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EDICIN N 123
Sntesis de protenas
Colgeno, insulina, hemoglobina, bilirrubina resultan nombres conocidos. Son
protenas que forman parte de la vida cotidiana. De hecho, son uno de los
componentes principales de las clulas y ms de la mitad de su peso seco. La cantidad
de funciones diferentes que realizan las protenas es enorme: son parte de la
estructura celular, regulan, transportan, defienden, aceleran reacciones, entre otras.
Cmo se descubri la estructura de las protenas? Corra la dcada de 1940 y
genetistas de la poca revelaban los primeros indicios de que los genes determinaban
la estructura de protenas individuales. Sin embargo, no fue sino hasta principio de
los aos 50 que el bioqumico britnico Frederick Sanger descubri, estudiando la
insulina, cmo se formaban las protenas a partir de la unin de molculas ms
pequeas.
As como el descubrimiento de la estructura del ADN ejerci una gran influencia
sobre el conocimiento de la base molecular de la herencia y de la gentica, la
determinacin de la secuencia de la insulina constituy la clave para comprender la
estructura y la funcin de las protenas.
Era lgico pensar que si la insulina tena una secuencia definida y genticamente
determinada, tambin la tuvieran las dems protenas. El mecanismo por el cual se
fabrican o sintetizan las protenas es tan fascinante como complejo y su
conocimiento proporciona una parte importe de las herramientas bsicas de la
biologa molecular.
Todo empieza en el ADN
La informacin gentica est almacenada en molculas de ADN (ver cuadernos n 3,
32, 65). Esta informacin se transmite mediante un flujo unidireccional, que va del
ADN hacia el ARN y de ste a las protenas. Este enunciado constituye el Dogma
Central de la Biologa (ver cuadernos n 3, 32, 100) y fue expresado por el cientfico
ingls Francis Crick, famoso adems por proponer junto a James Watson un modelo
de estructura para el ADN y por ganar el Premio Nobel en 1962 por ese trabajo.
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protena especfica, la porcin de ADN que la codifica ser copiada en forma de ARN,
mediante un proceso denominado transcripcin. Luego el ARN formado, que se
denomina ARN mensajero, es utilizado como molde para la sntesis de protenas por
un mecanismo llamado traduccin. Esta informacin finalmente llega de manera
unidireccional a las protenas, y son ellas quienes llevan a cabo la mayor parte de las
actividades celulares.
Utilizando un vocabulario informtico, se podra decir que el ADN representa el
software (instrucciones que las clulas reciben de sus progenitores), mientras que las
protenas constituyen el hardware (aparato fsico que ejecuta el programa
almacenado en la memoria). Actualmente, y aunque se sigue respetando este dogma
como una generalidad, se sabe que hay excepciones para este postulado (retrovirus,
ARN con actividad cataltica, etc.; ver cuadernos n 3 y 115).
La sntesis de protenas, paso a paso
Denominamos, entonces, sntesis proteica al mecanismo por el cual la informacin
contenida en el ADN (ver cuadernos n 3 y 32), se traduce en protenas. Es un
proceso complejo, que se realiza en distintos compartimientos celulares, en el que
intervienen variadas molculas y que se produce bsicamente en dos pasos:
Paso 1: La transcripcin
La transcripcin ocurre dentro del ncleo celular (en las clulas eucariotas), y en el
citoplasma en las procariotas (ver Cuaderno n 80).
En esta primera etapa los genes, que seran palabras escritas en el ADN mediante
la combinacin de cuatro letras o nucletidos A, T, C y G, se copian o transcriben a
otro lenguaje, el del ARN denominado ARN mensajero (ARNm). En este proceso,
denominado transcripcin, la sntesis de una molcula de ARNm es catalizada por una
enzima llamada ARN polimerasa (ARNpol). El proceso se inicia cuando dicha enzima
reconoce un lugar especfico del ADN llamado promotor. Luego de unirse al
promotor, la ARNpol desenrolla aproximadamente una vuelta completa de la hlice
del ADN poniendo al descubierto un fragmento de una sola hebra. Esta hebra de
ADN, llamada hebra codificante, sirve de molde para que la ARNpol vaya agregando
nucletidos complementarios uno tras otro, a medida que se desplaza en una
direccin especfica sobre el ADN (Figura 2). Los nucletidos que adiciona la ARNpol
para formar el ARNm son ribonucletidos, es decir, nucletidos que poseen en su
estructura el azcar ribosa (a diferencia de la desoxirribosa presente en los
nucletidos del ADN). Adems, la complementariedad de nucletidos se realiza de la
siguiente manera:
"El Cuaderno de Por Qu Biotecnologa" es una herramienta didctica creada y desarrollada por el
equipo pedaggico del Programa Educativo Por Qu Biotecnologa. Su reproduccin est autorizada
bajo la condicin de que se aclare la autora y propiedad de este recurso pedaggico por parte del
Programa Educativo Por Qu Biotecnologa.
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Figura 2: Proceso de transcripcin. A partir del ADN doble cadena, la enzima ARN
polimerasa sintetiza un ARN mensajero simple cadena.
Fuente: http://www.geosfera.es/monograficos/DNA/Adn/14-25.jpg
Una vez finalizada la transcripcin, el ARNm est casi listo para la siguiente etapa.
Pero an esta inmaduro y para madurar debe ser protegido de manera de evitar que
pueda degradarse en su viaje al citoplasma. Para ello, unas enzimas especficas se
encargan de ponerle una caperuza o CAP en uno de sus extremos y una cadena corta
de adeninas (colita de poliA) en el otro. Una vez completada la maduracin (que
involucra otros procesos que aqu no mencionamos), el ARNm parte hacia el
citoplasma a travs de los poros de la membrana nuclear en las clulas eucariotas.
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Paso 2: La traduccin
Una vez en el citoplasma, la secuencia del ARNm debe ser decodificada a protena.
Este es el proceso de traduccin y puede dividirse en tres fases: iniciacin,
elongacin y terminacin (Figura 3)
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y otra menor, y es esta ltima la que reconoce y se une en primer lugar al ARN
mensajero (ver figura 3).
Los codones de ARNm no reconocen directamente a los aminocidos, sino que la
traduccin utiliza molculas adaptadoras que unen el aminocido con su
correspondiente triplete o codn. Estos adaptadores son un grupo de pequeas
molculas de ARN, conocidas como ARN de transferencia (ARNt), cada una de las
cuales tiene solo entre 70 y 90 nucletidos de longitud. Esta molcula tiene una
conformacin tridimensional caracterstica, denominada hoja de trbol, que le
permite llevar a cabo su funcin de adaptador (Figura 4).
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Una vez finalizada la sntesis de la protena, el ARN mensajero queda libre y puede
ser ledo de nuevo. De hecho, es muy frecuente que antes de que finalice la sntesis
de una protena ya est comenzando otra, con lo cual, una misma molcula de ARN
mensajero, est siendo utilizada por varios ribosomas simultneamente. A este
complejo de ARNm con mltiples ribosomas y sus respectivas cadenas polipeptdicas
en crecimiento se lo denomina polisoma y es frecuente observarlo en las clulas
activas.
Finalmente, las protenas
Con lo visto hasta ahora, se puede definir a las protenas como macromolculas (es
decir, molculas grandes) formadas por polmeros de aminocidos, una cadena
formada a partir de aminocidos. Sin embargo, las protenas poseen distintos niveles
estructurales: el resultado inmediato de la sntesis proteica, es lo que se denomina
estructura primaria, es decir, la secuencia lineal y ordenada de aminocidos (Figura
6a). A partir de esta secuencia bsica, las caractersticas fsico-qumicas de los
grupos laterales (cadena R) de los aminocidos hacen que stos, aunque se
encuentren alejados en el collar, puedan acercarse y adoptar mltiples
conformaciones tridimensionales. Una de estas conformaciones es el plegamiento
regular local entre residuos aminoacdicos cercanos de la cadena polipeptdica,
gracias a la formacin de enlaces qumicos dbiles, que da como resultado la
estructura secundaria. Los motivos ms comunes son la hlice alfa y la lmina plegada
beta (Figura 6b). Luego, el modo en que la cadena polipeptdica se pliega en el espacio
se denomina estructura terciaria (Figura 6c). Finalmente, y en algunos casos, varias
cadenas proteicas plegadas (o subunidades) pueden unirse entre s por uniones no
covalentes, constituyendo la estructura cuaternaria. (Figura 6d).
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Figura 6: Estructura proteica. Las protenas poseen una estructura 1ria (a, cadena
lineal de aminocidos), y las estructuras tridimensionales: 2ria (b, lmina plegada
beta y hlice alfa), 3ria (c, subunidad proteica) y 4ria (d, protena formada por ms
de una subunidad)
Fuente:http://4.bp.blogspot.com/_EdiSPJX1jg8/Sh23fpZSypI/AAAAAAAABzU/zA
pnBrIJHUI/s400/estruc+1+prot.JPG
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1ra. letra
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ADN. Por otro lado, de los 64 codones que existen, 61 corresponden a aminocidos
(los otros 3 son codones de terminacin). Como slo existen 20 aminocidos, hay ms
codones que aminocidos, de forma que un determinado aminocido puede estar
codificado por ms de un triplete (por ejemplo, a la glicina le corresponden los
codones GGU, GGC, GGA y GGG). Es por eso que se dice que la otra caracterstica del
cdigo gentico es ser degenerado.
Regulacin de la expresin gnica
Todas las clulas de un organismo poseen la misma informacin gentica y sin
embargo, las protenas expresadas en cada tipo celular no son las mismas. Muchas
veces, ni siquiera en una misma clula se expresa el mismo tipo de protena, puesto
que su sntesis depende de muchos factores, tanto internos como seales o factores
externos. Es decir que la produccin de protenas a partir de los genes esta regulada,
y este control es central para que una clula sea lo que es.
En trminos generales, cul gen se expresa y cul no, est determinado por un
control que se ejerce principalmente a nivel de la transcripcin. En ella, molculas
proteicas especializadas son las encargadas de reprimir (regulacin negativa) o de
activar (regulacin positiva) la expresin de determinado gen (ver cuaderno n 115).
En la regulacin negativa, una protena denominada represor bloquea la regin de
unin de la ARNpol al ADN. En el caso de la regulacin positiva, las protenas
activadoras favorecen la unin de la ARNpol a zonas del ADN a las que normalmente
la enzima no es muy afn.
Otro punto de control muy importante que puede ocurrir tanto en la etapa de
transcripcin como en la de traduccin, y tanto en el ncleo como en el citoplasma de
la clula, es el silenciamiento gnico (ver cuaderno n 115): a nivel de transcripcin, el
silenciamiento se produce por la modificacin del ADN mediante el agregado de un
grupo qumico llamado metilo. La metilacin de bases impide el reconocimiento de los
promotores por las polimerasas, y por lo tanto que se exprese ese gen. En cambio, en
el silenciamiento gnico postranscripcional s hay transcripcin del gen silenciado. Lo
que ocurre es que el ARN mensajero sintetizado es degradado de forma especfica,
en funcin de su secuencia. En este caso tampoco habr sntesis proteica del gen que
esta siendo silenciado (ver cuaderno n 115).
Cada gen codifica para una protena?
Hasta hace no mucho tiempo, la idea de que cada gen produce una protena especfica
conocida como la hiptesis un gen, una protena fue un hito en el desarrollo de la
biologa moderna. Sin embargo, y en base a estudios que se vienen realizando en el
rea de la biologa molecular, ingeniera gentica y las micas (ver cuadernos n 4,
65, 114), este concepto fue cambiando. Cmo explicar la complejidad de la biologa
humana con un nmero de genes no mucho mayor al de la mosca de la fruta o con
menos del doble que un simple gusano? Todo indicaba que la complejidad del
organismo humano est ms all del nmero de genes. La respuesta se encontr en un
proceso de modificacin postranscripcional denominado "splicing alternativo". Es un
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CONSIDERACIONES METODOLGICAS
A lo largo del Cuaderno se han analizado diferentes aspectos vinculados con la
sntesis de protenas, que es interesante repasar con los alumnos, adems de las
etapas del proceso mismo.
Existe un cdigo gentico universal. Esto significa que el ADN de todos los seres
vivos, de los ms simples a los ms complejos, est escrito en el mismo lenguaje
de nucletidos. Y esto implica que slo 4 nucletidos, en sus diferentes
combinaciones, determinan la enorme diversidad de seres vivos que existen y
existieron en el planeta. Esto lleva, a su vez, a dos reflexiones interesantes en el
plano de la biologa:
1. sostiene la idea acerca de un origen comn de los seres vivos que habra
aparecido en la Tierra hace 3.500 millones de aos, y del cual han evolucionado
todos los dems tipos de organismos.
2. la similitud en el cdigo gentico hace posible la transgnesis, es decir que el
ADN de un humano pueda ser insertado, por ejemplo, en una bacteria, y que este
microorganismo reconozca el ADN y pueda fabricar la protena, igual a la que se
obtendra en el organismo original.
Todas las clulas de un organismo tienen el mismo ADN, es decir la misma cantidad
de molculas de ADN y con la misma informacin gentica. Sin embargo, las clulas
de un mismo organismo no son todas iguales ni cumplen la misma funcin. Esto se
debe a que los genes, fragmentos de ADN, se expresan de diferente manera en
diferentes clulas. Determinados genes estn activos en unas clulas e inactivos en
otras. Esta diferenciacin y especiacin ocurre ya en la etapa embrionaria (en
organismos pluricelulares).
No es lo mismo un polipptido que una protena. El polipptido es la molcula
formada a partir de la unin de aminocidos pero sin su estructura tridimensional
que le permite cumplir con su funcin. Es decir que slo se llamar protena al
polipptido funcional, es decir a aquel que tiene la estructura espacial que le
permite funcionar. Si la protena pierde esta estructura terciaria (se
desnaturaliza) se pierde la funcin. Esto puede ocurrir, por ejemplo, si la protena
se expone a temperaturas altas respecto de las habituales para su funcionamiento.
Si bien habitualmente se hace referencia a la sntesis de un tipo de protena
particular a partir de un gen, hoy se sabe que un mismo gen puede ser procesado
de diferentes formas y esto dar lugar a muchas protenas diferentes a partir de
una nica secuencia de ADN. Esto explica la enorme diversidad de protenas, a
pesar de no haber tantos genes en el genoma que las codifiquen.
El ADN slo codifica para la sntesis de protenas. Sin embargo, las clulas estn
compuestas por otros tipos de sustancias, como carbohidratos y lpidos. Estas
sustancias no estn codificadas en el ADN. Sin embargo, las protenas que se
fabrican a partir del ADN cumplen funciones muy variadas, entre ellas estn las
enzimas, catalizadores biolgicos que aceleran reacciones qumicas. Estas enzimas
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son las que harn posible que las clulas fabriquen el resto de los componentes
celulares.
Otro aspecto importante del trabajo en el aula es que, en ocasiones, se interpreta
que el ADN se convierte en ARN en el proceso de transcripcin. Es importante
que quede en claro que el ADN nunca sale del ncleo. La molcula de ARN
mensajero es una nueva molcula que se forma a partir de ribonucletidos, tomando
como molde una de las hebras de la molcula de ADN. El ADN sera el libro de
recetas que la clula consulta para fabricar sus protenas, pero el ADN no se
convierte en el producto final de esa receta, sino que queda en su lugar para ser
consultado cada vez que la clula lo requiera.
Otro aspecto que puede generar confusin entre los alumnos es la relacin entre
ADN, informacin gentica y cromosomas. A pesar de hablar del ADN como
sinnimo de informacin gentica, el ADN es una macromolcula, mientras que la
informacin gentica involucra a todas las molculas de ADN que hay en una clula.
Cada molcula de ADN se enrolla y se comprime formando un cromosoma. Es decir
que cada cromosoma es una molcula de ADN. Y lo que se menciona habitualmente
como ADN es todo el conjunto de cromosomas, y no una nica molcula de ADN.
Es importante que estos conceptos queden claros para que no generen confusin en
los alumnos y en su expresin.
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ACTIVIDADES
Actividad 1: Completar los espacios en blanco con una de las opciones dadas
1. Las protenas son -------------- (macromolculas/aminocidos/nucletidos)
formadas por polmeros de --------------------------(cidos nucleicos/aminocidos).
2. Para que la sntesis de protenas pueda ocurrir, en una primera etapa se debe
traspasar la informacin del gen a un ------------- (ARNt/ARNm/ARNr). Este proceso
es catalizado por la enzima------- (ADNpolimerasa/ARNpolimerasa) y se denomina--------- (transcripcin/traduccin). El ARNm sintetizado atraviesa los poros de la
membrana ------------ (plasmtica/nuclear) y se dirige hacia los ribosomas donde se
lee el mensaje del ARNm para comenzar la -------------(transcripcin, traduccin).
3. La unin de un grupo amino de un -----------(gen/aminocido/nucletido) con un
grupo carboxilo de otro, es lo que se denomina unin ----------------------(peptdica/aminoacdica) unin qumica muy ----------(dbil/fuerte) y es la manera en
que se forma la cadena polipeptdica o collar de aminocidos. Esta reaccin es
catalizada por la ---------------(aminoacil-ARNt sintetasa/peptidil transferasa).
4. Los cuatro niveles de organizacin estructural de las protenas son: estructura ---------(1ria/ 2ria/ 3ria/ 4ria) (o cadena lineal de aminocidos), estructura ------(1ria/ 2ria/ 3ria/ 4ria) es el plegamiento regular local entre residuos aminoacdicos --------(lejanos/cercanos) de la cadena polipeptdica y pueden formar conformaciones
de lmina ------(achatada/plegada/alargada) beta y hlice alfa), estructura -----(1ria/ 2ria/3ria/ 4ria) (subunidad proteica tridimensional) y estructura 4ria
(protena formada por---------(solo una/ ms de una/ms de tres) subunidades).
5. El dogma central de la biologa postula que la informacin gentica se transmite
mediante un flujo ----------- (bidireccional/unidireccional), que va del --------(ARN/ARNm/ADN/ARNt) hacia el -----------(gen/ARN/ARNt/protena) y de este a
las --------------(aminocidos/nucletidos/protenas).
6. La informacin del ARNm se divide en tripletes de bases nitrogenadas llamadas -------------(codones/anticodones) que tienen informacin para un ---------------(aminocido/monosacrido/nucletido) de los que formarn a la protena. Para
sintetizar la protena en los ribosomas es necesario que tengan los aminocidos
especificados por el ARNm. La molcula encargada de llevar un aminocido es el ----------- (ARNt/ARNm/ARNr) y la enzima que cataliza la unin del aminocido con el --------(ARNt/ARNm/ARNr) se llama--------- (aminoacil-ARNt sintetasa /peptidil
transferasa). Al llegar al ribosoma es reconocido por su triplete llamado-------------(codn/anticodn) que es complementario con el del ARNm.
7. El cdigo gentico es universal porque los mismos--------- (anticodones/codones)
en diferentes especies codifican para los mismos ------------------------------(nucletidos/aminocidos/protenas). Es degenerado puesto que hay ----(menos/ms) --------(codones/anticodones) que---------- (protenas/aminocidos), de
forma que un determinado aminocido puede estar codificado por ms de un-------------(anticodn/codn).
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de un nmero limitado de genes, en el cual mltiples zonas del ARNm denominadas -intrones son eliminadas del mensajero maduro, mientras que otras regiones, llamadas
exones, son cortadas y re-empalmadas de distintas formas.
Actividad 2: Completar las letras rojas en el proceso de traduccin
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AUGAGGGGGAUGCUGCCCCUCUUUGAGUGA
Met-Arg-Gly-Met-Leu-Pro-Leu-Phe-Glu.
Nota para el docente: es importante destacar que los ARNm no estn delimitados por un
AUG y un codn stop, sino que existe secuencia antes y despus de estos nucletidos.
Aqu se omiti dicha secuencia con fines didcticos.
d) De paso, y para quedar bien con el investigador, dibujen los ARNt que se habran
utilizado para esta traduccin, con sus anticodones y sus aminocidos
correspondientes.
Rta:
MET
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AUG-(CGU/CGC/CGA/CGG/AGA/AGG)- (GGU/GGC/GGA/GGG)-AUGMetArg
Gly
- Met(CUU/CUC/CUA/CUG/UUA/UUG)-(CCU/CCC/CCA/CCG)Leu
Pro
(CUU/CUC/CUA/CUG/UUA/UUG)- (UUU/UUC)- (GAA/GAG).
Leu
Phe Glu
.
Pptido
(pequea
protena)
Met-Arg-Gly-Met-Leu-Pro-Leu-Phe-Glu.
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MATERIAL DE CONSULTA
1. Biologa Molecular de la Clula. Alberts et al. (Versin en espaol de la 4a.
edicin). Editorial Omega, Barcelona (2004).
2. Fundamentos de biologa celular y molecular de De Robertis. Eduardo M. F. De
Robertis, Jos Hib. Editorial El Ateneo (2004).
3. Animacin sntesis de protenas:
o
o
o
http://www.dailymotion.com/video/xc5gxg_sintesis-de-proteinasanimacion-3d_school
http://www.dailymotion.com/video/x9jb9j_sintesis-de-proteinas-v-osubtitula_school
http://www.youtube.com/watch?v=FNqmh4PoMPQ
http://www.educa.madrid.org/web/cc.nsdelasabiduria.madrid/Ejercicio
s/2b/Biologia/proteinas/estruc_prot2.htm
http://www.educa.madrid.org/web/ies.sanisidro.madrid/Cienciasnatura
les/2BIO/2bio_pdf/2bio_pdf15/sintesisselectividad.pdf
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