La célula animal mide entre 10 y 20 μm de diámetro es decir, será unas 5
veces más pequeño que la menor partícula visible a simple vista. La teoría celular, marco el nacimiento formal de la biología celular, las células animales no solo son muy pequeñas si no que también incoloras y translucidas, por ello el descubrimiento de las principales características internas de la célula dependió del desarrollo de diversos colorantes que proporcionaron el suficiente contraste para hacerlas visibles. El límite máximo de resolución de un microscopio óptico está dentro del campo de luz visible que abarca desde 0,4 μm (violetas) hasta 0,7 μm (rojo lejano); es por estas razones que es posible perder detalles o componentes importantes de la célula al momento de elaborar las tinciones. Para evitar estas situaciones la solución consiste en examinar a las células mientras aun están vivas, es decir sin ningún tipo de fijación ni de congelación, por lo que para este proceso son útiles los microscopios con sistemas ópticos especiales. Los microscopios de contraste de fases aprovechan los cambios o interferencia que se producen cuando las ondas de luz se combina, de esta forma dará una imagen de la estructura celular. Una de las grandes ventajas de los microscopios de contraste de fases es que permite observar a las células en acción y estudiar los desplazamientos implicados en procesos como mitosis o migración celular.
Para la apreciación de detalles en la estructura de las membranas y orgánulos
celulares se requiere que la resolución sea con un microscopio electrónico de transmisión, al igual que la utilización de la localización de macromoléculas a través de anticuerpos unidos a las partículas.es posible la terminación de visiones de tipo tridimensional de las superficies de las células gracias a la microscopia electrónica de barrido. También vemos que es posible la utilización de ciertos métodos para combinar varias imágenes obtenidas de diferentes ángulos para obtener reconstrucciones mas detalladas de las macromoléculas usando técnicas como tomografía electrónica de reconstrucción). Estos métodos permiten que sea posible ajustar estructuras anatómicas de moléculas individuales.