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TEMA 1: INTRODUCCIÓN AL METABOLISMO

El metabolismo es un conjunto ordenado (ya que está muy regulado por muchas vías metabólicas y
estas deben estar ordenadas) de reacciones que se dan en el organismo.
Se puede regular vía enzimas, ya que tardarían mucho en ocurrir sin ellas (x cantidad...). Regulando
las enzimas conseguiremos regular las vías metabólicas. El metabolismo es algo integral, todas las
vías se dan de forma simultánea.

Vías metabólicas:
- Reacciones consecutivas en la mayoría, un metabolismo se transforma en otro y este en
otro y así
sucesivamente.
- Motores de las vías la variación de energía, el desplazamiento en el equilibrio de las rutas.
Las reacciones pueden ser de equilibrio, pero si la variación de E es negativa, quiere decir
que está muy desplazada; tira y hace que haya una corriente. Generalmente estas enzimas
que catalizan pasos con variación libre negativa son las que se regulan (por cantidad,
modificación covalente, modificación no covalente...). Los motores de una vía son aquellos
que tienen una energía libre negativa porque hace que se vean afectadas el resto de
reacciones.

Catabolismo: reacciones de degradación, suele ser oxidación, se libera energía, la cual podemos
almacenar en moléculas como ATP o con capacidad de poder reductor (NADPH). Degradación
molecular (oxidación).

Anabolismo: procesos de síntesis molecular, lo contrario al catabolismo, reducción y formación de


enlaces. A partir de moléculas pequeñas, obtener productos grandes, necesitando energía y poder
reductor obtenido a través del catabolismo.
Vías anapleróticas o anfibólicas: vías que funcionan de una forma transversal (no son catabólicas ni
anabólicas, ej: ciclo de Krebs). No tienen un balance neto ni anabólico ni catabólico

*Anabolismo y catabolismo es relativo porque puede estar degradado glucosas y sintetizando lípidos;
es decir, puede haber simultaneidad. Está todo mezclado por lo que es un sistema integral.

Los procesos de oxidación liberan energía, poder reductor... y en los procesos de síntesis se observa
lo contrario, a partir de moléculas más pequeñas formamos otras más grandes. Para ello
necesitamos energía y poder reductor porque formamos enlaces, no los rompemos. Es decir, lo que
hemos obtenido en los procesos de catabolismo los empleamos en los anabólicos.

TERMODINÁMICA DE LAS REACCIONES


Espontaneidad de las reacciones
La espontaneidad de una reacción viene dada por la variación de energía libre de la misma ( ∆G).

En una reacción aA +bB cC + dD, la ∆G = ∆Go + RT Ln[C]c [D]d/ [A]a [B]b


∆Go: variación de energía libre estándar de la reacción en condiciones estándar. La actividad a 25ºC
de las especies es 1 y 1 atmósfera de presión. En el equilibrio ∆G = 0.
Así , ∆Go = -RT ln Keq por lo que tenemos la relación entre la Keq y la variación de energía libre
estándar de una reacción.
Si nos fijamos en la variación de energía libre estándar se podrá decir si la reacción va a ocurrir o no:
- La variación de energía libre es negativa: será espontánea.
- La variación de energía libre es positiva: no será espontánea.
- Si es 0 se encuentra en equilibrio. No se desplazará o se desplazará a ambos lados de la
misma manera.
Es importante recordar que las enzimas no varían la energía libre de la reacción. Aunque no haya
enzima la reacción también ocurrirá, solo que más despacio porque con las enzimas aumenta la
velocidad.

En bioquímica se utilizan otras condiciones estándar:


- Se utilizan concentraciones en términos de molaridad (M) .
- Se utiliza el pH 7 como condición de referencia en lugar de pH =0 (1M H +).
- Siempre que el agua sea un reactivo o producto en un sistema acuoso su actividad se
considera la unidad aunque su concentración molar sea 55,5M.
- La actividad de las especies ionizables se expresa como la suma de ellas a pH 7. Así pues
se habla de ∆Go ́ por lo que ∆G para la reacción aA +bB cC + dD queda ∆G = ∆Go ́ + RT Ln
[C]c [D]d/[A]a [B]b

Condiciones de equilibrio y condiciones alejadas del equilibrio


En la reacción: aA+bB < — > cC+ dD
La variación de energía libre viene dada por ∆G = ∆Go ́ + RT Ln [C]c [D]d/[A]a [B]b

Las condiciones fisiológicas en las que se dan las reacciones no son necesariamente las de equilibrio
y el desplazamiento de la reacción depende , además de la variación de energía libre estándar de las
concentraciones de cada una de las especies que intervienen en el equilibrio.
Así hay reacciones con variaciones de energía libre estándar positivas pero que son posibles en las
condiciones fisiológicas al ser bajas las concentraciones de los “productos “ de la reacción.

Acoplamiento de la hidrólisis de ATP a procesos con variación de energía libre positiva


El ATP como moneda energética. Es una molécula con
enlaces ricos en energía. Tiene 3 enlaces fosfodiéster y cada
uno libera una energía negativa cuando se rompe. No todos
los enlaces liberan la misma energía, unos más que otros,
siendo el tercero el que menor energía libera, el 1o y 2o 7
kcal/mol y el 3o la mitad aproximadamente.

*La energía liberada en los procesos catabólicos se


almacenan en forma de ATP, otra parte también en NADPH
(con su poder reductor) y calor ya que es imposible
transformar toda la Ea liberada en trabajo, siempre hay una
degradación, una parte que se pierde en forma de calor: 2o
principio de la termodinámica).
Su síntesis está acoplada a la mayoría de procesos
endergónicos. Este ATP se podrá emplear para ceder energía
a determinados procesos, siendo la fuente de energía en la transferencia del grupo fosforilo al
sustrato o enzima más que en su hidrólisis. La variación de energía libre de este proceso es de -30·5
KJ/mol.
Otros compuestos que pueden almacenar energía aparte del ATP
1. Enol fosfatos:
EJ fosfoenol piruvato: cuando se hidroliza también libera energía libre

2. Acilfosfatos/ anhídridos mixtos: tenemos un grupo COOH unido a un grupo P y cuando se


rompe se libera Ea.

3. Fosfoguanidinas/fosfágenos
EJ fosfocreatina: suele estar en el músculo, es equivalente all ATP

REACCIONES REDOX
Reacción redox: intercambio de partículas entre dos sistemas (imp tener los dos sistemas). No hay
reacción si no hay dos sistemas, uno que suelta y otro da.
Por ejemplo, el hierro que no se oxidará si no hay oxígeno u otro elemento que actúe de oxidante.
Las reacciones de óxido-reducción permiten el intercambio de electrones entre sistemas. Son muy
importantes ya que hay un flujo de electrones en juego. En las reacciones redox siempre hay una
especie que se oxida y otra que se reduce, y ambas especies tienen un potencial (que mide en
voltios la afinidad que tiene el aceptor en un par redox).

¿Cómo sabemos cuál se oxidará o reducirá?


Debo fijarme en cual tiene el potencial más alto (O:+0.82) y es un oxidante (oxida), luego ya sabemos
que el que tiene el potencial más alto será el oxidante (cede) y el que lo tenga más bajo será el
reductor (coge).
Con esto podemos predecir en qué sentido de la reacción, el piruvato lactato como es el más positivo
irá en ese sentido, mientras que como el otro es más negativo, habrá que darle la vuelta. Al darle la
vuelta, cambió el signo de la E0.*El potencial que me dan es el de oxidación (por eso en las
reacciones de reducción le tengo que dar la vuelta).

RESUMEN IMPORTANTÍSIMO siempre que tengo un potencial de oxidación más positivo va de


oxidado a reducido mientras que el que tengo un potencial de oxidación más negativa, habrá que dar
la vuelta, irá de reducido a oxidado. El oxidante capta electrones, él mismo se reduce, oxida a otros,
mientras que el reductor suelta electrones, reduce a otros y él mismo se oxida.

El potencial redox está relacionado con la variación de energía libre estándar: ΔGo= -nFΔEo’
Siendo n = no electrones. F= cte. de Faraday (96’48KJ/mol o 23’06 Kcal/(mol·V)
La diferencia de potencial (Eo) se calcula como el potencial del oxidante con su signo + potencial del
reductor en signo contrario. También así potencial oxidante - potencial reductor. *El potencial más
positivo va tal y como me lo dan (de oxidado a reducido), y el otro potencial va al revés; es decir,
tengo:

Ejemplo:
Piruvato/lactato (Eo = -0,19V) → más positivo (irá piruvato→ lactato).
NAD/NADH (Eo = -0,32V) → más negativo (irá NADH → NAD) al revés, porque es el reductor, dará
electrones (reduce a otros y se oxida), es el más negativo.
El piruvato/lactato es más positivo, por lo que la reacción ocurrirá en ese sentido, es decir, el piruvato
pasará a lactato, y la otra reacción tendrá lugar en el otro sentido, desde NADH hasta NAD y también
habrá, por tanto, que cambiarle el signo a su potencial, pasando éste a ser positivo. La reacción
estaría desplazada en el sentido:
Piruvato + NADH → Lactato + NAD+ + H+
Con un E = +0·32 2 0·19 = 0·13, \ con Xna 'G= -6 kCal/mol, por lo que será espontánea en ese
sentido.

METABOLISMO DE DISTINTOS ORGANISMOS


Según las modalidades de metabolismo distinguimos organismos autótrofos o heterótrofos, según
puedan o no fijar CO2 (materia orgánica). Nosotros
somos heterótrofos:
1. Los autótrofos fijan CO2 (materia inorgánica)
y lo convierten en materia orgánica. Si para
fijarlo necesitan energía química (ej: energía
de reacción redox), son organismos
quimiolitótrofos (son reacciones que no
liberan mucha energía, son poco eficientes,
por ejemplo bacterias nitrificantes).
Por otro lado, si necesitan energía lumínica
para fijar el CO2 (fotosíntesis), son
fotolitótrofos (utilizan energía del sol y hacen
fotosíntesis). Pueden usar sulfhídrico como
fuente de electrones y en ese caso no
liberarán oxígeno, sino azufre.
2. Los heterótrofos necesitan la materia ya
elaborada para el organismo, no son capaces
de fabricarla por sí mismo (no pueden fijar
C02).
- Algunos dentro de este grupo,
obtienen energía de la fotosíntesis,
son los organismos fotoorganótrofos.
- Pero nosotros (animales superiores) somos organismos quimiorganótrofos,
necesitamos materia orgánica y la energía la cogemos de las reacciones redox.
Nosotros, necesitamos materia orgánica y la energía la obtenemos de la propia de la
materia orgánica que obtenemos y degradamos.

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