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CRECIMIENTO
MICROBIANO
MICROBIOLOGIA GENERAL
CONDICIONES OPTIMAS PARA EL
DESARROLLO MICROBIANO
• FACTORES NUTRICIONALES
Disponibilidad y Cantidad suficiente de:
- Macro y Micronutrientes
- Factores de Crecimiento
• CONDICIONES AMBIENTALES
- Temperatura
- Agua Disponible
- pH
- Oxígeno
Procesos de Control de
Crecimiento
• AGUA (Depuración – Potabilización)
- Filtración
- Cloración
• ALIMENTOS (Prevenir ETAs)
- Pasteurización
- Refrigeración
• PROCESOS
- Esterilización - Tindalización
- Desinfección
ESTERILIZACIÓN
• Proceso cuyo objetivo es la eliminación o
muerte de todo organismo vivo que contiene
un objeto o sustancia
APLICACIÓN
-Prevenir transmisión de enfermedades
- Evitar deterioro de alimentos y materiales
- Evitar contaminación en procesos
- Acondicionar materiales de laboratorio
- Preparar medios de cultivos
-Descontaminar material utilizado
Cinética de muerte
Log. Sobrevivientes / ml
Sobrevivientes/ ml
!"#$%&'
Nt = No e -kt
TIEMPO DE REDUCCIÓN DECIMAL (D)
Curva de Supervivencia
reducir la población
log Nº sobrevivientes
7
6
microbiana un 90% (o 5
un orden de magnitud) 4
3
a una condición dada 2
1
de tratamiento 0
0 D20 40 60 80
Tiempo (min)
t - to -1
D= D = ————
log No- log N pendiente
FACTORES QUE AFECTAN AL
PROCESO DE ESTERILIZACIÓN
RESISTENCIA
üEndosporas bacterianas +
üMycobacteria
üVirus sin envoltura lipídica
üHongos
üBacterias _
üVirus con envoltura lipídica
Factores que afectan al proceso de
esterilización
• Factores inherentes al microorganismo
- Tipo, esporulación, Gram, cápsula
- Estado fisiológico
Factores ambientales que actúan durante el
crecimiento del microorganismo
- Medio de cultivo
- Temperatura de incubación
• Factores que actúan durante la aplicación
del agente letal
- Número de microorganismos
- Tiempo de exposición al agente letal
Efecto del N° de microorganismos y del
tiempo de exposición
log Nº sobrevivientes
7
6
5
4
3
2
1
0
0 20 40 60 80
Tiempo (min)
Factores que actúan durante la aplicación del
agente letal
- Número de microorganismos
- Temperatura
VALOR Z
Cambio de temperatura necesario para reducir 10
veces (una unidad logarítmica) el valor D
2,5
T2-T1 2
Z=
log D2-log D1 1,5
log D
1
0,5
Z
Z = 20ºC 0
Tratamiento de 100 min a 90 100 110 120 130 140
a 120ºC
- Número de microorganismos
- Tiempo de exposición al agente letal
- Efecto de la concentración del agente de control
- Temperatura
- Matriz
- Consistencia
- Composición: proteínas, lípidos, materia orgánica
- Humedad
- pH
Modo de acción de los agentes de
esterilización
• Alteración de la permeabilidad y/o
ruptura de la membrana
citoplasmática
MECANISMOS DE ACCIÓN
• Desnaturalización de proteínas
• Destrucción de ácidos nucleicos
Autoclave
• El vapor de
agua saturado
y sometido a
presión
proporciona
temperaturas
superiores a las
que se obtienen
por ebullición.
Ø Indicadores
Físicos (temperatura – presión)
Químicos
Biológicos: Geobacillus stearothermophilus
USOS
- Materiales termoestables (soluciones acuosas)
- Desechos biológicos
VENTAJAS
- Esterilización en tiempos breves
- No deja residuos tóxicos
- Económico
INCONVENIENTES
- No se puede aplicar para sustancias termolábiles
- Corrosión de instrumentos metálicos
La presencia de materia orgánica
extraña reduce notablemente la eficacia
de los agentes antimicrobianos :
USOS
- Sustancias que no soportan altas presiones y temp
superiores a 100°C.
ESTERILIZACIÓN POR CALOR SECO
(Aire caliente)
MECANISMOS DE ACCIÓN
- Procesos de oxidación molecular
CONDICIONES DE PROCESO
- Equipo: Hornos (con o sin circulación forzada de aire)
VENTAJAS
- Esterilización de sustancias en polvo y no acuosas
- No es corrosivo para metales
INCONVENIENTES
- No se puede aplicar para sustancias termolábiles
- Requiere mayor tiempo de exposición que el calor
húmedo por el menor coeficiente de transferencia
calórica del aire con respecto al vapor de agua.
OTROS PROCESOS
TERMICOS
Mecanismo de acción
• Blanco: DNA à Dímeros de timina
Usos:
• Desinfección de superficies, aire y agua
FILTRACIÓN
• Proceso que consiste en pasar una mezcla de
fluido y partículas a través de un medio poroso
que retiene los solidos en su superficie, en su
matriz o en ambos
• Microorganismos retenidos (“ELIMINACIÓN”):
- efecto tamiz
- efecto adsorción por interacción electrostática
• Indicador biológico
Pseudomonas diminuta ATCC 19146 (0.2 µm)
Protege la
muestra, no al
operador
Cabina de Seguridad Biológica Clase II
(con Flujo Laminar Vertical)
Salida de aire
Protege la
muestra, el
operador y el
Entrada de medio
aire ambiente
AGENTES DE ESTERILIZACIÓN
ØAGENTES QUÍMICOS
“desinfectantes de alto nivel”
- Inconveniente: Irritante
Bactericida
Bacteriolítico
Conceptos Básicos
La Microbiología es la Ciencia que estudia la biología de
los microorganismos o microbios.
10 μm
1 μm
Subdivisiones de la Microbiología
´ Microbiología básica. Estudia la naturaleza y
propiedades de los microorganismos: morfología,
fisiología, bioquímica, genética, ecología y taxonomía.
6. Utilizan ATP
Características diferenciales procariotas-eucariotas
Propiedades Bacteria/Archaea Eukarya
(procariotas) (eucariotas)
Bacterias, Algas, Hongos, Plantas,
Grupos Arqueobacterias Animales, Protozoarios
Número de cromosomas 1
>1
DNA Molécula única (no forma Presente en cromosomas
complejos con histonas)
Mitosis y meiosis Ausente Presente
Virus
No celular * Viroides
Priones
Arqueobacteria Bacteria
Halobacterium salinarum Bacillus anthracis
Bacterias
Clasificación según morfología celular
Ribosomas: Similares a los de la célula eucariota aunque de menor tamaño. Intervienen en la síntesis
de proteínas.
Cromosoma bacteriano: Está formado por una sola molécula de ADN de doble hélice, circular y no
asociado a histonas.
Plásmidos: Moléculas de ADN extracromosómico también circular.
Inclusiones: Depósitos de sustancias de reserva.
Flagelos: Estructuras filamentosas con función motriz formados por fibrillas proteicas
Fimbrias adhesivas: Pelos de 4 a 7 nm de diámetro (según especie) repartidas por toda la superficie, permiten
la adhesión a sustratos vivos o inertes.
Pelos sexuales o Pili: Son más largos y más gruesos (unos 10 nm de diámetro) que las fimbrias
adhesivas. Aparecen en menor número (de 1 a 10 por célula) y su función es la de permitir los
contactos iniciales en la conjugación.
Cápsula
En numerosas bacterias se forma en
la parte externa de la pared una
cápsula viscosa compuesta por
sustancias glucídicas.
Cadena
tetrapeptídica
Pared celular GRAM POSITIVAS
En las Bacterias Gram-positivas, la pared celular tiene como base química
fundamental el PEPTIDOGLUCANO el que junto al resto de sus
componentes forman una malla especial llamada sáculo de mureína, de vital
importancia para conservar la forma y darle rigidez a la célula bacteriana.
Pared celular
Gram (-)
PG + ME
+
EP
penicilina
Funciones de la pared celular
´ Rigidez y resistencia osmótica (mantener la forma,
evitar la lisis).
Clostridium perfringens
(Gram positivas)
Gram + (violeta) Gram – (rosa)
Capa de peptidoglucano Gruesa (capas múltiples) Delgada (pocas capa)
Ácidos teicoicos Presentes en muchas Ausente
Espacio periplasmático Ausente Presente
Membrana externa Ausente Presente
Contenido de LPS Prácticamente nulo Elevado
Lípidos y lipoproteínas Reducido Elevado (m. externa)
Resistencia a destrucción Elevada Reducida
física
Ruptura por lisozima - Elevada Reducida
penicilina
Inhibición por colorantes y Elevada Reducida
detergentes
Resistencia a la desecación Elevada Reducida
Otra tinción diferencial de pared celular: Tinción ácido-
alcohol resistente (BAAR)
´ Micobacterias: bacterias gram positivas con
paredes con alto contenido lipídico (ceras-
ácidos micólicos)
´ Mycobacterium tuberculosis; M. leprae
a) Colorante rojo-carbolfucsina + calor suave
b) ácido-alcohol
c) azul de metileno
Membrana citoplasmática
Funciones de Membrana
Citoplasmática
´ Barrera de permeabilidad
Sólo moléculas pequeñas, sin carga, hidrofóbicas,
pueden atravesar la membrana por difusión
´ Ancla de proteínas
Transporte, generación de energía, quimiotaxis
Antibióticos:
estreptomicina-gentamicina (30S)
eritromicina-cloranfenicol (50S)
Flagelos
Son apéndices filiformes de
mayor longitud que la
bacteria que permiten su
locomoción.
Se presentan en número y
disposición variable y estén
formados por fibrillas
proteicas compuestas de
una proteína llamada
flagelina.
Flagelos
Distribución de flagelos
´ Monopolar ´ Monopolar
(monótrica) (polítrica)
´ Bipolar
(anfítrica) ´ Perítrica
Fimbrias y pili en bacterias
Aparece el
exosporio
- Memb. externa:
se degrada
- Córtex:
peptidoglucano
(núcleo
deshidratado y
comprimido)
- Pared celular
- Memb. interna:
Barra-Carrasco y col., 2014 fosfolípidos-
impermeable
- Núcleo:
DNA - Ribosomas
https://www.ugr.es/~eianez/Microbiologia/09esporas.htm
Salida de la nueva célula vegetativa al final de la germinación.
Observar la rotura de las cubiertas (exosporio, etc).
Característica Célula vegetativa endospora
Apariencia microscópica Gram + Cortex grueso, cutícula,
No refractil exosporio, refráctil
Contenido de calcio Bajo elevado
Acido dipicolinico ausente Presente
Actividad enzimática elevada baja
Metabolismo elevado Baja o ausente
Síntesis macromolecular presente Ausente
mRNA Presente Baja o ausente
Resistencia al calor baja Elevada
Resistencia a la radiación baja Elevada
´gránulos de almacenamiento -
polifosfato,azufre, polihidroxibutirato (PHBs)
´Carboxisomas, clorosomas.
Gránulos de polihidroxibutirato (PHBs)
vesículas de gas
flotación
Gránulos de polihidroxibutirato (PHBs)
IMPORTANCIA BIOTECNOLÓGICA
Crecimiento microbiano
• Crecimiento celular (aumento de tamaño
de la célula) – Crecimiento de poblaciones
celulares (aumento del número de células)
• División binaria
• Curva de crecimiento
4
División Binaria
Masa umbral (inicio replicación DNA)
Longitud umbral (inicio formación septo)
• La célula bacteriana se elonga y duplica su DNA
8
Duplicación de la población
Tiempo Células / Mililitro
Notación
Minutos Horas Número Científica Logaritmo
0 0 1000 103 3,0
1 20 0,33 2000 2 X 103 3,301
2 40 0,66 4000 4 x 103 3,602
Nf = N0 . 2n
∆y/∆x= ∆logN/∆t
Log Nf - log N0 = n log 2
n = (6-3)/0,3 g = tiempo/n v=n/tiempo
n = 10 g = 200’/10 v = 1/g
9
Curva de Crecimiento de la Población
Fase de muerte
- Exponencial
Fase estacionaria - Agotamiento de ATP
-Tamaño celular
-Composición celular
(proteínas y AG)
-Endosporas
Fase exponencial
-Sensibilidad a factores que
interfieren en el crecimiento
(penicilina, radiación)
11
REQUERIMIENTOS
NUTRICIONALES
12
NUTRICIÓN
13
Composición Química
16
Macronutrientes
NUTRIENTE Función Fuente
CARBONO Material celular (50 % p.seco) Azúcares, péptidos, ac. grasos, CO2
18
Función fisiológica de sales inorgánicas
• VITAMINAS
• AMINOÁCIDOS
• PURINAS Y PIRIMIDINAS
• ÁCIDOS GRASOS
- M.o. protótrofos: sintetizan sus F.C.
- M.o. auxótrofos: requieren fuente exógena de F.C.
20
Factor o vitamina Funciones principales
p-aminobenzoico (PABA) precursor en biosíntesis del ácido fólico
22
REQUERIMIENTOS NUTRICIONALES
Ejemplo
Nutriente Medio definido Medio complejo Medio definido
E. coli E. coli y L. mesenteroides L. mesenteroides
Glucosa 4-10 g 15 g 25 g
KH2PO4 2g 2g 0,6 g
(NH4)2SO4 1g ----- 1g
23
Complejos: constituidos por sustancias complejas de
origen animal o vegetal, (peptona, extracto de levadura,
Medios de cultivo extracto de carne, etc.) las que son usualmente
complementadas por la adición de minerales y otras
Clasificación
según sustancias.
composición No se conocen todos los componentes ni las cantidades
química exactas presentes de cada uno de ellos.
25
Clasificación de los microorganismos según
fuentes de Energía y Carbono utilizadas
FUENTE DE ENERGÍA
Dióxido de
FUENTE DE CARBONO
Compuestos
orgánicos Fotoheterótrofos Quimioheterótrofos
(hetero-)
26
Categorías (tipos) nutricionales
de microorganismos
Categoría nutricional Fuentes de energía, Ejemplos
Fuente de Carbono
- Velocidad de crecimiento
- Distribución
- Control
28
Definiciones
Crecimiento vs. Tolerancia
“ – filo “: crecimiento
“-tolerante”: supervivencia
“bacteria termofílica ≠ termotolerante”
• TEMPERATURA
• pH
• OXÍGENO
• (Luz, presiones) 30
TEMPERATURA
>V
V ÓPTIMA
<V
MÍNIMA
MÁXIMA
Temp.°C
TEMPERATURAS CARDINALES
- Rangos 30 - 40°C (entre mínima y máxima) - Características de c/especie 31
Óptima
Mínima
Máxima
Temperatura
32
TEMPERATURA
Clasificación de los microorganismos
Grupo Mínima ºC Óptima ºC Máxima ºC
Termófilos 40 - 45 55 - 75 60 - 90
Mesófilos 5 - 15 30 - 45 35 - 47
Psicrótrofos -5 - +5 20 - 30 30 - 35
Psicrófilos -5 - +5 12 – 15 15 – 20
Polaromonas vacuolata (4°C) (14°C)
MÍNIMA (8°C)
MÁXIMA (48°C)
10 20 30 40 50 Temp.°C
34
¿Relación con curva de crecimiento?
Temperaturas óptimas de crecimiento
Psicrótrofos
Listeria monocytogenes
(adaptado)
35
pH
CLASIFICACIÓN pH Ambientes
1 Suelos y aguas volcánicas
ACIDÓFILOS 2 Fluido gástrico
3 Drenaje de minas
ÁCIDOS
pHi: 6,5 4 Tomates
5 Quesos, coles
NEUTROS
NEUTRÓFILOS pHi 7,5 7 Agua pura
8 Agua de mar
14 -----
36
pH
pH
39
pH
- Membrana citoplasmática
- Neutralidad en citoplasma
- Sistema de transporte de electrones ATP dependiente
- Ácidos fuertes (inorgánicos) y débiles (orgánicos)
- Modificación de pH del medio por crecimiento celular
- Respuesta de tolerancia a stress por acidez
- Sistemas tampón en medios de cultivo
RANGO DE CRECIMIENTO MICROBIANO SEGÚN pH
Microorganismo Óptimo Extremo
- Aw ≠ Humedad (%)
Aw = 0 - 1
- Relación Aw y presión osmótica 42
ACTIVIDAD ACUOSA (Aw)
Aw Ambientes Microorganismos
1,000 Agua pura Spirillum sp.
0,995 Sangre humana Streptococcus sp.,
Escherichia sp.,
0,980 Agua de mar Pseudomonas sp.,
Vibrio sp.
0,950 Pan Bacilos Gram positivos
0,900 Jamón Cocos Gram Positivos
0,855 Chorizo Levaduras
0,800 Mermeladas Levaduras, Penicillium
sp.
0,750 Pescado salado Halobacterium,
Halococcus
0,700 Cereales, frutos secos Xeromyces bisporus,
Hongos xerófilos
PATÓGENOS Y ACTIVIDAD ACUOSA
Valor mínimo de aw para el desarrollo de microorganismos
productores de E.T.A. (bacterias) a pH y temperaturas óptimas.
Patógeno aw
Campylobacter jejuni 0,990
Aeromonas hydrofila 0,970
Clostridium botulinum E 0,970
Shigella sp. 0,960
Yersinia enterocolitica 0,960
Clostridium botulinum G 0,965
Clostridium botulinum A y B 0,945
Clostridium perfringens 0,950
Vibrio parahemolyticus 0,940
Salmonella sp. 0,940
Escherichia coli 0,935
Listeria monocytogenes 0,930
Bacillus cereus 0,930
Bacillus subtilis 0,910
Staphylococcus aureus (anaerobiosis) 0,910
Staphylococcus aureus (aerobiosis) 0,860
44
MICROORGANISMOS QUE CRECEN A BAJA aW
• HALÓFILOS (Halotolerantes)
• SACARÓFILOS (Osmófilos)
• XERÓFILOS (Xerotolerantes)
45
Efecto de la Concentración de ClNa
Halobacterium salinarum
Halofilo extremo
(15 – 36%)
Concentración de ClNa
0
S. aureus Halotolerante 46
Osmosis
§ Difusión de solvente
(generalmente, agua)
a través de membrana
permeable pero
selectiva
§ El agua tiende a
moverse hacia zonas
con mayor
concentración de
solutos 47
Tonicidad
Células en
diferentes
condiciones
osmóticas:
soluciones
isotónicas,
hipotónicas e
hipertónicas
48
ACTIVIDAD ACUOSA
EFECTO SOBRE LOS MICROORGANISMOS
BAJA aw (Plasmólisis)
Incorporación/síntesis
solutos compatible
Consumo de energía
Agua
Solutos compatibles
Soluto compatible: molécula o ión que se acumula en el
citoplasma para regular aw.
No inhibe procesos bioquímicos. Osmoprotectores
Solutos Compatibles
Microorganismo Principales solutos Aw minima p/crecimiento
acumulados
Bacterias no fotótrofas Glicina, prolina, glutamato 0,97-0,90
50
Efecto de la reducción de aw
- Inhibición del crecimiento
- Inhibición de la germinación de esporas
- Aumento de la fase de latencia (lag)
- Disminución de la velocidad del crecimiento
- Disminución del número final de
microorganismos
- Inhibición de síntesis de toxinas; retraso de
reacciones enzimáticas
1
0,98 y superior Carnes y pescados frescos, verduras, Se multiplican la mayoría de los
leche. gérmenes alterantes y todos los
patógenos transmitidos por alimentos
0, 98
0,98 – 0,93 Leche evaporada, pan, embutidos Se multiplican las enterobacterias
cocidos. incluyendo Salmonella en los niveles
superiores del rango y flora de
alteración como las bacterias lácticas.
0, 93
0,93 – 0,85 Carne vacuna desecada, leche Se multiplican Staphylococcus aureus
condensada edulcorada. y hongos productores de micotoxinas.
Levaduras y mohos de alteración.
0, 85
0,85 – 0,60 Harina, cereales, frutas secas No se multiplican bacterias patógenas
Alteración por microorganismos
xerófilos, osmófilos y halófilos
0
,6
0
Inferior a 0,60 Productos de repostería, fideos secos, No se multiplican los
galletitas, leche y huevo en polvo. microorganismos, aunque pueden
permanecer viables por mucho tiempo
52
OXÍGENO
53
Clasificación de los microorganismos de acuerdo a su tolerancia al O2
Cultivos en caldo Tioglicolato
(resazurina)
a) Aerobios estrictos
b) Anaerobios estrictos
c) Anaerobios facultativos
d) Microaerófilos
e) Anaerobios aerotolerantes
54
Reducción del O2 a H2O
Generación de formas tóxicas del oxígeno
55
La respuesta de un organismo al O2 depende de la presencia de varias enzimas que
reaccionan con él y con varios radicales generados por las células.
56
Reacciones enzimáticas
• H2O2 + H2O2 Catalasa
2 H2O + O2
• O2 - + O2 - + 2H + H2O2 + O2
Superóxido
dismutasa
(SOD)
57
Prueba de la catalasa
negativa positiva
catalasa
H2O2 + H2O2 2 H2O + O2
58
Formación del H2O2 y sus intermediarios
O2
oxígeno molecular
.- H+ .
O2 HO2
anión superóxido radical hidroperoxilo
superóxido
dismutasa
O2 + 2H2O2
catalasa
2O2 + 2H2O 59
60
ENZIMAS
Clasificación Presencia de Presencia de Microorganismo
Catalasa superoxido
dismutasa
Aerobios estrictos Presente Presente Pseudomonas
aeruginosa
61
Relación Oxígeno - Microorganismos
62
Relación Oxígeno – Microorganismos quimiótrofos
Clasificación Relación Enzimas Metabolismo Ejemplo Crec. en
con energético caldo
Oxígeno Catalasa Peroxidasa SOD tioglicolato
Geogemma banossi
Moritella
yayanosiii
Madigan M. et al. (2009) Brock Biología de los microorganismos 12°Ed. Pearson. España 67
NUTRICIÓN
y
METABOLISMO MICROBIANO
MICROBIOLOGÍA GENERAL
METABOLISMO MICROBIANO
Conjunto de reacciones químicas llevadas a cabo en las
células
CATABOLISMO
Degradación o descomposición de compuestos
(“desasimilación”)
Reacciones químicas que liberan energía
Productos de desecho
Nutrientes
Energía para
el movimiento,
transporte de
Energía nutrientes,etc
para el
desarrollo
Anabolismo
Catabolismo
Componentes
celulares
Fuente de energía
CONCEPTOS BIOQUÍMICOS
• ENERGÍA DE ACTIVACIÓN
•CATALIZADOR
Sustancia que disminuye la energía de activación de una
reacción para aumentar su velocidad.
No se consume ni se modifica durante la reacción
•ENZIMAS
Catalizador biológico, proteínas de alta especificidad (sitio activo –
unión sustrato)
Cofactores (no proteica): grupos prostéticos (Fe) – coenzima
REACCIONES QUÍMICAS Y ENERGÍA PRODUCIDA
• Reacciones Óxido – Reducción (REDOX)
• Dadores y Aceptores de e-
• Transportadores de electrones: NAD-NADP
• Compuestos de Alta Energía - Almacenamiento
REDOX Potencial de reducción
reducción (oxàred)
H2 +½ O2 à H2O
Hemirreacción dadora de e-
H2 à 2e- +2 H+
(oxidación)
Hemirreacción receptora de
e- (reducción)
½ O2+2 e- à O2-
2 H+ + O2- à H2O
Dadores y Receptores de
electrones
“Torre de electrones”
De mayor potencial reductor a
menor potencial reductor
Transportadores de Electrones
Coenzima Nicotinamida Adenina Dinucleotido (NAD)
TPDH
Triosa-fosfato DH
LDH
Otros T.E.
Flavin Adenina Dinucleótido (FAD)
Láctico DH Ácido Láctico
Ácido Pirúvico FMN
Compuestos de alta energía
Fosforilación
a nivel de sustrato
El grupo P se transfiere
desde un compuesto
metabólico intermedio
fosforilado al ADP
Generación de ATP: tipos de fosforilación
ADP + P à ATP
F. acoplada al sustrato F. oxidativa Fotofosforilación
Proceso por el cual los seres vivos toman del medio donde
habitan las sustancias químicas (nutrientes) que necesitan
para crecer y son utilizadas para actividades celulares
metabólicas ( fines energéticos y biosintéticos)
Membrana plasmática
Exterior
Interior
Transporte de Nutrientes
§ Transporte de pequeñas
moléculas no cargadas (H2O, O2,
CO2); inespecífico
Difusión Facilitada
§ Transporte de moléculas polares
y iones a través de membrana
por el gradiente de concentración
§ Proteínas Transportadoras
(permeasas) à > velocidad
§ Glicerol
Transporte Activo
§Transporte de
moléculas a través de Cotransporte
la membrana contra
gradiente de
concentración
(baja à alta)
§Sistema de
“Translocación en
grupo”: transporta y
modifica azúcares Sistema ABC
específicos Transporter
Sistemas de Transporte Activo en bacterias
Sistemas de Cotransporte
Fermentación Respiración
(aeróbica y anaeróbica)
FERMENTACIÓN / RESPIRACIÓN
GLUCÓLISIS
2
Glucosa
NADH2
ATP
Aldolasa
Ác.
pirúvico
FERMENTACIÓN / RESPIRACIÓN
Sin CTE ni AFEE Con CTE y AFEE
No requiere O2 - O2
LÁCTICA
- No O2
ALCOHÓLICA
ÁCIDO-MIXTA AERÓBICA
BUTILENGLICÓLICA NO AERÓBICA
FERMENTACIÓN
•Proceso redox que ocurre en ausencia de un aceptor final de
electrones externo.
NAD NAD
Ac. Láctico Etanol
FERMENTACIÓN ALCOHÓLICA
Microorganismo: Levaduras
OTRAS FERMENTACIONES
Fermentación Ácida Mixta (Ej: E.coli) Ferment.Butilenglicólica (Ej: Enterobacter)
Etanol
Etanol
Acetil-CoA Ac. Láctico
Ac. Acético
+ Ac. Succínico
CO2
Ac. Acético
Ac. Fórmico
H2
CO2 + H2
Resultado neto de la
Fermentación de la Glucosa
- Consumo de glucosa
FERMENTACIÓN
DE AZÚCARES
Producción de ácido
y gas
Respiración: Flujo de Carbono
y Transporte de Electrones
Respiración: proceso catabólico (generación de
ATP) en el cual los compuestos químicos son
oxidados y el O2 u otro oxidante actúan como
aceptor final de electrones
- Transformación de la cadena carbonada
- Flujo de electrones
1) Vías bioquímicas de transformación de C org. a
CO2
2) Transporte de electrones desde comp. org.
hasta aceptor terminal, con síntesis de ATP a
expensas de la fuerza motriz de protones
(“proton motive force”). Fosforilaciòn oxidativa
Etapas
1° Etapa: Glucólisis
Glucosa à 2 Ac. Pirúvico + 2 ATP + 2 NADH
2° Etapa: Escisión de Ácido Pirúvico à Acetil-CoA
NADH-NADPH
Ciclo de Ciclo de FADH
los Krebs (CAT)
ácidos Cadenas
tricarbo carbonadas
2-4-5-6 C
xílicos
(TAC –
CAT)
El conjunto de reacciones del ciclo de Krebs (CAT)
se puede resumir de la siguiente forma:
Membrana
plasmática
(procariotas)
Membrana
mitocondrial
(eucariotas)
Electrones
provenientes
Membranas de
del NADH o
Sistemas
fotosintéticos
clorofila
NADH
Flavopro-
teínas
Ferrosul-
foproteí-
nas
Quinonas
Citocro-
mos
Paracoccus denitrificans
Fuente: Tórtora et al, 2007
Rendimiento: 38 ATP!!!
INHIBIDORES DE LA CADENA
RESPIRATORIA
• Monóxido de Carbono (CO) se combina
directamente con la citocromo oxidasa
terminal, y bloquea la entrada de oxígeno
a la misma.
Shewanella, Geobacter
Escherichia coli
Digestión Extracelular de Polímeros
Orgánicos (proteínas y lípidos)
1° Fase de Glucólisis
Glicerina
Ácido Glicerina
graso
3 Ácidos Β oxidación de AG
grasos
Ácido graso
Lipasas extracelulares
Lípido (exterior celular) NADH2 Acetil CoA
Glicerol
3C
Gliceraldehído 3
P
RUTAS DE 3C
Ácido Láctico
Aminoácidos
OTROS 3C Ácido pirúvico
3C
COMPUESTOS 3C
Ácidos
EN LA Grasos
RESPIRACIÓN
Aminoácidos Alcohol
2C 2C
Acetil CoA
2C
Ciclo
Otros de los ácidos
aminoácidos de tricarboxílicos
más de
3C
Obtención de Energía
• Quimiotrofía: Oxidación de comp. químicos (catabolismo)
- Compuestos orgánicos: Glucosa à CO2
Glucólisis (glucosaàpiruvato)
Fermentación Respiración
(aeróbica y anaeróbica)
¿FOTOTROFIA = FOTOSÍNTESIS ?
FOTOFOSFORILACIÓN
CÍCLICA
ACÍCLICA
Fotofosforilación
a) CÍCLICA
- No hay dador externo de
electrones
- Fotoheterótrofas
- No fijación CO2
- Bact. rojas no sulfur. y
verdes no sulfurosas
Rhodopseudomonas;
Chloroflexus
b) ACÍCLICA
- Dador externo de e “H2A”
(agente reductor)
- Oxigénica: H2O
- Anoxigénica: H2S
- Fijación de CO2
- Fotoautótrofas Fuente: Tortora et al, 2007
FOTOSÍNTESIS
FOTOSÍNTESIS ANOXIGÉNICA
àBacterias verdes: Chlorobium sp.
à Bacterias púrpuras: Chromatium sp.
FASES
DE LA
FOTOSÍNTESIS
-Independiente de
luz
-Uso de energía y
poder de reducción
para forma enlaces
covalentes entre C
-Ídem
quimioautótrofos
BIOSÍNTESIS
(Anabolismo)
Intermediarios Ribosa Fosfopiruvato, Acetato,
de bajo peso carbamil fosfato Cetoácidos Malato Malonato
molecular
Núcleo, mitocondria,
Organelas cloroplasto, etc.
Intermediarios catabólicos
usados en el anabolismo
Biosíntesis de Peptidoglucano
- Molécula con
residuos alternados de
N-acetilglucosamina
(NAG) y ácido N-
acetilmurámico
(NAM).
-Tetrapéptido - NAM
- Uniones
interpeptídicas entre
cadenas
tetrapeptídicas
Fase 1: Síntesis de
precursores NAG-UDP y
NAM-UDP; adición
peptídica en NAM
(citoplasma)
Fase 3: traslocación de
disacárido y
polimerización por
transglucosidación
(glicolasas)
FASE I
RELACIÓN ENTRE LAS Acidos grasos Hexosas
Aminoácidos
TRANSFORMACIONES Glicerina Pentosas
CATABÓLICAS Y
ANABÓLICAS Gliceraldehido 3-fosfato
Fosfoenolpirúvato FASE II
Á.Pirúvico
Acetil CoA
Quimioheterótrofos
A. Oxaloacético Acido Cítrico
Comportamiento ante
el O2 Ciclo de los ácidos
tricarboxílicos
Acido Isocítrico
Acido Málico
Acido α - cetoglutárico
Quimio(lito)autótrofos Acido Fumárico
FASE III
Fotoautrótofos Acido Succínico Succinil CoA
CO2
Biosíntesis
Fermentación
(AFEE)
Quimioheterótrofo
(AFEE)
Quimioautotótrofo
Fotoheterótrofo
Fotoautotótrofo
MICROBIOLOGÍA INDUSTRIAL
Productos
metabólicos
Secundarios
METABOLITOS
• PRODUCTOS METABÓLICOS PRIMARIOS:
azúcar células
Concentración de alcohol
compuesto vs tiempo
METABOLITOS
• SECUNDARIOS:
• EJEMPLO ANTIBIÓTICOS
células
azúcar
atb
Concentración vs tiempo
MICROBIOLOGIA
INDUSTRIAL
FERMENTACIONES A GRAN ESCALA
EN LA MICROBIOLOGÍA INDUSTRIAL, LA
FERMENTACIÓN ES EL PROCESO MICROBIANO A
GRAN ESCALA QUE SE REALIZA TANTO EN
CONDICIONES AERÓBICAS O ANAERÓBICAS
FERMENTADOR
FERMENTADORES
• CLASES DE FERMENTADORES
• ANAEROBIOS: REQUIEREN MENOS EQUIPAMIENTO
• AEROBIOS: REQUIEREN MAS EQUIPAMIENTO
• POSEEN UN AGITADOR:
• MEZCLADO Y AIREACIÓN:
• SUPERFICIE/VOLUMEN
• GRAN DEMANDA DE OXIGENO AL TENER UNA GRAN BIOMASA
FERMENTACIONES A GRAN ESCALA
S
Poblaciones, gremios y
comunidades
S
Ejemplo
Streptococcus
Unicamente crecen Lactobacillus casei y
Degrada la
L. bulgaricus
lactosa a acido
lactico El medio acido
pH 3,-3,5
Superficies y biofilms
Desarrollo
S La placa dental
BIOFILMS
SBiofilms de interés:
S Fibrosis quística
S Periodontotitis
S Cálculos en el riñon
S tuberculosis
MICROBIOLOGIA DEL AIRE
ASPECTOS
GENERALES,
MICROORGANIMOS
PATOGENOS
ATMO-ECOSFERA
TROPOSFERA
●REGION MÁS PROXIMA A LA
SUPERFICIE DE LA TIERRA
●NUMERO SIGNIFICATIVO DE
MICROORGANISMOS
ESTRATOSFERA
●REGION INTERMEDIA
●ELEVADA CONCENTRACION
DE OZONO
●LENTO PROCESO DE MEZCLA
DE GASES
IONOSFERA
●REGION MÁS EXTERNA
DE MICROORGANISMOS
● HUMEDAD
● LUZ SOLAR
● TEMPERATURA
MICROORGANISMOS
SE ENCUENTRAN LOS
MICROORGANISMOS
MICROBIOTA DEL AIRE
ESPORAS
●HONGOS, ALGAS, PROTOZOOS, BACTERIAS,
LIQUENES
●TASA METABOLICA MUY BAJA
●PRODUCCION ELEVADA
●PIGMENTOS
●TAMAÑO PEQUEÑO
●NUMERO DE PERSONAS
ARTIFICIAL
PRESENTES
●RIEGO POR ASPERSION
●NATURALEZA Y GRADO DE
●GRANDES OPERACIONES
ACTIVIDADES QUE
DE TRILLADO
REALIZAN LOS INDIVIDUOS
●FILTROS DE GOTEO
QUE OCUPAN LOS
LOCALES ●GRANDES MATADEROS
BIOAEROSOLES
USUALMENTE EN GRANDES
FRAGMENTOS DE CÉLULAS
●
NUMEROS
BACTERIANAS
●ESPORAS DE BACILOS
ACTINOMICETES
● PEQUEÑAS PARTICULAS DE
●
HONGOS
●
POLVO
GOTITAS DE AGUA
PARTES DE ACTINOMICETES
●
●
GOTITAS DE SALIVA
HIFAS FUNGICAS
●
●
RARA VEZ
●
ENDOTOXINAS
●
RARA VEZ MÁS DE UN MICROBIO
●
EXOTOXINAS
● POR PARTICULA
ENZIMAS
●
GLUCANOS
●
MICOTOXINAS
●
BIOAEROSOLES
BIOAEROSOLES INDOOR
SINDROME DEL EDIFICIO ENFERMO
●IRRITACIONES DE LAS MEMBRANAS MUCOSAS NASALES Y FARINGEAS
●PIEL SECA
●OJOS LLOROSOS
●DOLOR DE CABEZA
EL NÚMERO DE MICROORGANISMOS
●
Streptococcus pneumoniae
●COCOS GRAM POSITIVOS. (0.5 -1.25
µm) ANAEROBIO FACULTATIVO. CON
TENDENCIA A ACUMULAR H2O2 EN
CULTIVOS AEROBICOS. CATALASA
NEGATIVO
●CAPSULA. PNEUMOLISINA.
NEURAMINIDASA. AUTOLISINA.
●MEDIOS ENRIQUECIDOS Y
OTRAS ALTERACIONES
RESPIRATORIAS,.
●NEUMONIA, FARINGITIS, OTITIS
MEDIA, MENINGITIS
MICROORGANISMOS PATOGENOS
TRANSMITIDOS POR EL AIRE
Bacillus anthracis
VEGETALES
Bacillus anthracis CONTAMINADOS
INGESTION
HERBIVOROS
INOCULACION
CARNIVORO
INHALACION
VEGETALES
CONTAMINADOS
INGESTION
HOMBRE ( HUESPED ACCIDENTAL)
BIOTERRORISMO
MICROORGANISMOS PATOGENOS
TRANSMITIDOS POR EL AIRE
Influenza virus
Orthomixoviridae
●
HELICOIDAL.
HEMAGLUTININA RESPONSABLE DE LA
●
VIRUS
ARN DE CADENA SENCILLA Y DE
●
POLARIDAD NEGATIVA
TRES TIPOS A, B Y C
●
LOS MICROORGANISMOS
●
LA MUESTRA DE AIRE SE
●
S
Microbiología del suelo
•Complejo dinámico, caracterizado
por una atmósfera interna, una
cantidad particular de agua,
elementos minerales, flora y fauna
determinadas”
•“La parte más diversa,
biológicamente, de la Tierra”
•Composición del Suelo
•Fracción Mineral.
•Fracción Orgánica.
•Agua
•Aire
•Organismos vivos.
EL SUELO
Capa de
Capa de agua
Agua
Algunos materiales del
El horizonte B:
horizonte A, llegan al B por
Contiene mucho menos material filtración del agua a través
orgánico y está menos meteorizado que del suelo:
el horizonte superior. Óxido de hierro.
Hay pocos microorganismos Partículas
arcillosas.
Pequeñas
El horizonte C
cantidades de
material orgánico.
¢ Compuesto por rocas y minerales
fragmentados y meteorizados de
los cuales se ha formado el suelo
verdadero de los horizontes
superiores.
¢ Los microorganismos son
escasos
Influencia del ambiente del suelo en las poblaciones
de microorganismos
:
Factores que afectan en mayor grado a las poblaciones de microorganismos
pH DEL SUELO
Acidez- Alcalinidad TEMPERATURA
POBLACIONES DE MICROORGANISMOS
DISPONIBILIDAD DE
TÉCNICAS DE
OXÍGENO, AGUA Y
MANEJO DEL SUELO
SUSTANCIAS
NUTRITIVAS
Papel de la población microbiana
del suelo:
Contribuyen a la formación de
materia orgánica
Controlan la disponibilidad de
muchos nutrientes importantes
para las plantas.
Papel de la población microbiana
del suelo:
¢ Mineralización (descomposición)
de la materia orgánica: Ciclo de la materia orgánica
proporciona a la planta los
nutrientes necesarios para su
desarrollo.
S
El ciclo del carbono
Fotosíntesis
Respiración
Descomposición materia orgánica
El ciclo del carbono
El ciclo del carbono
Descomposicion
anoxica: varios
grupos de
anaerobios
fermentativos
actúan
conjuntamente
Los sintrofos:
convierten los
acidos grasos y
alcoholes en
sustratos para la
metanogenesis y
la acetogenesis
Ciclo del carbono y el rumen
Ciclos biogeoquímicos
CO2 Fotosíntesis
(Plantas, microorganismos)
Oxidación fotoquímica
(atmosfera) Respiración Quimioautotrofia
(animales, (microorganismos)
microorganismos)
Compuestos
orgánicos Fermentación
(microorganismos)
Combustión
El ciclo del nitrógeno
El ciclo del nitrógeno
S Fácilmente asimilable
Fijación biológica de N
Bacterias de vida libre:
•Azobacter sp.
•Beijerinckia sp.
•Clostridium sp.
•Cyanobacterium sp.
•Rhizobium sp.
•Bradyrhizobium sp. Leguminosa Especie bacteriana
•Azorhizobium sp. Alfalfa Rhizobium melioti
Arveja R leguminosarum biovar viciae
S Los rizobios son bacilos gram (+), aeróbicos, habitantes del suelo y
capaces de nodular leguminosas
S Tipo cianobacterias:
Fijación del N
(simbiótica y no
simbiótica) Amonificación
(microorganismos)
Utilización del NO3-
N2
Fijación química
(Haber-Bosch)
NH3
Desvitrificación
Nitrificación
(Nitrosomonas)
Nitrificación
(Nitrobacter)
NO2-
El ciclo del azufre
Animales comen plantas
S orgánico S orgánico
(plantas, microorganismos) (animales)
Descomposición
(microorganismos)
S
Protozoos
S Unicelulares
S Especializacion celular
Protozoos
S autotrófica,
S heterotrofa,
S Locomoción:
S Pseudopodos
S Flagelos
S Cilios
Autotrofos Fotosinteticos
S Habitats:
S Acuaticos formando el plancton
S Suelos
S Troncos de arboles
Autotrofos fotosinteticos
S Diversidad de pigmentos
Volvox
S Fitoflagelado colonial
Células sexuales
especializadas
Autotrofos y heterotrofos
S Los Dinoflagelados:
S Gran diversidad morfologica y funcional
http://www.aqua.cl/2018/01/12/marea-
roja-aumenta-presencia-toxinas-marinas-sur-
chile/#
https://www.clarin.com/sociedad/muerte-ballenas-marea-roja-record-chubut-
temen-contaminacion-afecte-crias_0_7AEGeerOd3.html
Autotrofos y heterotrofos
S Los euglenoides:
S Caracteristicas:
S organismos unicelulares
S fotosintetizadores, heterotrofos o parasitos
S Zooflagelados o mastigoforos
S Diversidad nutricional
Paramecium
S Protozoos ciliados
S Vacuolas contractiles
Heterotrofos unicelulares
Paramecium
Heterotrofos unicelulares
Heterotrofos unicelulares
Tripanosomatidos
T. cruzi
Heterotrofos unicelulares
Heterotrofos unicelulares
Ciclo de vida
https://www.youtube.com/watch?v=1ais69H0l
i8
Heterotrofos unicelulares
El insecto vector
Heterotrofos unicelulares
Enfermedad de Chagas
Leishmaniasis
Heterotrofos unicelulares
Leishmaniasis
S Es transmitida por insectos flebotomos
S Tratamientos:
S Visceral: Anfotericina B liposomal, paromicina , etc.
S Cutanea: paromomycin, fluconazol y pentamidina
Especie especifico
Heterotrofos unicelulares
https://youtu.be/1ais69H0li8
Heterotrofos unicelulares
Heterotrofos unicelulares
Giardiasis
Variación antigénica
Heterotrofos unicelulares
Heterotrofos unicelulares
El ciclo de vida
Swallowing Giardia picked up from surfaces (such as
bathroom handles, changing tables, diaper pails, or
toys) that contain feces (poop) from an infected
person or animal
Drinking water or using ice made from water sources
where Giardia may live (for example, untreated or
improperly treated water from lakes, streams, or
wells)
Swallowing water while swimming or playing in water
where Giardia may live, especially in lakes, rivers,
springs, ponds, and streams
Eating uncooked food that contains Giardia organisms
Having contact with someone who is ill with giardiasis
Traveling to countries where giardiasis is common
Heterotrofos unicelulares
Heterotrofos unicelulares
Enfermedad del sueño
Heterotrofos unicelulares
Enfermedad del sueño
S Endoparasito
S Complejo Apical
Apicomplejos: Toxoplasmosis
• Clasificación y nomenclatura
– Caracterización exhaustiva: datos fenotípicos,
genotípicos (“taxonomía clásica”) y filogenéticos
(“taxonomía polifásica”)
– Aplicación de teoría y método de clasificación
– Formación de grupos taxonómicos (taxones)
– Nomenclatura
• Identificación
– Caracterización del organismo aislado usando número
limitado de tests adecuados al problema
– Comparación con spp. conocidas
– Asignación a una sp.
– No identificado: estudio taxonómico
5
Definiciones CLASIFICACIÓN
NOMENCLATURA
Escherichia coli
E. coli
8
Definiciones
Dominio
Reino
Proteobacterias
Filo
Clase
Orden Enterobacteriales
Familia Enterobacteriaceae
Género
Especie
9
Perro
Levadura de cerveza Rosa E. coli
Definiciones
10
Definiciones
SUBESPECIE
Nombre trinominal
Lactobacillus casei subsp. rhamnosus
Lactobacillus casei subsp. casei
11
Definiciones
Dominios 1 1 2
Phyla 23 3 26
Clases 32 8 40
Órdenes 77 12 89
Fuente: Garrity G., Boone D., Castenholz R. (Eds.). 2001. Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology, 2°Ed, Vol. 1. Springer, NY
13
Bergey´s Manual of Determinative Bacteriology
1923 (1ed)-1974 (8 ed) Características fenotípicas a
tener en cuenta para identificar
1994 (9ed) cepas (o sea “determinar a
que especie pertenecen)
Escherichia coli
Type strain (Cepa tipo): E. coli ATCC 11775
Serotype: O1:K1(L1):H7
16
GenBank accesion number (16S rRNA): X80725
Definiciones
Clasificación
Ordenamiento de los organismos
17
Características empleadas en TAXONOMIA (clásica) :
CLASIFICACIÓN - IDENTIFICACIÓN
FENOTÍPICAS
Morfológicas: morfología celular y colonia (forma-tamaño-color),
esporas ultraestructura, tinción, cilios y flagelos, movilidad, inclusiones
Fisiológicas y metabólicas: fuentes de energía, C y N, componentes de
la pared celular (tipo de peptidoglucano, ácidos teicoicos), productos de
fermentación, tipo nutricional, pH, temperatura de crecimiento,
luminiscencia, tolerancia osmótica, relaciones con el oxígeno, pigmentos
fotosintéticos, necesidad y tolerancia a la sal, metabolitos secundarios,
sensibilidad a antibióticos
Ecológicas: Ciclo vital, Relaciones simbióticas, Patogenicidad
Preferencia de hábitat (pH; oxígeno; aw)
Serología – Fagotipia
GENOTÍPICAS (ácidos nucleicos)
- Composición % G + C
- Hibridación de Ácidos Nucleicos (DNA-DNA; Tm; ARN/ADN)
18
Características
criterio de exclusión:
∆%GC > 3, probablemente especies diferentes
∆%GC > 10, probablemente géneros diferentes
19
Características
DESNATURALIZACION
TÉRMICA
Absorbancia
ADN simple hebra
Aumento de
ADN doble hebra
absorbancia del
ADN a 260nm por
220 260 300 desnaturalizacion
Longitud de onda (nm)
Abs. relativa 260 nm
• Hibridación ADN-ADN
- determinación por:
% hibridación de ADN1 - ADN2
Δ Tm del híbrido
- Desnaturalizar (Ø)
HIBRIDACIÓN
DE
ÁCIDOS
NUCLEICOS
-Mezclar DNA marcado
con DNA μo a comparar
(exceso)
-Enfriar mezcla
- Medir radiactividad en
DNA bicatenario
22
ESTABILIDAD TÉRMICA DEL HÍBRIDO
Ensayo de reasociación de ADN-ADN para cepas a y b
Curvas de
desnaturalización
térmica de ADN
homoduplex y
heteroduplex
23
ESPECIE BACTERIANA
24
TAXONOMÍA POLIFÁSICA
Es la tendencia moderna. Consenso en la
integración de distintos tipos de caracteres:
Ø Fenotípicos: - clásicos (morfología, nutrición, etc)
- marcadores quimiotaxonómicos
- perfil de proteínas totales y enzimas
- perfil de ácidos grasos
Fingerprinting de
ácidos
nucleicos
“Huella dactilar”
- Enzimas de
Restricción
- Sondas
marcadas
- PCR
29
PCR
Reacción en cadena de la polimerasa
(sigla en inglés: PCR = Polymerase Chain Reaction)
• Técnica de biología molecular (1986) cuyo objetivo es
obtener un gran número de copias de un fragmento de
ADN particular, partiendo de un mínimo; en teoría basta
partir de una única copia de ese fragmento original o molde.
• Esta técnica sirve para amplificar un fragmento de ADN; su
utilidad es que, tras la amplificación, resulta mucho más
fácil identificarlo, emplearlo para identificar
microorganismos, manipularlo para su secuenciación,
etc.
ADN polimerasa
primers o cebadores
oligonucleótido complementario a zona adyacente a la región a amplificar
ADN incógnita
nucleótidos (A-T-G-C)
30
PCR para amplificación de secuencias específicas de DNA
94°C
40-65°C
72°C
94°C
40-65°C
72°C
31
CARACTERES FILOGENÉTICOS
• Plantean hipótesis de evolución (determina relaciones de
parentesco entre las especies) à CLASIFICACIÓN
• Compara la secuencia de moléculas (que se comportan
como “cronómetros evolutivos”) y establece la relación
entre ellas à las secuencias son registro histórico de la
evolución
PROPIEDADES DE UN BUEN CRONÓMETRO EVOLUTIVO
- distribución universal (presente en todos los organismos, con función
homóloga)
-secuencias que permitan identificar regiones homólogas y heterogéneas
-La tasa de cambio de la secuencia de la macromolécula debe estar en
correlación con la distancia evolutiva
Molécula usada para determinar relaciones filogenéticas de organismos
☺ Los puntos rojos señalan posiciones en las que arqueas y bacterias suelen diferir
33
Filogenia
Amplificación
de genes de
rRNA 16 S
mediante PCR
para posterior
secuenciación
34
Árboles filogéneticos
36
Filogenia
Cladogramas
1 à
2 à
3 à
37
Relación entre la definición de especie
bacteriana y el análisis del gen ARNr 16S
Definición especie: % de hibridación ADN1-ADN2 > 70%
En general se cumple:
secuencia del gen del ARNr 16S difiere en más del 3%
con el resto de las secuencias conocidas de bacterias
entonces el % de hibridación ADN-ADN es menor al 70%
especies diferentes
Si diferían en
más del 3%
en RNA,
% DNA-DNA
< 70%
38
CRITERIOS PARA DIFERENCIACION DE ESPECIES Y
GÉNEROS EN SISTEMA DE CLASIFICACION
ACTUAL
< 5%
distinto género
39
Sondas de
DNA para
identificar
bacterias
40
Otros Metodos para identificar
41
AGAR BAIRD PARKER
Negras con
borde Cloruro de litio y telurito de
Bueno a blanco,
S. aureus
excelente rodeado de potasio: inhibir desarrollo de
una zona
clara.
flora microbiana acompañante
negra, -Piruvato de sodio y glicina:
tamaño
irregular. estimular selectivamente el
S. epidermidis Escaso o bueno
Zona opaca crecimiento de estafilococos.
alrededor
de la
colonia sin -Yema de huevo: colonias
zona clara
alrededor.
convexas negros rodeadas de
Igual al zona transparente debido a la
E. faecium Escaso
anterior lipólisis y proteólisis.
Colonias 42
Micrococcus Escaso marrón a
negro.
AGAR ENDO
43
Escherichia coli
(Gram negativas)
Clostridium perfringens
(Gram positivas)
44
Clasificación de los microorganismos de acuerdo a su tolerancia al O2
a) Aerobios estrictos
b) Anaerobios estrictos
c) Anaerobios facultativos
d) Microaerófilos
e) Anaeobios aerotolerantes
45
Prueba de la catalasa
negativa positiva
catalasa
H2O2 + H2O2 2 H2O + O2
Catalasa (-) Catalasa (+)
46
Anaerobios estrictos y an. aerotolerantes Aerobios, microaerófilos y an. facultativos
47
Pruebas Bioquímicas para Identificación de
Bacterias
Prueba Principio Método
E.coli E. aerogenes
I : + -
M: + - (“C”) (“I”)
VP: - +
C: - +
49
(“M”) (“VP”)
50
Detección de enterotoxinas de S. aureus
TEST ELISA
(“Enzyme linked immunoabsorbent assay”)
Ensayo de inmunoabsorción ligado a enzimas
Etapa I: Adición de la Etapa II: Formación de Etapa III: Visualización
muestra “sandwich” de punto final (color)
èConfirmación bioquímica
èConfirmacion serológica (O y H)
è Presencia de toxina Shiga (por
citotoxicidad o ELISA)
è Presencia de genes de toxina Shiga
(PCR o sondas)
52
Sistemas
comerciales
rápidos para
detección y
confirmación de
Listeria
53
www.oie.int/esp/normes/mmanual/pdf_es/2.10.14_Listeria_monocytogenes.pdf -
54
MÉTODOS DE IDENTIFICACIÓN BACTERIANA MEDIANTE
ESPECTROMETRÍA DE MASAS
55
Espectrometría de masas
MALDI-TOF
61
GRAM POSITIVAS
El Manual Bergey divide a las bacterias Gram Positivas de acuerdo a su
contenido de G+C
65
Identificación de género y especie
Bergey´s Manual of Determinative Bacteriology
1994 (9ed)
-Proporciona esquemas de identificación (listas de
características que permiten ubicar el microorgansimo
aislado en sistema de clasificación concebido con
anterioridad – FINES PRÁCTICOS)
Criterios
Morfología – tinción – requerimientos de oxígeno –
pruebas bioquímicas
à PROCEDIMIENTOS HABITUALES DE LABORATORIO66
Algunos grupos microbianos habituales en alimentos
Eucariotas Procariotas
Hongos y Levaduras Bacterias
Deterioro - Micotoxinas Deterioro - Infecciones/Intoxicaciones
Mac Faddin
68
SISTEMA DE
IDENTIFICACIÓN
TRADICIONAL
69
Virología
Guía de conceptos básicos para su
estudio
MICROBIOLOGÍA GENERAL
1
4
¿Qué son - Agentes infecciosos
- Pequeño tamaño
los virus? - Parasitismo obligatorio
8
Adaptado, Tortora et al 2007
Rango de hospedadores
Especificidad
a) Fijación a célula huésped: superficie externa viral + superficie celular (SRES)
(pared, fimbrias,flagelos///membrana plasmática)
b) Disponibilidad, dentro del huésped, de factores necesarios para la replicación viral
9
Estructura viral
VIRIÓN
Partícula infecciosa completa compuesta por ácido nucleico (DNA
o RNA, cadena simple o doble), rodeado por una cubierta
proteica o cápside, formada por subunidades estructurales.
Tienen un estado
Extracelular Intracelular
El virión), es Dentro del huésped,
metabólicamente donde ocurre la
inerte, sirve para replicación vírica.
transportar el Este proceso es la
genoma vírico de infección
la célula que lo
VMT
produjo a otra 10
Estructura viral
11
Estructura viral
CÁPSIDE Y ENVOLTURA
12
Estructura viral
CÁPSIDE Y ENVOLTURA
Cápside: cubierta proteica Envoltura
que protege al AN del virus
Capsómero: unidades
proteicas que forman la Cápside
cápside
Envoltura: combinación de
lípidos, proteínas e hidratos AN
de carbono que recubre a la
cápside
13
MORFOLOGÍA GENERAL
•Virus helicoidales: bastones (rígidos o flexibles). AN dentro de cápside cilíndrica
hueca de estructura helicoidal (virus de la rabia, ébola)
•Virus poliédricos: cápside icosaédrica (20 caras
triangulares). (poliovirus, adenovirus)
14
Bacteriófago T- par
15
Taxonomía de virus
Rango de hospedadores – Órganos afectados
17
Aislamiento, cultivo e identificación de virus
• Cultivo de virus animales
• En animales vivos: multiplicación; respuesta inmune;
diagnóstico por sintomatología
• En huevos embrionados:
Daño de embrión o membrana
Vacunas
• En cultivos celulares
• En células de insectos
18
Identificación viral
19
Multiplicación vírica
20
Etapas de la multiplicación vírica
1. Fijación-Adsorción: asociación de sitios específicos del virión
(ligandos) con los recepctores de superficie de una célula
susceptible
21
Curva de la multiplicación viral
• Adsorción
• Eclipse
• Maduración
(LATENCIA)
• Liberación
Duración del
ciclo
- V.B.: 20 - 60 minutos
22
- V.A.: 8 – 40 horas
Ciclo lítico de bacteriófago
23
T simétrico
24
25
Ciclo lítico y
lisogénico en
bacteriófagos
Ciclo
lisógenico:
Bacteriófago
Lambda (λ)
26
Ciclo lisógenico: Bacteriófago Lambda (λ)
28
29
30
Comparación multiplicación
Bacteriófagos vs. Virus animales
Etapas Bacteriófagos Virus animales
Proteína
normal Prión
Scrapie
PrPC
PrPSC
Membrana
celular Acumulación
celular
Neuronas
Agregados
Codificada
por gen en
cromosoma
20
• Solución natural
Biotecnología Alimentaria
Clostridium
Clostridium butiricum
propionicum y enterobacterias
Propioniobacterium
Los grupos que mas interesan desde el punto de vista alimentario son: enterobacterias y clostridium
(Sanitario) y bacterias lacticas , propionibacterias y levaduras (Productivo)
Cultivos iniciadores (“Starter Cultures”)
Los cultivos starter comprenden los microorganismos que se emplean en la
producción de productos lácteos fermentados, como queso y yogur.
La microflora natural de la leche es ineficiente, incontrolada e impredecible, o
bien es destruida durante el tratamiento térmico a que se somete la leche. Un
cultivo starter en cambio provee las características particulares deseadas en forma
mas controlable y predecible.
La función primaria de los cultivos iniciadores lácticos es la producción de acido
láctico a partir de la lactosa.
Otras funciones de los cultivos starters son:
sabor, aroma, y producción de etanol
actividad proteolítica y lipolítica
inhibición de microorganismos indeseables
1
u Los hongos son organismo eucariotas, con núcleos bien
organizados y su membrana nuclear esta bien definida son
aerobios, heterótrofos y no motiles, se reproducen por
esporas sexuales y asexuales.
Los hongos están constituidos por:
• Dilataciones o vesículas
• Órganos de resistencia o clamidosporas
• Órganos de fijación como rizoides
• Hifas en espiral o tirabuzón
• Órganos nodulares formados por hifas torcidas en forma de
nudos
u Tienen una pared celular formada por
quitina; esta pared es rígida, por lo que no
pueden fagocitar alimentos si no que
absorben nutrientes simples y solubles que
obtienen al desintegrar polímeros mediante
enzimas extracelulares llamadas
despolimerasas.
9
u La clasificación tradicional de hongos se ha modificado en
base a datos filogénicos
u Las divisiones actuales contempladas en el reino Fungi:
u CHYTRIDIOMYCOTA
u GLOMERULOMYCOTA (incluida anteriormente en
Zygomycota)
u ZYGOMYCOTA
u ASCOMYCOTA
u BASIDIOMYCOTA
10
u DIVISION ZYGOMYCOTA
u - Están constituidos por hifas cenocíticas con muchos núcleos
aploides.
u Presentan reproducción asexual , mediante esporas que se producen
en los esporangios ubicados en el extremo de las hifas aéreas y se
dispersan por el viento y también sexual generando zigotos de pared
dura y gruesa (zigosporas) que permanecen latentes en ambientes
hostiles
u Viven en materia vegetal y animal en descomposición en el suelo
u Interés industrial : se los utiliza para producir alimentos: tempeh,
tofu, sustancias anestésicas, alcoholes industriales, etc..
11
u DIVISION CHYTRIDIOMYCOTA
u - Contiene a los hongos verdaderos mas sencillos
u Son microscópicos unicelulares, masas multinucleadas o verdaderos
micelios.
u Presentan reproducción asexual , mediante zoosporas (esporas
flagelares móviles) y también sexual generando zigotos de pared dura
y gruesa (zigosporas) que permanecen latentes en ambientes hostiles
hasta convertirse en esporangios.
u Son terrestres y acuáticos Algunos saprofíticos sobre materia orgánica
muerta. Otros parásitos de algas, de otros hongos plantas e
invertebrados.
u Géneros representativos: Rhizophydium y Allomyces
12
u DIVISION GLOMERULOMYCOTA
u - Es una división recientemente separada de Zygomycota
Filogénicamente mas parecida d las divisiones Basidiomycota y
Ascomycota.
u Carecen de reproducción sexual y son simbiontes obligados de
plantas terrestres
u Tienen hifas no septadas y esporas grandes y multinucleadas
u Se nutren de carbohidratos simples y vitaminas de las raíces de
plantas e inducen a dicotomías de raíces aumentando la superficie de
absorción de nutrientes del suelo.
u Géneros representativos: Arqueospora y Glomus
13
u DIVISION ASCOMYCOTA
u - Grupo muy amplio y variado al que pertenecen especies unicelulares como
las levaduras y otras de crecimiento filamentoso.
u Reciben este nombre por su estructura reproductora características en
forma de saco (ASCA)
u Están formados por hifas tabicadas
u Presentan reproducción sexual , mediante conidioesporas que se disponen en
cadena en el extremo del conidioforo
14
15
16
Por su origen las hifas se
dividen en dos
u Hifas verdaderas: son propias de los hongos mohos o
filamentosos y se forman a partir de la germinación de
una conidia o espora
u Pseudohifas: son propias de las levaduras y se forman a
partir de germinaciones (blastoconidias) estas no se
desprenden de la célula madre.
Por su forma el micelio se
clasifica en
u Filamentoso: propio de los hongos mohos
ufc/ml o g
(o superficie o tiempo de apertura de
placa)
Se consideran aceptables para ser contadas
las placas que contengan entre 1021 a 150
colonias
•COLOR ANVERSO/REVERSO
•DIAMETRO
•EXUDADO PRESENCIA/AUSENCIA
•PIGMENTO PRESENCIA/AUSENCIA
22
Micología
1
MICOTOXINAS
ENFERMEDAD 3
Aguda – Crónica (cáncer)
Micotoxicosis secundaria
VEGETALES
Infección fúngica
Formación de micotoxinas
Unión a tejidos
Consumo por animales Productos cárneos
Secreción de leche
10
GÉNERO ASPERGILLUS
u Contaminan productos almacenados (granos de cereales, oleaginosas,
nueces, especias).
u Muy asociados con deterioro de alimentos y otros sustratos en climas cálidos
tropicales y subtropicales.
u Crecen fácilmente con Aw bajos 0,80 / 0,85 (xerófilos).
u Algunas especies se emplean en la elaboración de ingredientes de alimentos
en la industria alimentaria. A. oryzae para el koji y A. niger para fabricar
ácido cítrico.
u Recuento buenos se logran con un medio con antibacteriano y con
inhibidores adecuados para la dispersión de la colonia. Se recomienda Agar
dicloran rosa de bengala cloranfenicol (DRBC).
u Para la identificación puede ser medio Czapek o agar extracto de malta.
11
GÉNERO ASPERGILLUS
Especies toxicogénicas mas comunes
12
Aflatoxinas
Alimentos implicados
-Maíz
-Maní
-Alimentos balanceados
-Carnes (fresca,
chacinados y
embutidos)
-Leche
-Cerveza
-Cacao
-Soja
-Pan integral
-Zumo de manzana
-Corteza de quesos
Fuente: Carrillo L. (2003)
Aflatoxinas
u Carcinogénicas - Mutagénicas -
Teratogénicas
LUZ ULTRA-VIOLETA
(onda larga: 360nm)
17
OCRATOXINA: Cereales y derivados, zumo de frutas, cerveza, vino tinto, uvas y pasas, café,
leguminosas, cacao, derivados de carne de cerdo y aves - Fenilalanina
20
GÉNERO FUSARIUM
25
MICOTOXINA MICOTOXICOSIS HONGOS HUESPED EFECTOS
PRODUCTORES SUSCEPTIBLE BIOLOGICOS
Zearalenona Micotoxicosis Estrogénica Fusarium graminearum Humanos? Síndrome estrogénico
F.sporothrichioides Porcinos Vulvovaginitis
F.culmorum Prolapso vaginal y rectal
Tricotecenos Fusariotoxicosis Fusarium graminearum Humanos Rechazo de comida –
Deoxinivalenol (DON) (Akakabi-Byo) F.sporotrichioides Animales de granja Nauseas
Nivalenol F.trincictum Aves Vómitos –Diarrea –
Fusarenona X F.poae Leucopenia –
F.culmorum Hemorragias –
F.crookwellense Desórdenes reproducti-
F.solani vos -Inmunosupresión
T-2 Aleukia tóxica F.sporotrichioides Humanos Leucopenia - Sepsis –
Diacetoxiscirpenol (DAS) alimentaria F.poae Animales de granja Hemorragia - Angina
(ATA) necrótica - Muerte
Fumonisinas Cáncer esofágico F.moniliforme Humanos Cáncer esofágico
(endémico) F.proliferatum Equinos Leucoencefalomalacia
F.subglutinans Porcinos Edema pulmonar
F.anthophilum
26
Conservantes anfigúngicos
empleados en alimentos
u Ácido sórbico
u Ácido propiónico
u Ácido benzoico
u Ésteres del ácido p-hidroxibenzoico
u Dióxido de azufre
u Natamicina
27
Genética
Ciencia que estudia los mecanismos por los
cuales los caracteres pasan de un organismo a
otro
(«ciencia de la herencia»)
Objeto de estudio
Genes y el flujo de la información genética
(replicación – expresión) 2
Genética bacteriana
• Introducción
• Mutación
• Recombinación
– Transformación
– Transducción
– Conjugación
3
Genética bacteriana
• CICLO VITAL CORTO
– Plantas 1 año
– Conejos 3 meses
– Mosca 15 días
– Hongos 2 días
– Bacterias 15-30 minutos
• DESCENDENCIA ABUNDANTE
• SIMPLICIDAD GENICA
• INTERACCIÓN GENOMA-AMBIENTE
TRANSCRIPCIÓN
TRADUCCIÓN
6
Base química para la variación en el fenotipo
Mutación – Recombinación
Cambios en la secuencia de nucleótidos de la
molécula de ADN que se pueden transmitir a la
descendencia.
7
Genética bacteriana
• Introducción
• Mutación
• Recombinación
– Transformación
– Transducción
– Conjugación
8
• Cromosoma bacteriano: molécula circular de
ADN (doble cadena) que funciona como un
elemento genético auto replicable (replicón).
10
Estructura del ácido nucleico
11
Desoxirribonucleótido
Ribonucleótido
12
13
CADENAS
APAREADAS
DE DNA
ORIENTADAS
EN
DIRECCIONES
OPUESTAS
14
Estructura y función del ARN
Tipos de ARN
-Mensajero (RNAm): copiar DNA y llevar mensaje al ribosoma
-Transferencia (RNAt): traducción del mensaje de mRNA en
secuencia específica de AA
-Ribosomal (RNAr): síntesis de proteínas
15
16
Genética bacteriana
• Introducción
• Mutación
• Recombinación
– Transformación
– Conjugación
– Transducción.
17
Replicación del DNA
• Durante la replicación cada banda del
ADN helicoidal sirve como un molde para
la síntesis de una nueva banda
complementaria.
• Cada molécula de doble cadena de ADN
hija contiene una banda de polinucleótido
vieja y una banda nueva sintetizada.
• Este tipo de replicación del ADN se
denomina semiconservativa.
18
Replicación del DNA
• La replicación es
bidireccional.
20
Enzimas que afectan el DNA
21
Replicación del DNA
4
3 1
22
Plásmidos
• Los plásmidos son replicones que se mantienen como
elementos genéticos distintos, extracromosómico en las
bacterias.
ADN 3’-TACCGA
ARNm 5’-AUGGCU
TRADUCCIÓN
Lenguaje AN a
Lenguaje Proteínas (AA)
24
CÓDIGO GENÉTICO-EL LENGUAJE DE LA VIDA
DETERMINA
SECUENCIA DE AA de PROTEÍNA 25
26
Iniciación
- Unión de subunidad menor a codon de iniciación (AUG) del ARNm (5’ 3’)
- Acople de ARNt que corresponde y de subunidad mayor
28
Genética bacteriana
• Introducción
• Mutación
• Recombinación
– Transformación
– Transducción
– Conjugación
29
MUTACIÓN
• Cambio heredable en la secuencia de bases del ADN que no
resulte de la incorporación de material genético exógeno
30
MUTACIONES
MUTACIÓN
31
Sustituciones
• Pueden ser Mutación
causadas por
apareamiento
erróneo entre
bases
complementarias
durante la
replicación.
• ¿Toda sustitución
produce un cambio
en el fenotipo?
• Transición (pixpi o
puxpu) vs
transversión (pixpu) 32
Cambio de sentido Sin sentido Silenciosa
Supresiones e inserciones
• Supresiones o deleciones: son mutaciones en
las que se ha eliminado una región del DNA.
– Algunas deleciones son tan grandes que pueden
afectar a varios genes.
– No son reversibles salvo por recombinación genética.
– Puede ser causada por daño al DNA.
Mutación por inserción TCA GGA CTA ATA GTT A marco de lectura alterado
ADN normal TCA GGA TAA TAG TTA marco de lectura normal
Mutación por deleción TCA GGT AAT AGT TA marco de lectura alterado
34
Reversiones
• Las mutaciones puntuales son reversibles.
• Un revertiente se define operativamente
como una cepa en la que aparece
restaurado el fenotipo silvestre que se
perdió en el mutante.
• Dos tipos:
– Revertientes de un mismo sitio o verdaderas.
– Revertientes de segundo sitio o supresoras.
35
Mecanismos de la mutagénesis
•Mutagénesis dirigida:
•No son al azar; utilizan la tecnología de DNA recombinante; introducir
genes mutados para analizar efecto de la mutación.
36
Mutaciones
por análogos
de bases
Fármacos
antivirales
(AZT:
azidotimidina) o
antineoplásicos
37
Aparea con Citosina
Mutaciones
Tipo Agente causal Consecuencias
Sustitución
Transición: pirimidina sustituida por Análogos de bases, radiación Si se forma un codón sin sentido,
pirimidina o purina sustituida por UV, agentes péptido trunco.
purina. desaminantes, Si se forma un codón de sentido
alquilantes. Espontánea. erróneo, proteína alterada.
Transversión: purina sustituida por Espontánea.
pirimidina o viceversa.
Deleción
Macrodeleción: supresión de un HNO2, radiación, agentes Péptido trunco
segmento grande de nucleótidos alquilantes.
Microdeleción o deleción puntual. HNO2, radiación, agentes Corrimiento del marco de lectura,
Supresión de 1 o dos nucleótidos alquilantes. que casi siempre da lugar a
un codón sin sentido y a un
péptido trunco.
Adición
Macroadición: inserción de un Transposones o secuencias Gen interrumpido que da lugar a
segmento grande de nucleótidos de inserción un producto trunco.
Microadición o adición puntual: Acridina Corrimiento del marco de lectura,
Inserción de 1 o 2 nucleótidos. que casi siempre da lugar a
un codón sin sentido y a un
péptido trunco.
Inversión Transposones o secuencias Diversos efectos posibles 39
de inserción
Genética bacteriana
• Introducción
• Mutación
• Recombinación
– Transformación
– Transducción
– Conjugación
43
Recombinación genética
• Intercambio de genes entre dos moléculas de ADN para
formar nuevas combinaciones de genes en un
cromosoma.
• Transferencia génica horizontal en microorganismos
(parcial y unidireccional)
• Parte del ADN de una célula dadora (exogenote) es
transferido a una célula receptora (endogenote
«recombinante»)
• La recombinación genética en procariotas puede
observarse a través de 3 procesos diferentes:
• Transformación (DNA libre)
• Transducción (virus)
• Conjugación (Plásmidos)
44
Recombinación Genética
45
Genética bacteriana
• Introducción
• Mutación
• Recombinación
– Transformación
– Transducción
– Conjugación
46
Transformación genética
Transferencia de genes por Adn libre, soluble,
desde una célula dadora a una receptora
48
49
50
Transformación genética
• Estado de competencia (células competentes):
célula capaz de tomar una molécula de DNA y ser
transformada.
• Solo algunas cepas son competentes y esta
capacidad es heredable y regulada por distintas
proteínas (proteínas de fijación de ADN a
membrana, nucleasas).
• Hay diferentes formas de incorporar DNA.
• Algunas Gram – sólo incorporan DNA doble cadena
(Haemophilus).
• Gram +, sólo DNA simple cadena (Streptococcus y
Bacillus).
• Influencia del tamaño, concentración y estado del51
ADN
Pasos:
• 1) El ADN se une a la
superficie celular por una
proteína de unión
• 2) Actúa una nucleasa.
• 3) Se asocia a proteínas
específicas de
competencia.
• 4) Se produce
recombinación (actúa la
Rec A).
52
Transformación genética
• Si las bacterias son transformadas con
ADN extraído de un virus bacteriano, este
proceso se conoce como transfección.
• Competencia inducida
– Altas concentraciones de iones calcio y luego
se mantiene en frío.
– Electroporación
– Protoplastos
53
Genética bacteriana
• Introducción
• Mutación
• Recombinación
– Transformación
– Transducción
– Conjugación
54
Transducción
• En la transducción el DNA se transfiere el DNA
bacteriano de una célula a otra por medio de
virus (fago transductor).
• 2 tipos:
– Transducción generalizada
– Transducción especializada
• Mutación
• Recombinación
– Transformación
– Transducción
– Conjugación
59
Conjugación
• Plásmidos
- Elementos genéticos que se replican
independientemente del cromosoma
del hospedador.
- Mayoría DNA bicatenario.
- Pueden estar desde 1 o 3 copias hasta
mas de 100 en una misma célula.
- Se replican de manera similar al
cromosoma genes para su
autoduplicación
- Una de las principales característica es
la de otorgar resistencias a distintos
tipos de antibióticos (Factor R).
- Genes que gobiernan la conjugación:
Factor F o de fertilidad (plásmidos Verde oscuro: genes de replicación.
conjugativos) Verde claro: genes de transferencia
- Episoma: plásmido insertado en el conjugativa.
cromosoma bacteriano Amarillo: elementos transponibles.
60
Conjugación
• Proceso de transferencia genética de ADN
extracromosomal (plásmido) de una célula
dadora a una receptora a través de un puente
de conjugación (pili) requiere contacto célula
a célula.
• Hay una célula donadora (macho) que contiene
el plásmido conjugativo (F+), y una célula
receptora (hembra) que carece de el (F-)
requiere células de tipo sexual opuesto.
• En E.coli el plásmido F codifica para pelos F.
• El DNA se transfiere como simple cadena y
forma la segunda cadena en la cepa receptora. 62
Rápida diseminación de plásmidos conjugativos,
63
con sus genes asociados
64
Conjugación con Cepas Hfr
(Alta frecuencia de recombinación)
65
- En conjugación: cromosoma de
cepa HFR se rompe en sitio de
unión de factor F.
- Transferencia de genes según el
lugar del cromosoma bacteriano
donde está integrado F; cuanto
más alejado un gen del lugar de
iniciación de la transferencia,
menor la probabilidad de ser
transferido.
- Después la transferencia:
Cepa HFR permanece como HFR
Receptora: no se convierte en HFR
o en F+
F’ F-
F+ F+
Hfr F’ F’
F-
67
F+ x F- = 2F+ Hfr x F- = Hfr +F- F´x F- = F´ x F´ diploides parciales
FACTORES DE RESISTENCIA A ANTIBIÓTICOS o FACTORES R
- Pueden ser transferidos por conjugación o también por transducción, “in vitro”
o “in vivo” lo cual constituye un serio problema para el tratamiento de algunas
enfermedades infecciosas de origen bacteriano.
69
SECUENCIAS DE INSERCIÓN
71
Transposición de transposones
72
Los TRANSPOSONES son de gran
importancia en la diseminación de la
resistencia a antibióticos
• Contienen genes de resistencia a antibióticos y
desempeñan un papel fundamental en la generación de
plásmidos R.
• Los plásmidos de múltiple resistencia a fármacos a menudo
se originan por acumulación de transposones en un único
plásmido.
• Dado que los transposones se desplazan entre los
plásmidos y los cromosomas primarios los genes de
resistencia pueden intercambiarse produciendo una mayor
diseminación de la resistencia a antibióticos.
73
Los elementos móviles tienen
efecto mutagénico
74
Diferencia entre plásmido y
transposón
75
T.P. Nº 5
Pruebas Bioquímicas
1
Especie bacteriana: colección de cepas que comparten propiedades estables y difieren
significativamente de otros grupos de cepas.
IDENTIFICACION DE UN MICROORGANISMO
2
Catalasa
Oxidasa
Hidrólisis de almidón
Motilidad
Sensibilidad a antibióticos
IMViC
Pruebas bioquímicas para la
Agar Hierro-Dos azúcares de Kligler identificación de
API 20E enterobacterias
3
Prueba de la Oxidasa
(citocromo C oxidasa)
Vibrio
Aeromonas
Pseudomonas
Escherichia coli
4
Prueba de la Oxidasa
(citocromo C oxidasa)
Se utiliza un donor de
electrones artificial (tetrametil-
p-fenilenediamina).
Reacción + Reacción -
Vibrio Enterobacterias
Aeromonas
Pseudomonas
5
Prueba de la Catalasa
6
Prueba de la Catalasa
7
Prueba de la Catalasa
- +
Reacción + Bacillus
Aerobios estrictos o Staphylococcus
Ensayo: facultativos
Enterobacterias
Se toman bacterias de un cultivo
sólido y se esparcen con ansa sobre
una gota de peróxido de hidrógeno
30%.
Reacción - Clostridium
Streptococcus
Anaerobios estrictos o
microaerófilos
Lactobacillus
8
Hidrólisis de almidón
- +
Reacción +
(Halo transparente)
Agregado de Bacillus
Lugol
Agar - almidón
9
Motilidad
Se detecta la presencia de flagelo bacteriano.
10
Sensibilidad a antibióticos
Mecanismos de acción
Inhibición de la síntesis de la pared (Penicilina, Ampicilina,
Carbenicilina, Cefalosporinas, Vancomicina, etc.)
11
Sensibilidad a antibióticos
12
Sensibilidad a antibióticos
Metodología de trabajo:
Se mezcla el cultivo con agar blando (0,7%) y se vuelca sobre una placa de agar nutritivo.
13
Prueba de la Coagulasa
La coagulasa es un enzima capaz de desnaturalizar la bibrina del plasma.
Objetivo: buscar en factor de aglutinación de los microorganismos cuando
estos se mezclan con el plasma. Esta prueba se utiliza para diferenciar
microorganismos del genero Staphylococcus.
Procedimiento: Preparamos una mezcla de 0,1 ml. de CCC (caldo cerebro
corazon) y 0,3 ml. de plasma de conejo en un tubo de ensayo previamente
esterilizado. La muestra ya contiene cepas de St. Aureus. Tapamos el tubo de
ensayo con algodón hidrofílico y lo llevamos a baño María a 37° C durante
una hora, observando la muestra cada 15 minutos. Al completa la hora,
sacamos las muestras y observamos sus resultados.
Resultados: Se consideran positivos los niveles 3 y 4.
1: pequeños coágulos no organizados
2: pequeños coágulos organizados
3: gran coágulo organizado
4: todo el contenido aparece coagulado y se mantiene cuando invierte el
tubo.
14
Pruebas bioquimicas para la
identificación de Enterobacterias
1) IMViC
a)Prueba del Indol
b)Rojo Metilo
c)Voges Proskauer
d)Prueba del citrato
15
1) IMViC
a) Prueba del Indol
Indol: Subproducto de la degradación del aminoácido Triptofano
por la enzima triptofanasa.
16
Fermentacion:
Tipos de Fermentación
1) Láctica
2) Alcohólica
3) Propiónica
4) Butilenglicólica
5) Ácido Mixta
6) Aceto-Butírica
17
Fermentación Butilenglicólica
Enterobacter
Serratia
Erwinia
Bacillus
18
Fermentación Ácido
Mixta
Escherichia, Salmonella,
Proteus, etc.
19
1) IMViC
b) Rojo de Metilo
Reacción – Reacción +
(Amarillo) (Rojo)
Incubación 48h a 37ºC
Enterobacter E. coli
Klebsiella
20
1) IMViC
c) Voges Proskauer
E. coli Enterobacter
Klebsiella
21
1) IMViC
d) Prueba del Citrato
Este ensayo pone en evidencia la capacidad del microorganismo de utilizar
citrato como única fuente de carbono.
E. coli Salmonella
Shigella Enterobacter
Klebsiella
22
1) IMViC
I M V C
Escherichia coli + + _ _
Proteus mirabilis _ _
+ +
_ + _
Salmonella +
_ _
Enterobacter + +
Klebsiella _ _
+ +
23
2) Agar Hierro-Dos azúcares de Kligler
Medio de cultivo para la diferenciación de enterobacterias en base a su capacidad para
fermentar glucosa y lactosa, y para producir ácido sulfhídrico.
Tiosulfato de sodio.
Citrato de hierro y amonio. El tiosulfato de sodio se reduce a sulfuro de
hidrógeno, el cual reacciona con la sal de hierro
produciendo sulfuro de hierro (precipitado negro) .
24
10/3/2008
25
2) Agar Hierro-Dos azúcares de Kligler
Medio de cultivo para la diferenciación de enterobacterias en base a su capacidad para
fermentar glucosa y lactosa, y para producir ácido sulfhídrico.
26
API 20E
27
10/3/2008
API 20E
28
QUE ES LA
BIORREMEDIACION?
Biorremediación
Biorremediación
Se refiere al espectro de métodos que utilizan organismos
(como bacterias, plantas, hongos, etc.) o productos
metabólicos obtenidos a partir de ellos para degradar
contaminantes orgánicos peligrosos o convertir
contaminantes inorgánicos en compuestos
ambientalmente menos tóxicos o no tóxicos.
PRINCIPIO DE LA
BIORREMEDIACION
La biorremediación se basa
en la idea de que los
organismos son capaces de
tomar cosas del ambiente y
usarlas para su crecimiento.
En esta característica se
fundamenta el principio de la
biorremediación; usar
organismos para que tomen
sustancias contaminadas del
medio ambiente y las
conviertan en una forma no
tóxica. Algunas bacterias,
protistas, y hongos son muy
buenos en la degradación de
moléculas complejas.
PARA QUÉ NOS SIRVE LA
BIORREMEDIACIÓN?
La naturaleza tiene una cierta capacidad de limpieza de
los elementos contaminantes.
• Temperatura.
• Disponibilidad de nutrientes
inorgánicos (fuentes de fósforo y
nitrógeno).
• pH.
• Concentración de metales pesados.
• Concentración de bacterias.
BIORREMEDIACION
ATENUACION
IN SITU EX SITU
NATURAL
BIOESTIMULACION BIOAUMENTACION
TIPOS DE BIORREMEDIACIÓN…
A t e n u a c i ó n
natural: El propio medio ambiente
resuelve el problema si se dan las condiciones
óptimas, aunque se controla el proceso por si
se produjesen compuestos tóxicos secundarios.
In-situ:
Ventajas de la biorremediación:
BIORREMEDIACION
ATENUACION
EX SITU IN SITU
NATURAL
• Lodos activados.
DESVENTAJAS
Ò Rígido control operacional.
Ò Baja resistencia a carga de choque.
Ò Inestabilidad en la decantabilidad del lodo.
VENTAJAS DE LA BIOMASA FIJA