MICROBIOLOGA

LIC. MBLGO. CARLOS A. MEDINA PANTA

OBJETO DE ESTUDIO DE LA MICROBIOLOGA

El objeto de estudio de una ciencia se puede desglosar en dos apartados: objeto material y objeto formal. A. OBJETO MATERIAL: LOS MICROORGANISMOS: La Microbiologa es la ciencia que se ocupa del estudio de los microorganismos, es decir, de aquellos organismos demasiado pequeos para poder ser observados a simple vista, y cuya visualizacin requiere el empleo del microscopio. Esta definicin implica que el objeto material de la Microbiologa viene delimitado por el tamao de los seres que investiga, lo que supone que abarca una enorme heterogeneidad de tipos estructurales, funcionales y taxonmicos: desde partculas no celulares como los virus, viroides y priones, hasta organismos celulares tan diferentes como las bacterias, los protozoos y parte de las algas y de los hongos. De esta manera la Microbiologa se distingue de otras disciplinas organsmicas (como la Zoologa y la Botnica) que se centran en grupos de seres vivos definidos por conceptos biolgicos homogneos, ya que su objeto de indagacin se asienta sobre un criterio artificial que obliga a incluir entidades sin ms relacin en comn que su pequeo tamao, y a excluir a diversos organismos macroscpicos muy emparentados con otros microscpicos. A pesar de esto (o incluso debido a ello), la Microbiologa permanece como una disciplina perfectamente asentada y diferenciada, que deriva su coherencia interna del tipo de metodologas ajustadas al estudio de los organismos cuyo tamao se sita por debajo del lmite de resolucin del ojo humano, aportando un conjunto especfico de conceptos que han enriquecido la moderna Biologa. Podemos definir, pues, a los microorganismos como seres de tamao microscpico dotados de individualidad, con una organizacin biolgica sencilla, bien sea acelular o celular, y en este ltimo caso pudiendo presentarse como unicelulares, cenocticos, coloniales o pluricelulares, pero sin diferenciacin en tejidos u rganos, y que necesitan para su estudio una metodologa propia y adecuada a sus pequeas dimensiones. Bajo esta denominacin se engloban tanto microorganismos celulares como las entidades subcelulares. A.1. MICROORGANISMOS CELULARES: Comprenden todos los procariotas y los microorganismos eucariticos (los protozoos, los mohos mucosos, los hongos y las algas microscpicas). El encuadre de todos estos grupos heterogneos ser abordado en el prximo captulo. A.2. VIRUS Y PARTICULAS SUBVIRASICAS: Otro tipo de objetos de estudio de la microbiologa son las entidades no celulares, que a pesar de no poseer ciertos rasgos atribuibles a lo que se entiende por vida, cuentan con individualidad y entidad biolgica, y caen de lleno en el dominio de esta ciencia. Los virus son entidades no celulares de muy pequeo tamao (normalmente inferior al del ms pequeo procariota), por lo que debe de recurrirse al microscopio electrnico
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para su visualizacin. Son agentes infectivos de naturaleza obligadamente parasitaria intracelular, que necesitan su incorporacin al protoplasma vivo para que su material gentico sea replicado por medio de su asociacin ms o menos completa con las actividades celulares normales, y que pueden transmitirse de una clula a otra. Cada tipo de virus consta de una sola clase de cido nucleico (ADN o ARN, nunca ambos), con capacidad para codificar varias protenas, algunas de las cuales pueden tener funciones enzimticas, mientras que otras son estructurales, disponindose stas en cada partcula virsica (virin) alrededor del material gentico formando una estructura regular (cpsida); en algunos virus existe, adems, una envuelta externa de tipo membranoso, derivada en parte de la clula en la que se desarroll el virin (bicapa lipdica procedente de membranas celulares) y en parte de origen virsico (protenas). En su estado extracelular o durmiente, son totalmente inertes, al carecer de la maquinaria de biosntesis de protenas, de replicacin de su cido nucleico y de obtencin de energa. Esto les obliga a un modo de vida (sic) parasitario intracelular estricto o fase vegetativa, durante la que el virin pierde su integridad, y normalmente queda reducido a su material gentico, que al superponer su informacin a la de la clula hospedadora, logra ser expresado y replicado, producindose eventualmente la formacin de nuevos viriones que pueden reiniciar el ciclo. Los viroides son un grupo de nuevas entidades infectivas, subvirsicas, descubiertas en 1967 por T.O. Diener en plantas. Estn constituidos exclusivamente por una pequea molcula circular de ARN de una sola hebra, que adopta una peculiar estructura secundaria alargada debido a un extenso, pero no total, emparejamiento intracatenario de bases por zonas de homologa interna. Carecen de capacidad codificadora y muestran cierta semejanza con los intrones autocatalticos de clase I, por lo que podran representar secuencias intercaladas que escaparon de sus genes en el transcurso evolutivo. Se desconocen detalles de su modo de multiplicacin, aunque algunos se localizan en el nucleoplasma, existiendo pruebas de la implicacin de la ARN polimerasa II en su replicacin, por un modelo de crculo rodante que genera concatmeros lineares. Esta replicacin parece requerir secuencias conservadas hacia la porcin central del viroide. Los viroides aislados de plantas originan una gran variedad de malformaciones patolgicas. El mecanismo de patogenia no est aclarado, pero se sabe que muchos de ellos se asocian con el nucleolo, donde quiz podran interferir; sin embargo, no existen indicios de que alteren la expresin gnica (una de las hiptesis sugeridas); cada molcula de viroide contiene uno o dos dominios conservados que modulan la virulencia. En 1986 se descubri que el agente de la hepatitis delta humana posee un genomio de ARN de tipo viroide, aunque requiere para su transmisin (pero no para su replicacin) la colaboracin del virus de la hepatitis B, empaquetndose en partculas similares a las de este virus. A diferencia de los viroides vegetales, posee capacidad codificadora de algunas protenas. Los ARNs satlites son pequeas molculas de tamao similar al de los viroides de plantas (330-400 bases), que son empaquetados en cpsidas de determinadas cepas de virus (con cuyos genomios no muestran homologas). Se replican slo en presencia del virus colaborador especfico, modificando (aumentando o disminuyendo) los efectos patgenos de ste. Los virusoides constituyen un grupo de ARNs satlites no infectivos, presentes en el interior de la cpsida de ciertos virus, con semejanzas estructurales con los viroides, replicndose exclusivamente junto a su virus colaborador.
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Los priones son entidades infectivas de un tipo totalmente nuevo y original, descubiertas por Stanley Prusiner en 1981, responsables de ciertas enfermedades degenerativas del sistema nervioso central de mamferos (por ejemplo, el scrapie o prurito de ovejas y cabras), incluyendo los humanos (kuru, sndrome de GerstmannStrassler, enfermedad de Creutzfeldt-Jakob). Se definen como pequeas partculas proteicas infectivas que resisten la inactivacin por agentes que modifican cidos nucleicos, y que contienen como componente mayoritario (si no nico) una isoforma anmala de una protena celular. Tanto la versin celular normal (PrPC) como la patgena (PrPSc en el caso del scrapie) son glicoprotenas codificadas por el mismo gen cromosmico, teniendo la misma secuencia primaria. Se desconoce si las caractersticas distintivas de ambas isoformas estriban en diferencias entre los respectivos oligosacridos que adquieren por procesamiento post-traduccional. A diferencia de los virus, los priones no contienen cido nucleico y estn codificados por un gen celular. Aunque se multiplican, los priones de nueva sntesis poseen molculas de PrP que reflejan el gen del hospedador y no necesariamente la secuencia de la molcula del PrP que caus la infeccin previa. Se desconoce su mecanismo de multiplicacin, y para discernir entre las diversas hiptesis propuestas quiz haya que dilucidar la funcin del producto normal y su posible conversin a la isoforma patgena infectiva. Recientemente se ha comprobado que, al menos algunas de las enfermedades por priones son simultneamente infectivas y genticas, una situacin inslita en la Patologa humana, habindose demostrado una relacin entre un alelo dominante del PrP y la enfermedad de Creutzfeldt-Jakob. El gen del prin (Prn-p) est ligado genticamente a un gen autosmico (Prn-i) que condiciona en parte los largos tiempos de incubacin hasta el desarrollo del sndrome. B. OBJETO FORMAL: Todos los aspectos y enfoques desde los que se pueden estudiar los microorganismos conforman lo que denominamos objeto formal de la Microbiologa: caractersticas estructurales, fisiolgicas, bioqumicas, genticas, taxonmicas, ecolgicas, etc., que conforman el ncleo general o cuerpo bsico de conocimientos de esta ciencia. Por otro lado, la Microbiologa tambin se ocupa de las distintas actividades microbianas en relacin con los intereses humanos, tanto las que pueden acarrear consecuencias perjudiciales (y en este caso estudia los nichos ecolgicos de los correspondientes agentes, sus modos de transmisin, los diversos aspectos de la microbiota patgena en sus interacciones con el hospedador, los mecanismos de defensa de ste, as como los mtodos desarrollados para combatirlos y controlarlos), como de las que reportan beneficios (ocupndose del estudio de los procesos microbianos que suponen la obtencin de materias primas o elaboradas, y de su modificacin y mejora racional con vistas a su imbricacin en los flujos productivos de las sociedades). Finalmente, la Microbiologa ha de ocuparse de todas las tcnicas y metodologas destinadas al estudio experimental, manejo y control de los microorganismos, es decir, de todos los aspectos relacionados con el modo de trabajo de una ciencia emprica.

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IMPORTANCIA DE LA MICROBIOLOGA
La Microbiologa es una ciencia biolgica extraordinariamente relevante para la humanidad, dado que los microorganismos estn presentes en todos los hbitats y ecosistemas de la Tierra y sus actividades presentan una gran incidencia en numerossimos mbitos de inters: Los microorganismos han sido los primeros en aparecer en la evolucin, y constituyen seguramente la mayor parte de la biomasa de nuestro planeta. Se calcula que slo hemos descrito menos del 10% de los microorganismos existentes, por lo que los bilogos tienen una gran tarea por delante para estudiar esta parte de la biodiversidad. Las actividades microbianas sustentan los ciclos biogeoqumicos de la Tierra: los ciclos del carbono, del nitrgeno, del azufre o del fsforo dependen de modo fundamental de los microorganismos. Las actividades metablicas microbianas son excepcionalmente variadas, siendo algunas de ellas exclusivas del mundo procaritico. La biolologa bsica tiene aqu un gran campo de estudio. El aspecto aplicado y la incidencia econmica y social de los microorganismos es ingente, y aqu daremos unas breves pinceladas: Aspectos beneficiosos: Todas las culturas desarrollaron de modo emprico multitud de bebibas y alimentos derivados de fermentaciones microbianas: vino, cerveza, pan, verduras fermentadas, etc. Produccin de multitud de productos industriales: alcoholes, cidos orgnicos, antibiticos, enzimas, polmeros, etc. La ingeniera gentica empez con los microorganismos, que siguen desempeando un papel fundamental en la nueva generacin de medicamentos recombinantes y de terapias novedosas En su aspecto perjudicial, la Microbiologa dedica una especial atencin a los microorganismos patgenos, sobre todo a los que afectan a la humanidad Las enfermedades microbianas han sido causa de grandes males a nuestra especie. Baste recordar que la peste (muerte negra) caus a mediados del siglo XIV la muerte de la tercera parte de la poblacin europea, y ya en la primera mitad del siglo XV lleg a afectar a ms del 75%. Basta leer la literatura o ver las pinturas de la poca para darse cuenta del impacto terrorfico que supuso, lo que a su vez supuso un factor esencial en el surgimiento de las ideas del Renacimiento. Desde la poca del descubrimiento de Amrica, las exploraciones han conllevado el intenso trasiego de agentes patgenos de un lugar a otro. La desaparicin de buena parte de la poblacin indgena se debi en buena parte a no tener defensas frente a la viruela europea, pero a su vez los descubridores importaron la sfilis a Europa. No hace falta resaltar el papel que ha tenido la microbiologa mdica, desde la poca de Pasteur y Koch, en la lucha contra las enfermedades infecciosas (antisepsia, desinfeccin, esterilizacin, quimioterapia). Y aunque ahora tengamos nuevos retos (SIDA, fiebres hemorrgicas, etc.), no cabe duda de que la Microbiologa est contribuyendo a no perder esta permanente Aparte de todas estas
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actividades de los microorganismos sobre los humanos, hay que tener en cuenta que existen grmenes que afectan a animales, plantas, instalaciones industriales, que afectan a alimentos, etc., representando otras tantas reas de atencin para la Microbiologa batalla contra los grmenes patgenos

UBICACIN DE LOS MICROORGANISMOS EN EL MUNDO VIVO

Tras el descubrimiento de los microorganismos, a los naturalistas de la poca les pareci normal intentar encuadrarlos dentro de los dos grandes reinos de seres vivos conocidos entonces: animales y plantas. De este modo, a finales del siglo XVIII las algas y los hongos quedaron en el reino Plantae, mientras que los llamados infusorios se encuadraron en el reino Animalia. A mediados del siglo XIX se empez a ver que esa clasificacin era demasiado sencilla, y que el grupo de los infusorios era muy heterogneo. En 1866 Haeckel, seguidor de Darwin, propone un famoso rbol filogentico con tres reinos: Animalia Plantae Protista: todos los seres vivos sencillos, sean o no fotosintticos o mviles. Dentro de l consideraba los siguientes grupos: Protozoos Algas Hongos Moneras (=bacterias) Pero esta clasificacin iba a ser puesta en entredicho a mediados del siglo XX, cuando las tcnicas de microscopa electrnica y bioqumicas demuestran la gran diferencia de las bacterias respecto del resto de organismos. De hecho, ya en los aos 60 se reconoce que esta diferencia representa la mayor discontinuidad evolutiva del mundo vivo. En 1974, el Manual Bergeys (la biblia oficiosa de la clasificacin bacteriana) considera que la clasificacin al mximo nivel del mundo vivo debe reconocer la existencia de dos Reinos: Procaryotae (material gentico no rodeado de membrana nuclear) Eucaryotae (ncleo autntico) Pero en los aos recientes, la incorporacin a la taxonoma de los mtodos de biologa molecular, especialmente la secuenciacin de ARN ribosmico y la genmica, est obligando a nuevos planteamientos. Para resumir, hoy se asume lo siguiente: Existen dos tipos de organizacin celular, la procaritica y la eucaritica. Dentro de los seres vivos con organizacin procaritica, existen dos grandes dominios o imperios: Bacteria (las eubacterias o bacterias clsicas) y Archaea (antes llamadas arqueobacterias) A su vez, el dominio eucaritico comprende numerosas lneas filogenticas, muchas de ellas de microorganismos. Los mismos Protozoos es un grupo muy heterogneo, que comprende lneas filogenticas diversas y a veces muy separadas en el tiempo evolutivo