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Guía de clase

CIENCIAS BIOLÓGICAS
Bioquímica III

INTRODUCCIÓN
Los ácidos nucleicos son biomoléculas de elevado PM, compuestas por C, H, O, N y P. Se forman por
la polimerización de unas subunidades denominadas nucleótidos. Según la composición se distinguen
dos tipos: ADN y ARN.
Son las moléculas encargadas de almacenar, transmitir y expresar la información genética.

ÁCIDOS NUCLEICOS Y SU IMPORTANCIA COMO MOLÉCULAS PORTADORAS DE


INFORMACIÓN GENÉTICA.

1) Fueron descubiertos por Miescher en 1869, a partir de núcleos de leucocitos del pus y de
espermatozoides de salmón, sustancia que al principio denominó "nucleína". Al separar el
componente proteico de la nucleína observó que lo que quedaba tenía naturaleza de ácido y lo
llamó "ácido nucleico".

2) En los años treinta se descubrió que los cromosomas contenían esta asociación de ácidos nucleicos
con proteínas, por lo que la nucleína empezó a llamarse "cromatina" en vez de nucleína. Se
conocía además, desde finales del siglo XIX, que los cromosomas eran portadores de información
hereditaria, por lo que al principio se asoció la naturaleza de la información hereditaria a las
proteínas de la cromatina (formadas por más variedad de unidades) que a los ácidos nucleicos,
que se descubrió sólo formados por un tipo de azúcar, un resto fosfato y cuatro clases de bases
nitrogenadas. También se comprobó la existencia de distintos tipos de ácidos nucleicos, las bases
que contienen y la forma como se unen a otros componentes.

3) A partir de los años 40 se descubre la composición detallada y se demuestra que en el DNA el número
de bases de adenina es igual al de timina y el número de bases de guanina es igual al de citosina
pudiendo variar sin embargo el número de bases de adenina respecto al de guanina o de citosina.
Además A+G=T+C, por lo que se estableció que la información hereditaria debía residir en estos
ácidos en forma de secuenciación de estas bases y no en las proteínas de la cromatina. Hipótesis cuya
validez se demostraría más tarde.

4) En 1944, y basándose en las experiencias de Griffith (1928), Avery y colaboradores lo demuestran


experimentalmente: son los ácidos nucleicos los portadores de la información (experimentos con bacterias
virulentas y no virulentas de la neumonía en ratones). Libro página 230.

5) A partir de todos estos estudios anteriores junto al estudio de difracción de rayos X sobre fibras
de ADN, en 1953 Watson y Crick, descubrieron la estructura del DNA y formularon la hipótesis
sobre su mecanismo de autoduplicación.

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FUNCIONES DE LOS ÁCIDOS NUCLEICOS

1. Duplicación del ADN para transmitir información a las siguientes generaciones por medio de los
cromosomas (asociaciones de DNA y proteínas).

2. Transcripción del ADN para formar ARNm principalmente, pero también RNAr, RNAt y RNAm.

3. Traducción, en los ribosomas, del mensaje contenido en el ARNm a proteínas.

4. Capacidad de cierta mutación química, para conseguir nueva variabilidad genética y por tanto
fuente de evolución en las especies.

LOS NUCLEÓTIDOS

Los nucleótidos, a diferencia de los monosacáridos y los aminoácidos, sí son hidrolizables. Están
compuestos por la asociación de una base nitrogenada, una pentosa y una molécula de ácido fosfórico
(H3PO4).
Podemos definirlos como ésteres fosfóricos de los nucleósidos.

COMPOSICIÓN DE LOS NUCLEÓTIDOS

1. Las bases nitrogenadas: Son compuestos heterocíclicos que contienen N. Forman estructuras
planas y existen dos tipos:
a. Bases púricas: Derivan de la purina. Son la adenina (A) y la guanina (G)
b. Bases pirimidínicas: Derivan de la pirimidina. Son la citosina (C), la timina (T) y el uracilo
(U).

Todas ellas se obtienen por adición de diferentes grupos funcionales en distintas posiciones de los
anillos de la purina o de la pirimidina. Las características químicas de estos grupos funcionales les
permiten participar en la formación de puentes de hidrógeno, lo que resulta crucial para la función
biológica de los ácidos nucleicos.

2. Las pentosas: Monosacáridos ciclados de 5 carbonos (aldopentosas). Pueden ser de dos tipos:
ribosa (b–D–ribofuranosa) y desoxirribosa (b–D–2–dexosirribofuranosa). La ribosa se encuentra
en los nucleótidos del ARN o ribonucleótidos y la desoxirribosa en los nucleótidos del ADN o
desoxirribonucleótidos. Los átomos de C se numeran como 1´, 2´, 3´, 4´y 5´ para evitar confusión
con los de las bases nitrogenadas. La ciclación de las aldopentosas se consigue gracias a un enlace
hemiacetal intramolecular.

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3. El ácido fosfórico: Se encuentra en forma de ion fosfato (PO43 –).

NUCLEÓSIDOS: ENLACE N–GLUCOSÍDICO

Las pentosas se unen a las bases nitrogenadas dando lugar a unos compuestos denominados nucleósidos.
La unión se realiza mediante un enlace N–glucosídico entre el átomo de carbono carbonílico de la
pentosa (carbono 1’) y uno de los átomos de nitrógeno de la base nitrogenada, el de la posición 1 si ésta
es pirimídica o el de la posición 9 si ésta es púrica. El enlace N–glucosídico es una variante del tipo
más habitual de enlace glucosídico (O–glucosídico), que se forma cuando un hemiacetal o hemicetal
intramolecular reacciona con una amina, en lugar de hacerlo con un alcohol, liberándose una molécula
de agua.
Los nucleósidos se nombran añadiendo la terminación –osina al nombre de la base nitrogenada si ésta
es púrica (adenosina, guanosina) o bien la terminación –idina si ésta es pirimídica (citidina, timidina,
uridina), y anteponiendo el prefijo desoxi– en el caso de los desoxirribonucleósidos.

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NUCLEÓTIDOS: ENLACE FOSFOÉSTER

Los nucleótidos resultan de la esterificación (mediante un enlace fosfoéster) de la pentosa de un


nucleósido con una molécula de ácido fosfórico. Esta unión, en la que se libera una molécula de agua,
puede producirse en cualquiera de los grupos hidroxilo libres de la pentosa, pero como regla general tiene
lugar en el que ocupa la posición 5’; es decir, los nucleótidos son los 5’ fosfatos de los correspondientes
nucleósidos. La posesión de un grupo fosfato, que a pH 7 se encuentra ionizado, confiere a los nucleótidos
un carácter marcadamente ácido.

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Al igual que los nucleósidos, los nucleótidos pueden clasificarse en ribonucleótidos y
desoxirribonucleótidos según contengan ribosa o desoxirribosa respectivamente. Existen diversas
maneras de nombrar los nucleótidos; la de uso más amplio consiste en identificar cada nucleótido mediante
tres letras mayúsculas, la primera de ellas es la inicial de la base nitrogenada, la segunda indica si el
nucleótido es Mono~, Di~, o Trifosfato, y la tercera es la inicial del grupo fosfato (en inglés, phosphate);
en el caso de los desoxirribonucleótidos se antepone una "d" minúscula a estas tres siglas.
También es habitual nombrar a los nucleótidos como fosfatos de los correspondientes nucleósidos; por
ejemplo, el ATP es el trifosfato de adenosina o adenosín–trifosfato.
Otra forma de nombrarlos consiste en anteponer la palabra ácido y añadir la terminación –ílico al nombre
de la base nitrogenada correspondiente; así, por ejemplo, el AMP se puede denominar también como
ácido adenílico, o, dado que a pH 7 se encuentra normalmente disociado, como adenilato; este sistema
de nomenclatura resulta un tanto ambiguo ya que no especifica el número de grupos fosfato.

El ADN (Ácido Desoxirribonucleico)

– Formado por desoxirribosa más A, C, G y T (no U).


– Doble cadena de polinucleótidos (con estructura lineal o circular)
– Contiene la información genética (instrucciones para el funcionamiento celular e instrucciones para
formar un individuo)

I. ESTRUCTURA DEL ADN

El ADN se estructura en varios niveles de complejidad:

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a) Estructura primaria: Secuencia de nucleótidos (diferentes bases, igual pentosa).
Dirección: 5’  3’

b) Estructura secundaria: Propuesta por Watson y Crick en 1953, basándose en los anteriores
experimentos de:
• Chargaff: El número de bases púricas es siempre igual a las bases pirimidínicas, es decir
A=T y C=G

• Rosalind Frankin y Maurice Wilkins: Difracción de rayos X en la que se observaba una


doble hélice.

• Modelo tridimensional de Doble Hélice de Watson y Crick:


– Dos cadenas de polinucleótidos unidas entre sí.
– Dos cadenas antiparalelas (extremo 5’ unido con el 3’ de la otra cadena)
– Unión de las dos cadenas por puentes de H que se establecen entre las bases: A=T y
C=G.
– Cadenas complementarias (si se sabe una cadena se puede deducir la otra)
– Las dos cadenas enrolladas en espiral formando una doble hélice.
– La hélice se estructura con los esqueletos pentosa–P en el exterior y las bases hacia el
interior de la hélice. (las cargas negativas del P quedan fuera para estabilizarse con las
cargas positivas del medio)
– Las bases se sitúan perpendiculares al eje de la hélice.
– Las cadenas no pueden desenrollarse ni separarse.
– La hélice es dextrógira (sentido de las agujas del reloj)
– Las dimensiones de la hélice son: 2Nm de anchura, 3,4 Nm por vuelta, y 0,34 Nm entre
bases, por lo que hay 10 nucleótidos por vuelta.

La doble hélice en estado natural es muy estable, pero si se calienta hasta los 100º, la doble
hélice se separa, se produce la desnaturalización, Si se vuelve a enfriar por debajo de 65º,
vuelven a unirse, produciéndose la renaturalización. Esto se utiliza para unir cadenas de
diferentes individuos y conocer el grado de parentesco entre ellos.

c) Estructura terciaria:
Nuevos plegamientos de la doble hélice:
– Largas cadenas en un espacio muy reducido (núcleo celular).
– Su actividad depende del grado de empaquetamiento.
– El empaquetamiento se produce por la asociación de ADN a proteínas básicas, las Histonas.
– La doble hélice se encuentra súper enrollada formando una súper hélice. Esto ocurre con el
ADN bacteriano o mitocondrial.
– En células eucariotas el ADN se empaqueta aún más hasta formar la cromatina.

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II. TIPOS DE ADN

Según el número de cadenas se clasifican en:


– Monocatenario. Una sola cadena. Muy raro, solamente se conoce en virus.
– Bicatenario. Es el que presentan la mayoría de los organismos.

Según su forma puede ser:


– Lineal. En las células eucariotas y en algunos virus.
– Circular, en las bacterias, mitocondrias, cloroplastos y algunos virus.

El ARN (Ácido Ribonucleico)

Formado por pentosa (Ribosa) y las bases A, C, G y U (no T)


Cadenas monocatenarias, más cortas que pueden encontrarse en el núcleo y en el citoplasma.
Utiliza la información del ADN para producir proteínas y de esa forma ejecutar la información.
Varios tipos:

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A) ARN mensajero (ARNm)

– Monocatenario y generalmente lineal


– Copia de una parte del ADN (gen) y lleva la información hasta los ribosomas para que se
sintetice la proteína.
– Vida corta (una vez que se sintetiza la proteína se destruye)
– 3–5% del ARN total.

B) ARN transferente (ARNt)

– Monocatenario pero la molécula adopta una estructura secundaria debido a la complementariedad


de bases, formando unos bucles o asas, de manera que la molécula presenta una forma de hoja de
trébol (aunque en tres dimensiones tiene forma de L).
– Presenta nucleótidos raros, como la ribotimidina, la inosina, etc.
– Transporta los aminoácidos hasta los ribosomas, donde se unen para formar las proteínas.
– 10% del total.

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C) ARN ribosómico (ARNr)
– Asociado a proteínas, forma los ribosomas y representa el 60% de su masa.
– Presenta segmentos monocatenarios y segmentos en doble hélice.
– Su masa se expresa según el coeficiente de sedimentación (S), y podemos encontrar según el
mismo, dos tipos: ribosomas 70 S en procariotas y 80 S en eucariotas.

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01. Es altamente probable que hayan sido las 04. La figura corresponde a una simplificación
primeras moléculas en tener la capacidad de del modelo de ADN propuesto por Watson y
almacenar información, catalizar reacciones y Crick en 1953.
autorreplicarse:

A) ADN
B) ARN
C) Proteínas
D) Carbohidratos
E) Lípidos

02. Con respecto a los ácidos nucleicos, indique la


alternativa correcta.

A) Mediante el enlace fosfodiéster el grupo


fosfato se une a una base nitrogenada.
B) El ARN mensajero es de forma globular.
C) El ARN ribosómico se encarga de "leer"
los ARNm y formar una proteína.
D) El ARN de transferencia se forma por el Al respecto, es correcto afirmar que la
proceso de transcripción. importancia de este modelo radica en que:
E) Las bases nitrogenadas del ADN son
adenina, guanina, citosina y uracilo. I. Facilitó la comprensión de la estructura
del material genético.
03. En el modelo de la molécula de ADN propuesto II. Permitió explicar algunos fenómenos o
por Watson y Crick (1953), se describe al ADN situaciones problema relacionadas con el
como una molécula formada por dos esqueletos material genético.
de azúcar fosfato, desde el cual surgen bases III. Permitió observar la estructura del
nitrogenadas perpendiculares a un eje central y material genético tal cual es.
que tales hebras son antiparalelas. Este último
concepto hace referencia a que A) Solo I
B) Solo III
A) las hebras son sintetizadas por enzimas C) Solo I y II
distintas durante la replicación. D) Solo II y III
B) los extremos 3’ del ADN quedan juntos E) I, II y III
en un mismo extremo de la molécula.
C) las hebras se organizan de manera paralela
y que las direcciones de crecimiento de
estas están en sentido contrario.
D) las hebras se organizan de manera
paralela, pero se sintetizan en tiempos
distintos.
E) existen compartimentos distintos para la
síntesis de cada hebra.

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05. La siguiente figura es un esquema simplificado 08. El análisis de la composición porcentual de
que representa un ácido nucleico híbrido bases nitrogenadas en genomas de distintos
producto de la transcripción. organismos arrojó los siguientes resultados:
HO
Bases nitrogenadas
B Organismo T C U A G
A
HO 1 31,0 18,4 - 31,5 19,1
H 2 24,6 25,5 - 24,3 25,6
3 - 24,5 32,5 23,0 20,0
4 - 22,0 28,0 28,0 22,0
H
Del análisis de los datos es correcto inferir que
Al respecto, es correcto afirmar que, si la
estructura B es la pentosa ribosa, la base
I. los genomas de los organismos 1 y 2
nitrogenada A es necesariamente
corresponden a moléculas de ADN y los
A) guanina. de 3 y 4 a moléculas de ARN.
B) citosina. II. los genomas de los organismos 1, 2 y 4
C) uracilo. son moléculas de doble hebra.
D) timina. III. el organismo 3 posee un genoma de
E) adenina. simple hebra.

06. Si tenemos el fragmento de ADN


3`-TTACGGATGCTT-5`, entonces podemos A) Solo I
señalar que la secuencia codificante es: B) Solo II
C) Solo III
A) 3`-TTACGGATGCTT-5` D) Solo I y III
B) 3`-AATGCCTACGAA-5` E) I, II y II
C) 3`-UUACGGAUGCUU-5`
D) 5`-AATGCCTACGAA-3`
09. Elija los dos términos que completan
E) 5`-AAUGCCUACGAA-3`
correctamente este enunciado: "Los nucleótidos
07. Si en una muestra de ADN de una bacteria son a los/las …………….. como los/las ……
extremófila que vive en aguas de altas son a las proteínas".
temperaturas, se observa que el porcentaje G-C
es de 88%, ¿cuál será el porcentaje de timina? A) ácidos nucleicos – aminoácidos
B) aminoácidos – polipéptidos
A) 6%
B) 3% C) uniones glucosídicas – uniones peptídicas
C) 12% D) genes – enzimas
D) 88% E) polímeros – polipéptidos
E) 22%

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10. Sobre los ácidos nucleicos que participan en
la expresión génica se considera la siguiente
información:

X : ácido nucleico que contiene la


información genética.
Y : ácido nucleico que lleva la información
genética codificada al citoplasma.
Z : ácido nucleico que transporta aminoácidos
específicos.
W: ácido nucleico que estructura ribosomas.

Entonces X, Y, Z, W corresponden
respectivamente a

A) ADN, ARNm, ARNt, ARNr.


B) ARNm, ADN, ARNt, ARNr.
C) ADN, ARNm, ARNr, ARNt.
D) ARNm, ADN, ARNr, ARNt.
E) ARNr, ARNm, ADN, ARNt.

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