FACULTAD DE CIENCIAS

EXAMEN DEPARTAMENTAL DE BIOLOGÍA MOLECULAR

DICIEMBRE 2009

Nombre:____________________________________________________

I. Preguntas abiertas.
Conteste de manera concisa cada pregunta (20 puntos, 2 puntos/pregunta)

1.- Explique el mecanismo molecular a través del cual funciona una

topoisomerasa

2.- ¿Cuál es la función de la proteína DnaB en E. coli?

3.- ¿Cuál es la función de la proteína Pol I?

4.- ¿Cuál es la diferencia entre un transposón autónomo y un transposón no

autónomo?

5.- ¿Cuáles son los dos tipos de terminadores de transcripción en bacterias,

¿Cuál es la diferencia entre ambos?

6.- Describa la reacción de splicing por pasos

7.- ¿Cuál es la función de la secuencia Shine-Dalgarno?

8.- ¿Cómo está formado un ribosoma eucariótico y uno procariótico?

9.- Describa el modelo Holliday de la recombinación

10.- ¿Cuál es la principal función de la recombinación homóloga en las

bacterias?
II.- Indique si las afirmaciones son verdaderas (V) o falsas (F) (1punto /pregunta):
_ __La conjugación de alta frecuencia (Hfr) se da por la presencia de un fago
lisogénico.
_ __El “5’ y 3’ “en la nomenclatura de ácidos nucleicos se refiere al número de átomo
de carbono en los azúcares (ribosa o deoxirribosa).
_ __La temperatura de fusión de un ácido nucleico se refiere a la temperatura a la cual
se rompe el enlace fosfodiéster.
_ __Los nucleosomas son estructuras de DNA y proteínas encargadas de quitar los
intrones del RNAm.
_ __Los intrones se quitan del RNA primario por un complejo de RNAs pequeños
nucleares y proteínas que reconocen los bordes del intrón y el punto de
ramificación.
_ __Los fragmentos de Okazaki se generan durante la replicación porque la síntesis
procede en dirección 3’ a 5’
_ __Las helicasas abren la doble hélice mientras que las topoisomerasas se encargan
de relajar la tensión generada por acción de las primeras.
_ __La DNA ligasa cataliza la formación del enlace fosfodiéster
_ __Los telómeros garantizan la correcta repartición de cromosomas durante la división
celular
_ __Los centrómeros garantizan la correcta repartición de cromosomas durante la
división celular
___Los polimorfismos de sitios de restricción no permiten distinguir entre individuos
_ _Las tasas de sustitución de nucleótidos son iguales en regiones codificantes que en
intrones
_ ___En residuos catalíticos las tasas de sustitución son más restringidas que en otros
dominios de la proteína.
_ __La frecuencia de transiciones es igual a la frecuencia de transversiones
_ __Los inductores son moléculas de bajo peso molecular que se unen al represor
provocando la expresión de un gen.
_ __El operón de triptófano se regula por represión.
_ __El mecanismo de atenuación depende de la formación de estructuras tallo-asa en
el RNA mensajero.
_ __Los regulones son conjuntos de genes y/o operones regulados por factores de
transcripción comunes
_ _La recombinación homóloga no requiere que exista homología entre las cadenas
que van a recombinarse.
_ __En la recombinación homóloga RuvC resuelve el intermediario de Holiday
_ __La recombinación homóloga ocurre durante la meiosis o como parte del sistema de
reparación de DNA.
_ _La recombinación sitio específica es el mecanismo que utiliza el fago λ para insertar
su genoma en el de la célula huésped durante el ciclo lisogénico.
_ __En la recombinación sitio específica participan las proteínas Int e IHF
_ __Los mecanismos de replicación de los plásmidos difieren y controlan propiedades
importantes como margen de hospedero, número de copias e incompatibilidad
_ __Las secuencias de inserción son transposones formados por el gen de la
transposasa bordeado de secuencias invertidas repetidas
_ __En el mecanismo de transposición replicativa se genera un cointegrado que se
resuelve por doble recombinación
__ _Los transposones siempre duplican unas cuantas bases de la secuencia blanco al
insertarse
_ __El genoma de un retrovirus codifica para actividades como la transcriptasa reversa,
proteínas integrales de membrana y de la cápside del virus
__ _Las enzimas de restricción pueden generar extremos cohesivos o romos.

III.- Elija las respuestas correctas. Puede haber más de una respuesta correcta.
Una respuesta incorrecta anula una respuesta correcta (0.5 puntos/respuesta)

40.- Durante un PCR:

a) primero se desnaturalizan las moléculas de DNA
b) al bajar la temperatura se aparean los oligonucleótidos con su secuencia blanco
c) al subir la temperatura a 72°C la DNA polimerasa sintetiza la cadena complementaria
d) la temperatura de apareamiento debe estar unos 5°C por debajo de la Tm de los
oligonucleótidos

41.- Los ribosomas:

a) son partículas compuestas de RNA y proteínas donde se lleva a cabo la síntesis de
proteínas
b) están en el núcleo de la célula
c) constan de dos subunidades, una más grande que la otra
d) son exclusivos de organismos eucariontes

42. Durante la iniciación de la traducción en procariontes:

a) el factor IF1 está involucrado en unir a la subunidad 50S al complejo de iniciación
30S
b) el factor IF2 ensambla al tRNA-fMet con la subunidad 30S y el RNAm
c) el factor IF3 verifica el complejo de iniciación 30S
d) el tRNA-fMet queda en el sitio P del ribosoma.

43. Para la elongación de la traducción:

a) el factor EF-TU “lleva” a los aminoacil tRNAs al sitio P del ribosoma
b) el factor EF-TU “lleva” a los aminoacil tRNAs al sitio A del ribosoma
c) el factor EF-G, mediante la hidrólisis de ATP, provoca un cambio conformacional del
ribosoma restaurando el sitio A
d) se hace el enlace peptídico en el sitio P del ribosoma

44. En eucariontes:
a) el “cap” y la cola de poliA del RNAm son esenciales para la iniciación de la
traducción ya que son reconocidos por eIF4
b) existe un tRNA iniciador especial pero no formil-metionina
c) existen proteínas equivalentes a IF2, EF-Tu y EF-G
d) no existe el proceso de traducción, las proteínas son incorporadas del exterior

45.- Los genes de inmunoglobulinas:

a) están organizados de manera dispersa en el genoma del linfocito indiferenciado
b) se recombinan durante la diferenciación del linfocito para generar un gen funcional
c) requieren de un “enhancer” para su transcripción y sólo después de la recombinación
este es funcional
d) de las cadenas ligeras constan de regiones variables, regiones J y regiones
constantes

46.- La recombinación de genes de inmunoglobulinas:

a) se da a través de secuencias repetidas invertidas
b) estas secuencias se encuentran en los bordes de las regiones V, D, J y C
c) durante el proceso se “deleta” la región de DNA intermedia
d) ocurre siempre de noche

47.- El método de secuenciación de DNA de Sanger:

a) se basa en el uso de ribonucleótidos marcados
b) se basa en el uso de dideoxinucleótidos marcados
c) usa la DNA polimerasa y prímeros específicos
d) se "lee" la secuencia de acuerdo al tamaño de los fragmentos generados

48.- Para hacer secuencias de genomas

a) es necesario hacer una genoteca del genoma que se quiere secuenciar
b) se rompe el DNA al azar, se seleccionan fragmentos sobrelapantes de 2 kb
aproximadamente
c) hay que rellenar o rasurar los extremos del DNA para poder clonarlo
d) la secuencia se ensambla "in silico" (o sea en una computadora)

49.- Una genoteca para “clonar genes” y una para secuenciar un genoma se
parecen en:
a) ambas requieren de generar fragmentos de DNA sobrelapantes
b) estos se generan usando enzimas de restricción
c) se clonan en vectores para E.coli
d) el número de clonas independientes debe ser suficiente para representar al menos
tres veces el genoma

50.- Una genoteca para “clonar genes” y una para secuenciar un genoma se
diferencian en
a) los fragmentos de DNA se generan por ruptura mecánica en una y por enzimas de
restricción en otra
b) para secuenciar un genoma no es necesario clonar fragmentos sobrelapantes
c) el número de clonas es intrascendente para clonar genes
d) el tamaño de los fragmentos es mucho más pequeño en genotecas para secuenciar
genomas
51.- La transcriptómica:
a) se basa en la extracción de RNA mensajero de dos condiciones cualquiera y la
síntesis de cDNA
b) usa geles de doble dimensión
c) con distintos fluoróforos se marca el cDNA proveniente de cada condición
d) nos permite hacer un análisis global de la transcripción del genoma

BANCO DE PREGUNTAS
Un punto/pregunta a menos de que se indique otro valor.

52. Los nucleótidos son la unidad de los ácidos nucléicos. Cada nucleótido esta
compuesto por:
(a) Una pentosa, un fosfato y una base nitrogenada
(b) DNA, RNA y proteínas
(c) Adenina, guanina, citosina y timina
(d) Ácidos grasos, proteínas y azúcares
(e) El aminoácido, el codón y el anticodón

53. Son regiones del genoma que están permanentemente en una condición
altamente condensada y que no se expresan genéticamente
(a) heterocromatina
(b) eucromatina
(c) cromatina homóloga
(d) interbandas

54. Indica en cual de las fases del ciclo celular el DNA se encuentra en la forma
de eucromatina.
a. Profase.
b. Metafase.
c. Anafase.
d. Telofase.
e. Interfase.

55. Señala cual de las siguientes estructuras funciona en la replicación del

cromosoma eucarionte.
a. Centrómero.
b. Telómero.
c. Cinetocoro.
d. Las tres anteriores.
e. Ninguna de las anteriores.
56.- En el siguiente esquema marca una pirimidina, una purina, el carbono 5’, el
carbono 3’, un nucleótido, una deoxyribosa y un fosfato.

57.- Mapas de restricción del genoma lineal de λ (2 PUNTOS)

0 10,000 20,000 30,000 40,000

48,502
l----------------------l-------------------------l------------------------l-------------------------l-----------------
----l
EcoRI Sites
21,226 26,104 31,747 39,168 44,972
----------------------------------------------------l------------l--------------l-----------------l------------l------
----

BamHI Sites
5,505 22,346 27,972 34,499 41,732
-------------l-----------------------------------------l--------------l-----------------l--------------l--------------
----
NcoI Sites
19,329 23,901 27,868 44,238
-----------------------------------------------l------------l---------l-------------------------------------l---------
----

Si haces una digestión del genoma linea de λ con cada una de las enzimas arriba
mencionadas y corres el gel, como se vería ese gel (marca con una línea donde
correrían los fragmentos en cada carril) (2 PUNTOS)
Marcador de
Peso Molecular EcoRI BamHI BamHI + NcoI
(50,000)

(30,000)

(20,000)

(15,000)

(10,000)

(5,000)

(2,500)

(1,000)

58. Señala la respuesta correcta. En el cromatosoma,

a). La hebra de DNA da 1.75 vueltas alrededor de un octámero de histonas.
b). El octámero de histonas está formado por dos moléculas de H2A, dos de
H2B, dos de H3 y dos de H1.
c). La hebra de DNA alrededor del octámero de histonas está estabilizada por la
histona H4.
d). El diámetro del nucleosoma en el cromatosoma es de 30 nm.
59. Watson y Crick usaron la siguiente información para deducir la estructura del
DNA excepto:
a) La determinación del “principio transformante” por Avery, McLeod y McCarty.
b) Los estudios de difracción de rayos X hechos por Rosalind Franklin.
c) Las reglas de Chargaff de la composición de las bases del DNA.
d) Las micrografías electrónicas del DNA de Linus Pauling.
e) La determinación de que el tautómero predominante en las bases es el ceto.

60. Las reglas de Chargaff proponen que:

a) Las purinas se aparean con las pirimidinas.
b) El contenido de adeninas corresponde al contenido de timinas en el DNA
de cadena sencilla.
c) Sólo se aplican al DNA de cadena sencilla.
d) La relación A+T/G+C es 1 en el DNA de doble cadena.

61¿Cuál de las siguientes mutaciones puede causar una reducción en β-

galactosidasa?
a) una mutación en la adenilato ciclasa
b) una mutación en CAP
c) una mutación en el sitio de unión de CAP en la región regulatoria de lac
d) una mutación en el sitio de unión del represor de lac

62. La primera secuencia es la secuencia original de un ORF. Las siguientes

secuencias han sufrido mutaciones (subrayado). Explica cual ha sido la mutación
sufrida en cada caso y qué efecto tiene. (2 puntos)

a)…ATGGGCAAATATAGCATTCCATAAAAATATATA…
b)…ATGGGAAAATATAGCATTCCATAAAAATATATA…
c)…ATGGGCATATATAGCATTCCATAAAAATATATA…
d)…ATGGGCAAATAAAGCATTCCATAAAAATATATA…
e)…ATGGGCAAATATAGCATTCCATTAAAATATATA…
f)…ATGGCAAATATAGCATTCCATAAAAATATATA…
g)…ATGGGCTATAGCATTCCATAAAAATATATA…