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Los seres pluricelulares contienen generalmente millones de células, y estas a su vez contienen
de 15.000 a 50.000 genes de media. Los genes almacenan y expresan la información necesaria
para que los organismos desarrollen sus caracteres y transmitan esa información de una
generación a la siguiente. Las células madres pueden expresar todos los genes, en cambio las
células diferenciadas solo expresan una porción de los genes que desarrollan, solo los que
necesitan para sus funciones.
Los primeros experimentos fueron realizados por Griffith, un médico inglés que buscaba una
vacuna para la neumonía. En aquella época cuando no existían los antibióticos esta neumonía
bacteriana era muy grave. Se sabía que las bacterias poseían formas virulentas que eran las
causantes de la enfermedad y formas no virulentas. Las virulentas estaban cubiertas por una
cápsula lisa de polisacáridos que la protegía del sistema inmune, y las no virulentas carecían de
cápsula. La producción de esta cápsula es determinada de manera genética.
La investigación desarrollada por A. Hershey y M. Chase con baceriófagos, fue la clave para
llegar a la conclusión de que el DNA era el material genético. Cuando el fago infecta a la célula,
su DNA se inyecta en la bacteria dejando abandonada la cápsula vacía. El DNA contiene la
información necesaria y suficiente para reproducir nuevos fagos dentro de la bacteria.
La información genética que lleva el DNA se pone de manifiesto con la formación de proteínas,
muchas de ellas enzimas, que producirán los caracteres del individuo, como el color del pelo, la
altura, la forma de la nariz, etc. Estos compuestos orgánicos se forman en los ribosomas del
citoplasma, y el DNA no sale del núcleo en las células eucariotas, por lo que es necesario un
intermediario del DNA, que es el RNA. La síntesis de RNA a partir de DNA es la transcripción y
la formación de proteínas se llama traducción. En la traducción colaboran los 3 tipos de RNA
(mensajero, de transferencia y ribosómico) y los ribosomas ( ARNr y proteínas)
Hay un flujo de información genética irreversible que va desde el DNA al RNA y de este a las
proteínas.
Este flujo es conocido como el dogma central de la biología molecular. Se ha ampliado debido
a que existen virus que no llevan DNA como material genético, sino RNA, y son capaces de
hacer copias de su RNA mediante una enzima llamada RNA replicasa. Otros virus llamados
retrovirus, poseen una enzima que es la transcriptasa inversa, capaz de sintetizar DNA a partir
de su RNA.
El gen es la unidad mínima con función genética.
Hay pseudogenes que son genes que han sufrido procesos de mutaciones u otros fenómenos
de reorganización y han dejado de ser funcionales, pero siguen presentes en los genomas de
los seres vivos. El genoma contiene una cantidad elevada de DNA intergénico ( hasta un 98%)
que también se llama DNA basura.
Un gen se puede definir como la unidad mínima de función genética hereditaria. Los genes que
codifican proteínas o RNA son unidades de transcripción que además de intrones y exones
contienen regiones promotoras y secuencias reguladoras.
3. LA REPLICACIÓN.
La replicación o duplicación del DNA se produce durante la fase S de la interfase del ciclo
celular. A partir de una molécula de DNA “progenitora” se sintetizan dos moléculas idénticas,
con la misma secuencia que el DNA original. La manera en la que transcurre fue intuida por
J.D. Watson y F.H.C. Crick cuando establecieron la estructura de doble hélice del DNA, se
planteó el problema de cómo se replicaba el DNA y se propusieron tres soluciones.
MODELO CONSERVATIVO: En este modelo las dos cadenas de DNA parentales se vuelven a
juntar tras la replicación, de forma que una molécula contiene ambas cadenas parentales
antiguas, y la otra molécula contiene las dos cadenas del nuevo material sintetizado.
MODELO DISPERSIVO: La doble hélice se rompe en segmentos de doble cadena de DNA. Al
igual que en el modelo conservativo, actúan como moldes para la síntesis de nuevas
moléculas de doble hélice. Los segmentos se recomponen en dobles hélices de DNA
completas, cada una con segmentos intercalados de originales y nuevas.
MODELO SEMI-CONSERVATIVO: Las dos cadenas parentales del DNA se separan y sirven de
molde para la síntesis de una nueva cadena de DNA. El resultado son dos dobles hélices de
DNA, donde ambas están constituidas de una cadena antigua y una cadena nueva.
Cultivaron bacterias (E. colí) durante varias generaciones en un medio 15N para que el DNA de
la población incorporara el isótopo.
Transfirieron las bacterias a un medio con 14N, y dejaron que se produjeran varias generaciones
o ciclos de replicación-división en este medio.
Tomaron una muestra de bacterias tras cada generación, les extrajeron el DNA y lo
centrifugaron para comprobar cómo se incorporaba el 14N.
En la primera generación obtuvieron una sola banda en posición intermedia; este hecho les
indicó que todas las moléculas de DNA tenían la misma densidad y contenían 14N y 15N en las
mismas proporciones. Este resultado descartaba el modelo conservativo.
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1. Fase de iniciación.
La replicación comienza cuando múltiples copias de unas proteínas específicas llamadas DNA A
se unen a zonas concretas del origen de la replicación enrollando el DNA a su alrededor para
formar un gran complejo DNA-proteína. La función de las DNA A es reconocer el origen de
replicación, provocar la apertura de la burbuja y facilitar la entrada del resto de proteínas que
intervienen en el proceso. El complejo DNA-proteína se une a una helicasa, que es una enzima
que va rompiendo los enlaces de hidrógeno entre las bases nitrogenadas provocando la
apertura de la doble hélice, de forma que en esa zona se van separando las 2 cadenas de
nucleótidos. Como consecuencia de la separación de la doble hélice, se producen
superenrollamientos en el resto de la molécula, por lo que se necesita la presencia de una
enzima llamada toposiomerasas o girasas que rebajan la tensión y van desenroscando las
cadenas. Una vez separada las dos cadenas se mantienen abiertas gracias a la acción de las
proteínas SSB que se unen a las hebras individuales y las estabilizan. En el lugar de origen, se
forma una estructura llamada burbuja de replicación que se va abriendo en ambos sentidos,
dado que la replicación es bidireccional y da lugar a dos horquillas de replicación.
2. Fase de elongación
En esta fase se sintetiza una nueva hebra de DNA sobre cada hebra de la doble hélice original.
Intervienen las DNA polimerasas de varios tipos, las más importantes son las DNA polimerasas
I y III, cuya función es doble:
- ACTIVIDAD POLIMERASA: Realizada por la DNA polimerasa III. Unen entre sí los
nucleótidos que formarán el DNA. Para ello se recorren la hebra molde, seleccionan el
desoxirribonucleótido cuya base es complementaria con la de la hebra molde y lo
unen. La energía para el nuevo enlace se obtiene de la hidrólisis de los dos grupos
fosfatos del nucleótido entrante.
- ACTIVIDAD EXONUCLEASA (corrección de errores). Realizada por la DNA polimerasa I.
Eliminan nucleótidos cuyas bases nitrogenadas están mal apareadas, así como
fragmentos de RNA.
Las DNA polimerasa siempre unen nucleótidos siguiendo la dirección 5’-3’, es decir a partir de
un primer nucleótido se realizará un enlace fosfodiéster entre el radical hidroxilo (-OH) del
carbono 3’ de la desoxirribosa del primer nucleótido y el radical fosfato situado en el carbono
5’ de la desoxirribosa del segundo nucleótido.
Sin embargo, las DNA polimerasas no pueden iniciar de cero la síntesis de una nueva cadena
de DNA. En el punto de iniciación, de cada cadena de DNA molde, se necesita un pequeño
fragmento de RNA, de unos diez nucleótidos, denominado cebador, con un extremo hidroxilo
3’ libre al que añadir los nuevos nucleótidos. Este cebador es sintetizado por una RNA
polimerasa llamada primasa, que va uniendo esos nucleótidos en dirección 5’-3’.
Después interviene la DNA polimerasa III, que partiendo del cebador sigue la síntesis en
dirección 5’-3’. En cada horquilla hay una nueva hebra de DNA de dirección 5’-3’, que se
sintetiza de manera continua, en la misma dirección en que se mueve la horquilla de
replicación, recibiendo el nombre de hebra conductora o líder. En la otra hebra, también
llamada hebra retardada, se hace de manera discontinua y se requieren muchos cebadores. El
mecanismo de síntesis de la hebra retardada, consiste en una síntesis en una síntesis
discontinua de pequeños fragmentos de DNA de unos 1000 a 2000 nucleótidos (fragmentos de
Okazaki). Cada uno de los fragmentos requiere, cada ciertos intervalos de DNA, un cebador de
RNA sintetizado por la primasa. La DNA polimerasa I va eliminando el cebador y rellenando los
huecos con nucleótidos de DNA. Finalmente, la DNA ligasa suelda todos los fragmentos
obtenidos y la hebra retardada completa su síntesis.
3. Fase de terminación
La replicación en los procarióticos tiene origen en un único lugar y es bidireccional. Las dos
horquillas de replicación van avanzando en sentidos opuestos hasta llegar a un punto del
cromosoma bacteriano llamado Ter, situado en posición diametralmente opuesta al de
iniciación. El punto Ter está formado por una secuencia de nucleótidos a la que se fija una
proteína específica (proteína Tus); el complejo de proteínas Tus y secuencia Ter bloquea el
avance de las helicasas y la replicación termina.
La replicación del genoma eucariota transcurre en la fase S del ciclo celular de modo similar al
explicado para los procariotas: es semiconservativa y bidireccional; la hebra conductora se
sintetiza de manera continua y la retardada de forma discontinua, en forma de fragmentos de
Okazaki, que luego se unen; y también se requiere de un RNA cebador para dar comienzo al
proceso de replicación. Sin embargo, presenta una serie de diferencias.
El proceso de replicación del DNA se va completando hasta que se llega al extremo del
cromosoma, el telómero.
Cuando se elimina el último RNA cebador del extremo 5’ de cada una de las hebras retardadas,
el hueco que queda no lo puede rellenar las enzimas DNA polimerasas, porque no encuentra
extremos hidroxilos 3’ libres sobre los que adicionar nuevos nucleótidos, por lo que la hebra
retardada quedará incompleta. Por eso los telómeros llevan secuencias repetidas de
nucleótidos que no codifican proteínas.
Este hecho es el responsable de que el telómero se vaya acortando un poco cada vez que la
célula se divide, pudiendo suponer la pérdida de información genética importante, asociada a
los procesos de senescencia (envejecimiento) y muerte celular.
Para paliar el acortamiento de los cromosomas, los organismos eucarióticos tienen una enzima
específica, la telomerasa, una ribonucleoproteína con actividad polimerasa que posee como
grupo prostético un fragmento corto de RNA, que sirve como molde para sintetizar una cadena
complementaria de DNA. Esta enzima reconoce la cadena rica en Guanina de una secuencia
telomérica repetida y la alarga en el extremo 3’ del telómero, que tiene un grupo hidroxilo
libre, en dirección 5’-3’-
La acción de la telomerasa hace que la longitud se mantenga constante después de varios
ciclos de división, pero su acción no es igual en todo tipo de células. En los organismos
pluricelulares es muy activa en las células de la línea germinal, las embrionarias y las
cancerosas, pero no lo es tanto en las células somáticas en las que después de varias
divisiones, los telómeros se acortan, se pierde información, la célula se deteriora y muere.
Correccion de errores.
La DNA polimerasa III sólo une los nucleótidos complementarios a la cadena molde, a veces
hay errores que es necesario eliminar. Las enzimas nucleasas se encargan de quitar el
nucleótido mal emparejado.
PROTEÍNAS SSB: (single-stranded DNA binding) Mantiene abiertas y separadas las cadenas,
para que las polimerasa puedan actuar.
RNA-primasa: Sintetiza el cebador usando el molde de DNA y añade nucleótidos en sentido 5’-
3’.
DNA-polimerasa I: Elimina el RNA cebador, repara los errores de la síntesis de DNA y rellena
con desoxirribonucleótidos el hueco que ocupaban los ribonucleótidos de RNA cebador.
4. LA TRANSCRIPCIÓN.
La formación de RNA a partir de DNA se llama transcripción y la realizan enzimas llamadas RNA
polimerasas. Es el proceso por el cual se pasa de una secuencia de bases nitrogenadas del DNA
a una secuencia de bases nitrogenadas pertenecientes al RNA.
1. INICIACIÓN.
Comienza cuando la RNA polimerasa reconoce en el DNA que va a transcribir una señal que
indica que el proceso va a comenzar. Estas señales denominadas promotores son unas
determinadas secuencias cortas de bases nitrogenadas a las que se une la RNA polimerasa. El
promotor además indica cual será la cadena que actuará como molde.
En los procarióticos, la RNA polimerasa reconoce por sí misma al promotor, uniéndose a él. En
los eucarióticos se necesita la presencia de ciertas proteínas, llamadas factores de
transmisión, que se fijan en el promotor y es entonces cuando la RNA polimerasa II se une a éñ
y de comienzo a la transcripción. La RNA polimerasa hace que la doble hélice de DNA se abra y
se forme la burbuja de transcripción, quedando expuesta la secuencia de bases de DNA y
pudiéndose incorporar los ribonucleótidos que se van a unir para constituir el RNA.
En esta fase se produce la adición de sucesivos ribonucleótidos para formar el RNA. La RNA
polimerasa avanza a lo largo de la cadena molde de DNA “leyéndola” en sentido 3’-5’, mientras
que el sentido de la síntesis de RNA es 5’-3’. La enzima selecciona el ribonucleótido trifosfato
cuya base es complementaria con la de la cadena de DNA que actúa como molde y lo une
mediante un enlace éster al siguiente nucleótido, liberando un resto PPi en cada unión.
3.TERMINACIÓN DE LA TRANSCRIPCIÓN.
La RNA polimerasa reconoce en el DNA unas señales de terminación que indican el final de la
transcripción. Esto implica el cierre de la burbuja de transcripción formada en el DNA y la
separación de la RNA polimerasa del RNA transcrito.
En las células procariotas no hay núcleo con lo que la transcripción y posterior traducción
tienen lugar a la vez y en el mismo sitio, en el citoplasma, mientras que en eucariotas son
procesos separados en el espacio y en el tiempo, la transcripción tiene lugar en el núcleo.
En eucariotas maduran todos los RNA, en procariotas no hay exones ni intrones, solo maduran
el RNAt i el RNAr.
En eucariotas todos los genes estructurales son monocistrónicos, esto quiere decir que la
molécula transcripta de RNAm solo lleva la información de una proteína; en cambio en
procariotas puede ser mono o policistrónico, puesto que la secuencia de DNA que se
transcribe en una cadena larga de RNA incluye varios puntos posibles de inicio de traducción,
por tanto la cadena de RNAm contiene información sobre más de un polipéptido en el mismo
mensaje.
Una vez que se han unido unos 30 nucleótidos de la molécula del RNA transcripto se añade un
resto de metil-GTP en el extremo 5’ inicial, esta caperuza servirá como señal de inicio en el
proceso de traducción. Tras separarse el RNA del DNA, se une al extremo 3’ final de una
secuencia de 200 nucleótidos de adenina, llamados cola poli-A, que promueven el transporte
de la molécula desde el núcleo al ribosoma. La caperuza y la cola ayudan al RNAm a unirse al
ribosoma y protegen la molécula de la digestión enzimática.
La molécula de RNA contiene exones, que se conservan en el RNAm madura, pues constituyen
el mensaje que se va a expresar e intrones que interrumpen el mensaje, por lo que se
transcriben pero no se traducen. Los intrones son eliminados a través del proceso de corte con
ayuda de ribozimas (splicing) que unen los exones para formar una secuencia continua que
codificará un polipéptido funcional.
Dentro del epliceosoma , las RNPpn aparean sus bases con nucleótidos situados en lugares
específicos a lo largo del intrón; como consecuencia los intrones forman unos bucles que
provocan el acercamiento de los extremos de los exones; finalmente se produce el corte de los
intrones y la unión de los exones, por acción de una RNA ligasa, para formar un RNAm que ya
está en condiciones para salir del núcleo.
5. LA TRADUCCIÓN.
El código genético.
- Para descifrar el código se utilizó como hipótesis que cada tres bases nitrogenadas
codifican un aminoácido, ya que el número de posibles secuencias formadas por tres
nucleótidos es 64 (43= 64). A cada una de estas combinaciones se la denomina codón.
- Los trabajos partieron del descubrimiento realizado por Severo Ochoa, de la enzima
polinucleótido fosforilasa, que cataliza la síntesis de RNAm sin necesidad de utilizar un
molde de DNA. Une los ribonucleótidos que se encuentran en el medio. Ochoa
desarrolló un procedimiento de laboratorio con el que obtuvo un RNA al que llamó
“poli U”, formado exclusivamente por uracilo.
- En 1961, M. W. Nirenberg y J. H. Mattahei demostraron que el RNA dirige la síntesis
de proteínas. Emplearon extractos de E. coli que no contenían RNA y les añadieron
aminoácidos marcados radiactivamente y extractos no purificados de RNA
procedentes de diversas fuentes. Observaron que se sintetizaban pequeñas cantidades
de proteínas marcadas radiactivamente, lo que significaba que el RNA aunque fuese
ajeno a la bacteria, era capaz de dirigir la síntesis de estas proteínas. Luego, utilizando
el polinucleótido descubierto por Severo Ochoa, consiguieron demostrar que el “poli
U” codificaba un polipéptido formado por la repetición de un solo aminoácido, la
fenilalanina.
1. UNIVERSAL: Todos los organismos, incluidos los virus utilizan el mismo código
genético, salvo excepciones con pequeñas diferencias. Esto resplada la hipótesis de
que todos los organismos de la Tierra están relacionados y posibilita la transferencia
de genes mediante técnicas de ingeniería genética.
2. DEGENERADO: Todos los aminoácidos excepto la metionina y el triptófano están
codificados por más de un codón, es decir, hay codones sinónimos. Siendo una ventaja
en las mutaciones.
3. ES ARBITRARIO: No conocemos las razonas que relacionan un triplete de RNAm con su
aminoácido correspondiente.
4. Es ESPECÍFICO: Ningún codón codifica más de un aminoácido.
5. Es CONTINUA: No presenta solapamiento ni discontinuidades. Los codones se hallan
dispuestos de manera lineal y continua, donde una base no puede pertenecer a la vez
a los dos tripletes consecutivos y no puede quedar suelta.
FASE DE ACTIVACIÓN.
Los RNAt tienen forma de hoja de trébol y en ellos existen dos zonas especialmente
relevantes para su función.
FASE DE INICIACIÓN.
FASE DE TERMINACIÓN.
En los organismos pluricelulares todas las células proceden de una única célula, el cigoto,
que tras sucesivas mitosis y un proceso de diferenciación da origen a los diversos tipos
celulares que forman el organismo. Por lo que todas las células tienen el mismo genoma,
sin tener en cuenta su función. Lo que las hace distintas son las proteínas, ya que no todas
las células sintetizan las mismas proteínas, y no lo hacen en el mismo momento.
Existe una expresión génica diferencial, es decir, la expresión de genes distintos por parte
de células que tienen el mismo genoma. En una célula humana típica se transcriben en
RNA y luego se traduce entre 2000 y 5000 genes, es decir de un 10% a un 20% de los que
contiene el DNA.