BIOENERGÉTICA

La bioenergética es el estudio cuantitativo de las transducciones de energía que tienen lugar en las células vivas, así como la naturaleza
y la función de los procesos químicos sobre los que se basan esas transducciones.
También podemos definirla, más brevemente, como la rama de la termodinámica que estudia las transformaciones energéticas en los
seres vivos.
Las células y organismos deben desarrollar trabajo para permanecer vivos, crecer y reproducirse. Los tipos de trabajo son muy variados
(síntesis de macromoléculas, movimiento, gradientes electroquímicos, generación de calor y luz, etc.) y por lo tanto llevan a cabo diferentes
mecanismos de transducción de energía desde los combustibles y la luz solar.
Daremos por conocidas las leyes de la termodinámica, que se relacionan en la energía libre de Gibbs (G). La variación de energía libre
(∆G) expresa la cantidad de energía capaz de realizar trabajo durante un sistema reaccionante a presión y temperatura constantes.

∆G = ∆H-T∆S donde ∆H es la variación de entalpía que representa el calor interno del sistema, que a su vez es
un reflejo del número y tipo de enlaces de reactivos y productos; ∆S es la variación de entropía del sistema una expresión
cuantitativa de la aleatoriedad o desorden de un sistema; T es la temperatura absoluta.
Por convención, ∆S tiene signo positivo cuando aumenta la entropía y ∆H tiene valor negativo cuando se libera calor del sistema a
su entorno. Cualquiera de estas condiciones, que son típicas de los procesos favorables, tiende a hacer negativa ∆G. La entropía debe
aumentar durante todos los procesos físicos y químicos, pero ese incremento no tiene que ser necesariamente en el sistema
reaccionante.
La ∆G de un sistema que reacciona espontáneamente es siempre negativa, es decir los productos tienen menos energía libre que
los reactivos.
Los organismos vivos conservan su orden interno tomando de su entorno energía libre en forma de nutrientes o luz solar y
devolviendo al entorno una cantidad igual de energía en forma de calor y entropía.
La ∆G predice las direcciones de las reacciones, su posición en el equilibrio y la cantidad de trabajo que pueden realizar a
presión y temperatura constantes. Todas las reacciones químicas tienden a ir en la dirección que da lugar a una disminución en la
energía libre del sistema: ∆Greac > ∆Gprod

Aunque en estos ejemplos

de reacciones las flechas
aparecen en una sola
dirección, la mayoría de las
reacciones biológicas son
reversibles. Aquí se indican
condiciones de reacción
estándar transformadas.
 RELACIÓN ENTRE ∆G Y LAS CONSTANTES DE EQUILIBRIO
La composición de un sistema reaccionante tiende a continuar cambiando hasta que se llega al equilibrio. A la concentración de
equilibrio de reactivos y productos las velocidades de la reacción directa y reversa son exactamente iguales y no se produce
ningún cambio neto en el sistema.
Cuando un sistema reaccionante no está en equilibrio, la
[C]c [D]d tendencia a desplazarse al equilibrio representa una fuerza
aA + bB  cD + dD Keq = motriz cuya magnitud se puede expresar como la variación
[A]a [B]b
de energía libre de la reacción (∆G).
En química se definen las condiciones estándar de reacción como: temperatura = 298 K (25 ºC), las concentraciones de
reactivos y productos a 1M y los gases a 1 atm (101.3 kPa). Hablaríamos entonces de una ∆Go estándar. Como en biología la
mayoría de reacciones ocurren en condiciones acuosas tamponadas en torno a pH 7 y tanto el pH como la concentración de
agua no varían, se definen en bioquímica las condiciones estándar transformadas, donde [H+] = 10-7 (pH = 7) y la [H2O] =
55,5 M. En las reacciones (sobre todo en las que participa el ATP) en que interviene el Mg2+ se considera su concentración
constante a 1 mM. Hablaríamos entonces de una ∆G’o y una K’eq.

La ∆G y la constante de equilibrio de una reacción se relacionan mediante la siguiente expresión: ∆G’o = -RT lnK’eq

La ∆G’o de una reacción

química es simplemente una
forma matemática alternativa
de expresar la constante de
equilibrio.

La relación que hay entre ellas es

logarítmica, de modo que pequeñas
variaciones de ∆G’o suponen grandes
variaciones de K’eq.
 LA BIONERGÉTICA EN LA CÉLULA NO OCURE EN CONDICIONES ESTÁNDAR

∙ El cambio real de energía libre (∆G) de una reacción en la célula depende de:
 el cambio de energía libre en condiciones estándar. ¡Ojo! Estas concentraciones
de sustratos y productos no
 las concentraciones reales de productos y reactivos. son en el equilibrio, son al
Para la reacción aA + bB  cC + dD: inicio de la reacción en
condiciones no estándar.

[C ]c [ D]d
∆G = ∆G '° + RT ln
[ A]a [ B ]b
∙ Los cambios de energía libre (estándar y reales) son aditivos siempre que haya un intermediario común:

Las ∆G’o son aditivas, mientras que las

(1) A  B ΔG1
K’eq son multiplicativas. K’eq3 = K’eq1 x K’eq2
(2) B  C ΔG2
(3) Suma: A  C ΔG1 + ΔG2

Ejemplo de reacción acoplada:

(1) Glucosa + Pi  glucosa 6-fosfato + H2O ∆G’o = 13.8 kJ/mol (endergónica)

(2) ATP + H2O  ADP + Pi ∆G’o = -30.5 kJ/mol (exergónica)

(3) Suma: glucosa + ATP  glucosa 6-fosfato + ADP ∆G’o = -16.7 kJ/mol (exergónica)

NOTA: en esta presentación, para no generar equívocos, los decimales están escritos de acuerdo a la escritura
inglesa ya que se adjuntan tablas y valores de constantes de libros de ediciones anglosajonas. Es decir, los
decimales están indicados con puntos y no con comas. Para cifras de más de 4 dígitos se usa la escritura
recomendada por la RAE. P. ejp. 10.000 se escribirá 10 000.
 El ATP ESTÁ UNIDO AL Mg2+

La formación de los complejos con Mg2+ apantalla

parcialmente las cargas negativas e influye sobre la
conformación de los grupos fosfato de nucleótidos
tales como el ATP y el ADP.

HIDRÓLISIS DEL ATP

Pi

PPi
BASE QUÍMICA PARA LA ALTA VARIACIÓN DE ENERGÍA LIBRE DE LA HIDRÓLISIS DEL ATP

1) En primer lugar, la hidrólisis, al causar la separación

de cargas, elimina la repulsión electrostática entre las
cuatro cargas negativas del ATP. 2) En segundo lugar, el
fosfato inorgánico (Pi) liberado por la hidrólisis está
estabilizado por la formación de un híbrido de resonancia
1) en el que cada uno de los enlaces P-O tiene el mismo
grado de carácter de doble enlace mientras que el ion
hidrógeno no está asociado de manera permanente con
ninguno de los oxígenos. En los fosfatos implicados en
enlaces anhídrido o éster tiene lugar también un cierto
2) 3) grado de estabilización por resonancia, pero son
posibles menos formas de resonancia que para el Pi. 3)
En tercer lugar, el ADP2- producido en la hidrólisis se
ioniza inmediatamente, liberando un protón a un medio
de [H+] muy baja (pH 7). Un cuarto factor (no mostrado)
que favorece la hidrólisis del ATP es el mayor grado de
solvatación (hidratación) de los productos Pi y ADP con
relación al ATP, que estabiliza aún más los productos con
relación a los reactivos.

* Para eritrocitos, las concentraciones son las del

citosol (los eritrocitos humanos carecen de núcleo y
mitocondrias). En los otros tipos celulares los datos
son para el total del contenido celular, aunque el
citosol y las mitocondrias tienen unas
concentraciones de ADP muy diferentes. PCr es la
fosfocreatina. † Este valor refleja la concentración
total; el valor para ADP libre puede ser mucho
menor.
 HIDRÓLISIS DEL FOSFOENOLPIRUVATO HIDRÓLISIS DEL 1,3-BISFOSFOGLICERATO

1,3-Bisphosphoglycerate

El producto directo de la hidrólisis es el

ácido 3-fosfoglicérico, que posee un
grupo ácido carboxílico sin disociar,
pero la disociación se produce
inmediatamente. Esta ionización y las
estructuras resonantes que hace
posibles estabilizan el producto con
relación a los reactivos. La
Esta reacción, catalizada por la piruvato quinasa, va seguida de la estabilización por resonancia del Pi
tautomerización espontánea del producto, el piruvato. La contribuye a la variación de energía
tautomerización no es posible en el PEP, por lo que los productos libre negativa.
de hidrólisis están estabilizados en relación a los reactivos.
También tiene lugar la estabilización por resonancia del Pi.

HIDRÓLISIS DE LA FOSFOCREATINA
La rotura del enlace P-N de la fosfocreatina produce creatina, que está
estabilizada por la formación de un híbrido de resonancia. El otro H+
producto, Pi, también está estabilizado por resonancia.
 CLASIFICACIÓN DE LOS COMPUESTOS
BIOLÓGICOS FOSFORILADOS SEGÚN SUS
ENERGÍAS LIBRES ESTÁNDAR DE HIDRÓLISIS

Se muestra el flujo de grupos fosforilo, representados por P, desde donadores de fosforilo de elevada energía
vía ATP hasta moléculas aceptoras (tales como la glucosa y glicerol) para formar sus derivados fosfato de
baja energía. Este flujo de grupos fosforilo, catalizado por enzimas denominados quinasas, transcurre con
una pérdida global de energía libre en las condiciones intracelulares. La hidrólisis de los compuestos fosfato
de baja energía libera Pi, que tiene un potencial de transferencia de grupo fosforilo aún menor.
Gran parte del catabolismo está dedicado a la síntesis de compuestos fosfato de alta energía, pero su
formación no es un fin en sí mismo; constituyen una forma de activar una gran variedad de compuestos para
transformaciones químicas posteriores. La transferencia de un grupo fosforilo a un compuesto pone
efectivamente energía libre en dicho compuesto, de forma que tiene más energía libre para ceder durante sus
transformaciones metabólicas posteriores.
EL ATP PROPORCIONA ENERGÍA POR TRANSFERENCIA DE GRUPO, NO POR SU SIMPLE HIDRÓLISIS

Hidrólisis del ATP en dos pasos. La contribución del ATP a

una reacción se muestra a menudo como un paso único
(a), pero es casi siempre un proceso de dos pasos, tal
como el que se muestra para la reacción catalizada por la
glutamina sintetasa dependiente del ATP (b). 1) Se
transfiere inicialmente un grupo fosforilo desde el ATP al
glutamato y a continuación 2) el grupo fosforilo es
desplazado por NH3 y liberado como Pi.
REACCIONES DE DESPLAZAMIENTO
NUCLEOFÍLICO DEL ATP

Cualquiera de los tres átomos de P (α, β o γ) puede servir como diana

electrofílica para un ataque nucleofílico– en este caso, por el nucleófilo
marcado como R— 18O:. El nucleófilo puede ser un alcohol (ROH), un grupo
carboxilo (RCOO-) o un fosfoanhídrido (un nucleósido mono o difosfato, por
ejemplo).
(a) Cuando el oxígeno del nucleófilo ataca a la posición γ, se marca el oxígeno enlazante del producto, lo que indica que el grupo
transferido desde el ATP es un fosforilo (−PO3-), no un fosfato (−OPO3-). (b) El ataque sobre la posición β desplaza AMP y
conduce a la transferencia de un grupo pirofosforilo (no pirofosfato) al nucleófilo. (c) El ataque sobre la posición α desplaza PPi y
transfiere el grupo adenililo al nucleófilo.
REACCIÓN DE ADENILILACIÓN EN LA LOS NUCLEÓSIDOS TRIFOSFATO EN LA
ACTIVACIÓN DE UN ÁCIDO GRASO SÍNTESIS DEL RNA

Los dos enlaces fosfoanhídrido del

ATP se rompen finalmente en la
formación del palmitoil-coenzima A.
En primer lugar, el ATP dona
adenililo (AMP), formando el acil
graso adenilato y liberando PPi, el
cual es hidrolizado por la
pirofosfato inorgánico hidrolasa. El
grupo acil graso “energizado” se
transfiere seguidamente a la
coenzima A (CoASH), con la que
forma un enlace tioéster que
conserva parte de la energía
“invertida” del ATP.

Con cada nucleósido monofosfato adicionado a la cadena en

crecimiento, se libera un PPi que se hidroliza a dos Pi. La hidrólisis
de dos enlaces fosfoanhídrido por cada nucleótido adicionado
proporciona la energía para formar los enlaces en el polímero de
RNA y para construir una secuencia específica de nucleótidos.
 LA TRANSFOSFORILACIÓN ENTRE NUCLEÓTIDOS OCURRE EN TODOS LOS TIPOS CELULARES
Mecanismo Ping-Pong de la nucleósido difosfato quinasa. La
enzima une su primer sustrato (ATP en este ejemplo), y un
grupo fosforilo se transfiere a la cadena lateral de un residuo
His de la propia enzima. El ADP se libera y otro nucleósido (o
desoxinucleósido) difosfato lo remplaza, y este es convertido
al correspondiente trifosfato por transferencia del grupo
fosforilo desde el residuo fosfohistidina.

EL POLIFOSFATO INORGÁNICO ES UN POTENCIAL DONANTE DE FOSFORILO

En levaduras y bacterias se acumulan cantidades importantes de polifosfato inorgánico
(polyP) que pueden funcionar como fosfágeno. En plantas existe al menos una forma de
la enzima fosfofructoquinasa que utiliza el PPi (el polyP más pequeño) como donante de
grupo fosforilo, sustituyendo al ATP que se utiliza en animales y microorganismos. El
polyP tiene el mismo potencial de transferencia de grupo fosforilo que el PPi.
En bacterias la enzima polifosfato quinasa 1 (PPK-1) cataliza la reacción reversible ATP + polyPn  ADP + polyPn+1 ∆G’o = -20
kJ/mol. La polifosfato quinasa 2 (PPK-2) cataliza la síntesis reversible de GTP o ATP a partir de polyP:
GDP (ADP) + polyPn+1  GTP (ATP) + polyPn. Se cree que cada una de estas enzimas actúa principalmente en la dirección hacia
la derecha, en cada caso. En levaduras no hay genes similares a los PPK bacterianos, aunque se conocen 4 genes necesarios
para la síntesis de polyP. Los mecanismos en eucariotas para la síntesis del polyP parecen muy diferentes de los bacterianos.

CARGA ENERGÉTICA DE ADENILATO

En células con un buen estado energético [ATP] >>> [ADP] y [AMP]. Las rutas metabólicas que generan
energía, en general, se activan por niveles bajos relativos de ATP y relativamente altos de ADP y AMP. Y
viceversa, si los niveles de ATP se incrementan supone una señal para el descenso de las reacciones que
conducen a su producción.
[ATP] + 0.5[ADP]
Se ha propuesto el término de carga energética de adenilato que se define como:
[ATP] + [ADP] + [AMP]
Es la proporción de formas de gran energía de adenilato con respecto al total de estos nucleótidos. El ADP tiene
un “enlace de alta energía” en comparación con los dos que tiene el ATP. Las células aerobias con una buena
carga energética tienen un valor en torno a 0.9.
 REACCIONES DE OXIDACIÓN-REDUCCIÓN
INORGÁNICA ORGÁNICA

O O
Fe2+ + Cu2+ Fe 3+ + Cu+ R—C R—C + Cu2O + H2O
H + 4OH + 2Cu
- 2+
OH
Semirreacciones: Semirreacciones:

O O
1) R—C + 2OH- R—C + 2e- + H2O
1) Fe2+ Fe3+ + e- H OH
2) Cu2+ + e- Cu+
2) 2Cu2+ + 2e- + 2OH- Cu2O + H2O

FORMAS EN QUE LOS ELECTRONES SE PUEDEN TRANSFERIR DE UNA MOLÉCULA A OTRA

1) Directamente como electrones: por ejemplo, la reacción inorgánica indicada arriba.

2) En forma de átomos de hidrógeno: AH2 A + 2e- + 2H+ o con un aceptor: AH2 + B A + BH2
No confundir estas reacciones con una disociación de un ácido.

3) En forma de ion hidruro (:H-), que incluye dos electrones. Esto ocurre en el caso de las deshidrogenasas
ligadas a NAD+.

4) A través de una combinación directa con el oxígeno: R—CH3 + ½ O2 → R—CH2—OH

EQUIVALENTES DE REDUCCIÓN
El término equivalente de reducción suele usarse para designar un equivalente de e- simple que participa
en una reacción de oxidación-reducción, sin importar si este es un e-, un átomo de H, un hidruro o si la
transferencia de e- tiene lugar por reacción con el oxígeno. Habitualmente, las moléculas de combustible
biológicas suelen deshidrogenarse enzimáticamente perdiendo 2 equivalentes de reducción cada vez y el
átomo de O puede aceptar 2 equivalentes de reducción, por lo que en bioquímica, por convención, la
unidad de las oxidaciones biológicas son 2 equivalentes de reducción.
 ESTADOS DE OXIDACIÓN DEL CARBONO EN LA BIOSFERA

Los estados de oxidación se ilustran con algunos compuestos significativos. Hay que fijarse en el carbono
en rojo y sus electrones enlazantes. Cuando este carbono está enlazado al átomo de H, menos
electronegativo, ambos electrones enlazantes (en rojo) se asignan al carbono. Cuando el carbono está
enlazado a otro carbono, los electrones enlazantes se comparten por igual, de forma que uno de los dos
electrones se asigna al carbono en rojo. Cuando el carbono en rojo está unido al átomo de oxígeno, más
electronegativo, los electrones enlazantes se asignan al oxígeno.
El número a la derecha de cada compuesto es el número de electrones que “pertenecen” al carbono en rojo,
una expresión aproximada del estado de oxidación de este carbono. Cuando el carbono en rojo se oxida
(pierde electrones), el número se hace menor. Por tanto, el orden de estado de oxidación creciente es
alcano < alqueno < alcohol < alquino < aldehído < cetona < ácido carboxílico < dióxido de carbono.
 MEDICIÓN DEL POTENCIAL DE REDUCCIÓN ESTÁNDAR (E’0) DE UN PAR REDOX
Los electrones fluyen desde el
electrodo de ensayo al electrodo de
referencia, o viceversa. En último
término, la semicelda de referencia es
el electrodo de hidrógeno, tal como se
muestra aquí. La fuerza electromotriz
(fem) de este electrodo se toma como
0,00 V. A pH 7,0, el E’0 del electrodo
de hidrógeno es –0,414 V. La
variación del flujo de electrones
depende de la “presión” o potencial
electrónico relativo de las dos celdas.
Un puente salino que contiene un
disolución saturada de KCl
proporciona una vía para el
movimiento de contraiones entre la
celda de ensayo y la celda de referencia. A partir de la fem observada y
la fem conocida de la celda de referencia, se obtiene la fem de la celda
de ensayo que contiene el par redox. Por convención, la celda que
gana electrones tiene potencial de reducción más positivo. El
estándar de referencia es la semirreacción H+ + e- → ½ H2

ECUACIÓN DE NERNST

RT [aceptor de electrones]
E = E0 + ln * Este es el valor para el FAD libre; cuando el FAD está
nҒ [donador de electrones] unido a una flavoproteína específica (por ejemplo la
succinato deshidrogenasa) tiene un valor diferente de E’0.
E es el potencial de reducción a cualquier concentración de las
especies oxidadas y reducidas; E’0 es el potencial de reducción A 298 K (25 ºC) la ecuación se simplifica a:
en condiciones estándar; R es la constante de los gases= 8.315
J/mol·K; T es la temperatura absoluta en grados Kelvin; Ғ es la 0.026 V [aceptor de electrones]
E = E0 + ln
constante de Faraday= 96 480 J/V·mol; y n es el número de n [donador de electrones]
electrones transferidos por molécula.
 CÁLCULO DE LA VARIACIÓN DE LA ENERGÍA LIBRE GRACIAS A LOS POTENCIALES DE
REDUCCIÓN ESTÁNDAR
∆G = -nҒ∆E, o ∆G’0 = -nҒ∆E’0 n es el número de electrones transferidos en la reacción

Ejemplo para la reacción:

Por convención, ∆E’0 se expresa como E’0 para el aceptor
Acetaldehído + NADH + H+ etanol + NAD+ de electrones menos E’0 para el donador de electrones. En
Semirreacciones: este caso el acetaldehído está aceptado electrones del NADH,
por tanto, ∆E’0 = -0.197 V – (-0.320 V) = 0.123 V y n es 2.
Acetaldehído + 2H+ + 2e- etanol E’0= -0.197 V
NAD+ + 2H+ + 2e- NADH + H+ E’0= -0.320 V

∆G’0= -nҒ∆E’0 ⇒ ∆G ‘0 = -2(96.5 kJ/V·mol)(0.123 V) = -23.7 kJ/mol

Esta es la variación de energía libre para la reacción de oxidación-reducción a pH 7 cuando el acetaldehído, etanol, NAD+
y NADH están presentes a una concentración de 1 M. Si, en cambio, el acetaldehído y NADH estuviesen presentes a
concentración 1 M, pero el etanol y el NAD+ lo estuviesen a 0.1 M el valor de ∆G se calcularía de la manera siguiente.
Primero se determinan los valores de E para los dos reductores aplicando la ecuación de Nernst:

RT [NAD+]
ENADH = E’0 + RT
[acetaldehído]
Eacetaldehído = E’0 + ln ln
nҒ [etanol] nҒ [NADH]

0.026 V 1.0 0.026 V 0.1

= -0.197 V + ln = -0.167 V = -0.320 V + ln = -0.350 V
2 0.1 2 1.0

A continuación se utiliza ∆E para calcular ∆G:

∆E = -0.167 V – (-0.350) V = 0.183 V

∆G = -nҒ∆E
= -2 (96.5 kJ/V·mol) (0.183 V)
= -35.3 kJ/mol
 FLUJOS DE ELECTRONES Y ENERGÍA EN LAS CÉLULAS

Oxidations with molecular oxygen

Glucose + 6O2  6CO2 + 6H2O –2840 kJ/mol (∆G’o)
Palmitate + 23O2  16CO2 + 16H2O –9770 kJ/mol (∆G’o)

COCIENTES RESPIRATORIOS Y EQUIVALENTES REDUCTORES

Se define el término cociente respiratorio (CR) como el cociente del número de moles de CO2 producidos
por mol de O2 consumidos en la oxidación completa de un sustrato.
Cuanto menor es el CR se consume más O2 por C en la
CR glucosa: 6CO2 / 6O2 = 1 oxidación y hay mayor potencial de generación de energía
CR palmitato: 16CO2 / 23O2 = 0.7 por mol de sustrato.
Otra manera de expresarlo: se obtienen más equivalentes reductores de la oxidación de un ácido
graso que de un hidrato de carbono a igualdad de número de C.
 COENZIMAS DE OXIDO-REDUCCIÓN. NAD+ Y NADP+
(a) El dinucleótido de nicotinamida y adenina (NAD+) y su análogo
fosforilado (NADP+) se reducen a NADH o NADPH, aceptando un ion
NAD+
hidruro (dos electrones y un protón) a partir de un sustrato oxidable).
El ion hidruro se puede adicionar en la parte frontal (cara A) o
(oxidiced) posterior (cara B) del anillo plano de nicotinamida.

NADH
Semirreacciones de reducción de los nucleótidos de
or (reduced) nicotinamida:

NAD+ + 2e- + 2H+ NADH + H+

NADP+ + 2e- + 2H+ NADPH + H+

Reacciones generales de los nucleótidos de nicotinamida:

AH2 + NAD+ A + NADH + H+

A + NADPH + H+ AH2 + NADP+

Donde AH2 es el sustrato reducido y A el sustrato oxidado.

Reacción de la alcohol deshidrogenasa:

CH3CH2OH + NAD+ CH3CHO + NADH + H+

Etanol Acetaldehído

Los nucleótidos de nicotinamida se reciclan constantemente difundiendo de una enzima a otra, por ejemplo:

1) Gliceraldehído 3-fosfato + NAD+ 3-fosfoglicerato + NADH + H+

2) Acetaldehído + NADH + H+ etanol + NAD+

Suma: Gliceraldehído 3-fosfato + acetaldehído 3-fosfoglicerato + etanol

 COENZIMAS DE OXIDO-REDUCCIÓN. FAD Y FMN

El FMN consiste en la estructura que se muestra por encima de la línea a trazos roja en la estructura
oxidada (FAD). Los nucleótidos de flavina aceptan dos átomos de hidrógeno (dos electrones y dos
protones), que aparecen ambos en el sistema anular de la flavina. Cuando el FAD o el FMN aceptan un
solo átomo de hidrógeno, se forma la semiquinona, que es un radical libre estable.