionales que dan lugar a la
transcripción y formación del ARN gracias a la relajación causada
por algunas enzimas.

El producto que genera la ARN polemizaras II se denomina transcrito

primario o ARN heterogéneo nuclear (ARNhr), que es en realidad
precursor del ARN mensajero (ARNm) maduro.
maduración o procesamiento, implica tres procesos que se
realizan al mismo tiempo que la polemizara va sintetizando al
ARNr: la modificación del extremo 5', la remoción de los
intrones y la adición de adineras en el extremo 5'.
 Qué es VEGF

El factor de crecimiento del endotelio vascular o VEGF, es una

molécula clave en la regulación de la proliferación de las células
endoteliales. (Una célula endotelial es el tipo de célula plana que
recubre el interior de todos los vasos sanguíneos, y está en
contacto permanente con la sangre.) Promueve la proliferación,
migración y supervivencia de estas células, así como su
permeabilidad vascular.

El factor de crecimiento endotelial vascular (FCEV o VEGF, por

Vascular Endothelial Growth Factor) es una proteína señalizadora
implicada en la vasculogénesis (formación de novo del sistema
circulatorio embrionario) y en la angiogénesis (crecimiento de
vasos sanguíneos provenientes de vasos preexistentes). Las
acciones del VEGF han sido estudiadas en las células endoteliales
vasculares, aunque también tiene efectos sobre otros tipos
celulares (por ejemplo, estimula la migración de monocitos/
macrófagos, neuronas, células epiteliales renales y células
tumorales). Se ha demostrado que el VEGF estimula la división y la
migración de células endoteliales in vitro.
 Lista de bacterias parásitos con genomas pequeños

se han reportado numerosos casos de simbiontes bacterianos con genomas

extraordinariamente pequeños. Estos organismos representan linajes independientes
de diversos grupos bacterianos. Tienen conjuntos de genes diminutos que rivalizan con
algunas mitocondrias y cloroplastos en términos de números de genes y carecen de
genes que se consideran esenciales en otras bacterias.

Terminología del Genoma

Kb/Mb - Un kilobase (KB) es 1000 bases de

ADN, mientras que un megabase (Mb) es
1.000.000 bases.

Cromosoma circular - La ADN se arregla en

un circulo que es cerrado es sobre-rollado
negativamente que permite a tener en cuenta
la naturaleza compacta de muchos genomas
bacterianos.

Cromosoma linear - un cromosoma no cerrado, que tiene repeticiones invertidos en los

extremos, similar a los telomeros en cromosomas eucariótica.

Plasmido- la ADN adicional. Se réplica independientemente del cromosoma, y regula su

propia replicación.

Megaplasmid - un plasmid muy grande que se extiende de tamaño a partir de 100 a 1700
KB.
 Bases de datos genomicos para los siguientes organismos
y mencionar que tipos de analisis se pueden realizar

Escherichia coli https://ecocyc.or

EcoCyc es una base de datos científica para la bacteria

Escherichia coli K-12 MG1655. El proyecto EcoCyc realiza una
curaduría basada en la literatura de su genoma y de la regulación
transcripcional, los transportadores y las vías metabólicas.

EcoCyc es parte de la colección más grande de BioCyc de miles

de bases de datos Pathway/Genome para genomas secuenciados.

Saccharomyces cerevisiae https://www.yeastgenome.org

La base de datos del genoma de Saccharomyces (SGD)

proporciona información biológica integrada completa para la
levadura en ciernes Saccharomyces cerevisiae junto con
herramientas de búsqueda y análisis para explorar estos datos, lo
que permite el descubrimiento de relaciones funcionales entre
secuencias y productos genéticos en hongos y organismos
superiores.
Caenorhabditis elegans https://wormbase.org//#012-34-5https://wormbase.org//
#012-34-5

Esta pagina esta diseñada para facilitar conocimientos sobre la biología de los
nematodos WormBase es una base de datos biológica en línea sobre la biología y
el genoma del organismo modelo nematodo Caenorhabditis elegans y contiene
información sobre otros nematodos relacionados. WormBase es utilizado por la
comunidad de investigación de C. elegans como recurso de información y como
lugar para publicar y distribuir sus resultados. La base de datos se actualiza
periódicamente y se publican nuevas versiones cada dos meses.

Drosophila melanogaster. https://flybase.org/

FlyBase es una base de datos bioinformática en línea y el repositorio principal de

datos genéticos y moleculares de la familia de insectos Drosophilidae. Para la
especie y organismo modelo más ampliamente estudiado, Drosophila
melanogaster, se presenta una amplia gama de datos en diferentes formatos.

Arabidopsis thaliana. https://www.arabidopsis.org/

El recurso de información de Arabidopsis (TAIR) mantiene una base de datos de

datos genéticos y de biología molecular para el modelo de planta superior
Arabidopsis thaliana . Los datos disponibles de TAIR incluyen la secuencia
completa del genoma junto con la estructura genética, información del producto
genético, expresión genética, ADN y reservas de semillas, mapas del genoma,
marcadores genéticos y físicos, publicaciones e información sobre la comunidad de
investigación de Arabidopsis.
Oryza sativa. https://rapdb.dna.affrc.go.jp/

Secuenciación del genoma de Nipponbare realizada por el Proyecto

Internacional de Secuenciación del Genoma del Arroz con el objetivo de
proporcionar a la comunidad científica una anotación precisa y oportuna de la
secuencia del genoma del arroz. Uno de los principales objetivos de este
proyecto es facilitar un análisis exhaustivo de la estructura y función del
genoma del arroz sobre la base de la anotación.

Mus musculus. https://www.informatics.jax.org/

MGI es la base de datos internacional para ratones de laboratorio, que

proporciona datos genéticos, genómicos y biológicos integrados para facilitar el
estudio de la salud y las enfermedades humanas.

Rattus rattus. https://www.ensembl.org/Rattus_norvegicus/Info/Annotation

¿Qué puedo encontrar? Genes codificantes y no codificantes de proteínas,

variantes de empalme, secuencias de ADNc y proteínas, ARN no codificantes.
 Bases de datos biologicos

Las bases de datos más relevantes en biología incluyen datos de

secuencias de nucleótidos, proteínas, estructura de proteínas,
genomas, expresión genética, bibliografía, taxonomía,
metabolismo, factores de transcripción, etc. Nos podemos hacer
una idea de las bases de datos disponibles en esta base de datos de
bases de datos biológicas.

Principales bases de datos se secuencias de nucleótidos:

NCBI (EEUU)

EMBL (Europa)

DDBJ (Japón)

Algunas bases de datos de genomas de organismos concretos:

Flybase (Drosophila)

SGD (Levadura)

TAIR (Arabidopsis)

ENSEML (Hombre, ratón y otros)

Principales bases de datos de proteínas:

Uniprot

Swiss-prot

PDB

MMDB

SCOP

Bibliografía:

Pubmed

Rutas metabólicas:

KEGG

Enfermedades genéticas humanas:

OMIM