Las ADN polimerasas son enzimas (celulares o virales) que intervienen en el proceso

de replicación del ADN. Llevan a cabo la síntesis de la nueva cadena de ADN

emparejando los desoxirribonucleótidos trifosfato (dNTP) con los
desoxirribonucleótidos complementarios correspondientes del ADN molde. Los dNTP que
se usan en la replicación del ADN contienen tres fosfatos unidos al grupo hidroxilo
5' de la desoxirribosa y dependiendo de la base nitrogenada serán dATP, dTTP, dCTP
o dGTP. La reacción fundamental es una transferencia de un grupo fosfato en la que
el grupo 3'-OH actúa como nucleófilo en el extremo 3' de la cadena que está en
crecimiento. El ataque nucleofílico se produce sobre el fosfato α (el más próximo a
la desoxirribosa) del desoxirribonucleósido 5' trifosfato que entra, liberándose
pirofosfato inorgánico y alargándose el ADN (al formarse un nuevo enlace
fosfodiéster). A diferencia de la mayoría de procesos biológicos que ocurren en la
célula en los que solo se separa un grupo fosfato (Pi), durante la replicación se
separan los dos últimos grupos fosfato, en forma de grupo pirofosfato (PPi)

Este proceso se puede resumir en una ecuación química:

(DNA)n + dNTP ↔ (DNA)n+1 + PPi

A pesar de que la ADN polimerasa solo tiene un sitio activo para emparejar los
cuatro dNTPs diferentes, la unión correcta de los pares de bases A:T, C:G es
posible basándose en la geometría de estos: si la unión es incorrecta se produce un
desplazamiento del fosfato α haciendo más difícil su unión al extremo 3'-OH y
ralentizando así el ritmo de catalísis, lo que da lugar a que la ADN polimerasa
añada preferentemente las bases correctas.

Las ADN polimerasas pueden añadir hasta 1000 nucleótidos por segundo. Esto es
debido a su naturaleza, es decir, el número de nucleótidos que son capaces de
añadir cada vez que se asocian al molde de ADN que van a copiar. Dado que la
adición de los nucleótidos es un proceso que dura unos milisegundos, la velocidad
de catálisis va a depender del tiempo que la ADN polimerasa permanece unida al ADN,
esto es, de su procesividad.

Función correctora exonucleasa 3' → 5' de las ADN polimerasas.

El crecimiento de la cadena se produce en dirección 5' → 3', ya que se requiere de
un grupo 3'-OH libre para el inicio de la síntesis puesto que este es el que
realiza el ataque nucleofílico sobre el fosfato α del dNTP, de forma que las ADN
polimerasas requieren de un iniciador 3'-OH (que puede ser de ADN o ARN) llamado
cebador que es sintetizado por la ARN primasa. El extremo 3' del cebador se
denomina extremo cebador.

Las ADN polimerasas también realizan otras funciones durante el proceso de

replicación. Además de participar en la elongación, desempeñan una función
correctora y reparadora gracias a su actividad exonucleasa 3', que les confiere la
capacidad de degradar el ADN partiendo de un extremo de este. Es importante que
existan estos mecanismos de corrección ya que de lo contrario los errores
producidos durante la copia del ADN darían lugar a mutaciones.

Índice
1 Funciones
1.1 Estructura
1.2 Procesividad
2 Reacción en cadena de la polimerasa
3 Familias de ADN polimerasas
4 ADN polimerasas procariotas
4.1 Pol I
4.2 Pol II
4.3 Pol III
4.4 Pol IV
4.5 Pol V
4.6 Familia D
4.7 Transcriptasa inversa (RT)
5 ADN polimerasa en eucariotas
5.1 Polimerasas β, λ, σ, μ (beta, lambda, sigma, mu) y TdT
5.2 Polimerasas α, δ y ε (alfa, delta y épsilon)
5.3 Polimerasas η, ι y κ (eta, iota y kappa)
5.4 Polimerasas Rev1 y ζ (zeta)
5.5 Polimerasas γ, θ y ν (gamma, theta y nu)
5.6 Transcriptasa inversa (RT)
5.7 Telomerasa
6 ADN polimerasas virales
7 Referencias
8 Bibliografía
Funciones
Las ADN polimerasas pueden agregar nucleótidos libres solo al extremo 3 ' de la
cadena de ADN en formación. Esto provoca que el alargamiento de la cadena en
formación se realice en la dirección 5'-3 '. Ninguna ADN polimerasa conocida puede
iniciar una hebra de ADN nuevamente, es decir, no puede colocar el primer
nucleótido en la hebra, luego de unir el segundo, luego el tercero, y así
sucesivamente. Todo lo que pueden hacer es alargar una cadena existente por su
extremo 3'-OH, por lo que siempre debe haber un fragmento inicial ya formado. Esta
es la razón por la que la ADN polimerasa necesita un cebador pre-formado al que
agregar nucleótidos. Los cebadores pueden estar formados por ARN o ADN. En la
replicación del ADN, las dos primeras bases son siempre ARN y son sintetizadas por
otra enzima llamada primasa. También se requiere una enzima llamada helicasa para
desenredar el ADN y deshacer en esa región su estructura de doble hebra y formar la
estructura de dos hebras simples bifurcadas (esta región es la horquilla de
replicación o horquilla de replicación), lo que facilita la replicación de cada una
de las hebras siguiendo el modelo semiconservador de replicación del ADN.

Otra propiedad que tienen algunas ADN polimerasas, pero no todas, es la corrección
de errores. Este proceso corrige los errores producidos durante la formación del
ADN neosintetizado. Cuando se reconoce un par de bases incorrectamente colocado, la
ADN polimerasa invierte la dirección de su movimiento al retrasar un par de bases.
Esta actividad exonucleasa 3'-5' de la enzima permite eliminar el par de bases
incorrecto para luego ser reemplazado por el correcto, la propia polimerasa que
continuará la replicación. Esta actividad se llama corrección de pruebas. Las ADN
polimerasas se utilizan ampliamente en experimentos de biología molecular.

Las ADN polimerasas tienen una estructura muy conservada, lo que significa que sus
subunidades catalíticas varían muy poco de una especie a otra. Las estructuras
conservadas generalmente realizan funciones importantes e insustituibles en la
célula, cuyo mantenimiento produce una serie de ventajas.

Estructura
Las ADN polimerasas conocidas tienen una estructura muy conservada, lo que
significa que sus subunidades catalíticas generales varían muy poco de una especie
a otra, independientemente de sus estructuras de dominio. Las estructuras
conservadas suelen indicar funciones importantes e insustituibles de la célula,
cuyo mantenimiento proporciona ventajas evolutivas. La forma se puede describir
como una mano derecha con dominios de pulgar, dedo y palma. El dominio de la palma
parece funcionar catalizando la transferencia de grupos fosforilo en la reacción de
transferencia de fosforilo. El ADN se une a la palma cuando la enzima está activa.
Se cree que esta reacción está catalizada por un mecanismo de iones de dos metales.
El dominio de los dedos funciona para unir los nucleósidos trifosfatos.con la base
de la plantilla. El dominio del pulgar juega un papel potencial en la procesividad,
la translocación y el posicionamiento del ADN.

Procesividad
La rápida catálisis de la ADN polimerasa se debe a su naturaleza procesiva. La
procesividad es una característica de las enzimas que funcionan sobre sustratos
poliméricos. En el caso de la ADN polimerasa, el grado de procesividad se refiere
al número medio de nucleótidos añadidos cada vez que la enzima se une a una
plantilla. La ADN polimerasa promedio requiere aproximadamente un segundo para
localizar y unir una unión cebador / molde. Una vez que se une, una ADN polimerasa
no procesadora agrega nucleótidos a una velocidad de un nucleótido por segundo. Sin
embargo, las ADN polimerasas procesivas agregan múltiples nucleótidos por segundo,
lo que aumenta drásticamente la velocidad de síntesis de ADN. El grado de
procesividad es directamente proporcional a la tasa de síntesis de ADN. La tasa de
síntesis de ADN en una célula viva se determinó primero como la tasa de elongación
del ADN del fago T4 en bacterias infectadas con bacteriófagos. Durante el período
de aumento exponencial del ADN a 37 ° C, la tasa fue de 749 nucleótidos por
segundo.

La capacidad de la ADN polimerasa para deslizarse a lo largo de la plantilla de ADN

permite una mayor procesividad. Hay un aumento dramático en la procesividad en la
bifurcación de replicación. Este aumento se ve facilitado por la asociación de la
ADN polimerasa con proteínas conocidas como abrazadera deslizante de ADN. Las
pinzas son múltiples subunidades de proteínas asociadas en forma de anillo.
Utilizando la hidrólisis de ATP, una clase de proteínas conocidas como proteínas de
carga de abrazadera deslizante abren la estructura de anillo de las abrazaderas
deslizantes de ADN permitiendo la unión y liberación de la hebra de ADN.
Interacción proteína-proteínacon la pinza evita que la ADN polimerasa se difunda
desde la plantilla de ADN, lo que garantiza que la enzima se una a la misma unión
cebador/plantilla y continúe la replicación. La ADN polimerasa cambia de
conformación, aumentando la afinidad por la pinza cuando se asocia con ella y
disminuyendo la afinidad cuando completa la replicación de un tramo de ADN para
permitir la liberación de la pinza.

Reacción en cadena de la polimerasa

Artículo principal: Reacción en cadena de la polimerasa
La propiedad de las ADN polimerasas para replicar hebras de ADN se utiliza para la
reacción en cadena de la polimerasa, conocida como PCR por sus siglas en inglés,
para obtener un gran número de copias de un fragmento de ADN particular,
amplificándolo para propósitos de investigación. En los procesos de PCR se requiere
la utilización de polimerasas termoestables, como la polimerasa Taq, debido a que
es necesario aplicar altas temperaturas para desnaturalizar la molécula de ADN.

Familias de ADN polimerasas

Según la homología de su estructura y la secuencia de aminoácidos las ADN
polimerasas se pueden clasificar en 6 familias. Las ADN polimerasas de los virus de
ADN son difíciles de clasificar en los siguientes grupos debido a la alta
divergencia de las secuencias virales.

Familia A: Incluye las ADN polimerasas eucariotas γ, θ, ν, la procariota I y la

viral T7.
Familia B: Incluye las ADN polimerasas eucariotas ζ, α, δ, ε y la procariotas II.
También se ha propuesto la inclusión de algunas ADN polimerasas virales.
Familia D: Incluye la ADN polimerasa procariota D y también se ha propuesto la
inclusión de algunas ADN polimerasas virales.
Familia X: Incluye las ADN polimerasas eucariotas β, σ, λ, μ, TDT y la procariota
III.
Familia Y: Incluye las ADN polimerasas eucariotas ι, κ, η y las procariotas IV y V.
Familia RT: Incluye la telomerasa exclusiva de los eucariotas y las transcriptasas
inversas virales, eucariotas y procariotas.
ADN polimerasas procariotas

Holoenzima ADN Pol III de E. coli.

Actividad correctora exonucleasa 3' → 5' de la subunidad ε de la holoenzima ADN Pol

III.
Las ADN polimerasas de los procariotas (arqueas y bacterias) son: las Pol I, II,
III, IV, V, B, D y la RT cada una de ellas está especializada en una o más de éstas
funciones según cuál sea su papel en la replicación. Las polimerasas procarióticas
existen en dos formas: polimerasa central y holoenzima. La polimerasa central
sintetiza ADN a partir de la plantilla de ADN, pero no puede iniciar la síntesis
sola o con precisión. La holoenzima inicia la síntesis con precisión.

Pol I
Las polimerasas procariotas de la familia A incluyen la enzima ADN polimerasa I
(Pol I), que está codificada por el gen polA y es ubicua entre los procariotas.
Esta polimerasa reparadora participa en la reparación por escisión con actividad
exonucleasa 3'-5 'y 5'-3' y en el procesamiento de fragmentos de Okazaki generados
durante la síntesis de la hebra retrasada.1 Pol I es la polimerasa más abundante y
representa> 95% de la actividad polimerasa en E. coli; sin embargo, se han
encontrado células que carecen de Pol I, lo que sugiere que la actividad de Pol I
puede ser reemplazada por las otras cuatro polimerasas. Pol I agrega ~ 15-20
nucleótidos por segundo, mostrando así una pobre procesividad. En cambio, Pol I
comienza a agregar nucleótidos en el cebador de ARN: unión de plantilla conocida
como el origen de replicación (ori). Aproximadamente 400 pb aguas abajo del origen,
la holoenzima Pol III se ensambla y se hace cargo de la replicación a una velocidad
y naturaleza altamente procesivas.2

La polimerasa Taq es una enzima termoestable de esta familia que carece de

capacidad de corrección de pruebas.3

Pol II
La ADN polimerasa II es una polimerasa de la familia B codificada por el gen polB.
Pol II tiene actividad de exonucleasa 3'-5 'y participa en la reparación del ADN ,
el reinicio de la replicación para evitar lesiones, y su presencia celular puede
pasar de ~ 30-50 copias por célula a ~ 200-300 durante la inducción de SOS. También
se cree que Pol II es una copia de seguridad de Pol III, ya que puede interactuar
con proteínas holoenzimáticas y asumir un alto nivel de procesividad. Se cree que
el papel principal de Pol II es la capacidad de dirigir la actividad de la
polimerasa en la bifurcación de replicación y ayudó a detener los desajustes
terminales de derivación de Pol III.4

Pol III
La holoenzima de la ADN polimerasa III es la enzima principal involucrada en la
replicación del ADN en los procariotas y pertenece a la familia de las polimerasas
C. Consta de tres conjuntos: el núcleo pol III, el factor de procesividad de la
abrazadera deslizante beta y el complejo de carga de la abrazadera. El núcleo
consta de tres subunidades: α, el centro de actividad de la polimerasa, ɛ,
corrector de pruebas exonucleolítico y θ, que puede actuar como estabilizador para
ɛ. El factor de procesividad de la abrazadera deslizante beta también está presente
por duplicado, uno para cada núcleo, para crear una abrazadera que encierra el ADN,
lo que permite una alta procesividad.5 El tercer conjunto es un complejo cargador
de pinzas de siete subunidades (τ2γδδ′χψ).

El viejo "modelo de trombón" de los libros de texto describe un complejo de

alargamiento con dos equivalentes de la enzima central en cada horquilla de
replicación (RF), uno para cada hebra, el rezagado y el adelantado.6 Sin embargo,
la evidencia reciente de estudios de una sola molécula indica un promedio de tres
equivalentes estequiométricos de enzima central en cada RF tanto para Pol III como
para su contraparte en B. subtilis, PolC.7 La microscopía fluorescente en la célula
ha revelado que la síntesis de la cadena principal puede no ser completamente
continua, y Pol III* (es decir, las subunidades α, ε, τ, δ y χ de la holoenzima sin
la abrazadera deslizante ß2) tiene una alta frecuencia de disociación de los RF
activos.8 En estos estudios, la tasa de rotación de la horquilla de replicación fue
de aproximadamente 10 s para Pol III *, 47 s para la pinza deslizante ß2 y 15 m
para la helicasa DnaB. Esto sugiere que la helicasa DnaB puede permanecer asociada
de manera estable en los RF y servir como un punto de nucleación para la holoenzima
competente. Los estudios in vitro de una sola molécula han demostrado que Pol III *
tiene una alta tasa de renovación de RF cuando está en exceso, pero permanece
asociada de manera estable con horquillas de replicación cuando la concentración es
limitante.8 Otro estudio de una sola molécula mostró que la actividad de la
helicasa de ADNB y el alargamiento de la hebra pueden proceder con una cinética
estocástica desacoplada.8

Pol IV
La ADN polimerasa IV (Pol IV) es una ADN polimerasa propensa a errores que
participa en mutagénesis no dirigida.9 Pol IV es una polimerasa de la familia Y
expresada por el gen dinB que se activa mediante la inducción de SOS causada por
polimerasas estancadas en la bifurcación de replicación. Durante la inducción de
SOS, la producción de Pol IV se multiplica por diez y una de las funciones durante
este tiempo es interferir con la procesividad de la holoenzima Pol III. Esto crea
un punto de control, detiene la replicación y da tiempo para reparar las lesiones
del ADN a través de la vía de reparación adecuada.10 Otra función de Pol IV es
realizar la síntesis de translesiones en la bifurcación de replicación estancada
como, por ejemplo, eludir los aductos de N2-desoxiguanina a un ritmo más rápido que
atravesar el ADN no dañado. Las células que carecen del gen dinB tienen una mayor
tasa de mutagénesis causada por agentes que dañan el ADN.11

Pol V
La ADN polimerasa V (Pol V) es una ADN polimerasa de la familia Y que participa en
la respuesta SOS y en los mecanismos de reparación del ADN de la síntesis de
translesión.12 La transcripción de Pol V a través de los genes umuDC está altamente
regulada para producir solo Pol V cuando el ADN dañado está presente en la célula y
genera una respuesta SOS. Las polimerasas estancadas hacen que RecA se una al
ssDNA, lo que hace que la proteína LexA se digiera automáticamente. LexA pierde
entonces su capacidad para reprimir la transcripción del operón umuDC. La misma
nucleoproteína RecA-ssDNA modifica postraduccionalmente la proteína UmuD en
proteína UmuD '. UmuD y UmuD 'forman un heterodímero que interactúa con UmuC, que a
su vez activa la actividad catalítica de la polimerasa de umuC en el ADN dañado.13
Se ha propuesto un modelo de "cinturón de herramientas" de polimerasa para cambiar
la pol III por la pol IV en una horquilla de replicación detenida, donde ambas
polimerasas se unen simultáneamente a la pinza β.14 Sin embargo, la participación
de más de una polimerasa TLS trabajando en sucesión para evitar una lesión aún no
se ha demostrado en E. coli. Además, Pol IV puede catalizar tanto la inserción como
la extensión con alta eficiencia, mientras que pol V se considera la principal
polimerasa SOS TLS. Un ejemplo es la derivación del entrecruzamiento de guanina
timina intracatenaria donde se demostró, basándose en la diferencia en las firmas
mutacionales de las dos polimerasas, que pol IV y pol V compiten por TLS del
entrecruzamiento intracatenario.14

Familia D
En 1998, se descubrió la familia D de ADN polimerasas.15 El complejo PolD es un
heterodímero de dos cadenas, cada una codificada por DP1 (corrección pequeña) y DP2
(catalítico grande). A diferencia de otras ADN polimerasas, la estructura y el
mecanismo del núcleo catalítico DP2 se parecen a los de las ARN polimerasas de
múltiples subunidades. La interfaz DP1-DP2 se parece a la del dedo de zinc de
polimerasa eucariota de clase B y su pequeña subunidad. DP1, una exonucleasa
similar a Mre11, es probablemente el precursor de una pequeña subunidad de Pol α y
ε, proporcionando capacidades de corrección de pruebas ahora perdidas en
eucariotas. Su dominio HSH N-terminal es similar a las proteínas AAA, especialmente
la subunidad δ y RuvB de Pol III , en estructura. DP2 tiene un dominio KH de clase
II. PolD es más estable al calor y más preciso que la polimerasa Taq , pero aún no
se ha comercializado. Se ha sugerido que la ADN polimerasa de la familia D fue la
primera en evolucionar en organismos celulares y que la polimerasa replicativa del
último antepasado común universal (LUCA) pertenecía a la familia D.16

Transcriptasa inversa (RT)

Es una ADN polimerasa dependiente de ARN (RdDp) que sintetiza ADN a partir de una
plantilla de ARN. La familia de la transcriptasa inversa contiene tanto la
funcionalidad de la ADN polimerasa como la funcionalidad de la ARNasa H, que
degrada el ARN emparejado con el ADN. La transcriptasa inversa se emplea comúnmente
en la amplificación de ARN con fines de investigación. Usando una plantilla de ARN,
la PCR puede utilizar la transcriptasa inversa, creando una plantilla de ADN. Esta
nueva plantilla de ADN se puede utilizar para una amplificación típica por PCR. Los
productos de tal experimento son, por tanto, productos de PCR amplificados a partir
de ARN.

La transcripción inversa se acompaña de un cambio de plantilla entre las dos copias

del genoma (recombinación por elección de copia). De 5 a 14 eventos de
recombinación por genoma ocurren en cada ciclo de replicación. El cambio de
plantilla (recombinación) parece ser necesario para mantener la integridad del
genoma y como un mecanismo de reparación para salvar los genomas dañados

ADN polimerasa en eucariotas

Hay varios tipos de ADN polimerasa en los eucariotas: son las Pol ζ, α, δ, γ, θ, ν,
ε, β, σ, λ, μ, ι, κ, η, TDT y la RT. La primasa (que es parte de la molécula de ADN
polimerasa α) sintetiza cebadores de ARN y además comienza la elongación con ADN de
las dos cadenas. Después se produce un cambio de polimerasa y entra la ADN
polimerasa σ, que continúa la síntesis.

Polimerasas β, λ, σ, μ (beta, lambda, sigma, mu) y TdT

Las polimerasas de la familia X contienen la polimerasa eucariota pol β (beta) bien
conocida, así como otras polimerasas eucariotas como Pol σ (sigma), Pol λ
(lambda) , Pol μ (mu) y desoxinucleotidil transferasa terminal (TdT) . Las
polimerasas de la familia X se encuentran principalmente en vertebrados y algunas
se encuentran en plantas y hongos. Estas polimerasas tienen regiones altamente
conservadas que incluyen dos motivos hélice-horquilla-hélice que son imperativos en
las interacciones ADN-polimerasa. Un motivo está ubicado en el dominio de 8 kDa que
interactúa con el ADN corriente abajo y un motivo está ubicado en el dominio del
pulgar que interactúa con la cadena del cebador. Pol β, codificado por el gen POLB,
es necesario para la reparación por escisión de base de parche corto, una vía de
reparación del ADN que es esencial para reparar bases alquiladas u oxidadas, así
como sitios abásicos . Pol λ y Pol μ, codificados por los genes POLL y POLM
respectivamente, están involucrados en la unión de extremos no homólogos , un
mecanismo para volver a unir las roturas de doble cadena del ADN debido al peróxido
de hidrógeno y la radiación ionizante, respectivamente. TdT se expresa sólo en
tejido linfoide y añade "n nucleótidos" a las roturas de doble hebra formadas
durante la recombinación V (D) J para promover la diversidad inmunológica.17

Polimerasas α, δ y ε (alfa, delta y épsilon)

Pol α (alfa) , Pol δ (delta) y Pol ε (épsilon) son miembros de las polimerasas de
la familia B y son las principales polimerasas implicadas en la replicación del ADN
nuclear. El complejo Pol α (complejo pol α-ADN primasa) consta de cuatro
subunidades: la subunidad catalítica POLA1 , la subunidad reguladora POLA2 y las
subunidades primasa pequeña y grande PRIM1 y PRIM2, respectivamente. Una vez que la
primasa ha creado el cebador de ARN, Pol α comienza la replicación alargando el
cebador con ~ 20 nucleótidos. Debido a su alta procesividad, Pol δ se hace cargo de
la síntesis de las cadenas principales y retrasadas de Pol α. Pol δ se expresa
mediante los genes POLD1 , creando la subunidad catalítica, POLD2 , POLD3 y POLD4
creando las otras subunidades que interactúan con el antígeno nuclear de células
proliferantes (PCNA), que es una abrazadera de ADN que permite que Pol δ posea
procesividad. Pol ε está codificado por el gen POLE1, la subunidad catalítica,
POLE2 y POLE3. Se ha informado que la función de Pol ε es extender la cadena
principal durante la replicación, mientras que Pol δ replica principalmente la
hebra rezagada; sin embargo, evidencia reciente sugirió que Pol δ también podría
tener un papel en la replicación de la cadena principal de ADN. La región C-
terminal de Pol ε "reliquia de la polimerasa", a pesar de ser innecesaria para la
actividad de la polimerasa, se cree que es esencial para la vitalidad celular. Se
cree que la región C-terminal proporciona un punto de control antes de entrar en
anafase, proporciona estabilidad a la holoenzima y agrega proteínas a la holoenzima
necesarias para el inicio de la replicación. Pol ε tiene un dominio "palma" más
grande que proporciona alta procesividad independientemente del PCNA.

En comparación con otras polimerasas de la familia B, la familia de exonucleasas

DEDD responsable de la corrección de pruebas está inactivada en Pol α. Pol ε es
único en el sentido de que tiene dos dominios con dedos de zinc y una copia
inactiva de otra polimerasa de la familia B en su C-terminal. La presencia de este
dedo de zinc tiene implicaciones en los orígenes de Eukaryota, que en este caso se
coloca en el grupo Asgard con polimerasa arqueal B3.

Polimerasas η, ι y κ (eta, iota y kappa)

Pol η (eta) , Pol ι (iota) y Pol κ (kappa), son ADN polimerasas de la familia Y
implicadas en la reparación del ADN por síntesis de translesión y codificadas por
los genes POLH, POLI y POLK respectivamente. Los miembros de la Familia Y tienen
cinco motivos comunes para ayudar a unir el sustrato y el extremo del cebador y
todos incluyen los dominios típicos del pulgar, la palma y el dedo de la mano
derecha con dominios agregados como el dedo meñique (LF), el dominio asociado a la
polimerasa (PAD) o muñeca. El sitio activo, sin embargo, difiere entre los miembros
de la familia debido a las diferentes lesiones que se reparan. Las polimerasas de
la familia Y son polimerasas de baja fidelidad, pero se ha demostrado que hacen más
bien que mal, ya que las mutaciones que afectan a la polimerasa pueden causar
diversas enfermedades, como cáncer de piel y la variante de Xeroderma Pigmentosum
(XPS). La importancia de estas polimerasas se evidencia por el hecho de que el gen
que codifica la ADN polimerasa η se conoce como XPV, porque la pérdida de este gen
da como resultado la variante Xeroderma Pigmentosum de la enfermedad. Pol η es
particularmente importante para permitir una síntesis de translesión precisa del
daño del ADN resultante de la radiación ultravioleta. La funcionalidad de Pol κ no
se comprende completamente, pero los investigadores han encontrado dos funciones
probables. Se cree que Pol κ actúa como un extensor o un insertador de una base
específica en ciertas lesiones del ADN. Las tres polimerasas de síntesis de
translesiones, junto con Rev1, se reclutan en las lesiones dañadas a través de ADN
polimerasas replicativas estancadas. Hay dos vías de reparación de daños que llevan
a los investigadores a concluir que la vía elegida depende de qué hebra contiene el
daño, la hebra principal o la rezagada.

Polimerasas Rev1 y ζ (zeta)

La Pol ζ otra polimerasa de la familia B, está formada por dos subunidades Rev3, la
subunidad catalítica, y Rev7 (MAD2L2), que aumenta la función catalítica de la
polimerasa y participa en la síntesis de translesiones. Pol ζ carece de actividad
exonucleasa 3 'a 5', es único porque puede extender cebadores con desajustes
terminales. Rev1 tiene tres regiones de interés en el dominio BRCT , dominio de
unión a ubiquitina, y dominio C-terminal y tiene capacidad de transferasa de dCMP,
que agrega lesiones opuestas de desoxicitidina que detendrían las polimerasas
replicativas Pol δ y Pol ε. Estas polimerasas estancadas activan complejos de
ubiquitina que a su vez disocian las polimerasas de replicación y reclutan Pol ζ y
Rev1. Juntos, Pol ζ y Rev1 añaden desoxicitidina y Pol ζ se extiende más allá de la
lesión. A través de un proceso aún indeterminado, Pol ζ se disocia y las
polimerasas de replicación se reasocian y continúan la replicación. Pol ζ y Rev1 no
son necesarios para la replicación, pero la pérdida del gen REV3 en la levadura en
gemación puede causar una mayor sensibilidad a los agentes que dañan el ADN debido
al colapso de las horquillas de replicación donde las polimerasas de replicación se
han estancado.

Polimerasas γ, θ y ν (gamma, theta y nu)

Pol γ (gamma), Pol θ (theta) y Pol ν (nu) son polimerasas de la familia A. Durante
mucho tiempo se pensó que Pol γ, codificada por el gen POLG era la única polimerasa
mitocondrial. Sin embargo, investigaciones recientes muestran que al menos Pol β
(beta) , una polimerasa de la Familia X, también está presente en las mitocondrias.
Cualquier mutación que produzca una Pol γ limitada o que no funcione tiene un
efecto significativo sobre el ADNmt y es la causa más común de trastornos
mitocondriales hereditarios autosómicos. Pol γ contiene un dominio de polimerasa C-
terminal y un dominio de exonucleasa N-terminal 3'-5 'que están conectados a través
de la región enlazadora, que se une a la subunidad accesoria. La subunidad
accesoria se une al ADN y es necesaria para la procesividad de Pol γ. La mutación
puntual A467T en la región enlazadora es responsable de más de un tercio de todos
los trastornos mitocondriales asociados con Pol γ. Si bien muchos homólogos de Pol
θ, codificados por POLQgen, se encuentran en eucariotas, su función no se comprende
claramente. La secuencia de aminoácidos en el extremo C es lo que clasifica a Pol θ
como polimerasa de la familia A, aunque la tasa de error de Pol θ está más
estrechamente relacionada con las polimerasas de la familia Y. Pol θ extiende los
extremos del cebador que no coinciden y puede eludir sitios abásicos añadiendo un
nucleótido. También tiene actividad desoxirribofosfodiesterasa (dRPasa) en el
dominio de la polimerasa y puede mostrar actividad ATPasa en estrecha proximidad al
ssDNA. Pol ν (nu) se considera la menos eficaz de las enzimas polimerasas. Sin
embargo, la ADN polimerasa nu juega un papel activo en la reparación de la
homología durante las respuestas celulares a los enlaces cruzados, cumpliendo su
función en un complejo con helicasa.

Transcriptasa inversa (RT)

Es una ADN polimerasa dependiente de ARN (RdDp) que sintetiza ADN a partir de una
plantilla de ARN. La familia de la transcriptasa inversa contiene tanto la
funcionalidad de la ADN polimerasa como la funcionalidad de la ARNasa H, que
degrada el ARN emparejado con el ADN. La transcriptasa inversa se emplea comúnmente
en la amplificación de ARN con fines de investigación. Usando una plantilla de ARN,
la PCR puede utilizar la transcriptasa inversa, creando una plantilla de ADN. Esta
nueva plantilla de ADN se puede utilizar para una amplificación típica por PCR. Los
productos de tal experimento son, por tanto, productos de PCR amplificados a partir
de ARN.

La transcripción inversa se acompaña de un cambio de plantilla entre las dos copias

del genoma (recombinación por elección de copia). De 5 a 14 eventos de
recombinación por genoma ocurren en cada ciclo de replicación. El cambio de
plantilla (recombinación) parece ser necesario para mantener la integridad del
genoma y como un mecanismo de reparación para salvar los genomas dañados.

Telomerasa
La telomerasa es una enzima que funciona para replicar los extremos de los
cromosomas lineales, ya que la ADN polimerasa normal no puede replicar los extremos
o los telómeros. El saliente 3 'monocatenario del cromosoma bicatenario con la
secuencia 5'-TTAGGG-3' recluta telomerasa. La telomerasa actúa como otras ADN
polimerasas al extender el extremo 3 ', pero, a diferencia de otras ADN
polimerasas, la telomerasa no requiere una plantilla. La subunidad TERT, un ejemplo
de transcriptasa inversa, utiliza la subunidad de ARN para formar la unión cebador-
molde que permite que la telomerasa extienda el extremo 3 'de los extremos del
cromosoma. Se cree que la disminución gradual del tamaño de los telómeros como
resultado de muchas replicaciones a lo largo de la vida está asociada con los
efectos del envejecimiento.

ADN polimerasas virales

Los virus de ADN sintetizan una gran variedad de ADN polimerasas, que en su mayoría
no están emparentadas con las ADN polimerasas celulares o con las de otros virus de
ADN. Los virus retrotranscritos como el VIH se caracterizan por sintetizar
transcriptasas inversas, las cuales si están emparentadas entre sí y también con
las transcriptasas inversas celulares en especial con las eucariotas.

El fago Φ29 sintetiza una ADN polimerasa propia. Esta enzima es muy utilizada en
biología molecular para múltiples procedimientos de desplazamiento de amplificación
de ADN, y tiene una serie de características que la hacen particularmente adecuada
para esta aplicación.

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