Genoma Viral

Genoma Viral: Dr.
Francisco Álvarez-Nava, Carrera de Ciencias Biológicas, Universidad Central del Ecuador
REPÚBLICA DEL ECUADOR

UNIVERSIDAD CENTRAL DEL ECUADOR
FACULTAD DE CIENCIAS BIOLÓGICAS
CARRERA DE BIOLOGÍA
ASIGNATURA: GENÉTICA I y GENÉTICA II
DOCENTE RESPONSABLE: Dr. FRANCISCO ÁLVAREZ-NAVA
GENOMA VIRAL
DEFINICIÓN DE VIRUS
Un virus es un agente infeccioso de tamaño pequeño y composición simple que solo se puede
multiplicarse en células que se dividen de animales, plantas, bacterias o arqueas. Ellos varían en
tamaño desde 20 a 400 nanómetros de diámetro. A diferencia de las bacterias (las cuales son
100 veces más grandes), los virus no pueden ser visualizados por microscopía de luz, con la
excepción de algunos viriones grandes de la familia poxvirus.
Se describe una gran variedad de estructuras genómicas entre las especies virales. Los virus,
como grupo, contienen mayor diversidad genética que las bacterias, arqueas, plantas y
animales. Se conoce de la existencia de millones de diferentes tipos de virus, aunque solamente
se han descrito en detalles aproximadamente 5.000 especies de virus.
Existe una gran controversia en la definición de virus como una forma de vida. Para algunos, los
virus no se pueden considerar como seres vivos sino estructuras orgánicas que interactúan con
organismos vivos ya que son organismos simples acelulares que carecen de un sistema
generador de energía y poseen capacidades biosintéticas muy limitadas. Sin embargo, otros
afirman que son una forma de vida ya que ellos, desde el punto de vista genético, tienen muchas
características en común con las células como lo son 1) se reproducen al crear múltiples copias
de ellos mismos a través de auto-ensamblaje, 2) la expresión del genoma viral puede ser
regulada, 3) presencia de genes, los cuales están 4) sujetos a mutaciones, y 5) el genoma de
diferentes virus pueden recombinarse para formar una nueva progenie, y por lo tanto, estar 6)
sujetos a selección natural. Estas tres últimas características, diferencian a los virus del
crecimiento autónomo de los cristales. En contraposición de todo esto, y a pesar que los virus
poseen genes, ellos son acelulares, siendo la célula la unidad básica de la vida. Además, los
virus carecen de su propio metabolismo y requieren obligatoriamente de una célula hospedera
para replicarse. A pesar que organismos como ricketssia y chlamydia, son parásitos obligatorios
como los virus, estas bacterias son consideradas como seres vivos ya que usan la división
Guía elaborada por el Dr. Francisco Álvarez-Nava, Asignatura Genética II, Carrera Ciencias Biológicas y
Ambientales, Facultad de Ciencias Médicas, Universidad Central de Ecuador 1
Genoma Viral: Dr. Francisco Álvarez-Nava, Carrera de Ciencias Biológicas, Universidad Central del Ecuador
celular para reproducirse, a diferencia de los virus que espontáneamente se ensamblan dentro
de las células.
ESTRUCTURA DE UN VIRUS
Un virión es la partícula viral completa por lo que constituye la forma infecciosa de un virus y
consiste en dos estructuras básicas: 1) un núcleo interno compuesto de una molécula mono o
bicatenario, lineal o circular de ácido nucleico (RNA o DNA) llamado core el cual es rodeada por
2) una cubierta externa de naturaleza proteica, conocida como cápside. El cápside está formado
por subunidades polipeptídicas idénticas conocidas como capsómero. Estas subunidades
proteicas son codificadas por el genoma viral y la forma que adoptan sirvió inicialmente para la
clasificación de los virus. Estas proteínas estructurales virales se auto-ensamblan para formar el
cápside y requieren, en general, la presencia del genoma viral para su ensamblaje. Se conoce
como nucleoproteínas a los péptidos virales asociados con el ácido nucleico viral, y a la
asociación de los péptidos del cápside con el ácido nucleico se le conoce como nucleocápside.
La cubierta del virión o cápside protege el contenido de su interior lo cual incluye el genoma viral
y algunas proteínas necesarias para la replicación y supervivencia del virus, por lo que el
cápside proporciona protección al ácido nucleico y puede contener enzimas que le permiten al
virus entrar en la célula hospedera apropiada. De este modo, mientras que la cápside le
proporciona especificidad al virus, el core le confiere infectividad. Algunos virus poseen una
tercera estructura externa de naturaleza bilipídica que rodea y envuelve al cápside cuando el
virus deja la célula parasitada. Esta envoltura es conocida como envoltura viral o vírica. La
envoltura vírica es una forma modificada de membrana celular, la cual puede provenir de la
membrana celular externa de la célula hospedera infectada o de membranas celulares internas
como lo son la membrana nuclear o la del retículo endoplásmico. Esta membrana bilipídica viral
está incrustada de proteínas codificadas por el genoma viral y también por el genoma de la
célula hospedera. Sin embargo, la membrana bilipídica y los carbohidratos asociados presentes,
se originan enteramente de la célula hospedera. Después que el virión se une a la superficie de
la célula específica, su ácido nucleico (RNA o DNA, mono- o bicatenario) es inyectado al interior
de la célula hospedera. Una vez que el genoma viral está en el interior de la célula, se produce
la replicación del genoma viral, que trae como consecuencia la diseminación de la partícula viral
a otras células hospederas. En algunos virus, la cápside está rodeada externamente por una
envoltura de naturaleza lipídica.
Se conoce como viroide al agente infeccioso que, al igual que los virus, tienen tanto un ciclo
intracelular en el cual causa infección al huésped susceptible como un ciclo extracelular donde el
viroide no posee actividad metabólica. El viroide se caracteriza por estar constituidos por una
cadena cíclica corta de RNA, circular o con forma de varilla el cual no codifica proteínas. El
viroide no posee proteínas ni lípidos como es el caso de los virus, por lo que se considera al
viroide como una etapa primitiva del virus. De esta manera, el viroide tiene la misma estructura
genómica, es decir, RNA desnudo, tanto su forma intracelular como extracelular.
Estructura de los Virus
Como se dijo anteriormente, el cápside está formado por subunidades proteicas idénticas
llamadas cápsomeros. El cápside es hecho de proteínas codificadas por el genoma viral y su
forma sirve de base para clasificar a los virus. Las subunidades proteicas codificadas por el
genoma viral se ensamblan por sí misma para formar el cápside, pero, aparentemente, es
necesario, la presencia del genoma viral para su ensamblaje. Los virus complejos codifican
proteínas que permiten la construcción de su propia cápside. Estas proteínas asociadas a los
ácidos nucleicos son conocidas como nucleoproteínas y su asociación con el cápside viral se
conoce como nucleocápside.
La cantidad y el arreglo de las proteínas y el ácido nucleico del virus determinan su tamaño y
forma. Cuando las proteínas y el ácido nucleico constituyente se ensamblan, determina el
tamaño y la forma del virus para cada clase específica.
MODO DE DISEMINACIÓN DE LOS VIRUS

Los virus pueden propagarse de diferentes maneras dependiendo del tipo de virus y del
organismo que infecta. Por ejemplo, la transmisión de un virus de una planta a otra planta es
llevada a cabo por insectos que se alimentan de la savia de la planta (fitófagos), tales como
áfides. De una manera similar, entre animales, los virus pueden ser diseminados por insectos
que succionan sangre (hematófagos). Estos organismos, transmisores de virus, se les
denominan vectores. Por su parte, el virus de la influenza se propaga a través de gotitas de
saliva excretada por el estornudo y la tos. Por su parte, los virus que se producen enfermedad
gastrointestinal como los Norovirus y Rotavirus, son transmitidos por vía fecal-oral y son
pasados por contacto de persona a persona a través del agua y alimentos. Otra vía de
transmisión de los virus es el contacto sexual y la exposición directa a sangre infectada (por ej.,
transfusión sanguínea).
ESTRUCTURA DEL VIRUS DE INMUNODEFICIENCIA HUMANA
Ciclo del Virus dentro de la Célula Hospedera
CLASIFICACIÓN DE LOS VIRUS

Los virus fueron inicialmente clasificados por la morfología del cápside que contiene al genoma
viral. De esta manera, hay dos clases de virus: a) bastones o filamentos, llamados así debido a
la disposición lineal o helicoidal del ácido nucleico y las subunidades proteicas por lo que el
cápside es un cilindro desnudo (le falta la envoltura lipídica); y b) esferoidales, es decir,
icosaédrico, porque el cápside tiene 20 caras triangulares con unidades dispuestas regularmente
llamadas capsómeros en cuyo interior está el ácido nucleico densamente enrollado. Otros virus
tienen una cápside que posee un número irregular de evaginaciones, en cuyo interior, el ácido
nucleico está laxamente enrollado. La mayoría de los virus que infectan a las plantas son
filamentosos o poligonales. Los bacteriófagos, son virus grandes y complejos que poseen DNA
bicatenario y combina la forma filamentosa y poligonal. El clásico bacteriófago T4 está
compuesto por una cabeza poligonal, la cual contiene su genoma, y un tallo filamentoso de
grandes fibras.
Sin embargo, existe un consenso en clasificar a los virus por su morfología en cuatro diferentes
tipos
1. Virus Helicoidales
Estos virus están compuestos de un solo tipo de cápsomero apilado alrededor de un eje
central para formar una estructura helicoidal, la cual puede tener una cavidad central o tubo.
Esta disposición le confiere al virus una forma de bastón filamentoso y pueden ser muy
pequeños y rígidos, o por el contrario, largos y muy flexibles. El ácido nucleico de la partícula
viral se una a la hélice de proteína por interacciones entre el ácido nucleico cargado
negativamente y las cargas positivas de la proteína. De esta manera, la longitud del cápside
helicoidal, y en consecuencia, la del virus que carece de envoltura vírica, está relacionada con la
longitud del ácido nucleico que la contiene y su diámetro depende del tamaño y la disposición de
los cápsomeros. El virus del mosaico del tabaco es un ejemplo de virus helicoidales.
2. Virus Icosaédricos
Los virus icosaédricos o casi-esféricos están formados por 20 caras triangulares, 30 aristas y
12 vértices; dando origen a un icosaedro regular y dejando un hueco central donde se sitúa el
ácido nucleico. La mayoría de los virus que infectan a los anímales son icosaédricos.
3. Virus Encapsulados o Envueltos

Son los virus que poseen una tercera estructura compuesta de una membrana bilipídica con
incrustaciones de proteínas y carbohidratos (previamente descrita). La mayoría de los virus
encapsulados son dependientes de esta envoltura para su infectividad. El virus de la influenza y
el HIV usan esta estrategia.
4. Virus Complejos
Este tipo de virus no puede ser clasificados como helicoidales o icosaédricos y pueden
poseer estructuras extras como tallo proteicos o una pared compleja. El bacteriófago T4 es un
ejemplo de este tipo de virus presentando una cabeza icosaédrica unida a un tallo helicoidal.
Esta estructura filamentosa actúa como una inyectadora molecular que se une a la membrana
celular de la célula hospedera y luego inyecta el genoma viral al interior de la célula.
5. Prolate
Se trata de un icosaedro alargado a lo largo del eje y es una disposición común de las
cabezas de los bacteriófagos. Esta estructura se compone de un cilindro con una tapa en cada
extremo.
Los virus también pueden ser clasificados según su genoma como

1. Ácido Nucleico: a) Virus de DNA y b) Virus de RNA.
2. Forma del Ácido Nucleico: a) Lineal; b) Circular; y c) Segmentado.
3. Números de Cadenas del Ácido Nucleico: a) Monocatenario; b) Bicatenario; c) Mixto.
GENOMA VIRAL
Se define genoma a la información genética completa contenida en el DNA o como en el caso de
algunos virus, en el RNA, de un organismo. El genoma incluye tanto los genes como las
secuencias no codificantes. Por lo que se puede definir al genoma viral como el complemento
genético completo contenido en una molécula mono o bicatenaria, lineal o circular de DNA o
RNA en un virus.
Un virus puede tener genes de DNA o de RNA. La gran mayoría de los virus tienen genoma de
RNA. Los virus que infectan a las plantas son en su mayoría RNA monocatenarios. Por otra
parte, los bacteriófagos o fagos (virus que infectan a bacterias) por lo general tienen genomas de
DNA de doble cadena o bicaternarios. Entre los virus de RNA y ciertos virus de DNA, el genoma
a menudo está dividido en partes separadas, por lo que son llamados virus con genomas
segmentados. Para los virus de RNA, cada segmento codifica para una sola proteína y ellos
usualmente son encontrados juntos con sus cápsides. Sin embargo, no se requieren todos los
segmentos en el mismo virus para ser infeccioso.
ESTRUCTURA DE LOS VIRUS
El genoma viral, independiente del tipo de ácido nucleico, es mono o bicatenario. Debido a esto,
se les denota como ssRNA o ssDNA por las siglas en ingles de single-stranded y dsRNA o
dsDNA por las siglas en ingles de double-stranded. El genoma viral monocatenario consiste de
una molécula desapareada de ácido nucleico parecido a la mitad de una escalera de caracol.
Por el contrario, los genomas virales bicatenarios consisten de dos moléculas de ácidos
nucleicos apareadas y complementarias. Sin embargo, existen virus como algunos
pertenecientes a la familia Hepadnviridiae, que contiene un genoma que es parcialmente mono y
bicatenario.
Aunque a los virus se les han agrupado por el tipo de ácido nucleico que contiene su genoma, y
de acuerdo si el ácido nucleico es monocatenario (una sola cadena) o bicatenario (de dos
cadenas), más recientemente, se han clasificado a los virus según el análisis molecular de los
ciclos replicativos del virus (clasificación de Baltimore) por lo que existen 7 grupos.
CLASE I
Son virus de DNA de doble cadena (dsDNA) y son subdivididos a su vez en dos grupos: a) de
replicación exclusivamente nuclear por lo que son dependiente en gran medida del celular de la
célula hospedera; b) de replicación citoplasmática los cuales poseen enzimas necesarias para la
transcripción y replicación de sus genomas (p. ej., RNA polimerasa dependiente de DNA) siendo
independientes del ciclo celular de la célula hospedera.
CLASIFICACIÓN DE LOS VIRUS SEGÚN LA EXPRESIÓN DEL MATERIAL GENÉTICO
CLASE II
Son virus de DNA de una cadena (ssDNA) cuya replicación ocurre estrictamente en el núcleo,
por lo que es necesaria la formación de una doble cadena de DNA intermediaria, que sirve como
templete para la síntesis del nuevo ssDNA
CLASE III
Estos virus son RNA de cadena doble (dsRNA) segmentado. Cada segmento es transcripto
separadamente para producir mRNAs monocistrónicos individuales.
CLASE IV
Son virus de RNA de una sola cadena con polaridad positiva (ssRNA +) los cuales son
subdivididos en dos grupos: los que producen mRNAs monocistrónicos subgenómicos, unidos
en su extremo 3’y los que producen mRNAs policistrónicos: Polaridad positiva (+) significa que el
genoma de RNA forma el mRNA por lo que es traducido directamente a una polipéptido.
Posteriormente, el polipétido es hidrolizado para formar las proteínas maduras.
CLASE V
Estos virus son RNA monocatenario de polaridad negativa (ssRNA -) y son agrupados de
acuerdo a si tienen o no el genoma segmentado. En el primer grupo, la replicación comienza con
la transcripción del genoma ssRNA- por acción de la RNA polimerasa dependiente de RNA,
asociada al virión. Esta enzima produce un ssRNA+, es decir, un mRNA monocistrónico, que
sirve como molde para la replicación del genoma. De forma similar, en el segundo grupo
(genoma no segmentado), la RNA polimerasa viral transcribe un mRNA monocistrónico de la
misma longitud del genoma viral.
CLASE VI
Son virus de RNA simple de polaridad positiva (ssRNA+) que utilizan una forma intermediaria de
DNA para su replicación. A pesar de tener polaridad positiva no puede actuar directamente como
mRNA, sino que se tiene que transcribir a DNA por acción de la enzima viral transcriptasa
reversa. Son los llamados retrovirus.
CLASE VII
Son virus de DNA doble cadena (dsDNA), circular e incompleto que utiliza una forma
intermediaria de RNA. Cuando uno de estos virus infecta a una célula, es necesario que la
cadena de DNA incompleta sea polimerizada para que ocurra la transcripción, pero a diferencia
de los virus de la Clase VI, y a pesar de utilizar la transcriptasa reversa, la transcripción solo se
produce en la partícula viral durante la maduración.
CLASIFICACIÓN DE LOS VIRUS SEGÚN LA EXPRESIÓN DEL MATERIAL GENÉTICO
http://www.twiv.tv/viral-genomes/
ESQUEMA REPRESENTATIVO DE LA CLASIFICACIÓN DE LOS VIRUS SEGÚN LA

EXPRESIÓN DEL MATERIAL GENÉTICO
Flecha verde = síntesis de un ARNm; flecha verde punteada = uso directo del genoma viral como un ARNm. Imagen
modificada de "La clasificación de grupos de virus de Baltimore en familias depende de su tipo de genoma, por
ViralZone/Swiss Institute of Bioinformatics, CC BY-NC 4.0.

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