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adicionales al monofosfato. Los nucleótidos di~ y trifosfato son enlaces ricos en energía:
necesitan un aporte energético importante para formarse y liberan esta energía cuando se
los procesos metabólicos que la liberan hasta aquellos que la requieren. En algunas
reacciones del metabolismo, otros nucleótidos trifosfato como el GTP, CTP y UTP, pueden
enzimas). Tal es el caso del NAD, NADP, FAD o FMN, nucleótidos complejos en los que
aparecen bases nitrogenadas diferentes a las típicas de los ácidos nucleicos, que actúan
Otros nucleótidos como el cAMP, un fosfato cíclico de adenosina en el que el grupo fosfato
está unido mediante enlace éster al hidroxilo de la posición 3' y al de la posición 5’, actúan
Se refiere a la orientación química de punta a punta de un solo filamento de ácido nucleico. Por
convención química se nombran los átomos de carbono en la pentosa de los nucleótidos con números
que le confiere los nombres de extremo 5' y extremo 3' (pronunciados generalmente "extremo cinco
prima" y "extremo tres prima" respectivamente). La posición relativa de estructuras a lo largo de un
filamento de ácido nucleico, incluyendo los centros de unión de genes y varias proteínas, usualmente se
notan como: upstream (algo así como contra corriente o río arriba) si es hacia el extremo 5', o
downstream (río abajo) si es hacia el extremo 3'.
Extremo 5’
El extremo 5’ designa el extremo de una hebra de ADN o ARN que coincide con el grupo fosfato del quinto
carbono de la respectiva ribosa o desoxyribosa terminal. Un grupo fosfato unido al extremo 5' permite la
ligación de dos nucleótidos; por ejemplo, el enlazado covalente del grupo 5'-fosfato al 3'-hidroxilo de otro
nucleótido, para formar un enlace fosfodiéster.
Extremo 3’
Este extremo de una hebra de DNA o RNA coincide con el grupo hidroxilo del tercer carbono de la
respectiva ribosa o desoxirribosa terminal.
¿Cuál es la importancia de tener esta convención de
nombres?
Los ácidos nucleicos sólo pueden ser sintetizados in vivo en
una dirección 5' a 3'; porque la polimerasa usada para
ensamblar nuevos filamentos debe unir un nuevo nucleótido al
grupo 3'-hidroxilo (-OH) a través de un enlace fosfodiéster. Por
convención, las secuencias de filamentos simples de ADN o
ARN se escriben en dirección 5' a 3'.
DNA
La forma y actividad de cada célula está determinada en gran medida por la instrucciones
genéticas contenidas en los ácidos nucleicos.
DNA
A) Geometría
B) Flexibilidad
C) DNA superenrollado
A) Está formado por dos hebras de un polímeros de desoxirribonucleótidos unidos por enlaces
fosfodiéster. Las dos hebras de polinucleótidos antiparalelas se enrollan hacia la derecha
alrededor de un eje común para producir una doble hélice de aproximadamente 20 Armstrong
de diámetro.
Los planos de las bases nucleotídicas, que forman enlaces de hidrógeno apareados, son casi
perpendiculares al eje de la hélice. Las bases ocupan el centro de la hélice mientras que los
esqueletos de azúcar-fosfato se enrollan por fuera, y forman los surcos mayor y menor.
Cada apareamiento de bases tiene casi exactamente el mismo ancho , lo cual produce una
simetría casi perfecta de la molécula de DNA más allá de su composición de bases.
B) Flexibilidad
puede variar de 26º a 43º . Entonces cada apareamiento de bases puede desviarse de su
conformación ideal al rotar o girar como lo harían las aspas de una hélice. Estás variaciones
La molécula de ADN puede plegarse sobre sí misma para originar estructuras más compactas.
Cuando los extremos de la molécula de ADN no pueden rotar libremente, bien porque estén unidos por
enlaces covalentes formando moléculas circulares, o estén asociados con proteínas, adquieren una
conformación tridimensional superenrollado. En esta estructura la doble hélice como un todo puede
estar rotada hacia la derecha (superenrollado negativo) o hacia la izquierda (superenrollado positivo);
favorece el desenrollamiento de la hélice y la separación de las dos hebras, que como ya fue señalado
TOPOISOMERASAS
Se denomina de está forma debido a que alteran el estado topológico del DNA circular pero no su
estructura covalente.
a) Topoisomerasas tipo I. Crean roturas transitorias de una sola hebra de DNA. Las enzimas tipo I
pueden ser A o B dependiendo de su secuencia y mecanismo de reacción.
b) Topoisomerasas tipo II. Producen roturas transitorias de la doble hélice del DNA.
➢ -Los enlaces de hidrógeno que se forman en los pares de bases: contribuyen a la estabilidad
termodinámica de la doble hélice.
➢ - El apilamiento de las bases nitrogenadas: éstas exhiben la tendencia a apilarse unas sobre otras con
una orientación más o menos perpendicular al eje de la hélice, de forma que las interacciones de nubes
electrónicas de los orbitales entre las bases apiladas contribuye a la estabilidad de la doble hélice.
➢ - La hidratación de los grupos polares del esqueleto azúcar-fosfato con el entorno acuoso.
Histonas
Cromatina. Complejo de DNA y proteínas
Aproximadamente la mitad de la cromatina está compuesta por proteínas y la mayoría de las proteínas
están compuestas por histonas. Estas proteínas (H1, H2A, H2B, H3, H4) tiene una gran proporción de
residuos con cargas positivas, las cuales pueden unirse a las cargas negativas de los fosfatos del DNA.
Nucleosomas. Están compuestos por octámeros (H2A)2, (H2B)2(H3)2(H4)2 en asociación con alrededor
de 200pb de DNA. El DNA se enrolla alrededor de las histonas para formar la partícula central el
nucleosoma.
Cromosoma Eucariota duplicado y
ERWIN CHARGAFF analizó las base nitrogenadas del ADN en diferentes formas de vida,
iguales a las de las PIRIMIDINAS, la proporción era igual en todas las células de los
2. Las muestras de DNA aisladas de los diferentes tejidos de la misma especie se componen de las
mismas bases.
3. La composición de bases del DNA de una determinada especie no varía con la edad del
organismo, ni con su estado nutricional, ni con las variaciones ambientales.
fibras de DNA. A principios de la década de 1950 demostraron que el DNA produce un diagrama
de difracción de rayos X característico. El análisis de los diagramas permitió deducir que las
moléculas del DNA son helicoidales, y que sus bases aromáticas planas forman un apilamiento
que explicara los datos de difracción de rayos X, así como las equivalencias entre bases
descubiertas por Chargaff, junto con otras propiedades químicas del DNA.
La determinación de la estructura del DNA por parte de James Watson y
Francis Crick en 1953 marcó el nacimiento de la biología molecular moderna. La estructura de
Watson y Crick del DNA permitió la determinación del mecanismo molecular de la herencia
Watson y Crick (1953) postularon un modelo tridimensional para el DNA con las siguientes
carácterísticas:
pero cada una forma una hélice dextrógira (la diferencia entre una hélice dextrógira y una levógira
se muestra en la figura
3. Las bases ocupan el centro de la hélice y las cadenas de azúcares y
fosfatos se sitúan en el exterior. Esto minimiza las repulsiones entre los
grupos fosfato cargados. La superficie de la doble hélice contiene dos
hendiduras de ancho desigual: los surcos mayor y menor .
4. Cada base está unida por puentes de hidrógeno a una base de la hebra opuesta, para formar un par
de bases plano. Cada residuo de adenina debe formar pareja con un residuo de timina y viceversa, y
cada residuo de guanina debe aparearse con un residuo de citosina y viceversa. Estas interacciones
por puentes de hidrógeno, conocidas como apareamiento de bases complementarias, da como
resultado la asociación específica de las dos cadenas de la doble hélice
CROMOSOMA 12-AQUAPORINAS,
PROTEÍNAS G
CROMOSOMA 2- GLICOFORINAS
La doble hélice del DNA se mantiene unida por dos tipos
de fuerzas:
• Los enlaces de hidrógeno entre los pares de bases complementarias
• Las interacciones de apilamiento de las bases. Entre G y C se
pueden formar tres enlaces de hidrógeno, mientras solamente dos pueden
establecerse A y T.
Esta es una de las razones de la dificultad para separar las hebras
apareadas del DNA: cuanto mayor sea la relación de pares de bases
G = C con respecto a las A = T , más difícil será su separación .
La complementariedad de las hebras del DNA se debe a los enlaces de hidrógeno
que se establecen entre los pares de bases.
Debido a la flexibilidad del DNA esta molécula puede presentar variaciones
estructurales. Estás variaciones no tiene ningún efecto sobre las propiedades
fundamentales del DNA.
importantes:
• La zona de regulación
• La zona de codificación
La zona de regulación está formada por secuencias relativamente cortas de bases nitrogenadas que
determinan cuando, donde y con que intensidad debe expresarse un un gen determinado.
✓ PROMOTOR
✓ POTENCIADOR
✓ SILENCIADOR.
Los eucariotas tienen tres ARN polimerasa distintas, y cada una tiende a reconocer una
secuencia de promotores específicas. Estas secuencias reguladoras del ADN son
específicas respecto a los promotores. Los promotores tienen secuencias de nucleótidos
definidas, como la cajas "TATA" y "TTGACA". Los promotores se localizan en los extremos
5'-de la zona de codificación, las cajas TATA o TTGACA se encuentran a unos 30
nucleótidos del sitio de iniciación de transcripción.
Considerada como la principal secuencia del promotor, es el sitio de unión tanto de los
factores de transcripción como de las histonas (la unión de factores de transcripción
bloquea la unión de las histonas y viceversa) y está implicada en el proceso de
transcripción por la ARN polimerasa.
Proteínas activadoras: Se unen a secuencias específicas de ADN y
favorecen su transcripción.
Mecanismos de acción:
Mecanismos de acción:
*
Los factores de transcripción son proteínas que participan en la regulación de la
transcripción del ADN, pero no formar parte de la RNA polimerasa. Los factores de
transcripción pueden actuar recociendo o uniéndose a secuencias concretas de ADN,
uniéndose a otros factores o uniéndose directamente a la ARN polimerasa.
G1= dobla su tamaño y masa debido a la continua síntesis de todos sus componentes
como resultado de la expresión de los genes que codifican las proteínas responsables
de su fenotipo particular
Las proteínas que permiten el
progreso del ciclo.
Cdk1.ciclina B, A
Cdk2-ciclina A
Cdk2-ciclina E
Cdk4-ciclina D
Cdk4, 6-ciclina D
La forma y el tamaño de un organismo están definidos por los tres procesos fundamentales que dan forma y tamaño
al individuo:
✓ el crecimiento celular
✓ la muerte celular
✓ la proliferación celular
Esta ultima es el resultado del ciclo celular que como se reviso, está regulado por mediadores intracelulares (ciclinas-
Cdk); cabe señalar que la entrada al ciclo celular no es un proceso autónomo de la célula, se requiere de la activación
de estas vías (ciclinas-Cdk); a través de la señalización mediante factores solubles de naturaleza proteica
denominados mitógenos. De esta manera las células en organismos multicelulares proliferan solo cuando se
requieren más células.
Estructuras compuestas
por microtúbulos
acomodados en forma
circular que se originan
de los centros de
organizadores o
centrosomas. Se
generan dos pares de
centriolos.
Durante la interfase, la célula se encuentra en estado basal de funcionamiento.
Es cuando se lleva a cabo la replicación del ADN y la duplicación de los
orgánulos para tener un duplicado de todo antes de dividirse. Es la etapa previa a
la mitosis donde la célula se prepara para dividirse, en ésta, los centríolos y la
cromatina se duplican, aparecen los cromosomas los cuales se observan dobles.
El primer proceso clave para que se de la división nuclear es que todas las
cadenas de ADN se dupliquen (replicación del ADN); esto se da inmediatamente
antes de que comience la división, en un período del ciclo celular llamado
interfase, que es aquel momento de la vida celular en que ésta no se está
dividiendo. Tras la replicación tendremos dos juegos de cadenas de ADN, por lo
que la mitosis consistirá en separar esas cadenas y llevarlas a las células hijas.
Para conseguir esto se da otro proceso crucial que es la conversión de la
cromatina en cromosomas.
INICIO DE LA REPLICACIÓN DEL ADN
MCM2-MCM7
ACTIVIDAD DE HELICASA)
ORMC, MCMW-7, Cdc6
Son fosforiladas
Cdk2- Ciclina E
Cdc45- MCM-10
Permite el reclutamiento
de Cdc45, MCM10-
Activan a la HELICASA
Helicasa
Enzima vital en los seres vivos ya que participa en los procesos de duplicación y
reproducción celular de este, transcripción, recombinación y reparación del ADN. Su misión
es romper los puentes de hidrógeno que unen las bases nitrogenadas, haciendo así
posible que otras enzimas puedan copiar la secuencia del ADN.
Topoisomerasas
Son enzimas isomerasas que actúan sobre la topología del ADN. La configuración de
doble hélice del ADN les hace "difícil" su separación, imprescindible si las enzimas están
trascribiendo la secuencia que codifica las proteínas, o si los cromosomas se están
replicando.
Proteínas SSB
Es una enzima que sintetiza pequeños fragmentos de ARN sobre la cadena rezagada en la
replicación de DNA, de unos 10 nucleótidos, conocidos como cebadores, complementarios a la
hebra de ADN que se copia durante la replicación. Estos cebadores son necesarios para que el
ADN polimerasa III tenga un punto de partida (un grupo 3'-OH libre) en la síntesis 5'→3' de la hebra
molde y agregue los desoxinucleótidos.
Fragmentos de Okazaki
https://es.khanacademy.org/science/ap-biology/gene-expression-and-
regulation/replication/v/leading-and-lagging-strands-in-dna-replication