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proteína (p. ej., un cofactor enzimático).

Los tres tipos de regulación


_. ~:t'asas de serina hidrolizan los enlaces peptídicos en los sustra­ desempeñan papeles y funciones esenciales en las células vivas. En
. ;<"icos empleando las cadenas laterales de Ser-195, His-57 y Asp­ esta sección analizaremos primero los mecanismos para la regulación
grupos catalíticos. Los aminoácidos de los cuales depende la de la cantidad de una proteína y luego pasaremos a las interacciones
~ ::dad en el bolsillo de unión del sitio de unión de las proteasas de covalentes y no covalentes que regulan la actividad de la proteína.
n los que determinan qué residuo en el sustrato de la proteína
__ :uyo enlace peptídico será hidrolizado y dan cuenta de las dife­
La síntesis y degradación regulada de las proteínas
la especificidad de la tripsina, la quimotripsina y la elastasa.
es una propiedad fundamental de las células
;:"?C uencia, las enzimas, emplean la catálisis ácido-base media­
La velocidad de síntesis de las proteínas está determinada por la veloci­
: ~s cadenas laterales de uno o más aminoácidos, tales como los
dad a la cual el DNA se convierte a mRNA (transcripción), la cantidad
, ' m idazol en la His-57 de las proteasas de serina, para catalizar
de mRNA activo en la célula en el estado estacionario y la velocidad a la
-:iones. La dependencia del pH de la protonación de los grupos
cual el mR.t'\JA se convierte a proteínas recién sintetizadas (traducción).
- ;JS (pK,J, con frecuencia se refleja en el perfil de tasa de pH de
Estas vías importantes se describen en detalle en el Capítulo 4 .
;:!ad enzimática.
El espectro de vida de las proteínas intracelulares varía desde
~ l1J.l as enzimas, pequeñas moléculas no poLipeptídicas o iones, unos pocos minutos, para las cielinas de la mitosis, que ayudan a re­
cofactores o grupos prostéticos, pueden unirse al sitio activo gular el paso a través de la etapa de la división celular de este proceso
- .?Cñar un papel esencial en la catálisis enzimática. Los peque­ (véase Cap. 19), hasta toda la vida de un organismo, para las proteínas
; ?QS prostéticos orgánicos presentes en las enzimas también son
del cristalino ocular. El espectro vital de una proteína está controlado,
coenzimas; las vitaminas que no pueden ser sintetizadas por principalmente, por la degradación regulada de las proteínas.
~ s de los animales superiores, funcionan como coenzimas o se
Hay dos papeles especialmente importantes para la degradación
- -ara generarlas. de las proteínas. En primer lugar, la degradación elimina las proteí­
nas que son poten cialmente tóxicas, están inadecuadamente plega­
-..timas de una vía común se localizan dentro de compartimentos das o ensambladas o están dañadas -lo cual incluye a los productos
-tó específicos y pueden además estar asociadas como dominios de los genes mutados y las proteínas dañadas por los metabolitos
- . ¡;roteína monomérica, subunidades de una proteína multimé­ químicamente activos de las células o el estrés (p. ej., el choque tér­
. - mponentes de una proteína compleja ensamblados en un an­ mico)-. A pesar de la existencia del plegamiento proteico mediado
:Dm ún (véase la E g. 3-28). por chaperonas, algunas proteínas recién sintetizadas se degradan
rápidamente porque están plegadas de modo incorrecto. Esto puede
ocurrir por una falla en la participación de las chaperonas necesa­
rias en el momento adecuado para guiar su plegamiento o por su
ensamblaje defectuoso en complejos. La mayoría del resto de las
proteínas se degradan con mayor lentitud; la degradación es de al­
Regulación de la función de las proteínas rededor 1-2% por hora, en las células de mamífero. En segundo tér­
_ .-¡.ai'oría de los procesos celulares no son independientes entre mino, la destrucción controlada de proteínas, por lo demás norma­
. :~JJ ren a una velocidad constante. Las actividades de todas las les, proporciona un mecanismo poderoso para mantener los niveles
.;...1~ y biomoléculas están reguladas para integrar sus funcio­ adecuados de estas moléculas y de sus actividades y para permitir
- ~ el óptimo desempeño para la supervivencia. Por ejemplo, cambios rápidos de sus niveles y ayudar a las células a responder a
dad catalítica de las enzimas está regulada de modo tal que las condiciones cambiantes.
- ­ ....ad de producto de reacción es la suficiente para satisfacer Las células eucariontes tienen varias vías para la degradación
~~ .Jerimientos de la célula. Como resultado de ello, las concen­ de las proteínas. Una de las principales es la degradación median­
- -:'.S de los sustratos y los productos en el estado estacionario te las enzimas de los lisosomas, que son orgánulos limitados por
;:¡.--: dependiendo de las condiciones celulares. La regulación de membrana, cuyo interior acídico (pH - 4,5) está lleno de enzimas
-' :"'iDas no enzimáticas -la apertura o cierre de los canales de hidrolíticas del huésped. La degradación en el interior de los lisoso­
-- ::;::;;.."Irana o el ensamblaje de un complejo macromolecular, por mas está dirigida principalmente contra los orgánulos envejecidos o
.: -=~ también es esencial. dañados de la célula -mediante un proceso conocido como autofa­
eral, hay tres formas de regular la actividad enzimática. En gia- (véase el Cap . 14 ) y hacia las proteínas extracelulares captadas
_ ';'lr, las células pueden aumentar o disminuir el nivel de una por la célula. Los lisosomas serán analizados extensamente en capí­
o::: el estado estacionario al alterar su velocidad de síntesis, tulos posteriores. Aquí nos centraremos en otra vía importante: la
-=-:: de degradación, o ambas. En segundo término, las célu­ degradación de las proteínas en el citoplasma por los proteasomas,
: ~ iar la actividad intrínseca, de un modo independien­ que puede constituir hasta el 90% de la degradación proteica en las
~ad de la proteína. Por medio de interacciones covalentes células de los mamíferos.
~ _, pueden cambiar la afinidad por la unión al sustrato o
'lile la proteína se encuentra en la conformación activa El proteasoma es una máquina molecular usada
-. a la forma inactiva. En tercer lugar, puede haber un
pa ra la degradación de las proteínas
n calización o la concentración de la proteína dentro de
diana de la actividad proteica (p. ej., un sustrato enzi­ Los proteasornas son máquinas macro moleculares muy grandes que se
alguna otra molécula requerida para la actividad de la usan para degradar proteínas e influencian muchas funciones celulares

3.4 Regulación de la función de las proteínas 85


~ ANIMACIÓN GENERAL: El proteosoma

(b) FIGURA 3-29 Proteólisis mediada por ubicuitina y


proteasomas. (a) Izquierda' el proteosoma 265 tiene un a
E1 E2 Proteína diana estructura d línd rica con un casquete 195 (azu l) en cada
Ub AMP I I citosólica extremo de un núcleo 205, que consiste en cuatro anillos
C=O E2 E1

~ 1;'"~:~~~;co
+ ATP + pp¡ heptaméricos apilados (- 11 0 Ade diámetro x 160 Ade
I
E1 '-- J ~ Ub '-- J' ~ largo), cada uno de los cuales contiene o bien subuni­
dades a (a nillos externos) o bien subunidades (3 (anillos
r -_
D fJ
_ _ __ __ _ _ _ __ -----,UTb:O fJ internos) (a marillo). Derecho. corte tra nsversal del núcleo
205 que muestra las cámaras internas. La proteólisis de las
El enzima acti vadora de la ubicuitina
= proteínas marcadas por la ubicuitina tiene lugar dentro de
E2 enzima conjugadora de la ubicuitina
= -NH ~- Ub la cámara interna de l núcleo for mado por los anillos (3. (b)
E3 = ligasa de ubicuitina Las proteínas son ma rcadas para la degradación proteasó­
mica med ian te poliubicui inac ión. La enzima E1 se activa
Ub = ubicuitina por la unión de une moléc ula de ubicu itina (Ub) (paso D
¡ Jy I ego transfiere su mo lécula Ub a un residuo de cisteína
D ¡ Pasos 1, 2, 3 presente en E2 (paso El) La ligasa de ubicuitina (E3) tran s­
(a)
¡ (n veces) fiere la molécula de Ub presente en la cadena lateral-NH2
de una I/sina de la E2 en una proteína marcada, formando
un enlace isopeptídico (paso Dl 5e añade n moléculas
-Ub-Ub-Ub n+ 1
adidonales de Ub a la proteína marcada, modificada por la
Ub por medio de en laces isopeptídicos a la Ub previamente
añadida por repetic ión de los pasos RO, formando una
ATP ~ mi cadena de poliubicUi ina (paso D, La proteina marcada
poliubi cuitinilada es reconocida por el casquete del proteo­
ADP~l soma que emplea desubicuitinasas para retirar los grupos
Ub y la hidrólisis de ATP para llevar a cabo el desplegam ien­
Liberación Reconocimiento to y la transferencia de la proteína desdoblada dentro de la
Ub cámara de proteólisis de la zona central, a partir de la cual
Ub Ub Ub
Ub Ub luego se liberan fragmentos de digestión del péptido más
Ub
~ corto (paso OJ.War:e r'J¡j" .v. I!a"".,e'~ery(ols.. 1998,CeI1 98J 57.
ccnes[.2 de \. BaUf" i$ er mod.fkDda de M. Bochtier y rols" 19 , AnIl.Rev.
ATP) ------ Desplegamiento B'ophYl B:om-o/.lrru,r. 28.<95-317)

Péptidos

\ ~
---- Escisión

Descarga

diferentes, incluidos el ciclo celular (véase el Cap. 1':) ), la transcripción, sas del tipo AAA) con el fin de proporcionar la energía necesaria para
la reparación del DNA (véase el Cap. '¡ ), la muerte celular programada desplegar los sustratos proteicos y transferir selectivamente la energía
o apoptosis (véase el Ca p. 21 ), el reconocimiento y respuesta a las in­ de ellos a la cámara interna del núcleo catalítico del proteasoma. Los
fecciones por organismos extraños (véase el Cap, 23 ) y la eliminación estudios genéticos hechos en levaduras han mostrado que las células
de proteínas plegadas de modo incorrecto. En una célula de rnamífero no pueden sobrevivir sin proteasomas funcionales, lo que da cuenta de
típica hay aproximadamente 30 000 proteasornas. su importancia. Más aún, la actividad adecuada de los proteasomas es
Los proteasomas consisten en - 50 subunidades y tienen una masa de importancia tal que las células gastarán hasta el 30% de la energía
de 2-2,4 x lO' Da. Tienen una zona central catalítica, en forma de ba­ necesaria en sintetizar una proteína para degradarla en un proteasoma.
rril, llamada proteasoma 205 (en la que S es una unidad Svedberg so­ El núcleo catalítico 20S de un proteasoma está formado por dos ani­
bre la base de las propiedades de sedimentación de la partícula y es Uos internos cada uno de los cuales consta de siete subunidades ~, con
proporcional a su tamaño), que tiene aproximadamente 14,8 nm de tres sitios activos proteolíticos por anillo, que delimitan la cámara inter­
altura y 11,3 nm de diámetro. Unidos a los extremos de este núcleo se na de - 1,7 nm de diámetro, con forma de barril, y dos anillos externos
encuentran uno o dos complejos llamados casquetes 19S (Fig. 3-29<1 ) cada uno con siete sub unidades a., que controlan el acceso del sustrato
que regulan la actividad catalítica de la zona central 20S. Cuando este (Fig, J-29a ), Los proteasomas pueden degradar la mayoría de las proteí­
núcleo 20S y uno de los casquetes, o ambos, se combinan, se conoce nas por com pleto, a raíz de que los tres sitios activos en cada anillo de
como el complejo 26S, si bien el que contiene ambos casquetes tiene subunidades ~pueden separar residuos hidrofóbicos, acídicos o básicos.
tamaño mayor (30S). Un casquete 19S tiene entre 16 y 18 subunidades Los sustratos polipeptídicos deben entrar a la cámara a través de una
proteicas, 6 de las cuales pueden hidrolizar ATP (es decir, son ATPa­ abertura regulada de - 1,3 nm de diámetro, que se encuentra en el cen­

86 CAPITULO 3 • Estructura y función de las proteínas


~~ los anillos de subunidades a, más externos. En el proteasoma 265, cataLizada por la ¡igasa ubicuitina-proteína (E3). Este tipo de enlace se
~~ ~rtu ra de este orificio, que es estrecho y con frecuencia solo permi­ Llama enlace isopeptídico porque une covalentemente un grupo amino
- en trada de proteínas no plegadas, está controlada por las ATPasas de una cadena lateral, más que un grupo ami no a, al grupo carboxilo.
tes en el casquete 19S, que también participan en la unión y el Las reacciones posteriores de las ligasas unen covalentemente la glicina
~nb la miento selectivo del sustrato ( Fig. 3-29b, abajo a la derecha). C-terminal a una ubicuitina adicional por medio de un enlace isopép­
;:>ro ductos peptídicos cortos de la digestión proteasómica (2-24 re­ tido a la cadena lateral de la lisina 48, de la ubicuitina adicionada pre­
__ ,,~ de longitud) salen de la cámara y son adicionalmente degradados viamente, para generar una cadena de poliubicuitina unida en forma
- ::¡p idez por las pepdidasas lisosomales del citosol, convirtiéndose covalente a la proteína efectora.
- '. m ente en aminoácidos individuales ("libres"). Un investigador ha
- .;neado diciendo que los proteasomas son las "salas de ejecución ce­ Después de la adición de al menos cuatro ubicuitinas a la cadena
-;:>" en las cuales las proteínas "mueren por miles de cortes': de poliubicuitina, el casquete regulador 19S del proteasoma 26S (en
ocasiones con la ayuda de proteínas accesorias) reconoce las proteí­
Los inhibidores de la función de los proteasomas pueden em­ nas marcadas con la poliubicuitina y las despliega y transporta al
plearse terapéuticamente. Dada la importancia global de los pro­ interior del proteasoma para su degradación (véase la Fig. 3-29b ). A
m as para las células, su inhibición completa y permanente provo­ medida que el sustrato poliubicuitinado se despliega y pasa a la parte
e:, muerte celular. Sin embargo, su inhibición parcial durante central del proteasoma, enzimas llamadas desubicuitinasas (Dubs)
-' !"'"\'alos breves se introdujo como un enfoque para la quimioterapia hidrolizan los enlaces entre las ubicuitinas individuales y entre la
~ á.n cer. Para sobrevivir y crecer, las células necesitan normalmente proteína efectora y la ubicuitina, reciclando las ubicuitinas para ci­
=tividad intensa de una proteína reguladora llamada NFkB (véase el clos adicionales de modificación de proteínas (véase la Fig. 3-2%).
6) así como de otras proteínas similares "pro supervivencia". A su El análisis de las secuencias del genoma humano indica la presencia
. • 3 NFkB puede operar completamente y promover la supervivencia de - 90 Dubs, de los cuales aproximadamente el 80% emplea cisteí­
- cuando su inhibidor, el IkB, está separado y es degradado por los na en una tríada ca talítica similar a las proteasas de serina descritas
!~a Somas (véase el Cap. 16). La inhibición parcial de la actividad de previamente. En algunas Dubs, el cinc es un participante clave de las
?Toteasomas por una molécula pequeña de un fármaco inhibidor reacciones catalíticas.
como resultado el aumento de los niveles de IkB y, en consecuencia,
-:1.>Jl1inución de la actividad de la NFkB (es decir, la pérdida de su Especificidad de la degradación El marcado de proteínas específicas
..-idad pro supervivencia). En consecuencia, las células mueren por para la degradación proteasómica se logra principalmente por medio
: ~rytosis. Dado que algunos tipos de células tumorales son más sensi­ de la especificidad de sustrato de la ligasa E3. Como un testimonio de
~ a la eliminación por los inhibidores de los proteasomas que las su importancia, hay más de 600 genes de ligasa de ubicuitina predi­
..las normales, la administración controlada de los inhibidores de los chos en el genoma humano. Las muchas ligasas E3 de las células de los
~easomas a niveles que matan las células cancerosas pero no las nor­ mamíferos aseguran que pueda modificarse, cuando fuera necesario,
, mostró ser una terapia efectiva para al menos un tipo de cáncer la ampl ia variedad de proteínas que requerirán ser poliubicuitinadas.
.-::.:, el mieloma múltiple. • Algunas ligasas E3 están unidas a chaperonas que reconocen proteí­
nas desplegadas o mal plegadas; por ejemplo, la ligasa E3 CHIP es una
co-chaperona para la Hsp70. t.stas y otras proteínas (co chaperonas,
La ubicuitina marca a las proteínas citosólicas
factores escolta, adaptadores ) pueden mediar la poliubicuitinación
fa su degradación en los proteasomas
catalizada por la ligasa E3 de estas proteínas disfuncionales, que no
pueden volver a plegarse en forma adecuada rápidamente, y su entre­
- proteasomas degradan rápidamente solo aquellas proteínas que ga a los proteasomas para la degradación. En estos casos, el sistema
-en defectos o están programadas para ser eliminadas, deben po­ proteasoma-ubicuitinación-chaperona opera concertadamente para
distinguir entre las proteínas que necesitan degradarse y las que no el control de calidad de las proteínas.
:"quieren. Las células marcan las proteínas que deberían ser degra­ Además del control de calidad, el sistema proteasoma-ubicuitina
.!as, uniendo covalentemente a ellas una cadena lineal de múltiples puede emplearse para regular la actividad de importantes proteínas
_. -:> ias de un polipéptido de 76 residuos llamado ubicuitina, que está celulares. Ejemplo de ello es la degradación regulada de proteínas
-"v conservado desde las levaduras hasta los seres humanos. Esta "cola llamadas ciclinas, que controlan el ciclo celular (véase el Cap. 1'l ).
_ poliubicuitina" sirve como un "beso de la muerte" celular que marca Las ciclinas contienen la secuencia interna Arg-X-X-Leu-Gli-X-lle­
proteínas para su destrucción en los proteasomas. La adición de Gli-Asp/Asn (X puede ser cualquier aminoácido), reconocida por
: : u itina (T'ig. 3-29 b) implica tres pasos distintos: complejos enzimáticos ubicuitinantes específicos. En un momento
específico del ciclo celular, cada cictina es fosforilada por una cielina
~ activación de la enzima activadora de la ubicuitina (El) por la adi­ cinasa. Se piensa que esta fosforilación provoca un cambio de con­
-, de una molécula de ubicuitina, reacción que requiere ATP. formación que expone la secuencia de reconocimiento a las enzimas
ubicuitinantes, lo que conduce a la poliubicuitinación y la degrada­
• :..a transferencia de esta molécula de ubicuitina a un residuo de cis­ ción proteaosómica.
':!.a en la enzima que conjuga ubicuitina (E2).
Otras funciones de la ubicuitina y de las moléculas relacionadas
~ formación de un enlace covalente entre el grupo carboxilo de la con la ubicuitina Hay varios parientes cercanos de la ubicuitina que
~aa C-terminal 76 de la ubicuitina unida a la E2 y el grupo amino de emplean mecanismos similares dependientes de El, E2 y E3 para la
~ ! d ena lateral de un residuo de lisina en la proteína diana , reacción activación y transferencia a sustratos aceptores. Estas modificaciones

3.4 Regulación de la función de las proteínas 87


La rotura o fragmentación proteolítica activa
irreversiblemente algunas proteínas o las inactiva CONCEPTOS CLAVE de la Sección 3 .3
Regulación de la función de las proteínas
A diferencia de la fosforilación y la adición de ubicuitina, que son reversi­
bles, la activación o inactivación de la función proteica por rotura o frag­ • Las proteínas pueden estar reguladas a nivel de la síntesis proteica, de la
mentación proteolítica es un mecanismo irreversible de regulación de la degradación o de la actividad intrinseca de las proteínas, por medio de inte­
actividad proteica. Por ejemplo, muchas hormonas polipeptídicas como la racciones no covalentes o covalentes.
insulina se sintetizan como precursores más largos y, antes de la secreción
desde la célu la, parte de sus enlaces peptídicos deben hidrolizarse para que • El espectro vital de las proteínas intracelulares está determinado en gran
se plieguen adecuadamente. En algunos casos, u n precursor único largo medida por su susceptibilidad a la degradación proteolítica.
polipeptídico, una prohormona, puede fragmentarse a varias hormonas
activas distintas. Para evitar que las proteasas de serina pancreática digie­ uchas proteínas están marcadas para ser destruidas con una etiqueta po­
ran inadecuadamente proteínas antes de que lleguen al intestino delgado, liubicuitína por acción de las ligasas de ubicuitina, y luego se degradan den­
se sintetizan como zimógenos, enzimas precursoras inactivas. La rotura de tro de los proteasomas, grandes complejos cilíndricos con múltiples sitios
un enlace peptídico cerca del e>..1:remo N-terminal del tripsinógeno (el zi­ activos de proteasa en sus cámaras interiores (véase la Fig. 3-29).
mógeno de tri psi na), por una proteasa altamente específica del intestino
delgado, genera W1 nuevo residuo N-terminal (Ile-16 ) cuyos grupos a mino • La adición de ubicuitina a las proteínas es reversible, debido a la actividad de
pueden formar un enlace iónico con la cadena lateral del ácido carboxili­ las enzimas desubicui tinantes.
ca de un ácido aspártico interno. Esto provoca un cambio de conforma­
ción que abre el sitio de unión al sustrato, activando la enzima. La tripsina • En el alosterismo, la unión no covalente de una molécula de ligando, el
activa, luego puede activar al tripsinógeno, el quimotripsinógeno y otros efector alostérico, induce un cambio de conformación que altera la actividad
zimógenos. Cascadas de proteasas semejantes pero más elaboradas (una de una proteína o su afinidad por otros ligandos. El efector alostérico puede
proteasa que activa precursores inactivos de otras) que pueden amplificar ser de la misma estructura O de estructura distinta a las de los otros ligandos
una señal inicial, desempeñan funciones importantes en varios sistemas, cuya unión afecta. El efector alostérico puede ser activador o inhibidor.
tales como la cascada de coagulación de la sangre y el sistema del comple­
mento (véase el Cap. 23 ). La importancia de regular cuidadosamente estos • En las proteínas multiméricas como la hemoglobina, que unen múltiples
sistemas queda clara -la coagulación inapropiada puede provocar coágulos moléculas de ligando idénticas (p. ej., oxígeno), la unión de una molécula de
fatales en el sistema circulatorio mientras que la coagulación insuficiente este tipo puede awnentar o disminuir la afinidad o disminuir la dificultad de
llevaría a hemorragias sin control-. unión por las moléculas de ligando adicionales. Este tipo de alosterismo se
Un tipo raro e inusual de procesamiento proteolítico, llamado Quto­ conoce como cooperatividad (véase la Fig.3-30).
corte y empalme de proteínas ocurre en las bacterias y algunos eucariontes.
Este proceso es análogo a la edición de una película. Un segmento interno • Varios mecanismos alostéricos actúan como interruptores, encendiendo o
de un polipéptido se retira y los extremos de los polipéptidos se vuelven a apagando la actividad de las proteinas en fonna reversible.
unir (se ligan ). A diferencia de lo que ocurre con otras formas de procesa­
miento proteolítico, el autocone y empalme de las proteínas es un proceso • Hay dos clases de proteínas intracelulares interruptoras que actúan sobre
autocatalítico que avanza por sí mismo, sin la participación de otras enzi­ una variedad de procesos celulares: 1) las proteínas que unen Ca l+ (p. ej.,
mas. El péptido escindido parece autoeliminarse de la proteína mediante calmoludina) y 2) los miembros de la superfamilia de la GTPasa (p. ej., Ras),
un mecanismo semejante al que se emplea en el procesamiento de ciertas que ciclan entre las formas activas unidas a GTP e inactivas unidas a GDP
moléculas de RNA (véase el Cap. R). En las células de los vertebrados, el (véase la Fig. 3-32).
procesamiento de algunas proteínas incluye la autosegmentación, pero el
paso de unión posterior no existe. Una proteína de este tipo es la Hedge­ • La fosforilación y desfosfOlilación de los grupos hidroxilo de las cadenas
hog, una molécula de señalización unida a la membrana que resulta crítica laterales de los residuos de serina, treonina o tirosina, por acción de las pro­
para una diversidad de procesos del desarrollo (véase el Cap. 16). teincinasas y las fosfatasas proporciona una regulación reversible de tipo en­
cendido/apagado en numerosas proteínas (Fig. 3-33).
La regulación de orden superior incluye el control
• Las variaciones en la natmaleza de la unión covalente de la ubicuitina a las
de la localización y concentración de las proteínas
proteínas (monoubicuitinación, multiubicuitinación y poliubicuitinación
Todos los mecanismos de regulación descritos hasta aquí afectan a una que implican una diversidad de enlaces entre los monómeros de ubicuitina)
proteína localmente en su sitio de acción, activándola o desactivándola. están involucradas en una amplia variedad de funciones celulares distintas
Sin embargo, el normal funcionamiento de una célula requiere además de la degradación mediada por proteasomas, como los cambios en la loca.l.i­
la segregación de las proteínas a compartimentos específicos como las zación o actividad de las proteínas (véase la Fig. 3-34).
mitocondrias, el núcleo y los lisosomas. Con respecto a las enzimas,
la compartamentalización no solo proporciona una oportunidad de • Muchos tipos de regulación covalente y no covalente son reversibles, pero
controlar la llegada de un sustrato o la salida de un producto, sino que algunas formas de regulación como la escisión proteolítica, son irreversibles.
permite además que reacciones que compiten entre sí tengan lugar si­
multáneamente en distintas partes de la célula. Describimos los meca­ • La regulación de orden superior incluye la compaJ1imentación de las pro­
nismos que emplean las células para dirigir varias proteínas a diferentes teinas y el control de su concentración.
compartimentos en los Capítulos 13 y P .

92 CAPITULO 3 • Estructura y función de las proteínas


aa7- tRNA 7
r.n el DNA eucarionte, cada gen que codifica proteínas se transcribe entrante H
rartir de su propio promotor. Con frecuencia, el transcrito primario I
cial contiene regiones no codifican tes (intrones) interpuestas entre H2N-C-R
I 7
' ,;jones codifican tes (exones). H C===o
I I
H-C' ......-- N-C-R6 O
'-Os transcriptos primarios eucariontes deben sufrir procesamientos \ ,{ \ I
C~O H C=O
R.,"'IA para obtener RNA funcionales. Durante el procesamiento, los \ I
: ,emos de casi todos los transcriptos primarios de los genes que co­ O O
- ~ :an proteínas se modifican por la adición de un casquete 5' y una
tRNA4
.... de poli(A). Los transcriptos de los genes que contienen intrones
saliente
-en corte y empalme, la eliminación de los intrones y la unión de los
es (véase la Fig. 4- 15),
mRNA
- .., dominios individuales de las proteínas multidominio que se encuen­
5·. . . ! ! 3'
- en los eucariontes superiores, con frecuencia son codificados por '-,---' '-,---' i
.es individuales o por un pequeño número de exones. Con frecuen­ Codón Codón
uistintas isoFormas de estas proteínas se expresan en tipos celulares aa, aa2 aa3
. -~ :ili cos, como resultado del corte y empalme alternativo de los exones.
Movimiento del ribosoma - - - -.....

FIGURA 4-17 Los tres papeles del RNA en la síntesis proteica. El RNA
mensajero (mRNA) se traduce a proteínas por la acc ión conjunta del RNA
de transfe re ncia (tRNA) y el ri bosoma, que está compuesto por numerosas
3 La decodificación de los mRNA por los tRNA proteínas, y tres (en las bacterias) o cuatro (en los eucariontes) moléculas de
RNA ribosómico (rRNA) (no se muestran). Nótese el apareamiento de bases
0' ­ -e:n el DNA almacena la información para la síntesis proteica y el e ntre los anticodones de! tRNA y los codones complementarios en el mRNA.
_ :\ lleva las instrucciones codificadas en el DNA, la mayoría de las La formación de un enlace peptídico entre el grupo amino N en el aa-tRNA en·
trante y el e carboxi-termina l en la cadena de proteína crecien te (en verde) está
,jades biológicas son realizadas por las proteínas. Como vimos
ca talizado por uno de los rRNA. aa = am inoácido; R= grupo lateral. (Adap;ado de A.
.- apítul o 3, el orden lineal de los aminoácidos de cada proteina J. Gr,¡'f¡t.. . s y coís., 1999, f/.odem Ger.-flic Al?a'ysis. W H. Freeman and Company.l
-llina su estructura tridimensional y su actividad. Por esta razón,
-....m blado de los aminoácidos en el orden correcto, tal como está
:. :ddo en el DNA, resulta crítico para la producción de proteínas
C}¡lales y así para el adecuado funcionamiento de las células y de
= ,mismos.
_.:'. traducción es el proceso completo mediante el cual la secuencia proteica. Los ribosomas están compuestos por una subunidad grande
tidos de un mRNA se usa como molde para unir los aminoá­ y una pequeña, cada una de las cuales contiene su propia molécula o
~ una cadena polipeptídica en el orden correcto (véase la Fig. moléculas de rRNA .
• ::",'0 ~). En las células eucariontes, la síntesis proteica ocurre en el

,:na, lugar en que los tres tipos de moléculas de RNA se reúnen Estos tres tipos de RNA participan en la síntesis de proteínas en
- ~mpeñar funciones distintas pero cooperativas (Fig. 4- ) -): todos los organismos. En esta sección, nos centraremos en la decodi­
ficación del mRNA por los tRNA adaptadores y de qué manera la es­
'..\ mensajero (mRNA) lleva la información genética transcrip­ tructura de cada uno de estos RNA se relaciona con su tarea específica.
-- - del DNA en forma lineal. El mRNA se lee en conjuntos de se­ De qué manera operan en conjunto con el rRNA, los ribo somas y otros
~ e tres nucleótidos, llamadas codones, cada uno de los cuales factores proteicos para sintetizar proteínas está detallado en la sección
- ~_ tm aminoácido en particular. siguiente. Dado que la traducción es esencial para la síntesis proteica,
los dos procesos comúnmente se refieren como intercambiables. Sin
' A de transferencia (tRNA) es la clave para descifrar los codo­ embargo, las cadenas polipeptídicas resultantes de la traducción atra­
-- R..'\'A. Cada tipo de aminoácido tiene su propio subconjunto viesan un plegamiento postraduccional y con frecuencia otros cambios
que unen el aminoácido y lo llevan al extremo creciente de (p. ej., modificaciones químicas, asociación con otras cadenas) nece­
..l polipeptídica donde el siguiente codón del mRNA lo re­ sarios para la producción de proteínas maduras funcionales (Cap. 3) .
~:-'¡A adecuado, con su aminoácido unido, es seleccionado
'.$0, porque cada molécula de tRNA específica contiene una El RNA mensajero lleva información desde el DNA
i c tres nucleótidos, un anticodón, que se aparea con las ba­ en un código genético de tres letras
:i>-1ón complementario presente en el mRNA.
Como se mencionó previamente, el código genético empleado por las
,-ibosómico (rRNA) se asocia con un conjunto de proteínas células es un código de triple tes, en el que cada secuencia de tres nucleó­
. ribosomas. Estas estructuras complejas que se mue­ tidos, o codón, es "leída" a partir de un punto de iniciación especificado
. :. lo largo de una molécula de mRNA, catalizan el en­ en el mRNA. De los 64 codones posibles en el código genético, 61 espe­
"minoácidos en las cadenas polipeptídicas. También cifican aminoácidos individuales y tres son codones de terminación. El
'-ias proteínas accesorias, necesarias para la síntesis Cuadro 4-1 muestra que la mayoría de los aminoácidos está codificada

4.3 La decodificación de los mRNA por los tRNA 131


Cuadro 4-1 • ti •• • • •

Segunda posición

u e A G

Phe Ser Tyr Cys

Phe Ser Tyr Cys


U
Leu Ser Tyr Terminación

Leu Ser Terminació n Trp

Leu Pro Terminación Arg


ro ~
c: Leu Pro His Arg ri
·E ro
....
C Q¡

....W Leu Pro His Arg -o


o
!!!. '"
;:¡.
c:
-o Leu (Met) * Pro Gln Arg o:::J
:ºo
Vl
~
a. !le Thr GLn Ser ....
ro
ro ....
W !le Thr Asn Ser
3
E ::J
A ~
~
He Thr Asn Arg

Met (Iniciación) Thr Lys Arg

Val Ala Lys Gly

Val Ala Asp Gly


G
Val Ala Asp Gly

Val (Met )* Ala Glu Gly


~ Aue es el cedó n iniciador mas común; GUG habitualment e codifica ¡..'! J ra \";¡li nJ y CCG para Ic-ucina, pero en rJr¡¡s ocaSio ne5 estos cadanes pu eden codifi: ­
CM para mClionioa para inici ar una c..ldena de pro iein<e>.

por más de un codón. Solo dos -la m etio nina y el triptófano- tienen pecifica la secuencia lineal precisa de aminoácidos en una cadena polipep­
un único codón; en el otro extrem o, la leucina, la serina y la arginina tídica, y también señala dónde se inicia y termina la síntesis de la cadena.
son especificados cada uno por seis codones diferentes. Los diferentes Dado que el código genético es un código de tripletes que no se
codones para un aminoácido dado se denominan sinónimos. El código superponen, sin divisio nes entre ellos, un mRNA particular, en teor ía,
en sí se llama degenerado, lo que significa que un am inoácido en parti­ debería traducirse en tres marcos de lect ura distintos. De hecho, algu­
cular puede ser especificado por múltiples codones. nos mRNA mostraron contener información que se superpone y puede
La síntesis de todas las caden as polipeptídicas de una célula eucarion­ traducirse en diferentes marcos de lectura, dando como resultado di­
te o procarionte comienza con el aminoácido metionina. En las bacterias ferentes polipép tid os (Fig. -l - I R). La gran mayoría de mRl'iA , sin em­
se em plea una forma especializada de la m etionín a con un grupo formiJo bargo, puede leerse en solo un marco, porque los codones de detención
unido a su grupo amino. En la mayoría de los mRl'iA, el codón de inicia­ que se encuentran en los otros dos posibles marcos de lect ura terminan
ción (i niciador) que especi1i.ca esta metionina ami no term in al es el AUG. la traducción an tes de qu e se produzca una pro teí na funcion al. En muy
En unos pocos mRNA bacterianos, el codón iniciador es GUG y ocasio­ raras ocasiones ocurre otra configuración codifican te inusual por un
nalmente se usa como codón iniciador para metionina en los eucariontes corrimiento del marco de lectura. En este caso, la m aq uin ar ia de síntesis
CUG. Los tres codones UAA, UGA y UAG no especi1i.can aminoácidos proteica puede leer cua tro nucleótidos como un aminoácido y lu ego
sino que constituyen codones de detención (terminación) que marcan el ex­ continuar leyendo tripletes, o puede retro ceder la base y leer todos los
tremo carboxilo de las cadenas polipeptídicas de la mayoría de las células. tripletes que se continúan en el nuevo marco, hasta la terminació n de la
La secuencia de codones que va entre un codón de iniciación específico cadena. Se conoce solo una docena de casos de este tipo.
hasta un codón de terminación se llama un marco de lectura. Esta dispo­ El significado de cada codón es el mismo en la mayoría de los
sición lineal precisa de ribonucleótidos en grupos de tres, en el mRl\!A, es­ organ ismos conocidos -un fuerte argumento en favor de que la vida

132 CAPíTULO 4 • Meca nismo s genéticos moleculares


Marco 1 La estructura plegada de los tRNA promueve sus
- -,GCU " UGU " UUA " CGA , AU U,AA- mRNA funciones de decodificación
~~~

Polipéptido 1 La traducción o decodificación del lenguaje de cuatro nucleótidos del


DNA y el mRNA al lenguaje de 20 aminoácidos de las proteínas re­
Marco 2
quiere tRt\fA y enzimas llamadas aminoacil-tRNA sintetasas, Para par­
:. -G,CU U " GUU UAC" GAA " UUA ,A - mRNA
ticipar en la síntesis de proteínas, la molécula de tRNA debe ligarse
Polipéptido 2 químicamente a un aminoácido particular mediante un enlace de alta
energía formando un aminoacil-tRNA ( Fig. ·1-19). El anticodón del
Marco 3 tRNA se aparea luego con las bases de un codón del mRNA, de modo
--GCUUG UUU ACG AAU UAA- mRNA tal que el aminoácido activado pueda añadirse a la cadena polipeptí­
dica creciente (véase la Fig . -i-I- ),
Polipéptido 3
Se han identificado alrededor de 30-40 tRNA diferentes en las bac­
; .1 4- 18 Múltiples marcos de lectura en una secuencia de mRNA. terias, y hasta 50-100 en las células animales y vegetales. Así, el número
_::Clón de la secue ncia de mRNA mostrad a comien za en :res sik)s de tRNA de la mayoría de las células es mayor que el número de ami­
" ~ " , ba diferentes (q ue no se muestran). entonces son pos ibles ¡res noácidos empleados en la síntesis de proteínas, y también difiere del
" 'ectu ra superpuestos, En es le eJecnp lo, los codo ne, estar co '¡:dos
número de codones de aminoácidos del código genético (61). En con­
.,.? ~ d erecha en el marco de l mea io y do s bases 2 la derec ha e'l el
- I.·e fi naliza en un codón de detención. Co mo res ult ado, la 'l1is n'¡ a
secuencia, muchos aminoácidos tienen más de un tRNA al que pueden
e - ucleótidos especifica diferentes amin oácic os durante la rra ­ unirse (lo cual explica que pueda haber más tRNA que aminoácidos);
.~ ,;"'1 05 regiones de secuencia que se tradu=en en dos de los tres además, muchos tRNA pueden aparearse con más de un codón (lo cual
. uro posibles son rar as, hay eje mpl:Js ta mo en procariome s C0 "10 explica por qué puede haber más codones que tRNA) .
..-: '1, en especial, en sus viru s, e n los que la mi sma seevencia se
La función de las moléculas de tRNA que tienen 70-80 nucleóti­
: r 'llRI'<A alternativos expresados a partir de la misma reg iór elel
dos de largo depende de sus estructuras tridimensionales precisas. En
::~...¡a se lee en un marco de lec tura en un mRNA y en un marco
solución, todas las moléculas de tRNA se pliegan en una estructura
allvQ en otro, Hay incluso pocos casos en los qu e 13 r'li,ma
se lee en los tres marcos de lectura pos ibles, similar de tallo y bucle, lo cual se asemeja a una hoja de trébol cuando
se lo transporta a dos dimensiones ( r ig. .J.-.2lJa ), Los cuatro tallos son
doble hélices cortas estabilizadas por apareamiento de bases de Wat­
son-Crick; tres de los cuatro tallos tienen bucles que contienen siete
. -:- J evolucionó solo una vez-o De hecho, el código genético u ocho bases en sus extremos, mientras que el resto del tallo que no
- -:1" en el C u adro 4- 1 se conoce como código universal. Sin forma bucles, contiene los extremos 3' y 5' de la cadena, Los tres nu­
~ ~ <1 d igo genético difiere en unos pocos codones en mu­ cleótidos que constituyen el anticodón se encuentran localizados en el
J I ias, en los protozoarios ciliados y en Acetabularia, una medio del bucle central, en una posición accesible que facilita el apa­
- -r~·lLa r. Como se muestra en el Clhldro -1-2 , la mayoría de reamiento de bases codón-anticodón. En todos los tRNA, el extremo
, im plican la lectura de codones normales de termina­ 3' del tallo aceptar del aminoacido que no participa en el bucle tiene
;uesen aminoácidos, no un intercambio de un aminoá­ la secuencia CCA que, en la mayoría de los casos, se añade después de
.. Estas excepciones al código universal, probablemente que la síntesis y el procesamiento del tRNA están completos. Algunas
---o llos evolutivos tardíos; es decir, en ningún momento el bases, en la mayoría de los tRNA, también se modifican después de la
tij o de manera inmutable, aunque no se toleraron cam­ transcripción, creando nucleótidos no estándar como la inosina, di­
.: n3 vez que se comenzó a funcionar un código general hidrouridina y la seudouridina. Como veremos brevemente, algunas
~ .:'e la evolución. de estas bases modificadas tienen papeles importantes conocidos en

: J .t-2

Código universal Código inusual * Se encuentra en

Terminación Trp Mycoplasma, Spiroplasma, mitocondrias de muchas especies

Leu Thr Las mitocondrias de las levaduras

Terminación Gln Acetabularia, Tetrahymena, Paramecium, etc.

Terminación Cys Euplotes

":""...~ nucl eares de los organismos que aparecen en la lista y en los genes de las mitocondrias según se indican .
. 1992, Microbio/. Re\'. 56:229.

4.3 La decodificación de los mRNA por los tRNA 133


Amin oácido (phe) Enlace éster
H o de alta energía
. -_ _H
I
_ ,_N-¡:-C-OH
n H
I
o/
I
H,N - C -C-o H,N-C-C-O
H
I
o
11

I
6 OH
I
11
Unión de la
Phe al tRNAPhe 6
¿H, fJ
Phe-tRNA Phe se
une al codón UUU 6
¿H, I
Resultado neto:
la Phe es
seleccionada

/\)1 • • por su codón

ATP AMP
+ pp¡
I
Aminoacil-tRNA AAA AAA 5_AAA
__
sintetasa especí­ tRNA específico Aminoacil -tRNA 3'
fica para Phe para Phe (tRNA Phe ) mRNA

FIGURA 4-19 Decodificación de la secuencia de ácidos nucleicos a la energ ía (en am2nllo) a un 2' o 3' hidroxilo de la adenosina termina len el tRNA
secuencia de aminoácidos. El proceso pa ra la traducc ión de las secuencias correspondiente. Paso 1'1: una sec ue ncia de tres bases en el tRNA (elan ticodón)
de ác idos nucleicos del mR NA a secuencias de aminoácidos de las proteínas se apa rea luego por la s bases con un codón presente en el mRNAque especi­
involucra dos pasos. Paso il una aminoacil-tRNA sintetasa se acopla en primer fica el amlnoácico unido. Si oc urre un error en cualquier paso, el aminoácido
térm ino a un aminoácido específico por medio de un enlace éster de alta incorrecto puede incorporarse a una cadena poli peptíd ica. Phe = fenilalani na.

(a) 3' la sín tesis pro teica . Vista en tres dimensio nes, la molécula plegada de
A tRl\lA tiene forma de L, en la qu e el bucle con el an ticodón y el tallo
@ ~ dihidro uridina aceptor forman los extremos de los dos brazos (Fig. 4-20b ).
CD ~ in os ina
(El = ribotimidina Tall o aceptor Entre los codones y los anticodones con frec uencia
® = seudourídina ocu rre el apareamiento de bases no estándar
m = grupo metilo
Si fuera imperativo el apareamiento pe rfecto de bases Watson-Crick
entre los codones y los anticodones, las cél ulas deberían con tener
al menos 61 tipos diferentes de tRNA, uno para cada codón que es­
pecifica un aminoácido. Sin embargo, como se indicó previamente,
muchas célul as co ntienen menos de 61 tRNA. La explicación para
el menor nú me ro, radica en la capacid ad de un único anticodó n de
tRNA de reconocer más de un codón, pero no necesariamente cada
codón que cor respon da a un aminoácido dado. Este reconocim ien to
variable más amplio puede ocu rri r por el apareamiento 110 estándar entre las
bases de la así lIa mada posición de balanceo: es decir, la tercera base
(3') en un codón de mRNA y la primera base correspondiente (5') en
: Anticodón su anticodón de tRN A.
La primera y segunda bases de un codón casi siempre fo rman pa­
res de bases es tándar de Watson-Crick y las tercera y segu nda bases,
2 1
respectivamente, del an ticodón correspondi en te, pero pueden ocurrir
,---~~~~--- ,
(b) interacciones no estándar en la cuarta posición, entre las bases en la
f"'. . .
Bucle T'I'CG Tall o aceptor

3' FIGURA 4-20 Estructura de los tRNA. (a) Si bien la secuencia de nucleótidos
exacta varia entre los ¡RNA, todos se pliegan en tallos de cuatro pares de bases
y tres bucles. La secu er cia CCA en el ex remo 3' también está presente en todos
los R\lA. La unión de un aminoácido al A3'da un a'1linoacil-tRNA. Alg unos de
los residuos A, C, G Y Use modifican postranscripcionalmente en la mayoría de
los t R~ .ll, (véase la clave). La c ihidrouridlna (D) casi siempre está prese nte en el
bucle D; de modo similar, la ribotimidina (T) y la seudouridina N') casi siempre
están presen tes en el bucle T'l'CG. El ¡RNAde la alanina de las levaduras, que se
reOéesenta aq f. contiene tan- bién otras bases modificadas. El triplete que se
encue1tra en el extremo de bucle del anticodón se apa rea por sus bases con el
codón correspc ndleme en el mRNA. (b) iVodelo tridimens ional de la es truc tura
general de todos los tR A. Nótese la forma de Lde la molécula . (Pa rte taJ. véaSf
.'.I. ~:; 1:, ) ( C'} 1965, 31.. ¿,net'. 147 '4ó2. Pa1lé ~b~ ,aja¡::tJ::I3 d-e J. A ,"\'n z y D ""oras, 1~9' . T,ends Blochem.
oa 22- ' ,

134 CAPITULO 4· Mecanismos genéticos moleculares


tRNA tRt'\fA que contienen inosina se emplean mucho en la traducción de los
3' codones sinónimos que especifican un único aminoácido. Por ejemplo,
cuatro de los seis codones para la leucina (eUA, eue, euu y UUA)
son reconocidos por el mismo tRNA con el anticodón 3'-GAI-S'; la
inosina en la posición de balanceo forma pares de bases no estándar
Si estas bases se encuentran en la
pr imera posición, o posición de balanceo, con la tercera base de los cuatro codones. En el caso del codón UUA,
del anticodón también se forma un par no estándar G·U entre la posición 3 del anti­
codón y la posición 1 del codón.
32 e
12 G e I entonces el tRNA puede Los aminoácidos se activan cuando se unen
5' mRNA 3' A reconocer los codones
U en el mRNA que tienen en forma covalente a los tRNA
estas bases en la
tercera posición El reconocimiento del codón o de los codones que especifican un ami­
noácido dado por un tRNA en particular es, de hecho, el segundo paso
Si estas bases están en la tercera
posición, o posición de balanceo, en la decodificación del mensaj e genético. El primer paso, la unión del
5' mRNA 3' de un codón de mRNA aminoácido apropiado a un tRNA, es catalizado por una aminoacil­
12 CI A I GI U tRNA-sintetasa. eada una de las 20 diferentes sintetasas reconoce un
aminoácido y todos sus tRNA compatibles o afines. Estas enzimas aco­
32 GI U e A
1 I U G
entonces el codón puede
ser reconocido por un tRNA pIadas unen un aminoácido al hidroxilo libre 2' o 3' de la adenosina,
I que tenga estas bases en en el 3' terminal de las moléculas de tRNA mediante una reacción que
la primera posición del requiere ATP. En esta reacción, el aminoácido es unido al tRNA me­
anticodón
diante un enlace de alta energía, por lo que se dice que está activado. La
energía de este enlace, posteriormente, es la que impulsa la formación
5'
del enlace peptídico que mantiene unidos a los aminoácidos adyacen­
3' tes de la cadena polipeptídica creciente. El equilibrio de la reacción de
tRNA aminoacilación es impulsado adicionalmente hacia la activación del
aminoácido por la hidrólisis del enlace fosfoanhidrido de alta energía
IGURA 4-21 Apareamiento de bases no estándar en la posición de
del pirofosfato liberado (véase la hg. ·H'» ),
ba lanceo. La base en la tercera posición (de balanceo) de un codón de mRNA
Las aminoacil-tRNA sintetasas reconocen sus tRNA afines al inte­
l lrecuencia form a un par de bases no estándar con la base en la primera
osición (o posición de balanceo) del anticodón del tRNA, El apareamiento de ractuar principalmente con el bucle del anticodón y el tallo aceptar, si
¿lanceo permite que el tRNA reconozca más de un codón de mRNA (arriba); bien, en algunos casos, las interacciones con otras regiones de un tRNA
''''iprocamente, permite que el codón sea reconocido por más de un tipo de también contribuyen al reconocimiento. Además, las bases específi­
';"'A (abajo), aunque cada tRNA llevará el mismo aminoácido, Nótese que un cas en los tRNA incorrectos, que son de estructura similar a un tRNA
A con I (inosina) en la posición de balanceo puede "leer" (aparearse con)
afín, inhibirán la carga del tRNA incorrecto. Así, el reconocimiento del
'~ codones distintos, y un tRNA con G o U en la posición de balanceo puede
tRNA correcto depende de ambas, las interacciones positivas y la au­
'\"' dos codones, Aunque A es en teoría posib le en la posición de balanceo del
.:;--ícodón, casi nunca se la encuentra en la na turaleza, sencia de interacciones negativas, Aun así, dado que algunos aminoá­
cidos son de estructura muy sin1ilar, las aminoacil-tRNA sintetasas en
ocasiones comenten errores. Estos, sin embargo, se corrigen por acción
de las propias enzimas que tienen una actividad de verificación de lectu­
ra que controla la corrección en su bolsillo de unión de aminoácidos. Si
::-osición de balanceo. Es de particular importancia el par de bases G·U, se ha unido un aminoácido incorrecto al tRNA, la sintetasa unida cata­
yue estructuralmente se adecua casi tan bien como el par estándar G·c. liza la elin1inación del aminoácido desde el tRNA. Esta función crucial
j, un anticodón dado en el tRNA con G en la primera posición (ba­ ayuda a garantizar que el tRNA entregue el aminoácido correcto a la
.anceo) puede formar un par de bases con los dos codones correspon­ maquinaria de síntesis proteica. La tasa global de errores de traducción
'entes que tengan una pirimidina (e o U) en la tercera posición (Fig. en E. coli es muy baja, aproximadamente 1 por cada 50 000 codones,
2 l ). Por ejemplo, los codones de fenilanalina UUU y uue (5' ---7 3') evidencia tanto de la fidelidad del reconocimiento del tRNA como de
n reconocidos ambos por el tRNA que tiene como anticodón GAA la importancia de la verificación de la lectura por las aminoacil-tRNA
:: --') 3'), De hecho, cualquiera dos anticodones del tipo NNPir (N = sintetasas.
:ualquier base; Pir = pirimidina) codifica un aminoácido único y es
1ecodificado por un tRNA único, con una G en la primera posición
balanceo) del anticodón.
Si bien en raras ocasiones se encuentra adenina en la posición de
alanceo del anticodón, muchos tRNA de plantas y animales contienen CONCEPTOS CLAVE de la Sección 4.3
asina (1), un producto desaminado de la adenina, en esta posición. La decodificación del mRNA por los tRNA
, inosina puede formar pares de bases no estándar con A, e y U. Un
'A con la inosina en la posición de balanceo, puede así reconocer La información genética se transcribe del DNA al mRNA en forma de
'odones correspondientes en el mRNA que tengan A, e o U en la un código de tripletes superpuestos degenerado.
~ : ~a posición (de balanceo) (véase la Fig. ·1-11 ). Por esta razón, los

4.3 La decodificación de los mRNA po r los tRNA 135


• Cada aminoácido está codificado por una o más secuencias de tres individuales dentro de un ribosoma. El ribosoma, el complejo celular
nucleótidos (codones) del mRNA. Cada codón especifica un aminoáci­ con mayor abundancia de RNA y proteínas, dirige el alargamiento de
do, pero la mayoría de los aminoácidos están codificados por múltiples un polipéptido a una tasa de entre tres y cinco aminoácidos adicionados
codones (véase el Cuadro 4- 1). por segundo. Por lo tanto, se sintetizan pequeñas proteínas de 100-200
aminoácidos en un minuto o menos. Por otra parte, tarda entre dos y tres
· El codón AUG para la metionina es el codón de iniciación más común horas sintetizar la proteína más grande conocida, la titina , presente en el
que especifica el aminoácido en el extremo NH,-terminal de una cade­ músculo, que contiene alrededor de 30 000 residuos de aminoácidos. La
na proteica. Tres codones (UAA, UAG, UGA) funcionan como codones máquina celular que lleva a cabo esta tarea debe ser precisa y persistente.
de terminación y no especifican aminoácidos. Con ayuda del microscopio electrónico, los ribosomas se descu­
• Un marco de lectura, la secuencia ininterrumpida de codones del brieron como pequeñas partículas individuales, ricas en RNA presentes
mRNA desde un codón de iniciación específico hasta un codón de en las células, que secretan grandes cantidades de proteínas. Sin embar­
terminación, se traduce en la secuencia lineal de aminoácidos de una go, su papel en la síntesis proteica no se identificó hasta que se obtuvie­
cadena polipeptídica. ron preparados razonablemente puros de ribosomas. Los experimentos
in vitro, con radiomarcaje de preparados de este tipo, mostraron que
· La decodificación de la secuencia de nucleótidos del mRNA a la se­ los aminoácidos radiactivos se incorporaban en primer lugar en las ca­
cuencia de aminoácidos de las proteínas depende de los tRt'\fA y de las denas polipeptídicas crecientes asociadas con los ribosomas, antes de
aminoacil-tRNA sintetasas. aparecer en las cadenas terminadas.
• Todos los tRNA tienen estructura tridimensional semejante, que in­ Si bien hay diferencias entre los ribosomas procariontes yeucarion­
cluye un brazo aceptor para la unión de un aminoácido específico y un tes, las grandes similitudes estructurales y funcionales entre los ribo­
tallo-bucle con una secuencia de anticodón de tres bases en sus extre­ somas de todas las especies reflejan un origen evolutivo común de la
mos (véase la r ig. 4-20). El anticodón puede aparear sus bases con su mayoría de los constituyentes básicos de las células vivas. Un ribosoma
codón correspondiente en el mRNA. está compuesto por tres (en las bacterias) o cuatro (en los eucariontes)
moléculas distintas de rRNA y hasta 83 proteínas, organizados en una
• Dadas las interacciones no estándar, un tRNA puede aparear sus bases subunidad grande y una subunidad pequeña (rig. 1-- 22). Las subunida­
con más de un codón del mRt'\fA; recíprocamente, un codón particular des ribosómicas y las moléculas de rRNA se designan comúnmente en
puede aparearse por sus bases con múltiples tRNA. Sin embargo, en unidades Svedberg (S), una medida de la velocidad de sedimentación
cada caso solo el aminoácido adecuado se insertará en la cadena poli­ de las macromoléculas centrifugadas en condiciones estándar -esencial­
peptídica creciente. mente una medida de su tamaño-o La subunidad ribosómica pequeña
• Cada una de las 20 aminoacil-tRNA sintetasas reconoce un único ami­ contiene una única molécula de rRNA, conocida como rRNA peque­
noácido y lo une de manera covalente a un tRNA afín, formando un ño. La subunidad grande contiene una molécula de rRNA grande y una
aminoacil-tRNA (véase la Fig. 4-19 ). Esta reacción activa el aminoácido, molécula de rRNA SS, más una molécula adicional de rRNA 5,8S en
de modo que puede participar en la formación del enlace peptídico. los vertebrados. Las longitudes de las moléculas de rRNA, la cantidad
de proteínas en cada subunidad y, en consecuencia, los tamaños de las
subunidades difieren entre las células bacterianas y euc~riontes. El ri­
bosoma ensamblado es de 70S en las bacterias y 80S en los vertebrados.
4.4 Síntesis escalonada de las proteínas Actualmente se conocen las secuencias de los rRNA pequeño y
grande de varios miles de organismos. Aunque las secuencias pri­
en los ribosomas
marias de nucleótidos de estos rRNA varían considerablemente, las
Las secciones previas han presentado dos de los principales partici­ mismas partes de cada tipo de rRNA, en teoría, pueden formar tallos­
pantes en la síntesis proteica -el mRNA y el tRNA aminoacilado. Aquí, bucles con bases aparead~s, que generarían una estructura tridimen­
describimos por primera vez el tercer jugador clave en la síntesis de sional similar para cada rRNA en todos los organismos. Las estruc­
proteínas - el ribosoma que contiene rRNA- antes de hacer un detalle turas tridimensionales de los rRNA bacterianos se han determinado
de cómo estos tres componentes se unen para llevar a cabo los eventos por cristalografía de rayos X para las subunidades aisladas 50S y 305,
bioquímicos que conducen a la formación de las cadenas polipeptídi­ Ypara los ribosomas completos 70S ( Fig. -1--23 ). Las múltiples proteí­
cas en los ribosomas. De modo similar a la transcripción, el complejo nas ribosómicas, mucho más pequeñas en casi todo, están asociadas
proceso de la traducción puede dividirse en tres etapas -la iniciación, la con los rRNA de superficie. Si bien el número de moléculas proteicas
elongación y la terminación-, que consideraremos de manera ordena­ de los ribosomas en gran medida excede el número de moléculas de
da. Centraremos nuestra descripción sobre la traducción en las células RNA , éste constituye aprox.imadamente el 60% de la masa de un ribo­
eucariontes, aunque el mecanismo de la traducción es fundamental­ soma. Los sitios en los que los tRNA se unen a los ribosomas se cono­
mente el mismo en todas las células. cen como sitio A , sitio P y sitio E. Como veremos en breve, el tRNA se
mueve entre estos sitios a medida que se desarrolla la síntesis protei­
los ribosomas son máquinas de síntesis proteica ca. Las estructuras cristalinas del ribosoma 80S de las levaduras, una
subunidad 40S de un protozoario y la microscopia crioelectrónica de
Si los muchos componentes que participan en la traducción de] mRNA los ribosomas de plantas se han descrito hace poco tiempo. General­
debiesen interactuar libres en solución, la probabilidad de que ocurrie­ mente, son similares a los ribosomas bacterianos, pero aprox.imada­
ran colisiones simultáneas sería tan baja que la tasa de polimerización de mente el 50% más grandes por las inserciones específicas, presentes
los aminoácidos sería también muy baja. La eficiencia de la traducción en los eucariontes, de segmentos de RNA en regiones de los rRNA
aumenta, en gran medida, por la unión del mRNA y los aminoacil-tRNA bacterianos, así como por la presencia de un número más grande de

136 CAPíTULO 4 • Mecanismos genéticos moleculares


Ribosomas
rRNA Proteínas Subunidades ensamblados

~ + Total: 31

>-
;,
23S 5S
(2900 rNTs) (120 rNT) 50S
~
~ 16S
+ Total: 21 ~

(1 500 rNT)

,. 28S~ ;,8S + Total: 50 ~

:1 28S : 5,8S 5S
> (4 800 rNT, 160 rNT) (120 rNT)
.::

~
~

+ Total: 33
'"
~
;.u
18S 80S
(1 900 rNT) 40S

; 'GURA 4-22 Componentes de los ribosomas procariontes y eucarion­ las bacterias. rRNA 285 y 185 en los vertebrados) y un rRNA 55. la sub unidad
tes.. En todas las células, cada ribosoma consiste e n una subunidad grande grande de los ribosomas de los ve rtebrad os contiene también un rRNA 5,85
5ubunidad pequeña Las dos subunidade s contienen rRNA (en rojo) de apareado por sus bases al rRNA 285. El número eje ribonudeótidos (rNT) de
:eentes long itudes, así como un conjunto de proteínas difere ntes. Todos los cada tipo de rRN A está indicado.
momas contienen dos moléculas de rRNA principales (rRNA 235 y 165 en

- :!ltc ínas (véase la hg. ,1-22 ). Se cree que los aspectos básicos de la metionina solo a una cadena de proteina creciente. La misma aminoacil
tesis proteica son semejantes, si bien la iniciación de la traducción tRNA sintetasa (MetRS) carga ambos tRNA con metionina. Pero solo la
- - lo s eucariontes, que trataremos más adelante, es más compleja y Met-tRNA¡~!c' (es decir, la metionina activada unida al tRNA¡Me,) puede
.:-; :.3 sujeta a mecanismos de regulación adicionales. unirse al sitio apropiado en la subunidad ribosómica pequeña, el sitio P,
Durante la traducción, un ribosoma se mueve a lo largo de una para iniciar la sin tesis de una cadena polipeptídica . El Met-tRNA Met y
.:.sdena de mRNA, interactúa con varios factores proteicos y tRNA y otros tRl"JA cargados se unen solamente al sitio A, como se describirá más
_:.J.fre grandes cambios de conformación. A pesar de la complejidad adelante. Los tRl"JA entran al sitio de salida o sitio E después de transferir
..:eI ribosoma, se han hecho grandes progresos en la determinación de su aminoácido unido covalentemente a la cadena polipeptídica creciente.
estructura general de los ribosomas bacterianos y del modo en que
imcionan en la síntesis proteica. Más de 50 años después del descubri­ La iniciación de la traducción en los eucariontes
-..liento inicial de los ribosomas, finalmente están siendo esclarecidos generalmente ocurre en el primer AUG cercano
II estructura general y su funcionamiento durante la síntesis proteica.
al extremo 5' de un mRNA
Durante la primera etapa de la traducción, las subunidades ribos6­
El metionil-tRNA¡Met reconoce el codón micas pequeña y grande se ensamblan alrededor de un mRNA que
de iniciación AUG tiene un tRNA iniciador activado, ubicado correctamente en el codón
de iniciación en el sitio ribosómico P. En los eucariontes, este proceso
Gamo se mencionó previamente, el codón AUG para metionina funcio­ está mediado por un conjunto especial de proteínas conocidas como
- - corno el codón de iniciación para la gran mayoría de los mRl"JA. Un factores de iniciación de la traducción eucarionte (eIF). A medida
pecto crítico de la iniciación de la traducción es comenzar la síntesis de que cada componente individual se une al complejo, es guiado por
~ teínas en el codón de iniciación, estableciendo de este modo el marco interacciones con eIF específico. Varios de estos factores de iniciación
.3! lectura apropiado para todo el mRNA. Tanto los procariontes como unen GTP y la hidrólisis de GTP a GDP funciona corno un interrup­
eucariontes contienen dos tRNA de metionina diferentes: el tRl"JAt f" , tor de verificación de la lectura que solamente permite que los pasos
e puede iniciar la síntesis proteica, y el tRNAMe<, que puede incorporar posteriores ocurran si el paso previo se desarrolló en forma correcta.

4.4 Síntesis escalonada de las proteínas en los ribosomas 137


~ VIDEO: Modelo 3D de ribosoma bacteriano

50S

30S

FIGURA 4-23 Estructura del ribosoma 70S de E. coli determinado por en claro y oscuro, respectivamente, y el rRNA SS está coloreado en azul
cristalografía de rayos X. Modelo del ribosoma visto en la interface entre oscuro. Se indican las posiciones ribosómicas de los sitios A, P Y E. Note que las
la s subunidades grande (50S) y pequeña (305). El rRNA 165 y las proteínas de la proteínas ri bosómicas se localizan principalmente en la superficie del ribosoma
subunidad pequeña están coloreados en verde claro y verde oscuro, respecti ­ y los rRN A en el interior, cubriendo los sitios A, P Y E. (De B. S. Schuwirth y col$.. 2C05.
vamente; el rRNA 23 5 y las proteínas de la subunidad grande están coloreados x ience 31 0:8 27.)

Antes de la hidrólisis del GTP, el complejo es inestable y permite un El modelo actual sobre iniciación de la traducción en los vertebra­
segundo intento en la formación del complejo, hasta que se ensamble dos se representa en la Figura'¡ 2-1. Las subunidades ribosómica grande
el complejo correcto, lo que da como resultado la hidrólisis del GTP y pequeña, liberadas de un ciclo previo de traducción, se mantienen
y la estabilización del complejo apropiado. En los últimos años se separadas por la unión de los eIF 1, lA Y 3 a la subunidad pequeña
han hecho notables avances en la comprensión de la iniciación de la 405 ( Fig. '¡-2.,1" arriba). El primer paso de la iniciación de la traduc­
traducción en los vertebrados. ción es la formación del complejo de preiniciación 435. Este complejo

138 CAPiTULO 4· Mecanismos genéticos moleculares


Met
Formación
del complejo Met
ternario elF2
40S
D Formación del
> @GTP:'F-comPlejO 435
@GTP
o
Complejo elF4 \ ~ ~e\ }
fÍ\GTP .
'él ~ Complejo de
preiniciación
@ Acti vación 43S
del mRNA

~ .J7-
(.1Fhl AUG

~ 11 Unión al mRNA
ATP
AA
~e\ ¡
~ @GTP
PABP

5'

~e\ 1m Barrido 5' a 3'

5'. < .f q.l:


>-
• ""·U RA 4-24lnidación de la traducción en los eucariontes.
~d~l o actual de iniciación eucarionte implica ocho pasos
- ~ n un comp lejo ternario elF 2 se forma cuando el eIF2-GTP
· 'O ._- tRNAiMet. Paso~: cua ndo un ribosoma se disocia al

mdereconocim ie nto
?"" ' -.aria traducción, la subunidad 405 se une al elFl , el elF1 A
::< =i Se forma un comp lejo de preiniciación 435 cua ndo este
· ~x;a con un complejo ternari o elF2 y elFs. Paso n un mRN A
1
Met
codones,
hidrólisis del
elF2 unido al GTP
y liberación de P
~ ;..~~ ,'O cuando un complejo elF4 de múltiples subunidades se
-" :. subunidad elF4E se une a la estructura del casquete s'y
· ' _ tt~ r¡idad elF4G se une a múltiples copias de la proteína que
:: ~ ~1i(A) (PABP) unida a la co la de poli(A) unida al mRI'JA La
5"...- - - -........~

-t
Complejo de
Jild de helicasa de la subunidad elF4A del RNA desenroll a iniciación 48S
}
_~ ] Jier estructura secundaria del RNA en el extremo 5' del
: "El eIF4B, que estimula la actividad de helica sa eIF4A, tam­
~- ,me este complejo circular en el cua l ta nto el casquete 5' del
I5B\GTP Unión de la subunidad y
como la cola de poli(A) están asociados con el complejo ~ desplazamiento del factor
0=· " 3S0 ril: el complejo de preiniciación 435 se une a un com ­

0@GDPG>~@
: -= - e,F4-m RNA Paso Ii): la helicasa de mRNA elF4A desenrolla
, ':';:"\Jctura secundaria del RNA a medida que el complejo 405
""en la dirección 5'--7 3'hasta que reconoce al codón de @
-::"oon. Paso 0 : el reconocimiento del codán de iniciación
- :e .::¡ue el elFs estimule la hidróli sis del GTP unido al e1F2. Esto
;:3 1a conformación del complejo de oarrido a un complejo
~ --=iación 485 con el anticodón del tRNAiMet apareado por
~:" e s al iniciador AUG en el sitio P 405. Paso flla subunidad 5' . H__ *
,_ :.e une a la subunidad 405, lo que conduce la liberación de

~
- 'oJOria de los elF de acción temprana, a medida que elFsB . Hidrólisis del GTP unido a elF5B
~-:: ;;: une al elFl A del sitio A del ri bosoma. El complejo elF4 • y liberación de elF5B y elF1A
7':;~ y el elF4B se asocian con el casque te y la PABR como
E: ~, .es tra en el paso~, para prepararse para la interacción con
@@GDP
__ : ::>mplejo de preiniciación de 435. Por simplicidad, esto no
,,- ~i?stra. Paso III: la correcta asociación de las subunidades 405
:.; 'esulta en la hidrólisis del GTP unido al elFsB, la liberación Complejo de
':' =SB-GOP y el elFl A y la formación del compl ejo de inicia­ iniciación 80S
80S con el tRNAiMet apareado por sus bases al codón de
: =: 16n del sitio Pdel ribosoma. (Mapacc cel Q 1. j "',~o nyco'~, 20i O.
iDl. Cell Biol. 10: 11 3.)

4,4 Síntesis escalonada de las proteínas en los ribosomas 139


de preiniciación se forma cuando la subunidad 405 con elF 1, lA Y 3 se y eIF4G que luego se asocia con el eIF3 unido a las subunidades 40S,
asocia con eIF5 y un complejo ternario formado por el Met-tRNAt k' con eIF 1 y eIFIA. Este ensamble se une posteriormente a un complejo
y eIF2 unido a GTP (Fig. 4-24, pasos D y D). El factor de inici<1ción ternario eIF2 para ensamblarse a un complejo de iniciación directa­
eIF2 alterna entre asociarse con GTP y GDP; solo puede unirse al Met­ mente sobre un codón AUG vecino. Además, la traducción de algunos
tRNA¡Met cuando se encuentra asociado con GTP. Las células pueden RNA virales de cadena positiva, que carecen de casquete 5' terminal,
regular la síntesis proteica al fosforilar un residuo de serina en el eIF2 se inicia en secuencias IRES virales. Estas caen en clases diferentes, de­
unido a GDP; el complejo fosforilado no puede intercambiar el GDP pendiendo de cuántos eIF estándar se requieran para la iniciación. En
unido por GTP y, de este modo, no puede unir Met-tRNA¡Met con lo el caso del v irus de la parálisis d el grillo, iel IRES de '" 200-nt de largo
que inhibe la síntesis de proteínas. se pliega en una estructura co mpleja que interact úa en forma directa
El mRNA que debe traducirse se une al complejo eIF4 de múlti­ con el ribosoma 405 y lleva a la iniciación sin los eIF e incluso sin el
ples subunidades, que interactúa tanto con la estr uctura del casquete S' iniciador Met-tRNAti<q
como con la proteína que se une a poli(A) (PABP) en múltiples copias En las bacterias, la unión de la subunidad ribosómica pequeña a un
a la cola de poli(A) del mRNA. Se requieren ambas interacciones para ciclo de iniciación ocurre mediante un mecanismo distinto que permi­
la traducción de la mayoría de los mRNA. Esto resulta en la formación te la iniciación en sitios internos en el mRNA policistrónico transcripto
d e un complejo circular (Fig. 4-2-1, paso D). El complejo eIF4 que se a partir de los operones. En los mRNA de las bacterias, una secuencia
une al casquete consiste en varias sub unidades con diferentes funcio­ de'" 6 bases, complementaria al eJl:tremo 3' term inal de rRNA peque­
nes. La subunidad eIF4E se une a la estructura del casquete 5' sobre los ño, precede al codón de iniciación AUG en 4-7 nucleótidos. El apa­
mRNA (Fig. .j.- H ).. La subunidad grande eIF4G interactúa con la pro­ rea miento de bases entre esta secuencia del mRNA, llamada secuencia
teína PABP unida a la cola de poli(A) del mRNA y forma de este modo de Shine-Dalgarno, por sus descubridores, y el rRNA pequeño, ubican
un andamiaje sobre el cual se unen las otras subunidades del eIF4. El a la subunidad ribosómica pequeña en la posición adecuada para la
complejo mRNA-elF4 se asocia luego con el complejo de preiniciación iniciación. Los factores de iniciación comparables a elF1A, eIF2, eIF3,
por medio de una interacción entre el eIF4G y el eIF3 (paso [1). f-Met-tRNAt let se asocian luego con la subunidad pequeña, seguida de
El complejo de iniciación luego se desliza o barre el mRNA asocia­ la asociación de la subunidad grande para formar el ribosoma bacte­
do, a medida que la actividad de helicasa del eIF4A, estimulada por e! riano completo.
eIF4B, usa la energía de la hidrólisis del ATP para desenrollar la estruc­
tura secundaria del RNA (paso D). Este barrido se detiene cuando el Durante la elongación de la cadena cada
anticodón tRNA¡MeI reconoce al codón de iniciación qu e es el primer aminoacil-tRNA entrante se mueve a través
AUG corriente abajo a partir del extremo S' terminal, en la mayoría
de tres sitios ribosómicos
de los mRNA e ucariontes. El reconocimiento del codón de iniciación
lleva a la hidrólisis del GTP asociado con el eIF2, un paso irreversib le El co mplejo ribosoma-Met-tRNAt 1e' adecuadamente ubicado ahora
que evita el barrido adicional, dando como resultado la formación del está listo para comenzar la tarea de la adición secuencial de aminoá­
complejo de iniciación 485 (pas o O). Este direccionamiento al codón cidos para la traducción del mRNA dentro del marco. Como en el
de iniciación correcto se ve facilitado por el elFS, una proteína eIF2 caso de la iniciac ión, un conjunto de proteínas especiales llamad as
activadora de la GTPasa (GAP, véase la Fig . .3-32). La selección del AUG factores de elongación (EF) son necesarias para llevar a cabo el pro­
iniciador se ve facilitada por los nucleótidos que lo rodean , específicos, ceso de elongación de la cadena. Los pasos clave en la elongaci ón so n
llamados secuencia de Kozak, por Marilyn Kozak, quien la definió: (5') la entrada de cada amin oac il tRNA posterior con un tRN A comple­
ACCAUGG (3'). La A que precede al AUG (en negritas) y la G inmedia­ ment ario al siguiente cod ón, la formación de un enlace peptídico yel
tamente posterior a él son los nucleótidos más importantes que afectan movimiento o translocación del ribosoma un codón por vez a lo largo
la eficiencia de la iniciación de la traducción. del mRNA.
La asociación de la subunidad grande (60S) está mediada por la Cuando se completa la iniciación de la traducci ón, como ya se in­
unión de eIF5B al GTP, y resulta en el desplazamiento de muchos de dicó , el Met-tRNA¡'ktse une al sit io P en el ribosoma 80S ensamblado
los factores de iniciación (paso a). La asociación correcta entre las ( Fig. -1-25, arriba). Esta región del ribosoma se llama sitio P porque el
subunidades del ribo soma resulta en la hidrólisis del eIF5B unido al tRNA químicamente unid o a la cadena polipeptídica se localiza allí.
GTP, que se transforma en GDP y la liberación de eIFSB-GDP y de! El seglLl1do aminoacil-tRNA es llevado al ribosoma en forma de un
eIFiA (paso El), con lo qu e se completa la formación de un complejo complejo ternario , asoc iado con EFlcx·GTP y se une al sitio A, lla­
de iniciación 80S. El acoplamiento de la sub unidad ribosómica , al unir mado de este mod o porque es donde el tRNA aminoacilado se une
la reacción a la hidrólisis de GTP por el eIF5B, permite que e! proceso a él ( paso D ). El EFlcx·GTP unido a varios aminoacil-tRNA difunde
de iniciación continúe solo cuando ha ocurrido correctamente la inte­ al sitio A pero el siguiente paso en la traducción ocurre solo cuando
racción de la subunidad. Esto también lo transform a en un paso irre­ el anticod ón del tRNA aparea sus bases con el segundo codón d e la
versible, de tal modo que las sub unidades ribosómicas no se disocian región codifican te. Cuando eso ocurre adecuadamente, el GTP en el
hasta que todo el mRNA se haya traducido y se haya terminado la sín­ EFI cx·GTP asociado se hidroliza. La hidróli sis de GTP promueve un
tesis proteica. La maquinaria de síntesis proteica eucarionte comienza cambio de conformación en el EFlu que lleva a la liberación del com­
la traducción de la mayoría de los mRNA celulares a una distancia de plejo EFla·GDP y la estrecha unión del aminoacil-tRNA en el sitio
aproximadamente 100 nucleótidos del extremo S' con casquete, como A (paso D). Este cambio de conformación también ubica al extremo
se acaba de describir. Sin embargo, algunos mRNA celulares contienen aminoacilado 3' del tRt'\fA en el sitio A en la cercanía del extremo 3'
un sitio de entrada de ribosomas interno (IRES ), localizado corriente terminal del Met- tRNA¡Me, en el sitio P. La hidrólis is de GTP, y así la
abajo, lejos del extremo S' terminal. Se piensa que los IRES celulares unión estrecha, no ocurren si el anticodón del aminoacil-tRNA en­
forman estructuras de RNA que interactúan con un complejo de eIF4A tran te no puede aparear s us bases con el codón del sitio A. En este

140 cAPfTULO 4 • Mecanismos genéticos moleculares


NIMACJÓN FOCALlZADA : Síntesis proteica

; r.U RA 4-25 Elongación de la cadena peptídica en los eucariontes. Met¡

~
XG) _~
e¡ que se ensambla el ri bosoma 80Scon Me¡·¡RI\l A;,lel en el sino P del
:na (arribo) , un com pl ejo ternar io que lieva el segundo aminoácido (aa,)
""....ado por el mRNA se une al sitio A (paso ()) Des¡)ués de un cambio de ­ ( " -" 0 --Jo :,
i:Ymación en el ribosoma inducido por la hidrolisi, de GTP en el EF 1o GTP : i
"

.i I
~, el rRNA grande cataliza la formación del enlace peptídico entre el
t ),_
~ ~
, /!
= , el aa 2 (paso ~). La hidrólisis del GTP en el EF 2·GTP causa otro cambio de
.:ormación en el ribosoma que resulta en su translocaclón un codón a lo lar­ 5 ..........
el mRNAy el corrimiento del tRNA,'·1et no aci la do al sitiO E. y el tRNA con el
~ ' ~I(!o unido al sitio r (paso f:]). El ciclo puede comenzar nuevamente con la
de un complejo ternari o que leva el aa, al sitio A ahora abierto. En el se - RibDO,ol~t'GTP ¿r'~
o ciclo de elongación y ciclos posteriotes. el tRNA en e sitio Ese expu lsa
3nte el paso f] como resultad o del cambio de conformación induc;do por
'drólisis del GTP en el EF1o·GTP lAOapl'o" oe K. H " l!~iho"s y m i,. 2000. e:' P ¡.., Ga,! e,r)
~ . [he Ril",~ome- 51f1.lLFUf( FrmCl! o.:n, Arlf'b:mK;' r¡ó rU úll J!d ' ¡'rl!t'ru :t_~M, "\'SM ~· · b~. p_ ~ 1~1
Entrada del
siguiente
aa-tRNA en
el sitio A
r6 ¿r'GTP

= 0, el complejo ternario difunde dejand o un sitio A vacío que pue­


:- asociarse con otros com plejos aminoacil-tRNA-EFla.·GTP has ta Hidró lisis del
.. ue se una un tRNA con bases que se apareen correctamente. Así, la GTP, cambio de
conformación
hidrólisis de GTP por EFlex es otro paso en la ve rifi cación de lec tura del ri bosoma
que permite que la síntesis proteica ava nce solo cuando el tRN A ami­
)oacilado correcto se una al sitio A. Este fenómeno co ntribuye a la
5delidad de la sí ntesis proteica.
Con el Met-tRNA,'vie, iniciado r en el sitio P y el seg undo aminoa ­
"il-tRNA fuertemente unido en el sitio A, el gru po ami no-ex del se ­
~u ndo aminoác ido reacciona con la metionina "activada" (con enlace
este r) del tRNA iniciador formando un enla ce peptídico (Fig. 4-25 ,
aso O; véase la FJg. 1-1 ; ). Esta reaccióll de peptidil transfe rasa está
:a talizada por el rRNA grande que orienta con precisión a los átomos
que interactúan , permitiendo que la rea cc ión avance. El 2' -hidroxilo
,j el A terminal del peptidil-tRNA del sitio P parti cipa tambi én en la
Formaci ón
del enlace
peptídico 01
·a tálisis. La capacidad catalítica del rRNA grande de las bacterias se
emostró elimin an do cuidadosamente la gran mayoría de las proteí­
'l as de las sub unidades ribosómicas grandes. El rRNA 235 bacteriano
.:.as i puro puede catalizar una reacción de peptidil transferasa entre
análogos de tRNA aminoacilados y el peptidil-tRNA. El apoyo adicio­

r
nal al papel cata lítico del rRNA grande en la sí ntesis proteica proviene
ue estudios cristalográfic os de alta reso lu ción que muestran que no Translocación
EF2·GTP

.,ay proteínas cerca del sitio de síntesis del enlace peptídico en la es­ del ribosoma El EF2'GDP + p¡
uctura cristalina de la subunidad gran de en las bac terias.
Después de la síntesis del enl ace peptídico, el ribosoma se ¡¡'anslo­
ca a lo largo delmRNA a una distancia equivalente a la de un codón.
Este paso de translocació n es tá con trolado por la hidróli sis de GT P en
complejo EF2· GTP en los eucariontes . Ya ocurrid a la translocac ión
:o rrec tamen te, el GTP unido se hidroliza , otro proceso irreversible
que evita qu e el ribosoma se mueva a 10 largo del RNA en la direcc ión
correcta o que se tr ansloque un número incorrecto de nucleóti­
dos. Com o res ultado de los cambios de conformación en el ribosoma ,
e acompañan a la translocación adecuada y la hidrólisis resultante
de GTP por el EF2, el tR N Ai ~'k', ahora sin la metionina activada, se
:nu eve al sitio E (sa lida, en in glés exit ) so bre el ribosoma; al mismo es tado en el cual el sitio A queda abierto y es ca paz de aceptar otro
üempo, un segu ndo tRNA unido ahora en form a covalente a un di­ tRNA aminoacilado que forma complejo con un EFlex·GTP, com en ­
do (un peptidil-tRNA) se mueve al sitio P (Fig. 4-25, paso D ). zando otro sitio de elongación de la cadena. La repetición del ciclo de
translocació n hace que el ribosoma retorn e su conformación a un elongación que se muestra en la Figura 4-25 añade un aminoácido

4.4 Síntesis escalonada de la s proteínas en lo s ribosomas 141


cada vez al extremo C-terminal de la cadena polipeptídica creciente ciden el destino del complejo mRNA-ribosoma-tRNA-peptidil. Se
dirigida por la secuencia de mRNA, hasta que se encuentra un codón han descubierto dos tipos de factores de liberación (RF). El eRFI
de detención. En ciclos posteriores, el cambio de conformación que eucarionte, cuya forma es similar a la del tRNA, actúa uniéndose al
ocurre en el paso El expulsa el tRNA no acilado del sitio E. A medi­ sitio A ribosómico y reconociendo los codones de terminación di­
da que el polipéptido naciente se alarga, se inserta en un canal en la rectamente. Al igual que algunos factores de iniciación y elongación
unidad ribosómica grande y sale en una posición opuesta aliado que que se analizaron con anterioridad, el segundo factor de liberación
interactúa con la subunidad ribosómica pequeña ( Fig. 4-26 ). eucarionte, eRF3, es una proteína que une GTP. El eRF3·GTP actúa
En ausencia del ribosoma, el híbrido de tres pares de bases RNA­ en conjunto con el eRF 1 para promover la escisión del peptidil-tRNA,
RNA entre los anticodones del tRNA y los codones del mRNA en los liberando así la cadena polipeptídica completa ( Hg. 4-2 7) . Las bacte­
sitios A y P no sería estable; los dúplex RNA-RNA entre las moléculas rias tienen dos factores de liberación (RFl y RF2), que son análogos
separadas de RNA deberían ser considerablemente más largos para re­ funcionales de eRF1 , y un factor que une GTP (RF3 ), que es análogo
sultar estables en condiciones fisiológicas. Sin embargo, múltiples inte­ a eRF3 . Nuevamente, la GTPasa eRF3 controla el reconocimiento co­
racciones entre los rRNA grandes y pequeños y los dominios generales rrecto de un codón de detención por el eRFI. El peptidil-tRNA unido
de los tRNA (p. ej., los bucles D y TI'CG, véase la Fig. 4-.20) estabilizan al tRNA en el sitio P no se separa, terminando la traducción, hasta
los tRNA en los sitios A y P, mientras que otras interacciones RNA­ que uno de los tres codones de detención sea reconocido correcta­
RNA controlan el correcto apareamiento de bases codón-anticodón , mente por el eRFI, otro ejemplo de un paso de verificación de lectura
asegurando la correcta lectura del código genético. Luego, las interac­ en la síntesis proteica.
ciones entre los rRNA y los dominios generales de todos los tRNA dan La liberación de la proteína completa deja un tRNA libre en el
como resultado el movimiento de los tRNA entre los sitios A, P Y E a sitio P y el mRNA aún asociado con el ribosoma 80S y eRFI yeRF3­
medida que los ribosomas se translocan a lo largo del mRNA en grupos GDP unido en el sitio A. En los eucariontes ocurre un reciclado de
de codones de tres nucleótidos a la vez. ribosomas cuando este complejo posterminación se une a una pro­
teína llamada ABCEI , que emplea energía procedente de la hidrólisis
La traducción se termina por factores de liberación del ATP para separar las subunidades y liberar al mRNA. Los factores
cuando se llega a un codón de terminación de iniciación e1Fl , eIFIA Y eIF3 también se requieren y se cargan en
la subunidad 405, dejándola lista para otra ronda de iniciación (Fig.
Las etapas finales de la traducción , al igual que la iniciación y la elon­ 4-24 , arriba ). En realidad, nunca se libera un mRNA libre como se
gación, requieren señales moleculares de alta especificidad que de­ representa en la Figura 4-2/ , por simplicidad . Más bien, el mRNA
tiene otros ribosomas asociados con él en varias etapas de elonga­
ción, PABP unidas a la cola de paliA y complejo eIF4 asociado con el
casquete 5', listo para unirse con otro complejo de preiniciación 435
( Fig. -1-24 ) .

Los polisomas y el reciclaje rápido de los ribosomas


incrementan la eficiencia de la traducción

La traducción de una molécula eucarionte de mRNA individual para


dar como resultado una proteína de tamaño típico toma entre uno y
dos minutos. Hay dos fenómenos que incrementan de modo significa­
tivo la tasa global a la cual las células pueden sintetizar una proteína: la
traducción simultánea de una molécula única de mRNA por múltiples
ribosomas y el rápido reciclado de subunidades ribosómicas después
que se sueltan del extremo 3' terminal de un mRNA. La traducción
simultánea de un mRNA por ribosomas múltiples es fácilmente obser­
vable en fotomicrografías electrónicas y por análisis de sedimentación
que muestran el mRNA unido a múltiples ribosomas que sostienen
cadenas polipeptídicas nacientes en crecimiento. Estas estructuras de­
nominadas poJirribosomas o polisomas tenían aspecto circular, en las
fotomicrografías electrónicas de algunos tejidos. Estudios posteriores
con factores de iniciación purificados explicaron la forma circular de
los polirribosomas y sugirieron los mecanismos por los cuales los ribo­
3'
somas reciclan de manera eficiente.
Estos estudios revelaron que múltiples copias de la proteína que
FIGURA 4-26 Modelo del ribosoma 70S de E. colí unido a un mRNA con se una a poli(A) (PABP ) interactúan tanto en la cola de poli(A ) del
una cadena polipeptídica naciente en el túnel de salida. mRNA como con la subunidad eIF4G del eIF4. Dado que la subuni­
El modelo se basa en estudios de crio-ME. Los tres lRNA estan superpu estos en dad eIF4E del eIF4 se une a la estructura de casquete del extremo 5'
los sitios A (rosado), P (verde) y E (amarillo) La cadena polipep ídica naciente
terminal de un mRNA, los dos extremos de una molécula de mRNA
está ente rrada en un túnel en la subunidad ribosómica grande que comie nza a
están unidos por un puente mediante las proteínas intervinientes,
cerrarse cerca del ta llo aceptar del tRI\j A en el sitio P. iW,.,~ 1 ~ . 1:;3b"hviliy coi~. 20':(.
CeU1 00:537: COrresíi! de J Flan k.) formando un mRNA "circular" (Fig. 4 -28a). Dado que los do s extre­

142 CAPITULO 4' Mecanismos genéticos moleculares


bunidad 405 Y sus factores de iniciación asociados con el eIF4 unido
al casquete 5', La forma circu lar que se muestra en la F igura 4- 28G
se piensa que incrementa el reciclado ribosómico y así aumenta la
eficiencia de la síntesis de proteínas.

La superfamilia de las proteínas GTPasa funciona


3' en varios pasos del control de calidad de la
traducción
1/ @ -GTP

r eRF1'
Vemos ahora que una o más proteínas que unen GTP participan en
cada etapa de la traducción. Estas proteínas pertenecen a la superfa­
milla de las GTPasa de proteínas interruptoras que ciclan entre una
forma activa unida a GTP y una forma inactiva unida a GDP (véa­
se la Fig. 3-32 ). La hidrólisis del GTP unido provoca un cambio de
conformación en la GTPasa y otras proteínas asociadas que resultan
críticas para varios procesos moleculares complejos. En la iniciación
de la traducción, por ejemplo, la hidrólisis del eIF2·GTP al eIF2-GDP
5' ~ 3' evita un barrido ulterior del mRNA una vez que se encuentra el sitio
de iniciación y permite la unión de la subunidad ribosómica grande a
la subunidad pequeña (véase la Fig. -! - ~-± , paso riJ), De modo si mil ar,

~P
la hidrólisis de EFla,GTP a EFlcx·GDP durante la elongación de la
Escisión del
peptidil-tRNA cadena ocurre solamente cuando el sitio A está ocupado por un tRNA
cargado con un anticodón que aparea sus bases con e! codón de! si tio
A, La hidrólisis del GTP provoca un cambio de conformación e n e!

.~
EFlcx que da como resultado la liberación de su tR.t\lA unido, permi­
tiendo que el extremo 3' terminal aminoacilado del tRNA cargado se

J~ 5' ~t...#...-.l 3'


Complejo de
posterminación
mueva a la posición requerida para la formación del enlace peptídico
(1 ig. -!-~b , paso D ). La hidrólisis de EF2·GTP a EF2·GDP lleva a la
correcta translocación del ribosoma a lo largo del mRNA (véase la
fig. -t 26, paso El) , y la hidrólisis de eRF3·GTP a eRF3·GDP asegura la
correcta terminac ión de la traducción ( Fi~ . 4-27 ). Dado que la hidró­
lisis del enlace fosfodiéster de alta energía p-y del GTP es irreversible,
el acoplamiento de estos pasos en la síntesis proteica a la hidrólisis del
GTP evita que avancen en la dirección inversa,
ATP
@-G DP
Las mutaciones sin sentido provocan la terminación
ABCE1 ADP + Pi
prematura de la síntesis proteica
eRFl
Un tipo de mutación que puede inactivar un gen en cualquier orga­
nismo es un cambio en un par de bases que convierte a un codón que
normalmente codifica para un aminoácido en un codón de detención,
p. ej" UAC (q ue codifica tirosina) -7 UAG (detención). Cuando esto
ocurre precozmen te en el marco de lectura, la proteína truncada re­
5' . 3' sultante habitualmente no es funcional. Estas mutaciones se llaman sin
sentido porque cuando el código genético que iguala cada triplete de
~ 'GURA 4-27 Terminación de la traducción en eucariontes, Cuando codones con un aminoácido fue descifrado por los investigadores, se
',DOsoma que lleva una cadena proteica naciente llega a un codó n de encontró que los tres codones de detención no codificaban aminoácido
_ -nación (UAA, UGA, UAG), el factor de libe ració n eR Fl emra al siri o A junto
alguno -no "tenían sentido"-.
'" eRFJGTP. La hidrólisis del GTP unido es acompañada por 13 escisión de
o :~:len a peptídica desde el tRNA de l si tio P y la expuls ión del rRNA del sitio E,
En estudios genéticos con la bacteria E. coli se descubrió que el
- .ando un complejo de posterminaciÓ n. Las 'iubun idades del ribosoma se efecto de una mutación sin sentido puede suprimirse por una segunda
, ...'a'an por acción de la ATPasa ABCE1 juma co n los elF 1, elF1A Ye!F3. l a su­ mutación en un gen de tRNA. Esto ocurre cuando la secuencia que
_ . ·:;ad 40S se libera unida a estos el F, li sta para iniciar ot ro ciclo de traducc ión codifica el anticodón en el gen de tRNA cambia a un triplete comple­
,~": la Frg. 4-',4).
mentario con el codón de detención original, p, ej., una mutación en el
tRNATyr que cambia su anticodón de GUA a CUA, que puede aparear
las bases con el codón de detención UAG, El tRNA mutante puede ser
- ' o de un polisoma están relativamente cercanos, las subunidades reconocido por la aminoacil sin teta sa de tirosina y acoplarse a la tiro­
,.,,,ómicas que se desprenden del extremo 3' se ubican cerca del sina. Las células que tiene tanto la mutación sin sentido original como
' ~ -emo 5', facilitando la reiniciación por la interacción con la su­ la segunda mutación en el anticodón del gen de tRNA Tyr en consecuen­

4.4 Síntesis escalonada de las proteínas en los ribosomas 143


TSC2, nombradas por estar involucradas en e! síndrome clínico com ­ al crecimiento celular y a la replicación en ausencia de señales norm:­
plejo de esclerosis tuberosa (del inglés tuberous sclerosis complex), les para el crecimiento y la proliferación.
corno se analizó anteriormente. En la conformación activa, el hetero­ La actividad proteincinasa elevada de mTOR en los tumores
dímero TSC1 /TSC2 funciona corno una proteína activadora GTPasa correlaciona con un pronóstico clínico desfavorabl e. En consecuenc
para Rheb (Rheb-GAP ), causando la hidrólisis del GTP unido a Rheb en la actualidad se están evaluando inhibidores de mTOR en ensay'
a GDP. Esto convierte a Rheb a su conformación con GDP unida, que clínicos a fin de probar su eficacia para tratar cánceres en conjunc i
se une al complejo mTOR e inhibe su actividad cinasa. Finalmente, la con otros modos de terapia. La rapamicina y otros inhibidores : .
actividad de TSC1/TSC2 Rheb-GAP está regulada por diversas señales, mTOR relacionados son supresores potentes de la respuesta inmur. .
permitiendo a la célula integrarse en diferen tes vías de señalización ce­ taria , debido a que inhiben la activación y la replicación de linfo d l
lular para controlar la velocidad global de la síntesis proteica . La señali­ T en respuesta a antígenos extraños (l.ap. 23 ). Diversos virus codific.z.·
zación a partir de los receptores de superficie de factores de crecimiento proteínas que activan mTOR pronto después de la infección viral. ~
conduce a la fosfori.lación de TSC1 /TSC2 en sitios inhibitorios, causan­ estimulación de la traducción resultante tiene una ventaja selectiva o
do un in c remento en Rheb·GTP y la activación de la actividad cinasa via para estos parásitos celulares . •
de mTOR. Este tipo de regulación a través de receptores de la superficie
celular conecta el control del crecimiento celular con los procesos de! Cinasas elF2 Las cinasas también regulan la velocidad global de la
desarrollo controlados por las interacciones célula-célula. tesis de proteínas celulares. La Hg. 01-24 resume los pasos en la ini :.
La actividad de mTOR también es regulada en respuesta al estado ción de la traducción. El factor de iniciación de la traducción elF2 tr~_
nutricional. Cuando la energía de los nutrientes no es suficiente para el el tRNA iniciador cargado hasta el sitio P de la subunidad ribosó lli... .
crecimiento, el descenso resultante en la relación de las concentracio­ pequeña; elF2 es una proteína G trimérica y en consecuencia exi- ·
nes de ATP respecto de A.lV1.P es detectado por la A.l\iIP cinasa (A.l\ilPK ). en su conformación con un GTP unido o con un GDP unido. Solo.
La AMP cinasa fosforila a TSC1 /TSC2 en los sitios de activación, esti­ forma de elF2 con GTP unido es capaz de integrar el tRNA inicia·
mulando su actividad Rheb-GAP y en consecuencia inhibiendo la ac ­ cargado y asociarse con la subunidad ribosómi ca pequeña. La su _
tividad mTOR cinasa y la velocidad global de traducción. La hipoxia y nidad pequeña con el factor de iniciación unido y el tRNA iniciad
otros estreses celulares también activan la Rheb-GAP del TSClITSC2. cargado, luego interactúa con el complejo elF4 unido a la caperuza ~
Finalmente, la concentración de nutrientes en el espacio extracelular de un mRNA a través de su subunidad eIF4E. A continuación la =_
también regula a Rheb, mediante un mecanismo desconocido que no bunidad ribosómica pequeña se mueve rastreando en la direcció n ~
requiere del complejo TSC1/TSC2. del mRNA en busca del codón de iniciación AUG, que puede for!'"
Además de regular la velocidad global de la síntesis de proteína apareamiento de bases con el tRNA iniciador en su sitio P. Cua r. :
celular y la producción de ribosomas, los tRNA y los factores de tra­ esto ocurre, el GTP unido por elF2 es hidrolizado a GDP y se liber.:. ::'
ducción, mTOR regula al menos otro proceso involucrado en la res­ complejo eIF2·GDP resultante. La hidrólisis GTP da como resultado _
puesta a las bajas concentraciones de nutrientes: la macroautofagia (o paso de "corrección de prueba" irreversible, que prepara la subuni¿ : _
simplemente autofagia ). Las células privadas de nutrientes degradan ribosómica pequeña para asociarse con la subunidad grande solo cc.:-·
los constituyentes citoplasmáticos, incluyendo orgánulos enteros, para do un tRl"lA iniciador es adecuadamente unido al sitio P y se aparea·
suministrar energía y precursores a los procesos celulares esenciales. manera correcta con el codón de inicio AUG. Antes de que elF2 pu
Durante este proceso una estructura de membrana doble, grande, en­ participar en otro ciclo de iniciación, su GDP unido debe ser reem r ~
gulle una región del citoplasma para formar un autofagosoma, que lue­ zado con GTP. Este proceso está catalizado por el factor de iniciaciór.
go se fusiona con un lisosoma donde las proteínas, los lípidos y otras la traducción elF2B, un factor de intercambio de nucleótido de gua!!!:
macromoléculas atrapadas son degradados, completando el proceso de (GEF ) específico para e1F2.
macroautofagia . mTOR activado inhibe la macroautofagia en las célu­ Un mecanismo para la inhibición de la síntesis proteica en gen.::.
las en crecimiento cuando los nutrientes son abundantes. La macroau­ de las células estresadas involucra la fosforilación de la subunida<l
tofagia está estimulada cuando la ac tividad mTOR disminuye en las de elF2 en una serina específi ca. La fosforilación en este sitio no i m~ ­
células privadas de nutrientes. fiere con la función elF2 en la síntesis de proteína directamente. En
lugar, el elF2 fosforilado tiene una muy alta afinidad para el facto r ~
Los genes que codifican los componentes de la vía mTOR están intercambio de nucleótido guanina elF2, elF2B, que no puede libe.
mutados en muchos cánceres humanos, dand Q como resultado el elF2 fosforilado y en consecuencia está bloqueado para cataliza: _
en el crecimiento celular en la ausencia de señales de crecimiento intercambio de GTP de factores adi cionales elF2. Puesto que existe _ ~
normales. TSCl y TSC2 (véase la fig . 8-30 ) fueron inicialmente iden­ exceso de elF2 respecto de elF2B, la fosforilación de una fracció r, :
tificados debido a que una u otra de las proteínas es mutante en un elF2 da como resultado la inhibición de todo el elF2B celular. El r
síndrome genético humano raro: el complejo de esclerosis tuberculo­ de elF2 se acumula en su forma de GDP unido, que no puede partia:
sa. Los pacien tes con este trastorno desarrollan tumores benignos en en la síntesis proteica, inhibiendo así casi toda la síntesis de prol ­
múltiples tejidos. La enfermedad resulta de la inactivación de TSCl o celular. Sin embargo, algunos mRNA tienen regiones 5' que pern:l __
TSC2 que elimina la actividad Rheb-GAP del heterodímero TSCl/ la iniciación de la traducción a la concentración de elF2-GTP, qu.: ­
TSC2, dando corno resultado la concentración desregulada y anor­ sulta de la fosforilación de elF2. Estos mRNA incluyen aquellos
malmente elevada de Rheb·GTP y la actividad desregulada y elevada proteínas chaperonas que funcionan para volver a plegar las prot· ..;
resultante de mTOR. Las mutaciones en los componentes de las vías celulares desnaturalizadas como resultado del estrés celular, prot ~­
de transducción de señales a través de receptore s de la superficie celu­ adicionales que ayudan a la célula a lidiar con el estrés y los facto r :
lar que llevan a la inhibición de la actividad de Rheb-GAP del TSC1/ transcripción que activan la transcripción de los genes que codifica ~,
TSC2, también son comunes en los tumores humanos y contribuyen proteínas inducidas por estrés.

378 CAPíTULO 8 • Control génico postraduccional


.....l5 células humanas contienen cuatro cinasas elF2 que fosforilan la El control de la concentración de hierro intracelular por parte de
-.a serina de inhibitoria elF2o:. Cada una de estas está regulada por la proteína de unión a elementos de respuesta al hierro (IRE-BP) es un
f'ú diferente de estrés celular, inhibiendo la síntesis de proteína y ejemplo sofisticado de una única proteína que regula la traducción de
" jendo a las células repartir la gran fracción de recursos celulares un mRNA y la degradación de otro. La regulación precisa de la concen­
mente utilizados para la síntesis de proteína en las células en creo tración del hierro celular es crucial para la célula. Múltiples enzimas
~I o, para que sean usados en responder al estrés. y proteínas contienen Fe 2 + como cofactor, tales como las enzimas del
_" cinasa GCN2 elF2 (control general no desreprimible 2) es acti· ciclo de Krebs (véase la Fig. ) 2- lO ) Y las proteínas de transporte de
:>Q r la unión de los tRNA sin carga. La concentración de los tRNA electrones involucradas en la generación de ATP en las mitocondrias y
. !rga aumenta cuando las células están privadas de aminoácidos, cloroplastos (Cap. J 2). Por el otro lado, el exceso de Fe 2+ genera radica­
i.ldo la actividad cinasa de GCN2 elF2 e inhibiendo en gran me· les libres que reaccionan con las macromoléculas celulares y las dañan .
.." síntesis de proteína . Cuando los almacenamientos de hierro intracelular son bajos, funcio­
~ PEK (cinasa pancreática e1F2) se activa cuando las proteínas transo na un sistema de control dual para incrementar las concentraciones de
:> al interior del retículo endoplasmático (RE) no se pliegan ade­ hierro celular; si hay hierro en exceso, el sistema funciona para evitar la
~ente, debido a anomalías en el ambiente del interior del RE. Los acumulación de niveles tóxicos de iones hierro libres.
::ores, incluyendo concentraciones elevadas de hidratos de carbono Un componente en este sistema es la regulación de la producción
. J que estos inhiben la glucosilación de muchas proteínas del RE y de ferritina, una proteína de unión a hierro intracelular que se une yal­
- ,.1<!ciones inactivantes en una chaperona del RE, son necesarias para macena el exceso de hierro celular. La región S' no traducida de mRNA
:u ado plegamiento de muchas proteínas del RE (Laps. 13 y 14). ferritina contiene elementos de respuesta al hierro (IRE) que tienen
.,., in hibidor hemirregulado (HRI) es activado en los eritrocitos en una estructura de tallo y bucle. La proteína de unión a lRE (IRE-BP)
llo cuando el suministro del grupo prostético hemo es dema­ reconoce cinco bases específicas en el bucle [RE y en la naturaleza dú­
najo para acomodar la velocidad de la síntesis de la proteína glo· plex del tallo. A concentraciones bajas de hierro, la lRE·BP se encuen­
:::;te ciclo de retroalimentación negativa disminuye la velocidad tra en su conformación activa que se une a las IRE (ri g. i\-31 ól). La
~~sis de la proteína globina hasta que coincida con la velocidad unión de IRE·BP bloquea la subunidad pequeña del ribosoma para el
-:i'sis del grupo hemo. HRI también se activa en otros tipos de codón de inicio AUG (véase la hg. 4-2-1 ), inhibiendo así la iniciación
e n respuesta al estrés Q),.idativo o al choque térmico. de la traducción. La disminución resultante en la ferritina significa que
: - almente, la proteincinasa activada por RNA (PKR) es activa­ hay menos hierro formando complejo con la ferritina y por ende, se
- los RNA doble hebra más largos que - 30 pares de bases. En encuentra más hierro disponible para las enzimas que lo requieren.
• ·ancias normales en las células de mamífero, tales RNA doble A concentraciones elevadas de hierro, la IRE-BP se encuentra en una
l o se producen durante una infección viral. Largas regiones de conformación inactiva que no se une a los IRE S', por lo tanto puede
_o ble hebra se generan en los intermediarios de replicación de proceder la iniciación de la traducción. Las ferritinas recién sintetiza­
=e RNA o a partir de la hibridación de regiones complementa· das luego se unen a los iones hierro libre, evitando su acumulación
~ NA, que se transcriben a partir de ambas hebras de los geno­ hasta concentraciones perjudiciales.
- ~ \'lrus de DNA. La inhibición de la síntesis de proteína evita la La otra parte de este sistema regulador controla la importación del
'.:ión de progenie de viriones, protegiendo células vecinas de la hierro al interior de las células. En los vertebrados, la ingesta de hierro
n. De manera interesante, los adenovirus desarrollaron una de· es transportada a través del sistema circulatorio unido a una proteína
: '1 ntra la PKR: ellos expresan cantidades prodigiosas de un RNA denominada transferrina. Después de la unión al receptor de transferri­
al virus (VA) de - 160 nucleótidos con regiones doble hebra na (TfR) en la membrana plasmática. el complejo transferrina·hierro
, :'1 horquillas. VA RNA es transcrito por la RNA polimerasa lJJ es introducido al interior de las células mediante endocitosis mediada
n ado desde el núcleo por la exportina 5, la exportina para los por receptor (Cap. 14). La región 3' no traducida del mRNA TfR con·
'A (véase la Fig. g-2 7). El VA RNA se une a la PKR con afinidad tiene IRE cuyos tallos tienen secuencias desestabilizadoras ricas en AV
". inhibiendo su actividad proteincinasa y evitando la inhibición ( Fig. f;-."Ib ). A concentraciones elevadas de hierro, cuando la IRE-BP
ntesis de proteína observada en las células infectadas con un está en la conformación inactiva, no unida, estas secuencias ricas en AU
.rus mutante a partir del cual se eliminó el gen VA. promueven la degradación del mRNA TfR por el mismo mecanismo
que lleva a la rápida degradación de otros mRNA de vida corta, como
se describió anteriormente. La disminución resultante en la produc­
roteínas de unión al RNA de secuencia ción del receptor transferrina rápidamente reduce la importación de
ífica controlan la traducción del mRNA hierro, protegiendo así a la célula del exceso de hierro. A concentracio­
nes de hierro bajas, sin embargo, IRE- BP puede unirse a los IRE 3' en
í11co
el mRNA de TfR. La lRE·BP unida bloquea el reconocimiento de las
~a ste a la regulación global del mRNA, los mecanismos también secuencias desestabilizadoras ricas en AV mediante las proteínas que de
lucionado para controlar la traducción de ciertos mRNA. Esto otra manera podrían degradar rápidamente los mRNA. Como resulta­
~ realizar proteínas de unión a RNA de secuencia específica que do, se incrementa la producción del receptor transferrina y se lleva más
- a una secuencia particular o estructura de RNA en el mRNA. hierro al interior de la célula.
, la unión es en la región S' no traducida (S' VTR) de un mRNA, Otras proteínas de unión al RNA reguladas también pueden actuar
",ea la capacidad de un ribosoma de realizar una búsqueda para en el control de la traducción o la degradación del mRNA, al igual que
; el primer codón de iniciación, inhibiendo la iniciación de la la lRE-BP de doble acción. Por ejemplo, una proteína de unión al RNA
-: lÓn. La unión en otras regiones puede promover o inhibir la sensible al hemo controla la traducción del mRNA que codifica la ami­
,ción del mRNA. nolevulinato sin tasa (ALA), una enzima clave en la síntesis del hemo.

8.4 Mecanismos citoplasmaticos de control postranscripcional 379


(a) mRNA de ferritina Otro mecanismo llamado degradación mediada por mutacw"
IREs Región codificadora COOH sentido causa la degradación de los mRNA, en los cuales uno :

~ Hierro alto
5' ~ U ( -I"I¡iCMIlI.llllj'¡a.ilil.¡¡¡nmaGmiI+:'
I o An ------+
H NJ
2
sD
'@a
exones han sido cortados y empalmados de manera incorrecta. Ta. .
cesamiento incorrecto suele al terar el marco abierto de lectura ­
reg ión 3' de la unión exón inadecuada, dando como resultado L
troducción de una mutación con sentido alterado fuera de ma r~

IRE-BP 'o"tivo ("\ ~ Ferriti na


un codón de terminaci ón incorrecto. Para casi todos los mRNA ca

1
dos correctamente, el codón de terminación está en el exón final. ::
traducida
degradación mediada por mutaciones sin sen tido da como resu l: '
IRE-BP activ o l r la rápida degradación de los mRNA con los codones de termin al.
que se producen antes de la última unión cortada y em palmada er'

o O Hierro bajo
mRNA puesto que en la mayoría de los casos, tales mRNA surgen .

~ LJ L w¡t!ij}I!i3.!.h"dii.!fM- An -11--+
er rores en el proceso de corte y empalme del RNA. Sin embarg
5' No se inicia
degradación mediada por mutaciones sin sentido también tiene 1L.::
la traducción
a partir de una mutación que crea un codón de terminación dentr :
(b) mRNA de TfR

Hierro alto
.5ÚlLvIREs
Regi ó n rica en AU
" I_ ,
... " .
,~ ~~"'
un gen o una deleción o inserción con corrimiento del marco de le . .
ra. Este mecanismo de degradación se descubrió inicialmente dur ' ­
el estudio de pacientes con tal asemi a ~o, quienes producen una con -.
5' o&'¡'¡"i+n,rr.l4f An ------+ tración baja de proteína globina asociada con una concentración '
(.. .1,-,
1
, .... J

,. .......
I
de mRNA ~-globina (J·i g. -32a, b ).
Una búsqueda de posibles señales moleculares que podrían i
Mononucleótidos car las posiciones de las uniones empalmadas en un mRNA proce5.l.:
degradados
llevó al descubrimiento de los complejos de unión d e exones. Ce_
ya se mencionó, estos com plejos de diversas proteínas (incluye~._
Y14, Magoh, eIF4IlIA, UPF2, UPF3 y REF) , unen - 20 nucleótidos ~
Hierro bajo una unión exón-exón a continuación del proceso de corte y emp a::-­
del RNA (Flg. !l -32c), estimulando la expor tación de los mRNP a:, .
5' · .. , . An -11--+ Poca
de el núcleo mediante interacción con el mRNA exportador (véa
degradación
Fig. /'1-21 J. El análisis de mutantes de levadura indicó que una de
FIGURA 8-31 Regulación dependiente de hierro de la traducción y proteínas en los complejos de unión de exones (UPF3) funcion a,
degradación de mRNA. La proteína de unión a los elementos de respuesta al la degradación mediada por mutaciones sin sentido. En el citopL
hierro (lRE-BP) controla (a) la traducción de mR NA ferritina y (b) la degradación ma , este componente de complejos de unión de exones interactúa ~
de mRN A del receptor de transferr ina (TfR). Una concentración de hierro intrace­
una proteína (UPF1) y una proteincinasa (SMG1) qu e fosforila UPF
lular baja IRE-SP se une a los elementos de respuesta a hierro (IRE) en la fegión
5' o 3' no traducida de estos mRNA. A altas co ncentraciones de hierro, IRE-SP causando que el mRNA se asocie con los cuerpos P, reprimiendll
sufre un cambio en la conformación y no puede uni r los mRNA. El control dual traducción del mRNA. Una proteína adicional (UPF2) asociada co • ~
por parte de IRE-SP regula precisamente la concentración de íones de hierro complejo mRNP, se une a un cuerpo P asociado co n la desanilasa e _.
libre dentro de las célu las. Véase el texto para mayor deta lle. rápidamente elimina la cola de poli(A) de un mRNA asociado, llevan.::
a la rápida eliminación de la cape ruza S' y a la degradación del cuer.
P asociado a la exonucleasa 5' ~ 3' (véase la Fig. R- 29 ). En el casCl .:. .
D e manera sim ilar, estudios in vitro han demostrado que el mRNA que los mRNA adecuadamente procesados, el complejo unión-exón se a,
codifica la proteína de la leche caseína está estabilizada por la hormona cia con el complejo de unión a la caperuza nuclear (CBP80, CBP20
prolactina y rápidamente se degrada en su ausencia. medida que el mRNP es transportado a través de un complejo del po;­
nucl ear, protegiendo así al mRNA de la degradación. Se cree que '
Mecanismos de vigilancia evitan la traducción com plejos de unión de exones so n desprendidos del mRNA al pa, ..:;
de los mRNA procesados inadecuadamente por el primer ribosoma "pionero" para traducir el mRNA. Sin emba:­
go, para los mRNA con un codón de terminación antes de la unión -::. .
La traducción de un mRNA procesado d e manera inadecuada podría los exones finales, uno o más complejos de unión de exones permane.: ­
llevar a la producción de una proteína ano rmal , que interfiere con la asociado con el mRNA , dando como resultado la degradación media _
función normal del gen. Este efecto es equivalente al que resulta de por mutaciones sin sen tido ( rig. ¡l. 32 ).
las mutaciones dominantes negativas, analizadas en el Capitulo 5 ( Hg.
5 ·44 ). Diversos mecanismos colectivamente denominad os vigilancia
del mRNA ayudan a la célula a evitar la traducción de las moléculas localización de los mRNA que permiten la
de mRNA procesadas de manera inadecuada. Previamente se mencio­ producción de proteínas en regiones específicas
naron dos de tales mecanismos de vigilancia: el reconocimiento de los
dentro del citoplasma
pre-mRNA procesados inadecuadamente en el núcleo y sus degrada­
ciones por el exosoma, y la restricción general contra la exportación Muchos procesos celulares dependen de la localización de proteín.c. .
nuclear de los pre-mRNA procesados de forma incompleta que perma­ particulares en estructuras o regiones específic as de la célula. En L
necen asociados con un espliceosoma. últimos capítulos se analizará cómo algunas proteínas son transpor­

380 CAPITULO 8 • Control génico postraduccional


CAPiTULO

El movimiento
de proteínas en
membranas y orgánulos

bmicrografía de Auorescencia de una célula de mamífero en cultivo (COS-7)


' muest ra la distribuc ión de l retículo endoplasmático (verde), el aparato de
~ i (rojo) y el núcleo (azul). Las proteínas de secreción recién sinte tizadas
[lero se dirigen hacia el RE, donde se pliegan y se mod if,can antes de ser
ortadas al Golgi, para su clasificación a destinos corriente abajo. (Co"esiade
:~ r Li pptncon-Schwartz y Prasanna Satpu:.eJ

Una célula de mamífero típica contiene hasta 10 000 tipos de pro ­ El primer proceso general inlplica el direccionamiento de una proteína
las diferentes; una levadura, ap roximadam ente 5 000. La gran ma­ recién sintetizada desde el citoplasma a un orgánulo intracelular. Esto
:ía de estas proteínas son sintetizadas por ribosomas citosólicos, y puede ocurrir durante la traducción o poco después de que se haya
I( has permanecen dentro del citosol (Cap. 4 ). Sin embargo, hasta completado la síntesis de la proteína. Para las pro teínas de membrana,
rlitad de las diferentes clases de proteínas producidas en una célula el direccionamiento conduce a la inserción de la proteína dentro de
íca son enviadas a uno u otro de los diferentes orgánulos rodead os la bicapa lipídica de la membrana, mientras que en las proteínas hi­
r membrana dentro de la célula o a la superficie celular. Por ejem- drosolubles el direccionamiento lleva a la translocación de la proteína
muchas proteínas receptoras y proteínas transportadoras deben completa a través de la membrana al interior acuoso de l orgánulo. Las
nviadas a la m embrana plasmática, algunas enzimas hidrosolubles, proteínas son clasificadas al retículo endoplasmático (RE), las mito­
110 las RNA y las DNA polimerasas, deben ser dirigidas al núcleo; y condrias, los cloroplastos, los peroxisomas y el núcleo mediante este
¡w mponentes de la matriz extracelular, así como las enzimas diges­ proceso general (rig. J .~ - l ) .
ls y las moléculas de señalización poli peptídicas, deben dirigirse a El segundo proceso general de clasificación se conoce como la
ilperficie celular para ser secretadas desde la célu la. Éstas y todas las vía secreto ra e implica el transporte de pro teínas desde el RE a s u
as proteínas producidas por una célula deberán alcanzar sus ubica­ destino final , dentro de las vesículas rodeadas por membrana . Para
!les correctas para que la célul a funcione adecuadamente. muchas proteínas, incluso las que co nstituyen la matriz extracelul ar,
El envío de proteínas recién si ntetizadas a sus destinos celulares el destino final es el exterio r de la célula (de allí el nombre); las pro­
tcuados, habitualmente conocida como direccionamiento o clasifica­ teínas integrales de la membrana también son transportada s al Golgi,
rle proteínas, comprende dos tipos de procesos muy distintos: un los lisosomas y la membrana plasmática m ed iante este proceso. La
ccionamiento basado en señales y un tránsito basado en vesículas. vía secre tora comienza en el RE; así, todas las proteínas que han sido

NTENIDO

1 Direccionamiento de las proteínas hacia 13.4 Direccionamiento de las proteínas


la membrana del RE y a través de ésta 579 hacia las mitocondrias y los cloroplastos 601

2 Inserción de las proteínas de la membrana 13.5 Direccionamiento de ,las proteínas a los peroxisomas 612
dentro del RE 587
13.6 Transporte hacia el interior y el exterior del núcleo 615
3 Modificaciones, plegamiento y control de calidad
de las proteínas en el' RE 594
o ANIMACiÓN GENERAL: Clasificación de las proteínas
Membrana
nuclear externa

Membrana
-jf
nuclear interna Núcleo

/
mRNA "-....
D\ Poro
nuclear

Citosol

~ Secuencia de
señalizaci ón RE 7)0"\
Prote!~a ~ /
Q)
cltosollca Secuencia ~
Retículo endoplásmíco direccionadora ~ Peroxisoma

Espacio
intermembranoso
Membrana externa

Matriz __~~=\;:::=~~::::::--::..:¡:;

interna Mitocondria

Cloroplasto

m ) \ mi
Memb~na ~
plasmática
~,Llsosoma
VíA SECRETORA
Figura 13-1 Resumen de las principales vías de clasificación de las prote'nas son seleccionadas para otros subcompartimentos de estos Oi _
proteínas en los eucariontes. Todos los mRNA codificados en el núcleo se nulos por pasos adicionales de clasificació n Las proteínas nucleares enlf?
traducen en ribosomas citosólicos, Derecha (vías no secretoras): la síntesis de y salen a través de poros visibles en la envoltu ra nuclear. Izquierda (vía de
proteínas que carecen de una secuencia de seña lización RE se completa en secreción): Los ribosomas que si ntetizan proteínas nacien tes en la vía Sff' ;;,-­
los ribosoma s libres (paso i1) , Las proteínas que no contienen secuencia de ra se dirigen hacia el retícu lo endoplasmático (RE) rugoso por una secue- ' ­
direccionamiento son liberad as en el citosol y permanecen allí (paso ~ , Las de señalización (rosado; pasos O, ~ , Después de que se ha completado ';
proteínas co n una sec uencia específi ca para orgánulo (rosa do) primero son traducción sobre el RE. estas proteínas pueden desplazarse por medio de
liberadas al citoso l (paso ~ y luego son importadas a las mitocon'drias, cloro­ vesícu las de transporte hacia el complejo de Golgi (paso 6), La clasificac': ­
plastos, peroxisomas o el núcleo (pasos~, La s proteínas de las mitocondrias adicional envía proteínas a la membrana plasmática o a los lisosomas (pas ­
y de los cloroplastos típicamente atrav iesa n las membranas externa e interna rn,ffil), Los procesos que emplea n vesículas corresponden a la vía seere :r
para ingresar en la matriz o en el espacio del estroma, respectivamente, Otras (pasos ~. O, recuadro sombreado) y se ana lizan en el CaJ'- '1ulc 1,l ,

seleccionadas para ingresar en la vía secretora, inicialmente, están di­ nativa mediante los catalizadores del plegamiento proteico pre5t'!
reccionadas ha cia ese orgá nul o, en la luz del RE, De hecho, el RE es la localización en la que ap ~
El direccionamiento hacia el RE, por lo general, incluye las proteí­ madamente un tercio de las proteínas de un a célu la típi ca se p lt ~
nas nacientes aún en proceso de síntesis, en un ribosoma, Las proteí­ sus co nformaciones nativas, y la mayoría de las proteínas residente< _
nas recién sintetizadas son expulsadas desde el ribosoma directamente RE -de un modo direc to o indirecto- contribuyen al proceso de ;
al interior de la membrana del RE, Una vez translocadas a través de garnien to, Corno parte de dicho proceso, las proteínas también S ~
la membrana del RE, las proteínas se ensamblan en su conformación mod ificacio nes postraduccionales específicas en el RE, Estos prOOl'

578 CAPiTULO 13 • El movimiento de proteínas en membranas y orgánulos


_, cuidadosamente controlados y solo después de que se han comple­ Para cada uno de los eventos de direccionamiento de las proteínas
''':'-:0 el plegamiento y el ensamblaje, las proteínas son transportadas analizados en este capítulo, buscaremos una respuesta a cuatro pregun­
exterior del RE hacia otros destinos. Aquellas cuyo destino final es ta s fundamentales :
Golgi, los lisosomas, la membrana plasmática o el exterior celular l. ¿Cuál es la naturaleza de la secuencia señal y qué la distingue de otros
11 transportadas a lo largo de la vía secretora mediante la acción de
tipos de secuencias señal?
· _'queñas vesículas que brotan desde la membrana de un orgánulo y,
2. ¿Cuál es el receptor para la secuencia señal?
- ~o, se fusionan con la membrana de otro (véase la Fig. 13-1, recuadro
'lI breado). En el siguiente capítulo, analizaremos el tránsito de proteí­ 3. ¿Cuál es la estructura del canal de translocaci6n que permite la transfe­
-l: mediante vesículas porque su mecánica difiere significativamente rencia de las proteínas a través de la bicapa de la membrana? En particu­
:-.; direccionamiento de proteínas que no depende de vesículas al inte­ lar, ¿el canal es tan estrecho que las proteínas pueden pasar a través de éste
r de los orgánulos intracelulares. solo en estado no plegado o acomoda dominios de proteínas plegadas?
En este capítulo, examinamos el modo en que las proteLnas se di­ 4. ¿Cuál es la fuente de la energía que impulsa la transferencia unidirec­
-= ~ ci onan hacia cinco orgánulos intracelulares: el RE, las mitocondrias, cional a través de la membrana?
~ doroplastos, los peroxisomas y el núcleo. Dos características de este En la primera parte del capítulo, cubrimos el direccionamiento de
-Qceso de direccionamiento de las proteínas, inicialmente, fueron bas­ las proteinas al RE, incluidas las modificaciones postraduccionales que
"lte desconcertantes: de qué manera una proteína determinada podía experimentan las proteínas a medida que ingresan en la vía secretora.
-igirse solo a una membrana específica y de qué modo las moléculas El direccionamiento de las proteínas hacia el RE es el ejemplo mejor
-meicas hidrófilas relativamente grandes podían ser translocadas a comprendido de direccionamiento proteico y servirá como patrón del
- ~·..és de una membrana hidrofóbica sin romper la bicapa como barre­ proceso en general. Luego, describiremos el direccionamiento de las
- para los iones y las moléculas pequeñas. Empleando una combina- proteínas hacia las mitocondrias, cloroplastos y peroxisomas. Final­
de métodos bioquímicos de purificación y técnicas de detección mente, cubriremos el transporte de las proteínas hacia el interior y al
_: ::dica para identificar mutantes incapaces de ejecutar pasos de trans­ e:>,.1:erior del núcleo a través de los poros nucleares.
. : l ción particulares, los biólogos celulares han identificado muchos
:-= :os componentes celulares necesarios para la translocación a través
:-'! : ada una de las diferentes membranas intracelulares. Además, nu­ 13.1 Direccionamiento de las proteínas hacia
-~rosos procesos de translocación centrales de la célula se han recons­
la membrana del RE y a través de ésta
do con el empleo de componentes proteicos purificados incorpo­
.los a bicapas lipídicas artificiales. Estos sistemas in vitro pueden ser Todas las células eucariónticas poseen un retículo endoplasmático. El
- o;:¡ ipulados experimentalmente con libertad. RE es un orgánulo grande, con convoluciones, constituido por túbulos
Estos estudios han mostrado que, a pesar de ciertas variaciones, los y sacos aplanados, cuya membrana se continúa con la membrana nu­
- ;ffiOS mecanismos básicos rigen la clasificación de todas las proteínas clear. La membrana del RE es el lugar de síntesis de los lípidos celulares
.- :odos los orgánulos intracelulares. Sabemos ahora, por ejemplo, que (Cap. 10), y el RE es el sitio en el que se ensamblan la mayoría de las
,formación para dirigir una proteína a un destino particular en un proteínas de la membrana, incluso las de la membrana plasmática y las
-; m ulo está codificada en la secuencia de aminoácidos de la propia de la membrana de los lisosomas, el RE y el Golgi. Además, todas las
· --;¡eÍna, por lo general, dentro de las secuencias de aproximadamente proteínas solubles que finalmente serán secretadas por la célula -así
.l.iU inoácidos, conocidas genéricamente como secuencias señal (véa­ como aquellas destinadas a la luz del RE, el Golgi o los lisosomas- son
:a Fig. 13- 1); éstas también se denominan secuencias de captación­ inicialmente enviadas a la luz del RE (véase la fig . 13- 1). Como el RE
<:_-cionamiento o péptido señal. Estas secuencias de direccionamiento desempeña una función tan importante en la secreción de las proteí­
;>Ílualmente se presentan en el extremo N -terminal de una proteína, nas, nos referimos a la vía del tránsito de proteínas que fluye a través
· - ~ es la primera parte de una proteína en ser sintetizada. Más raramen­ del RE como la "vía secretora". Para simplificar, nos referiremos a todas
- :as secuencias de direccionamiento pueden presentarse en el extremo las proteínas inicialmente direccionadas hacia el RE como "proteínas
- ~mlinal o en el interior de una secuencia proteica. Cada orgánulo de secreción", pero tendremos en mente que, en realidad, no todas las
-.: a un conjunto de proteínas receptoras que se unen solamente ti­ proteínas direccionadas hacia el RE son secretadas desde la célula.
• · 0 específicos de secuencias señal, lo que asegura que la información En esta primera sección, analizaremos el modo en el que las pro­
:.:.jificada en la secuencia señal gobierna la especificidad del direccio­ teínas son inicialmente identificadas como proteínas de secreción, y de
- ·Z1iento. Una vez que una proteína que contiene una secuencia señal qué forma estas proteínas son translocadas a través de la membrana del
· . ~t eractuado con el receptor correspondiente, la cadena proteica es RE. Nos ocuparemos primero de las proteínas solubles -aquellas que
.rall5ferida a cierto tipo de canal de translocaci6n que permite que la recorren el camino a través de la membrana del RE, dentro de la luz de
::1lleina pase hacia el interior o a través de la bicapa de la membrana. La éste-o En la siguiente sección, analizaremos las proteínas integrales de
' - ::.r.,ferencia unidireccional de una proteína al interior de un orgánulo, membrana, aquellas que se insertan en la membrana del RE.
. ' 'Olver al citoplasma, habitualmente se logra al acoplar la transloca­
_ ;-. a un proceso energéticamente favorable , como la hidrólisis del GTP Los experimentos de marcado con pulsos con
.:e! ATP. Después, algunas proteínas se clasifican adicionalmente para membranas purificadas del RE demostraron que las
~_lfl zar un subcompartimento dentro del orgánuJo diana; esta clasifi­
proteínas secretadas atraviesan la membrana del RE
n depende también de otras secuencias señal y de otras proteínas
-~71O ras. Finalmente, las secuencias señal, con frecuencia, son eJimi­ Aunque todas las células secretan una diversidad de proteínas (p. ej., las
-desde la proteína madura por proteasas específicas, una ve z que se proteínas de la matriz extracelular), ciertos tipos de células están espe­
:':;¡jl pletado la translocación a través de la membrana. cializadas para secretar grandes cantidades de proteínas específicas. Las

13.1 Direccionamiento de las proteínas hacia la membrana del RE y a través de ésta 579
I1ACIÓN FOCALlZADA: Sfntesis de las proteínas secretadas un idas a la membrana

=' .A SRP
a
D

:lecuencia
r::
~E señalización
El ~GDP.P;

!L3
-

Translocón Translocón
(cerrado) (abierto)

"'­
Secuencia de
señalización
cortada Proteína
plegada

- =iA 13-6 Translocación cotraduccional. Pasos D, fl una vez que la dica. Paso 0 : a medida que la cadena polipeptídica se alarga, pasa a través del
;; de señalización RE emerge del ribosoma, se une por una pa rtícula de canal del trans locón hacia la luz del RE, donde la secuencia de señalización es
-niento de la señal (PRSl Paso~: la PRS entrega el com plejo ribosoma/ cortada por la peptidasa señal y rápidamente degradada. Paso rilla cadena
10 nacien te al receptor PRS, en la membrana del RE. Esta interacción peptídica contin úa alargándose a medida que el mRNA se traduce hacia el
- ::C"Zilda por la unión de GTP tanto a la PRS como a su receptor Paso n extremo 3' terminal. Como el ribosoma está unido al translocón, la cadena
;:"da del ribosoma/polipéptido naciente al translocón, que conduce a la creciente es expulsada a través del translocón hacia la luz del RE. Pasos fl, m:
: CJe su canal de translocación e inserción de la secuencia de seña lización una vez que se ha completado la traducción. el ribosoma se libera, el resto de
' ~en to adyacente del polipéptido creciente al poro central. Ta nto la la proteína es extraída a la luz del RE, el translocón se cierra y la proteína asume
-:- el receptor de PRS. una vez disociados del translocón, hidrolizan su la conformac ión plegada nativa .
• - y luego están listos para iniciar la inserción de otra cadena polipeptí­

-:gura 13-6 resume nuestro conocimiento actual acerca de la sín­ la membrana del RE, el ribosoma y la cadena naciente rápidamente
~_~ proteínas que serán secretadas, así como la función de la partícula son transferidos al translocón, un complejo de proteínas que forma un
-': nocimiento de señal y de su receptor, en este proceso. La hidrólisis canal embebido dentro de la membrana del RE. A medida que conti­
-:-;-P unido acompaña el desensamblaje de la partícula de reconoci­ núa la traducción, la cadena en crecimiento pasa directamente desde la
. -. de señal y del receptor de esta y, en un modo que aún no se com­ subunidad ribosómica grande al poro central del translocón. La subu­
-~. inicia la transferencia de la cadena naciente y del ribosoma a un nidad ribosómica 60S está alineada con el poro del translocón de modo
: : la membrana del RE, donde puede producirse la translocación. tal que la cadena creciente nunca queda expuesta al citoplasma y se
- .~s de disociarse una de la otra, la partícula de reconocimiento de evita que se pliegue hasta que alcance la luz del RE (véase la ¡: ig. 13-6).
u receptor liberan -cada uno- su GDP unido, la partícula de El translocón fue identificado inicialmente por mutaciones en el
- )(imiento de señal se recicla en el citosol y ambas están listas para gen de la levadura que codifica la Sec61a, que causan un bloqueo en
- otro ciclo de interacción entre los ribosomas que sintetizan pro- la translocación de las proteínas secretoras al lnterior de la luz del RE.
nacientes -que serán secretadas- y la membrana del RE. Posteriormente, se encontró que tres proteínas denominadas complejo
Sec61 formaban el translocón de los mamíferos: Sec61a, una proteí­
aso de los polipéptidos crecientes a través na integral de la membrana con 10 hélices a que se expandían en la
translocón es impulsado por la traducción membrana, y dos proteínas más pequeñas llamadas Sec61~ y Sec61y.
Experimentos de entrecruzamiento químico -en los cuales las cadenas
tZ que la partícula de reconocimiento de señal y su receptor han laterales de los aminoácidos de proteínas nacientes, por ser secretadas,
..;:jonado un ribosoma que sintetiza una proteína secretora hacia podían unirse mediante enlaces covalentes a la subunidad Sec61a- de­

13.1 Direccionamiento de las proteínas hacia la membrana del RE y a través de ésta 583
Inserción de las proteínas de la membrana Varias clases topológicas de proteínas integrales
o del RE de la membrana se sintetizan en el RE

· j los anteriores, hemos descrito numerosos aspectos acerca de La topología de una proteína de membrana se refiere al número de veces
-idad de configuraciones de las proteínas integrales (que atra­ que su cadena polipeptídica se expande en la membrana y a la orien­
membrana) presentes en toda la célula. Cada una de estas pro­ tación de estos segmentos que se expanden en la membrana dentro de
' . o:le una orientación única con respecto a la bicapa fosfolipídica ésta. Los elementos clave que determinan la topología de una proteína
.- c-mbrana. Las proteínas integrales de la membrana localizadas son los segmentos que se expanden en el interior de la membrana; ha­
- .E. el Golgi y los lisosomas, así como las proteínas de la membra­ bitualmente, son hélices u. que contienen entre 20 y 25 aminoácidos hi­
:l'!z tica -todas sintetizadas en el RE rugoso- permanecen embe­ drófobos que contribuyen a interacciones energéticamente favorables
.;-. la membrana, en su orientación única, a medida que se mue­ en el interior hidrófobo de la bicapa fosfolipídica.
_-;a sus destinos finales a lo largo de la misma vía que siguen las La mayoría de las proteínas integrales de la membrana se encuen­
's solubles que serán secretadas (véase la Fig. 13- 1, izquierda ). tran dentro 'de una de las cinco clases topológicas que se ilustran en la
· .este transporte, la orientación de una proteína de membrana Fí¡rura 13-1 (J . Las clases topológicas 1, IJ, III Ylas proteínas ancladas por
- >:;1; es decir, los mismos segmentos de la proteína siempre en­ la cola comprenden las proteínas de un pase único que poseen solo un
d citosol, mientras que otros segmentos siempre enfrentan la segmento de hélice u. que se expande en la membrana. Las proteínas
~. opuesta. De este modo, la orientación final de estas proteínas tipo 1 tienen una secuencia de señalización RE N-terminal cortada y
--~ brana está establecida duran te su biosíntesis sobre la mem­ están ancladas en la membrana con su región N-terminal hidrófila en
:.; . RE. En esta sección, en primer lugar, veremos de qué manera la cara luminal (conocida también como cara exoplasmática) y su re­
~ ,as integrales pueden interactuar con las membranas; a con- gión hidrófila C-terminal sobre la cara citosólica. Las proteínas tipo II
n. examinaremos cómo diferentes tipos de secuencias, conoci­ no contienen una secuencia de señalización RE cortada y están orien­
· ~ :j vamente como secuencias topogénicas, dirigen la inserción tadas por su región N-terminal hidrófila sobre la cara citosólica y, por
~1t ación en la membrana de varias clases de proteínas integrales. su región C-terminal hidrófila, en la cara exoplasmática (opuesta a las
~ -o ( esos se llevan a cabo mediante modificaciones de los meca­ proteínas tipo 1) . Las proteínas tipo IIJ poseen un segmento hidrófobo
oásicos empleados para translocar las proteínas de membrana que se expande en la membrana en su N-terminal y, de este modo, tie­
:l secretadas a través de la membrana del RE. nen la misma orientación que las proteínas tipo 1, pero no contienen

co:)

/ cno

coo
encia
de señalización
j' \ segmentada
• NH NH 1
celular) !
Tipo I Tipo 11 Tipo 111 Proteína anclada Tipo IV Proteína unida a GPI
por la cola
Receptor LDL Receptor de Citocromo v-SNARE y Receptores acoplados a la Receptor del activador
Proteína HA de asia log lucoproteína P450 t-SNARE proteína G de plasminógeno
la influenza Receptor de transferrina Transportadores de glucosa Fasciclina II
Receptor de Galactosi Itra nsfe rasa Canales con compuerta
insulina de Golgi regulados por Ca 2+
Receptor de la Sialiltransferasa de Bombas moleculares
hormona del Golgi pequeñas ABC
crecimiento Canal de (CI-) CFTR
Sec61

3-10 Proteínas de la membrana del RE. (inco clases topológicas de ésta son hidrófilas y se pliegan en varias confo rmaciones. Todas las proteínas
- - 3S integrales de la membrana se sintetizan en el RE rugoso, como tipo IVtienen múlti ples hél ices (j transmembrana. La topología tipo IV mostrada
. un sexto tipo unido a la membrana por un ancl a fosfollpidica. La s aquí corresponde al de los receptores acoplados a proteína G: siete hélices (j, el
." la membrana se clasifican por su orientación en ésta y los tipos de \l-terminal en el lado exoplásmico de la membrana y el (-terminal del lado ci­
_~ contienen para di rig irlas hacia allí. Para la s proteínas integrales de la tosóli co. Otras proteínas tipo IV pueden poseer un número diferente de hélices
, ::lS segmentos hidrófobos de la cadena proteica forme n hélices (j y va rias orientaciones del extremo N-terminal y (-terminal. (Véase E. Hartmann y cols.
·-=. : :,n la bicapa de la membra na; las regiones que se encuentran fu era ·9f;. p,x. i.ar·IACll.:l. Sél. US A 865786 yc. P llro'Nl1 y 5. D. Block. 1989. J. 8101. ehem. 264:444 2.)

13.2 Inserción de las proteínas de la membrana dentro del RE 587


Cadena
polipeptídica en
translocación

COmPI'jO )
Sec63 \
~m. IDn~
Luz del RE
~ p 0-P..~¡
Secuencia
de señalización El
cortada

~..,-- ........
Figura 13-9 Translocación postraduccional. Este mecan ismo es bastante
común en las levaduras y, probablemen te, se produzca en ciertas ocasiones
en los eucariontes superiores. Las pequeñas Aechas dentro del tran slocón
re prese ntan el deslizamiento al aza r del poli pép tido en translocaci ón hacia e l
interior y hacia el exterior. La unión su cesiva de BiP·ADP a los segmentos que
ingresan del polipéptido evita que la cadena se deslice hacia afuera, hacia el
citoso l. (Véase K. E. Matlack y cols., 1997. Science 277:938)

ADP

CONCEPTOS CLAVE DE LA SECCiÓN 13,1 ción de la PRS (véanse las Figs . 13 -5 y 13-6). A medida que el n'ho
unido al translocón continúa la traducción, la cadena proteica ~
Direccionamiento de las proteínas hacia de la gada es expulsada hacia la luz del RE. No se requiere energía ad .
membrana del RE y a través de esta para la translocación.

• La síntesis de las proteínas secretadas, las proteínas integrales de la ' El translocón contiene un canal central, tapizado con residu "
membrana plasmática y las destinadas al RE, el complejo de Golgi o fobos, que permite el tránsito de una cadena de proteína no __ ~
los lisosomas se inicia sobre los lisosomas del citoso l, que se unen a mientras que permanece sellado para los iones y pequeñas 1110 _: .
la membrana del RE y constituyen el RE rugoso (véase la Fig. 13 - 1, hidrófilas. Además, el canal tiene una compuerta, de modo tal : _
izquierda). abre solo cuando está siendo translocado un polipéptido.

• La secuencia señal de RE sobre una proteína de secreción naciente • En la translocación postraduccional, una proteína secretora co;:- :
consiste en un segmento de aminoácidos hidrófobos localizados en el es direccionada hacia la membrana del RE por la interacción de
extremo N-terminal. cuencia de señalización con el translo cón. Después, la cadena po i: _
dica es dirigida hacia el RE por un m ecanismo de trinquete que r '. _
• En la translocación cotraduccional, la partícula de reconocimiento
la hidrólisis de ATP por la chaperona BiP, que estabiliza el poli. ~
de la señal (PRS) reconoce inicialmente la señal RE de una proteína de
entrante (véase la Fig. 13-9). En las bacterias, la fuerza impulsora ¡: ­
secreción naciente; se une a ésta y, a su vez, es unida por un receptor de
translocación postraduccional proviene de la SecA, una ATPasa ei: .
PRS a la membrana del RE; de este modo, se dirige el complejo riboso ­
ca que empuja los polipéptidos a través del canal del translocón.
ma/cadena naciente hacia el RE.
• Tanto en la translocación cotraduccional como postraducciona. _­
• Luego, la PRS y el receptor de PRS median la inserción de la proteína
peptidasa señal de la membrana del RE corta la secuencia de se-.~
secretora naciente dentro de translocón (complejo Sec61) . La hidrólisis
ción del RE de una proteína secretora, poco después de que el en: :
de dos moléculas de GTP por la PRS y su receptor provocan la diso cia­ N-terminal ingresa en la luz.

586 CAPITULO 13 • El movimiento de proteínas en membranas y orgánulos


una secuencia de señalización que pueda ser escindida. Finalmente, las un a secuencia topogénica interna única . Como veremos, existen trec~
proteínas ancladas por su cola tienen un segmento hidrófobo en su C ­ tipos principales de secuencias topogénicas empleadas para direccio­
terminal, que se expande en la membrana. Estas diferentes topologías nar las proteínas hacia la membran a del RE y para orientarlas dent
reflejan distintos mecanismos empleados por la célula para establecer de éste. Ya hemos presentado una de ellas, la secuencia de señalizaci 6 ~.
la orientación de los segmentos transmembrana en la membrana, se­ N-terminal. Las otras dos analizadas aquí son las secuencias inter ~
gún se analizará en la siguiente sección. conocidas como secuencias de detención de la transferencia-anclaje y S<' ­
Las proteínas que forman la clase topológica IV contienen dos o cuencias de señalización- anclaje. A diferencia de las secuencias de se ñ.l ­
más segmentos que se expanden en la membrana y, en ciertas ocasio­ lización , los dos tipos de secuencias topogénicas internas terminan ~
nes, se denominan proteínas multipaso (o de paso múltiple). Por ejem­ la proteína madura como segmentos que se expanden en la membra nc...
plo, muchas de las proteínas de transporte analizadas en el Cap It ulo 11 Sin embargo, los dos tipos de secuencias topogénicas internas difie r<,c
y los numerosos receptores acoplados a la proteína G expuestos en el en su orientación final en la membrana.
apltuln 15 pertenecen a esta clase. Un tipo final de proteína de mem­
brana carece de un segmento hidrófobo que se expanda en la membra­ Proteínas tipo I Todas las proteínas transmembrana de tipo 1 pos ec­
na; en lugar de ello, estas proteinas están ligadas a un ancla fosfolipídi­ una secuencia de señalización N-terminal que las direcciona hacia :..
ca anfipática que se encuentra embebida en la membrana ( Fig. [5 - \O, RE, así como una secuencia hidrófoba interna que se transforma _­
derecha). la hélice a, que atraviesa la membrana. La secuencia de señalizaci
N-terminal de una proteína naciente tipo 1, como el de una prote=-­
soluble que será secretada, inicia la translocación cotraduccional d.:
las secuencias internas de detención de la proteína mediante la acción combinada de la partícula de reco n , ­
transferencia y señalización-anclaje determinan miento de señal y el receptor de dicha partícula. Una vez que el extre:-:
N -terminal del polipéptido creciente in gresa en la luz del RE, la secu~ .
la topología de las proteínas de paso único
cia de señalización se segmenta y la cadena creciente continúa sie r.::.
Comenzamos nuestro an álisis acerca del modo en que se determina expulsada a través de la membrana del RE. Sin embargo, a diferencíz -.: .
la topología de las membranas con la inserción de las proteínas inte­ lo que sucede con las proteínas so lubles que serán secretadas, CU 2:-::
grales de membrana que contienen un segmento hidrófobo único que la secuencia de aproximadamente 22 aminoácidos hidrófobos q u
se expande en la membrana. Hay dos secuencias involucradas en el transformará en el dominio que se encuentra dentro de la membr ­ .
direccionamiento y la orientación de las proteínas tipo I en la mem­ de esta cadena naciente ingresa en el translocón, detiene la transfe:- ,-·
brana del RE, mientras que las proteínas tipo II y tipo III contienen cia de la proteína a través del canal (fig . 13-11 ). El complejo '~-

Citosol

5'

Translocón
abierto , .. ~

Peptidasa
señal
?1lJ ~ NH,

~
C,deo,
polipeptídica
naciente
Secuencia de
detención de la
transferencia anclaje

Secuencia
Luz del RE de señalización
cortada

NH

Figura 13-11 Posicionamiento de las proteínas tipo I de paso único. la transferencia cl' claje se desplaza en direcc ión latera l, entre la s su' Uf' ~_
Paso U: después de que el complejo ribosoma/cadena nacien e se asoci a con oel ranslocón, y se ancla a la bicapa de fosfolipidos. Probablemente, e- ­
un tra nslocón en la me mb rana del RE, la secuencia de se'ial : za~;6n N-ter Inal mome nto, el t'a nsl ocón se c erre. Paso 0 : a medioa que la síntesis co n- ­
se segmenca. Este proceso se produce po r el mismo mec nisn1 0 que el oe las I¿, cadena qu e esra alargándose pu ede for mar un asa hacia el citosol,,, - _
proteínas solubles secretoras (véase la Flg. 13-6) Pa sos ~, El: la cadena se a arga de un pequeño espacio en re el ri oosoma y ei translocón. Paso [11: cua- ­
hasta que se sintetiza la secuencia de detención de la transferer.cia anclaje sí resis se ha co, pletado, las sub unidades ri bosómicas se liberan en'?' :
hidrófoba e ingresa en el ranslocón.lugar en el Que evita que la ade a na­ y también se ibera la oroteíl' a para ou e difunda en la membrana. (W.",­
ciente salga más allá, ha da la luz del RE. Paso ril: la secuencia de e¡ene ló', Je : :- ":iS : ;%, : ¿- 85 : :~9 y -:.' ;\'O: ¡"~!· y _ols.. 19; 7 ':t' 89:52 3 \

588 CAPfTULO 13 • El movimiento de proteínas en membranas y orgánulos


:,:",tonces, puede abrirse como la valva de una almeja y permitir que el de a-hélice de la membrana o bien falta o bien se transloca por com­
.puento hidrófobo del interior de la membrana de es te péptido que pleto hacia la luz del RE y, finalmente, se secreta desde la célula como si
_transloca se mueva en dirección latera l entre los dominios proteicos fuese un a proteína soluble. Estos tipos de experimentos establecen que
- _e constituyen la pared del translocón (véase la hg. 1.3-8). Cuando el la hélice a transmembrana hidrófoba del receptor de HGH y de otras
_;:l! ido sale del translocón de esta manera, se ancla en la bicapa fosfoli­ proteínas tipo I funciona como secuencia de detención de la transfe­
¿ica de la membrana. Dada la doble función de una secuencia de este rencia y como ancla de membrana que evita que el extremo C-terminal
: .: '0, que consiste en detener el paso de la cadena polipeptídica a través de la proteína atraviese la mem brana del RE.
. ,!,_ translocón yen transformarse en el segmento hidrófobo inserto en
:-~Ie mbrana dentro, de la bicapa de ésta , se la denomina secuencia de Proteínas tipo 11 y tipo 111 A diferencia de las proteínas tipo 1, las pro­
.-"llción de la transferencia-anclaje. teínas tipo II y tipo III carecen de una secuencia de señalización N­
e na vez que se ha interrumpido la translocación, la traducción terminal RE escindible. En lugar de ello, ambas poseen una sola secuen­
-.ü núa en el ribosoma, que aún se encuentra anclado al translocón cia de señalización-anclaje interna hidrófoba que funciona, al mismo
_~_ en ese momento, está desocupado y cerrado. A medida que se sin­ tiempo, como secuencia de señalización al RE y como una secuencia
el extremo C-terminal de la cadena pro teica, esta forma un asa en de anclaje a la membrana. Recordemos que las proteínas tipo Il y tipo
..:do citosólico de la membrana. Cuando se ha completado la traduc­ III tienen orientaciones opuestas en la membrana (véase la Fig. 13-1 0) ;
- -el ribosoma se libera del translocón, y el extremo C-terminal de la esta diferencia depende de la orientación que sus respectivas secuencias
.cina tipo I recién sintetizada permanece en el citoso l. de señalización -anclaje adquieran dentro del translocón. La secuencia
~5t udios segú n los cuales los cDNA que cod ifican va rios receptores de seña lización -anclaje interna en las pro teínas tipo II dirige la inser­
-:4ntes de la hormona de crecimiento humana (HG H) se exp resan ción de la cadena naciente en la membrana del RE, de modo tal que
- : =Iu]as de mamífero en cultivo dan sustento a este tipo de mecanis­ el ext remo N-terminal de la cadena enfrente al citosol, con el uso del
:::1 receptor silvestre de la HGH , un a proteína típica tipo 1, normal­ mismo meca nismo dependiente de la partícula de reconocimiento de
-·· e. se transporta hacia la membrana plasmática. Sin embargo, un señal descrito para las secuen cias de señal (Fig. 13-1 2a). Sin embargo, la
-'- ~ .Jr mutante que tiene residuos cargados insertos en el segmento secuencia de señalización-anclaje interna no es escindida y se mueve en

EJ o (bl

Cadena
polipeptídica
naciente

o El EJ coo

~
RE

13-12 Posicionamiento de las proteínas de paso único tipo 11 interna se desplaza en dirección lateral, sale del translocón y ancla la cadena
al Proteínas tipo 11. Paso U después de que se ha sintetiZado la a la bicapa de fos folíp idos. Paso~: una vez que se ha completado la síntesis
, ',terna seña li zación-an claje en un ribosoma citosólico, es unida por pro tei ca, el extremo (-ter minal del polipéptido se li bera hacia la luz. y las
-} se muestra), que dirige el complejo ribosoma/cadena nac iente subunidades ribosómicas se libera r¡ al citosol. (bl Proteínas tipo 111. Paso D: el
. ~'-nb rana del RE. Esto es similar al direcciona miento de las proteínas ensamblaje se realiza por una vía similar a las de las proteínas tipo 11, excepto
:~-::'e toras, excepto por el hecho de que la secuencia de se ñalización qu e los residuos positivamente cargados en el lado (- ter minal de la secuencia
- -o se localiza en el extremo f+ terminal y no es posteriormente de seña lización-anclaje hacen que el segmento transmembrana se oriente
-o cadena nac ie nte se orienta en el translocón, con su porción dent ro de! translocón, con su porción (-te rmi na l orientada hacia el citosolyel
_ r acia el citosol. Se cree que esta orientación estiÍ medi ada por los lado ¡\J-tE 'minal de ia proteína en la luz de l RE. Pa sos ~, U la elongación de la
: ¡:¡ivamente ca rgados que se muest'an en posición N-termin al cadena de la porción C-te'mi nal de la proteína se completa en el citosol, y se
- --:) a la secuencia de señalización-anclaJe. Paso ~: a medida que la liberan las subun idades ribosó micas. (Vé~se M. Splesl Y H". Lodlsh. 1986. Cel: 44:177 y H. Do
=¿, 3iga y se expulsa hacia la luz, la secuencia señalización-anc laje y m is, ' .g%, Ü:,f 85 3 c;_~

13.2 Inserción de las proteínas de la membrana dentro del RE 589


sentido lateral entre los dominios proteicos de la pared del translocón, con carga negativa hace que la neuraminidasa adquiera la orienta..
en la bicapa fosfolipídica, donde funciona como un ancla de membra­ inversa. Experimentos similares han mostrado que otras proteína"
na. A medida que procede la elongación, la región e-terminal de la orientación tipo 11 o tipo IlI, pueden "saltar" a la orientación inver' _
cadena creciente sale a través del translocón hacia el interior de la luz la membrana del RE, al mutar los residuos cargados que flanqu
del RE mediante translocación cotraduccional. segmento interno de señalización-anclaje interno.
En el caso de las proteínas tipo 111, la secuencia de señalización ­
anclaje que se localiza cerca del N-terminal inserta la cadena naciente Proteínas ancladas por la cola Para todas las clases topológica;
en la membrana del RE con su extremo N-terminal enfrentado a la proteínas que hemos considerado hasta el momento, la inserción
luz, en la orientación opuesta de la señalización-anclaje de las proteínas membrana comienza cuando la partícula de reconocimiento de se­
tipo JI. La secuencia de señalización-anclaje de las proteínas tipo III reconoce un péptido topogénico hidrófobo, a medida que surge
también funciona como una secuencia de detención de la transferen­ ribosoma. El reconocimiento de las proteínas ancladas por la cola, .
cia y evita la salida posterior de la cadena naciente hacia la luz del RE poseen una sola secuencia topogénica hidrófoba en el e-terminal"
(Fíg. 13- 12b). La elongación continua de la cadena e-terminal hasta la senta un desafío único, ya que el e-terminal solamente está dispor,
secuencia de señalización-anclaje/detención de la transferencia se pro­ para su reconocimiento después de que se ha completado la tradu <x
duce como en las proteínas tipo 1, en las que la secuencia hidrófoba se y la proteína se ha liberado desde el ribosoma. La inserción de las ­
desplaza en dirección lateral entre las subunidades del translocón para teínas ancladas por la cola a la membrana del RE no emplea la part í ~.
anclar el polipéptido a la membrana del RE (véase la I-Ig. J3-l t ). de reconocimiento de señal, el receptor de dicha partícula o el tr ­
Una de las características de la secuencia de señalización-anclaje, locón; en lugar de ello, depende de una vía dedicada a este propó,­
que parece determinar su orientación de inserción, es una elevada con­ como se muestra en la fi gurJ 15- U . El direccionamiento de las F
centración de aminoácidos con carga positiva adyacentes a un extremo teínas ancladas por la cola involucra una ATPasa conocida como G
del segmento hidrófobo. Estos residuos de carga positiva tienden a per­ que se une al segmento hidrófobo e-terminal de las proteínas ancl ~:...
manecer en el lado citosólico de la membrana, sin atravesar la membra­ por la cola. El complejo de Get3 unido a una proteína anclada po.
na hacia la luz del RE. De este modo, la posición de los residuos cargados cola es reclutado hacia el RE por un receptor de membrana intev
dicta la orientación de la secuencia de señalización-anclaje dentro del dimérico conocido como Getl/Get2, y la proteína anclada por la e
translocón y determina si el resto de la cadena polipeptídica continúa se libera desde Get3 para su inserción en la membrana. La inserción _
pasando hacia la luz del RE: las proteínas tipo Ir tienden a presentar la proteína anclada por la cola en las membranas del RE por las pro::
residuos con carga positiva en el lado N-terminal de su secuencia de nas Get comparte similitudes fundamentales, en cuanto al mecanis::­
señalización-anclaje, lo que orienta el extremo N-terminal en el citosol con el direccionamiento de las proteínas que llevan secuencias de . :
y permite el paso del lado e-terminal hacia el RE (Fig. 15- 12.1), mientras ñalización hacia el RE, por parte de la partícula de reconocimient :...
que las proteínas tipo III tienden a tenerlos en el lado del e-terminal de señal y su receptor. Dos diferencias principales entre los dos proc~
su secuencia de señalización-anclaje. Su extremo N-terminal se inserta de direccionamiento consisten en lo siguiente: después de la liberae:
en el translocón y el lado e-terminal se restringe al citosol (lig. 1-'-I .2 b ). desde Get3, las proteínas ancladas por la cola pueden ser inserta :..
Una demostración experimental sorprendente de la importancia directamente en la bicapa de la membrana mientras que la partíc
de la carga lateral en la determinación de la orientación de la membra­ de reconocimiento de señal transfiere una secuencia de señalizaciÓr.
na la proporciona la neuraminidasa, una proteína tipo II presente en la translocón y la Get3 acopla el direccionamiento y la transferencia:
cubierta superficial del virus de la influenza. Hay tres residuos de argi­ las proteínas ancladas por la cola a la hidrólisis del ATP, mientras qu
nina localizados exactamente en la posición N-terminal con respecto a partícula de reconocimiento de señal acopla el direccionamiento de _
la secuencia de señalización-anclaje de la neuraminidasa. La mutación proteína que será secretada ex la hidrólisis del GTP.
de estos tres residuos cargados positivamente a residuos de glutamato

f D
"-
~
\ coo- ~ Get3

~ ----,
Cola hidrófoba -_o, ..,¡~_ _ _ _ _ _ _ __

C-terminal ~ ,~!!.) '--­


~ATP
Figura 13-13 Inserción de proteínas ancladas por la cola. Para
las proteínas ancladas por la cola (-ter mi nal, el extremo (-terminal
hidrófobo no está dispon ible pa ra la inserción en la membrana hasta
que se haya completado la síntesis proteica y la proteína se haya liberado
del ribosoma. Paso n la Get3, un ida al ATp, se une a la cola hidrofó ca
fJ(
(-terminal. Esta reacción de unión es facilitada por un cu n plejo de tres
proteínas, 5g t2, Get4 y GetS, que secuestran la cola (-terminal hid rófoba Citosol
antes de transferirla a la GeGATP (no se muestra) Paso El: el complejo
ternario Get3ATP unido a la cola (-terminal ancla I s proteínas Getl y
Get2, que están embebidas en la membrana del RE. Paso n sucesiva­
men te, el ATP se hidroliza y se libera ADP desde la Get3. Al mi smo tiem­
po, la cola hidrófoba (-terminal se libera desde la Get3 y qu eoa inserta Luz del RE Get1 Get2
en la membrana del RE, Paso tl: la Get3 se une al ATp, y se libera Get3ATP
desde el com plejo de Getl y Get2 en fo rma soluble, lista para otro ciclo
de unión a la cola (-terminal hidrófoba.

590 CAPITULO 13 • El movimiento de proteínas en membranas y orgánulos


gosacárido preformado N-ligado se agrega dolicol resultante está orientado de modo tal que la porción del oligo­
as proteínas en el RE rugoso sacárido enfrenta la luz del RE.
Todo el precursor de 14 residuos es transferido desde el portador
~;esis de todos los oligosacáridos N-ligados se inicia en el RE dolicol a un residuo de asparagina en un polipéptido naciente a medida
: L'n la adición de un precursor de oligosacárido preformado que emerge hacia la luz del RE ([,ig. 13-18, paso D). Solo los residuos de
- ¡jeae 14 residuos (rig. 13-17). La estructura de este precursor asparagina en las secuencias del tripéptido Asn-X-Ser y Asn-X-Thr (en
n la en los vegetales, animales y eucariontes unicelulares: un los que X es cualquier aminoácido, excepto prolina ) son sustratos de la
~.L-¡ do ramificado que contiene 3 moléculas de glucosa (Glc) , oligosacaril tral1sferasa, la enzima que cataliza esta reacción. Dos de las
';-.osa (Ma n) y 2 de N-acetilglucosamina (GlcNAc), que puede tres subunidades de esta enzima son proteínas de membrana del RE cu­
.-~' como Glc,Man 9 (GJcNAc),. Una vez que se ha agregado a la yos dominios citosólicos se unen al ribosoma, lo que ubica una tercera
- .: esta estructura de carbohidrato ramificada se modifica por subunidad de la transferasa, la catalítica, cerca de la cadena de polipép­
.. ;:¡ e.liminación de los monosacáridos en los compartimentos del tido creciente en la luz del RE. No todas las secuencias Asn-X-Ser/Thr se
: 'lm plejo de Golgi. Las modificaciones a las cadenas N-ligadas glucosilan, y no es posible predecir -a partir de la secuencia de aminoá­
- ':e una glucoproteína a otra y entre diferentes organismos, cidos exclusivamente- cuáles son los sitios de potencial glucosilación
:onserva un núcleo de 5 de los 14 residuos en las estructuras N-ligada que se modificarán ; por ejemplo, el rápido plegamiento de un
~ los oligosacáridos N-ligados en las proteínas secretoras y las segmento de una proteína que con tiene una secuencia Asn-X-Ser/Thr
~nr ana . puede evitar la transferencia del oligosacárido precursor a ese segmento.
. ,,~ ::; de la transferencia a una cadena naciente en la lu z del RE, el Inmediatamente después de que el precursor completo,
.::!rido precursor se ensambla en un ancla unida a la membrana GJc)Man 9 (GJcNAc),se transfiere a un polipéptido naciente, tres en­
- ~ da dolieal fosfato , un lípido poliisoprenoide de cadena larga zimas diferentes, denominadas glucosidasas, eliminan los tres resi­
. Después de que el primer azúcar, GlcNAc, se une al dolicol duos de glucosa y un residuo de manosa en particular (Fig. j 3- 1R,
"!'Iediante un enlace pirofosfato, los otros azúcares se agregan pasos O-O). Los tres residuos de glucosa, que son los últimos residuos
- .di.o de enlaces glucosídicos a un conjunto complejo de reaccio­ agre gados durante la síntesis del precursor en el portador de dolicol'
.ilizado por enzimas unidas a las caras citosólica o luminal de parecen actuar como una señal de que el oligosacárido está completo y
- . m ana del RE rugoso (Fil'. J 3-1 :O ). El oligosacárido pirofosforil listo para ser transferido a una proteína.

3 ~ oqueado
tunicamicina Citosol
_:p I UDP 5 GDP
• Ó
4 GDP 3 UDP
IMP \ 4 GDP Ó 3 UDP A

,
\

Dj /if" ~ /EI
JA

"O'
T(:

r ~ >-< >-<
~
t ~ ~ f: :j ~
11 = N-acetilglucosamina
0= Manosa
A = Glucosa
Luz del RE

13-17 Biosíntesis del precursor de oligosacáridos. El dolicol sacáridos N-iigados de las células. Después de que el intermediar io dolicol
;os un lípido fuertemente hidrófobo que contiene 75-95 áto mos de pirofosforilo de siete residuos cambia a la ca ra luminal (paso tiI), los cuatro
y está em bebido en la membra na del RE. Se añaden dos residuos residuos de manosa y los tres residuos de glucosa restantes se añaden uno
-¿,¡ilglucosam ina (GlcNAc) y cinco residuos de manosa. uno a la vez. al por vez (pasos 0,0). En las últi mas reacciones, el azúcar que será añadido se
'mfato de la cara citosólica de la membrana del RE(pasos O-D). Los tra nsfiere, primero, desde un nucleótido-azúcar a un transportador dolicol­
=5 de nucleótido-azúcar, en estas reacciones y otras posteriores, se fosfato en la cara citosólica del RE; luego, el transportador se vuelve hacia
21 en el citosol. Nótese que el pri mer residuo de azúcar está unido al la cara lu mi nal, donde el azúcar es transferido al oligosacárido creciente;
'Tlediante un enlace pirofosfato de alta energía. La tun icamici na, que despué s, el transportador "vacío" se vuelve nuevamente a la cara citosólica.
~ ; la primera enzima de esta vía, inhi be la síntesis de todos los oligo­ fTorr·ado de C Abeijon y C. 6. Hi',mo.rg. 1992. írend, Biochem. So 17:32.)

13.3 Modificaciones, plegamiento y control de calidad de las proteínas en el RE 595


001
m

~
+-­ Al
\.. ~ ~ ~

D fJ El El
'V (Man)s(GlcNAC)2

Luz del RE

Dol = Dolicol 0 = Manosa


• = N-acetilglucosamina L = Glucosa

FIGURA 13-18 Adición y procesamiento inicial de oligosacáridos La ad'ció osterior de un resi:iuo de glucosa (paso ÉE) cumple un papel er ­
N-ligados. En el RErugoso de las células de los vertebrados. el precursor plega miento correcto de muchas proteínas en el olegamiento del RE. com
Glc,Man 9(GlcNAc), es transferido desde el t'cl1s portado r oo:icol hada un anali zará des pués, El proceso de glucosilación N-ligada de una proteína soC
residuo de asparagina susceptible, en un protelna raciente, an pr::mto cOmo secretora se uestrc aquí. pero las porciones lumi nales de una proteína jr -,:­
la asparagina atraviesa aliado luminal del RE (paso (J), En tres reacciones sepa­ gra: de ia memb"a03 pueden ser modi' cadas sobre los residuos de aspa rf.,!
radas, en primer lugar un residuo de glucosa (paso fl); luego, dos resiouos de por el mismo mec a ni s mv. \/~~F Korn"'oyS Kcmfelu. 1985.Ar.n Re'IB /lem 45:6;1
glucosa (paso ~ y, fi nalmente, un residuo de manosa (paso ~ son elimin -ocs. ~ :;;:;:i3y a .i ¡;arooi, ·~S,E, l,lb..;). 14 :"¡i%.l

Las cadenas laterales de los oligosacáridos que une azúcares en ciertas CAM presentes en las células endoteliale' :: ,
pueden promover el plegamiento y la estabilidad revisten los vasos sanguíneos. Esta interacción une los leucocitos al
de las glucoproteínas dotelio y ayuda en su movimiento hacia el interior de los tejidos dL!T
una respuesta inflamatoria a la infección (véase la Fig. 20-39 ). Otr~:c .
Los oligosacáridos unidos a las glucoproteínas cumplen varias funcio­ coproteínas de la superficie celular poseen cadenas laterales de olig
nes. Por ejemplo, algunas proteínas requieren los oligosacáridos N­ ridos que pueden inducir una respuesta inmunitaria. Un ejemplo co .. _
ligados para plegarse adecuadamente en el RE. Esta función ha sido está representado por los antígenos de los grupos sanguíneos A. '"
demostrada en estudios realizados con el antibiótico tunicamicina , que que son oligosacáridos O-ligados unidos a glucoproteínas y glucolij: ~
bloq uea el primer paso de la formación del precursor ligado a dolicol y, de la superficie de los eritrocitos y de otros tipos celulares (Fig. I -_
por lo tanto, inhibe la síntesis de todos los oligosacáridos N-ligados en En ambos casos, los oligosacáridos se agregan a la superficie lum!.!'L _
las células (véase la Fig. 1.3-1 7, arriba, a la izquierda). Por ejemplo, en estas proteinas de la membrana de modo similar a lo que se mue ~ _
presencia de tunicamicina, el polipéptido precursor de la hemaglutini­ la figura U-Ji; para las proteínas solubles. La cara luminal de es tas _
na del virus de la influenza (HAo) se sintetiza, pero no puede plegarse teínas de membrana es topológicamente equivalente a la cara exter; - ,
adecuadamente y formar un trímero normal; en este caso, la proteína la membrana plasmática en la que, finalmente, terminan estas prOL
permanece mal plegada en el RE rugoso. Más aún, la mutación de una
asparagina en particular en la secuencia de la HA a un residuo de gluta­
mina evita la adición de un oligosacárido N-ligado a ese sitio y hace que Los enlaces disulfuro son formados y reordenad05
la proteína se acumule en el RE en un estado desplegado. por proteínas de la luz del RE
Además de promover el plegamiento adecuado, los oligosacáridos
N-ligados también confieren estabilidad a muchas glucoproteínas se­ En el Capítulo j aprendimos que tanto los enlaces disulfuro (-5­
cretadas. Numerosas proteínas secretoras se pliegan adecuadamente intramoleculares como intermoleculares ayudan a estabilizar la ~ ,'
y son transportadas hacia su destino final, aunque esté bloqueada la tura terciaria y cuaternaria de muchas proteínas. Estos enlaces co'
adición de todos los oligosacáridos N-ligados, por ejemplo, por la tu­ tes se forman por la unión oxidativa de los grupos sulfhidrilo -_
nicamicina. Sin embargo, estas proteínas no glucosiladas mostraron ser conocidos también como grupos tio/, sobre dos residuos de cist
menos estables que las formas glucosiladas. Por ejemplo, la fibronec­ la misma cadena polipeptídica o en cadenas polipeptídicas dis- '
tina glucosilada, un componente normal de la matriz extracelular, se Esta reacción puede producirse de forma espontánea solo cuan;:..
degrada mucho más lentamente por acción de las proteasas tisulares presente un oxidante adecuado. En las células eucariónticas, se [-­
que la fibronectina no glucosilada. enlaces disulfuro solo en la luz del RE rugoso. De modo que los.-.
Los oligosacáridos de ciertas glucoproteínas de la superficie celular disulfuro se encuentran solamente en las proteínas de secrecio.
también desempeñan una función en la adhesión intercelular. Por ejem­ bIes y en los dominios exoplasmáticos de las proteínas de la merr~
plo, la membrana plasmática de los glóbulos blancos (leucocitos) contie­ Las proteínas citosólicas y de los orgánulos sintetizadas sobre I
ne moléculas de adhesión celular (CAi'vf) , que están extensamente gluco­ somas libres (las destinadas a las mitocondrias, cloroplastos, ~
siladas. Los oligosacáridos de estas moléculas interactúan con el dominio mas, etc.) habitualmente carecen de enlaces disulfuro.

596 CAPITULO 13 • El movimiento de proteínas en membranas y orgánulos


::>rmación eficiente de los enlaces disulfuro en la luz del RE de­ cias de aminoácidos, mientras que un polipéptido aún se encuentra
:~ la enzima proteína disulfuro isomerasa (PDI), que está pre­ creciendo sobre el ribosoma. Sin embargo, esta formación secuencial
~ - to das las células eucariÓnticas. Esta enzima abunda especial- en ciertas ocasiones produce enlaces disulfuro entre las cisteínas equi­
n el RE de las células secretoras en órganos como el hígado y el vocadas. Por ejemplo, la proinsulina, un precursor de la hormona pep­
. -:!.S-. en las que se producen grandes cantidades de proteínas que tídica insulina, tiene tres enlaces disulfuro que unen las cisteínas 1)' 4,2
~- :-il enlaces disulfuro. Como se muestra en la Figura 13-1%, el Y6, Y3 Y 5. En este caso, un enlace disulfuro que inicialmente se formó
_..)ulfuro en el sitio activo de la POI puede transferirse fácilmen­ secuencialmente (p. ej., entre las cisteínas I y 2) no se hubiera reorde­
- . proteína a través de dos acciones de transferencia tiol-disulfuro nado para que la proteína alcanzara su conformación plegada adecua­
- :íales. La PDr reducida, generada por esta reacción, vuelve a una da. En las células, el reordenamiento de los enlaces disulfuro también se
,xidada por acción de una proteína residente en el RE, denomi­ ve acelerado por la PDl, que actúa en un amplio espectro de sustratos
:;- -j. que lleva un enlace disulfuro que puede ser transferido a la proteicos)' les permite a éstos alcanzar sus conformaciones termodiná­
propia Erol se oxida por una reacción con el oxígeno molecu­ micamente más estables (Fig. 13- 19b ). Los enlaces disulfuro, en gene­
.la difundido en el RE. ral, se forman en un orden específico; en primer término, estabilizan
15 proteínas que contienen más de un enlace disulfuro, el apa­ pequeños dominios de un polipéptido )' luego, las interacciones entre
; ';:; ;0 adecuado de los residuos de cisteína es esencial para la es­ segmentos más distantes; este fenómeno se ilustra en el plegamiento de
. -:l l' actividades normales. Los enlaces disulfuro, por lo general, la proteína hemaglutinina (HA) de la influenza, que se analizará en la
1 entre cisteínas que aparecen secuencialmente en las secuen­ siguiente sección.

S S

(a) Formación de un enlace disulfuro


~
...-S PDI .... SH
POI reducida ____ S H
oxidada 'S .... SH

L
'S ---' 2

~
SH

Proteína
SH

L ~
::----- S­

sustrato Proteína
reducida sustrato
oxidada

(b) Reordenamiento de los enlaces disulfuro

POI .... SH .... SH


reducida PDI ...-SH
'S­ 'S --3
reducida 'SH
-S S

~ L • S S

Proteína con enlaces


disulfuro incorrectos Proteína con enlaces
disulfuro correctos

13-19 Acción de la proteína disulfuro isomerasa (POI). La POI :iol ionizado en el sustrato reacciona con este intermediario; fo rma un enlace
-:¿-:omoda enlaces disulfu ro por medio de un sitio activo con dos disulfuro con a proteína sustrato y li bera la POIreducida. A su vez, la POI
.:.~ cisteína cercanos, que fác il mente se interconvierten entre la forma transfie re electrones a un enlace disulfuro en la proteína lu mi nal Ero1,Io que
.. _:ida y la forma disulfuro oxidada. Las flechas nu-neradas en rojo regenera J¡¡ forma oxidada de la POI. (b) La POI reducida puede catalizar el
" ;ecuencia de las transferencias electrónicas. Las barras en ama rillo reacomoda miento de enlaces di sulfuro incorrec tamente formados mediante
-:.~ los enlaces disulfuro. (a) En la form ación de los enlaces disu!fu ­ reacciones de transfere nd a similares tiol-disulfuro. En este caso, la POI reducida
- , 'oniza da (-5-) de una cisteína de un tiol. en la proteína sustrato, se inicia y se regenera en la vía de reacción. Estas reacciones se repi ten hasta
. :¡ -Jil el enlace disulfuro (S-S) en una POI oxidada para formar un que se logra la conformación más estable de la proteína. (Véase M. M Lyles yH. F.
. ;,río POI, con enlace disu lfuro-proteína sustrato. Luego, un segundo ~ I ""~ . '¡>9I .BJochemiw;30:619.l

13.3 Modificaciones, plegamiento y control de calidad de las proteínas en el RE 597


Las chaperonas y otras proteínas del RE facilitan de unirse de manera transitoria a cadenas na cientes, a medida que
el plegamiento y el ensamblaje de las proteínas gresan en el RE durante la translocación cotraduccional. Se cree qL,
BiP unida evita que los segmentos de una cadena naciente se plie _ ~ ­
Si bien muchas proteinas desnaturalizadas pueden volver a plegarse incorrectamente o formen agregados, lo que promovería el plegalT_:
en forma espontánea a su estado nativo in vitro, este repliegue habi­ to del polipéptido completo en la conformación adecuada. La prou
tualmente requiere horas para completarse. En lugar de ello, nuevas disulfuro isomerasa contribuye también al plegamiento adecuado :
proteínas solubles y de membrana producidas en el RE, en general , se que la conformación 3-D estabiliza por medio de enlaces disulfur '
pliegan a su conformación adecuada en el lapso de minutos después de muchas proteínas.
la síntesis. El rápido plegamiento de estas proteínas recién sintetizadas Como se ilustró en la Figura 13-20, otras dos proteínas del Rl
en las células depende de la acción secuencial de varias proteínas pre­ lectinas homólogas (proteínas que unen hidratos de carbono) cal"
sentes dentro de la luz del RE. Hemos visto ya de qué modo la chape­ y calreticulina, se unen selectivamente a ciertos oligosacáridos N-l.i __
rona molecular BiP puede conducir la translocación postraduccional en cadenas nacientes. El ligando para estas dos lectinas, que se ase=
en las levaduras, al unirse a polipéptidos completamente sintetizados, a al precursor oligosacárido N-ligado pero que tiene solo un residt:
medida que ingresan en el RE (véase la FiE!. U-Y). La BiP también pue­ glucosa (Glc¡Man 9 [ GlcNAc l,l, es generado por una glucosiltransi.. ._

(a) Oligosacaril
transferasa
Oolicol
oligosacárido (X-hélice que se (X-hélice
extiende en la membrana luminal
Citosol

POI -s
1
SH
Trímero HAo

Monómero
HAo completo

(b)

FIGURA 13-20 Plegamiento y ensamblaje de la hemaglutini­


na. (a) Mecanismo de en samblaje de los rí eros de (HA). La unión
transitoria de la chaperona SiP (paso il!) a la cadena naciente yde dos
lectinas, la calnexina y la calreticulina, a ciertas cadenas de oligosacá­
ridos (paso ml) promueve el plegamiento adecuado de segmentos
ad yacentes. Se agrega un total de siete cadenas de oligosacáridos
N-ligados a la porción luminal de la cadena naciente durante la trans­
locación cotraduccional. y la PDI cataliza la form ación de seis enlaces
disulfu ro por monóme ro. Los monómeros de HAo completos se ancian
a la membrana por una hélice (X simple que abarca la membrana
con su extremo N-terminal en la luz (paso ~ La interacción de las
tres cadenas HAo entre sí, inicialmente por medio de sus hélices a
transmembrana, aparentemente desencadena la formaci ón de un
largo tallo que contiene una hélice (X desde la parte lu minal de cada
polipéptido HAo' Finalmente, se produce n interacciones entre las tres
cabezas globulares y se genera un trímero HA , estable (pa so~. (b)
Fotomicrografía electrónica de un virión de la influenza completo, que
muestra los trimeros de la proteína HA, que sobresalen co mo espigas
desde la superfiCie de la membrana viral. (La Darle la). ',,"a!eu. Tó!u ·' ' 1 ·~ 5 .
EMBOJ. 14:1340 y D. Herben el , 1, 199 7, 1. e,1I 8101 139:613.• • parte .b; Ch ,',8jornoerg i
PhOto Re searchers, Inc.)

598 CAP[rULO 13 • El movimiento de proteínas en membranas y orgánulos


:~ la luz del RE (véase la fig . U-H!, paso m). Esta enzima han mostrado que se requieren 10 minutos, exactamente, para que
.d las cadenas polipeptídicas no plegadas o mal plegadas y, en los polipéptidos HAo se plieguen y ensamblen en su conformación
s,l ucosiltransferasa actúa como uno de los mecanismos de trimérica adecuada.
:--..;:narios para asegurar el control de calidad del plegamiento
,.- ~i RE, pero el mecanismo por el cual la glucosiltransferasa Las proteínas plegadas inadecuadamente en
:-- ,leínas plegadas de no plegadas aún no se conoce. La unión el RE inducen la expresión de catalizadores del
- :::-.ma y la calreticulina a las cadenas nacientes no plegadas,
plegamiento proteico
:-"n oligosacáridos N-ligados glucosilados, evita la agregación
",,~t:'nt os adyacentes de una proteína, a medida que está siendo Las proteínas silvestres sintetizadas en el RE rugoso no pueden salir de
~ ~'l el RE. Así, la calnexina y la calreticulina, al igual que la este compartimento, a menos que logren su conformación completa­
:: ü que se produzca el plegamiento prematuro incorrecto de mente plegada. De forma similar, casi cualquier mutación que evite el
~ e una proteína recién sintetizada. plegamiento adecuado de una proteína en el RE bloquea, además, el
:-:nalizadores importantes del plegamiento proteico en la luz movimiento del poiipéptido de la luz de éste o su membrana hacia el
- las peptidil-prolil isomerasas, una familia de enzimas que complejo de Golgi. Los mecanismos destinados a retener las proteínas
-,)13ción alrededor de los enlaces peptidil-prolil en los resi­ no plegadas o plegadas de modo incompleto dentro del RE, probable­
- -..tina en segmentos no plegados de un polipéptido: mente, incrementen la eficiencia global del plegamiento al mantener
formas intermedias en la vecindad de los catalizadores de plegamiento,
que son más abundantes en el RE. Las proteínas inadecuadamente ple­
"
O", /NH gadas retenidas dentro del RE, por lo general, se encuentran unidas a
C" las chaperonas BiP y a la calnexina . De este modo, estos catalizadores
O HC- CH 2 O HC 2-CH 2 del plegamiento luminal desempeñan dos funciones relacionadas: ayu­
"'~ I " ~ '" I Prolil
/.,S-.N CH 2 ~ / C-N / CH 2 dar al plegamiento de las proteínas normales, evitando su agregación, y
' CH 2 'CH unirse a las proteínas mal plegadas para retenerlas en el RE.
Prolil I Tanto las células de mamífero como las levaduras responden a la
,1C
O{/ " NH presencia de proteínas no plegadas en el RE rugoso con el aumento
de la transcripción de varios genes que codifican chaperonas del RE
cis trans " y otros catalizadores del plegamiento. Un participante clave en esta
respuesta a la proteína no plegada es la Irel, una proteína de la mem­
Qcasiones, estas isomerizaciones constituyen el paso limitan­ brana del RE que se encuentra como monómero y como dímero. La
~.&lcidad en el plegamiento de los dominios proteicos. Muchas forma dimérica, no la monomérica, promueve la formación de Hacl,
''''' ~olil isomerasas pueden catalizar la rotación de enlaces ex­ un factor de transcripción de las levaduras que activa la expresión de
~ :ptidil-prolil indiscriminadamente en numerosas proteínas, los genes, inducida en respuesta a la proteína no plegada. Como se
tienen sustratos proteicos muy específicos. muestra en la Figura J3-2 1, la unión de la BiP al dominio luminal de
. . n antes proteínas secretoras solubles y de membrana, sinte­ la Ire I monomérica evita la formación del dímero Ire 1. Así, la can­
_ ~ el RE, están construidas por dos o más subunidades poli­ tidad de BiP libre en la luz del RE determina la proporción relativa
._ En todos los casos, el ensamblaje de las subunidades que de Ire I monomérica y dimérica. La acumulación de proteínas no
En estas proteínas de múltiples subunidades (multiméricas) plegadas dentro de la luz del RE secuestra las moléculas de BiP y las
~:? en el RE. Una clase importante de proteínas multiméri­ torna no disponibles para su unión al Irel. Como resultado, aumen­
, -Jdas son las inmunoglobulinas, que contienen dos cadenas tan los niveles de la Ire I dimérica, lo que conduce a un incremento
:-í ) y dos cadenas ligeras (L) , todas unidas mediante enlaces en el nivel de Hacl y de la producción de proteínas que ayudan el
_ntracatenarios. La HA es otra proteína multimérica que plegamiento proteico.
na un buen ejemplo de plegamiento y ensamblaje de subu­ Las células de mamífero contienen una vía regulatoria adicional
"?ase la Fig. 13 - 20 ). Esta proteína trimérica forma las espigas que opera en respuesta a las proteínas no plegadas en el RE. En esta
_,~ ien de la superficie de la partícula del virus de la influenza. vía, la acumulación de proteínas no plegadas en el RE desencadena
HA se forma dentro del RE de una célula huésped infecta­ la proteólisis de la ATF6, una proteína transmembrana de la mem­
-:.ir de tres copias de un precursor de la proteína, denominado brana del RE, en un sitio dentro del segmento que está inserto en la
_c ?osee una sola hélice a. que se inserta en la membrana. En membrana. El dominio citosólico de ATF6, liberado por proteólisis,
de Golgi, cada una de las tres proteínas HAo es escindida se desplaza luego hacia el núcleo, donde estimula la transcripción de
-, ar dos polipéptidos, HA¡ y HA,: así, cada molécula HA que los genes que codifican las chaperonas RE, La activación de un factor
-~~ se encuentra en la superficie del virus contiene tres copias de transcripción por medio de esta proteólisis regulada intramembra­
. ~r es de HA, (véase la Fig. 3-10). El trímero está estabilizado na se produce también en la vía de señalización Notch y durante la
: cciones entre los dominios exoplasmáticos grandes de los activación del factor de transcripción SREBP en respuesta al coleste­
. Jos constituyentes, que se extienden hacia el interior de la rol (véanse las Figs 16- .,5 y ló-37) .
:' t; después de que la HA se ha transportado a la superfi­
.T. estos dominios se extienden hacia el espacio extracelu­ Una forma hereditaria de enfisema ilustra los efectos dañinos que
:-:!eracciones entre las porciones citosólicas más pequeñas pueden resultar del plegamiento inadecuado de las proteínas en
-~io nes integradas a la membrana de las sub unidades de la el RE. Esta enfermedad es provocada por una mutación puntual en la
-: ;én ayudan a estabilizar la proteína trimérica. Los estudios antitripsina (XI' que normalmente es secretada por los hepatocitos y los

13.3 Modificaciones, plegamiento y control de calidad de las proteínas en el RE 599


FIGURA 13-21 la respuesta de proteína no plegada. La Irel . una pro­ Factor de
teína transmembrana de la membrana del RE. tiene un sitio de unión para transcripción
la BiP en su dominio lu minal; el do ¡nío citosólico contie ne una endonu­ El ~ Hac1
cleasa de RN A específica. Paso iI: la acumulación de pro eínas no plegadas mRNA Hac1 (Traducción
en la luz del RE une moléculas BiP lo que las libera de la Ire 1 monomérica.
cortado y '" j
La dimerización de la Ire l genera, entonces, su actividad de endonucleasa.
empalmado "--"""" ~EI

"dO,"d"'~\
Pasos 111, 1!1: el prec'u rsor de mRNA, no segme ntado ni e mpa lmado, que
codifica el factor de transcripción Hac l es eSCindido por la Ire l dimérica, y
los dos exones son unidos para formar un mRNA fu ncional de Hac l . La evi­
dencia actual indica que este procesamienlo sucede en el citoso l, aunque mRNA d, H"l oort,do pO'
el procesamiento del pre-mRNA generalmente se produzca en el núcleo.
Paso ril: el Hacl se traduce a la proteína Hacl , q ue luego vuel ve al núcleo mRNA Hac1 sin
'-/
y activa la transcripción de los genes que codifi can varios ca talizadores de l cortar ni empalmar~
plegamiento de las proteínas. (W" . U R,.egsegger ., dI., 2C·Y. ( , 11 107:1 3, ~ 3~'tO' ol"!
coll.. 2000, Nor. e.rre,ol 2'326 y C. Sldrauski y P. W.;ter. 1997, Ce1/ 90.1 0jl ; Monómero
Ire1

Citosol

r
macrófagos. La proteína silvestre se une a la tripsina, a la que inhibe, y Luz Dímero Ire1
también a la proteasa sanguínea elastasa. En ausencia de antitripsina del RE D
a, ,la elastasa degrada el tejido fino del pulmón que participa en la ab­
sorción del oxígeno, lo que produce finalmente los síntomas del enfise­ BiP C3'
G
SL
ma. Si bien la antitripsina <Xl mutante es sintetizada en el RE rugoso, no
se pliega adecuadamente y forma un agregado casi cristalino que no se
exporta desde el RE. En los hepatocitos, la secreción de otras proteínas
Proteínas no plegadas Proteínas no plegadas
también se ve afectada, a medida que el RE rugoso se va llenando con la con BiP unida
antitripsina a, agregada . •

Las proteínas no ensambladas o mal plegadas del


RE con frecuencia son transportadas hacia el citosol
de hidratos de carbono N-ligadas por las a-manosidasa 1 se prod
para su degradación
lentamente, de modo tal que solo las glucoproteínas que perman e: ~­
Las proteínas solubles secretoras y las proteínas de membrana, así mal plegadas en la luz del RE durante un período lo suficiente me::.:..:
como las subunidades no ensambladas de las proteínas multiméricas, prolongado son recortadas y, por lo tanto, direccionadas para su deg:r-:.­
con frecuencia se degradan en un lapso de aproximadamente una hora dación. Las proteínas luminales que carecen de cadenas de hidrato: :­
o dos, después de su síntesis en el RE rugoso. Durante muchos años, los carbono también pueden ser direccionadas para su degradación, lo _'
investigadores consideraron que las enzimas proteoUticas presentes en indica que deben existir, además, otros procesos para el reconoci mi.o::-·
la luz del RE catalizaban la degradación de los polipéptidos mal ple­ de las proteínas no plegadas. Otros mecanismos destinados a rec
gados o no ensamblados, pero estas proteasas nunca fueron halladas. cer proteínas no plegadas que no involucran el recorte de cade!l6ó : ;
Estudios más recientes han mostrado que las proteínas de secreción hidratos de carbono N-ligados deberían existir porque las proteína<, :...
mal plegadas son reconocidas por proteínas de membrana específicas membrana que carecen de cadenas de hidratos de carbono N-liga . ;.,
del RE y son direccionadas para su transporte desde la luz del RE hacia otra manera, no podrían ser direccionadas para su degradación,
el citosol, en un proceso conocido como dislocación. Una vez que una proteína no plegada ha sido identificada, es ¿.~ ~.
La dislocación de las proteínas mal plegadas al exterior del RE de­ cionada para la dislocación a través de la membrana del RE. De t .
pende de un conjunto de proteínas localizadas en la membrana de éste y ber algún tipo de canal para la dislocación de las proteínas mal pI...:
en el citosol, que llevan a cabo tres funciones básicas. La primera de éstas a través de la membrana del RE, y existe un complejo de, al menos :-.­
es el reconocimiento de las proteínas mal plegadas que serán sustra­ tro proteínas integrales de la membrana, conocido como el COl-:-.:
tos para la reacción de dislocación. Un mecanismo de reconocimiento ERAD (degradación asociada al RE). La estructura del canal d ~ ­
implica el recorte de las cadenas de hidrato de carbono N-ligadas por cación y el mecanismo por el cual las proteínas mal plegadas atrz'
la enzima <x-manosidasa 1 ([ig. 13-22 ). Los glucanos recortados de la la membrana del RE aún no se conocen.
estructura Man 8 (GlcNAc), son reconocidos por la proteína lectinoide A medida que segmentos del polipéptido dislocado son ex-r .:.
conocida como EDEM, y los glucanos que adicionalmente se recortan a al citosol, éstos encuentran enzimas citosólicas que impulsa n i-­
Man,( GlcNAc), son reconocidos por la proteína lectinoide 05-9. Tanto locación. Una de estas enzimas es una ATPasa denominada --;: -­
la EDEM como la 05-9 direccionan la glucoproteína recortada hacia miembro de una familia de proteínas conocida como la fa.mi:.­
el complejo de dislocación para su degradación. Se desconoce el me­ ATPasa AAA, que acopla la energía de la hidrólisis del ATP al ~ =
canismo preciso por el cual la a-manosidasa 1 distingue proteínas que samblaje de los complejos proteicos. En la retrotranslocación : ~­
no pueden plegarse adecuadamente y, de este modo, son legítimos sus­ lisis del ATP por la p97 puede proporcio nar la fuerza impuls..:: _
tratos para el proceso de dislocación, durante el cual presentan estados dirigir las proteínas mal plegadas desde la membrana del RE '-­
transitorios parcialmente plegados hasta que adquieren su conforma­ citosol. A medida que las proteínas mal plegadas reingresan e:-. _
ción completamente plegada. Es probable que el recorte de las cadenas sol, enzimas que son ligasas de ubicuitina -específicas de la m:- '

600 CAPITULO 13 • El movimiento de proteínas en membranas y orgánulos


FIGURA EXPERIMENTAL 13-23 Importación

~
e
de las proteínas precursoras mitocondriales

~~
~ Tripsina
c~: ensayada en un sistema libre de células. Los
precursores de las prote ínas mitocondriales con
señales de captación-direccionamiento unidas
~ "- • @ eJ.'" '" pueden ser sintetizada s en ribosomas en una reac­

"
='Ina . ~ Adición de
c;ón libre de células. Cuando las mitocondrias que
. - ::ondrtal _ ~ mitocondrias de

~
levaduras
energizadas ~ c{}: están respirando se ag regan a los precursores de
las proteínas mitocondriales (arriba), las proteínas
son cap tadas por las mitocondrias. Dentro de estos
organulos, las proteínas son protegidas de la ac­
"'roteínas mitocondriales Proteínas captadas por las Proteínas ción de las proteasas, como la tripsina. Cuando no
d e las levaduras sintetizadas mitocondrias; eliminación y secuestradas
hay rnitocondrias presentes (abajo), las proteínas
por los ribosomas citoplasmáticos degradación de la secuencia dentro de las
i;n sistema libre de células de direccionamiento de la mitocondrias, mitocondr iales se degradan, al agregar proteasa. La
captación resistentes a la captación proteica se produce solo con mito­
tripsina condrias energizadas (que están respirando), que
tienen un gradiente electroquímico de protones
• C • e (fu erza protomotriz), a través de la membrana
in terna. La proteína im portada debe contener una
Tripsina ..
.,
C'
~
.c
e
. sec ue ncia captación-direccionamiento adecuada .
. ,,' c _ La captación requiere también ATP y un extracto
tc. •• • - c. cltosólico que contenga proteínas chaperonas
Secuencia de e oC que mantengan las proteínas precursoras en una
captación-direccionamiento · c· : c . i: conformación no plegada. Este ensayo ha sido
y degradación de las proteínas . e ':c empleado para estudiar secuencias de direccio­
mitocondriales .c: ' C na miento y otras características del proceso de
translocac ión.

acción secuencial de dos secuencias de direccionamiento y dos este efecto. Estos hallazgos indican que el carácter anfipático de las se­
po- ~ d e translocación unidos a la membrana: uno para dirigir la cuencias de direccionamiento hacia la matriz es crítica para su función.
, hacia el orgánulo y otro para dirigirla hacia el compartimento El ensayo libre de células que se resume en la FigLl ra J:>-13 ha sido
.- · r o a la membrana adecuada del orgánulo. Como veremos, los ampliamente utilizado en estudios destinados a definir los pasos bio­
-:)1 0 Spara seleccionar distintas proteínas para su envío hacia las qu ímicos de la importación de proteínas precursoras a la mitocondria.
-::.rias y los cloroplastos están relacionados con algunos de los En este sistema , las mitocondrias que están respirando (energizadas)
' :nos que analizamos con anterioridad . extraídas de las células pueden incorporar proteínas precursoras mi­
tocondrial es que llevan las secuencias de captación-direccionamiento
cuencias de señalización N-terminales adecuadas que han sido sintetizadas en ausencia de mitocondrias. La
~ticas dirigen las proteínas hacia la matriz incorporación exitosa de los precursores al orgánulo puede ser ensaya­
L;':"~nd ria l da por resistencia a la digestión mediante una proteasa agregada, como
la tripsina. En otros ensayos, la importación exitosa de una proteína
s proteínas que se desplazan desde el citosol hasta el mismo precursora puede mostrarse por la rotura adecuada de las secuencias
-rutocondrial tienen señales de direccionamiento que compar­ de direccionamiento N-terminales por proteasas mitocondriales espe­
'os en común, aunque las secuencias de señalización, por lo cíficas. La captación de las proteínas precursoras mitocondriales com­
~o son idénticas. De este modo, los receptores que reconocen pletas, presintetizadas por el orgánulo, en este sistema contrasta con la
,,:"'.al es son capaces de unir un número de secuencias diferentes, translocación cotrad uccionallibre de células de las proteínas secretoras
- .-"-d onadas. Las secuencias más ampliamente estudiadas para hacia el interior del RE, que se produce generalmente solo cuando las
zación de proteínas en las mitocondrias son las secuencias de membrana s microsomales (derivadas del RE) se encuentran presentes
:lI miento hacia la matriz. Estas secuencias, localizadas en el N­ durante la síntesis (véase la Fig. J3--i ).
. . habitualmente tienen 20-50 aminoácidos en su longitud. Son
~ minoácidos hidrófobos, aminoácidos básicos de carga posi­ La importación de las proteínas hacia la
~iniJ1a y lisina) y otros hidroxilados (serina y treonina ), pero mitocondria requiere receptores en la membrana
a carecer de residuos acídicos cargados negativamente (aspar­
externa y translocones en ambas membranas
: utamato).
J pone que las secuencias de direccionamiento hacia la matriz La Figur;1 13-2-1 presenta un panorama de la importación de una proteí­
- .:ocondria adquieren una conformación cx-heLicoidal en la cual na desde el citosol hasta la matriz de la mitocondria, la ruta dentro de la
o ácidos cargados positivamente predominan a un lado de la mitocondria seguida por la mayoría de las proteínas importadas. Anali­
los aminoácidos hidrófobos, del otro lado. Las secuencias de zaremos en detalle cada paso del transporte de proteínas hacia la matriz
-' . que contienen regiones hidrófobas e hidrófilas simultánea­ y consideraremos el modo en el que algunas proteínas, posteriormente,
conocen como antipáticas. Las mutaciones que alteran este son direccionadas hacia otros compartimentos de la mitocondria.
,"-- anfipático, en general, evitan que se direccionen hacia la ma­ Después de la slntesis en el citosol, los precursores solubles en las
- 'q ue muchas otras sustituciones de aminoácidos no provocan proteínas mitocondriales (incluso las proteínas integrales hidrófobas

13.4 Direccionamiento de las proteínas hacia las mitocondrias y los cloroplastos 603
FIGURA 13-24 Importación de proteínas a la coo
matriz de la mitocondria. Las proteínas precur­ Proteína
soras sintetizadas en los ribosomas citosólicos se precu rsora
mantienen en un estado no plegado o parc Ial­
mente plegado por chaperonas unidas, como la
Hsc70 (paso D). Después de que una proteína pre­
cursora se une a un receptor de im portación cerca
de un sitio de contacto con la membra na Interna
(paso fl), se transfiere al poro de importación Hsc70
general (paso~ . La proteína en translocac ión se ATP citosólica
desplaza, entonces, a través de este canal y de un
canal adyacente en la membrana interna (pasos ADP + Pi
rJ, 0). Nótese que la translocación se produce e n Secuencia de
raros "sitios de contacto"en los cual es s membra­ ----- direccionamiento
nas interna y externa parecen tocarse. La unión de

/.
hacia la matriz
la proteína de translocaciór¡ por la chapero a de la NH 3­
matriz Hsc70 y la posterior hidrólisis del ATP po la
Hsc70 ayuda a impulsar la im portación a la matriz

~/
Una vez que la secuencia de direccio na mien o de
la captación ha sido retirada por una oroteasa de
la matriz y la Hsc70 se ha li berado de la proteína
Receptor Poro de
recién importada (pa so cm, se pliega a la confor­ de importación fJ
mación madura, act iva dentro de la matriz (paso (Tom20/22)
fA). El plegamiento de algunas proteínas depende
de las chaperoninas de la matriz. {'Jéa¡."- Schatz. 19% Citosol
1. 8jo[ Chem. 271 :3 1763 'J ~J . Pf.arv"\ ~ ( '! c.c \.s 1 9~ 7 , Ar"l R::-/ Cel!
Devel B /. 13:2S)

Espacio
intermembranas

Hsc70
de la matriz
~w;.~ ;::9¡,'\.. ,~W;; 7íf' .~.
Procesa m-"
l Membrana interna " ~.,.,,­ de la ma ':
.cc('iX.c~tCi o-:Jj:r:. ·L'- por protea;.?
Matriz de la mitocondria
\
proteína~
actIva c.v Secuencia de
direccionamie-' :
segmentada

de la membrana) interactúan en forma directa con la membrana mito­ nales de direccionamiento hacia la matriz son reconocidas como Th:;- ~
condrial. En general, pueden importarse solo las proteínas no plegadas y Tomn. (Las proteínas que se encuentran en la membrana extem.: :
a la mitocondria. Las proteinas chaperonas, como la Hsc70 citosólica, la mitocondria, implicadas en el direccionamiento y la importació
mantienen las proteínas nacientes y recién sintetizadas en un estado denominan proteínas Tom, por su nombre en inglés, translocón el .
no plegado, de modo tal que pueden ser captadas por la mitocondria. membrana externa, translocon of the outer membrane.)
Este proceso requiere la hidrólisis de ATP. La importación de precurso­ Los receptores de importación, posteriormente, transfieren las r ­
res mitocondriales no plegados se inicia por la unión de una secuencia teinas precursoras a un canal de importación de la membrana ext __­
de direccionamiento hacia la mitocondria a un receptor de importación Este canal, compuesto principalmente por la proteína Tom40, se e ­
presente en la membrana externa de la mitocondria. Estos receptores se ce como poro de importación general porque todas las proteínas pfee~_­
identificaron, inicialmente, mediante experimentos en los cuales se mos­ soras de la mitocondria conocidas acceden a los compartimentos := :
traba que anticuerpos dirigidos contra proteínas específicas de la mem­ riores del orgánulo a través de este canal. Cuando la Tom40 se p w-: ­
brana externa de las mitocondrias inhibían la importación de proteínas e incorpora a liposomas, forma un canal que atraviesa la membr=
hacia mitocondrias aisladas. Experimentos genéticos posteriores, en los con un poro de la suficiente amplitud como para acomodar una c: '
cuales los genes para proteínas de las membranas eA1:ernas de las mito­ na polipeptídica no plegada . El poro de importación general forOl ;'! _ .
condrias específicas se encontraban mutados, mostraron que receptores canal, en gran medida pasivo, a través de la membrana externa de la ,
proteicos específicos eran los causantes de la importación de diferentes tocondria, y la fuerza impulsora para el transporte unidireccional h..:...
clases de proteínas mitocondriales. Por ejemplo, las secuencias N-termi­ el interior de la mitocondria proviene del interior de este orgán ula. =.

604 CAPITULO 13 • El movimiento de proteínas en membran as y orgánulos


.; .: ;os precursores destinados a la matriz mitocondrial, la trans­ Por ejemplo, los mutantes de las levaduras defectuosas en Hsc60, una
::. :ravés de la membrana externa se produce simultáneamente chaperonina de la matriz mitocondrial, pueden importar proteínas
-~D sferencia, a través de un canal de la membrana interna com­ de la matriz y segmentar la secuencia de captación-direccionam iento
:-or las proteínas Tim23 y Tim 17. (Tim proviene del nombre en normalmente, pero los polipéptidos importados no podrán plegarse ni
~ ~ translocón de la membrana interna, n'anslocón of the inner ensamblarse en las estructuras terciaria y cuaternaria nativas.
c!le.) La translocación al interior de la matriz se produce, de este
! ~! "sitios de contacto" en los que se encuentran muy próximas los estudios con proteínas quiméricas demuestran
_. :;.:¡ ~ana externa y la interna. características importantes de la importación
: 0 después de que la secuencia N-terminal de direccionamiento
mitocondrial
_:l1atriz de una proteína ingresa en la matriz de la mitocondria,
-:mada por una proteasa que reside dentro de la matriz. La pro­ Una evidencia notable de la capacidad de las secuencias de direcciona­
r-.ergente también es unida por la Hsc70 de la matriz, una cha­ miento hacia la matriz mitocondrial para dirigir la importación provino
- -: que se localiza en los canales de translocación de la membrana de las proteínas quiméricas producidas por técnicas de DNA recombi­
-:.: d e la mitocondria, por su interacción con la proteína trans­ nante. Por ejemplo, la secuencia de direccionamiento hacia la matriz de
:": ~ J!1 a Tim44. Esta interacción estimula la hidrólisis de ATP por la la deshidrogenasa alcohólica puede fusionarse con el extremo N-termi­
- ~e la matriz, y se cree que estas dos proteínas juntas impulsan la nal de la dihidrofolato reductasa (DHFR), que normalmente reside en el
~ac ión de las proteínas al interior de la matriz. citosol. En presencia de las chaperonas, que evitan que el segmento C­
-.!Zle de las proteínas importadas pueden plegarse a su conforma- termínal de la DHFR se pliegue en el citosol, los ensayos de translocación
- -'-;¡al activa sin ayuda posterior. El plegamiento final de numerosas libres de células muestran que la proteÚla quimérica se transporta hacia
""::,1s de la matriz requiere, sin embargo, una chaperonina. Como la matriz (foig. 13-2Sa). El inhibidor metotrexato, que se une estrecha­
~ ó en el Capítu lo 3, las proteínas chaperoninas fa cilitan acti­ mente al sitio activo de la DHFR y estabiliza en gran medida su confor­
~ : e el plegamiento proteico, en un proceso dependiente de ATP. mación plegada, hace que la proteína quimérica se torne resistente al des-

coa (b) Inhibidor (e)

/
DHFR
no plegada
";('0 · Citosol
~

( plegada

Intermediario de
DHFR la translocación
Matriz
mitocondrial
Secuencia de
direccionamiento O,21J.m
segmentada

. 'U\ EXPERIMENTAL 13-25 Experimentos con proteínas quiméricas tO, la translocación se bloquea. Si la secuencia espaciadora tiene la longitud
iten dilucidar la importación de proteínas a las mitocondrias. Estos sufi cien te como pa ra ex tenderse a través de ambos canales de transporte,
-­ '":l entos muestran que una sola secuencia direccionadora a la matriz se genera un in termediario de translocación estable, se escinde la secuencia_
¿ a s proteínas hacia la matriz de la mitocondria y que solo las proteínas direccionadora, generad a en presenc ia de metotrexato, como se muestra aquí
=-:¡.adas son translocadas a través de ambas me mbranas. La proteína qui­ (cl El extremo C-terrnin al del intermediari o de translocación en (b) puede de­
-" de estos experimentos contiene una seña lde direccionami en to hacia la tectarse al in cubar las mitocon drlas con anti cuerpos que se unen al segmento
L en su extremo N-terminal (rojo), seg uida de una secuencia espac ia oora OHFR, seg uid o por partículas de oro cubiertas con la proteína bacteriana A,
'n.:iÓn particular (negro) y lu ego, por la dihidrofol ato reductasa (DHm), que se une de rnodo no especííico a noléculas de anticuerpo (véase la nq.
~~2i ma normalmente presente solo en el citosol. (a) Cuar1do el seg mento ~ : ~). Una fotornicrografía elew ónica de un corte muestra partículas de oro
= JHFR se despliega, la proteína quimérica se desplaza a través de ambas (pu nta de flecha roja) unida al intermediario de translocación, en un sitio de
_.:cranas hacia la matriz de la mitocondria energizada, y la seña lde direc­ contacto entre las meMbranas externa e interna. Son evidentes, también, otros
-.:.cniento hacia la matriz se elimina. (b) Cuando el extremo C-termina lde la siti os de contaCto (fl echas negras). (la; panes [a! y lb! ada p.adasde J. Rassow y cols.. 1990,
. ~ na quimérica queda fijo en el estado plegado por la uniÓn del metotrexa­ =¿.B5 _eu 27S : ~ ~) L3 P¿!( : ~ {e} de M. $ch'::€ ger y ccls., 1987,) CeU Hio/. 105:235. cortesia de W. NeupeH.)

13.4 Direccionamiento de las proteínas hacia las mitocondrias y los cloroplastos 605
-­ , Se cree que las repeticiones FG hidrófobas se presentan en programadas mediante ingeniería genética, en los cuales esta secuen­
_H adenas polipeptídicas extendidas, por lo demás hidrófilas, cia se fusionó con una proteína citosólica , demostraron que esta dirige
-, ~l centro del canal transportador. Las nucleoporinas FG son el transporte hacia el interior del núcleo y, en consecuencia, funciona
para la función del CPN; sin embargo, el CPN sigue siendo como una SLN, Posteriormente, las secuencias SLN se identificaron en
aún si hasta la mitad de las repeticiones FG han sido dele­ muchas otras proteínas incorporadas al núcleo. Muchas de éstas son
-e considera que las nucleoporinas FG forman una matriz similares a la SLN básica del an tígeno T grande del SV40, mientras que
l1exible, con propiedades generales que permiten la difusión otras SLN son bastante diferentes, desde el punto de vista químico. Por
::-~la s pequeñas y excluyen las proteínas hidrófilas no chapero­ ejemplo, una SLN en la proteína que une RNA, hnRNP Al, es hidrófo­
_:- r riores a 40 kDa (véase la fig. 13-330). ba. De modo que debe haber múltiples mecanismos para el reconoci­
miento de estas secuencias tan distintas,
....eptores de transporte nuclear escoltan a las Los trabajos iniciales sobre el mecanismo de importación nuclear
'-=:emas que contienen señales de localización mostraron que las proteínas que contienen una SLN básica, similar a
~¡;¡:¡r hacia el interior del núcleo la presente en el antígeno T grande de SV40, serán transportadas con
eficiencia hacia los núcleos aislados, siempre que se les proporcione
,;-m as que se encuentran en el núcleo -como las histonas, los un extracto citosólico CFig, 13-35), Empleando este sistema de ensayo,
~e transcripción y las DNA y RNA polimerasas- se sintetizan los investigadores purificaron dos compo nentes citosólicos requeridos:
. plasma y se incorporan en el interior del núcleo a través de Ran y un receptor del transportador nuclear. La Ran es una proteína
- _s: de poro nucleares. Estas proteínas contienen una señal de
: .--:611 nuclear (SLN) que dirige su transporte selectivo hacia el
(a) Efecto de la digitonina
':"as SLN fueron descubiertas mediante el análisis de mutantes
_. ?ara el antígeno T grande, localizado en el virus 40 de los si­
-40). La forma silvestre del antígeno T grande está localizada
- _-:leo de la s células infectadas por virus, mientras que algunas
::lutadas del antígeno T grande se acumulan en el citoplasma
-01 ). Todas las mutaciones causantes de esta localización celular
, se producen en una secuencia específica de 7 residuos, rica
- oácidos básicos, cercana al extremo C-terminal de la proteína:
'3 -Lys -Lys-Arg-Lys-Val. Los experimentos con proteínas híbridas

(b)
- Digitonina + Digitonina

. ' (b) Importación nuclear por células permeabilizadas

O
- Lisado + Lisado

FIGURA EXPERIMENTAL 13-35 Se requieren proteínas citosólicas para


el transporte hacia el núcleo. El fracaso del transporte nuclear en células
'A EXPERIMENTAL 13-34 l a señal de localización nuclear (SlN) cultivadas. pe rmea bilizadas en ausencia de un lisado, demuestra el compromi­
las proteínas hacia el núcleo de la célula. Las proteínas citoplas­ so de componentes citosóli cos solubles en el proceso, (a) Fotomicrografías de
,;S pueden ser dirigidas hacia el núcleo cuando se han fus ionado a una contraste de fase de células HeLa no tra tadas y permeabilizadas con digitonina,
¿ loca lización nuclear. (a) La piru vato cinasa normal. vista por ¡nmu­ E! tratamiento de las monocapas de células cultivadas con el detergente suave
~sce ncia después de que las célu las en cu ltivo ha n sido tratadas con no iónico digitonina permeabiliza la membra na plasmática. de modo tal que
";:uerpo específico (amarill o). se loca liza en el Citoplasma, Esta proteína los consrituyentes citosólicos se pierden. pero permite que la envoltura nuclear
: o muy grande actúa en el metabolismo de los hidratos de carbono, y el CPN pe rmanezca n intactos, (b) Fotomicrografías de fl uorescencia de las
~n do se expresó una pir uva to cinasa quimérica que conten ía la SLI--J del células HeLa pe rmeabll izadas con digitonina. incubadas con una proteína
7'l su extremo N-terminal en las células. se localizó en el núc leo. La pro- fluorescente aco plada químicamente al péptido SLN contra el antígeno Tdel
e 1ui mérica se expresó a partir de un gen transfectado mediante ingen iería SV40 sintético, en presencia y ausencia de citosol (Iisado), La acumulación de
~- t<l. producido al fusionar un fragmento génico vira l que cod ificaba SLN esta sustancia de tran sporte en el núcl eo solo se produce cuando el citosol
.::o al gen de piruvato cinasa. (To'naao de D, K,lderon ywl,,, 1984,(eI/39:499, COHesfa se incluye en la incu bación (derecho) , (jamado de S. Adam ycols, 1990, ), ( 0118;01.111807,
corteii-a .:3e Dr Laf ry Gerac.eJ

13,6 Transporte hacia el interior y el exterior del núcleo 617


FIGURA 13-36Importadón nuclear. Meca nismo Ran·GDP Ran·GTP Importina Carga
para la importación nuclear de proteínas "carga'~ En el
citoplasma (arriba), un receptor de transpor te nu clear Ca)
o
G
T
libre (importina) se un e a la SLN de una proteína p p
::
carga y forma un complejo de carga bi moiecula r. El
complejo de carga difunde a través del CPN media nte
la interacción trans itoria con las nucleoporinas FG.
En el nucleoplasma, la Ran·GTP se une a la impor ina,
lo que produce un cam bi o de conformación que
w o
P

dism inuye su afi nidad por la SL y libera la carga. Para


dar sustento a otro ciclo de Im portación, el complejo
Complejo
de carga ~GAP
exportina-Ran ·GTP se transporta nueva mente hacia
el citoplasma. Una proteína que acelera la GTPasa
(GAP), asociada con los fi la mentos ci toplasmáticos del
CPN, estimula la Ran para hidrolizar el GTP unido. Esto
genera un ca mbio de conformación que provoca la
disociación desde el receptor de transporte nuclea r, Citoplasma
que puede entonces iniciar otro ciclo de im portación .
La Ran·GDP vuelve al nucleoplasma, donde el factor CPN
de intercambio de guanina nucleótido (GEF) provoca
la liberación del GDP y la nueva unión de GTP Nucleoplasma
Nucleoporinas FG

fV'\ GEF
\.rcvl ~(~\l
~ GTP GDP

G monomérica, pequeña, que existe en conformaciones unidas a GTP ra de la GTPasa (Ran-GAP), que es un componente de los ~
o GDP (véase la Fig. 13-32 ). El receptor de transporte nuclear se une citoplasmáticos del CPN. Esto estimula la Ran para que hic-'
tanto a la SLN de una proteína carga que será transportada al interior GTP unido a GDP, lo que produce la conversión a una coni ­
del núcleo como a las repeticiones FG de las nucleoporinas. Mediante con baja afinidad por el receptor de transporte nuclear, de :-, _
un proceso físico que aún no se conoce con certeza, uniéndose transi­ que el receptor de transporte nuclear libre se libera al citopla S-.~ _
toriamente a las repeticiones FG, los receptores de transporte nuclear de puede participar de otro ciclo de importación. El Ran · G D~
tienen la capacidad de atravesar con rapidez la matriz que contiene las plaza nuevamente a través de! poro hacia el nucleoplasma, d.
repeticiones FG en el canal central del poro nuclear, mientras que las encuentra con un fador de intercambio-guanina nucle6tido (
proteínas de tamaño similar que carecen de esta propiedad son exclui­ que hace que la Ran libere su GDP unido en favor del GTP. El ._
das del canal central. Los receptores de transporte nuclear pueden ser neto de esta serie de reacciones es el acoplamiento de la hidT\:
monoméricos, con un solo polipéptido que puede unirse tanto a las GTP a la transferencia de una proteína que lleva SLN desde el .
SLN como a las repeticiones FG, o diméricos, con una subunidad que ma hacia el interior del núcleo y proporciona, de este modo, u­
se une a las SLN, y la otra a las repeticiones FG. conductora para el transporte nuclear.
El mecanismo de importación de proteínas carga citoplasmáti­ Aunque el complejo receptor de transporte nuclear-car _
cas, mediado por un receptor de importación nuclear, se muestra en plaza a través del poro por difusión al azar, el proceso cotr~
la Figu ra 13-36. Receptores libres de transporte nuclear, presentes en transporte de la carga hacia el interior del núcleo es unidi r. : :­
el citoplasma, se unen a sus SLN semejantes en una proteína carga y Dada la rápida disociación del complejo de importación cuar _ .
forman un complejo importina-carga. Luego, el complejo de carga se al nucleoplasma, hay un gradiente de concentración del re _;
transloca a través del canal de l CPN cuando el receptor de transporte trans porte n uelear-carga a través del CPN: elevado en el cit :
nuclear interactúa con las repeticiones FG. El complejo carga rápida­ donde el complejo se ensambla, y bajo en el nucleoplasma,
mente llega al nucleoplasma y, allí, el receptor del transportador nuclear disocia. El gradiente de concentración es causante de la r: ~ _
interactúa con Ran·GTP, lo que provoca un cambio de conformación unidireccional de la importación nuclear. Un gradiente de ­
en el receptor del transportador nuclear que desplaza la SLN y libera la tración similar impulsa el receptor de transporte nuclear dt ­
proteína carga al nucleoplasma. El complejo receptor de transportador nuevamente al citoplasma. La concentración del complejo rcCtt'
nuclear-Ran·GTP difunde nuevamente a través del CPN. Una vez que transporte nuclear-Ran·GTP es más elevada en el nucleoplas ~
e! complejo receptor del transportador nuclear-Ran·GTP llega alIado se ensambla, que en el lado cito plasmático del CPN, donde ~ .:
citoplasmático del CPN, la Ran interactúa con una proteína activado- Finalmente, la dirección del proceso de transporte depende de

618 CAPITULO 13 • El movimiento de proteínas en membranas y orgánulos


- asimétrica de la Ran-GEF y de la Ran-GAP. La Ran-GEF del nu­ rencia, los dos procesos de transporte son notablemente similares.
5ma mantiene la Ran en el estado Ran·GTP, en el que promueve En ambos, la asociación de un receptor de transporte nuclear con
:iJción del complejo carga. La Ran-GAP del lado citoplasmático Ran·GTP en el nucleoplasma provoca un cambio de conformación
- convierte Ran·GTP en Ran·GDP, por disociación el receptor que afecta su afinidad por la señal de transporte. Durante la impor­
;:.:.porte nuclear-Ran·GTP y liberación del receptor de transporte tación, la interacción provoca la liberación de la carga; durante la ex­
-. hacia el ci tosol. portación, la interacción promueve la asociación con ésta. Tanto en la
exportación como en la importación, la estimulación de la hidrólisis
Ran·GTP en el citoplasma, por el Ran-GAP, produce un cambio de
5egu ndo tipo de receptores de transporte conformación en la Ran que libera el receptor de sei'íal de transporte.
ear escoltan las proteínas que contienen En el transcurso de la exportación nuclear, la carga también se libera.
La localización de la Ran-GAP y Ran-GEF en el citoplasma y el nú­
- les nucleares de exportación hacia el exterior
cleo, respectivamente, constituye la base del transporte unidireccio­
úcleo
nal de proteínas de carga a través del CPN.
'!Z3 un mecanismo muy semejante para exportar proteínas, De un modo paralelo con su similitud de función, ambos tipos
;ubunidades ribosómicas desde el núcleo hacia el citoplasma. de receptores de transporte nuclear son homólogos en secuencia y
-¡en te, este mecanismo fue descubierto en estudios de com­ estructura. La familia de receptores de transporte nuclear tiene 14
~u cleicos ribonucleares que "se trasladan" entre el núcleo y miembros en las levaduras y más de 20, en las células de mamífero.
: :Llsma. Estas proteínas "de traslado" contienen una señal de Las SEN o SLN, a las cuales se unen, han sido determinadas solo para
_:lón nuclear (SEN) que estimula su exportación desde el nú­ una parte del proceso. Algunos receptores de transporte nuclear fun­
_.:i a el citoplasma a través de los poros nucleares, además de cionan tanto en la importación como en la exportación.
; que es captada por el núcleo. Los experimentos con genes Un mecanismo de transporte similar se ha mostrado para la ex­
- ; . programados mediante ingeniería genética, que codifican portación de otras cargas desde el núcleo. Por ejemplo, la exportina-t
:-c ína restringida al núcleo, fusionada en varios segmentos de funciona para exportar los tRl\lA. La exportina-t se une a tRNA com­
:d na que transporta hacia el interior y el exterior del núcleo, pletamente procesado en un complejo con la Ran·GTP que difunde a
-'¿-']l itido identificar tres clases diferentes de SEN: una secuencia través del CPN y se disocia cuando interactúa con Ran-GAP en los fila­
~ l! c ina que se encuentra en el PKI (un inhibidor de la proteí­ mentos citoplasmáticos del CPN; esto produce la liberación del tRNA
A) yen la proteína Rev del virus de la inmunodeficiencia en el citosol. También se requiere un proceso dependiente de Ran para
_ VIH), así como dos secuencias identificadas en dos partí­ la exportación nuclear de las subunidades ribosómicas a través del
. ...)t)l1ucleoproteicas heterogéneas (hnRNP). Las características CPN, una vez que los componentes RNA y proteína se han ensamblado
..rales significativas, desde el punto de vista funcional, que de manera adecuada en el nucléolo. De modo similar, ciertos mRNA
: :.a n la exportación desde el núcleo aún son poco conocidas. específicos, que se asocian con proteínas hnRNP particulares, pueden
~ ~canismo por el cual las proteínas de traslado se exportan ser exportados por un mecanismo dependiente de Ran.
n úcleo se comprende mejor en los casos de aquellas que con­
:iEN rica en leucina. De acuerdo con el modelo actual, que
. ,..J'a en la FiglJl'3 13-37a, un receptor de transporte nuclear La mayoría de los mRNA se exportan desde el
- : J en el núcleo, denominado exportina 1, primero forma un
núcleo por un mecan ismo independiente de Ran
con la Ran·GTP; luego, se une a la SEN en una proteína
unión de la exportina I al Ran·GTP causa un cambio de Una vez que el procesamiento de un mRNA se ha completado en el
~--.ac ión en la exportina 1, que incrementa su afinidad por la núcleo, permanece asociado con proteínas específicas hnRNP en un
- :nodo tal que se forma un complejo carga trimolecular. Como complejo mensajero proteína ribonuclear o mRNP. El principal trans­
:o n otros receptores de transporte nuclear, la exportina I inte­ portador de mRNP hacia el exterior del núcleo es el exportador de
. -ansitoriamente con las repeticiones FG en las nucleoporinas rnRNP, una proteína heterodimérica compuesta por una subuni­
:1 de a través del CPN. El complejo de carga se disocia cuan- dad grande denominada factor 1 de exportación nuclear (F lXN) y
m tra el Ran-GAP en los filamentos citoplasmáticos del CPN, una subunidad pequeña, el transportador 1 de exportación nuclear
tim ula la Ran a hidrolizar el GTP unido, y produce a la Ran (TIXN). Múltiples dímeros FIXN/TlXN se unen a las mRNP nu­
,jo de conformación con baja afinidad por la exportina l. La cleares a través de interacciones cooperativas con el RNA y otras
- 1 I liberada cambia la conformación en una estructlJl'a que mRNP adaptadoras, que se asocian con los pre mRNA nacientes du­
,d afinidad por la SEN, lo que libera la carga en el cito sol. La rante la elongación de la transcripción y el procesamiento del pre
~¡ del proceso de exportación es impulsada por la disociación mRNA. En muchos aspectos, la FIXN/ TIXN actúa como un recep­
-",3 desde la exportina I hacia el citoplasma, lo que genera un tor de transportador nuclear que se une a una SLN o a una SEN, en
-:: de concentración desde el complejo de carga a través del el sentido en que ambas subunidades interactúan con los dominios
_~ es alta en el nucleoplasma y baja en el citoplasma. Luego, la FG de las nucleoporinas FG y les permiten difundir a través del canal
..:;..c. I Y la Ran·GDP se transportan nuevamente hacia el núcleo central del CPN .
~e un CPN. El proceso de exportación de las mRNP no requiere Ran; de este
-: parando este modelo de exportación nuclear con el de la Fi­ modo, para el transporte unidireccional de mRNA hacia el exterior
ó para la importación nuclear, podemos observar una di­ del núcleo, es necesaria una fuente de energía distinta de la hidrólisis
o bvia: la Ran·GTP es parte del complejo de carga durante del GTP por la Ran. Una vez que el complejo mRNP-FIXN/ TlXN
-:lC ión, pero no durante la importación. Fuera de esta dife­ llega a la cara citoplasmática del CPN, FIXN y TlXN se disocia de

13.6 Transporte hacia el interior y el exterior del núcleo 619

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