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Una molécula de ADN está formada por dos cadenas largas, cada una de las cuales está hecha de
bloques de construcción ensamblados llamados «nucleótidos».
Cada nucleótido consta de tres componentes: un grupo fosfato, un azúcar desoxirribosa y una
base nitrogenada. Todos los nucleótidos son idénticos salvo por su base. El ADN tiene cuatro bases
distintas conocidas como adenina, timina, citosina y guanina. Estas bases se identifican muchas
veces con las letras A, T, C y G.
Las dos cadenas del ADN se mantienen unidas por medio de enlaces de hidrógeno entre las bases.
Las bases del ADN siempre se emparejan del mismo modo: A con T y C con G.
La molécula bicatenaria adopta una forma de doble hélice que parece una escalera enrollada. Las
cadenas opuestas son antiparalelas entre ellas; es decir, van en direcciones opuestas. Esto
garantiza que las cadenas queden bien ensambladas la una con la otra.
La ley de Chargaff se apoya en la relación cuantitativa de los nucleótidos que forman la doble
hélice del ADN, establece que la proporción de adenina (A) es igual a la proporción de timina (T) y
la proporción de guanina (G) es igual a la proporción de Citosina (C), esto es, el total de bases
purínicas es igual al total de
estado de reglas que el ADN de cada célula en todos y cada uno de los organismos debe tener una
proporción de 1:1 de bases de pirimidina a purinas y, mucho más particularmente, que la
proporción de guanina es igual a la de citosina y la de adenina es igual a la de timina.
predicho)
La cantidad de bases variaba entre especies, pero no entre individuos de la misma especie
cantidad de G (A = T y G = C)
La estructura del ADN, representada según el modelo de Watson y Crick, es una hélice dextrógira
de doble cadena antiparalela. El esqueleto de azúcar-fosfato de las cadenas de ADN constituye la
parte exterior de la hélice, mientras que las bases nitrogenadas se encuentran en el interior y
forma pares unidos por puentes de hidrógeno que mantienen juntas a las cadenas del ADN.
Un par de bases de Hoogsteen es una variación del apareamiento de bases en ácidos nucleicos
como el par A • T. De esta manera, dos nucleobases , una en cada hebra, pueden mantenerse
juntas mediante enlaces de hidrógeno en el surco principal. Un par de bases de Hoogsteen aplica
la posición N7 de la base de purina (como aceptor de enlace de hidrógeno) y el grupo amino C6
(como donante), que se unen a la cara Watson-Crick (N3-C4) de la base de pirimidina .
El mecanismo más estudiado de reparación del ADN es la reparación por escisión de nucleótidos.
En este proceso, se eliminan las bases dañadas en forma de oligonucleótidos y se rellena el
"hueco" mediante síntesis reparativa. Existen diferentes vías de reparación por escisión debido a
la variabilidad en la longitud de los segmentos que deben ser reparados, clasificadas como "short-
patch" (relleno pequeño) y "long-patch" (relleno largo).
El dogma central de la biología molecular es una teoría que postula que la información genética
fluye en una sola dirección, del ADN al ARN y de este a la proteína, o del ARN directamente a la
proteína.
-El ADN se divide en unidades funcionales llamadas genes, los cuales pueden especificar
polipéptidos (proteínas y subunidades proteicas) o ARN funcionales (como los ARNt y ARNr).
_Transcripción: una cadena del ADN del gen se copia en ARN. En eucariontes, el transcrito de
ARN se debe someter a pasos adicionales de procesamiento para convertirse en un ARN
mensajero maduro (ARNm).
-Durante la traducción, los nucleótidos del ARNm se leen en grupos de tres llamados codones.
Cada codón especifica un aminoácido en particular o una señal de alto. Este conjunto de
relaciones se conoce como código genético.
-Topoisomerasa:(replicación)(transcripción)
Las células contienen una variedad de topoisomerasas, que se pueden dividir en dos clases. Las
topoisomerasas tipo I cambian el estado superenrollado de una molécula de DNA al crear una
ruptura transitoria en una cadena del duplex, La enzima escinde una cadena del DNA y luego
permite que la cadena intacta, complementaria se someta a una rotación controlada, que relaja la
molécula superenrollada. La topoisomerasa I es esencial para procesos como la replicación de DNA
y la transcripción. Funciona en estas actividades mediante la prevención de un superenrollamiento
excesivo, al formar cadenas complementarias de un DNA dúplex que se separan y desenrollan. Las
topoisomerasas tipo II producen una ruptura transitoria en ambas cadenas de un DNA dúplex.
Otro segmento de la molécula de DNA (o una molécula separada enteramente) luego se
transporta a través de la ruptura, y las cadenas cortadas se vuelven a sellar. Como era de esperar,
este complejo mecanismo de reacción se acompaña de una serie de intensos cambios de
conformación. Estas enzimas son capaces de algunos “trucos” extraordinarios. Además de poder
superenrollar y relajar el DNA, las topoisomerasas tipo II pueden unir una molécula de DNA en
nudos o desatar un nudo de DNA. También pueden formar una población de DNA circulares
independientes, para entrelazarse (catenación), o circulares entrelazados separados en
componentes individuales. La topoisomerasa II es necesaria para desenredar las moléculas de
DNA, antes de que los cromosomas duplicados puedan separarse durante la mitosis. La
topoisomerasa II humana es un objetivo para una serie de fármacos (p. ej., etopósido y
doxorrubicina) que se unen a la enzima y evitan que las cadenas de DNA escindidas
vuelvan a unirse. (Karp)
-Helicasa:
(Replicación) Son proteínas motoras que requieren ATP y que separan a las cadenas unidas del
DNA bicatenario. La helicasa principal de E. coli es DnaB, un hexámero de forma anular que abre la
doble hélice. Las helicasas desenrollan el dúplex de DNA, se ensamblan dos replisomas y la
replicación procede hacia afuera en ambas direcciones. (bioquímica, las bases moleculares)
-Primasa:(replicación)
Inicia la replicación del DNA sintetizando un segmento corto de RNA de 10 nucleótidos, seguido
por un segmento de DNA de 10 a 20 nucleótidos (bioquímica, las bases...)
-ADN polimerasa:(replicación)
La enzima responsable de unir fragmentos de DNA en una hebra continua. Une los fragmentos de
ADN Okazaki en la cadena discontinua de la hebra rezagada. (KARP)
-ARNt-aminoacil sintetasa:(traducción)
ARNm:
El RNA mensajero contiene dentro de su secuencia de nucleótidos las instrucciones de
codificación para sintetizar un polipéptido específico.
Las moléculas de mRNA contienen secuencias de tres bases, llamadas codones, que dictan
los aminoácidos específicos en la proteína que se sintetizará.
La longitud de los mRNA es muy variable.
El mRNA procariota y el eucariota se diferencian en varios aspectos. En primer lugar,
muchos mRNA procariotas son policistrónicos, es decir, contienen información que
codifica varias cadenas polipeptídicas. Por el contrario, el mRNA eucariota codifica un solo
polipéptido y por lo tanto se denomina monocistrónico. (Un cistrón es una secuencia de
DNA que contiene información codificadora de un polipéptido y varias señales necesarias
para la función ribosómica.)
ARNt:
Las moléculas de RNA de transferencia (tRNA) transportan los aminoácidos a los
ribosomas para su ensamblaje en las proteínas.
La longitud promedio de una molécula de tRNA es de 75 nucleótidos, debido a que cada
una de estas moléculas se une a un aminoácido específico, las células poseen al menos
una clase de tRNA para cada uno de los 20 aminoácidos estándar.
La estructura tridimensional de las moléculas de tRNA, que se asemeja a una hoja de
trébol alabeada (fig. 17.26), es consecuencia en primera instancia de un gran
emparejamiento de bases intracatenario.
Las moléculas de tRNA contienen diversas bases modifi cadas. Entre ellas se encuentran la
seudouridina, la 4-tiouridina, la 1-metilguanosina y la dihidrouridina.
ARNr:
El RNA ribosómico (rRNA) es la forma más abundante de RNA en las células vivas, tiene
una estructura de complejidad extraordinaria.
El rRNA es un componente de los ribosomas.
En cada tipo de subunidad ribosómica se encuentran varias clases diferentes de rRNA y de
proteínas.
Cada RNAr presenta cadenas de diferente tamaños.
8 - Sobre el código genético: ¿Qué significa que este sea universal, específico, redundante,
degenerado y continuo?
El código genético puede describirse como un diccionario codificador que especifica un significado
para la secuencia de bases.
A que se refiere cuando decimos que el código genético es:
Universal: Es universal porque es el mismo para todos los organismos, siempre y cuando
se hable de material genético nuclear.
Específico: Es específico porque cada codón es una señal para un aminoácido específico.
Redundante: Se dice que es redundante porque en varios casos, codones distintos
significan el mismo aminoácido.
Degenerado: Es cuando en el código genético existen más tripletes o codones que
aminoácidos, de forma que un determinado aminoácido puede estar codificado por más
de un triplete.
Continuo: Es cuando en el código genético no existen signos que separen los tripletes, por
lo cual éstos se escriben de manera continua sin separaciones entre ellos.
Nucleosomas: Los nucleosomas son la unidad básica de empaquetamiento del ADN en la célula.
Cada nucleosoma consiste en una secuencia de ADN de aproximadamente 147 pares de bases (pb)
enrollada alrededor de un octámero de histonas. Las histonas son proteínas alrededor de las
cuales se enrolla el ADN.
Solenoides: Los nucleosomas no son suficientes para empacar eficazmente todo el ADN en el
núcleo celular, ya que se requiere un mayor nivel de empaquetamiento.
Los solenoides son estructuras formadas por la superenrollamiento del ADN alrededor de una
estructura en forma de solenoide compuesta por histonas.
->Esto genera una mayor compactación del ADN en comparación con la organización en
nucleosomas.
Estas fibras se forman a partir de la condensación de solenoides y pueden considerarse como una
forma altamente enrollada de ADN y proteínas histonas.
Cromosomas: Los cromosomas son la forma más altamente condensada del ADN y son visibles
durante la división celular.
Cada cromosoma contiene una sola molécula de ADN que se ha empaquetado de manera muy
compacta mediante la organización en fibras de cromatina y una serie de proteínas específicas.
->Los cromosomas son cruciales para la segregación del ADN durante la división celular y para
mantener la integridad genómica.
Transición y Transversión.
La sustitución de un nucleótido por otro puede ser diferenciada en dos clases de eventos. La
transición es el reemplazo de una base pirimídica por otra base pirimídica o de una púrica por otra
púrica. En cambio, la transversión es el reemplazo de una base pirimídica por una base púrica o
viceversa.
Consideremos un triplete de ARNm, tal como UGC, que codifica normalmente para el aminoácido
cisteína. Este triplete puede ser modificado de diferentes formas por sustitución de nucleótidos,
pero analizaremos sólo las concernientes a la tercera base, la citosina. Si esta citosina es
reemplazada por uracilo -la otra base pirimidínica del ARN- el triplete deviene en UGU. Esta
transición no tiene ningún efecto sobre el producto del gen porque UGU, tanto como UGC,
codifican para el aminoácido cisteína. Este tipo de mutación es llamada silenciosa.
En otro caso de transversión, si la citosina (base pirimídica) es reemplazada por una adenina (base
púrica) se forma el codón UGA que es una de las señales de detención de la traducción, por lo
tanto, la cadena polipeptídica va a interrumpirse en forma prematura, generando una proteína
trunca sin función biológica. Estas sustituciones se llaman mutaciones sin sentido.
Transposiciones
Un segmento de un gen cambia de posición para estar en otro lugar distinto del mismo gen o en
otro lugar del genoma.
Tipos de transposición:
Una inserción se da cuando se añade una o más bases a la secuencia de ADN. Una deleción se
presenta cuando se elimina una o más bases de la secuencia de ADN.
Dado que el código genético se lee en codones (tres bases a la vez), la inserción o deleción de
bases puede cambiar el "marco de lectura" de la secuencia. Este tipo de mutación se llama
mutación de marco de lectura.
Como se puede ver en este ejemplo, una mutación de marco de lectura cambia la forma como se
interpretan los nucleótidos como codones más allá del lugar de la mutación, y esto a su vez puede
cambiar la secuencia de aminoácidos.
Las inserciones y deleciones que son múltiplos de tres nucleótidos no causan mutaciones de marco
de lectura. Por el contrario, solo se estará agregando o eliminando uno o más aminoácidos de la
proteína. Las inserciones o deleciones que no son múltiplos de tres nucleótidos, sin embargo,
pueden alterar dramáticamente la secuencia de aminoácidos en la proteína
Otras lesiones por radiación incluyen la creación de sitios apurinínicos o apirimidinicos por
eliminación de las bases correspondientes, pueden producirse rupturas en las cadenas sencillas o
dobles o entrecruzamiento entre ellas.
La radiación es más dañina en personas con defectos en sus sistemas de reparación del ADN, y el
riesgo es mayor para niños menores de 10 años y ancianos.
Mutágenos químicos
Los mutágenos químicos ocasionan inestabilidad general que produce cambios químicos en el
ADN; cambian quimicamente las bases, con lo que causan errores de apareamiento.
Existen diferentes tipos de mutágenos químicos: los agentes alquilantes son un grupo de
sustancias químicas que alquilan (por ejemplo, metilan o etilan) las bases de los ácidos nucleicos.
Todos los nitrógenos y oxígenos de las bases pueden ser alquilados, y la alquilación guía a
diferentes productos algunos ejemplos de agentes alquilantes son: ifosfamida, melfalán, thiotepa,
clorambucil, busulfán. Otro tipo de mutágenos químicos son los análogos de base como 6-
mercaptopurina,
arabinosa-c, clastógenos como ciclofosfamida. Otros mutágenos químicos son: gas mostaza,
etilmetano sulfonato, fenol, formaldehído, 5 bromouracilo, methotrexate hexano y otras
sustancias químicas. Los mutágenos químicos pueden encontrarse también como componentes de
la dieta, carcinógenos industriales y desechos tóxicos, el furano, solvente de resinas y lacas,
componente del smog y cigarros, así como los insecticidas, y pesticidas, Zeljezic.
Un ejemplo de la acción de los mutágenos químicos sobre el ADN es el ácido nitroso, el cual,
desarrolla una desaminación oxidativa que convierte la citosina en uracilo y la adenina en guanina,
ocasionando futuros errores en la replicación del ADN.
Mutágenos Biológicos
Respecto a los mutágenos biológicos, son especial importancia los cambios en el ADN que
producen los virus. v aunque se conoce muy poco de esta relación, se han reportado desde
simples rompimientos cromosómicos hasta pulverización total del complemento cromosómico.
Los virus son la causa de muchos cánceres en animales; por ejemplo, en el ser humano el virus de
Epstein-Barr se asocia con el linfoma de Burkitt, el carcinoma nasofaríngeo y los linfoepiteliomas,
el virus de la hepatitis B está relacionado con la hepatocarcinoma, el virus herpes simple (tipo 2) y
varios tipos de papilomavirus humano han sido implicados en el cáncer de cérvix, estos virus están
constituidos por ADN. El virus HTLV (human T-cell leukemia virus), sin embargo, está formado por
ARN (retrovirus), y como la mayor parte de los virus asociados a tumores en animales produce una
leucemia humana debido a que en presencia de una enzima denominada transcriptasa reversa
induce a la célula infectada a producir copias en el ADN de los genes del virus, que de esta manera
se incorporan al genoma celular. Estos virus de ARN contienen un gen denominado oncogén viral
capaz transformar las células normales en células malignas.