ADN polimerasa

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Este aviso fue puesto el 26 de febrero de 2020.
ADN polimerasa ADN-dirigida
DNA polymerase.png
Estructura tridimensional de los motivos h�lice-giro-h�lice de uni�n al ADN de una
ADN polimerasa beta humana (basada en el archivo PDB 7ICG )
Estructuras disponibles
PDB
Estructuras enzim�ticas[mostrar]
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Identificadores
externos
Bases de datos de enzimas[mostrar]
N�mero EC 2.7.7.7
N�mero CAS 9012-90-2
Ontolog�a g�nica[mostrar]
Ort�logos
Especies
Humano Rat�n
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PMC (B�squeda)
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vte
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Las ADN polimerasas son enzimas (celulares o virales) que intervienen en el proceso
de replicaci�n del ADN. Llevan a cabo la s�ntesis de la nueva cadena de ADN
emparejando los desoxirribonucle�tidos trifosfato (dNTP) con los
desoxirribonucle�tidos complementarios correspondientes del ADN molde. Los dNTP que
se usan en la replicaci�n del ADN contienen tres fosfatos unidos al grupo hidroxilo
5' de la desoxirribosa y dependiendo de la base nitrogenada ser�n dATP, dTTP, dCTP
o dGTP. La reacci�n fundamental es una transferencia de un grupo fosfato en la que
el grupo 3'-OH act�a como nucle�filo en el extremo 3' de la cadena que est� en
crecimiento. El ataque nucleof�lico se produce sobre el fosfato a (el m�s pr�ximo a
la desoxirribosa) del desoxirribonucle�sido 5' trifosfato que entra, liber�ndose
pirofosfato inorg�nico y alarg�ndose el ADN (al formarse un nuevo enlace
fosfodi�ster). A diferencia de la mayor�a de procesos biol�gicos que ocurren en la
c�lula en los que solo se separa un grupo fosfato (Pi), durante la replicaci�n se
separan los dos �ltimos grupos fosfato, en forma de grupo pirofosfato (PPi)

Este proceso se puede resumir en una ecuaci�n qu�mica:

(DNA)n + dNTP ? (DNA)n+1 + PPi

A pesar de que la ADN polimerasa solo tiene un sitio activo para emparejar los
cuatro dNTPs diferentes, la uni�n correcta de los pares de bases A:T, C:G es
posible bas�ndose en la geometr�a de estos: si la uni�n es incorrecta se produce un
desplazamiento del fosfato a haciendo m�s dif�cil su uni�n al extremo 3'-OH y
ralentizando as� el ritmo de catal�sis, lo que da lugar a que la ADN polimerasa
a�ada preferentemente las bases correctas.

Las ADN polimerasas pueden a�adir hasta 1000 nucle�tidos por segundo. Esto es
debido a su naturaleza, es decir, el n�mero de nucle�tidos que son capaces de
a�adir cada vez que se asocian al molde de ADN que van a copiar. Dado que la
adici�n de los nucle�tidos es un proceso que dura unos milisegundos, la velocidad
de cat�lisis va a depender del tiempo que la ADN polimerasa permanece unida al ADN,
esto es, de su procesividad.

Funci�n correctora exonucleasa 3' ? 5' de las ADN polimerasas.

El crecimiento de la cadena se produce en direcci�n 5' ? 3', ya que se requiere de
un grupo 3'-OH libre para el inicio de la s�ntesis puesto que este es el que
realiza el ataque nucleof�lico sobre el fosfato a del dNTP, de forma que las ADN
polimerasas requieren de un iniciador 3'-OH (que puede ser de ADN o ARN) llamado
cebador que es sintetizado por la ARN primasa. El extremo 3' del cebador se
denomina extremo cebador.

Las ADN polimerasas tambi�n realizan otras funciones durante el proceso de

replicaci�n. Adem�s de participar en la elongaci�n, desempe�an una funci�n
correctora y reparadora gracias a su actividad exonucleasa 3', que les confiere la
capacidad de degradar el ADN partiendo de un extremo de este. Es importante que
existan estos mecanismos de correcci�n ya que de lo contrario los errores
producidos durante la copia del ADN dar�an lugar a mutaciones.

�ndice
1 Funciones
1.1 Estructura
1.2 Procesividad
2 Reacci�n en cadena de la polimerasa
3 Familias de ADN polimerasas
4 ADN polimerasas procariotas
4.1 Pol I
4.2 Pol II
4.3 Pol III
4.4 Pol IV
4.5 Pol V
4.6 Familia D
4.7 Transcriptasa inversa (RT)
5 ADN polimerasa en eucariotas
5.1 Polimerasas �, ?, s, � (beta, lambda, sigma, mu) y TdT
5.2 Polimerasas a, d y e (alfa, delta y �psilon)
5.3 Polimerasas ?, ? y ? (eta, iota y kappa)
5.4 Polimerasas Rev1 y ? (zeta)
5.5 Polimerasas ?, ? y ? (gamma, theta y nu)
5.6 Transcriptasa inversa (RT)
5.7 Telomerasa
6 ADN polimerasas virales
7 Referencias
8 Bibliograf�a
Funciones
Las ADN polimerasas pueden agregar nucle�tidos libres solo al extremo 3 ' de la
cadena de ADN en formaci�n. Esto provoca que el alargamiento de la cadena en
formaci�n se realice en la direcci�n 5'-3 '. Ninguna ADN polimerasa conocida puede
iniciar una hebra de ADN nuevamente, es decir, no puede colocar el primer
nucle�tido en la hebra, luego de unir el segundo, luego el tercero, y as�
sucesivamente. Todo lo que pueden hacer es alargar una cadena existente por su
extremo 3'-OH, por lo que siempre debe haber un fragmento inicial ya formado. Esta
es la raz�n por la que la ADN polimerasa necesita un cebador pre-formado al que
agregar nucle�tidos. Los cebadores pueden estar formados por ARN o ADN. En la
replicaci�n del ADN, las dos primeras bases son siempre ARN y son sintetizadas por
otra enzima llamada primasa. Tambi�n se requiere una enzima llamada helicasa para
desenredar el ADN y deshacer en esa regi�n su estructura de doble hebra y formar la
estructura de dos hebras simples bifurcadas (esta regi�n es la horquilla de
replicaci�n), lo que facilita la replicaci�n de cada una de las hebras siguiendo el
modelo semiconservador de replicaci�n del ADN.

Otra propiedad que tienen algunas ADN polimerasas, pero no todas, es la correcci�n
de errores. Este proceso corrige los errores producidos durante la formaci�n del
ADN neosintetizado. Cuando se reconoce un par de bases incorrectamente colocado, la
ADN polimerasa invierte la direcci�n de su movimiento al retrasar un par de bases.
Esta actividad exonucleasa 3'-5' de la enzima permite eliminar el par de bases
incorrecto para luego ser reemplazado por el correcto, la propia polimerasa que
continuar� la replicaci�n. Esta actividad se llama correcci�n de pruebas. Las ADN
polimerasas se utilizan ampliamente en experimentos de biolog�a molecular.

Las ADN polimerasas tienen una estructura muy conservada, lo que significa que sus
subunidades catal�ticas var�an muy poco de una especie a otra. Las estructuras
conservadas generalmente realizan funciones importantes e insustituibles en la
c�lula, cuyo mantenimiento produce una serie de ventajas.

Estructura
Las ADN polimerasas conocidas tienen una estructura muy conservada, lo que
significa que sus subunidades catal�ticas generales var�an muy poco de una especie
a otra, independientemente de sus estructuras de dominio. Las estructuras
conservadas suelen indicar funciones importantes e insustituibles de la c�lula,
cuyo mantenimiento proporciona ventajas evolutivas. La forma se puede describir
como una mano derecha con dominios de pulgar, dedo y palma. El dominio de la palma
parece funcionar catalizando la transferencia de grupos fosforilo en la reacci�n de
transferencia de fosforilo. El ADN se une a la palma cuando la enzima est� activa.
Se cree que esta reacci�n est� catalizada por un mecanismo de iones de dos metales.
El dominio de los dedos funciona para unir los nucle�sidos trifosfatos.con la base
de la plantilla. El dominio del pulgar juega un papel potencial en la procesividad,
la translocaci�n y el posicionamiento del ADN.

Procesividad
La r�pida cat�lisis de la ADN polimerasa se debe a su naturaleza procesiva. La
procesividad es una caracter�stica de las enzimas que funcionan sobre sustratos
polim�ricos. En el caso de la ADN polimerasa, el grado de procesividad se refiere
al n�mero medio de nucle�tidos a�adidos cada vez que la enzima se une a una
plantilla. La ADN polimerasa promedio requiere aproximadamente un segundo para
localizar y unir una uni�n cebador / molde. Una vez que se une, una ADN polimerasa
no procesadora agrega nucle�tidos a una velocidad de un nucle�tido por segundo. Sin
embargo, las ADN polimerasas procesivas agregan m�ltiples nucle�tidos por segundo,
lo que aumenta dr�sticamente la velocidad de s�ntesis de ADN. El grado de
procesividad es directamente proporcional a la tasa de s�ntesis de ADN. La tasa de
s�ntesis de ADN en una c�lula viva se determin� primero como la tasa de elongaci�n
del ADN del fago T4 en bacterias infectadas con bacteri�fagos. Durante el per�odo
de aumento exponencial del ADN a 37 � C, la tasa fue de 749 nucle�tidos por
segundo.

La capacidad de la ADN polimerasa para deslizarse a lo largo de la plantilla de ADN

permite una mayor procesividad. Hay un aumento dram�tico en la procesividad en la
bifurcaci�n de replicaci�n. Este aumento se ve facilitado por la asociaci�n de la
ADN polimerasa con prote�nas conocidas como abrazadera deslizante de ADN. Las
pinzas son m�ltiples subunidades de prote�nas asociadas en forma de anillo.
Utilizando la hidr�lisis de ATP, una clase de prote�nas conocidas como prote�nas de
carga de abrazadera deslizante abren la estructura de anillo de las abrazaderas
deslizantes de ADN permitiendo la uni�n y liberaci�n de la hebra de ADN.
Interacci�n prote�na-prote�nacon la pinza evita que la ADN polimerasa se difunda
desde la plantilla de ADN, lo que garantiza que la enzima se una a la misma uni�n
cebador/plantilla y contin�e la replicaci�n. La ADN polimerasa cambia de
conformaci�n, aumentando la afinidad por la pinza cuando se asocia con ella y
disminuyendo la afinidad cuando completa la replicaci�n de un tramo de ADN para
permitir la liberaci�n de la pinza.

Reacci�n en cadena de la polimerasa

Art�culo principal: Reacci�n en cadena de la polimerasa
La propiedad de las ADN polimerasas para replicar hebras de ADN se utiliza para la
reacci�n en cadena de la polimerasa, conocida como PCR por sus siglas en ingl�s,
para obtener un gran n�mero de copias de un fragmento de ADN particular,
amplific�ndolo para prop�sitos de investigaci�n. En los procesos de PCR se requiere
la utilizaci�n de polimerasas termoestables, como la polimerasa Taq, debido a que
es necesario aplicar altas temperaturas para desnaturalizar la mol�cula de ADN.

Familias de ADN polimerasas

Seg�n la homolog�a de su estructura y la secuencia de amino�cidos las ADN
polimerasas se pueden clasificar en 6 familias. Las ADN polimerasas de los virus de
ADN son dif�ciles de clasificar en los siguientes grupos debido a la alta
divergencia de las secuencias virales.

Familia A: Incluye las ADN polimerasas eucariotas ?, ?, ?, la procariota I y la

viral T7.
Familia B: Incluye las ADN polimerasas eucariotas ?, a, d, e y la procariotas II.
Tambi�n se ha propuesto la inclusi�n de algunas ADN polimerasas virales.
Familia D: Incluye la ADN polimerasa procariota D y tambi�n se ha propuesto la
inclusi�n de algunas ADN polimerasas virales.
Familia X: Incluye las ADN polimerasas eucariotas �, s, ?, �, TDT y la procariota
III.
Familia Y: Incluye las ADN polimerasas eucariotas ?, ?, ? y las procariotas IV y V.
Familia RT: Incluye la telomerasa exclusiva de los eucariotas y las transcriptasas
inversas virales, eucariotas y procariotas.
ADN polimerasas procariotas

Holoenzima ADN Pol III de E. coli.

Actividad correctora exonucleasa 3' ? 5' de la subunidad e de la holoenzima ADN Pol

III.
Las ADN polimerasas de los procariotas (arqueas y bacterias) son: las Pol I, II,
III, IV, V, B, D y la RT cada una de ellas est� especializada en una o m�s de �stas
funciones seg�n cu�l sea su papel en la replicaci�n. Las polimerasas procari�ticas
existen en dos formas: polimerasa central y holoenzima. La polimerasa central
sintetiza ADN a partir de la plantilla de ADN, pero no puede iniciar la s�ntesis
sola o con precisi�n. La holoenzima inicia la s�ntesis con precisi�n.

Pol I
Las polimerasas procariotas de la familia A incluyen la enzima ADN polimerasa I
(Pol I), que est� codificada por el gen polA y es ubicua entre los procariotas.
Esta polimerasa reparadora participa en la reparaci�n por escisi�n con actividad
exonucleasa 3'-5 'y 5'-3' y en el procesamiento de fragmentos de Okazaki generados
durante la s�ntesis de la hebra retrasada.1? Pol I es la polimerasa m�s abundante y
representa> 95% de la actividad polimerasa en E. coli; sin embargo, se han
encontrado c�lulas que carecen de Pol I, lo que sugiere que la actividad de Pol I
puede ser reemplazada por las otras cuatro polimerasas. Pol I agrega ~ 15-20
nucle�tidos por segundo, mostrando as� una pobre procesividad. En cambio, Pol I
comienza a agregar nucle�tidos en el cebador de ARN: uni�n de plantilla conocida
como el origen de replicaci�n (ori). Aproximadamente 400 pb aguas abajo del origen,
la holoenzima Pol III se ensambla y se hace cargo de la replicaci�n a una velocidad
y naturaleza altamente procesivas.2?
La polimerasa Taq es una enzima termoestable de esta familia que carece de
capacidad de correcci�n de pruebas.3?

Pol II
La ADN polimerasa II es una polimerasa de la familia B codificada por el gen polB.
Pol II tiene actividad de exonucleasa 3'-5 'y participa en la reparaci�n del ADN ,
el reinicio de la replicaci�n para evitar lesiones, y su presencia celular puede
pasar de ~ 30-50 copias por c�lula a ~ 200-300 durante la inducci�n de SOS. Tambi�n
se cree que Pol II es una copia de seguridad de Pol III, ya que puede interactuar
con prote�nas holoenzim�ticas y asumir un alto nivel de procesividad. Se cree que
el papel principal de Pol II es la capacidad de dirigir la actividad de la
polimerasa en la bifurcaci�n de replicaci�n y ayud� a detener los desajustes
terminales de derivaci�n de Pol III.4?

Pol III
La holoenzima de la ADN polimerasa III es la enzima principal involucrada en la
replicaci�n del ADN en los procariotas y pertenece a la familia de las polimerasas
C. Consta de tres conjuntos: el n�cleo pol III, el factor de procesividad de la
abrazadera deslizante beta y el complejo de carga de la abrazadera. El n�cleo
consta de tres subunidades: a, el centro de actividad de la polimerasa, ?,
corrector de pruebas exonucleol�tico y ?, que puede actuar como estabilizador
para ?. El factor de procesividad de la abrazadera deslizante beta tambi�n est�
presente por duplicado, uno para cada n�cleo, para crear una abrazadera que
encierra el ADN, lo que permite una alta procesividad.5? El tercer conjunto es un
complejo cargador de pinzas de siete subunidades (t2?dd'??).

El viejo "modelo de tromb�n" de los libros de texto describe un complejo de

alargamiento con dos equivalentes de la enzima central en cada horquilla de
replicaci�n (RF), uno para cada hebra, el rezagado y el adelantado.6? Sin embargo,
la evidencia reciente de estudios de una sola mol�cula indica un promedio de tres
equivalentes estequiom�tricos de enzima central en cada RF tanto para Pol III como
para su contraparte en B. subtilis, PolC.7? La microscop�a fluorescente en la
c�lula ha revelado que la s�ntesis de la cadena principal puede no ser
completamente continua, y Pol III* (es decir, las subunidades a, e, t, d y ? de la
holoenzima sin la abrazadera deslizante �2) tiene una alta frecuencia de
disociaci�n de los RF activos.8? En estos estudios, la tasa de rotaci�n de la
horquilla de replicaci�n fue de aproximadamente 10 s para Pol III *, 47 s para la
pinza deslizante �2 y 15 m para la helicasa DnaB. Esto sugiere que la helicasa DnaB
puede permanecer asociada de manera estable en los RF y servir como un punto de
nucleaci�n para la holoenzima competente. Los estudios in vitro de una sola
mol�cula han demostrado que Pol III * tiene una alta tasa de renovaci�n de RF
cuando est� en exceso, pero permanece asociada de manera estable con horquillas de
replicaci�n cuando la concentraci�n es limitante.8? Otro estudio de una sola
mol�cula mostr� que la actividad de la helicasa de ADNB y el alargamiento de la
hebra pueden proceder con una cin�tica estoc�stica desacoplada.8?

Pol IV
La ADN polimerasa IV (Pol IV) es una ADN polimerasa propensa a errores que
participa en mutag�nesis no dirigida.9? Pol IV es una polimerasa de la familia Y
expresada por el gen dinB que se activa mediante la inducci�n de SOS causada por
polimerasas estancadas en la bifurcaci�n de replicaci�n. Durante la inducci�n de
SOS, la producci�n de Pol IV se multiplica por diez y una de las funciones durante
este tiempo es interferir con la procesividad de la holoenzima Pol III. Esto crea
un punto de control, detiene la replicaci�n y da tiempo para reparar las lesiones
del ADN a trav�s de la v�a de reparaci�n adecuada.10? Otra funci�n de Pol IV es
realizar la s�ntesis de translesiones en la bifurcaci�n de replicaci�n estancada
como, por ejemplo, eludir los aductos de N2-desoxiguanina a un ritmo m�s r�pido que
atravesar el ADN no da�ado. Las c�lulas que carecen del gen dinB tienen una mayor
tasa de mutag�nesis causada por agentes que da�an el ADN.11?
Pol V
La ADN polimerasa V (Pol V) es una ADN polimerasa de la familia Y que participa en
la respuesta SOS y en los mecanismos de reparaci�n del ADN de la s�ntesis de
translesi�n.12? La transcripci�n de Pol V a trav�s de los genes umuDC est�
altamente regulada para producir solo Pol V cuando el ADN da�ado est� presente en
la c�lula y genera una respuesta SOS. Las polimerasas estancadas hacen que RecA se
una al ssDNA, lo que hace que la prote�na LexA se digiera autom�ticamente. LexA
pierde entonces su capacidad para reprimir la transcripci�n del oper�n umuDC. La
misma nucleoprote�na RecA-ssDNA modifica postraduccionalmente la prote�na UmuD en
prote�na UmuD '. UmuD y UmuD 'forman un heterod�mero que interact�a con UmuC, que a
su vez activa la actividad catal�tica de la polimerasa de umuC en el ADN da�ado.13?
Se ha propuesto un modelo de "cintur�n de herramientas" de polimerasa para cambiar
la pol III por la pol IV en una horquilla de replicaci�n detenida, donde ambas
polimerasas se unen simult�neamente a la pinza �.14? Sin embargo, la participaci�n
de m�s de una polimerasa TLS trabajando en sucesi�n para evitar una lesi�n a�n no
se ha demostrado en E. coli. Adem�s, Pol IV puede catalizar tanto la inserci�n como
la extensi�n con alta eficiencia, mientras que pol V se considera la principal
polimerasa SOS TLS. Un ejemplo es la derivaci�n del entrecruzamiento de guanina
timina intracatenaria donde se demostr�, bas�ndose en la diferencia en las firmas
mutacionales de las dos polimerasas, que pol IV y pol V compiten por TLS del
entrecruzamiento intracatenario.14?

Familia D
En 1998, se descubri� la familia D de ADN polimerasas.15? El complejo PolD es un
heterod�mero de dos cadenas, cada una codificada por DP1 (correcci�n peque�a) y DP2
(catal�tico grande). A diferencia de otras ADN polimerasas, la estructura y el
mecanismo del n�cleo catal�tico DP2 se parecen a los de las ARN polimerasas de
m�ltiples subunidades. La interfaz DP1-DP2 se parece a la del dedo de zinc de
polimerasa eucariota de clase B y su peque�a subunidad. DP1, una exonucleasa
similar a Mre11, es probablemente el precursor de una peque�a subunidad de Pol a y
e, proporcionando capacidades de correcci�n de pruebas ahora perdidas en
eucariotas. Su dominio HSH N-terminal es similar a las prote�nas AAA, especialmente
la subunidad d y RuvB de Pol III , en estructura. DP2 tiene un dominio KH de clase
II. PolD es m�s estable al calor y m�s preciso que la polimerasa Taq , pero a�n no
se ha comercializado. Se ha sugerido que la ADN polimerasa de la familia D fue la
primera en evolucionar en organismos celulares y que la polimerasa replicativa del
�ltimo antepasado com�n universal (LUCA) pertenec�a a la familia D.16?

Transcriptasa inversa (RT)

Es una ADN polimerasa dependiente de ARN (RdDp) que sintetiza ADN a partir de una
plantilla de ARN. La familia de la transcriptasa inversa contiene tanto la
funcionalidad de la ADN polimerasa como la funcionalidad de la ARNasa H, que
degrada el ARN emparejado con el ADN. La transcriptasa inversa se emplea com�nmente
en la amplificaci�n de ARN con fines de investigaci�n. Usando una plantilla de ARN,
la PCR puede utilizar la transcriptasa inversa, creando una plantilla de ADN. Esta
nueva plantilla de ADN se puede utilizar para una amplificaci�n t�pica por PCR. Los
productos de tal experimento son, por tanto, productos de PCR amplificados a partir
de ARN.

La transcripci�n inversa se acompa�a de un cambio de plantilla entre las dos copias

del genoma (recombinaci�n por elecci�n de copia). De 5 a 14 eventos de
recombinaci�n por genoma ocurren en cada ciclo de replicaci�n. El cambio de
plantilla (recombinaci�n) parece ser necesario para mantener la integridad del
genoma y como un mecanismo de reparaci�n para salvar los genomas da�ados

ADN polimerasa en eucariotas

Hay varios tipos de ADN polimerasa en los eucariotas: son las Pol ?, a, d, ?, ?, ?,
e, �, s, ?, �, ?, ?, ?, TDT y la RT. La primasa (que es parte de la mol�cula de ADN
polimerasa a) sintetiza cebadores de ARN y adem�s comienza la elongaci�n con ADN de
las dos cadenas. Despu�s se produce un cambio de polimerasa y entra la ADN
polimerasa s, que contin�a la s�ntesis.

Polimerasas �, ?, s, � (beta, lambda, sigma, mu) y TdT

Las polimerasas de la familia X contienen la polimerasa eucariota pol � (beta) bien
conocida, as� como otras polimerasas eucariotas como Pol s (sigma), Pol ?
(lambda) , Pol � (mu) y desoxinucleotidil transferasa terminal (TdT) . Las
polimerasas de la familia X se encuentran principalmente en vertebrados y algunas
se encuentran en plantas y hongos. Estas polimerasas tienen regiones altamente
conservadas que incluyen dos motivos h�lice-horquilla-h�lice que son imperativos en
las interacciones ADN-polimerasa. Un motivo est� ubicado en el dominio de 8 kDa que
interact�a con el ADN corriente abajo y un motivo est� ubicado en el dominio del
pulgar que interact�a con la cadena del cebador. Pol �, codificado por el gen POLB,
es necesario para la reparaci�n por escisi�n de base de parche corto, una v�a de
reparaci�n del ADN que es esencial para reparar bases alquiladas u oxidadas, as�
como sitios ab�sicos . Pol ? y Pol �, codificados por los genes POLL y POLM
respectivamente, est�n involucrados en la uni�n de extremos no hom�logos , un
mecanismo para volver a unir las roturas de doble cadena del ADN debido al per�xido
de hidr�geno y la radiaci�n ionizante, respectivamente. TdT se expresa s�lo en
tejido linfoide y a�ade "n nucle�tidos" a las roturas de doble hebra formadas
durante la recombinaci�n V (D) J para promover la diversidad inmunol�gica.17?

Polimerasas a, d y e (alfa, delta y �psilon)

Pol a (alfa) , Pol d (delta) y Pol e (�psilon) son miembros de las polimerasas de
la familia B y son las principales polimerasas implicadas en la replicaci�n del ADN
nuclear. El complejo Pol a (complejo pol a-ADN primasa) consta de cuatro
subunidades: la subunidad catal�tica POLA1 , la subunidad reguladora POLA2 y las
subunidades primasa peque�a y grande PRIM1 y PRIM2, respectivamente. Una vez que la
primasa ha creado el cebador de ARN, Pol a comienza la replicaci�n alargando el
cebador con ~ 20 nucle�tidos. Debido a su alta procesividad, Pol d se hace cargo de
la s�ntesis de las cadenas principales y retrasadas de Pol a. Pol d se expresa
mediante los genes POLD1 , creando la subunidad catal�tica, POLD2 , POLD3 y POLD4
creando las otras subunidades que interact�an con el ant�geno nuclear de c�lulas
proliferantes (PCNA), que es una abrazadera de ADN que permite que Pol d posea
procesividad. Pol e est� codificado por el gen POLE1, la subunidad catal�tica,
POLE2 y POLE3. Se ha informado que la funci�n de Pol e es extender la cadena
principal durante la replicaci�n, mientras que Pol d replica principalmente la
hebra rezagada; sin embargo, evidencia reciente sugiri� que Pol d tambi�n podr�a
tener un papel en la replicaci�n de la cadena principal de ADN. La regi�n C-
terminal de Pol e "reliquia de la polimerasa", a pesar de ser innecesaria para la
actividad de la polimerasa, se cree que es esencial para la vitalidad celular. Se
cree que la regi�n C-terminal proporciona un punto de control antes de entrar en
anafase, proporciona estabilidad a la holoenzima y agrega prote�nas a la holoenzima
necesarias para el inicio de la replicaci�n. Pol e tiene un dominio "palma" m�s
grande que proporciona alta procesividad independientemente del PCNA.

En comparaci�n con otras polimerasas de la familia B, la familia de exonucleasas

DEDD responsable de la correcci�n de pruebas est� inactivada en Pol a. Pol e es
�nico en el sentido de que tiene dos dominios con dedos de zinc y una copia
inactiva de otra polimerasa de la familia B en su C-terminal. La presencia de este
dedo de zinc tiene implicaciones en los or�genes de Eukaryota, que en este caso se
coloca en el grupo Asgard con polimerasa arqueal B3.

Polimerasas ?, ? y ? (eta, iota y kappa)

Pol ? (eta) , Pol ? (iota) y Pol ? (kappa), son ADN polimerasas de la familia Y
implicadas en la reparaci�n del ADN por s�ntesis de translesi�n y codificadas por
los genes POLH, POLI y POLK respectivamente. Los miembros de la Familia Y tienen
cinco motivos comunes para ayudar a unir el sustrato y el extremo del cebador y
todos incluyen los dominios t�picos del pulgar, la palma y el dedo de la mano
derecha con dominios agregados como el dedo me�ique (LF), el dominio asociado a la
polimerasa (PAD) o mu�eca. El sitio activo, sin embargo, difiere entre los miembros
de la familia debido a las diferentes lesiones que se reparan. Las polimerasas de
la familia Y son polimerasas de baja fidelidad, pero se ha demostrado que hacen m�s
bien que mal, ya que las mutaciones que afectan a la polimerasa pueden causar
diversas enfermedades, como c�ncer de piel y la variante de Xeroderma Pigmentosum
(XPS). La importancia de estas polimerasas se evidencia por el hecho de que el gen
que codifica la ADN polimerasa ? se conoce como XPV, porque la p�rdida de este gen
da como resultado la variante Xeroderma Pigmentosum de la enfermedad. Pol ? es
particularmente importante para permitir una s�ntesis de translesi�n precisa del
da�o del ADN resultante de la radiaci�n ultravioleta. La funcionalidad de Pol ? no
se comprende completamente, pero los investigadores han encontrado dos funciones
probables. Se cree que Pol ? act�a como un extensor o un insertador de una base
espec�fica en ciertas lesiones del ADN. Las tres polimerasas de s�ntesis de
translesiones, junto con Rev1, se reclutan en las lesiones da�adas a trav�s de ADN
polimerasas replicativas estancadas. Hay dos v�as de reparaci�n de da�os que llevan
a los investigadores a concluir que la v�a elegida depende de qu� hebra contiene el
da�o, la hebra principal o la rezagada.

Polimerasas Rev1 y ? (zeta)

La Pol ? otra polimerasa de la familia B, est� formada por dos subunidades Rev3, la
subunidad catal�tica, y Rev7 (MAD2L2), que aumenta la funci�n catal�tica de la
polimerasa y participa en la s�ntesis de translesiones. Pol ? carece de actividad
exonucleasa 3 'a 5', es �nico porque puede extender cebadores con desajustes
terminales. Rev1 tiene tres regiones de inter�s en el dominio BRCT , dominio de
uni�n a ubiquitina, y dominio C-terminal y tiene capacidad de transferasa de dCMP,
que agrega lesiones opuestas de desoxicitidina que detendr�an las polimerasas
replicativas Pol d y Pol e. Estas polimerasas estancadas activan complejos de
ubiquitina que a su vez disocian las polimerasas de replicaci�n y reclutan Pol ? y
Rev1. Juntos, Pol ? y Rev1 a�aden desoxicitidina y Pol ? se extiende m�s all� de la
lesi�n. A trav�s de un proceso a�n indeterminado, Pol ? se disocia y las
polimerasas de replicaci�n se reasocian y contin�an la replicaci�n. Pol ? y Rev1 no
son necesarios para la replicaci�n, pero la p�rdida del gen REV3 en la levadura en
gemaci�n puede causar una mayor sensibilidad a los agentes que da�an el ADN debido
al colapso de las horquillas de replicaci�n donde las polimerasas de replicaci�n se
han estancado.

Polimerasas ?, ? y ? (gamma, theta y nu)

Pol ? (gamma), Pol ? (theta) y Pol ? (nu) son polimerasas de la familia A. Durante
mucho tiempo se pens� que Pol ?, codificada por el gen POLG era la �nica polimerasa
mitocondrial. Sin embargo, investigaciones recientes muestran que al menos Pol �
(beta) , una polimerasa de la Familia X, tambi�n est� presente en las mitocondrias.
Cualquier mutaci�n que produzca una Pol ? limitada o que no funcione tiene un
efecto significativo sobre el ADNmt y es la causa m�s com�n de trastornos
mitocondriales hereditarios autos�micos. Pol ? contiene un dominio de polimerasa C-
terminal y un dominio de exonucleasa N-terminal 3'-5 'que est�n conectados a trav�s
de la regi�n enlazadora, que se une a la subunidad accesoria. La subunidad
accesoria se une al ADN y es necesaria para la procesividad de Pol ?. La mutaci�n
puntual A467T en la regi�n enlazadora es responsable de m�s de un tercio de todos
los trastornos mitocondriales asociados con Pol ?. Si bien muchos hom�logos de
Pol ?, codificados por POLQgen, se encuentran en eucariotas, su funci�n no se
comprende claramente. La secuencia de amino�cidos en el extremo C es lo que
clasifica a Pol ? como polimerasa de la familia A, aunque la tasa de error de Pol ?
est� m�s estrechamente relacionada con las polimerasas de la familia Y. Pol ?
extiende los extremos del cebador que no coinciden y puede eludir sitios ab�sicos
a�adiendo un nucle�tido. Tambi�n tiene actividad desoxirribofosfodiesterasa
(dRPasa) en el dominio de la polimerasa y puede mostrar actividad ATPasa en
estrecha proximidad al ssDNA. Pol ? (nu) se considera la menos eficaz de las
enzimas polimerasas. Sin embargo, la ADN polimerasa nu juega un papel activo en la
reparaci�n de la homolog�a durante las respuestas celulares a los enlaces cruzados.

Transcriptasa inversa (RT)

Es una ADN polimerasa dependiente de ARN (RdDp) que sintetiza ADN a partir de una
plantilla de ARN. La familia de la transcriptasa inversa contiene tanto la
funcionalidad de la ADN polimerasa como la funcionalidad de la ARNasa H, que
degrada el ARN emparejado con el ADN. La transcriptasa inversa se emplea com�nmente
en la amplificaci�n de ARN con fines de investigaci�n. Usando una plantilla de ARN,
la PCR puede utilizar la transcriptasa inversa, creando una plantilla de ADN. Esta
nueva plantilla de ADN se puede utilizar para una amplificaci�n t�pica por PCR. Los
productos de tal experimento son, por tanto, productos de PCR amplificados a partir
de ARN.

La transcripci�n inversa se acompa�a de un cambio de plantilla entre las dos copias

del genoma (recombinaci�n por elecci�n de copia). De 5 a 14 eventos de
recombinaci�n por genoma ocurren en cada ciclo de replicaci�n. El cambio de
plantilla (recombinaci�n) parece ser necesario para mantener la integridad del
genoma y como un mecanismo de reparaci�n para salvar los genomas da�ados.

Telomerasa
La telomerasa es una enzima que funciona para replicar los extremos de los
cromosomas lineales, ya que la ADN polimerasa normal no puede replicar los extremos
o los tel�meros. El saliente 3 'monocatenario del cromosoma bicatenario con la
secuencia 5'-TTAGGG-3' recluta telomerasa. La telomerasa act�a como otras ADN
polimerasas al extender el extremo 3 ', pero, a diferencia de otras ADN
polimerasas, la telomerasa no requiere una plantilla. La subunidad TERT, un ejemplo
de transcriptasa inversa, utiliza la subunidad de ARN para formar la uni�n cebador-
molde que permite que la telomerasa extienda el extremo 3 'de los extremos del
cromosoma. Se cree que la disminuci�n gradual del tama�o de los tel�meros como
resultado de muchas replicaciones a lo largo de la vida est� asociada con los
efectos del envejecimiento.

ADN polimerasas virales

Los virus de ADN sintetizan una gran variedad de ADN polimerasas, que en su mayor�a
no est�n emparentadas con las ADN polimerasas celulares o con las de otros virus de
ADN. Los virus retrotranscritos como el VIH se caracterizan por sintetizar
transcriptasas inversas, las cuales si est�n emparentadas entre s� y tambi�n con
las transcriptasas inversas celulares en especial con las eucariotas.

El fago F29 sintetiza una ADN polimerasa propia. Esta enzima es muy utilizada en
biolog�a molecular para m�ltiples procedimientos de desplazamiento de amplificaci�n
de ADN, y tiene una serie de caracter�sticas que la hacen particularmente adecuada
para esta aplicaci�n.

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IdentificadoresMicrosoft Academic: 2756471Diccionarios y enciclopediasBritannica:
urlIdentificadores qu�micosN�mero CAS: 9012-90-2N�meros EINECS: 232-741-
2Identificadores biol�gicosMGI: 9012-90-2
Categor�as: EC 2.7.7Replicaci�n de ADNPolimerasas

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