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Enzimas

Reacción química
• Las reacciones
químicas pueden ser
espontaneas o no
espontaneas.
• Estas reacciones
dependen de la
Energía libre de Gibbs
• Teoría de Coliciones
Teoría de colisiones cinética química
• Las moléculas de los reactivos
tienen que chocar entre sí.
• Con energía suficiente de forma
que se puedan romper y formar
enlaces químicos.
• Con orientación adecuada para
que los enlaces que se tienen
que romper y formar estén a una
distancia y posición viable.
Catalizadores
• Conocemos como catalizador a
cualquier sustancia que acelera la
velocidad de una reacción, pero sin
participar químicamente en ella.
• Por ejemplo, la descomposición del
peróxido de hidrógeno a agua y
oxígeno es extremadamente lenta,
pero la adición de ión férrico acelera la
reacción, con la formación observable
de burbujas de oxígeno
Catalizadores biológicos
• Casi todas las funciones
biológicas se realizan gracias a
reacciones químicas catalizadas
por catalizadores biológicos
llamados enzimas
• Casi todas los enzimas son
proteínas, aunque existen
enzimas de ácido ribonucleico,
denominadas ribozimas
Funcionamiento de los enzimas
• Los enzimas son catalizadores, es
decir, sustancias que, sin consumirse
en una reacción, aumentan
notablemente su velocidad.
• Reducen la energía de activación
• Ello hace posible que en condiciones
fisiológicas tengan lugar reacciones
que sin catalizador requerirían
condiciones extremas de presión,
temperatura o pH.
Curso de una reacción espontánea

S P

Energía libre de Gibbs
G‡S P.

G‡P
S.

P
(G)

G’

Curso de reacción
Mecanismo general de la catálisis enzimática

E+S ES
P
2 ‡
G‡Sin
cat.

4

5
G‡cat.
ES EP
3

Reacción catalizada vs reacción no catalizada


Estado de transición
(‡)
Mecanismos que utilizan las enzimas para
aumentar la velocidad de las reacciones

Acercan a los reactantes

Disminuyen la energía de
activación

¿CÓMO LO HACEN?

A través de la formación
del Complejo Enzima -
Sustrato
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Características de las Enzimas
1. Tienen gran poder catalítico.

2. Son altamente específicas.


3. Aumentan la velocidad de la reacción
sin
alterar las constante de equilibrio.

4. La mayoría de las enzimas son proteínas.


5. Su actividad puede ser regulada.

6. Las enzimas interconvierten diferentes formas de


energía.
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Enzimas de Naturaleza Proteica

 PROTEINAS PURAS:
no requieren cofactor (tripsina, quimotripsina, elastasa)

 HOLOENZIMAS:
 Porción proteica ó Apoenzima

Coenzima: molécula orgánica que


está débilmente unida a la enzima.
Cofactor: Catión metálico, unido
 Porción no proteica débilmente a la enzima.

Grupo prostético: molécula orgánica o


unión metálico que está covalentemente
unido a la enzima. 8
Sitios de la
Enzima
SITIO DE UNIÓN AL SUSTRATO:
Contiene los grupos químicos (cadenas laterales de aminoácidos)
que fijan al sustrato formando el Complejo Enzima – Sustrato. La
unión es reversible y se establece mediante débiles
enlaces (electrostáticos o salinos, puentes de
hidrógeno, hidrofóbicas y fuerzas de Van der fuerzas
Waals).

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Sitios de la Enzima

SITIO ACTIVO:
Contiene los grupos químicos específicos implicados en la catálisis
(cadenas laterales de aminoácidos o nucleótidos), pudiendo estar
cercanos o alejados en su estructura primaria. Puede integrar o no
al sitio de unión al sustrato.

Ser

Asp

His
Glucosa 6-
fosfotransferasa

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Sitios de la Enzima

Sitio activo de una


enzima

Sustrato: H2O2

Sitio Activo

Sustrato
Sitio Activo

Modelo molecular de la Modelo esquemático


Catalasa de una enzima
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Sitios de la Enzima

SITIO ALOSTÉRICO:

Presente en las enzimas regulatorias, en donde se fijan efectores o


inhibidores alostéricos, que provocan un cambio conformacional en
el sitio de unión al sustrato o en el sitio catalítico, regulando la
actividad enzimática.

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Especificidad enzimática

Especificidad de sustrato

Absoluta

Relativa

Especifi
cidad de
acción

Absoluta
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Especificidad enzimática

Especificidad de Sustrato

Cuando están presentes diferentes moléculas de sustrato,


únicamente aquella que tenga la forma específica y
complementaria al sitio activo de la enzima será capaz de
ocupar el sitio activo.

Sustrato
Sitio
Activo

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Especificidad enzimática

Especificidad Absoluta

DE GRUPO: alcohol, enlace peptídico, enlace éster.

ÓPTICA: D, L (D-monosacáridos; L-aminoácidos)

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Modelos que explican la Especificidad enzimática

(a) Modelo cerradura-llave, propuesto por Emil Fisher en


1890

Sitio +
activ +
o

La forma del sitio activo de la enzima es complementaria a la forma


del sustrato que encaja completamente en éste

Mathews y20
van Holde, 1998
Modo de acción

Sitio activo de la ribulosa 1,5


difosfato carboxilasa-
oxigenasa, con su sustrato,
la ribulosa 1, 5 difosfato

Bioquímica, 4° ed. Lubert Stryer. Reverté ed., 2001.


(b) Modelo del ajuste inducido, propuesto por Daniel Koshland Jr. en
1968

+ +

Conformación del
estado de transición

Según este modelo el centro activo une el sustrato y como


consecuencia de esta unión su conformación cambia, ocurre una
deformación del sustrato y de la enzima para alcanzar una mejor
complementariedad, lo que facilita la transformación del sustrato en
producto.
Mathews y van Holde, 1998
Modelo de ajuste inducido

Modelo de llave-cerradura
Especificidad

•La enzima Glucocinasa posee una


especificidad absoluta para la glucosa.

•La enzima Hexocinasa posee una


especificidad relativa ya que además de
glucosa también puede usar como sustrato
a otras hexosas y algunos derivados de las
mismas.
Sin embargo, la realidad es
mejor que los modelos.
Enzima que actúa según el
modelo de ajuste inducido.
En rojo, las cadenas laterales
que participan en la catálisis
(junto con el zinc), y en
amarillo, el sustrato.

Bioquímica, 4° ed. Lubert Stryer. Reverté ed., 2001.


LA Vmax SE ALCANZA CUANDO TODOS LOS CENTROS
ACTIVOS ESTÁN OCUPADOS CON SUSTRATO

Velocidad inicial

1/2 Vmax

Km
Concentración de sustrato [S]
Garrett, R.H. and Grisham, C.M. Biochemistry. 2ª ed. Saunders College Publishing. 1999.
LA Vmax SE ALCANZA CUANDO TODOS LOS CENTROS
ACTIVOS ESTÁN OCUPADOS CON SUSTRATO
Velocidad inicial

1/2 Vmax

Km Concentración de sustrato [S]

Garrett, R.H. and Grisham, C.M. Biochemistry. 2ª ed. Saunders College Publishing. 1999.
CALCULO DE Km Y Vmax POR LA
REPRESENTACIÓN DE LINEWEAVER-­‐BURK

Garrett, R.H. and Grisham, C.M. Biochemistry. 2ª ed. Saunders College Publishing. 1999.
PARÁMETROS
ENZIMÁTICOS
1. Km (constante para cada enzima) = concentración de S a la que la Vo es
1/2 Vmax. Es una medida de la afinidad del enzima por S. Cuanto menor
es Km, mayor es la afinidad del enzima por S.
2. Kcat (constante para cada enzima) = número de recambio = número de
moléculas de sustrato convertidas en producto por molécula de enzima
y unidad de tiempo, en condiciones de saturación de sustrato.
3. Vmax = velocidad máxima teórica = la velocidad cuando todos los centros
activos están ocupados con sustrato (nunca alcanzada en la realidad).
4. Unidad de enzima = cantidad de enzima que transforma 1 µmol de
sustrato por min = una forma común de expresar la velocidad.
5. Actividad específica = unidades por mg de proteína total de la
preparación enzimática. En el caso de enzimas en suero: unidades/L.
Km de algunas enzimas

Nelson, DL and Cox, M.M. Lehninger Principles of Biochemistry. 3ª ed. Worth Publishers, 2000.
EFECTO DEL pH SOBRE LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA
• Los enzimas poseen grupos
químicos ionizables (carboxilos •1
-COOH; amino -NH2; tiol -SH;
imidazol, etc.) en las cadenas •2
laterales de sus aminoácidos.
• Según el pH del medio, estos
grupos pueden tener carga
eléctrica positiva, negativa o •3
neutra.
• La conformación de las proteínas •4
depende, en parte, de sus cargas
eléctricas,
• Este es el llamado pH óptimo.
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EFECTO DEL pH SOBRE LA ACTIVIDAD
ENZIMÁTICA
• La mayoría de los enzimas son muy
sensibles a los cambios de pH.
• Desviaciones de pocas décimas por encima
o por debajo del pH óptimo pueden afectar
drásticamente su actividad.
• Así, la pepsina gástrica tiene un pH óptimo
de 2, la ureasa lo tiene a pH 7 y la arginasa
lo tiene a pH 10
• Para evitar estos cambios en el pH se
utilizan amortiguadores fisiológicos.

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EFECTO DE LA TEMPERATURA SOBRE LA
ACTIVIDAD ENZIMÁTICA
• El aumentos de temperatura
aceleran las reacciones
químicas: por cada 10ºC de
incremento, la velocidad de
reacción se duplica.
• Las reacciones catalizadas
por enzimas siguen esta ley
general.
• La temperatura a la cual la
actividad catalítica es
máxima se llama
temperatura óptima
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EFECTO DE LAS CONCENTRACIONES SOBRE LA
ACTIVIDAD ENZIMÁTICA

• La velocidad de una reacción enzimática


depende de la concentración de sustrato.
• La presencia de los productos finales
puede hacer que la reacción sea más
lenta, o incluso invertir su sentido

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