Examen departamental

BIOLOGIA MOLECULAR
Depto. de Bioquímica y Biología Molecular
Facultad de Ciencias, UAEM
Semestre: Enero a Mayo de 2011
Nombre del alumno:

1.Los ácidos nucléicos están compuestos por nucleótidos. Los nucleótidos están
constituidos por:
a) Una base nitrogenada, un fosfato, y una pentosa
b) Un ester, una cadena hidrofobica y glicerol
c) Alanina, fenilalanina y prolina
d) Adenina guanina, citocina, timina y uracilo

2.Un genoma es:

a) Un segmento de DNA que contiene información genética y codifica para un
RNAm
b) Todo e material genético de un organismo vivo.
c) El conjunto de RNAm de un organismo.
d) Una unidad discreta que contiene muchos genes.

3. El transcritoma se define como:

a) Las moléculas de RNA de transferencia presentes en una célula.
b) Las moléculas de RNA ribosómico presentes en una célula.
c) Las moléculas de RNA que codifican para proteínas presentes en la célula.
d) Todas las moléculas de RNA presentes en una célula.

4. El proteoma es:
a) Todas las proteínas que una célula es capaz de sintetizar
b) Todas las proteínas presentes en una célula durante el tiempo de vida
c) Todas proteínas presentes en una célula en un momento dado
d) Todas las proteínas activas en la célula en un momento dado

5. ¿Qué técnica se aplica para resolver los diferentes tamaños de los fragmentos
de DNA después de la digestión por una enzima de restricción?
a) Secuenciación de DNA
b) Electroforesis en gel
c) PCR
d) Clonación de genes.

6. La reacción en cadena de polimerasa es una técnica que se utiliza para:

a) Secuenciar un fragmento de DNA
b) Generar múltiples copias de un fragmento de DNA
c) Expresar la información de un fragmento de DNA
d) Desnaturalizar un fragmento de DNA

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7. Un vector de clonación es:
a) Un plásmido que solo replica en bacterias
b) Un plásmido que tiene resistencia a los antibióticos
c) Una molécula de DNA capaz de replicar dentro de un hospedero y se usa para
clonar otros fragmentos
d) Una molécula de DNA circular que tiene múltiples genes.

8. Un mapa de restricción
a) Es un mapa genético que muestra la posición de los genes en un fragmento de
DNA
b) Es un mapa que muestra la secuencia de los genes
c) Es un mapa que muestra los fragmentos de diferentes tamaños generados por
la digestión de un fragmento de DNA
d) Es un mapa que muestra las secuencias repetidas en un fragmento de DNA.

9. Los marcadores genéticos que están altamente representados en el genoma

humano son:
a) RFLPs
b) Minisatelites
c) Microsatelites
d) Polimorfismo de un solo nucleótido.

10. La conjugación es
a) La transferencia de DNA entre dos bacterias que requiere contacto físico.
b) Transferencia de DNA empacado en un fago entre bacterias.
c) La adquisición de DNA desnudo por una célula.
d) Introducción de un fago purificado dentro de una bacteria.

11. El origen de la replicación es:

a) Una proteína involucrada en el inicio de la síntesis del DNA.
b) Una secuencia de DNA que se encuentra varias veces dentro de los
cromosomas bacterianos.
c) Una secuencia de DNA corta que indica la zona en donde se une el
primosoma para dar inicio a la replicación.
d) Las secuencias que delimitan a los intrones.

12. Señala si las siguientes afirmaciones son falsas (F) o verdaderas (V).
Para los procesos de replicación y transcripción y traducción.

( ) La cadena líder ("leading strand") se sintetiza de manera discontinua.

( ) La cadena líder ("leading strand") se sintetiza de manera continua.
( ) La cadena líder ("leading strand") necesita fragmentos de Okazaki.
( ) La cadena de retraso ("lagging strand") se sintetiza de manera discontinua.
( ) La cadena de retraso ("lagging strand") se sintetiza de manera continua.
( ) La replicación inicia en el promotor
( ) La DNA pol III tiene actividad de exonuclesa 5´-3´.
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( ) Los fragmentos de Okazaki son fragmentos de RNA
( ) El promotor es una secuencia de DNA necesaria para que la RNA pol inicie la
transcripción
( ) La RNA pol tiene 4 subunidades 3 unidades α y 1 β.
( ) La RNA pol de eucariontes tiene dos tipos de terminaodores (intrínsecos y Rho-
dependientes)
( ) El operón del triptófano se regula por represión.
( ) Los regulones son conjuntos de genes y/o operones regulados por factores de
transcripción comunes.
( ) El promotor en bacterias tiene secuencias conservadas en el -10 y -35.
( ) Los genes regulados por control negativo se expresan cuando esta presente el
represor
( ) Los genes regulados por control positivo se expresan cuando esta presente el
activador.
( ) El tRNA es el puente entre el RNAm y la cadena polipéptidica.
( ) El fenómeno de bamboleo impide el reconocimiento del RNAm.
( ) El ribosoma es idéntico entre bacterias y eucariontes.
( ) La cadena polipéptidica necesita de un procesamiento postraduccional.
( ) El proteasoma es un complejo que sintetiza proteínas.
( ) Las chaperonas son proteína que participan en el plaegamiento de otro proteina
( ) La ubiquitina marca proteínas para que sean degradadas
( ) Una inteina es un segmento de una proteína que es removida por splicing
después de la tradución.

Preguntas abiertas

13. Explica el fundamento del método Sanger de secuenciación.

14. Explica el método que se uso para ensamblar el genoma de Haemophulis

influenzae.

15. ¿Cuál es la diferencia entre genes ortólogos y paralogos?

16. Explica como funciona el sistema de dos híbridos para identificar si existe
interacción entre proteínas.

17. Explica como se hizo el experimento que permitió demostrar que la replicación
es semiconservativa.

18. Explica el proceso por medio del cual el fago lambda ingresa a la bacteria y se
mantiene en un ciclo lisógenico.

19. Explica el sistema de reparación de DNA por mismatch.

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20. Explica como funciona el sistema de recombinación homologa RecBCD en
bacterias.

21. Explica brevemente las rutas por medio de las cuales un compuesto
extracelular puede modificar la actividad del genoma.

22. Recientemente se descubrió que Marinomonas sp. produce una proteína que
es muy eficiente para degradar celulosa. Ya se conoce la secuencia de la
proteína, sin embargo Marinomonas crece muy lentamente en condiciones de
laboratorio.
Diseña una estrategia utilizando las diferentes técnicas de biología molecular que
conoces para producir grandes cantidades de esta enzima y poder darle un uso
comercial.

23. Relaciona una enzima con una función

a. Topoisomerasa.
b. Helicasa.
c. Ligasa.
d. Nucleasa.
e. Proteasa
f. DNA polimerasa
g. RNA polimerasa
h. Primasa

( ) Desdoblamiento de las cadenas del DNA.

( ) Rompimiento y unión reversible de las cadenas del DNA.
( ) Síntesis del RNA iniciador.
( ) Síntesis de una cadena de ácidos desoxiribonucléicos
( ) Formación de enlaces covalentes 5´-3´.
( ) Degrada moléculas de ácidos nucléicos.
( ) Rompe enlaces peptidicos.
( ) Sintetiza cadenas de ácidos ribonucleicos

24 Completa las oraciones

Los agentes mutagénicos pueden ser de tipo

Una transición es un cambio de ______________ por __________ y una

transversión es un cambio de ______________ por _____________.

Los efectos de las mutaciones en orgaismos multicelulares se dividen es dos

categorías que son__________________ y ______________

La diferencia entre transposición conservativa y replicativa es que en el primer

caso______________________________________________________ y en e l
segundo caso_____________________________________________________
4
Los organelos que contienen su propio material genético son: _____________ y
_______________

Las tres estructuras básicas de la capside de los virus son:

_____________________________________________________________

Los priones son estructuras hechas básicamente de ______________________

Los _______________ son complejos que son la unidad básica estructural de la

cromatina.

Son dominios de proteínas que se unen al DNA __________________________

Se puede definir como el proceso cuyo resultado es una división celular.

25. Mapas de restricción del genoma lineal de lambda

0 10,000 20,000 30,000 40,000 48,502

l----------------------l-------------------------l------------------------l-------------------------l---------------------l

EcoRI Sites

21,226 26,104 31,747 39,168 44,972

----------------------------------------------------l------------l--------------l-----------------l------------l----------

BamHI Sites

5,505 22,346 27,972 34,499 41,732

-------------l-----------------------------------------l--------------l-----------------l--------------l------------------

NcoI Sites

19,329 23,901 27,868 44,238

-----------------------------------------------l------------l---------l-------------------------------------l-------------

Si haces una digestión del genoma lineal de λ con cada una de las enzimas arriba
mencionadas y corres el gel, como se vería ese gel (marca con una línea donde correrían
los fragmentos en cada carril)

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Marcador de

Peso Molecular EcoRI BamHI BamHI + NcoI

(50,000)

(30,000)

(20,000)

(15,000)

(10,000)

(5,000)

(2,500)

(1,000)