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Familia Parvoviridae
Familia Parvoviridae
La familia Parvoviridae
Susan F. Cotmore • Mavis AgbandjeMcKenna • John A. Chiorini • Dmitry V. Mukha •
David J. Pintel • Jianming Qiu • Maria SoderlundVenermo • Peter Tattersall • Peter Tijssen • Derek Gatherer
• Andrew J. Davison
Recibido: 11 de septiembre de 2013 / Aceptado: 28 de octubre de 2013 / Publicado en línea: 9 de noviembre de 2013
SpringerVerlag Viena 2013
Resumen El Comité Internacional sobre Taxonomía de Virus (ICTV) está Se identificaron 134 nuevos virus y variantes de virus. El
revisando actualmente un conjunto de propuestas para racionalizar y las propuestas introducen nuevas especies y géneros en ambas
ampliar la taxonomía de la familia Parvoviridae. Los virus de esta familia subfamilias, resuelven una especie mal clasificada y mejoran la claridad
infectan a una amplia gama de huéspedes, como lo refleja la antigua taxonómica mediante el empleo de una serie de cambios sistemáticos.
división en dos subfamilias: Parvovirinae, que contiene virus que infectan Estos incluyen identificar un nivel preciso de similitud de secuencia
a huéspedes vertebrados, y Densovirinae, que abarca virus que infectan requerido para que los virus pertenezcan al mismo género y disminuir el
a huéspedes artrópodos. Utilizando una definición modificada para la nivel de similitud de secuencia requerido para que los virus pertenezcan
clasificación en la familia que ya no exige aislamiento siempre que el a la misma especie. Estos pasos facilitarán el reconocimiento de las
contexto biológico sea sólido, pero sí requiere una secuencia de ADN principales ramas filogenéticas dentro de los géneros y eliminarán la
casi completa, confusión causada por la casi identidad de especies y virus. Los cambios
en la nomenclatura de taxones establecerán nombres binomiales
numerados y no latinizados para las especies, indicando la afiliación al
género y el rango de huéspedes en lugar de recapitular los nombres de
Este artículo está relacionado con una propuesta taxonómica en curso, presentada al los virus. Además, se incluirán afijos en los nombres de los géneros para
Comité Internacional sobre Taxonomía de Virus (ICTV) y aún bajo deliberación. Los aclarar la afiliación a las subfamilias y reducir la ambigüedad que resulta
cambios taxonómicos discutidos aquí pueden diferir de cualquier taxonomía nueva
del uso vernáculo de "parvovirus" y "densovirus" para denotar múltiples
que finalmente se apruebe.
niveles de taxones.
SF Cotmore, M. AgbandjeMcKenna, JA Chiorini, DV Mukha, DJ Pintel, J. Qiu, M.
SoderlundVenermo, P. Tattersall y P.
Tijssen son miembros del Grupo de Estudio ICTV Parvoviridae.
M. AgbandjeMcKenna J. Qiu
Departamento de Bioquímica y Biología Molecular, Centro de Biología Estructural, Departamento de Microbiología, Genética Molecular e Inmunología,
McKnight Brain Institute, Facultad de Medicina, Universidad de Florida, Centro Médico de la Universidad de Kansas, Kansas City, KS, EE. UU.
Gainesville, FL, EE. UU.
JA Chiorini M. SöderlundVenermo
Subdivisión de Fisiología Molecular y Terapéutica, Instituto Nacional de Departamento de Virología, Instituto Haartman, Universidad de
Investigación Dental y Craneofacial, Institutos Nacionales de Salud, Bethesda, Helsinki, Helsinki, Finlandia
MD, EE. UU.
P. Tattersall
DV Mukha Departamentos de Medicina de Laboratorio y Genética, Facultad de
Instituto Vavilov de Genética General, Academia Rusa de Medicina de la Universidad de Yale, New Haven, CT, EE. UU.
Ciencias, Gubkin 3, Moscú 119991, Rusia
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Introducción (VP) regiones codificantes y cumplen con las limitaciones de tamaño y patrones
de motivos característicos de la familia''.
Un grupo de revisión que incluye a todos los miembros del Grupo de Estudio Esta definición permite la inclusión de 134 nuevos virus y cepas de virus
de Parvoviridae (SG) del Comité Internacional sobre Taxonomía de Virus en la familia Parvoviridae, junto con 47 de los 53 aislados previamente
(ICTV) ha presentado un conjunto de propuestas para actualizar la taxonomía reconocidos [14]. Seis virus reconocidos para los cuales no hay información de
de la familia Parvoviridae, y actualmente se encuentra bajo revisión. Hasta que secuencia disponible actualmente han sido retirados de la taxonomía formal
se alcance una decisión final sobre ICTV, la propuesta se puede descargar en en espera de un análisis más detallado, pero permanecerán incluidos en
http://talk.ictvonline.org/files/proposals/taxonomy_proposals_vertebra1/ informes posteriores como no asignados en su género actual. Para mejorar la
default.aspx . La taxonomía de esta familia se modificó por última vez en 2004, claridad taxonómica y facilitar la fácil asimilación de los virus candidatos
antes de la publicación del 8º Informe ICTV [13], y ahora está significativamente presentes y futuros, se requiere una reevaluación profunda de la estructura
anticuada. Mientras tanto, se han identificado muchos nuevos virus candidatos taxonómica y
y jerarquías virales previamente insospechadas, a menudo mediante el uso de
enfoques de descubrimiento viral que se basan en la amplificación del ADN También se instituyó la nomenclatura de la familia, lo que condujo al desarrollo
por reacción en cadena de la polimerasa. Desafortunadamente, este enfoque de nuevas directrices sistemáticas. Los cambios propuestos a la taxonomía se
generalmente confunde la caracterización de estructuras secundarias complejas resumen en la Tabla 1. En la subfamilia Parvovirinae, estos cambios incluyen
en los telómeros virales en horquilla que son esenciales para la viabilidad [8, la introducción de tres nuevos géneros y la expansión de cinco nombres de
10], lo que dificulta la recuperación de virus a partir del ADN. Para dar cabida géneros existentes con los afijos ''parvo'' o ''proto''.
a estos nuevos virus importantes, evitando al mismo tiempo la inclusión de
fragmentos de secuencia viral integrados en los genomas del huésped [1, 9] o En la subfamilia Densovirinae, los cambios propuestos incluyen la introducción
datos metagenómicos que carecen de integridad o atribución clara del huésped de dos nuevos géneros de virus del camarón y la expansión de los nombres
(por ejemplo, una secuencia completa del virus similar al densovirus de de género existentes Iteravirus y Densovirus a Iteradensovirus y Ambidensovirus,
Blatella germanica , GenBank JQ320376, con un probable huésped cucaracha respectivamente. En ambas subfamilias, los niveles de identidad de las
identificado en heces de murciélago [7]), el SG desarrolló una definición especies se reducirán, se numerarán, se adoptarán nombres binomiales de
politética de un virus de la familia Parvoviridae. Esto requiere la secuencia especies y se introducirán nuevas especies.
completa de ADN de todas las secuencias codificantes de proteínas virales,
pero ya no requiere absolutamente el aislamiento de un virus viable, siempre
que la estructura y disposición del genoma, la serología u otros datos biológicos
respalden una etiología infecciosa. La definición viral utilizada a lo largo de Cambios en la estructura taxonómica y la nomenclatura.
estas propuestas es: "Para que un agente sea clasificado en la familia
Parvoviridae, se debe considerar que es un parvovirus auténtico sobre la base Criterios de demarcación de taxones
D. Gatherer AJ Davison MRC, menos confiables en las mayores distancias aparentes entre las dos
Centro de Investigación de Virus de la Universidad de Glasgow, subfamilias. Por lo tanto, los cambios taxonómicos propuestos están
Glasgow, Reino Unido respaldados por alineamientos proteicos de las dos proteínas virales principales.
Anteriormente, los géneros se definían en gran medida mediante criterios no
Dirección actual: D.
Gatherer cuantificables, incluido el virus auxiliar.
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Eritrovirus 4 9 Eritroparvovirus 6 12
parvovirus 12 18 Protoparvovirus 5 25
Tetraparvovirusa 6 10
Hepandensovirusa 1 7
Negrita en nombres de género iteravirus 1 1 iteradensovirus 5 6
denota nuevos afijos
a Penstyldensovirusa 1 4
Denota nuevos géneros
b Pefudensovirusb 11
Denota un género retirado
requisitos y características del genoma, que proporcionaron taxón. En la taxonomía existente, la mayoría de estos virus ''ambi
poca estructura taxonómica [13, 14]. Las propuestas actuales sentido'' se agrupan en el género Densovirus, con un
añadir el requisito de que todos los virus de un género deben ser único valor atípico (Periplaneta fuliginosa densovirus) que
monofiléticos y codifican proteínas NS1 que generalmente son infecta a un huésped blattodean y es el único miembro del género
[30 % idénticos entre sí en la secuencia de aminoácidos Pefudensovirus. Recientemente, esta organización fue cuestionada
nivel pero \30 % idéntico a los de otros géneros como por la identificación de cuatro nuevos aislamientos con ambisense
determinado por alineamientos de secuencias por pares. Dentro de organización, que infectan insectos de diferentes huéspedes
subfamilia Parvovirinae, estos criterios funcionan bien para separar órdenes y están estrechamente relacionados, aunque no monofiléticos
todos los géneros actuales y propuestos, con el menor con virus de ambos géneros ambisense existentes.
excepción del género propuesto Erythroparvovirus, donde Para resolver esta situación, se propone que los seis grupos
Es evidente una divergencia marginalmente mayor entre algunos deben combinarse como especies distintas en un solo género
pares de virus. Los ocho géneros resultantes en esta subfamilia son monofilético de Ambidensovirus, que tendrá
bien respaldado por análisis filogénicos, como se ilustra en Criterios de demarcación relajados que probablemente reflejan el país anfitrión.
Fig. 1 y detallado en las propuestas. diáspora. Miembros del género propuesto Ambidensovirus
En la subfamilia Densovirinae, secuencias atribuibles parecen ilustrar cómo la divergencia del anfitrión puede enmascarar y
están disponibles sólo para un pequeño número de personas económicamente complicar la filogenia subyacente basada en secuencias: usar
virus importantes, lo que probablemente refleje mal la enfoques actuales, sería difícil rastrear
naturaleza diversa de los virus que infectan a los huéspedes desde el inmenso linajes virales con reordenamientos genómicos menos notorios en este
filo Artrópodos. En consecuencia, el [30 % de identidad contexto de deriva genética relacionada con el huésped.
El requisito se aplica con menos rigor dentro de esta subfamilia, para Anteriormente, las especies de la familia eran generalmente
permitir la agrupación de virus monofiléticos. debe estar [95 % relacionado en la secuencia de ADN NS1,
con características notoriamente similares de las órdenes de acogida que es un nivel tan alto que muchas especies actuales consisten en
separados por grandes distancias evolutivas. Constitucion aislados únicos. Esto ha alimentado la confusión entre taxones y
Los virus en la mayoría de estos géneros están estrechamente relacionados y virus en la literatura, y permite que el nivel de especie
infectan artrópodos del mismo orden de hospedadores. Sin embargo, en contribuyen poco a la estructura taxonómica. Las propuestas
género propuesto Ambidensovirus, ciertos pares de virus que infectan Disminuir significativamente los criterios de identidad de especies, requiriendo
diferentes órdenes de huéspedes no alcanzan el nivel virus en una especie para codificar proteínas NS1 que muestran
requisitos de identidad propuestos. Sin embargo, todos estos [85 % de identidad de secuencia de aminoácidos mientras diverge por
Los virus exhiben un reordenamiento genómico complejo que [15 % de virus de otras especies. Este ajuste
les permite coordinar la transcripción bidireccional, Permite que una especie contenga una mayor diversidad de virus.
que no se observa en virus de ningún otro parvovirus que es el caso actualmente, por lo que normalmente designa un
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Fig. 1 Árbol filogenético que muestra los géneros de la familia Parvoviridae. (http://www.chemcomp.com). Se construyeron matrices de distancia p por pares a
Análisis filogenético basado en la secuencia de aminoácidos de la proteína iniciadora partir de esta alineación utilizando MEGA versión 5.10 [12].
de la replicación viral, NS1, que contiene un AAA conservado. dominio helicasa Los árboles bayesianos se calcularon en mil millones de iteraciones utilizando
correspondiente al dominio Parvo_NS1 Pfam: http://pfam.sanger.ac.uk/family/ BEAST [5], utilizando un modelo de especiación de Yule y un reloj molecular
Parvo_NS1. Esta región se alineó incorporando conocimientos de biología estructural relajado exponencial [4]. Los árboles se visualizaron en FigTree (parte de BEAST)
utilizando la aplicación ehmmalign en EMBASSY [6], y las secuencias que flanquean en formato ultramétrico en una escala arbitraria, con raíces en el punto medio y con
el dominio Pfam se alinearon utilizando la modificación del método de alineación puntuaciones de probabilidad posteriores indicadas en nodos estadísticamente
local NeedlemanWunsch [11] implementado en MOEAlign. significativos. Las letras en negrita en los nombres de género indican los afijos
utilizados para ampliar los nombres existentes. Los asteriscos indican los nombres de nuevos géneros
rama filogenética distinta y, por lo tanto, agrega una estructura útil dentro La identidad de este taxón efectivamente elimina las divisiones de
del género. Todavía se consideran otros criterios existentes, como el especies actuales. La convocatoria de nuevos nombres que abarquen
huésped, las propiedades antigénicas y las características del genoma. grupos más amplios de virus brinda una oportunidad para que el campo
adopte un sistema binomial no latinizado que se ha discutido ampliamente
Las dos subfamilias, Parvovirinae y Densovirinae, se distinguen en la literatura [15, 16] y se usa comúnmente en otras familias virales. En
principalmente por su capacidad respectiva para infectar huéspedes la nomenclatura propuesta, los nombres de las especies son enfáticamente
vertebrados y artrópodos, y este sigue siendo el caso en las propuestas. diferentes de los nombres de los virus y típicamente consisten en un
Esta separación está respaldada por la filogenia bayesiana, aunque no taxón huésped, una afiliación de género y un sufijo numérico o alfabético
es inmediatamente evidente en el procedimiento de enraizamiento distintivo, por ejemplo, Protoparvovirus de roedor 1 (especie tipo del
utilizado en la Fig. 1. género Protoparvovirus, que incluye ambos). la especie tipo existente, el
virus Minute de ratones, y un grupo de virus de roedores estrechamente
Nomenclatura de taxones relacionados, como se detalla en la Tabla 2). Dado que estos nombres
indican la variedad de virus incluidos y su rama dentro de la familia,
Se proponen cambios sistemáticos a nivel de especie, en parte porque proporcionan información útil.
se reduce el nivel obligatorio de secuencia
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Amdoparvovirus Amdoparvovirus carnívoro 1 Virus de la enfermedad del visón aleutiano AMDV JN040434
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Tabla 2 continuación
Dependeroparvovirus pinnípedo 1 Virus adenoasociado del león marino de California CslAAV JN420372
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Tabla 2 continuación
La especie tipo de cada género se indica en negrita. Virus de la especie actual Virus adenoasociado canino, Adenoasociado equino
El virus adenoasociado ovino, el parvovirus HB, el parvovirus lapino y el parvovirus RT no cumplen los nuevos criterios de inclusión en el
familia. Los virus de la especie actual El parvovirus del pollo se transfiere del género Protoparvovirus al nuevo género Aveparvovirus en la nueva
especie Aveparvovirus galliforme 1
sobre las probables propiedades del virus y permitir una fácil Dependovirus y Erythrovirus son géneros dentro del mismo
adición de nuevas especies simplemente avanzando el número subfamilia de la familia Parvoviridae, y que Iteravirus es
sufijo, como en el protoparvovirus 2 de roedores, que actualmente un género de la subfamilia Densovirinae. Esta dislocación
contiene un solo virus, el parvovirus de rata 1. Además, se solucionará añadiendo los infijos ''parvo'' o ''denso''
porque las especies propuestas distinguen ramas principales para indicar afiliación a subfamilia, como en los géneros Amdoparvovirus,
dentro de cada género, proporcionarán nombres taxonómicos para Bocaparvovirus, Dependoparvovirus, Erythroparvovirus e Iteradensovirus.
grupos de virus que ahora se discuten comúnmente juntos en la literatura. Un género restante
Las únicas excepciones a esta norma en la subfamilia Densovirinae, Brevidensovirus, ya
El patrón de denominación involucra dos especies del género contiene el infijo y los nombres propuestos para todos los nuevos géneros
Dependoparvovirus, que contienen virus que muestran un excelente incluirá la notación apropiada. Se espera que esto
potencial para uso clínico como terapia génica. La modificación mejorará el reconocimiento familiar, proporcionando así
vectores. Los virus de una especie se denominan "virus adenoasociados" información sobre las propiedades generales de un virus.
más un número con guión entre 1 y 4 o en cualquier género dado a personas fuera del campo, y lo hará
613, con aislamientos individuales que muestran diferencias importantes obviar la necesidad de explicar la taxonomía siempre que los virus
en la unión al receptor y la transducción específica de tejido. Se comparan diferentes géneros de parvovirus. Prácticamente,
eficiencia. Debido a que los nombres de estos virus son tan bien Se estaba volviendo un desafío inventar nombres para nuevos géneros,
reconocidos tanto dentro como fuera del campo, y porque su ya que estos comúnmente parecían sugerir afiliación a un
números específicos tienen implicaciones tan importantes, el SG diferente familia de virus. Por ejemplo, una propuesta previamente
consideró imprudente introducir taxones hospedantes o nombre del género Partetravirus, que se utiliza ampliamente en
números en el nombre de la especie. En consecuencia, la propuesta campo para abarcar virus relacionados con el parvovirus humano 4
El nombre de esta especie es Dependenciavirus A adenoasociado (en (PARV4, GenBank AY622943), no fue bien recibido por el
lugar del más sistemático Dependenciaoparvovirus 1 de primates). Se ICTV porque podría decirse que sugirió que estos virus eran
nombra una segunda especie de este género. miembros de la familia Alphatetraviridae. En la corriente
Dependeroparvovirus B adenoasociado e incluye uno propuestas, volvemos a buscar el reconocimiento para este grupo de
virus, virus adenoasociado5, que también es de actualidad virus, pero bajo el nombre de género Tetraparvovirus, ya que
Interés para aplicaciones de terapia génica. el infijo debería limitar sustancialmente la ambigüedad.
En general, albergan descriptores de taxones a nivel de orden, Aunque las afiliaciones de subfamilias de virus en las existentes
en lugar de familia, se seleccionan para que los nombres de las especies Los géneros Parvovirus y Densovirus son explícitos y vernáculos.
acomodar la posible disparidad en el rango de huéspedes entre los virus. El uso de "parvovirus" y "densovirus" es ambiguo.
Sin embargo, cuando dichos nombres de host se consideraban confusos porque los términos indican múltiples taxones. Así, "parvovirus" puede
o difíciles de pronunciar, se utilizaban términos menos rígidos. referirse a miembros del género Parvovirus, el
preferido, como en el uso de ''pinnípedos'' (mamíferos con patas subfamilia Parvovirinae, o la familia Parvoviridae, mientras que
incluyendo morsas, focas y leones marinos) en lugar de "carnívoro" para ''densovirus'' puede indicar afiliación a un género o subfamilia.
los virus del león marino de California, y "ungulate" (animales con Para proporcionar una mayor precisión taxonómica, las propuestas también
pezuñas) en lugar de "artiodáctilo" para los virus inserte el prefijo ''Proto'' antes de Parvovirus, creando el
de vacas, cerdos y ovejas. nombre del género Protoparvovirus (del griego, "proto" que significa
Las propuestas también amplían los nombres de la mayoría de los existentes. "primero", en este caso los primeros virus identificados), y
géneros introduciendo un afijo en cada nombre. Dos distintos ''Ambi'' antes de Densovirus, creando el nombre del género Am
Los problemas se abordan de esta manera. Primero, se requiere bidensovirus (del latín o celta, que significa ''ambos'',
conocimiento especializado para reconocer que Amdovirus, Bocavirus, refiriéndose a la transcripción ambisentido). En general, estos
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Los cambios deberían proporcionar al campo un marco más Copiparvovirus, un siglum para vaca y cerdo, que fueron los
autoexplicativo y una mayor precisión al utilizar términos derivados huéspedes de las dos primeras especies identificadas, y
taxonómicamente. Tetraparvovirus, del nombre del virus fundador, parvovirus humano
Las listas de taxones y virus para la clasificación propuesta son 4 (PARV4), utilizando el latín ''tetra'' en lugar del número 4.
se muestra en las Tablas 2 y 3. En la subfamilia Parvovirinae, En la subfamilia Densovirinae, se proponen dos nuevos géneros
Hay tres nuevos géneros, que se denominarán Aveparvovirus, para para dar cabida a los virus del camarón. estos lo harán
indicar las aves (Aves) huéspedes de los miembros fundadores, llamarse Hepandensovirus, para reflejar el nombre original de
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Penstyldensovirus. Debido a que estos nombres y abreviaturas no Linden RM, Muzyczka N, Parrish CR, Tijssen P (2005) Familia Parvoviridae.
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