BIOLOGÍA MOLECULAR Y GENÉTICA

Semana 2

TALLER 2: ANÁLISIS DE ADN Y BÚSQUEDA DE SECUENCIAS DE GENES

MITOCONDRIALES

Integrantes:

I. Realice la búsqueda de la información solicitada utilizando la base de datos del National Center
for Biotechnology Information – NCBI (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)

a) Ejemplo: Citocromo C oxidasa Subunidad III en gatos

Especie de interés
Nombre científico de la especie
Taxonomy ID de la especie
Información del gen Gene ID
Nombre del gen
Símbolo del gen
Número de accesión del
genoma mitocondrial
Localización dentro del
genoma mitocondrial
Tamaño del gen
Secuencia FASTA del gen:

b) Ejercicio 1: Citocromo C oxidasa Subunidad I en caballos

Especie de interés
Nombre científico de la especie
Taxonomy ID de la especie
Información del gen Gene ID
Nombre del gen
Símbolo del gen
Número de accesión del
genoma mitocondrial
Localización dentro del
genoma mitocondrial
Tamaño del gen
Secuencia FASTA del gen:

c) Ejercicio 2: Citocromo C oxidasa Subunidad II en perros

Especie de interés Perro

Nombre científico de la especie Canis lupus familiaris
Taxonomy ID de la especie 9615
Información del gen Gene ID 804479
Nombre del gen COX2
Símbolo del gen COX2
Número de accesión del NC_002008.4
genoma mitocondrial
Localización dentro del (7034..15322)
genoma mitocondrial
Tamaño del gen 684 nt
 BIOLOGÍA MOLECULAR Y GENÉTICA
Semana 2
Secuencia FASTA del gen:
>NC_002008.4:7034-7717 Canis lupus familiaris mitochondrion,
complete genome
ATGGCGTACCCATTTCAACTCGGATTACAGGACGCAACCTCCCCTATTATAGAGGAGCTACTTCATTT
TC
ATGACCATACACTAATAATTGTATTCTTAATCAGTTCTTTAGTTCTCTATATCATTTCACTAATATTG
AC
TACAAAATTAACCCATACAAGCACAATAGACGCACAAGAAGTGGAAACAGTATGAACCATTCTACCCG
CC
ATTATCCTAATCCTAATCGCTCTACCTTCCCTCCGAATCCTTTATATAATGGACGAAATTAATAACCC
CT
CTTTAACCGTGAAAACAATAGGCCACCAATGATACTGAAGCTATGAATATACTGACTATGAAGACTTA
AA
CTTTGACTCCTACATAATCCCAACACAAGAATTAAAGCCAGGAGAACTCCGACTATTAGAAGTAGACA
AC
CGAGTTGTCCTCCCAATAGAAATAACCATCCGAATACTTATCTCTTCAGAAGACGTTTTGCATTCATG
AG
CCGTTCCATCACTAGGTCTAAAAACTGACGCTATTCCAGGACGACTAAACCAAACCACCCTTATAGCC
AT
ACGACCAGGACTGTACTATGGCCAGTGCTCTGAAATCTGCGGATCTAACCACAGCTTTATACCCATTG
TT
CTTGAAATAGTCCCCCTATCTTACTTTGAGACCTGATCTGCCTTAATAGTATAA

d) Ejercicio 3: Citocromo b en ganado bovino

Especie de interés
Nombre científico de la especie
Taxonomy ID de la especie
Información del gen
Secuencia FASTA del gen:
Gene ID
Nombre del gen
Símbolo del gen
Número de accesión del
genoma mitocondrial
Localización dentro del
genoma mitocondrial
Tamaño del gen

e) Ejercicio 4: NADH deshidrogenasa Subunidad 5 en ovejas

Especie de interés
Nombre científico de la especie
Taxonomy ID de la especie
Información del gen
Secuencia FASTA del gen:
Gene ID
Nombre del gen
Símbolo del gen
Número de accesión del
genoma mitocondrial
Localización dentro del
genoma mitocondrial
Tamaño del gen

f) Ejercicio 5: NADH deshidrogenasa Subunidad 3 en caprinos

 BIOLOGÍA MOLECULAR Y GENÉTICA
Semana 2
Especie de interés
Nombre científico de la especie
Taxonomy ID de la especie
Información del gen Gene ID
Nombre del gen
Símbolo del gen
Número de accesión del
genoma mitocondrial
Localización dentro del
genoma mitocondrial
Tamaño del gen
Secuencia FASTA del gen:

II. Busque información y responda las siguientes preguntas de forma breve y clara:

a) Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR) (https://youtu.be/TalHTjA5gKU) 3.40 min

 ¿Para qué sirve la PCR?
 ¿Qué insumos se necesita para hacer una PCR?
 Complete el cuadro con la información solicitada:

N° Ciclos Fase T° ¿Qué ocurre?

b) Electroforesis horizontal con gel agarosa (https://youtu.be/iG15-05_Z90) 2.13 min

 ¿El ADN tiene carga positiva o negativa? ¿Por qué?
 ¿Qué es y para qué sirve el ladder o marcador de peso molecular?

c) Secuenciamiento de Sanger (https://youtu.be/NEu0mO-2ras) 3.05 min

 ¿Cuál es el fundamento teórico del secuenciamiento de Sanger?
 ¿Cuál es la diferencia entre un dNTP y un ddNTP?