Plegamiento de proteínas in vivo

Elkin
Elkin Agudelo
Agudelo
Bioquímica
Bioquímica Avanzada
Avanzada
Indice
• ¿Por qué es importante el plegamiento?
• Proteínas chaperonas
• Función de las chaperonas en el ribosoma.
• El sistema Hsp70
• El sistema Hsp90
• Red de proteostasis
• PN como objetivo de medicinas
• Conclusiones.
 ¿Por qué es importante el
plegamiento?
• Funciones biológicas específicas
para la proteína.

• Acumulación de proteínas mal

plegadas hace que sean
potencialmente tóxicas.

• Una célula de mamífero típica

expresa entre 10k y 20k
proteínas diferentes.
• Evita el hacinamiento celular.
• La mayoría de estas proteínas
debe plegarse en estructura 3D
definida.
 Proteínas chaperonas
Las proteínas chaperonas son un conjunto de proteínas presentes en
todas las células, cuya función es la de ayudar al plegamiento de otras
proteínas recién formadas en la síntesis de proteínas.

Las chaperonas no llevan a cabo el plegamiento de las proteínas a su

conformación activa funcional. Se limitan únicamente a unirse a la
superficie hidrofóbica de las proteínas desdobladas o parcialmente
plegadas, para evitar de esta manera el plegamiento aberrante.

Son actores clave en la red de proteostasis celular y sirven para

mantener un proteoma equilibrado.

GroES/GroEL (Hsp10/Hsp60)
 Chaperonas moleculares
En la década de 1950 estudios proporcionaron información
fundamental sobre el plegamiento de proteínas, que mostró que las
proteínas pequeñas se repliegan espontáneamente in vitro al eliminar
el desnaturalizante.

Sin embargo, la evidencia comenzó a mostrar que ciertas proteínas

requieren asistencia de las chaperonas moleculares para plegarse in
vivo.

La formación de agregados tóxicos por proteínas metaestables está

asociada con la enfermedad de Alzheimer y Parkinson.

El plegamiento se basa en la cooperación de muchas interacciones

débiles y no covalentes e involucra contactos de aminoácidos
cercanos en secuencia y muy separados.
Chaperonas moleculares
El paisaje de energía libre hacia el estado nativo
termodinámicamente favorable a menudo es
accidentado, lo que significa que las moléculas
necesitan atravesar barreras de energía
sustanciales y, en consecuencia, poblar intermedios
plegables.
Chaperonas moleculares
Función de las chaperonas en el
ribosoma.
En bacterias, TF (trigger factor) se une a la
subunidad ribosómica grande en la apertura del
túnel de salida del polipéptido e interactúa con
las cadenas nacientes de la mayoría de las
proteínas> 100 aa de manera independiente de
ATP.

TF reduce la velocidad del plegamiento co-

traduccional pero aumenta el rendimiento de la
reacción de plegamiento. Para cadenas
nacientes más largas, TF coopera con el sistema
DnaK / DnaJ regulado por ATP.

En eucariotas, RAC y NAC pueden cumplir un

papel similar al de TF en el plegamiento de
proteínas. RAC en Saccharomyces cerevisiae y
otros hongos es un complejo de la chaperona
Hsp70 Ssz1 y la co-chaperona zuotina Hsp40
que se une al ribosoma (Hsp70L1 y Mpp11 en
mamíferos).
Función de las chaperonas en el
ribosoma.
El NAC modula la fidelidad de la partícula de
reconocimiento de señal (SRP) al dirigir las
proteínas al retículo endoplásmico.
Función de las chaperonas en el
ribosoma.
 El sistema Hsp70
Hsp70 (DnaK en bacterias) es una chaperona
alostérica paradigmática que se une a elementos
de secuencia de 5 a 7 aa que están enriquecidos
en residuos hidrofóbicos y generalmente están
expuestos por proteínas no nativas.

El ciclo de reacción de Hsp70 está íntimamente

regulado por las proteínas Hsp40 y los factores
de intercambio de nucleótidos (NEF).

Las co-chaperonas Hsp40 (DnaJ en bacterias,

conocidas conjuntamente como proteínas de
dominio J) funcionan al reconocer y transferir las
proteínas del sustrato a Hsp70 en el estado ATP,
en el que el enlazador hidrofóbico de
interdominios y la tapa helicoidal “a” del SBD
están asociados con el NBD, y el SBD está en
una conformación abierta.
 El sistema Hsp90
En eucariotas, Hsp90 admite no solo el
plegamiento de proteínas, sino también la
maduración conformacional y el mantenimiento
de una gama de proteínas de señalización
médicamente relevantes.

Debido a su participación en múltiples vías de

señalización, Hsp90 también juega un papel
evolutivo importante al amortiguar las
mutaciones desestabilizadoras en sus proteínas
cliente.

Después de la hidrólisis de ATP y la liberación de

nucleótidos, Hsp90 vuelve al estado abierto (Fig.
7B). Aunque el ATP aporta energía libre y
direccionalidad al ciclo conformacional Hsp90, el
paso limitante de la velocidad no es la hidrólisis
de ATP, sino la gran transición conformacional
del estado abierto al cerrado.
El sistema Hsp90

Investigaciones recientes sugieren que Hsp90

tiene una interfaz de unión al sustrato extendida
que cruza los límites del dominio y exhibe
especificidad por proteínas con residuos
hidrófobos expuestos, independientemente de si
están desordenadas, parcialmente plegadas o
casi nativas.

La interacción con Hsp90 puede estabilizar

selectivamente proteínas cliente metaestables
en su conformación activa.
Red de proteostasis
PN como objetivo de medicinas
Los mecanismos que promueven la proteostasis tienen el potencial de mantener proteínas mutantes en un
estado funcional, no agregado; envejecimiento lento y disminuir la incidencia de enfermedades relacionadas con
la edad en organismos modelo. Por lo tanto, aumentar la capacidad de PN puede ser beneficioso tanto en
enfermedades de pérdida de función como de ganancia de función tóxica del plegamiento de proteínas.

Por ejemplo, la inhibición de Hsp90 con moléculas que bloquean la unión de ATP previene la activación de
proteínas cliente que promueven el crecimiento tumoral y las dirige hacia la degradación.

Del mismo modo, la inhibición farmacológica de Hsp70 o sus interacciones cofactor puede interferir con el
plegamiento y promover la degradación de proteínas, definiendo una estrategia prometedora en el
tratamiento del cáncer y ciertas enfermedades neurodegenerativas.
• Conclusiones
• Desde la aparición del concepto de chaperona molecular hace más de
dos décadas, se ha logrado un progreso dramático hacia la
comprensión del plegamiento de proteínas in vivo y cómo las células
mantienen el equilibrio del proteoma.

• Desde una perspectiva mecanicista, no está claro cómo exactamente

los principales sistemas de chaperona dependientes de ATP (Hsp70,
Hsp90, chaperoninas) apoyan el plegamiento de proteínas.

• Será fascinante descubrir por qué la chaperonina eucariota TRiC puede

plegar proteínas, como la actina y las tubulinas, que la bacteria GroEL /
GroES no puede manejar.

• Se sabe poco sobre cómo los sistemas de chaperona responden al

aumento de la carga debido al estrés proteotóxico, y cómo las células
logran un equilibrio óptimo entre las diferentes actividades de
chaperona (por ejemplo, prevención de plegamiento versus retención y
agregación, o transferencia a la maquinaria de degradación)