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El neurocientífico
http://nro.sagepub.com/

MicroRNAs as Neuronal Fate Determinants


Malin Åkerblom and Johan Jakobsson
Neuroscientist publicado online el 22 de julio de
2013.
DOI: 10.1177/1073858413497265
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http://nro.sagepub.com/content/early/2013/07/22/1073858413497265

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¿Qué es esto?

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2013
Artícul
o
El Neurocientífico XX(X)

Los microARN como


1-8
© The Author(s) 2013
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neuronal DOI: 10.1177/1073858413497265


nro.sagepub.com

Malin Åkerblom1 y Johan Jakobsson1

Resumen
Desde que hace 20 años se descubrieron los microARN (miARN) cortos y reguladores, la comprensión de su impacto
en la regulación génica ha aumentado espectacularmente. La diferenciación de las células requiere cambios
exhaustivos en las redes reguladoras a todos los niveles de la expresión génica. La regulación postranscripcional
por miARN conduce a rápidas modificaciones en el nivel proteico de grandes redes génicas, por lo que no es de
extrañar que se haya descubierto que los miARN influyen en el destino de las células en diferenciación. Varios
estudios recientes han demostrado que la sobreexpresión de un único miARN en diferentes contextos celulares
provoca la diferenciación forzada de las células nerviosas. La pérdida de este miARN limita la neurogénesis y
favorece la gliogénesis. Este miARN, miR-124, es probablemente el ejemplo mejor documentado de miARN que
controla la determinación del destino de las células nerviosas. En esta revisión resumimos los hallazgos recientes
sobre miR-124, los posibles mecanismos moleculares utilizados por miR-124 para impulsar la diferenciación
neuronal, y esbozamos futuras direcciones.

Palabras clave
microARN, célula madre neural, miR-124, diferenciación, destino celular

comprensión de la forma en que los miARN controlan la


Introducción determinación del destino neuronal podría, en última
La neurogénesis, la formación de nuevas células instancia, aprovecharse para mejorar la reprogramación
nerviosas a partir de células madre/progenitoras neurales celular y el desarrollo neuronal.
(NSPC), está estrechamente controlada a nivel
molecular. Los microARN (miARN) son ARN
pequeños, de 21 a 23 nucleótidos de longitud,
monocatenarios y de expresión endógena, que han
demostrado desempeñar un papel fundamental en este
proceso (Bartel 2009; Shi y otros 2010). El miARN
maduro se produce inicialmente a partir de un miARN
primario más largo, que se transcribe a partir de un gen
codificador de miARN. Mientras permanece en el
núcleo, es escindido por la enzima ARNasa III Drosha,
parte del complejo microprocesador, formando un
miARN precursor. Una vez exportado fuera del núcleo,
es reconocido por la enzima Dicer de ARNasa III, que
escinde el miARN a su forma madura. El miARN se
incorpora al complejo de silenciamiento inducido por
ARN (RISC) y guía a este complejo hasta las regiones 3′
no trans- ladas (UTR) complementarias de los ARNm,
donde actúa degradando o reprimiendo la traducción
(Bartel 2009) (Fig. 1).
Un solo miARN puede tener cientos de genes diana,
y se han identificado más de mil miARN en células
humanas. Además, cada gen diana puede tener sitios de
unión para varios miARN, lo que sugiere un papel
amplio y complejo de los miARN en la traducción de
proteínas (Griffiths-Jones 2006). Una mayor
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2 ayudar al desarrollo de nuevas dianas moleculares en El Neurocientífico XX(X)
estados patógenos.

Los miARN en el desarrollo cerebral


Para comprender la importancia de los miARN en el
desarrollo cerebral, se han generado ratones knockout
de la enzima Dicer para eliminar la mayoría de los
miARN maduros. La supresión de Dicer en ratones
provoca la muerte antes de la formación del eje
(Bernstein y otros, 2003). La ablación condicional de
Dicer durante el desarrollo del cerebro provoca
importantes alteraciones celulares, histo- lógicas y
anatómicas, lo que sugiere un papel de los miARN en
este proceso (Davis y otros 2008; De Pietri Tonelli y
otros 2008; Kawase-Koga y otros 2009). Sin embargo,
el propio Dicer tiene otras funciones (Kaneko y otros
2011), y la alteración de este gen podría dar lugar a
consecuencias celulares independientes del miARN,
complicando la conclusión de los fenotipos observados.
Además, la larga vida media de ciertos miARN debe
tenerse en cuenta al analizar knock-outs condicionales
(Konopka y otros 2 0 1 0 ), lo que complica aún más

1Laboratorio de Neurogenética Molecular, Departamento de


Ciencias Médicas Experimentales, Centro de Neurociencias Wallenberg
y Centro de Células Madre de Lund, Universidad de Lund, Lund,
Suecia.
Autor correspondiente:
Johan Jakobsson, Departamento de Ciencias Médicas Experimentales,
Centro de Neurociencias Wallenberg, BMC A11, 221 84 Lund, Suecia.
Correo electrónico: johan.jakobsson@med.lu.se

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Figura 1. La vía de biogénesis de los miARN. 1. El gen que codifica el miARN es transcrito por la ARN polimerasa II,
produciendo un miARN primario (pri-miARN). 2. 2. El pri-miARN es posteriormente escindido por Drosha, parte del
complejo microprocesador, en un precursor (pre-miARN). 3. 3. El pre-miARN se exporta fuera del núcleo. 4. 4. Dicer lo
escinde hasta su longitud madura. 5.
El miARN maduro se incorpora al RISC, donde se une a la 3′ UTR de su ARNm diana. 6. 6. Se inhibe la traducción del ARNm
en proteína.

la interpretación tras la ablación de Dicer. Por lo tanto, mostraron graves implicaciones en el desarrollo cerebral
son necesarios estudios adicionales en los que se alteren (Shibata y otros, 2011). Aunque estos estudios
miARN individuales para comprender su verdadera demuestran la importancia de miR-9 y miR-124, será
función. Por desgracia, se trata de una tarea complicada necesario eliminar las tres copias de estos miARN para
porque (a) una especie de miARN puede estar codificada comprender plenamente su papel en el cerebro en
en múltiples regiones del genoma, (b) puede estar desarrollo, ya que es probable que los transcritos
localizada dentro de genes, o (c) está situada en grupos restantes compensen parcialmente las isoformas
con otros miARN (Griffiths-Jones 2006). eliminadas.
miR-9 y miR-124, dos miARNs conocidos por su Recientemente, se han desarrollado enfoques
implicación en la neurogénesis, se transcriben desde tres alternativos para inhibir permanentemente el miARN,
loci diferentes en ratones y humanos (miR-9-1, miR-9-2, como el uso de vectores virales esponja (Gentner y
miR-9-3 y miR-124-1, miR-124-2, miR-124-3, otros, 2009). Las esponjas son transcritos transgénicos
respectivamente), pero sus secuencias maduras son c o m p l e m e n t a r i o s al miARN maduro, excepto
idénticas y se conservan entre especies (Griffiths-Jones por una región de aproximadamente cuatro pares de
2006). Sanuki y cowork-ers (2011) hicieron un knockout bases que forma una protuberancia al emparejarse.
de miR-124-1 agotando el ARN no codificante reti- nal Como resultado, el miARN diana es secuestrado o
3 (Rncr3), que es la fuente dominante de miR-124. La degradado y no puede inhibir sus dianas naturales de
pérdida de miR-124-1 resultó en disfunción neuronal y ARNm (Ebert y otros 2007). Se ha demostrado que el
maduración neuronal aberrante (Sanuki y otros 2011). uso de vectores virales para expresar de forma estable la
Para miR-9, se ha generado un ratón knockout de miR- secuencia esponja inhibe eficazmente la actividad del
9-2 y miR-9-3. Estos ratones miARN y es un enfoque prometedor para los estudios de
pérdida de función del miARN (Akerblom y otros 2012;
Bhalala y otros 2012;

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Figura 2. Expresión y función de miR-124 en la zona subventricular adulta Expresión y función de miR-124 en la zona
subventricular adulta. (A) miR-124 no se expresa en las células madre neurales (NSC); su expresión se inicia en la fase de
progenitor neural y aumenta con la maduración neural. (B) Cuando se suprime miR-124 en las NSC, se bloquea la neurogénesis y
se estimula la gliogénesis. Por el contrario, la sobreexpresión de
miR-124 en NSCs conduce a la maduración neural precoz y a la pérdida de automantenimiento de las NSCs.

Gentner y otros 2009; Luikart y otros 2011; Mei y otros miR-124 representa entre el 25% y el 50% del miARN
2011; Pathania y otros 2012). El uso de vectores que total del cerebro adulto, y su elevada expresión se ha
expresan esponjas es un avance factible en la confirmado en muchos estudios (revisado en Gao 2010).
eliminación permanente de un miARN individual Su expresión se inicia en algún momento durante el
durante el desarrollo del cerebro, sorteando las proceso de diferenciación de célula madre neural (NSC)
desventajas de la eliminación de miARN o Dicer. a célula precursora neural, y los niveles se acumulan en
Posiblemente, la generación de ratones transgénicos que la maduración neural (Fig. 2A) (Akerblom y otros 2012;
expresen esponjas podría inhibir de forma estable la Cheng y otros 2009; Krichevsky y otros 2006; Maiorano
familia de miARN deseada. Otro enfoque podría ser el y Mallamaci 2009), lo que sugiere que desempeña un
uso de la electroporación in utero para papel central en la regulación de los transcritos, y por lo
i n t r o d u c i r esponjas en un momento temprano tanto de los productos proteicos, en las células
y específico del desarrollo. Este método tiene la ventaja nerviosas. No se expresa en otros tipos celulares del
de dirigirse a zonas específicas del cerebro. Así pues, SNC, como las células ependimarias, los astrocitos, la
existen posibilidades de utilizar tecnologías novedosas microglía, los oligodendrocitos o las NSC (Akerblom y
para estudiar la pérdida de función de miARN otros, 2012).
individuales durante el desarrollo cerebral. Hay varios estudios que demuestran que la
sobreexpresión de miR-124 en progenitores neuronales,
miR-124 como determinante del células madre embrionarias y células de glioma provoca
una diferenciación neuronal forzada (Krichevsky y
destino neuronal otros, 2006; Lang y otros, 2012; Lim y otros, 2005;
El miR-124 fue descrito por primera vez como un Silber y otros, 2008; Smirnova y otros, 2005; Xia y
miRNA específico del cerebro y, más recientemente, otros, 2012). La sobreexpresión de miR-124 da lugar a
como específico de las neuronas. En 2002, Lagos- un aumento de la expresión de marcadores neuronales,
Quintana y colaboradores estimaron que así como de la morfología de las neuronas.
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Figura 3. Genes diana y vías de m i R - 1 2 4 . Resumen de genes diana de miR-124 y vías importantes en la determinación
del destino neural.

cambios que incluyen un mayor crecimiento de las En conjunto, estos datos sugieren que miR-124 actúa
neuritas y una mayor com- plejidad (Sanuki y otros, como determinante del destino neuronal en las NSPC.
2011; Yoo y otros, 2011). Estudios in vivo han
demostrado que miR-124 puede promover la
neurogénesis durante el desarrollo cerebral, así como en
Objetivos moleculares de miR-124
el nicho de células madre de la zona subventricular Como se ha mencionado anteriormente, la
(SVZ) adulta (Akerblom y otros, 2012; Cheng y otros, sobreexpresión de miR-124 provoca la diferenciación
2009). El efecto de miR-124 parece ser, al menos hasta forzada de progenitores a neuronas. Como los miARN
cierto punto, independiente del contexto celular. Un actúan como represores, esto sugiere que miR-124
ejemplo clásico es la administración de dúplex de miR- bloquea las vías que mantienen los estados
124 a células HeLa, que induce un perfil genético madre/progenitor y también bloquea las vías que
neuronal (Lim y otros, 2005). Más recientemente, se ha conducen a destinos celulares alternativos, como hacia
demostrado que la expresión de miR- 124 (cuando se la glía. Así pues, es probable que miR-124 medie sus
sobreexpresa junto con miR-9*) en fibroblastos induce efectos de forma compleja en varios niveles. De acuerdo
la conversión a neuronas (Yoo y otros 2011). Además, la con esto, las predicciones computacionales y los
represión de PTBP en fibroblastos, que es suprimida por enfoques experimentales sugieren que miR-124 tiene el
miR-124 durante el desarrollo normal del cerebro (véase potencial de regular cientos de genes diana. Se han
más adelante), es suficiente para transdiferenciar sugerido y verificado experimentalmente varios genes
fibroblastos en neuronas (Xue y otros 2013). Estos individuales, así como redes reguladoras, como dianas
estudios sugieren que miR-124 tiene un papel instructivo funcionales de miR-124 (Fig. 3).
en la promoción de la diferenciación neuronal. El factor de transcripción silenciador RE1 (REST)
Los estudios de pérdida de función de miR-124 en inhibe los genes neurales en células no neurales
NSPCs han dado resultados más inconsistentes, mediante el reclutamiento de histonas desacetilasas. La
probablemente debido a problemas técnicos. Sin regulación a la baja oportuna de REST conduce a la
embargo, recientemente hemos utilizado vectores diferenciación neuronal (Qureshi y otros 2010). En
lentivirales esponjosos para suprimir permanentemente neuronas, miR-124 inhibe REST, permitiendo que se
miR-124 en el nicho de células madre de la SVZ adulta. expresen genes neuronales. Sin embargo, en las células
Este experimento demostró que la neurogénesis estaba no neuronales miR-124 es silenciado por REST. Así,
regulada a la baja y era sustituida por la gliogénesis (Fig. miR-124 y REST actúan de forma recíproca (Conaco y
2B), con el resultado de que los astrocitos migraban al otros 2006; Visvanathan y otros 2007; Yoo y otros
bulbo olfatorio (Akerblom y otros, 2012). 2009) para establecer el
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neuronal. Además, el pequeño dominio c-terminal de la junto con miR-9*, es responsable de la represión de
fosfatasa 1 (SCP1) es otro importante factor no neuronal BAF53a, permitiendo que
cuya regulación a la baja es necesaria para promover la
diferenciación neuronal. SCP1 es reclutado por genes
neurales que contienen RE1, vinculándolo a la vía
reguladora REST. miR-124 suprime SCP1 en la médula
espinal en desarrollo, lo que a su vez promueve la
diferenciación neural (Visvanathan y otros 2007).
Además, los enfoques computacionales encontraron
sitios de unión de miR-124 en las 3′ UTRs de MeCP2 y
coREST (Wu y Xie 2006). Así pues, miR-124 tiene
varias dianas en la vía REST y, por tanto, confiere
identidad neuronal.
La vía de señalización Notch controla el
mantenimiento de las NSPC (Louvi y Artavanis-
Tsakonas 2006). El receptor transmembrana Notch se
expresa en las NSC y, al unirse a su ligando
transmembrana Jagged1 (Jag1), se promueve la
autorrenovación de las células madre neu- rales y se
inhibe la diferenciación (Imayoshi y Kageyama 2011).
miR-124 suprime Jag1 y, por tanto, permite la salida del
estado de no diferenciación (Cheng y otros 2009; Liu y
otros 2011). El factor de transcripción Sox9, que regula
la especificación del destino glial durante el desarrollo,
es otro objetivo de miR-124 en la SVZ (Cheng y otros,
2009). Es probable que la supresión de Sox9 participe en
la función de miR-124 de bloquear la gliogénesis.
Además, se ha informado de que miR-124 promueve
la diferenciación neuronal desencadenando el splicing
alternativo de pre-mRNA específico del cerebro (Makeyev
y otros, 2007). PTBP1 es un represor global del splicing
alternativo en células no neurales. PTBP1 se dirige al
pre-ARN de PTBP2 dejando fuera un exón importante
(Spellman y Smith 2006). Durante la diferenciación
neuronal, miR-124 regula a la baja PTBP1, dando lugar
a la acumulación de proteína PTBP2 correctamente
empalmada y aumentando los patrones de empalme
alternativo específicos del cerebro (Makeyev y otros
2007). Además, PTBP tiene el potencial de regular toda
la maquinaria de miARN enmascarando los sitios de
unión de miARN en el ARNm (Xue y otros 2013).
Como miR-124 suprime PTBP, se puede formar una
hipótesis interesante que miR-124 controla toda la vía
miRNA y de esa manera gobierna el destino celular.
Un paso importante en la formación de nuevas
células nerviosas es la salida mitótica, cuando las NSPC
pierden su capacidad de autorrenovación y empiezan a
diferenciarse y a formar conexiones estables. Durante el
desarrollo, la transición se asocia a un cambio en el
mecanismo de remodelación de la cromatina
dependiente del ATP. En el complejo BAF específico de
progenitores neurales (npBAF), las subunidades se
sustituyen para formar un BAF específico de neuronas
(nBAF); la expresión de BAF53a en npBAF permite que
BAF53b se exprese en nBAF, lo que conduce al
desarrollo neural postmitótico y a la morfogénesis
dendrítica. Si falla el cambio de subunidades, los ratones
presentan defectos en el cierre del tubo neural. miR-124,
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BAF53b se exprese. Esta expresión es necesaria para la
pérdida de proliferación y crecimiento dendrítico (Yoo y
otros 2009).
En conjunto, estos estudios confirman que miR-124
actúa sobre una amplia red de genes y vías en las
NSPCs (Fig. 3). Aún no se conocen completamente los
mecanismos moleculares que subyacen a la capacidad
de miR-124 para promover la diferenciación neuronal.
Los estudios futuros deberían tener como objetivo
proporcionar datos experimentales sobre el conjunto
completo de dianas de miR-124 en las NSPCs. Tales
estudios son necesarios para apreciar exactamente cómo
este miARN puede mediar sus efectos pro neuronales.

miR-124 en otras especies


La secuencia madura de miR-124 y su expresión
enriquecida en el cerebro están bien conservadas entre
especies. Sin embargo, los estudios mencionados se han
realizado principalmente en ratones, y cada vez está más
claro que el papel funcional de miR- 124 difiere en los
invertebrados. En Aplysia californica, miR-
124 se expresa en neuronas sensoriales e inhibe la
transmisión inducida por serotonina mediante la
regulación de CREB (Rajasethupathy y otros 2009), un
activador transcripcional necesario para la potenciación
a largo plazo. La supresión de miR-124 en
Caenorhabditis elegans no produjo defectos aparentes
en la diferenciación de neuronas sensoriales (Clark y
otros 2010). En Drosophila melanogas- ter, miR-124 se
expresa en precursores neuronales en proliferación y en
neuronas postmitóticas en diferenciación (Weng y
Cohen 2012). El knockout completo de miR-124 en
Drosophila resultó en un comportamiento casi normal
de las moscas y eran totalmente viables con una vida
más corta (Sun y otros 2012; Weng y Cohen 2012). A
diferencia de los ratones, miR-124 es necesario para
apoyar la proliferación de neuroblastos y no para
promover la diferenciación (Weng y Cohen 2012).
Además, los genes diana de miR-124 son diferentes
entre vertebrados e invertebrados. Estos estudios
señalan una divergencia en el papel funcional de miR-
124 entre invertebrados y vertebrados como los ratones.

Expresión de miRNAs en NSCs y su


importancia en la neurogénesis
Como se ha mencionado anteriormente, miR-124 no se
expresa en las NSPC y no se inicia hasta que ha
comenzado el proceso de diferenciación neuronal. Por lo
tanto, es posible que otros miRNAs, que están presentes
en la población progenitora real, puedan contribuir a la
determinación del destino neuronal. Por ejemplo, Let-7
es la familia de miARNs más expresada en las NSPCs, y
constituye más del 50% de todos los miARNs en este
tipo celular, lo que sugiere que la familia Let-7 tiene un
gran impacto en la neurogénesis y como determinantes
del destino neuronal (Marson y otros 2008; Wulczyn y
otros 2007; Zhao y otros 2010). Otros miRNAs que son

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altamente expresados en NSPCs son miR-103, miR- otros ARN no codificantes, como los ARN no codificantes
181a/b, miR17-20, miR-130/301, miR-21, miR-15/16, largos (lncARN), los ARN que interactúan con piwi
miR-9,
y miR-26, identificados mediante una secuenciación de
ARN pequeños (Marson y otros 2008). Además, miR-
125b y miR-132 se han relacionado con la neurogénesis
(Franke y otros 2012; Le y otros 2009; Luikart y otros
2011; Magill y otros 2010; Pathania y otros 2012; Yoo y
otros 2009). El papel funcional de estos miRNAs en la
neurogénesis permanece en gran parte inexplorado, y
será muy interesante seguir futuros estudios que
investiguen el papel del miRNome en las NSPCs.

Conclusión
Es tentador argumentar que miR-124 tiene un papel
poderoso e instructivo en el gobierno de la neurogénesis
y la diferenciación neuronal. Esto se sugiere fuertemente
por (a) su expresión y aumento de la actividad en el
proceso de diferenciación neuronal, (b) la presencia de
neuronas disfuncionales en un knockout de dos de los
tres genes de miR-124, y (c) el cambio del destino
celular hacia la gliogénesis después del knockdown de
miR-124 en células de la SVZ. La sobreexpresión de
miR-124 en diferentes tipos celulares es potente y
promueve un cambio hacia el destino neuronal,
probablemente independiente del con- texto celular. La
sobreexpresión de miR-124 en neuronas o NSPCs
produce diferenciación precoz, promoción de la
neurogénesis, expresión regulada al alza de marcadores
neuronales, así como cambios morfológicos. La
generación de ratones knockout condicionales capaces
de suprimir las tres copias del gen miR-124 contribuiría
enormemente a comprender con exactitud el papel
funcional de miR-124 en el cerebro y en la
neurogénesis.
Se han validado varios genes diana de miR-124, y
aunque todos ellos pueden ser importantes, el panorama
dista mucho de ser completo. miR-124 actúa muy
probablemente dirigiéndose a cientos de ARNm
implicados en diferentes redes génicas. La posibilidad
de que miR-124 pueda influir en toda la vía reguladora
de los miARN (regulando la PTB) lo convierte en un
miARN de acción potencial muy amplia. El uso de
técnicas como HITS-CLIP (Chi y otros 2009) para
identificar experimentalmente dianas de miR-124 en
NSPCs a gran escala ayudaría enormemente a clarificar
cómo actúa miR-124 a nivel molecular.
No todos los miARN influyen tanto en la regulación
génica como el miR-124. Muchos estudios confirman un
papel modesto de los miARN individuales en la
regulación de la expresión génica (Ebert y Sharp 2012).
Sin embargo, cada vez hay más pruebas de que distintos
miARN desempeñan funciones combinatorias y
sinérgicas. Así lo ejemplifican Yoo y otros (2009), que
demostraron que tanto miR-9* como miR-124 eran
necesarios para reprogramar fibroblastos y convertirlos
en neuronas. Además, existe un número creciente de
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8 El Neurocientífico
miR-124 regula la neurogénesis adulta en el XX(X)
nicho de
(piRNA), ARN nucleolar pequeño (snoRNA) y
células madre de la zona subventricular. Nat Neurosci
ARN interferente pequeño (siRNA) que se han 12:399-408.
relacionado con funciones importantes en la
regulación génica (Qureshi y Mehler 2012). Además,
las esponjas circulares de expresión endógena, que
regulan la expresión de miARN, demuestran otro
nivel de regulación del ARN (Hansen y otros, 2013;
Memczak y otros, 2013). Por lo tanto, con el
miARN, es posible que solo hayamos empezado a
comprender el impacto de los ARN no codificantes
en la determinación del destino.
Dado que miR-124 desempeña un papel
poderoso e instructivo a la hora de dirigir la
diferenciación, resulta atractivo especular que los
efectos proneuronales podrían utilizarse con fines
terapéuticos. Hipotéticamente, miR-124 puede
explotarse para potenciar la formación de nuevas
células nerviosas utilizadas en la terapia de
trastornos neurodegenerativos como la enfermedad
de Parkinson. También podría utilizarse para
diferenciar las células madre de glioma hacia un
destino neuronal, frenando así la característica
oncogénica de estas células. En conclusión, un
mayor conocimiento de los mecanismos
reguladores de los miARN en la determinación del
destino facilitaría la búsqueda de nuevas dianas
moleculares para los trastornos cerebrales.

Acuse de recibo
Agradecemos a Josephine Malmevik sus excelentes
comentarios sobre el artículo.

Declaración de conflicto de intereses


Los autores declaran no tener ningún conflicto de
intereses en relación con la investigación, la autoría y/o la
publicación de este artículo.

Financiación
Los autores declararon haber recibido el siguiente apoyo
financiero para la investigación, autoría y/o publicación
de este artículo: Nuestra investigación cuenta con el
apoyo del Consejo Sueco de Investigación (subvención
n.º 2009-2483), la Fundación Sueca contra el Cáncer
(subvención n.º 2010/400) y la Fundación Sueca del
Cerebro.

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