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importancia de la
fenotipificación
Sandro Jhonatan Condori Pacsi
Antecedentes
• 1900: Karl Landsteiner en la Universidad de Viena, descubrió por qué
algunas transfusiones de sangre eran exitosas mientras que otras
podían ser mortales.
• Landsteiner descubrió el sistema de grupos sanguíneos ABO
mezclando los glóbulos rojos y el suero de cada miembro de su
personal.
• Demostró que el suero de unas personas aglutinaba los glóbulos rojos
de otras.
Antecedentes
• A partir de estos primeros experimentos, identificó tres tipos, llamados
A, B y C (más tarde, C pasaría a llamarse O por el alemán "Ohne", que
significa "sin" o "Cero", "nulo" en inglés).
• El cuarto grupo sanguíneo AB menos frecuente, fue descubierto un
año después.
• En 1930, Landsteiner recibió el Premio Nobel de Fisiología y
Medicina por su trabajo.
Origen de los alelos del locus ABO
• Gorilas => Alelos similares al grupo B humanos
• Chimpancé => Dos alelos semejantes a los alelos A y O => Mutaciones
especificas distintas a las humanas.
• Homo sapiens:
• Alelo ancestral (A101) => Dio origen al alelo B (3.5 Ma)
• Alelo A => Dio origen al alelo O01 => Del (261 del exón 6) => Codón
prematuro stop (1,15 ± 0.2 Ma) => Mutación se da antes de la
divergencia del homo sapiens y Neandertal.
https://doi.org/10.1038/srep06601
Homo sapiens
Homo neanderthalensis
Alelo i (O)
Evolución de la familia de genes de la
transferasa α1,3-Gal(NAc)
https://doi.org/10.1038/srep06601
Genética del grupo sanguíneo
ABO
Ubicación cromosómica
El gen que determina el tipo de sangre humano ABO se encuentra en el cromosoma 9 (9q34.1) y se llama
ABO glicosiltransferasa.
DOI: 10.46701/APJBG.2018022018113
Allele IA
functional enzyme
Allele i
truncated enzyme
Gametos Proporción:
Hembra
1/2 IA 1/2 i Genotipica
Gametos
Macho IAIB = 1/4
1/4 IAIB = AB IBi = 1/4
1/4 IBi = B
IAi = 1/4
i i = 1/4
Genotipo
1/2 IB
IBi Fenotipica
substancia H antígeno A o B
Hh IAi x Hh Iai
9 H_ IA_ => A
3 H_ ii => O
3 hh IA_ => Bombay (Donante)
1 hh ii => Bombay
Fenotipo Bombay
Glucosa Galactosa Acetil glucosamina Fucosa
LOCUS H LOCUS ABO
IA_
A
H_ Compuesto ‘H’
IB _
B
Sustrato
ii
O
hh
Bombay
Genética de poblaciones
Genética de poblaciones
Estudia la dotación genética de la población y la manera en que cambia
la composición genética en el tiempo.
Numero de alelos: 2 A1 y A2
Genotipos
• Naranja con rayas negras: A1A1 o A1A2 (AA o Aa)
• Blanco: A2A2 (aa)
Rasgos con dominancia incompleta y codominantes
Numero de alelos: 3 A1, A2 y A3
Genotipos
• Rojo : A1A1
• Blanco: A2A2
• Amarillo:A3A3
• Rosado:A1A2
• Naranja:A1A3
Numero de alelos: 2 A1 y A2
Genotipos
Rojo : A1A1 (ARAR)
Blanco: A2A2 (ABAB)
Rosado:A1A2 (ARAB)
Alelos: Marcadores moleculares: Codominante
Numero de alelos: 2 A1 y A2 o (450 pb y 350
PM 1 2 3 4 5 6 7 8 pb)
Genotipos:
450
350 1: A1A1 (450/450)
2: A1A1 (450/450)
3: A2A2 (350/350)
PM 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18
Numero de alelos: 5 A1, A2, A3, A4, A5 y A6
A1
Genotipos:
1: A5A5
A2
A3
A4
A5
A6
2: A3A5
3: A5A5
Cálculo de las frecuencias
Donde: NA1A1+NA1A2+NA2A2 = N
Cálculo de la Frecuencia genotípica
Donde : F(A1A1)+F(A1A2)+F(A2A2) = 1
Frecuencia Alélicas a partir del número de individuos:
Donde:
= p+q=1
p=
Cumple:
q= =
p=1-q
p= = + = F(A1A1) +
q= = + = F(A2A2) +
En la población se cumple
Frecuencia genotípica:
F(A1A1)+F(A1A2)+F(A2A2) = 1
FA1 + FA2 = 1
Ejemplo:
Se estudio el nivel de polimorfismo del gen de la fosfatasa alcalina, se
encontró que existen dos variantes alélicas (A y a) para dicho gen en una
población muestral de 200 individuos, con igual proporción de varones y
mujeres:
A1A1 = 80
A1A2 = 80
A2A2 = 40
Hallar las frecuencias genotípicas y alélicas.
Analicemos
Frecuencia
Genotipos N Frecuencia alélica
genotípica
A1A1 70 0.35 A1(p) 0.6
A1A2 100 0.5 A2(q) 0.4
A2A2 30 0.15
TOTAL 200 1 1
A1A2 A1 A1
A1A2 A1A1
A1A2 = 0,4 A1A2 = 0,4 A2A2 = 0,2 p = 0,6 q = 0,4
Generación 1
Las frecuencias genotípicas de Patagona gigas
A1A1 = 0,4 A1A2 = 0,4 A2A2 = 0,2
A1A2 A1 A1
A1A2 A1A1
A1A2 = 0,4 A1A2 = 0,4 A2A2 = 0,2 p = 0,6 q = 0,4
Generación 2
Las frecuencias genotípicas de Patagona gigas
A1A1 = 0,4 A1A2 = 0,4 A2A2 = 0,2
A1A2 A1 A1
A1A2 A1A1
A1A2 = 0,4 A1A2 = 0,4 A2A2 = 0,2 p = 0,6 q = 0,4
Expresión algebraica
Posa gamética
Sexo Machos Sexo Machos
Hembras p (A1) q (A2) Hembras A1A1 (p2) A1A2 (2pq) A2A2 (q2)
p (A1) p2 (A1A1) pq (A1A2) A1A1 (p2) p4 2p3q p2q2
q (A2) pq (A2A2) q2 (A2A2) A1A2 (2pq) 2p3q 4p2q2 2pq3
A2A2 (q2) p2q2 2pq3 q4
Donde: A1A1 = p2 A1A2 = 2pq A2A2 = q2
1
Frecuencia alélica Frecuencia fenotipica
p q total AA Aa aa total 0.9
0 1 1 0 0 1 1
Frecuencias genotipicas
0.8
0.1 0.9 1 0.01 0.18 0.81 1 0.7
0.2 0.8 1 0.04 0.32 0.64 1 0.6
0.3 0.7 1 0.09 0.42 0.49 1
0.5
0.4 0.6 1 0.16 0.48 0.36 1
0.4
0.5 0.5 1 0.25 0.5 0.25 1
0.6 0.4 1 0.36 0.48 0.16 1 0.3
Una de cada 20000 personas presenta el síndrome de Duchen, tenga en cuenta que el síndrome se
expresa como homocigoto recesivo ¿Cuántos heterocigotos más que homocigotos recesivos habrá?
(la población está en equilibrio).
Normales: 19999/20000
S.Duchen: 1/20000 = 0,00005 = q2 >> q = = 0,0071
P= 1- q = 1- 0,0071 = 0,9929
2pq = 2*0,9929*0,0071 = 0,014
2pq/q2 = 0,014/0,00005 = 280
Para determinar si una población está en equilibrio de H-
W, se utiliza Chi-cuadrado
Se estudio el locus para la fosfatasa alcalina en una población humana compuesta por 1000
individuos, determine si la población se encuentra en equilibrio de H-W para el locus en mención.
Observado Esperado
Frecuecnia
Frecuencia alelos X2
Genotipo N en el N
Genotípica
equilibrio
AA 230 0.23 p q 0.255 255.025 2.456
Aa 550 0.55 0.505 0.495 0.500 499.950 5.011
aa 220 0.22 0.245 245.025 2.556
TOTAL 1000 1 1 1 1000 10.02
X2 tabla(95%, 1) 3.84
Conclusión: Con un nivel de confianza del 95% se concluye que la población humana (Homo sapiens), no se
encuentra en equilibrio de H-W para el locus fosfatasa alcalina.
Alelos múltiples
Individuos: Un par En una población pueden existir más de dos formas
de alelos por locus alélicas por locus
A3 A4 A2 A3
A1 A2 A1 A3 A4 A4
A1, A2 y A3
q2 IBIB
B q 2
+2qr
2qr Ii
B
𝑟 𝑒𝑠𝑡𝑖𝑚𝑎𝑑𝑎 =√ 𝐹𝑟𝑒𝑐𝑢𝑒𝑛𝑐𝑖𝑎 𝑑𝑒 𝑂
2
Corrección de Bernstein (1924)
Ejemplo:
Determinar si la población para el locus ABO se encuentra en
equilibrio de H-W.
A = 30, B = 12, AB = 2 y O = 120
Frecuencia Frecuencias
Frecuencia alelica
Fenotipo N fenotipica Frecuencia alelica D fenotipicas en N esperado X2
corregidas
observadas el equilobrio
A 30 0.18 p 0.101 p 0.101 0.183 30.09 0.0003
B 12 0.07 q 0.042 q 0.042 0.073 12.04 0.0001
AB 2 0.01 r 0.855 0.002 r 0.857 0.008 1.39 0.2728
O 120 0.73 0.735 120.49 0.0020
TOTAL 164 1.00 0.998 1.000 1.000 164.00 0.2752
Saldaña et al (2022)
Frecuencias alélicas para el locus ABO para la
población Arequipeña Genotipo Locus Frecuencias
Frecuencia Población (N)
ABO-Locus Rh (%)
IAIA DD 0.001571 0.157 2173
A A
II Dd 0.000176 0.018 244
A A
II dd 0.000005 0.000 7
A
Ii DD 0.071030 7.103 98216
A
Ii Dd 0.007977 0.798 11030
A
Ii dd 0.000224 0.022 310
B B
II DD 0.000127 0.013 175
IBIB Dd 0.000014 0.001 20
IBIB dd 0.000000 0.000 1
B
Ii DD 0.020182 2.018 27906
B
Ii Dd 0.002266 0.227 3134
Fenotipo
B
Ii dd 0.000064 0.006 88
Frecuencia Frecuencias (%) Población (N)
(Grupo y factor) A B
II DD 0.000893 0.089 1235
A+ 0.080755 8.08 111662 A B
II 0.000100 0.010 139
Dd
A- 0.000229 0.02 317 A B
0.000003 0.000 4
II dd
B+ 0.022589 2.26 31235
ii DD 0.802694 80.269 1109910
B- 0.000064 0.01 89
ii Dd 0.090142 9.014 124642
AB+ 0.000993 0.10 1373
4 ii dd 0.002531 0.253 3499
AB- 0.000003 0.00
0+ 0.892836 89.28 1234552 TOTAL 1 100 1 382 730
0- 0.002531 0.25 3499
TOTAL 1.000000 100 1 382 730 Saldaña et al (2022)
Frecuencias de variantes o subgrupos
DOI 10.1002/bies.201300030
Correlación con enfermedades
Chakrani et al. (2018) describe que las personas del grupo sanguíneo O
tienen más probabilidades de infectarse por Helicobacter pylori y con
predisposición al desarrollo de ulcera péptica.
Mientras que las personas con grupo sanguíneo B y AB tienen menos
probabilidades, esto debido a que las personas de grupo O convierten del
antígeno H tipo 1 en antígeno Leb (sistema de Lewis), la alta expresión de
este antígeno en la mucosa gástrica y duodenal funcionaria como
receptores epiteliales gástricos para Helicobacter pylori.
https://doi.org/10.1038/s41598-018-36006-x
Correlación con enfermedades
• Mayor probabilidad de infectar COVID-19 entre personas con grupo
sanguíneo A
• Las personas con grupo sanguíneo AB parecen relacionar un mayor
riesgo con la gravedad de COVID-19 y muerte
• Mientras tanto, las personas con el grupo sanguíneo O podrían tener
un menor riesgo de gravedad de la COVID-19
• Personas con el grupo sanguíneo B probablemente relacionarían un
menor riesgo con la muerte por COVID-19.
https://doi.org/10.1016/j.meegid.2020.104485
Los linfocitos presentan receptores
asociados a resistencias frente a infecciosas
Solloch U.V. , Lang K. , LangeV. , Böhme I. , Schmidt A.H. , Sauter J. (2017) Frequencies of gene variant CCR5-Δ32 in 87 countries based on next generation sequencing of 1.3 million individuals sampled from
3 national DKMS donor centers. Hum. Immunol., 78: 710-717 https://doi.org/10.1016/j.humimm.2017.10.001
doi:10.1016/j.imlet.2004.09.007
¿Se dará a un incremento en la frecuencia del alelo ∆ 32 en las poblaciones
humanas?
Xu, M. CCR5-Δ32 biology, gene editing, and warnings for the future of CRISPR-Cas9 as a human and humane gene editing tool. Cell
Biosci 10, 48 (2020). https://doi.org/10.1186/s13578-020-00410
Mis estudios científicos me han brindado una
gran satisfacción, y estoy convencido de que no
pasará mucho tiempo antes de que todo el mundo
reconoce los resultados de mi trabajo (Mendel
1822-1884)
GRACIAS