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UNIVERSIDAD NACIONAL ABIERTA Y ADISTANCIA (UNAD)

ZOOTECNIA

MEJORAMIENTO AMINAL

PASO 2 ACTIVIDAD INTERMEDIA- FUNDAMENTOS DE GENÉTICA


APLICADA AL MEJORAMIENTO ANIMAL

Elaborado por:

Duván Sneider López González

Ledis Isabel Uscategui Pantoja. Código: 33369964

Luis Alfonso Pareja

Oscar Mauricio Sandoval

GRUPO COLABORATIVO: 201108_9

ENTREGADO A:

MYRIAM JANETH ORTEGA (TUTORA)

OCTUBRE DE 2020

COLOMBIA
Introducción

El siguiente trabajo se realiza con el fin de comprender de manera objetiva y sencilla el


funcionamiento del ADN en el mejoramiento animal y las causas que pueden alterar a
este de manera radical, observando los diferentes procesos hereditarios que pueden
modificar los rasgos genéticos positiva como negativamente, las pruebas que facilitan
observar en tiempo real estos factores y cómo podemos controlarlos de manera simple
por medio de la estadística descriptiva recolectando datos y de forma biométrica
calculándolos para un buen proceso de mejoramiento de estos factores.

La genética juega un papel fundamental dentro de los sectores productivos pecuarios del
mundo, en donde cada año se avanza más en tecnología aplicada a este proceso,
metodologías de diseño y manejo de la información y recopilación de datos, que
permiten avanzar de forma rápida y segura en la toma de decisiones de fin genético y de
mejoramiento animal por medio del ADN.

Es así como en este trabajo daremos a conocer los datos recolectados y las actividades
realizadas basados en la guía rubrica de trabajo de fundamentos de genética aplicada al
mejoramiento animal, para obtener mejores ganancias del sector pecuario productivo y
así lograr mejores condiciones de vida y de productividad de los animales.
Objetivo general

Desarrollar la guía rubrica de trabajo paso 2 de fundamentos de genética aplicada al


mejoramiento animal.

Objetivos específicos

- Resolver los ítems propuestos por la guía rubrica de trabajo.


- Resolver los interrogantes propuestos en cada punto.
- Concluir acerca de la actividad desarrollada.
DESARROLLO DE LAS ACTIVIDADES

Actividad 1. Repaso estadística descriptiva.

1. Cada uno de los integrantes del grupo, debe trabajar con una característica
cuantitativa (se sugiere para efectos de que todos puedan aportar tomar la altura
de los perros o de los gatos), luego cada uno de los integrantes definirán con cual
sistema de producción trabajaran, cada uno de los estudiantes del grupo debe
aportar mínimo diez datos de la característica productiva de la especie
seleccionada, si se trabaja con altura de los perro, debe colectar información, no
solo de la altura, también de la raza, edad del animal y tipo de alimentación.

Antes de comenzar, los estudiantes revisan el vídeo cuyo link se adjunta:


https://es.khanacademy.org/math/statistics-probability/modelingdistributions-of-
data/normal-distributions-library/v/ck12-org-normaldistribution-problems-empirical-
rule

Una vez colectados los datos de todos los integrantes del grupo, se realizada:

Tabla 1. Característica cuantitativa de algunas razas de perro

Item Raza Esperanza de vida Altura cm Peso adulto kg


1 labrador retriever 10 - 12 55 - 70 25 - 45
2 pastor alemán 8 - 10 55 - 70 25 - 45
3 Schnoodle 12 - 14 45 - 55 10 - 25
4 schnocker 12 - 14 35 - 45 3 - 10
5 pastor croata 12 - 14 45 - 55 10 - 25
6 Zuchón o shichón 15 - 20 15 - 35 3- 10
7 shih-poo 15 - 20 35 - 45 3 - 10
8 Shorkie 10 - 12 15 - 35 1-3
9 Puggle 12 - 14 15 - 35 3 - 10
10 border collie 15 - 20 45 - 55 10 - 25

Item Raza Esperanza de vida Altura cm Peso adulto kg


1 leopardo de atahoula 12 - 14 45 - 55 25 - 45
2 Kerry blue terrier 12 - 14 45 - 55 10 - 25
3 chiuahua 15 – 20 13 - 25 1-3
4 golden retriever 10 -12 55 - 70 25 -45
5 cimarrón uruguayo 10 - 12 45 - 55 25 -45
6 pinscher alemán 12 - 14 25 - 45 10 - 25
7 frenchton 15 – 20 35 - 45 3 - 10
8 teddy roosevelt 12 – 14 35 – 45 3 -10
terrier
9 husky inu 12 -14 25 – 45 10 - 25
10 mal-shi 12 - 14 35 - 45 3 - 10
Item Raza Esperanza de vida Altura cm Peso adulto kg
1 Braco francés 12 - 14 45 - 55 25 - 45
2 ussiedoodle 12 - 14 35 - 45 10 - 25
3 azawakh 12 – 14 55 -70 25 - 45
4 cavachón 12 – 14 15 – 35 3 - 10
5 australian cobberdog 12 - 14 45 - 55 10 - 25
6 cockapoo 12 - 14 15 – 35 3 – 10
7 eurasier o eurasian 10 -12 45 - 55 10 - 25
8 thai ridgeback 10 - 12 55 - 70 10 – 25
9 Alaskan Malamute 12 - 14 55 - 70 25 - 45
10 mastín español 12 - 14 70 – 80 45 - 100

Datos recuperados de: https://www.expertoanimal.com/razas-de-perros

a. Una tabla que contenga los valores y sus frecuencias

Se toman el mayor valor en peso de la raza de perro

Ledis Isabel Uscategui Duvan Sneider Lopez Luis Alfonso Pareja

45 45 25 10 25 45 25 3 45 45 45 25 45 10 25
10 10 3 10 25 25 10 10 25 10 10 25 25 45 100

3-3—10-10-10-10-10-10-10-10-10-25-25-25-25-25-25-25-25-25-25-45-45-45-45-45-45-45-45-
100

Media o promedio =

3+3+10+10+10+10+10+10+10+10+10+25+25+25+25+25+25+25+25+25+25+45+45+45+45+45+
45+45+45+100 =

30

Media =806 / 30 = 26,86

Media = 26,86 Kl

Mediana (número central):

3-3—10-10-10-10-10-10-10-10-10-25-25-25-25-25-25-25-25-25-25-45-45-45-45-45-45-45-45-
100

Me = 25 + 25 / 2 = 25 Kl
Moda (el número más frecuente):

Mo= 25 Kl con 10 ejemplares

c. Una gráfica que muestre la producción versus las frecuencias (la producción versus el
número de animales, con la misma producción)

producción versus número de animales


12

10

8
frecuencia

0
0 20 40 60 80 100 120
peso

d. Indicar cuales individuos se encuentran en los extremos de la curva, cuales en el


promedio.

Podemos observar que en los extremos de la curva se encuentran los animales de 3 Kl


con dos ejemplares y los de 100Kl con un solo ejemplar; como promedio encontramos
26, 86 Kl

e. Una vez realizadas las estadísticas anteriores, el estudiante indicará que porcentaje de
la población se encuentra entre +1 y -1 desviación estándar.
Encontramos que según la regla empírica existe un 68% de animales entre 25,01 y 28.71
Kl peso

f. Calcule la varianza de la altura de los perros, ¿qué indica este número? ¿Cree usted
que se hace necesario un valor comparativo?, si es así, ¿cuál valor utilizaría que sea útil
para comparar sus resultados?

Varianza Ϭ²=

(3-26,86)²+(3-26,86)²+(10-26,86)²+(10-26,86)²+(10-26,86)²+(10-26,86)²+(10-
26,86)²+(10-26,86)²+(10-26,86)²+(10-26,86)²+(10-26,86)²+(25-26,86)²+(25-26,86)² +(25-
26,86)²+(25-26,86)² +(25-26,86)²+(25-26,86)² +(25-26,86)²+(25-26,86)² +(25-26,86)²+(25-
26,86)²+(45-26,86)² +(45-26,86)² +(45-26,86)² +(45-26,86)² +(45-26,86)² +(45-26,86)² +(45-
26,86)² +(45-26,86)² +(100-26,86)²

30

Varianza Ϭ²=
4,84+4,84+4,11+4,11+4,11+4,11+4,11+4,11+4,11+4,11+4,11+1,36+1,36+1,36+1,36+
1,36+1,36+1,36+1,36+1,36+1,36+4,25+4,25+4,25+4,25+4,25+4,25+4,25+4,25+8,55

30

Varianza Ϭ²=102,82 / 30 = 3,42


Desviación estándar = √varianza

Ϭ² = √3,42 = 1,85 Kl

¿qué indica este número? R. nos indica la diferencia promedio que existe entre cada una
de las muestras realizadas

¿Cree usted que se hace necesario un valor comparativo? R. Si, porque al tener un valor
comparativo podemos determinar la productividad de cada individuo en particular.

¿cuál valor utilizaría que sea útil para comparar sus resultados? Seria más conveniente
compararlos con la media porque así podríamos determinar cuáles animales están por
encima del promedio y cuales no tienen un buen rendimiento.

g. El grupo de estudiantes debe concluir sobre el ejercicio, indicando cuales de los


ejemplares pueden ser los que eligen para realizar una selección.

Los estudios estadísticos son de gran utilidad para poder calcular la productibilidad de
un terminado grupo de animales, así podremos determinar cuales son los mejores
ejemplares para la producción, en este caso en particular podemos decir que las mejores
razas de perros en cuanto a su peso estarían por encima del promedio que es 26,86 kl, al
mostrar una mayo porcentaje.

RANGO: Xmax - Xmin = R= 100 – 3 = 97

N ° INTEVALOS (k)

K = 1+3.332 Log(n) K = 1+3.332 Log (30) = 5,92

K=5

R 97
AMPLITUD= A= A = A¿ = 19,4 = 19
K 5

NUEVO RANGO = k * A NR = 5 * 19 = 95

Diferencia de rango: R – NR = 97 – 95 = 2

Peso Xi f Fr % F
2 - 21 11 11 0,37 37% 11
21 – 40 30 10 0,33 33% 21
40 – 59 49 8 0,27 27% 29
59 – 78 68 0 0 0% 29
78 - 101 87 1 0,03 3% 30
30 1 100%

Li+ Ls
Xi = 2

f= número de veces que se repite un dato.

f
Fr = n °de datos

F = acumula f

b. Calcular las medidas de tendencia central

Peso Xi f F Xxf

2 - 21 11 11 11 121
21 – 40 30 10 21 300
40 – 59 49 8 29 392
59 – 78 68 0 29 0
78 - 101 87 1 30 87
30 900

Media:

∑ xf
X́ =
n

900
X́ = =30 Kilos
30

Mediana (x ̃o Me) :

n
~
x=Li +
2
(
−Fi−1
fi
A )
n 30
Posición = =15 → F media promedio
2 2

Li= 21
A = Ls-Li = 21 – 40 = 19
Fi-1 = 11
fi = 10

15−11 4
~
x=21+ ( 10 )
∗19=21+ ∗19=15+7,6=22,6
10
~
x=22,6 kilos

Moda ¿ o Mo):

fi−(fi−1)
X =Li+
^
( )
( fi−( fi−1 ) ) +(fi−( fi+ 1 ))
∗A

X → f mayor (11)
^
fi=11
fi-1=0
fi+1=30
Li=2
A=19

11−0 11
X =2+
^
(11−19 )
∗19=2+ ∗19=2+ 26,12=28,12
8
^
X =28,12 kilos

c. Una gráfica que muestre la producción versus las frecuencias (la producción versus el
número de animales, con la misma producción)

Peso Xi f F Xxf

2 - 21 11 11 11 121
21 – 40 30 10 21 300
40 – 59 49 8 29 392
59 – 78 68 0 29 0
78 - 101 87 1 30 87
30 900
d. Indicar cuales individuos se encuentran en los extremos de la curva, cuales en el
promedio.

e. Una vez realizadas las estadísticas anteriores, el estudiante indicará que porcentaje de
la población se encuentra entre +1 y -1 desviación estándar.

f. Calcule la varianza de la altura de los perros, ¿qué indica este número? ¿Cree usted
que se hace necesario un valor comparativo?, si es así, ¿cuál valor utilizaría que sea útil
para comparar sus resultados?

g. El grupo de estudiantes debe concluir sobre el ejercicio, indicando cuales de los


ejemplares pueden ser los que eligen para realizar una selección.
2. Con los datos de la tabla No.1 realice las respectivas gráficas de relación entre las
variables X1 y X2, X1 y X3, X1 y X4, indique el significado de cada una de estas
gráficas. ¿Para qué les sirve esta información en mejora animal?

X1 X2 X3 X4

2 4 44 4
4 8 40 44
6 12 36 20
8 16 32 32
10 20 28 12
12 24 24 28
14 28 20 24
16 32 16 36
18 36 12 16
20 40 8 40
22 44 4 8

Valores X1-X2
50
45
40
35
30
X2

25
20
15
10
5
0
0 5 10 15 20 25

X1
Valores X1-X3
50
45
40
35
30
X1

25
20
15
10
5
0
0 5 10 15 20 25

X3

Valores X1-X4
50
45
40
35
30
X1

25
20
15
10
5
0
0 5 10 15 20 25

X4

En la grafica X1-X2 podemos observar una tendencia creciente continua que nos indica
que los parámetros van en aumento en una forma exponencial, en la segunda grafica
X1-X3 se evidencia lo contrario a la primera gráfica, los datos no sindican un descenso
continuo en las mediciones realizadas, y en la tercera grafica X1-X4 podemos ver que
no hay un parámetro fijo que nos indique si va en aumento o descenso, marca una
constante fluctuación de los valores de X4 en relación a los de X1.

¿Para qué les sirve esta información en mejora animal?

Nos sirve para llevar un control sobe los cambios que se realizan a diario, y poder
establecer una relación entre los diversos parámetros que se utilizan para el
mejoramiento, tener una medición precisa de cuales se mantiene estables, cuales están
en aumento o cuales están en deceso, es decir nos brinda una idea mas clara de las
mediciones que se realizan a diario.

Actividad 2. Genética molecular

Una vez traducida la proteína, indique la secuencia del péptido resultante y por medio
de un dibujo una la estructura los dos primeros aminoácidos por medio del enlace
peptídico.

Utilice esta secuencia para realizar el siguiente ejercicio:

ATGTGATGAGGGTCCCAGTGGATGGAGGAGTGAGCAGAAGAGGTAAGAGC

AGGGGAGTCTCGGAGGCAGAGAAAGGGAAAGTGAAAAAGAGGCGGGTGGT

GGGACTCAGAGAGCAAATGGGGAAAGAGGAAGAGCAGAGAGCCAAGAGGG

CAGCCAGAGGGCAGGAGATGAAGAGTTGGAGGGGAGACCAAGGCAACAAC

GGAGCCAGGGCTGCAGGGGTGGGAGGGGCGGGGGCAGGCCTGGGGACAGT

CAGACTCAACAGAAAGCGTTGAGTCTGGCCTTGTCACGAACCACCTGCAGTT

GGAAACAGCTTTCCTAGTTAGCTACAACTGGAACTTGTCACGAACCACCTGCAGTT

CCGTGTAACTCATCCTCTTATCTTGATTCTCCGGGAATCAGAGATCCAGTTAT

TTCAACAGCAGGGACTTTTGACCTC

Traducción a ARN

AUGUGAUGAGGGUCCCAGUGGAUGGAGGAGUGAGCAGAAGAGGUAAGAGCAGG
GGAGUCUCGGAGGCAGAGAAAGGGAAAGUGAAAAAGAGGCGGGUGGUGGGACUC
AGAGAGCAAAUGGGGAAAGAGGAAGAGCAGAGAGCCAAGAGGGCAGCCAGAGGG
CAGGAGAUGAAGAGUUGGAGGGGAGACCAAGGCAACAACGGAGCCAGGGCUGCA
GGGGUGGGAGGGGCGGGGGCAGGCCUGGGGACAGUCAGACUCAACAGAAAGCGU
UGAGUCUGGCCUUGUCACGAACCACCUGCAGUUGGAAACAGCUUUCCUAGUUAG
CUACAACUGGAACUUGUCACGAACCACCUGCAGUUCCGUGUAACUCAUCCUCUU
AUCUUGAUUCUCCGGGAAUCAGAGAUCCAGUUAUUUCAACAGCAGGGACUUUUG
ACCUC

Proteína

M. = Metionina (AUG)

a. ¿Con cuál aminoácido comienza la proteína?

Metionina (AUG)
¿Cuál es el codón para este aminoácido?

Metionina

Codón de inicio: metionina (AUG)

Codón de paro: valina (GUU)

Extremo- N: metionina (AUG)

Extremo-C: serina (UCC)

b. En el primer codón cambie la A por una T ¿qué ocurre?

La Metionina se convierte en leucina.

¿Luego cambien la segunda posición la T por una C, que ocurre?

La Metionina se convierte en serina.

Finalmente, la G por una A, ¿qué ocurre? Saque una conclusión respecto al


cambio de un único nucleótido.

La histidina se convierte en serina.

c. ¿Realice el mismo ejercicio, pero seleccionando la secuencia que está en rojo,


hay algún cambio significativo?

En el primer codón cambie la A por una T ¿qué ocurre?

La histidina se convierte en glutamina.

5` GGAGTTGAAGAGTTGGAGGGGAGACC 3` ADN

3` CCUCAACUUCUCAACCUCCCCUCUGG 5` ARN mensajero

5` GGUCUCCCCUCCAACUCUUCAACUCC 3` Traducción a proteína

Luego cambien la segunda posición la T por una C, que ocurre?

La histidina se convierte en una arginina.

5` GGAGACGAAGAGTTGGAGGGGAGACC 3` ADN

3` CCUCUGCUUCUCAACCUCCCCUCUGG 5` ARN mensajero


5` GGUCUCCCCUCCAACUCUUCGUCUCC 3` Traducción a proteína

Finalmente la G por una A, ¿qué ocurre? Saque una conclusión respecto al cambio
de un único nucleótido.

La histidina se convierte en tirosina.

5` GGAGATAAAGAGTTGGAGGGGAGACC 3` ADN

3` CCUCUAUUUCUCAACCUCCCCUCUGG 5` ARN mensajero

5` GGUCUCCCCUCCAACUCUUUAUCUCC 3` Traducción a proteína

d. Consulte la función de la proteína serpina, específicamente relacionada con la


calidad organoléptica de la carne bovina.

Según [ CITATION Car05 \l 3082 ] “La terneza es el atributo de calidad más importante de
la carne. Entre diferentes variables de orden biológico y fisicoquímico, in vivo los
inhibidores de serina peptidasas (SERPINAS) como la antitrombina III (AT-III), han
sido los mejores indicadores de la terneza de la carne de bovino.”

Es decir que se usa como indicador de que permite saber la calidad de la carne, la
capacidad de ser cortada o masticada por el consumidor, esto hace que la terneza sea el
mayor atributo y está dada por la serpina o inhibidores de serina peptidasas.

Por ello se mide esta proteína en función de la capacidad que tiene para dar calidad a la
carne bovina.

Defina con sus compañeros de grupo, un método para obtener de manera


tridimensional una maqueta que le permita explicar el concepto de gen eucariota,
con todas sus partes. Para ello determinen entre los integrantes del grupo, la
manera cómo van a realizar la maqueta cuyo producto final es la estructura de un
gen, compartan en el foro. Una vez finalizado la maqueta de gen, esta debe ser
presentada mediante un corto vídeo de no más de cinco minutos de duración, que
le permita al profesor observar la estructura del gen que el grupo realizó.

Video:

Actividad 3. Ligamiento genético y mapeo de genes.


En conejos, el color de pelaje negro (B) es dominante sobre el color de pelaje café (B),
mientras que el color completo (C), es dominante sobre el color chinchilla (cch). Los
genes que controlan estas características están ligados, así los ratones que son
heterocigotos para estas características se expresan como de color negro, café, y con
color completo, estos conejos fueron cruzados con conejos que expresan el color café y
la chinchilla, con los siguientes resultados:

31 café, chinchilla

34 negros, color completo

16 café, color completo

19 negros, chinchilla

Con esta información determine el re arreglo de los alelos en los padres heterocigotos y
el mapa de distancia entre los genes.
Actividad 4. Aberraciones cromosómicas. Por medio de un dibujo a mano alzada y después de entender el concepto, explique cada uno de los
términos de anormalidades en la estructura de los cromosomas que se relacionan en la figura.
Actividad 5. Identificación de QTLs

a. Cómo se realiza un análisis de asociación, para llegar a conocer los QTLs,


realice una secuencia paso a paso bien descrita.

SECUENCIACIÓN POR SHOTGUN.

Se utilizan métodos enzimáticos fragmentando el genoma, después de obtener


segmentos pequeños del ADN, estos son clonados y secuenciados, posteriormente se
usan algoritmos de cómputo para ensamblar los contings que se derivan de miles de
secuencias una tras otra.

Esta se parece mucho a la jerárquica en cuestión de que los genotecas han sido
generados en su totalidad y los vectores de clonación se parecen a los usados en (BACs
y YACs)

Se pueden usar diferentes tipos de software tales como: Screener, Overlapper,


Unitigger, Scaffolde, Repeaty Resolver para ensamblar los distintos contigs.

Tomado de: [CITATION Nat20 \l 3082 ]

Paso 1. Se corta en varios trozos más pequeños el ADN que se requiere analizar.

Paso 2. Luego cada uno de los trozos se secuencia de forma individual.

Paso 3. La secuencia resultante se lee en una computadora con uno de los programas.
Paso 4. Se identifican secuencias similares entre todos los trozos.

Paso 5. Se sutura la secuencia.

Paso 6. Se repite el proceso una y otra vez hasta obtener la secuencia completa a partir
de la estructura de ADN.

b. ¿Qué tipos de QTLs s han identificado dentro del genoma animal? Enuncie
al menos dos ejemplos de ellos, con el respectivo sustento de cómo se llegó a
su identificación.

Según [ CITATION Jan11 \l 3082 ] “Algunos ejemplos en bovinos incluyen la detección de


genes como los de la tiroglobulina, la calpastatina y la miostatina, implicados en
características como el marmóreo, la terneza de la carne y la doble musculatura
respectivamente.”

Algunos QTLs identificados son:

Análisis de variación, mapeo de intervalos, mapeo de intervalos compuestos, mapeo


basado en pedigrí familiar.

Mapeo en pedigrí familiar:

Mapeo de intervalos compuestos:


CONCLUSIONES

- Consideramos que la genética es fundamental dentro del uso del mejoramiento


animal ya que por medio de ella podemos identificar factores tales como el riego
de vida, la capacidad del animal por sacar el vigor hibrido, el gen recesivo que
puede afectar la mejora genética, las posibles enfermedades genéticas que se
pueden obtener al realizar un mal cruce o una modificación biomolecular y
demás acciones que se pueden hacer en base a la genética animal y el
mejoramiento.
- Nos parece importante la estadística descriptiva como herramienta para obtener
datos en tiempo real que nos permitan tomar decisiones acertivas acerca de los
procesos realizados en el sector productivo pecuario, analizando, observando y
definiendo que se realizara en base al dato obtenido y la integración de todos los
datos como referencia de la decisión a tomar.
- Consideramos que este tipo de trabajos nos abren las puertas a nuevos
conocimientos de gran profundidad y practica sobre el área de la genética, la
estructura mitocondrial y todos aquellos factores pertenecientes al origen de la
vida y las modificaciones que esto puede traer con las decisiones tomadas en la
vida profesional, que no solo serán de gran importancia sino que contraen
consigo una amplia responsabilidad sobre lo que haremos con los animales del
sector productivo que estemos manejando.
REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS

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