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~ 1;'"~:~~~;co
+ ATP + pp¡ heptaméricos apilados (- 11 0 Ade diámetro x 160 Ade
I
E1 '-- J ~ Ub '-- J' ~ largo), cada uno de los cuales contiene o bien subuni
dades a (a nillos externos) o bien subunidades (3 (anillos
r -_
D fJ
_ _ __ __ _ _ _ __ -----,UTb:O fJ internos) (a marillo). Derecho. corte tra nsversal del núcleo
205 que muestra las cámaras internas. La proteólisis de las
El enzima acti vadora de la ubicuitina
= proteínas marcadas por la ubicuitina tiene lugar dentro de
E2 enzima conjugadora de la ubicuitina
= -NH ~- Ub la cámara interna de l núcleo for mado por los anillos (3. (b)
E3 = ligasa de ubicuitina Las proteínas son ma rcadas para la degradación proteasó
mica med ian te poliubicui inac ión. La enzima E1 se activa
Ub = ubicuitina por la unión de une moléc ula de ubicu itina (Ub) (paso D
¡ Jy I ego transfiere su mo lécula Ub a un residuo de cisteína
D ¡ Pasos 1, 2, 3 presente en E2 (paso El) La ligasa de ubicuitina (E3) tran s
(a)
¡ (n veces) fiere la molécula de Ub presente en la cadena lateral-NH2
de una I/sina de la E2 en una proteína marcada, formando
un enlace isopeptídico (paso Dl 5e añade n moléculas
-Ub-Ub-Ub n+ 1
adidonales de Ub a la proteína marcada, modificada por la
Ub por medio de en laces isopeptídicos a la Ub previamente
añadida por repetic ión de los pasos RO, formando una
ATP ~ mi cadena de poliubicUi ina (paso D, La proteina marcada
poliubi cuitinilada es reconocida por el casquete del proteo
ADP~l soma que emplea desubicuitinasas para retirar los grupos
Ub y la hidrólisis de ATP para llevar a cabo el desplegam ien
Liberación Reconocimiento to y la transferencia de la proteína desdoblada dentro de la
Ub cámara de proteólisis de la zona central, a partir de la cual
Ub Ub Ub
Ub Ub luego se liberan fragmentos de digestión del péptido más
Ub
~ corto (paso OJ.War:e r'J¡j" .v. I!a"".,e'~ery(ols.. 1998,CeI1 98J 57.
ccnes[.2 de \. BaUf" i$ er mod.fkDda de M. Bochtier y rols" 19 , AnIl.Rev.
ATP) ------ Desplegamiento B'ophYl B:om-o/.lrru,r. 28.<95-317)
Péptidos
\ ~
---- Escisión
Descarga
diferentes, incluidos el ciclo celular (véase el Cap. 1':) ), la transcripción, sas del tipo AAA) con el fin de proporcionar la energía necesaria para
la reparación del DNA (véase el Cap. '¡ ), la muerte celular programada desplegar los sustratos proteicos y transferir selectivamente la energía
o apoptosis (véase el Ca p. 21 ), el reconocimiento y respuesta a las in de ellos a la cámara interna del núcleo catalítico del proteasoma. Los
fecciones por organismos extraños (véase el Cap, 23 ) y la eliminación estudios genéticos hechos en levaduras han mostrado que las células
de proteínas plegadas de modo incorrecto. En una célula de rnamífero no pueden sobrevivir sin proteasomas funcionales, lo que da cuenta de
típica hay aproximadamente 30 000 proteasornas. su importancia. Más aún, la actividad adecuada de los proteasomas es
Los proteasomas consisten en - 50 subunidades y tienen una masa de importancia tal que las células gastarán hasta el 30% de la energía
de 2-2,4 x lO' Da. Tienen una zona central catalítica, en forma de ba necesaria en sintetizar una proteína para degradarla en un proteasoma.
rril, llamada proteasoma 205 (en la que S es una unidad Svedberg so El núcleo catalítico 20S de un proteasoma está formado por dos ani
bre la base de las propiedades de sedimentación de la partícula y es Uos internos cada uno de los cuales consta de siete subunidades ~, con
proporcional a su tamaño), que tiene aproximadamente 14,8 nm de tres sitios activos proteolíticos por anillo, que delimitan la cámara inter
altura y 11,3 nm de diámetro. Unidos a los extremos de este núcleo se na de - 1,7 nm de diámetro, con forma de barril, y dos anillos externos
encuentran uno o dos complejos llamados casquetes 19S (Fig. 3-29<1 ) cada uno con siete sub unidades a., que controlan el acceso del sustrato
que regulan la actividad catalítica de la zona central 20S. Cuando este (Fig, J-29a ), Los proteasomas pueden degradar la mayoría de las proteí
núcleo 20S y uno de los casquetes, o ambos, se combinan, se conoce nas por com pleto, a raíz de que los tres sitios activos en cada anillo de
como el complejo 26S, si bien el que contiene ambos casquetes tiene subunidades ~pueden separar residuos hidrofóbicos, acídicos o básicos.
tamaño mayor (30S). Un casquete 19S tiene entre 16 y 18 subunidades Los sustratos polipeptídicos deben entrar a la cámara a través de una
proteicas, 6 de las cuales pueden hidrolizar ATP (es decir, son ATPa abertura regulada de - 1,3 nm de diámetro, que se encuentra en el cen
FIGURA 4-17 Los tres papeles del RNA en la síntesis proteica. El RNA
mensajero (mRNA) se traduce a proteínas por la acc ión conjunta del RNA
de transfe re ncia (tRNA) y el ri bosoma, que está compuesto por numerosas
3 La decodificación de los mRNA por los tRNA proteínas, y tres (en las bacterias) o cuatro (en los eucariontes) moléculas de
RNA ribosómico (rRNA) (no se muestran). Nótese el apareamiento de bases
0' -e:n el DNA almacena la información para la síntesis proteica y el e ntre los anticodones de! tRNA y los codones complementarios en el mRNA.
_ :\ lleva las instrucciones codificadas en el DNA, la mayoría de las La formación de un enlace peptídico entre el grupo amino N en el aa-tRNA en·
trante y el e carboxi-termina l en la cadena de proteína crecien te (en verde) está
,jades biológicas son realizadas por las proteínas. Como vimos
ca talizado por uno de los rRNA. aa = am inoácido; R= grupo lateral. (Adap;ado de A.
.- apítul o 3, el orden lineal de los aminoácidos de cada proteina J. Gr,¡'f¡t.. . s y coís., 1999, f/.odem Ger.-flic Al?a'ysis. W H. Freeman and Company.l
-llina su estructura tridimensional y su actividad. Por esta razón,
-....m blado de los aminoácidos en el orden correcto, tal como está
:. :ddo en el DNA, resulta crítico para la producción de proteínas
C}¡lales y así para el adecuado funcionamiento de las células y de
= ,mismos.
_.:'. traducción es el proceso completo mediante el cual la secuencia proteica. Los ribosomas están compuestos por una subunidad grande
tidos de un mRNA se usa como molde para unir los aminoá y una pequeña, cada una de las cuales contiene su propia molécula o
~ una cadena polipeptídica en el orden correcto (véase la Fig. moléculas de rRNA .
• ::",'0 ~). En las células eucariontes, la síntesis proteica ocurre en el
,:na, lugar en que los tres tipos de moléculas de RNA se reúnen Estos tres tipos de RNA participan en la síntesis de proteínas en
- ~mpeñar funciones distintas pero cooperativas (Fig. 4- ) -): todos los organismos. En esta sección, nos centraremos en la decodi
ficación del mRNA por los tRNA adaptadores y de qué manera la es
'..\ mensajero (mRNA) lleva la información genética transcrip tructura de cada uno de estos RNA se relaciona con su tarea específica.
-- - del DNA en forma lineal. El mRNA se lee en conjuntos de se De qué manera operan en conjunto con el rRNA, los ribo somas y otros
~ e tres nucleótidos, llamadas codones, cada uno de los cuales factores proteicos para sintetizar proteínas está detallado en la sección
- ~_ tm aminoácido en particular. siguiente. Dado que la traducción es esencial para la síntesis proteica,
los dos procesos comúnmente se refieren como intercambiables. Sin
' A de transferencia (tRNA) es la clave para descifrar los codo embargo, las cadenas polipeptídicas resultantes de la traducción atra
-- R..'\'A. Cada tipo de aminoácido tiene su propio subconjunto viesan un plegamiento postraduccional y con frecuencia otros cambios
que unen el aminoácido y lo llevan al extremo creciente de (p. ej., modificaciones químicas, asociación con otras cadenas) nece
..l polipeptídica donde el siguiente codón del mRNA lo re sarios para la producción de proteínas maduras funcionales (Cap. 3) .
~:-'¡A adecuado, con su aminoácido unido, es seleccionado
'.$0, porque cada molécula de tRNA específica contiene una El RNA mensajero lleva información desde el DNA
i c tres nucleótidos, un anticodón, que se aparea con las ba en un código genético de tres letras
:i>-1ón complementario presente en el mRNA.
Como se mencionó previamente, el código genético empleado por las
,-ibosómico (rRNA) se asocia con un conjunto de proteínas células es un código de triple tes, en el que cada secuencia de tres nucleó
. ribosomas. Estas estructuras complejas que se mue tidos, o codón, es "leída" a partir de un punto de iniciación especificado
. :. lo largo de una molécula de mRNA, catalizan el en en el mRNA. De los 64 codones posibles en el código genético, 61 espe
"minoácidos en las cadenas polipeptídicas. También cifican aminoácidos individuales y tres son codones de terminación. El
'-ias proteínas accesorias, necesarias para la síntesis Cuadro 4-1 muestra que la mayoría de los aminoácidos está codificada
Segunda posición
u e A G
por más de un codón. Solo dos -la m etio nina y el triptófano- tienen pecifica la secuencia lineal precisa de aminoácidos en una cadena polipep
un único codón; en el otro extrem o, la leucina, la serina y la arginina tídica, y también señala dónde se inicia y termina la síntesis de la cadena.
son especificados cada uno por seis codones diferentes. Los diferentes Dado que el código genético es un código de tripletes que no se
codones para un aminoácido dado se denominan sinónimos. El código superponen, sin divisio nes entre ellos, un mRNA particular, en teor ía,
en sí se llama degenerado, lo que significa que un am inoácido en parti debería traducirse en tres marcos de lect ura distintos. De hecho, algu
cular puede ser especificado por múltiples codones. nos mRNA mostraron contener información que se superpone y puede
La síntesis de todas las caden as polipeptídicas de una célula eucarion traducirse en diferentes marcos de lectura, dando como resultado di
te o procarionte comienza con el aminoácido metionina. En las bacterias ferentes polipép tid os (Fig. -l - I R). La gran mayoría de mRl'iA , sin em
se em plea una forma especializada de la m etionín a con un grupo formiJo bargo, puede leerse en solo un marco, porque los codones de detención
unido a su grupo amino. En la mayoría de los mRl'iA, el codón de inicia que se encuentran en los otros dos posibles marcos de lect ura terminan
ción (i niciador) que especi1i.ca esta metionina ami no term in al es el AUG. la traducción an tes de qu e se produzca una pro teí na funcion al. En muy
En unos pocos mRNA bacterianos, el codón iniciador es GUG y ocasio raras ocasiones ocurre otra configuración codifican te inusual por un
nalmente se usa como codón iniciador para metionina en los eucariontes corrimiento del marco de lectura. En este caso, la m aq uin ar ia de síntesis
CUG. Los tres codones UAA, UGA y UAG no especi1i.can aminoácidos proteica puede leer cua tro nucleótidos como un aminoácido y lu ego
sino que constituyen codones de detención (terminación) que marcan el ex continuar leyendo tripletes, o puede retro ceder la base y leer todos los
tremo carboxilo de las cadenas polipeptídicas de la mayoría de las células. tripletes que se continúan en el nuevo marco, hasta la terminació n de la
La secuencia de codones que va entre un codón de iniciación específico cadena. Se conoce solo una docena de casos de este tipo.
hasta un codón de terminación se llama un marco de lectura. Esta dispo El significado de cada codón es el mismo en la mayoría de los
sición lineal precisa de ribonucleótidos en grupos de tres, en el mRl\!A, es organ ismos conocidos -un fuerte argumento en favor de que la vida
: J .t-2
":""...~ nucl eares de los organismos que aparecen en la lista y en los genes de las mitocondrias según se indican .
. 1992, Microbio/. Re\'. 56:229.
I
6 OH
I
11
Unión de la
Phe al tRNAPhe 6
¿H, fJ
Phe-tRNA Phe se
une al codón UUU 6
¿H, I
Resultado neto:
la Phe es
seleccionada
ATP AMP
+ pp¡
I
Aminoacil-tRNA AAA AAA 5_AAA
__
sintetasa especí tRNA específico Aminoacil -tRNA 3'
fica para Phe para Phe (tRNA Phe ) mRNA
FIGURA 4-19 Decodificación de la secuencia de ácidos nucleicos a la energ ía (en am2nllo) a un 2' o 3' hidroxilo de la adenosina termina len el tRNA
secuencia de aminoácidos. El proceso pa ra la traducc ión de las secuencias correspondiente. Paso 1'1: una sec ue ncia de tres bases en el tRNA (elan ticodón)
de ác idos nucleicos del mR NA a secuencias de aminoácidos de las proteínas se apa rea luego por la s bases con un codón presente en el mRNAque especi
involucra dos pasos. Paso il una aminoacil-tRNA sintetasa se acopla en primer fica el amlnoácico unido. Si oc urre un error en cualquier paso, el aminoácido
térm ino a un aminoácido específico por medio de un enlace éster de alta incorrecto puede incorporarse a una cadena poli peptíd ica. Phe = fenilalani na.
(a) 3' la sín tesis pro teica . Vista en tres dimensio nes, la molécula plegada de
A tRl\lA tiene forma de L, en la qu e el bucle con el an ticodón y el tallo
@ ~ dihidro uridina aceptor forman los extremos de los dos brazos (Fig. 4-20b ).
CD ~ in os ina
(El = ribotimidina Tall o aceptor Entre los codones y los anticodones con frec uencia
® = seudourídina ocu rre el apareamiento de bases no estándar
m = grupo metilo
Si fuera imperativo el apareamiento pe rfecto de bases Watson-Crick
entre los codones y los anticodones, las cél ulas deberían con tener
al menos 61 tipos diferentes de tRNA, uno para cada codón que es
pecifica un aminoácido. Sin embargo, como se indicó previamente,
muchas célul as co ntienen menos de 61 tRNA. La explicación para
el menor nú me ro, radica en la capacid ad de un único anticodó n de
tRNA de reconocer más de un codón, pero no necesariamente cada
codón que cor respon da a un aminoácido dado. Este reconocim ien to
variable más amplio puede ocu rri r por el apareamiento 110 estándar entre las
bases de la así lIa mada posición de balanceo: es decir, la tercera base
(3') en un codón de mRNA y la primera base correspondiente (5') en
: Anticodón su anticodón de tRN A.
La primera y segunda bases de un codón casi siempre fo rman pa
res de bases es tándar de Watson-Crick y las tercera y segu nda bases,
2 1
respectivamente, del an ticodón correspondi en te, pero pueden ocurrir
,---~~~~--- ,
(b) interacciones no estándar en la cuarta posición, entre las bases en la
f"'. . .
Bucle T'I'CG Tall o aceptor
3' FIGURA 4-20 Estructura de los tRNA. (a) Si bien la secuencia de nucleótidos
exacta varia entre los ¡RNA, todos se pliegan en tallos de cuatro pares de bases
y tres bucles. La secu er cia CCA en el ex remo 3' también está presente en todos
los R\lA. La unión de un aminoácido al A3'da un a'1linoacil-tRNA. Alg unos de
los residuos A, C, G Y Use modifican postranscripcionalmente en la mayoría de
los t R~ .ll, (véase la clave). La c ihidrouridlna (D) casi siempre está prese nte en el
bucle D; de modo similar, la ribotimidina (T) y la seudouridina N') casi siempre
están presen tes en el bucle T'l'CG. El ¡RNAde la alanina de las levaduras, que se
reOéesenta aq f. contiene tan- bién otras bases modificadas. El triplete que se
encue1tra en el extremo de bucle del anticodón se apa rea por sus bases con el
codón correspc ndleme en el mRNA. (b) iVodelo tridimens ional de la es truc tura
general de todos los tR A. Nótese la forma de Lde la molécula . (Pa rte taJ. véaSf
.'.I. ~:; 1:, ) ( C'} 1965, 31.. ¿,net'. 147 '4ó2. Pa1lé ~b~ ,aja¡::tJ::I3 d-e J. A ,"\'n z y D ""oras, 1~9' . T,ends Blochem.
oa 22- ' ,
~ + Total: 31
>-
;,
23S 5S
(2900 rNTs) (120 rNT) 50S
~
~ 16S
+ Total: 21 ~
(1 500 rNT)
:1 28S : 5,8S 5S
> (4 800 rNT, 160 rNT) (120 rNT)
.::
~
~
+ Total: 33
'"
~
;.u
18S 80S
(1 900 rNT) 40S
; 'GURA 4-22 Componentes de los ribosomas procariontes y eucarion las bacterias. rRNA 285 y 185 en los vertebrados) y un rRNA 55. la sub unidad
tes.. En todas las células, cada ribosoma consiste e n una subunidad grande grande de los ribosomas de los ve rtebrad os contiene también un rRNA 5,85
5ubunidad pequeña Las dos subunidade s contienen rRNA (en rojo) de apareado por sus bases al rRNA 285. El número eje ribonudeótidos (rNT) de
:eentes long itudes, así como un conjunto de proteínas difere ntes. Todos los cada tipo de rRN A está indicado.
momas contienen dos moléculas de rRNA principales (rRNA 235 y 165 en
- :!ltc ínas (véase la hg. ,1-22 ). Se cree que los aspectos básicos de la metionina solo a una cadena de proteina creciente. La misma aminoacil
tesis proteica son semejantes, si bien la iniciación de la traducción tRNA sintetasa (MetRS) carga ambos tRNA con metionina. Pero solo la
- - lo s eucariontes, que trataremos más adelante, es más compleja y Met-tRNA¡~!c' (es decir, la metionina activada unida al tRNA¡Me,) puede
.:-; :.3 sujeta a mecanismos de regulación adicionales. unirse al sitio apropiado en la subunidad ribosómica pequeña, el sitio P,
Durante la traducción, un ribosoma se mueve a lo largo de una para iniciar la sin tesis de una cadena polipeptídica . El Met-tRNA Met y
.:.sdena de mRNA, interactúa con varios factores proteicos y tRNA y otros tRl"JA cargados se unen solamente al sitio A, como se describirá más
_:.J.fre grandes cambios de conformación. A pesar de la complejidad adelante. Los tRl"JA entran al sitio de salida o sitio E después de transferir
..:eI ribosoma, se han hecho grandes progresos en la determinación de su aminoácido unido covalentemente a la cadena polipeptídica creciente.
estructura general de los ribosomas bacterianos y del modo en que
imcionan en la síntesis proteica. Más de 50 años después del descubri La iniciación de la traducción en los eucariontes
-..liento inicial de los ribosomas, finalmente están siendo esclarecidos generalmente ocurre en el primer AUG cercano
II estructura general y su funcionamiento durante la síntesis proteica.
al extremo 5' de un mRNA
Durante la primera etapa de la traducción, las subunidades ribos6
El metionil-tRNA¡Met reconoce el codón micas pequeña y grande se ensamblan alrededor de un mRNA que
de iniciación AUG tiene un tRNA iniciador activado, ubicado correctamente en el codón
de iniciación en el sitio ribosómico P. En los eucariontes, este proceso
Gamo se mencionó previamente, el codón AUG para metionina funcio está mediado por un conjunto especial de proteínas conocidas como
- - corno el codón de iniciación para la gran mayoría de los mRl"JA. Un factores de iniciación de la traducción eucarionte (eIF). A medida
pecto crítico de la iniciación de la traducción es comenzar la síntesis de que cada componente individual se une al complejo, es guiado por
~ teínas en el codón de iniciación, estableciendo de este modo el marco interacciones con eIF específico. Varios de estos factores de iniciación
.3! lectura apropiado para todo el mRNA. Tanto los procariontes como unen GTP y la hidrólisis de GTP a GDP funciona corno un interrup
eucariontes contienen dos tRNA de metionina diferentes: el tRl"JAt f" , tor de verificación de la lectura que solamente permite que los pasos
e puede iniciar la síntesis proteica, y el tRNAMe<, que puede incorporar posteriores ocurran si el paso previo se desarrolló en forma correcta.
50S
30S
FIGURA 4-23 Estructura del ribosoma 70S de E. coli determinado por en claro y oscuro, respectivamente, y el rRNA SS está coloreado en azul
cristalografía de rayos X. Modelo del ribosoma visto en la interface entre oscuro. Se indican las posiciones ribosómicas de los sitios A, P Y E. Note que las
la s subunidades grande (50S) y pequeña (305). El rRNA 165 y las proteínas de la proteínas ri bosómicas se localizan principalmente en la superficie del ribosoma
subunidad pequeña están coloreados en verde claro y verde oscuro, respecti y los rRN A en el interior, cubriendo los sitios A, P Y E. (De B. S. Schuwirth y col$.. 2C05.
vamente; el rRNA 23 5 y las proteínas de la subunidad grande están coloreados x ience 31 0:8 27.)
Antes de la hidrólisis del GTP, el complejo es inestable y permite un El modelo actual sobre iniciación de la traducción en los vertebra
segundo intento en la formación del complejo, hasta que se ensamble dos se representa en la Figura'¡ 2-1. Las subunidades ribosómica grande
el complejo correcto, lo que da como resultado la hidrólisis del GTP y pequeña, liberadas de un ciclo previo de traducción, se mantienen
y la estabilización del complejo apropiado. En los últimos años se separadas por la unión de los eIF 1, lA Y 3 a la subunidad pequeña
han hecho notables avances en la comprensión de la iniciación de la 405 ( Fig. '¡-2.,1" arriba). El primer paso de la iniciación de la traduc
traducción en los vertebrados. ción es la formación del complejo de preiniciación 435. Este complejo
~ .J7-
(.1Fhl AUG
~ 11 Unión al mRNA
ATP
AA
~e\ ¡
~ @GTP
PABP
5'
mdereconocim ie nto
?"" ' -.aria traducción, la subunidad 405 se une al elFl , el elF1 A
::< =i Se forma un comp lejo de preiniciación 435 cua ndo este
· ~x;a con un complejo ternari o elF2 y elFs. Paso n un mRN A
1
Met
codones,
hidrólisis del
elF2 unido al GTP
y liberación de P
~ ;..~~ ,'O cuando un complejo elF4 de múltiples subunidades se
-" :. subunidad elF4E se une a la estructura del casquete s'y
· ' _ tt~ r¡idad elF4G se une a múltiples copias de la proteína que
:: ~ ~1i(A) (PABP) unida a la co la de poli(A) unida al mRI'JA La
5"...- - - -........~
-t
Complejo de
Jild de helicasa de la subunidad elF4A del RNA desenroll a iniciación 48S
}
_~ ] Jier estructura secundaria del RNA en el extremo 5' del
: "El eIF4B, que estimula la actividad de helica sa eIF4A, tam
~- ,me este complejo circular en el cua l ta nto el casquete 5' del
I5B\GTP Unión de la subunidad y
como la cola de poli(A) están asociados con el complejo ~ desplazamiento del factor
0=· " 3S0 ril: el complejo de preiniciación 435 se une a un com
0@GDPG>~@
: -= - e,F4-m RNA Paso Ii): la helicasa de mRNA elF4A desenrolla
, ':';:"\Jctura secundaria del RNA a medida que el complejo 405
""en la dirección 5'--7 3'hasta que reconoce al codón de @
-::"oon. Paso 0 : el reconocimiento del codán de iniciación
- :e .::¡ue el elFs estimule la hidróli sis del GTP unido al e1F2. Esto
;:3 1a conformación del complejo de oarrido a un complejo
~ --=iación 485 con el anticodón del tRNAiMet apareado por
~:" e s al iniciador AUG en el sitio P 405. Paso flla subunidad 5' . H__ *
,_ :.e une a la subunidad 405, lo que conduce la liberación de
~
- 'oJOria de los elF de acción temprana, a medida que elFsB . Hidrólisis del GTP unido a elF5B
~-:: ;;: une al elFl A del sitio A del ri bosoma. El complejo elF4 • y liberación de elF5B y elF1A
7':;~ y el elF4B se asocian con el casque te y la PABR como
E: ~, .es tra en el paso~, para prepararse para la interacción con
@@GDP
__ : ::>mplejo de preiniciación de 435. Por simplicidad, esto no
,,- ~i?stra. Paso III: la correcta asociación de las subunidades 405
:.; 'esulta en la hidrólisis del GTP unido al elFsB, la liberación Complejo de
':' =SB-GOP y el elFl A y la formación del compl ejo de inicia iniciación 80S
80S con el tRNAiMet apareado por sus bases al codón de
: =: 16n del sitio Pdel ribosoma. (Mapacc cel Q 1. j "',~o nyco'~, 20i O.
iDl. Cell Biol. 10: 11 3.)
~
XG) _~
e¡ que se ensambla el ri bosoma 80Scon Me¡·¡RI\l A;,lel en el sino P del
:na (arribo) , un com pl ejo ternar io que lieva el segundo aminoácido (aa,)
""....ado por el mRNA se une al sitio A (paso ()) Des¡)ués de un cambio de ( " -" 0 --Jo :,
i:Ymación en el ribosoma inducido por la hidrolisi, de GTP en el EF 1o GTP : i
"
.i I
~, el rRNA grande cataliza la formación del enlace peptídico entre el
t ),_
~ ~
, /!
= , el aa 2 (paso ~). La hidrólisis del GTP en el EF 2·GTP causa otro cambio de
.:ormación en el ribosoma que resulta en su translocaclón un codón a lo lar 5 ..........
el mRNAy el corrimiento del tRNA,'·1et no aci la do al sitiO E. y el tRNA con el
~ ' ~I(!o unido al sitio r (paso f:]). El ciclo puede comenzar nuevamente con la
de un complejo ternari o que leva el aa, al sitio A ahora abierto. En el se - RibDO,ol~t'GTP ¿r'~
o ciclo de elongación y ciclos posteriotes. el tRNA en e sitio Ese expu lsa
3nte el paso f] como resultad o del cambio de conformación induc;do por
'drólisis del GTP en el EF1o·GTP lAOapl'o" oe K. H " l!~iho"s y m i,. 2000. e:' P ¡.., Ga,! e,r)
~ . [he Ril",~ome- 51f1.lLFUf( FrmCl! o.:n, Arlf'b:mK;' r¡ó rU úll J!d ' ¡'rl!t'ru :t_~M, "\'SM ~· · b~. p_ ~ 1~1
Entrada del
siguiente
aa-tRNA en
el sitio A
r6 ¿r'GTP
r
nal al papel cata lítico del rRNA grande en la sí ntesis proteica proviene
ue estudios cristalográfic os de alta reso lu ción que muestran que no Translocación
EF2·GTP
.,ay proteínas cerca del sitio de síntesis del enlace peptídico en la es del ribosoma El EF2'GDP + p¡
uctura cristalina de la subunidad gran de en las bac terias.
Después de la síntesis del enl ace peptídico, el ribosoma se ¡¡'anslo
ca a lo largo delmRNA a una distancia equivalente a la de un codón.
Este paso de translocació n es tá con trolado por la hidróli sis de GT P en
complejo EF2· GTP en los eucariontes . Ya ocurrid a la translocac ión
:o rrec tamen te, el GTP unido se hidroliza , otro proceso irreversible
que evita qu e el ribosoma se mueva a 10 largo del RNA en la direcc ión
correcta o que se tr ansloque un número incorrecto de nucleóti
dos. Com o res ultado de los cambios de conformación en el ribosoma ,
e acompañan a la translocación adecuada y la hidrólisis resultante
de GTP por el EF2, el tR N Ai ~'k', ahora sin la metionina activada, se
:nu eve al sitio E (sa lida, en in glés exit ) so bre el ribosoma; al mismo es tado en el cual el sitio A queda abierto y es ca paz de aceptar otro
üempo, un segu ndo tRNA unido ahora en form a covalente a un di tRNA aminoacilado que forma complejo con un EFlex·GTP, com en
do (un peptidil-tRNA) se mueve al sitio P (Fig. 4-25, paso D ). zando otro sitio de elongación de la cadena. La repetición del ciclo de
translocació n hace que el ribosoma retorn e su conformación a un elongación que se muestra en la Figura 4-25 añade un aminoácido
r eRF1'
Vemos ahora que una o más proteínas que unen GTP participan en
cada etapa de la traducción. Estas proteínas pertenecen a la superfa
milla de las GTPasa de proteínas interruptoras que ciclan entre una
forma activa unida a GTP y una forma inactiva unida a GDP (véa
se la Fig. 3-32 ). La hidrólisis del GTP unido provoca un cambio de
conformación en la GTPasa y otras proteínas asociadas que resultan
críticas para varios procesos moleculares complejos. En la iniciación
de la traducción, por ejemplo, la hidrólisis del eIF2·GTP al eIF2-GDP
5' ~ 3' evita un barrido ulterior del mRNA una vez que se encuentra el sitio
de iniciación y permite la unión de la subunidad ribosómica grande a
la subunidad pequeña (véase la Fig. -! - ~-± , paso riJ), De modo si mil ar,
~P
la hidrólisis de EFla,GTP a EFlcx·GDP durante la elongación de la
Escisión del
peptidil-tRNA cadena ocurre solamente cuando el sitio A está ocupado por un tRNA
cargado con un anticodón que aparea sus bases con e! codón de! si tio
A, La hidrólisis del GTP provoca un cambio de conformación e n e!
.~
EFlcx que da como resultado la liberación de su tR.t\lA unido, permi
tiendo que el extremo 3' terminal aminoacilado del tRNA cargado se
~ Hierro alto
5' ~ U ( -I"I¡iCMIlI.llllj'¡a.ilil.¡¡¡nmaGmiI+:'
I o An ------+
H NJ
2
sD
'@a
exones han sido cortados y empalmados de manera incorrecta. Ta. .
cesamiento incorrecto suele al terar el marco abierto de lectura
reg ión 3' de la unión exón inadecuada, dando como resultado L
troducción de una mutación con sentido alterado fuera de ma r~
1
dos correctamente, el codón de terminación está en el exón final. ::
traducida
degradación mediada por mutaciones sin sen tido da como resu l: '
IRE-BP activ o l r la rápida degradación de los mRNA con los codones de termin al.
que se producen antes de la última unión cortada y em palmada er'
o O Hierro bajo
mRNA puesto que en la mayoría de los casos, tales mRNA surgen .
~ LJ L w¡t!ij}I!i3.!.h"dii.!fM- An -11--+
er rores en el proceso de corte y empalme del RNA. Sin embarg
5' No se inicia
degradación mediada por mutaciones sin sentido también tiene 1L.::
la traducción
a partir de una mutación que crea un codón de terminación dentr :
(b) mRNA de TfR
Hierro alto
.5ÚlLvIREs
Regi ó n rica en AU
" I_ ,
... " .
,~ ~~"'
un gen o una deleción o inserción con corrimiento del marco de le . .
ra. Este mecanismo de degradación se descubrió inicialmente dur '
el estudio de pacientes con tal asemi a ~o, quienes producen una con -.
5' o&'¡'¡"i+n,rr.l4f An ------+ tración baja de proteína globina asociada con una concentración '
(.. .1,-,
1
, .... J
,. .......
I
de mRNA ~-globina (J·i g. -32a, b ).
Una búsqueda de posibles señales moleculares que podrían i
Mononucleótidos car las posiciones de las uniones empalmadas en un mRNA proce5.l.:
degradados
llevó al descubrimiento de los complejos de unión d e exones. Ce_
ya se mencionó, estos com plejos de diversas proteínas (incluye~._
Y14, Magoh, eIF4IlIA, UPF2, UPF3 y REF) , unen - 20 nucleótidos ~
Hierro bajo una unión exón-exón a continuación del proceso de corte y emp a::-
del RNA (Flg. !l -32c), estimulando la expor tación de los mRNP a:, .
5' · .. , . An -11--+ Poca
de el núcleo mediante interacción con el mRNA exportador (véa
degradación
Fig. /'1-21 J. El análisis de mutantes de levadura indicó que una de
FIGURA 8-31 Regulación dependiente de hierro de la traducción y proteínas en los complejos de unión de exones (UPF3) funcion a,
degradación de mRNA. La proteína de unión a los elementos de respuesta al la degradación mediada por mutaciones sin sentido. En el citopL
hierro (lRE-BP) controla (a) la traducción de mR NA ferritina y (b) la degradación ma , este componente de complejos de unión de exones interactúa ~
de mRN A del receptor de transferr ina (TfR). Una concentración de hierro intrace
una proteína (UPF1) y una proteincinasa (SMG1) qu e fosforila UPF
lular baja IRE-SP se une a los elementos de respuesta a hierro (IRE) en la fegión
5' o 3' no traducida de estos mRNA. A altas co ncentraciones de hierro, IRE-SP causando que el mRNA se asocie con los cuerpos P, reprimiendll
sufre un cambio en la conformación y no puede uni r los mRNA. El control dual traducción del mRNA. Una proteína adicional (UPF2) asociada co • ~
por parte de IRE-SP regula precisamente la concentración de íones de hierro complejo mRNP, se une a un cuerpo P asociado co n la desanilasa e _.
libre dentro de las célu las. Véase el texto para mayor deta lle. rápidamente elimina la cola de poli(A) de un mRNA asociado, llevan.::
a la rápida eliminación de la cape ruza S' y a la degradación del cuer.
P asociado a la exonucleasa 5' ~ 3' (véase la Fig. R- 29 ). En el casCl .:. .
D e manera sim ilar, estudios in vitro han demostrado que el mRNA que los mRNA adecuadamente procesados, el complejo unión-exón se a,
codifica la proteína de la leche caseína está estabilizada por la hormona cia con el complejo de unión a la caperuza nuclear (CBP80, CBP20
prolactina y rápidamente se degrada en su ausencia. medida que el mRNP es transportado a través de un complejo del po;
nucl ear, protegiendo así al mRNA de la degradación. Se cree que '
Mecanismos de vigilancia evitan la traducción com plejos de unión de exones so n desprendidos del mRNA al pa, ..:;
de los mRNA procesados inadecuadamente por el primer ribosoma "pionero" para traducir el mRNA. Sin emba:
go, para los mRNA con un codón de terminación antes de la unión -::. .
La traducción de un mRNA procesado d e manera inadecuada podría los exones finales, uno o más complejos de unión de exones permane.:
llevar a la producción de una proteína ano rmal , que interfiere con la asociado con el mRNA , dando como resultado la degradación media _
función normal del gen. Este efecto es equivalente al que resulta de por mutaciones sin sen tido ( rig. ¡l. 32 ).
las mutaciones dominantes negativas, analizadas en el Capitulo 5 ( Hg.
5 ·44 ). Diversos mecanismos colectivamente denominad os vigilancia
del mRNA ayudan a la célula a evitar la traducción de las moléculas localización de los mRNA que permiten la
de mRNA procesadas de manera inadecuada. Previamente se mencio producción de proteínas en regiones específicas
naron dos de tales mecanismos de vigilancia: el reconocimiento de los
dentro del citoplasma
pre-mRNA procesados inadecuadamente en el núcleo y sus degrada
ciones por el exosoma, y la restricción general contra la exportación Muchos procesos celulares dependen de la localización de proteín.c. .
nuclear de los pre-mRNA procesados de forma incompleta que perma particulares en estructuras o regiones específic as de la célula. En L
necen asociados con un espliceosoma. últimos capítulos se analizará cómo algunas proteínas son transpor
El movimiento
de proteínas en
membranas y orgánulos
Una célula de mamífero típica contiene hasta 10 000 tipos de pro El primer proceso general inlplica el direccionamiento de una proteína
las diferentes; una levadura, ap roximadam ente 5 000. La gran ma recién sintetizada desde el citoplasma a un orgánulo intracelular. Esto
:ía de estas proteínas son sintetizadas por ribosomas citosólicos, y puede ocurrir durante la traducción o poco después de que se haya
I( has permanecen dentro del citosol (Cap. 4 ). Sin embargo, hasta completado la síntesis de la proteína. Para las pro teínas de membrana,
rlitad de las diferentes clases de proteínas producidas en una célula el direccionamiento conduce a la inserción de la proteína dentro de
íca son enviadas a uno u otro de los diferentes orgánulos rodead os la bicapa lipídica de la membrana, mientras que en las proteínas hi
r membrana dentro de la célula o a la superficie celular. Por ejem- drosolubles el direccionamiento lleva a la translocación de la proteína
muchas proteínas receptoras y proteínas transportadoras deben completa a través de la membrana al interior acuoso de l orgánulo. Las
nviadas a la m embrana plasmática, algunas enzimas hidrosolubles, proteínas son clasificadas al retículo endoplasmático (RE), las mito
110 las RNA y las DNA polimerasas, deben ser dirigidas al núcleo; y condrias, los cloroplastos, los peroxisomas y el núcleo mediante este
¡w mponentes de la matriz extracelular, así como las enzimas diges proceso general (rig. J .~ - l ) .
ls y las moléculas de señalización poli peptídicas, deben dirigirse a El segundo proceso general de clasificación se conoce como la
ilperficie celular para ser secretadas desde la célu la. Éstas y todas las vía secreto ra e implica el transporte de pro teínas desde el RE a s u
as proteínas producidas por una célula deberán alcanzar sus ubica destino final , dentro de las vesículas rodeadas por membrana . Para
!les correctas para que la célul a funcione adecuadamente. muchas proteínas, incluso las que co nstituyen la matriz extracelul ar,
El envío de proteínas recién si ntetizadas a sus destinos celulares el destino final es el exterio r de la célula (de allí el nombre); las pro
tcuados, habitualmente conocida como direccionamiento o clasifica teínas integrales de la membrana también son transportada s al Golgi,
rle proteínas, comprende dos tipos de procesos muy distintos: un los lisosomas y la membrana plasmática m ed iante este proceso. La
ccionamiento basado en señales y un tránsito basado en vesículas. vía secre tora comienza en el RE; así, todas las proteínas que han sido
NTENIDO
2 Inserción de las proteínas de la membrana 13.5 Direccionamiento de ,las proteínas a los peroxisomas 612
dentro del RE 587
13.6 Transporte hacia el interior y el exterior del núcleo 615
3 Modificaciones, plegamiento y control de calidad
de las proteínas en el' RE 594
o ANIMACiÓN GENERAL: Clasificación de las proteínas
Membrana
nuclear externa
Membrana
-jf
nuclear interna Núcleo
/
mRNA "-....
D\ Poro
nuclear
Citosol
~ Secuencia de
señalizaci ón RE 7)0"\
Prote!~a ~ /
Q)
cltosollca Secuencia ~
Retículo endoplásmíco direccionadora ~ Peroxisoma
Espacio
intermembranoso
Membrana externa
Matriz __~~=\;:::=~~::::::--::..:¡:;
interna Mitocondria
Cloroplasto
m ) \ mi
Memb~na ~
plasmática
~,Llsosoma
VíA SECRETORA
Figura 13-1 Resumen de las principales vías de clasificación de las prote'nas son seleccionadas para otros subcompartimentos de estos Oi _
proteínas en los eucariontes. Todos los mRNA codificados en el núcleo se nulos por pasos adicionales de clasificació n Las proteínas nucleares enlf?
traducen en ribosomas citosólicos, Derecha (vías no secretoras): la síntesis de y salen a través de poros visibles en la envoltu ra nuclear. Izquierda (vía de
proteínas que carecen de una secuencia de seña lización RE se completa en secreción): Los ribosomas que si ntetizan proteínas nacien tes en la vía Sff' ;;,-
los ribosoma s libres (paso i1) , Las proteínas que no contienen secuencia de ra se dirigen hacia el retícu lo endoplasmático (RE) rugoso por una secue- '
direccionamiento son liberad as en el citosol y permanecen allí (paso ~ , Las de señalización (rosado; pasos O, ~ , Después de que se ha completado ';
proteínas co n una sec uencia específi ca para orgánulo (rosa do) primero son traducción sobre el RE. estas proteínas pueden desplazarse por medio de
liberadas al citoso l (paso ~ y luego son importadas a las mitocon'drias, cloro vesícu las de transporte hacia el complejo de Golgi (paso 6), La clasificac':
plastos, peroxisomas o el núcleo (pasos~, La s proteínas de las mitocondrias adicional envía proteínas a la membrana plasmática o a los lisosomas (pas
y de los cloroplastos típicamente atrav iesa n las membranas externa e interna rn,ffil), Los procesos que emplea n vesículas corresponden a la vía seere :r
para ingresar en la matriz o en el espacio del estroma, respectivamente, Otras (pasos ~. O, recuadro sombreado) y se ana lizan en el CaJ'- '1ulc 1,l ,
seleccionadas para ingresar en la vía secretora, inicialmente, están di nativa mediante los catalizadores del plegamiento proteico pre5t'!
reccionadas ha cia ese orgá nul o, en la luz del RE, De hecho, el RE es la localización en la que ap ~
El direccionamiento hacia el RE, por lo general, incluye las proteí madamente un tercio de las proteínas de un a célu la típi ca se p lt ~
nas nacientes aún en proceso de síntesis, en un ribosoma, Las proteí sus co nformaciones nativas, y la mayoría de las proteínas residente< _
nas recién sintetizadas son expulsadas desde el ribosoma directamente RE -de un modo direc to o indirecto- contribuyen al proceso de ;
al interior de la membrana del RE, Una vez translocadas a través de garnien to, Corno parte de dicho proceso, las proteínas también S ~
la membrana del RE, las proteínas se ensamblan en su conformación mod ificacio nes postraduccionales específicas en el RE, Estos prOOl'
13.1 Direccionamiento de las proteínas hacia la membrana del RE y a través de ésta 579
I1ACIÓN FOCALlZADA: Sfntesis de las proteínas secretadas un idas a la membrana
=' .A SRP
a
D
:lecuencia
r::
~E señalización
El ~GDP.P;
!L3
-
Translocón Translocón
(cerrado) (abierto)
"'
Secuencia de
señalización
cortada Proteína
plegada
- =iA 13-6 Translocación cotraduccional. Pasos D, fl una vez que la dica. Paso 0 : a medida que la cadena polipeptídica se alarga, pasa a través del
;; de señalización RE emerge del ribosoma, se une por una pa rtícula de canal del trans locón hacia la luz del RE, donde la secuencia de señalización es
-niento de la señal (PRSl Paso~: la PRS entrega el com plejo ribosoma/ cortada por la peptidasa señal y rápidamente degradada. Paso rilla cadena
10 nacien te al receptor PRS, en la membrana del RE. Esta interacción peptídica contin úa alargándose a medida que el mRNA se traduce hacia el
- ::C"Zilda por la unión de GTP tanto a la PRS como a su receptor Paso n extremo 3' terminal. Como el ribosoma está unido al translocón, la cadena
;:"da del ribosoma/polipéptido naciente al translocón, que conduce a la creciente es expulsada a través del translocón hacia la luz del RE. Pasos fl, m:
: CJe su canal de translocación e inserción de la secuencia de seña lización una vez que se ha completado la traducción. el ribosoma se libera, el resto de
' ~en to adyacente del polipéptido creciente al poro central. Ta nto la la proteína es extraída a la luz del RE, el translocón se cierra y la proteína asume
-:- el receptor de PRS. una vez disociados del translocón, hidrolizan su la conformac ión plegada nativa .
• - y luego están listos para iniciar la inserción de otra cadena polipeptí
-:gura 13-6 resume nuestro conocimiento actual acerca de la sín la membrana del RE, el ribosoma y la cadena naciente rápidamente
~_~ proteínas que serán secretadas, así como la función de la partícula son transferidos al translocón, un complejo de proteínas que forma un
-': nocimiento de señal y de su receptor, en este proceso. La hidrólisis canal embebido dentro de la membrana del RE. A medida que conti
-:-;-P unido acompaña el desensamblaje de la partícula de reconoci núa la traducción, la cadena en crecimiento pasa directamente desde la
. -. de señal y del receptor de esta y, en un modo que aún no se com subunidad ribosómica grande al poro central del translocón. La subu
-~. inicia la transferencia de la cadena naciente y del ribosoma a un nidad ribosómica 60S está alineada con el poro del translocón de modo
: : la membrana del RE, donde puede producirse la translocación. tal que la cadena creciente nunca queda expuesta al citoplasma y se
- .~s de disociarse una de la otra, la partícula de reconocimiento de evita que se pliegue hasta que alcance la luz del RE (véase la ¡: ig. 13-6).
u receptor liberan -cada uno- su GDP unido, la partícula de El translocón fue identificado inicialmente por mutaciones en el
- )(imiento de señal se recicla en el citosol y ambas están listas para gen de la levadura que codifica la Sec61a, que causan un bloqueo en
- otro ciclo de interacción entre los ribosomas que sintetizan pro- la translocación de las proteínas secretoras al lnterior de la luz del RE.
nacientes -que serán secretadas- y la membrana del RE. Posteriormente, se encontró que tres proteínas denominadas complejo
Sec61 formaban el translocón de los mamíferos: Sec61a, una proteí
aso de los polipéptidos crecientes a través na integral de la membrana con 10 hélices a que se expandían en la
translocón es impulsado por la traducción membrana, y dos proteínas más pequeñas llamadas Sec61~ y Sec61y.
Experimentos de entrecruzamiento químico -en los cuales las cadenas
tZ que la partícula de reconocimiento de señal y su receptor han laterales de los aminoácidos de proteínas nacientes, por ser secretadas,
..;:jonado un ribosoma que sintetiza una proteína secretora hacia podían unirse mediante enlaces covalentes a la subunidad Sec61a- de
13.1 Direccionamiento de las proteínas hacia la membrana del RE y a través de ésta 583
Inserción de las proteínas de la membrana Varias clases topológicas de proteínas integrales
o del RE de la membrana se sintetizan en el RE
· j los anteriores, hemos descrito numerosos aspectos acerca de La topología de una proteína de membrana se refiere al número de veces
-idad de configuraciones de las proteínas integrales (que atra que su cadena polipeptídica se expande en la membrana y a la orien
membrana) presentes en toda la célula. Cada una de estas pro tación de estos segmentos que se expanden en la membrana dentro de
' . o:le una orientación única con respecto a la bicapa fosfolipídica ésta. Los elementos clave que determinan la topología de una proteína
.- c-mbrana. Las proteínas integrales de la membrana localizadas son los segmentos que se expanden en el interior de la membrana; ha
- .E. el Golgi y los lisosomas, así como las proteínas de la membra bitualmente, son hélices u. que contienen entre 20 y 25 aminoácidos hi
:l'!z tica -todas sintetizadas en el RE rugoso- permanecen embe drófobos que contribuyen a interacciones energéticamente favorables
.;-. la membrana, en su orientación única, a medida que se mue en el interior hidrófobo de la bicapa fosfolipídica.
_-;a sus destinos finales a lo largo de la misma vía que siguen las La mayoría de las proteínas integrales de la membrana se encuen
's solubles que serán secretadas (véase la Fig. 13- 1, izquierda ). tran dentro 'de una de las cinco clases topológicas que se ilustran en la
· .este transporte, la orientación de una proteína de membrana Fí¡rura 13-1 (J . Las clases topológicas 1, IJ, III Ylas proteínas ancladas por
- >:;1; es decir, los mismos segmentos de la proteína siempre en la cola comprenden las proteínas de un pase único que poseen solo un
d citosol, mientras que otros segmentos siempre enfrentan la segmento de hélice u. que se expande en la membrana. Las proteínas
~. opuesta. De este modo, la orientación final de estas proteínas tipo 1 tienen una secuencia de señalización RE N-terminal cortada y
--~ brana está establecida duran te su biosíntesis sobre la mem están ancladas en la membrana con su región N-terminal hidrófila en
:.; . RE. En esta sección, en primer lugar, veremos de qué manera la cara luminal (conocida también como cara exoplasmática) y su re
~ ,as integrales pueden interactuar con las membranas; a con- gión hidrófila C-terminal sobre la cara citosólica. Las proteínas tipo II
n. examinaremos cómo diferentes tipos de secuencias, conoci no contienen una secuencia de señalización RE cortada y están orien
· ~ :j vamente como secuencias topogénicas, dirigen la inserción tadas por su región N-terminal hidrófila sobre la cara citosólica y, por
~1t ación en la membrana de varias clases de proteínas integrales. su región C-terminal hidrófila, en la cara exoplasmática (opuesta a las
~ -o ( esos se llevan a cabo mediante modificaciones de los meca proteínas tipo 1) . Las proteínas tipo IIJ poseen un segmento hidrófobo
oásicos empleados para translocar las proteínas de membrana que se expande en la membrana en su N-terminal y, de este modo, tie
:l secretadas a través de la membrana del RE. nen la misma orientación que las proteínas tipo 1, pero no contienen
co:)
/ cno
coo
encia
de señalización
j' \ segmentada
• NH NH 1
celular) !
Tipo I Tipo 11 Tipo 111 Proteína anclada Tipo IV Proteína unida a GPI
por la cola
Receptor LDL Receptor de Citocromo v-SNARE y Receptores acoplados a la Receptor del activador
Proteína HA de asia log lucoproteína P450 t-SNARE proteína G de plasminógeno
la influenza Receptor de transferrina Transportadores de glucosa Fasciclina II
Receptor de Galactosi Itra nsfe rasa Canales con compuerta
insulina de Golgi regulados por Ca 2+
Receptor de la Sialiltransferasa de Bombas moleculares
hormona del Golgi pequeñas ABC
crecimiento Canal de (CI-) CFTR
Sec61
3-10 Proteínas de la membrana del RE. (inco clases topológicas de ésta son hidrófilas y se pliegan en varias confo rmaciones. Todas las proteínas
- - 3S integrales de la membrana se sintetizan en el RE rugoso, como tipo IVtienen múlti ples hél ices (j transmembrana. La topología tipo IV mostrada
. un sexto tipo unido a la membrana por un ancl a fosfollpidica. La s aquí corresponde al de los receptores acoplados a proteína G: siete hélices (j, el
." la membrana se clasifican por su orientación en ésta y los tipos de \l-terminal en el lado exoplásmico de la membrana y el (-terminal del lado ci
_~ contienen para di rig irlas hacia allí. Para la s proteínas integrales de la tosóli co. Otras proteínas tipo IV pueden poseer un número diferente de hélices
, ::lS segmentos hidrófobos de la cadena proteica forme n hélices (j y va rias orientaciones del extremo N-terminal y (-terminal. (Véase E. Hartmann y cols.
·-=. : :,n la bicapa de la membra na; las regiones que se encuentran fu era ·9f;. p,x. i.ar·IACll.:l. Sél. US A 865786 yc. P llro'Nl1 y 5. D. Block. 1989. J. 8101. ehem. 264:444 2.)
COmPI'jO )
Sec63 \
~m. IDn~
Luz del RE
~ p 0-P..~¡
Secuencia
de señalización El
cortada
~..,-- ........
Figura 13-9 Translocación postraduccional. Este mecan ismo es bastante
común en las levaduras y, probablemen te, se produzca en ciertas ocasiones
en los eucariontes superiores. Las pequeñas Aechas dentro del tran slocón
re prese ntan el deslizamiento al aza r del poli pép tido en translocaci ón hacia e l
interior y hacia el exterior. La unión su cesiva de BiP·ADP a los segmentos que
ingresan del polipéptido evita que la cadena se deslice hacia afuera, hacia el
citoso l. (Véase K. E. Matlack y cols., 1997. Science 277:938)
ADP
CONCEPTOS CLAVE DE LA SECCiÓN 13,1 ción de la PRS (véanse las Figs . 13 -5 y 13-6). A medida que el n'ho
unido al translocón continúa la traducción, la cadena proteica ~
Direccionamiento de las proteínas hacia de la gada es expulsada hacia la luz del RE. No se requiere energía ad .
membrana del RE y a través de esta para la translocación.
• La síntesis de las proteínas secretadas, las proteínas integrales de la ' El translocón contiene un canal central, tapizado con residu "
membrana plasmática y las destinadas al RE, el complejo de Golgi o fobos, que permite el tránsito de una cadena de proteína no __ ~
los lisosomas se inicia sobre los lisosomas del citoso l, que se unen a mientras que permanece sellado para los iones y pequeñas 1110 _: .
la membrana del RE y constituyen el RE rugoso (véase la Fig. 13 - 1, hidrófilas. Además, el canal tiene una compuerta, de modo tal : _
izquierda). abre solo cuando está siendo translocado un polipéptido.
• La secuencia señal de RE sobre una proteína de secreción naciente • En la translocación postraduccional, una proteína secretora co;:- :
consiste en un segmento de aminoácidos hidrófobos localizados en el es direccionada hacia la membrana del RE por la interacción de
extremo N-terminal. cuencia de señalización con el translo cón. Después, la cadena po i: _
dica es dirigida hacia el RE por un m ecanismo de trinquete que r '. _
• En la translocación cotraduccional, la partícula de reconocimiento
la hidrólisis de ATP por la chaperona BiP, que estabiliza el poli. ~
de la señal (PRS) reconoce inicialmente la señal RE de una proteína de
entrante (véase la Fig. 13-9). En las bacterias, la fuerza impulsora ¡:
secreción naciente; se une a ésta y, a su vez, es unida por un receptor de
translocación postraduccional proviene de la SecA, una ATPasa ei: .
PRS a la membrana del RE; de este modo, se dirige el complejo riboso
ca que empuja los polipéptidos a través del canal del translocón.
ma/cadena naciente hacia el RE.
• Tanto en la translocación cotraduccional como postraducciona. _
• Luego, la PRS y el receptor de PRS median la inserción de la proteína
peptidasa señal de la membrana del RE corta la secuencia de se-.~
secretora naciente dentro de translocón (complejo Sec61) . La hidrólisis
ción del RE de una proteína secretora, poco después de que el en: :
de dos moléculas de GTP por la PRS y su receptor provocan la diso cia N-terminal ingresa en la luz.
Citosol
5'
Translocón
abierto , .. ~
Peptidasa
señal
?1lJ ~ NH,
~
C,deo,
polipeptídica
naciente
Secuencia de
detención de la
transferencia anclaje
Secuencia
Luz del RE de señalización
cortada
NH
Figura 13-11 Posicionamiento de las proteínas tipo I de paso único. la transferencia cl' claje se desplaza en direcc ión latera l, entre la s su' Uf' ~_
Paso U: después de que el complejo ribosoma/cadena nacien e se asoci a con oel ranslocón, y se ancla a la bicapa de fosfolipidos. Probablemente, e-
un tra nslocón en la me mb rana del RE, la secuencia de se'ial : za~;6n N-ter Inal mome nto, el t'a nsl ocón se c erre. Paso 0 : a medioa que la síntesis co n-
se segmenca. Este proceso se produce po r el mismo mec nisn1 0 que el oe las I¿, cadena qu e esra alargándose pu ede for mar un asa hacia el citosol,,, - _
proteínas solubles secretoras (véase la Flg. 13-6) Pa sos ~, El: la cadena se a arga de un pequeño espacio en re el ri oosoma y ei translocón. Paso [11: cua-
hasta que se sintetiza la secuencia de detención de la transferer.cia anclaje sí resis se ha co, pletado, las sub unidades ri bosómicas se liberan en'?' :
hidrófoba e ingresa en el ranslocón.lugar en el Que evita que la ade a na y también se ibera la oroteíl' a para ou e difunda en la membrana. (W.",
ciente salga más allá, ha da la luz del RE. Paso ril: la secuencia de e¡ene ló', Je : :- ":iS : ;%, : ¿- 85 : :~9 y -:.' ;\'O: ¡"~!· y _ols.. 19; 7 ':t' 89:52 3 \
EJ o (bl
Cadena
polipeptídica
naciente
o El EJ coo
~
RE
13-12 Posicionamiento de las proteínas de paso único tipo 11 interna se desplaza en dirección lateral, sale del translocón y ancla la cadena
al Proteínas tipo 11. Paso U después de que se ha sintetiZado la a la bicapa de fos folíp idos. Paso~: una vez que se ha completado la síntesis
, ',terna seña li zación-an claje en un ribosoma citosólico, es unida por pro tei ca, el extremo (-ter minal del polipéptido se li bera hacia la luz. y las
-} se muestra), que dirige el complejo ribosoma/cadena nac iente subunidades ribosómicas se libera r¡ al citosol. (bl Proteínas tipo 111. Paso D: el
. ~'-nb rana del RE. Esto es similar al direcciona miento de las proteínas ensamblaje se realiza por una vía similar a las de las proteínas tipo 11, excepto
:~-::'e toras, excepto por el hecho de que la secuencia de se ñalización qu e los residuos positivamente cargados en el lado (- ter minal de la secuencia
- -o se localiza en el extremo f+ terminal y no es posteriormente de seña lización-anclaje hacen que el segmento transmembrana se oriente
-o cadena nac ie nte se orienta en el translocón, con su porción dent ro de! translocón, con su porción (-te rmi na l orientada hacia el citosolyel
_ r acia el citosol. Se cree que esta orientación estiÍ medi ada por los lado ¡\J-tE 'minal de ia proteína en la luz de l RE. Pa sos ~, U la elongación de la
: ¡:¡ivamente ca rgados que se muest'an en posición N-termin al cadena de la porción C-te'mi nal de la proteína se completa en el citosol, y se
- --:) a la secuencia de señalización-anclaJe. Paso ~: a medida que la liberan las subun idades ribosó micas. (Vé~se M. Splesl Y H". Lodlsh. 1986. Cel: 44:177 y H. Do
=¿, 3iga y se expulsa hacia la luz, la secuencia señalización-anc laje y m is, ' .g%, Ü:,f 85 3 c;_~
f D
"-
~
\ coo- ~ Get3
~ ----,
Cola hidrófoba -_o, ..,¡~_ _ _ _ _ _ _ __
3 ~ oqueado
tunicamicina Citosol
_:p I UDP 5 GDP
• Ó
4 GDP 3 UDP
IMP \ 4 GDP Ó 3 UDP A
,
\
Dj /if" ~ /EI
JA
"O'
T(:
r ~ >-< >-<
~
t ~ ~ f: :j ~
11 = N-acetilglucosamina
0= Manosa
A = Glucosa
Luz del RE
13-17 Biosíntesis del precursor de oligosacáridos. El dolicol sacáridos N-iigados de las células. Después de que el intermediar io dolicol
;os un lípido fuertemente hidrófobo que contiene 75-95 áto mos de pirofosforilo de siete residuos cambia a la ca ra luminal (paso tiI), los cuatro
y está em bebido en la membra na del RE. Se añaden dos residuos residuos de manosa y los tres residuos de glucosa restantes se añaden uno
-¿,¡ilglucosam ina (GlcNAc) y cinco residuos de manosa. uno a la vez. al por vez (pasos 0,0). En las últi mas reacciones, el azúcar que será añadido se
'mfato de la cara citosólica de la membrana del RE(pasos O-D). Los tra nsfiere, primero, desde un nucleótido-azúcar a un transportador dolicol
=5 de nucleótido-azúcar, en estas reacciones y otras posteriores, se fosfato en la cara citosólica del RE; luego, el transportador se vuelve hacia
21 en el citosol. Nótese que el pri mer residuo de azúcar está unido al la cara lu mi nal, donde el azúcar es transferido al oligosacárido creciente;
'Tlediante un enlace pirofosfato de alta energía. La tun icamici na, que despué s, el transportador "vacío" se vuelve nuevamente a la cara citosólica.
~ ; la primera enzima de esta vía, inhi be la síntesis de todos los oligo fTorr·ado de C Abeijon y C. 6. Hi',mo.rg. 1992. írend, Biochem. So 17:32.)
~
+- Al
\.. ~ ~ ~
D fJ El El
'V (Man)s(GlcNAC)2
Luz del RE
FIGURA 13-18 Adición y procesamiento inicial de oligosacáridos La ad'ció osterior de un resi:iuo de glucosa (paso ÉE) cumple un papel er
N-ligados. En el RErugoso de las células de los vertebrados. el precursor plega miento correcto de muchas proteínas en el olegamiento del RE. com
Glc,Man 9(GlcNAc), es transferido desde el t'cl1s portado r oo:icol hada un anali zará des pués, El proceso de glucosilación N-ligada de una proteína soC
residuo de asparagina susceptible, en un protelna raciente, an pr::mto cOmo secretora se uestrc aquí. pero las porciones lumi nales de una proteína jr -,:
la asparagina atraviesa aliado luminal del RE (paso (J), En tres reacciones sepa gra: de ia memb"a03 pueden ser modi' cadas sobre los residuos de aspa rf.,!
radas, en primer lugar un residuo de glucosa (paso fl); luego, dos resiouos de por el mismo mec a ni s mv. \/~~F Korn"'oyS Kcmfelu. 1985.Ar.n Re'IB /lem 45:6;1
glucosa (paso ~ y, fi nalmente, un residuo de manosa (paso ~ son elimin -ocs. ~ :;;:;:i3y a .i ¡;arooi, ·~S,E, l,lb..;). 14 :"¡i%.l
Las cadenas laterales de los oligosacáridos que une azúcares en ciertas CAM presentes en las células endoteliale' :: ,
pueden promover el plegamiento y la estabilidad revisten los vasos sanguíneos. Esta interacción une los leucocitos al
de las glucoproteínas dotelio y ayuda en su movimiento hacia el interior de los tejidos dL!T
una respuesta inflamatoria a la infección (véase la Fig. 20-39 ). Otr~:c .
Los oligosacáridos unidos a las glucoproteínas cumplen varias funcio coproteínas de la superficie celular poseen cadenas laterales de olig
nes. Por ejemplo, algunas proteínas requieren los oligosacáridos N ridos que pueden inducir una respuesta inmunitaria. Un ejemplo co .. _
ligados para plegarse adecuadamente en el RE. Esta función ha sido está representado por los antígenos de los grupos sanguíneos A. '"
demostrada en estudios realizados con el antibiótico tunicamicina , que que son oligosacáridos O-ligados unidos a glucoproteínas y glucolij: ~
bloq uea el primer paso de la formación del precursor ligado a dolicol y, de la superficie de los eritrocitos y de otros tipos celulares (Fig. I -_
por lo tanto, inhibe la síntesis de todos los oligosacáridos N-ligados en En ambos casos, los oligosacáridos se agregan a la superficie lum!.!'L _
las células (véase la Fig. 1.3-1 7, arriba, a la izquierda). Por ejemplo, en estas proteinas de la membrana de modo similar a lo que se mue ~ _
presencia de tunicamicina, el polipéptido precursor de la hemaglutini la figura U-Ji; para las proteínas solubles. La cara luminal de es tas _
na del virus de la influenza (HAo) se sintetiza, pero no puede plegarse teínas de membrana es topológicamente equivalente a la cara exter; - ,
adecuadamente y formar un trímero normal; en este caso, la proteína la membrana plasmática en la que, finalmente, terminan estas prOL
permanece mal plegada en el RE rugoso. Más aún, la mutación de una
asparagina en particular en la secuencia de la HA a un residuo de gluta
mina evita la adición de un oligosacárido N-ligado a ese sitio y hace que Los enlaces disulfuro son formados y reordenad05
la proteína se acumule en el RE en un estado desplegado. por proteínas de la luz del RE
Además de promover el plegamiento adecuado, los oligosacáridos
N-ligados también confieren estabilidad a muchas glucoproteínas se En el Capítulo j aprendimos que tanto los enlaces disulfuro (-5
cretadas. Numerosas proteínas secretoras se pliegan adecuadamente intramoleculares como intermoleculares ayudan a estabilizar la ~ ,'
y son transportadas hacia su destino final, aunque esté bloqueada la tura terciaria y cuaternaria de muchas proteínas. Estos enlaces co'
adición de todos los oligosacáridos N-ligados, por ejemplo, por la tu tes se forman por la unión oxidativa de los grupos sulfhidrilo -_
nicamicina. Sin embargo, estas proteínas no glucosiladas mostraron ser conocidos también como grupos tio/, sobre dos residuos de cist
menos estables que las formas glucosiladas. Por ejemplo, la fibronec la misma cadena polipeptídica o en cadenas polipeptídicas dis- '
tina glucosilada, un componente normal de la matriz extracelular, se Esta reacción puede producirse de forma espontánea solo cuan;:..
degrada mucho más lentamente por acción de las proteasas tisulares presente un oxidante adecuado. En las células eucariónticas, se [-
que la fibronectina no glucosilada. enlaces disulfuro solo en la luz del RE rugoso. De modo que los.-.
Los oligosacáridos de ciertas glucoproteínas de la superficie celular disulfuro se encuentran solamente en las proteínas de secrecio.
también desempeñan una función en la adhesión intercelular. Por ejem bIes y en los dominios exoplasmáticos de las proteínas de la merr~
plo, la membrana plasmática de los glóbulos blancos (leucocitos) contie Las proteínas citosólicas y de los orgánulos sintetizadas sobre I
ne moléculas de adhesión celular (CAi'vf) , que están extensamente gluco somas libres (las destinadas a las mitocondrias, cloroplastos, ~
siladas. Los oligosacáridos de estas moléculas interactúan con el dominio mas, etc.) habitualmente carecen de enlaces disulfuro.
S S
L
'S ---' 2
~
SH
Proteína
SH
L ~
::----- S
sustrato Proteína
reducida sustrato
oxidada
~ L • S S
13-19 Acción de la proteína disulfuro isomerasa (POI). La POI :iol ionizado en el sustrato reacciona con este intermediario; fo rma un enlace
-:¿-:omoda enlaces disulfu ro por medio de un sitio activo con dos disulfuro con a proteína sustrato y li bera la POIreducida. A su vez, la POI
.:.~ cisteína cercanos, que fác il mente se interconvierten entre la forma transfie re electrones a un enlace disulfuro en la proteína lu mi nal Ero1,Io que
.. _:ida y la forma disulfuro oxidada. Las flechas nu-neradas en rojo regenera J¡¡ forma oxidada de la POI. (b) La POI reducida puede catalizar el
" ;ecuencia de las transferencias electrónicas. Las barras en ama rillo reacomoda miento de enlaces di sulfuro incorrec tamente formados mediante
-:.~ los enlaces disulfuro. (a) En la form ación de los enlaces disu!fu reacciones de transfere nd a similares tiol-disulfuro. En este caso, la POI reducida
- , 'oniza da (-5-) de una cisteína de un tiol. en la proteína sustrato, se inicia y se regenera en la vía de reacción. Estas reacciones se repi ten hasta
. :¡ -Jil el enlace disulfuro (S-S) en una POI oxidada para formar un que se logra la conformación más estable de la proteína. (Véase M. M Lyles yH. F.
. ;,río POI, con enlace disu lfuro-proteína sustrato. Luego, un segundo ~ I ""~ . '¡>9I .BJochemiw;30:619.l
(a) Oligosacaril
transferasa
Oolicol
oligosacárido (X-hélice que se (X-hélice
extiende en la membrana luminal
Citosol
POI -s
1
SH
Trímero HAo
Monómero
HAo completo
(b)
"dO,"d"'~\
Pasos 111, 1!1: el prec'u rsor de mRNA, no segme ntado ni e mpa lmado, que
codifica el factor de transcripción Hac l es eSCindido por la Ire l dimérica, y
los dos exones son unidos para formar un mRNA fu ncional de Hac l . La evi
dencia actual indica que este procesamienlo sucede en el citoso l, aunque mRNA d, H"l oort,do pO'
el procesamiento del pre-mRNA generalmente se produzca en el núcleo.
Paso ril: el Hacl se traduce a la proteína Hacl , q ue luego vuel ve al núcleo mRNA Hac1 sin
'-/
y activa la transcripción de los genes que codifi can varios ca talizadores de l cortar ni empalmar~
plegamiento de las proteínas. (W" . U R,.egsegger ., dI., 2C·Y. ( , 11 107:1 3, ~ 3~'tO' ol"!
coll.. 2000, Nor. e.rre,ol 2'326 y C. Sldrauski y P. W.;ter. 1997, Ce1/ 90.1 0jl ; Monómero
Ire1
Citosol
r
macrófagos. La proteína silvestre se une a la tripsina, a la que inhibe, y Luz Dímero Ire1
también a la proteasa sanguínea elastasa. En ausencia de antitripsina del RE D
a, ,la elastasa degrada el tejido fino del pulmón que participa en la ab
sorción del oxígeno, lo que produce finalmente los síntomas del enfise BiP C3'
G
SL
ma. Si bien la antitripsina <Xl mutante es sintetizada en el RE rugoso, no
se pliega adecuadamente y forma un agregado casi cristalino que no se
exporta desde el RE. En los hepatocitos, la secreción de otras proteínas
Proteínas no plegadas Proteínas no plegadas
también se ve afectada, a medida que el RE rugoso se va llenando con la con BiP unida
antitripsina a, agregada . •
~
e
de las proteínas precursoras mitocondriales
~~
~ Tripsina
c~: ensayada en un sistema libre de células. Los
precursores de las prote ínas mitocondriales con
señales de captación-direccionamiento unidas
~ "- • @ eJ.'" '" pueden ser sintetizada s en ribosomas en una reac
"
='Ina . ~ Adición de
c;ón libre de células. Cuando las mitocondrias que
. - ::ondrtal _ ~ mitocondrias de
~
levaduras
energizadas ~ c{}: están respirando se ag regan a los precursores de
las proteínas mitocondriales (arriba), las proteínas
son cap tadas por las mitocondrias. Dentro de estos
organulos, las proteínas son protegidas de la ac
"'roteínas mitocondriales Proteínas captadas por las Proteínas ción de las proteasas, como la tripsina. Cuando no
d e las levaduras sintetizadas mitocondrias; eliminación y secuestradas
hay rnitocondrias presentes (abajo), las proteínas
por los ribosomas citoplasmáticos degradación de la secuencia dentro de las
i;n sistema libre de células de direccionamiento de la mitocondrias, mitocondr iales se degradan, al agregar proteasa. La
captación resistentes a la captación proteica se produce solo con mito
tripsina condrias energizadas (que están respirando), que
tienen un gradiente electroquímico de protones
• C • e (fu erza protomotriz), a través de la membrana
in terna. La proteína im portada debe contener una
Tripsina ..
.,
C'
~
.c
e
. sec ue ncia captación-direccionamiento adecuada .
. ,,' c _ La captación requiere también ATP y un extracto
tc. •• • - c. cltosólico que contenga proteínas chaperonas
Secuencia de e oC que mantengan las proteínas precursoras en una
captación-direccionamiento · c· : c . i: conformación no plegada. Este ensayo ha sido
y degradación de las proteínas . e ':c empleado para estudiar secuencias de direccio
mitocondriales .c: ' C na miento y otras características del proceso de
translocac ión.
acción secuencial de dos secuencias de direccionamiento y dos este efecto. Estos hallazgos indican que el carácter anfipático de las se
po- ~ d e translocación unidos a la membrana: uno para dirigir la cuencias de direccionamiento hacia la matriz es crítica para su función.
, hacia el orgánulo y otro para dirigirla hacia el compartimento El ensayo libre de células que se resume en la FigLl ra J:>-13 ha sido
.- · r o a la membrana adecuada del orgánulo. Como veremos, los ampliamente utilizado en estudios destinados a definir los pasos bio
-:)1 0 Spara seleccionar distintas proteínas para su envío hacia las qu ímicos de la importación de proteínas precursoras a la mitocondria.
-::.rias y los cloroplastos están relacionados con algunos de los En este sistema , las mitocondrias que están respirando (energizadas)
' :nos que analizamos con anterioridad . extraídas de las células pueden incorporar proteínas precursoras mi
tocondrial es que llevan las secuencias de captación-direccionamiento
cuencias de señalización N-terminales adecuadas que han sido sintetizadas en ausencia de mitocondrias. La
~ticas dirigen las proteínas hacia la matriz incorporación exitosa de los precursores al orgánulo puede ser ensaya
L;':"~nd ria l da por resistencia a la digestión mediante una proteasa agregada, como
la tripsina. En otros ensayos, la importación exitosa de una proteína
s proteínas que se desplazan desde el citosol hasta el mismo precursora puede mostrarse por la rotura adecuada de las secuencias
-rutocondrial tienen señales de direccionamiento que compar de direccionamiento N-terminales por proteasas mitocondriales espe
'os en común, aunque las secuencias de señalización, por lo cíficas. La captación de las proteínas precursoras mitocondriales com
~o son idénticas. De este modo, los receptores que reconocen pletas, presintetizadas por el orgánulo, en este sistema contrasta con la
,,:"'.al es son capaces de unir un número de secuencias diferentes, translocación cotrad uccionallibre de células de las proteínas secretoras
- .-"-d onadas. Las secuencias más ampliamente estudiadas para hacia el interior del RE, que se produce generalmente solo cuando las
zación de proteínas en las mitocondrias son las secuencias de membrana s microsomales (derivadas del RE) se encuentran presentes
:lI miento hacia la matriz. Estas secuencias, localizadas en el N durante la síntesis (véase la Fig. J3--i ).
. . habitualmente tienen 20-50 aminoácidos en su longitud. Son
~ minoácidos hidrófobos, aminoácidos básicos de carga posi La importación de las proteínas hacia la
~iniJ1a y lisina) y otros hidroxilados (serina y treonina ), pero mitocondria requiere receptores en la membrana
a carecer de residuos acídicos cargados negativamente (aspar
externa y translocones en ambas membranas
: utamato).
J pone que las secuencias de direccionamiento hacia la matriz La Figur;1 13-2-1 presenta un panorama de la importación de una proteí
- .:ocondria adquieren una conformación cx-heLicoidal en la cual na desde el citosol hasta la matriz de la mitocondria, la ruta dentro de la
o ácidos cargados positivamente predominan a un lado de la mitocondria seguida por la mayoría de las proteínas importadas. Anali
los aminoácidos hidrófobos, del otro lado. Las secuencias de zaremos en detalle cada paso del transporte de proteínas hacia la matriz
-' . que contienen regiones hidrófobas e hidrófilas simultánea y consideraremos el modo en el que algunas proteínas, posteriormente,
conocen como antipáticas. Las mutaciones que alteran este son direccionadas hacia otros compartimentos de la mitocondria.
,"-- anfipático, en general, evitan que se direccionen hacia la ma Después de la slntesis en el citosol, los precursores solubles en las
- 'q ue muchas otras sustituciones de aminoácidos no provocan proteínas mitocondriales (incluso las proteínas integrales hidrófobas
13.4 Direccionamiento de las proteínas hacia las mitocondrias y los cloroplastos 603
FIGURA 13-24 Importación de proteínas a la coo
matriz de la mitocondria. Las proteínas precur Proteína
soras sintetizadas en los ribosomas citosólicos se precu rsora
mantienen en un estado no plegado o parc Ial
mente plegado por chaperonas unidas, como la
Hsc70 (paso D). Después de que una proteína pre
cursora se une a un receptor de im portación cerca
de un sitio de contacto con la membra na Interna
(paso fl), se transfiere al poro de importación Hsc70
general (paso~ . La proteína en translocac ión se ATP citosólica
desplaza, entonces, a través de este canal y de un
canal adyacente en la membrana interna (pasos ADP + Pi
rJ, 0). Nótese que la translocación se produce e n Secuencia de
raros "sitios de contacto"en los cual es s membra ----- direccionamiento
nas interna y externa parecen tocarse. La unión de
/.
hacia la matriz
la proteína de translocaciór¡ por la chapero a de la NH 3
matriz Hsc70 y la posterior hidrólisis del ATP po la
Hsc70 ayuda a impulsar la im portación a la matriz
~/
Una vez que la secuencia de direccio na mien o de
la captación ha sido retirada por una oroteasa de
la matriz y la Hsc70 se ha li berado de la proteína
Receptor Poro de
recién importada (pa so cm, se pliega a la confor de importación fJ
mación madura, act iva dentro de la matriz (paso (Tom20/22)
fA). El plegamiento de algunas proteínas depende
de las chaperoninas de la matriz. {'Jéa¡."- Schatz. 19% Citosol
1. 8jo[ Chem. 271 :3 1763 'J ~J . Pf.arv"\ ~ ( '! c.c \.s 1 9~ 7 , Ar"l R::-/ Cel!
Devel B /. 13:2S)
Espacio
intermembranas
Hsc70
de la matriz
~w;.~ ;::9¡,'\.. ,~W;; 7íf' .~.
Procesa m-"
l Membrana interna " ~.,.,, de la ma ':
.cc('iX.c~tCi o-:Jj:r:. ·L'- por protea;.?
Matriz de la mitocondria
\
proteína~
actIva c.v Secuencia de
direccionamie-' :
segmentada
de la membrana) interactúan en forma directa con la membrana mito nales de direccionamiento hacia la matriz son reconocidas como Th:;- ~
condrial. En general, pueden importarse solo las proteínas no plegadas y Tomn. (Las proteínas que se encuentran en la membrana extem.: :
a la mitocondria. Las proteinas chaperonas, como la Hsc70 citosólica, la mitocondria, implicadas en el direccionamiento y la importació
mantienen las proteínas nacientes y recién sintetizadas en un estado denominan proteínas Tom, por su nombre en inglés, translocón el .
no plegado, de modo tal que pueden ser captadas por la mitocondria. membrana externa, translocon of the outer membrane.)
Este proceso requiere la hidrólisis de ATP. La importación de precurso Los receptores de importación, posteriormente, transfieren las r
res mitocondriales no plegados se inicia por la unión de una secuencia teinas precursoras a un canal de importación de la membrana ext __
de direccionamiento hacia la mitocondria a un receptor de importación Este canal, compuesto principalmente por la proteína Tom40, se e
presente en la membrana externa de la mitocondria. Estos receptores se ce como poro de importación general porque todas las proteínas pfee~_
identificaron, inicialmente, mediante experimentos en los cuales se mos soras de la mitocondria conocidas acceden a los compartimentos := :
traba que anticuerpos dirigidos contra proteínas específicas de la mem riores del orgánulo a través de este canal. Cuando la Tom40 se p w-:
brana externa de las mitocondrias inhibían la importación de proteínas e incorpora a liposomas, forma un canal que atraviesa la membr=
hacia mitocondrias aisladas. Experimentos genéticos posteriores, en los con un poro de la suficiente amplitud como para acomodar una c: '
cuales los genes para proteínas de las membranas eA1:ernas de las mito na polipeptídica no plegada . El poro de importación general forOl ;'! _ .
condrias específicas se encontraban mutados, mostraron que receptores canal, en gran medida pasivo, a través de la membrana externa de la ,
proteicos específicos eran los causantes de la importación de diferentes tocondria, y la fuerza impulsora para el transporte unidireccional h..:...
clases de proteínas mitocondriales. Por ejemplo, las secuencias N-termi el interior de la mitocondria proviene del interior de este orgán ula. =.
/
DHFR
no plegada
";('0 · Citosol
~
( plegada
Intermediario de
DHFR la translocación
Matriz
mitocondrial
Secuencia de
direccionamiento O,21J.m
segmentada
. 'U\ EXPERIMENTAL 13-25 Experimentos con proteínas quiméricas tO, la translocación se bloquea. Si la secuencia espaciadora tiene la longitud
iten dilucidar la importación de proteínas a las mitocondrias. Estos sufi cien te como pa ra ex tenderse a través de ambos canales de transporte,
- '":l entos muestran que una sola secuencia direccionadora a la matriz se genera un in termediario de translocación estable, se escinde la secuencia_
¿ a s proteínas hacia la matriz de la mitocondria y que solo las proteínas direccionadora, generad a en presenc ia de metotrexato, como se muestra aquí
=-:¡.adas son translocadas a través de ambas me mbranas. La proteína qui (cl El extremo C-terrnin al del intermediari o de translocación en (b) puede de
-" de estos experimentos contiene una seña lde direccionami en to hacia la tectarse al in cubar las mitocon drlas con anti cuerpos que se unen al segmento
L en su extremo N-terminal (rojo), seg uida de una secuencia espac ia oora OHFR, seg uid o por partículas de oro cubiertas con la proteína bacteriana A,
'n.:iÓn particular (negro) y lu ego, por la dihidrofol ato reductasa (DHm), que se une de rnodo no especííico a noléculas de anticuerpo (véase la nq.
~~2i ma normalmente presente solo en el citosol. (a) Cuar1do el seg mento ~ : ~). Una fotornicrografía elew ónica de un corte muestra partículas de oro
= JHFR se despliega, la proteína quimérica se desplaza a través de ambas (pu nta de flecha roja) unida al intermediario de translocación, en un sitio de
_.:cranas hacia la matriz de la mitocondria energizada, y la seña lde direc contacto entre las meMbranas externa e interna. Son evidentes, también, otros
-.:.cniento hacia la matriz se elimina. (b) Cuando el extremo C-termina lde la siti os de contaCto (fl echas negras). (la; panes [a! y lb! ada p.adasde J. Rassow y cols.. 1990,
. ~ na quimérica queda fijo en el estado plegado por la uniÓn del metotrexa =¿.B5 _eu 27S : ~ ~) L3 P¿!( : ~ {e} de M. $ch'::€ ger y ccls., 1987,) CeU Hio/. 105:235. cortesia de W. NeupeH.)
13.4 Direccionamiento de las proteínas hacia las mitocondrias y los cloroplastos 605
- , Se cree que las repeticiones FG hidrófobas se presentan en programadas mediante ingeniería genética, en los cuales esta secuen
_H adenas polipeptídicas extendidas, por lo demás hidrófilas, cia se fusionó con una proteína citosólica , demostraron que esta dirige
-, ~l centro del canal transportador. Las nucleoporinas FG son el transporte hacia el interior del núcleo y, en consecuencia, funciona
para la función del CPN; sin embargo, el CPN sigue siendo como una SLN, Posteriormente, las secuencias SLN se identificaron en
aún si hasta la mitad de las repeticiones FG han sido dele muchas otras proteínas incorporadas al núcleo. Muchas de éstas son
-e considera que las nucleoporinas FG forman una matriz similares a la SLN básica del an tígeno T grande del SV40, mientras que
l1exible, con propiedades generales que permiten la difusión otras SLN son bastante diferentes, desde el punto de vista químico. Por
::-~la s pequeñas y excluyen las proteínas hidrófilas no chapero ejemplo, una SLN en la proteína que une RNA, hnRNP Al, es hidrófo
_:- r riores a 40 kDa (véase la fig. 13-330). ba. De modo que debe haber múltiples mecanismos para el reconoci
miento de estas secuencias tan distintas,
....eptores de transporte nuclear escoltan a las Los trabajos iniciales sobre el mecanismo de importación nuclear
'-=:emas que contienen señales de localización mostraron que las proteínas que contienen una SLN básica, similar a
~¡;¡:¡r hacia el interior del núcleo la presente en el antígeno T grande de SV40, serán transportadas con
eficiencia hacia los núcleos aislados, siempre que se les proporcione
,;-m as que se encuentran en el núcleo -como las histonas, los un extracto citosólico CFig, 13-35), Empleando este sistema de ensayo,
~e transcripción y las DNA y RNA polimerasas- se sintetizan los investigadores purificaron dos compo nentes citosólicos requeridos:
. plasma y se incorporan en el interior del núcleo a través de Ran y un receptor del transportador nuclear. La Ran es una proteína
- _s: de poro nucleares. Estas proteínas contienen una señal de
: .--:611 nuclear (SLN) que dirige su transporte selectivo hacia el
(a) Efecto de la digitonina
':"as SLN fueron descubiertas mediante el análisis de mutantes
_. ?ara el antígeno T grande, localizado en el virus 40 de los si
-40). La forma silvestre del antígeno T grande está localizada
- _-:leo de la s células infectadas por virus, mientras que algunas
::lutadas del antígeno T grande se acumulan en el citoplasma
-01 ). Todas las mutaciones causantes de esta localización celular
, se producen en una secuencia específica de 7 residuos, rica
- oácidos básicos, cercana al extremo C-terminal de la proteína:
'3 -Lys -Lys-Arg-Lys-Val. Los experimentos con proteínas híbridas
(b)
- Digitonina + Digitonina
O
- Lisado + Lisado
fV'\ GEF
\.rcvl ~(~\l
~ GTP GDP
G monomérica, pequeña, que existe en conformaciones unidas a GTP ra de la GTPasa (Ran-GAP), que es un componente de los ~
o GDP (véase la Fig. 13-32 ). El receptor de transporte nuclear se une citoplasmáticos del CPN. Esto estimula la Ran para que hic-'
tanto a la SLN de una proteína carga que será transportada al interior GTP unido a GDP, lo que produce la conversión a una coni
del núcleo como a las repeticiones FG de las nucleoporinas. Mediante con baja afinidad por el receptor de transporte nuclear, de :-, _
un proceso físico que aún no se conoce con certeza, uniéndose transi que el receptor de transporte nuclear libre se libera al citopla S-.~ _
toriamente a las repeticiones FG, los receptores de transporte nuclear de puede participar de otro ciclo de importación. El Ran · G D~
tienen la capacidad de atravesar con rapidez la matriz que contiene las plaza nuevamente a través de! poro hacia el nucleoplasma, d.
repeticiones FG en el canal central del poro nuclear, mientras que las encuentra con un fador de intercambio-guanina nucle6tido (
proteínas de tamaño similar que carecen de esta propiedad son exclui que hace que la Ran libere su GDP unido en favor del GTP. El ._
das del canal central. Los receptores de transporte nuclear pueden ser neto de esta serie de reacciones es el acoplamiento de la hidT\:
monoméricos, con un solo polipéptido que puede unirse tanto a las GTP a la transferencia de una proteína que lleva SLN desde el .
SLN como a las repeticiones FG, o diméricos, con una subunidad que ma hacia el interior del núcleo y proporciona, de este modo, u
se une a las SLN, y la otra a las repeticiones FG. conductora para el transporte nuclear.
El mecanismo de importación de proteínas carga citoplasmáti Aunque el complejo receptor de transporte nuclear-car _
cas, mediado por un receptor de importación nuclear, se muestra en plaza a través del poro por difusión al azar, el proceso cotr~
la Figu ra 13-36. Receptores libres de transporte nuclear, presentes en transporte de la carga hacia el interior del núcleo es unidi r. : :
el citoplasma, se unen a sus SLN semejantes en una proteína carga y Dada la rápida disociación del complejo de importación cuar _ .
forman un complejo importina-carga. Luego, el complejo de carga se al nucleoplasma, hay un gradiente de concentración del re _;
transloca a través del canal de l CPN cuando el receptor de transporte trans porte n uelear-carga a través del CPN: elevado en el cit :
nuclear interactúa con las repeticiones FG. El complejo carga rápida donde el complejo se ensambla, y bajo en el nucleoplasma,
mente llega al nucleoplasma y, allí, el receptor del transportador nuclear disocia. El gradiente de concentración es causante de la r: ~ _
interactúa con Ran·GTP, lo que provoca un cambio de conformación unidireccional de la importación nuclear. Un gradiente de
en el receptor del transportador nuclear que desplaza la SLN y libera la tración similar impulsa el receptor de transporte nuclear dt
proteína carga al nucleoplasma. El complejo receptor de transportador nuevamente al citoplasma. La concentración del complejo rcCtt'
nuclear-Ran·GTP difunde nuevamente a través del CPN. Una vez que transporte nuclear-Ran·GTP es más elevada en el nucleoplas ~
e! complejo receptor del transportador nuclear-Ran·GTP llega alIado se ensambla, que en el lado cito plasmático del CPN, donde ~ .:
citoplasmático del CPN, la Ran interactúa con una proteína activado- Finalmente, la dirección del proceso de transporte depende de