Guía de estudios 3.

Magaña Ruiz Ana Vanessa

1.3.1 Enzimas

1. Define los términos enzimas y catalizadores.

Son moléculas de naturaleza proteínica que aceleran las reacciones bioquímicas.

Son catalizadores biológicos que disminuyen la energía de activación de las

reacciones que catalizan, de forma que aceleran sustancialmente la tasa de
reacción.

Es una molécula inorgánica u orgánica que incrementa notablemente la

velocidad de las reacciones químicas sin ser modificada o consumida en la
reacción.

2. Esquematice la reacción enzimática simple.

3. Explique cuándo las reacciones bioquímicas son espontáneas y cuándo no son

posibles.

Las reacciones proceden espontáneamente si hay un descenso en la energía libre

cuando la temperatura y la presión se mantienen constantes.

Muchas reacciones bioquímicas, que son termodinámicamente posibles, ocurren

a velocidades despreciables, es decir son cinéticamente imposibles.

Lo que determina si una reacción es termodinámicamente posible es el valor del

cambio en energía libre (ΔG).

Lo que determina si una reacción es cinéticamente posible es el valor de su energía

de activación (ΔG‡).

4. Explique los términos de energía libre (ΔG) y energía de activación (ΔG‡).

Energía de activación (ΔG‡): Es la diferencia entre los niveles de energía del estado
basal y del estado de transición.

Estado de transición: es una configuración particular a lo largo de la coordenada

de reacción que se define como el estado que corresponde al máximo de energía
a lo largo de la misma.
5.- Rellena los espacios según los cambios de energía libre de una reacción NO
CATALIZADA.

Estado de transición

G s-p
G p-s

G
Estado
Basal
Edo Basal

6.- Rellena los espacios según los cambios de energía libre de una reacción
CATALIZADA.

Estado de transición

G sin G
catalizar

G
catalizar

8. Escribe la ecuación que relaciona la energía libre y la constante de equilibrio

(Keq).

G°´=-RTlnKeq
9. Explique la necesidad de la biocatálisis y las ventajas de las enzimas sobre los
catalizadores inorgánicos.

Porque de lo contrario estarían todas en equilibrio.

Porque así la célula puede regular en forma diferencial su velocidad, regulando la

actividad de los catalizadores de cada una de ellas.

10. De tres ejemplos de la magnitud del aumento en la velocidad de la reacción

por las enzimas.

 Ciclofilina
 Anhidrasa Carbonica
 Triosa Fosfato Triasa

11. Mencione los requerimientos para catálisis específica.

 Unión específica a la proteína de las moléculas de sustrato y de moléculas

reguladoras.
 Reactividad específica de la proteína con el (los) sustrato (s).

12. Explique las teorías de unión específica del sustrato.

 Teoría de la llave y la cerradura (modelo de Fischer).

 Teoría del ajuste inducido o modelo del guante y la mano (Teoría de
Koshland).

13. Define los siguientes términos: holoenzima, apoenzima, cofactor, coenzima y

grupo prostético.

Holoenzima: Una enzima completa, catalíticamente activa junto con su cofactor

(coenzima o ión metálico) unido.

Parte proteínica de la holoenzima: apoenzima o apoproteína.

Parte no proteínica de la holoenzima cofactor

Coenzimas: moléculas orgánicas o metalo-orgánicas complejas.

Grupo prostético: cofactor (coenzima o ion inorgánico) unido muy fuertemente

(covalentemente) a la enzima.

14. Describe las propiedades de las coenzimas.

 Actúan como portadores transitorios de grupos funcionales específicos.

 La mayoría son derivadas de vitaminas, nutrimentos orgánicos requeridos en
pequeñas cantidades de la dieta.
 Algunas enzimas requieren ambos, una coenzima y uno o más iones
metálicos para su actividad.

15. De tres ejemplos de iones inorgánicos que sirven como cofactores.

Citocromo Oxidasa,Piruvato Cinasa y Ureasa.

16. De tres ejemplos de coenzimas que sirven como portadores transitorios de

átomos específicos o grupos funcionales.

Biocitina, Coenzima A y Lipoato.

17. Describe la clasificación de las enzimas por el tipo de reacción que catalizan y
ejemplos (oxidorreductasas, transferasas, hidrolasas, liasas, isomerasas, ligasas).

Oxidorreductasas: Reacciones de oxidación-reducción: transferencia de

electrones (iones hidruro o átomos de H).

Transferasas: Transferencia de grupos funcionales

Hidrolasas: Reacciones de hidrólisis (transferencia de grupos funcionales o agua).

Liasas: Adición de grupos a dobles enlaces, o formación de dobles enlaces por

remoción de grupos.

Isomerasas: Isomerización: Transferencia de grupos dentro de moléculas para

producir formas isoméricas.

Ligasas: Formación de enlace C-C, C-S, C-O y C-N por reacciones de

condensación acopladas a la ruptura de ATP o un cofactor similar.

18. Explique la estereoespecificidad y especificidad geométrica de las enzimas.

Estereoespecificidad: sustratos quirales, las enzimas actúan sobre sustratos L o D,

pero no sobre ambos. Las enzimas son estereoespecíficas porque forman varias
interacciones entre aminoácidos del sitio activo y los distintos grupos del sustrato.

Especificidad geométrica: las enzimas son selectivas hacia la identidad de los

grupos químicos situados en los sustratos.

19. Define los siguientes términos: sitio activo, sitio de unión al sustrato y sitio
alostérico.

Sitio activo: hueco en la enzima en donde se une el sustrato y se lleva a cabo la

catálisis enzimática.

Sitio alostérico: Lugar de unión a moléculas pequeñas, cuyo efecto es un cambio

en el sitio activo

sitio de unión a sustrato: lo que modula la actividad enzimática.

20. Mencione las unidades de expresión de la actividad y actividad específica de

una enzima.

 Vmax
 Concentración x tiempo-1 (μmol mL-1 min-1).
 Kcat
  Tiempo-1 (min-1, s-1).Km
 Concentración (mM, μM).
 Vmax/Km
 Tiempo-1 (min-1, s-1).
 kcat/Km
 Concentración-1 x tiempo (M-1 s-1).

21. Anote la ecuación de Michaelis-Menten (parámetros cinéticos) y dibuja la

gráfica.

22. Define y explique el significado de: velocidad máxima (Vmax.), constante

catalítica (Kcat), constante de Michaelis Menten (Km), constante de especificidad
(Vmax/Km o Kcat/Km).

Velocidad máxima(Vmax):Es la velocidad cuando todos los sitios activos están

ocupados con el sustrato.

Constante catalítica(kcat) o número de recambio:Número de moléculas de

sustrato convertidas en producto por molécula de enzima y unidad de tiempo, en
condiciones saturantes del sustrato. Esconstante para cada enzima.

Constante de Michaelis-Menten(Km):Concentración del sustrato (S) a la que la

velocidad inicial (V0) es ½Vmax. Es una medida de la afinidad de la enzima por elS.
Cuanto menor es Km, mayor es la afinidad de la enzima por S. Es constante para
cada enzima.

Constante de especificidad:Indica cuál es el mejor sustrato de una enzima (aquel

que tenga la mayor constante de especificidad). La enzima más específica está
más próxima a la perfección catalítica.

Representa el paso de unión de la enzima y el sustrato (cualquier factor que afecte

esta constante estáafectando el paso de unión).
23. Dibuje una gráfica y anote los parámetros cinéticos de la transformación de
Lineweaver-Burk.

24. Describe los factores que afectan la velocidad de una reacción catalizada por
enzimas.

 Concentración de sustrato o sustratos

 Presencia de cofactores.
 Concentración de enzima.
 Activadores.
 Inhibidores (reversibles e irreversibles).
 pH.
 Temperatura.

25. Define los términos: inhibidor y activador de las reacciones enzimáticas.

Inhibidor: Molécula o ion que al unirse a la enzima produce una disminución en la

velocidad de la reacción catalizada.

Activador: Molécula o ion que al unirse a la enzima produce un aumento en la

velocidad de la reacción catalizada.

26. Define los siguientes tipos de inhibidores: isostérico, alostérico, competitivo,

incompetitivo y mixto.

ISOSTÉRICO:El inhibidor se une al mismo sitio que el sustrato (sitio activo).

ALOSTÉRICO: El inhibidor se une a un sitio diferente al que se une el sustrato (sitio

alostérico).

COMPETITIVO: El inhibidor se une a la enzima libre interfiriendo con la unión del

sustrato.

INCOMPETITIVO:El inhibidor se une al complejo enzima-sustrato interfiriendo con la

formación de producto.

MIXTO: El inhibidor se une tanto a la enzima libre como al complejo enzima sustrato,
interfiriendo con la unión del sustrato y con la formación del producto.
26. Describe el efecto de los inhibidores sobre los parámetros cinéticos.

COMPETITIVO: Líneas que se cruzan en el eje de ordenadas (1/v)

INCOMPETITIVO:Líneas paralelas.

MIXTO:Líneas que se cruzan en el segundo cuadrante (a la izquierda del eje de

ordenadas (1/v)).

NO COMPETITIVO:Líneas que se cruzan en el eje de abscisas (1/ [S]) (a la izquierda

del eje de ordenadas).

27. Describe el efecto del pH sobre la actividad de las enzimas.

Cambio en la ionización de:

 Residuos de aminoácidos implicados en la unión del sustrato.

 Residuos de aminoácidos implicados en la catálisis.

Grupos del sustrato.

 Residuos de aminoácidos implicados en la estabilidad de la enzima.

28. Describe el efecto de la temperatura sobre la actividad enzimática.

En las reacciones catalizadas por enzimas:

 La velocidad aumenta con la temperatura hasta que la enzima comienza a

desnaturalizarse.
 No existe una temperatura óptima de reacción, depende de las
condiciones en que midamos la reacción, especialmente del tiempo.

29. Mencione los mecanismos por medio de las cuales se regula la cantidad y
actividad de las enzimas.

 Regulación de la cantidad de la enzima.

 Regulación de la actividad de la enzima preexistente.

30. Describe la regulación de la actividad enzimática por proteólisis limitada.

La proteólisis limitada consiste en la hidrólisis de uno o pocos enlaces peptídicos

específicos en la molécula precursora.

La proteólisis limitada produce formas activas a partir de precursores inactivos.

31. Define los términos: isoenzimas y zimógenos.

Las isoenzimas son diferentes proteínas que catalizan la misma reacción.Pueden

estar presentes en la misma especie, en el mismo tejido o incluso en la misma célula.

Los zimógenos son formas inactivas de enzimas que son convertidas a formas
activas por proteólisis en sitios específicos con proteasas específicas.
32. Explique y de ejemplos de la modificación química reversible por adición de un
grupo.

Modificación química reversible por oxidación- reducción de cisteínas vecinas

Por ejemplo, las fosforilaciones en la treonina-14 (T14) y la tirosina-15 (Y15) en las

kinasas dependientes de ciclinas, Cdk (del inglés, Cyclin-dependet kinase) tienen
un efecto sinérgico, pues ambas son inhibidoras, mientras que la fosforilación en
treonina-160 (T160) tiene un efecto antagónico con las anteriores pues es
activadora

33. Describe el significado de cooperatividad positiva y negativa y complete los

espacios faltantes en la gráfica.

Positiva:La unión del sustrato es cada vez más fácil a medida que la enzima se
satura más y más.

Negativa: La unión del sustrato es cada vez más difícil a medida que la enzima se
satura más y más.

Cooperatividad
positiva
Cinética de Michaelis

Cooperatividad negativa

34. Describe los tipos de catálisis enzimática.

Catálisis ácido-base: La catálisis ácida general consiste en la transferencia de un

protón.

La catálisis básica general consiste en la transferencia de un protón desde el

sustrato o intermediarios de la reacción a un residuo de la enzima.

Catálisis electrostática: La enzima estabiliza intermediarios o estados de transición

de la reacción por neutralización de cargas gracias a la disposición espacial en el
sitio activo de residuos con carga opuesta.
Catálisis covalente: La enzima forma transitoriamente un enlace covalente con el
sustrato.

35. Complete la imagen de los agentes químicos que rompen puentes disulfuro.