Universidad Nacional Autónoma de México

Facultad de Estudios Superiores Cuautitlán Campo 1

Sección de Bioquímica y Farmacología Humana
Lic. en Bioquímica Diagnóstica
Clave de la carrera: 10569

Ejercicios GenBank

Alumno
Hernández García Emmanuel

Bioinformática
Clave de la asignatura: 0041
Grupo: 1001
Semestre 2021-I
Asesoras:
M. en C. Maritere Domínguez Rojas
BQD Larisa Andrea González Salcedo
BQD Rosa María de los Ángeles López Cabrera

Fecha de entrega: 4 de octubre de 2020

1. Busca la secuencia codificadora completa (CDS) nucleotídica del síndrome Von Hippel-Lindau.

Síndrome Von Hippel-Lindau

Búsqueda Ilustración Descripción

La secuencia elegida
Elige la
contiene el CDS
secuencia más
completo para la
apropiada
especia humana.
justificando la
Número de
elección. Indica
identificación:
el número de
AF010238.1
identificación.
¿Cuál es su
14543 bp
longitud?

Gen supresor de
¿Cuál es el tumores (VHL) del
nombre del Homo sapiens Von
gen? Hippel-Lindau
 ¿En qué
cromosoma se
3
encuentra el
gen?

¿De dónde a Abarca 715...1054,

dónde abarca el 5392...5514,
CDS? 867...8845
 ¿De qué tejido No se menciona, solo
se aisló la especifica que el gen
-
secuencia? es de la especie Homo
sapiens

2. Busca la secuencia codificante (CDS) completa de p53.

p53
Búsqueda Ilustración Descripción

Elige la
secuencia
La secuencia elegida contiene el
más
CDS completo para el gen de la
apropiada
especia humana.
justificando
Número de identificación:
la elección.
U94788.1
Indica el
número de
identificación
¿Cuál es su
20303 bp
longitud?

¿Cuándo se
subió la
secuencia y La secuencia se subió el 17 de
qué número julio de 2001 y tiene el número de
de revisión revisión 1
tiene?
¿Cuál es el
Gen de p53 humano (TP53)
nombre del
gen?

¿En qué No se menciona en la entrada de

cromosoma características, pero se encuentra
se encuentra en el 17 (información obtenida de
el gen? omim.org)
 Abarca 11717…11790,
11906...11927, 12021...12299,
13055...13238,
13320...13432, 14000...14109,
14452…14588, 14681...14754,
17572...17678, 18599...18680
¿De dónde a Secuencia de aminoácidos:
dónde MEEPQSDPSVEPPLSQETFSDLWKLLP
ENNVLSPLPSQAMDDLM
abarca el LSPDDIEQWFTEDPGPDEAPRMPEAAPRVAP
CDS? APAAPTPAAPAPAPSWPLSSSVPSQKT
Mencionar la YQGSYGFRLGFLHSGTAKSVTCTYSPALNK
MFCQLAKTCPVQLWVDSTPPPGTRVRAM
secuencia de AIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLA
aminoácidos PPQHLIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVV
PYEPPEVGSDCTTIHYNYMCNSSCMGGM
NRRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVRVCA
CPGRDRRTEEENLRKKGEPHHELPPGS
TKRALPNNTSSSPQPKKKPLDGEYFTLQIRG
RERFEMFRELNEALELKDAQAGKEPGGS
RAHSSHLKSKKGQSTSRHKKLMFKTEGPDSD
3. Busca la secuencia AY769950.1

AY769950.1
Búsqueda Ilustración Descripción

¿Qué tipo de
DNA lineal
molécula es?

¿Cuál es su
192029 bp
longitud?
 ¿Cuándo se
La secuencia se subió
subió y cuál es
el 11 de diciembre de
el número de
2004 y tiene el número
versión?
de revisión 1

¿De qué
organismo se Homo sapiens
aisló?
 ¿Cuál es el
Factor VIII de
nombre
coagulación de Homo
completo de la
sapiens
proteína?

Gen del componente

¿Cómo también
procoagulante
se le conoce al
(hemofilia A) (Gen F8)
gen?
 No se encontraron
fácilmente. En
Graphics haciendo
zoom y con el cursor
¿Cuántos
sobre el gen aparece
exones tiene?
información más
detallada de esa
sección. Tiene 26
exones.

El gen F8 codifica el
factor de coagulación
VIII, una glicoproteína
¿Cuál es la que funciona en la
función de la cascada de
proteína? coagulación de la
sangre como un
cofactor (Información
obtenida de omim.org)