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Bioenergética

Bionergética: Estudio de la transformación de la energía dentro de la célula

Metabolismo: Conjunto de procesos por los que la célula obtiene energía y el poder reductor a partir de su
entorno, oxidando compuestos, para luego sintetizar los componentes fundamentales de sus macromoléculas
utilizando esta energía y poder reductor.

Termodinámica
Un sistema termodinámico se define como la materia comprendida en la región de estudio. Por ejemplo una reacción
química de una vía metabólica.
El entorno es la materia del resto del universo.
Sistema+Entorno=Universo

Primera ley de la termodinámica: La energía en el universo es constante. No se crea ni se destruye, se


transforma.
Función de estado termodinámica: función que depende del estado inicial y final del proceso y no de como ocurre.
ΔH = Q - W

Segunda Ley de la termodinámica: El grado de desorden (entropía) del universo (sistema + entorno) siempre
tiende a aumentar.

Energía libre de Gibbs (G): energía capaz de realizar trabajo durante una reacción a P y T constante. (ΔG = joules/
mol)
ΔG negativo = reacción exergónica (libera energía) =Espontánea
ΔG positivo = reacción endergónica (consume energía) =No espontánea

ΔG = ΔH-TΔS
Entropía (S): desorden del sistema

Entalpía (H): Contenido calórico. Refleja número


y tipos de enlaces químicos del sistema
(reactivos y productos). No confundir con la
temperatura a la que transcurre la reacción

ΔH negativo: reacción exotérmica (libera calor)


Δ positivo: reacción endotérmica (consume calor)

Energía de reactivos menor


Energía de reactivos mayor que la Energía de reactivos igual que la
que la de productos: no
de productos: Espontánea. ΔG < 0 de productos: Equilibrio ΔG = 0
espontánea ΔG > 0
Las reacciones son reversibles, si están cercas del equilibrio.

La energía libre depende de la concentración de productos y reactivos

'
Varía dependiendo del -

dG= AGÓTRTINECILD]
sistema. Criterio de "
espontaneidad [ AJTB]

No depende del sistema. Definida en


condiciones estándar para cada reacción

Único término variable. Depende


de las concentraciones de
productos y reactivos

Variaciones de energía libre estandar (ΔǴ0): Determinada en condiciones de 1atm, 25ºc, [R]: 1M, [P]: 1M y pH: 7.
Estas condiciones nunca están presentes en la célula pero nos permite conocer otro criterio de la reacción que
estamos estudiando. Está directamente relacionada con el equilibrio de la reacción, la reversibilidad.

Equilibrio: Las reacciones continúan cambiando hasta llegar al equilibrio. A las concentraciones de P y R en el
equilibrio las velocidades de la reacción son iguales y no hay cambio neto.
Las concentraciones de productos y reactivos en el equilibrio definen Keq (constante de equilibrio).

[D]
'

ke :[ c)
"
a # BB > cctld
b
[ A) [B)

Cuando el sistema está en equilibrio ΔG es 0 así se despeja la variación de energía libre estándar

Cuando un sistema no está en Eq, la tendencia a desplazarse hacia el Eq representa una fuerza cuya magnitud se
puede expresar como el cambio de energía libre, determinada en condiciones estándar es el ΔǴ0.

ΔǴ0= -RTlnKeq

ΔǴ0 es una forma alternativa de expresar Keq.


Si los valores están cercanos a 1, podemos decir que la reacción está cerca del equilibrio, cuando está muy
alejado la reacción esta ocurriendo lejos del equilibrio.
Acoplamiento de las reacciones químicas

Si la célula fuera un sistema aislado, las reacciones químicas alcanzarían siempre el equilibrio, lo cual no sería bueno
ya que no habría energía libre para realizar el trabajo necesario para mantenerla viva.
Las células se mantienen alejadas del equilibrio manipulando las concentraciones de reactivos y productos para
mantener sus reacciones metabólicas en la dirección necesaria. Lo hace acoplando reacciones.

No espontánea. La glucolisis no continuaría


Ejemplo:

Al hidrolisarse el ATP libera energía,


esta reacción es espontanea y se
acopla con la anterior.

La reacción final es espontánea.


La glucosa usando ATP se puede
fosforilar.

La hidrólisis de ATP es una reacción muy exergónica

Esto se debe:
❊Disminución de la repulsión de cargas. Hay cuatro cargas
negativas ocupando un espacio muy acotado esto hace que
haya una gran repulsión de cargas dentro de la molécula lo
que lo hace muy inestable. Está favorecido la entrada de una
molécula de agua al último de los fosfatos para liberar fosfato
inorgánico y ADP.

❊ Estos productos pueden estabilizarse por resonancia. Las


cargas negativas del fosfato pueden compartirse entre los
cuatro oxígenos de este. Hace entonces que el ADP sea
mucho más estable que el ATP.

❊Ionización de los productos. A pH fisiológico esta favorecida


la liberación del protón al medio y por lo tanto favorece la
estabilización por resonancia de esas cargas negativas
resultantes.

Moléculas de alta energía: moléculas que sus enlaces fosfato covalentes tienen almacenada energía que se
libera cuando se hidrolizan.
Los enlaces fosfatos hacen que las moléculas sean inestables y que cuando se hidrolizan hacen que los productos
sean más estables, este proceso libera energía que es aprovechada en general por reacciones acopladas por otra
reacción que necesita energía para proceder en el sentido deseado.
Metabolismo

Se puede dividir en dos grupos de reacciones

Anabolismo: Son todas las reacciones químicas que requieren aporte de energía y poder reductor para la síntesis
de moléculas orgánicas complejas a partir de precursores sencillos. ΔG > 0. No va a ocurrir espontáneamente a
menos que se acople una reacción. La célula hace esto para sintetizar moléculas complejas a partir de precursores
sencillos (por ejemplo de aminoácidos formar proteínas).

Catabolismo: reacciones químicas que transforman combustibles en energía celular. ΔG < 0. Le sirve a la célula para
oxidar carbohidratos, grasas, proteínas en moléculas más sencillas, como CO2, agua y amoníaco. Ocurre un trabajo
útil, la obtención de energía a través de la oxidación de compuestos y hay liberación de calor. Forma ATP y poder
reductor.

El catabolismo son siempre vías convergentes a un intermediario, en anabolismo es divergente, de un compuesto


salen varios.

Ciclo de Krebs

Se alimenta a partir de una molécula de dos carbonos, el acetilCoA que puede provenir de la oxidación de los ácidos
grasos, de los glúcidos o de los aminoácidos.
El acetilCoA termina oxidándose completamente a CO2 y en las reacciones que forman parte del ciclo se forman
moléculas de poder reductor que luego van a entran en la fosforilación oxidativa y van a producir el ATP.
Por cada acetilCoA que entra al ciclo de Krebs, se dan 3NADH y un FADH2, también se forma una molécula de GTP.

ay
El ciclo comienza con la condensación aldólica entre el acetilCoA y el oxalacetato para formar primero un
intermediario, el citrilCoA, se hidroliza por agua y forma el citrato. El acetilCoA se reutiliza en la reacción de piruvato
deshidrogenasa. Es una reacción irreversible.

l
Luego, a partir de citrato se forma isocitrato por una simple isomerización, mediante la cual se cambia la posición del
grupo funcional. El isocitrato es la que permite el próximo paso. Es reversible.
Ocurre una decarboxilación oxidativa del isocitrato, el producto es el α-cetoglutarato que es una molécula de cinco
carbonos, se pierde el primero de los carbonos. Ocurre la primera formación de NADH.
La enzima requiere Mn+2 como cofactor y el α-cetoglutarato va a ser el sustrato de la siguiente enzima que es otra
reacción irreversible catalizada por α-cetoglutarato deshidrogenasa que es un complejo grande. Es la segunda
reacción de carboxilación oxidativa, se libera el segundo carbono, se forma otro NADH.

Las tres primeras reacciones son espontáneas.


En la tercera y cuarta se oxida un carbono y se reducen dos NAD+.

La 5 reacción consiste en la hidrolisis de succinilCoA, que fue uno de las moléculas de partida, en succinato. Esta
reacción es reversible, catalizada por siccinilCoA sintetasa, la energía acumulada en el enlace del succinilCoA es de
alta energía se usa para fosforilar un GDP o ADP en GTP o ATP (fosforilación a nivel del sustrato).
El succinato se transforma en fumarato por una deshidrogenación, por la succinatodeshidrogenasa la cual se
encuentra unida a la membrana interna de la mitocondria, esta enzima tiene un FAD unido covalentemente, se reduce
un FADH2 en esta reacción.
El fumarato se hidrata para formar el malato por la fumarasa y esta molécula de malato se vuelve a oxidar a
oxalacetato, esta reacción reduce un NAD a NADH.

La energía es solo espontánea en tres reacciones: las catalizadas por la citrato sintasa, por la isocitrato
deshidrogenasa, la α-cetoglutarato deshidrogenasa. Son los pasos regulados por regulación alosterica.

Regulación del ciclo de Krebs

Los moduladores de las enzimas alostéricas tienen efecto


cooperativo. (Moduladores negativos en rojo, positivos en
verde).
Los tres tienen en común que el ATP es un modulador
negativo, por lo que concentraciones muy altas de ATP
van a enlentecer el ciclo y cuando el ADP o Ca++ es alto
se favorece el ciclo.
Ciclo de Krebs es una vía anfibólica
Cuando hay carga energética baja funciona como vía catabólica y cuando es alta, como vía anabólica

Reacciones anapleróticas: Otros intermediarios hacen que vuelvan los intermediarios al ciclo de Krebs después
que estos hayan ido a la vía anabólica. Son importantes porque son las que hacen que el ciclo funcione
anfibólicamente.

El oxalacetato se puede regenerar a partir de piruvato por carboxilación y consumo de un ATP. Esta reacción está
catalizada por la piruvato carboxilasa. Importante en hígado y riñón.
También se puede formar oxalacetato a partir de el fosfoenolpiruvato que se fosforila por la fosforenolpiruvato
carboxiquinasa y consumo de GDP.
La Fosforenolpiruvato carboxilasa a partir de fosfoenolpiruvato + bicarbonato también peude formar oxalacetato

La enzima málica que carboxila piruvato usando NADPH y bicarbonato forma malato y NADP+
Fosforilación oxidativa

Es el proceso por el cual se acopla la oxidación de las moléculas combustibles con la síntestis de ATP
En eucariotes ocurre en la mitocondria
Este acoplamiento se produce por un gradiente de protones a través de la membrana mitocondrial interna
En la fosforilación oxidativa se utilizan el NADH y el FADH producidos en las vías catabolicas para reducir el O2 a agua.
Este proceso es muy exergonico. Se utiliza para sintetizar ATP.
Se produce un gradiente de protones, que se produce por el transporte de electrones desde el NADH y el FADH2 a
través de una serie de transportes acoplados a la mmi que genera un gradiente de protones hacia el lado externo de la
membrana que después va a canalizar la sintesis de ATP.

Una molécula oxidada puede tomar electrones del entorno y reducirse teniendo un potencial de reducción (capacidad
de tomar electrones) y por el contrario una sustancia reducida puede liberar electrones y oxidarse va a tener un
potencial de donor de electrones.

Fuerza impulsora del transporte de electrones que permite la formación del gradiente de protones y la
síntesis de ATP

El potencial de reducción es una función de estado, depende del estado inicial y el final.
Como el transporte de electrones va del NADH al O2, la energía que se pone en juego es el cambio del potencial de
reducción (Potencial de reducción del O2 - potencial de reducción del NADH). En este caso una diferencia de
potencial de 1,13 V entre el NADH y el O2 permite la formación del gradiente de protones y la síntesis de ATP.
Se pueden formar alrededor de 7,15 moléculas de ATP por cada NADH.

La cadena de transporte de electrones mitocondrial es un sistema de dadores y aceptores de electrones que funciona
en modo espontáneo hacia el aceptor final que es el oxígeno.

Compuestos intervinientes en la cadena transportadores de electrones

Todos los transportadores tienen hierro que se reduce de Fe3 a Fe2 y se oxida de Fe2 a Fe3 cada vez que recibe y
cede el electrón.
Anillo heterocíclico capaz de tomar
NAD+ electrones del medio y reducirse o liberarlo
al medio y oxidarse
FAD+

Encargado de
reducirse/
oxidarse

Siempre están unidos covalentemente a la


enzima que realiza la acción

Ubiquinona/ CoQ Citocromos


Centros Fe-S

Es un grupo hemo. Están unidos


covalentemente a las proteínas (grupos
celestes). El atomo de hierro se oxidan/
reducen

Transportador en la mmi, es
un lípido no es una proteína.

El NAD+ cuando se reduce transporta dos protón y dos electrones.


El FAD+ transporta dos protón y dos electrones
La UQ transporta dos protones y dos electrones
Los citocromos (todas las proteínas que tienen Fe) transportan solo un electrón

Todos estos transportadores se hallan organizados en complejos que se localizan en la membrana mitocondrial interna
Los complejos proteicos se ordenan en base a sus potenciales de reducción
Primeramente el NADH le cede los electrones producto de la oxidación del ciclo de Krebs al complejo I que está
formado por varias proteínas, este complejo se llama NADH Q oxidorreductasa, transporta los electrones
desde el NAD hacia la ubiquinona.
El segundo complejo, esta formado por la enzima succinato deshidrogenasa, es una enzima que tiene FAD
unido covalentemente, y el FADH le entrega los electrones a la ubiquinona.
La ubiquinona recibe los electrones del complejo I y II y en una serie de oxidaciones se produce la reducción de
la ubiquinona en su forma totalmente reducida a ubiquinol y le pasa esos electrones al complejo III.
El complejo II se llama Q citocromo C oxidorreductasa, este complejo, entrega los electrones al citocromo C,
proteína movil con porción hidrofóbica que está unida a la mmi, a la parte mas hidrofílica, al recibir los
electrones el citocromo C se mueve a través de la membrana y los entrega al complejo IV.
El complejo IV se llama Citocromo c oxidasa, aca comienza una serie de transporte entre diferentes proteínas
dentro del complejo hasta que finalmente son entregados al oxígeno que se reduce a agua.

Complejo I

Transfiere electrones desde el NADH a la Q.


Bombea 4 H+ hacia el espacio intermembrana desde la matriz mitocondrial.
Está formado por 42 cadenas polipetídicas, una cadena FMN unida covalentemente a una de estas proteínas y estas
proteínas contienen 6 centros ferrosulfurados (con hierro) esto permite que la ubiquinona se redusca y migre por la
membrana hasta el complejo III donde entrega los electrones.
Complejo II

Transfiere los electrones del FADH a la ubiquinona, no hay un bombeo neto de protones de la matriz al espacio
intermembrana.

Complejo III

Transfiere electrones desde la ubiquinona reducida al citocromo C oxidado. Bombea 4 H+ hacia el espacio
intermembrana en dos pasos de dos cada uno.

Complejo IV

Transfiere electrones desde el citocromo C reducido al O2. Bombea 4H+


Como se acopla el transporta de electrones con la síntesis de ATP

El gradiente de protones que se genera, es un gradiente químico, porque del espacio intermembrana se
acumulan protones y dentro de la matriz se acumulan oxhidrilos (OH-) a causa del bombeo de protones que
sale y eso genera un gradiente de carga. Con una carga positiva de un lado de la membra y otra negativa del
lado de la matriz mitocondral.

Hipótesis Quimio-Osmótica: La transferencia de electrones a través de la cadena respiratoria provoca el


bombeo de protones desde la matriz hacia el citosol a través de la mmi. El gradiente de pH y la diferencia de
potencial constituyen la fuerza proton-motriz que es utilizada para dirigir la sintetis de ATP. A través de la
ATPsintasa.

ATPsintasa
Es una proteína que tiene varias subunidades y está anclada a la membranta mitocondrial. Tiene una subunidad F0
anclada a la membrana y una F1 que está en la matriz mitocondrial.
La subunidad F0 es un canal de protones, los protones que se fueron acumulando en el espacio intermembrana por la
cadena transportadora de electrones, ahora van a empezar a volver a la matriz. El movimiento de protones a través de
la subunidad F0 hace que la enzima se vaya desplazado y hace que vaya cambiando la conformación de la subunidad
F1 y ese movimiento que tiene capacidad catalítica de fosforilación de ADP, genera el ATP. Más protones van a seguir
pasando cambiando la conformación de F1, permitiendo que el ATP formado y unido al sitio activo se libere.

La salida del ATP de la matriz mitocondrial al citosol está favorecida por un transportador de nucleotidos de adenina,
se compensa con la entrada de ADP, que va a ser el sustrato de la ATPsintasa en la matriz. Se equilibra la salida de ATP
(producto) de la matriz mitocondrial con la entrada de ADP (sustrato) desde el citosol).
También hay entrada de fosfato co-simporte con protones, ingresa el fosfato a la matriz.

Desacoplantes e inhibidores de la cadena transportadora de electrones

El funcionamiento de la CTE puede ser intervenido por sustancias desacoplantes o inhibitorias de origen endógeno o
exógeno con importantes consecuencias desde el punto de vista clínico.

Tipos de interferencias:
Inhibición de la transferencia electrónica (Cianuro, CO).
Inhibición de la ATPsintasa (Aurovertina, Oligomicina)
Desacoplamiento de la fosforilación y el transporte electrónico (FCCP, DNP)
Inhibición del intercambio ATP-ADP (Atractilósido)

Inhibidores de la CTE
Rotenona: Inhibe el transporte en el complejo I
Antimicina A: Inhiben el complejo III
Cianuro o CO: Inhiben complejo IV

Lo que ocurre es que el transporte eléctrico se va a deter porque no va a haber aceptores de electrones. Se detiene
la CTE, también el gradiente de H+ y trae aparejado una inhibición total de la síntesis de ATP.

Desacoplantes
Los protones van a volver a la matriz no por la ATPsintasa si no que van a volver por unos desacoplantes, por lo tanto
se disipa el gradiente de protones y se deja de formar ATP. EJ:Dinitrofenol.
Se pone en juego energía en el transportador pero no se aprovecha como trabajo útil, porque no se forma ATP. Se
disipa solo como calor.
La CTE funciona normalmente, no se detiene y como la célula censa que el ATP que se forma es bajo acelera el
metabolismo oxidativo, para generar más poder reductor. La CTE va a estar muy acelerada pero la ATPsintasa va a
estar inhibida.

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