El material genómico se refiere al conjunto completo de material genético dentro de las células de un organismo.

En la mayoría de los
organismos vivos, incluidos los humanos, el material genómico se compone principalmente de ADN (ácido desoxirribonucleico). El ADN
contiene las instrucciones genéticas que guían el desarrollo, el funcionamiento y la reproducción de un organismo. Está organizado en
estructuras llamadas cromosomas, y cada cromosoma lleva genes específicos que codifican la información de varios rasgos y
características.
ISPM. (2020). Material genético. Recuperado de: https://www.ispm.cl/doc/2020/2medio/biologia/BIOLOGÍA%20SEGUNDO
%20MEDIO.pdf

1. **Organización Celular:**
- Los procariotas, como las bacterias, carecen de un núcleo definido. Su material genético se encuentra en el citoplasma en una región
llamada nucleoide.
- Los eucariotas tienen un núcleo donde se encierra el material genético. El ADN se organiza en cromosomas dentro del núcleo.

2. **Embalaje de ADN:**
- En procariotas, el ADN suele ser un único cromosoma circular que no está asociado con proteínas histonas. Generalmente es más
accesible para la manipulación.
- El ADN eucariótico es lineal y está estrechamente enrollado alrededor de las proteínas histonas para formar cromatina, que luego se
condensa en los cromosomas. Esta estructura compacta puede hacer que la extracción de ADN sea más compleja.

3. **Pared celular:**
- Los procariotas a menudo tienen una pared celular que se puede descomponer químicamente para acceder al ADN.
- Las células eucariotas, especialmente las células vegetales, pueden tener una pared celular rígida compuesta de celulosa que
requiere pasos adicionales para eliminar antes de la extracción del ADN.

4. **Orgánulos unidos a membrana:**

- Las células eucariotas contienen orgánulos unidos a la membrana, como las mitocondrias y los cloroplastos (en las células vegetales),
que también tienen su propio ADN. Si el aislamiento es para ADN nuclear, estos orgánulos deben separarse.

5. **Tamaño de la muestra:**
- Los procariotas suelen ser más pequeños y tienen menos ADN, por lo que es posible que se necesiten mayores cantidades de cultivo
bacteriano para la extracción.
- Los organismos eucariotas generalmente tienen mayores cantidades de ADN en sus células, lo que facilita la extracción.

6. **Técnicas:**
- Las técnicas para el aislamiento de ADN de procariotas pueden implicar métodos más simples debido a su falta de membrana
nuclear.
- La extracción de ADN de eucariotas a menudo implica pasos adicionales para descomponer la envoltura nuclear y liberar
eficientemente el ADN de la cromatina.

Gleichmann, N. (2023). Prokaryotes vs Eukaryotes: What Are the Key Differences? Recuperado de:
https://www.technologynetworks.com/cell-science/articles/prokaryotes-vs-eukaryotes-what-are-the-key-differences-336095

Soluciones tampón: El ADN se puede suspender en soluciones tampón que ayudan a mantener un pH estable y proporcionan los iones
necesarios para respaldar la integridad del ADN. Los tampones comunes incluyen el tampón Tris-EDTA (TE) y la solución PBS.

Baja temperatura: El almacenamiento de ADN a bajas temperaturas, como -20 °C o -80 °C, puede ralentizar la actividad enzimática que
conduce a la degradación.

Deshidratación: El ADN puede secarse y almacenarse en forma de polvo. Esto reduce el riesgo de degradación enzimática.
Precipitación con etanol: lo que hace que el ADN se agrupe y precipite fuera de la solución. Después, el sedimento de ADN puede
lavarse y almacenarse.

Wu, J., Cunanan, J., Kim, L., Kulatunga, T., Huang, C. y Anekella, B. (s.f.). Stability of Genomic DNA at Various Storage Conditions.
Recuperado de: https://www.colorado.edu/ecenter/sites/default/files/attached-files/
seracare_stability_of_genomic_dna_at_various_storage_conditions_isber2009.pdf

Reactivos de estabilización de ADN: lo reactivos de estabilización de ADN disponibles comercialmente se pueden agregar a las muestras
de ADN para protegerlas de la degradación durante el almacenamiento. Estos reactivos a menudo funcionan inhibiendo las enzimas que
descomponen el ADN.

Desecación: quitar el agua de la solución de ADN liofilizándola o usando desecantes puede ayudar a preservar la estabilidad del ADN.
Esto evita el crecimiento de microorganismos que podrían degradar el ADN.

Cabe resaltar que el almacenamiento de ADN en tubos o viales herméticamente cerrados minimiza la exposición al aire y la humedad,
que pueden contribuir a la degradación.
Ryding, S. (2023). How to Store DNA. Recuperado de: https://www.news-medical.net/life-sciences/How-to-Store-
DNA.aspx#:~:text=Some%20studies%20indicate%20that%20DNA,for%20DNA%20concentration%20and%20evaporation

1. **PCR de Puente:**
- Las moléculas de ADN unidas a la cadena de acoplamiento se doblan y se unen a otras cadenas complementarias cercanas, formando
puentes.
- Una enzima llamada polimerasa copia la cadena complementaria.
- Los puentes se rompen y las moléculas de ADN se unen solo a cadenas de acoplamiento.
- Se repite este proceso varias veces, formando clústeres con alrededor de 2000 moléculas de ADN cada uno.

2. **Barrido:**
- Se realiza un barrido para eliminar las moléculas de ADN unidas a la otra cadena de acoplamiento.
- Solo se mantienen las moléculas de ADN unidas a una cadena de acoplamiento específica (por ejemplo, azul).
- En cada clúster, todas las moléculas de ADN serán idénticas debido a la amplificación clonal.
- Al final, se obtienen alrededor de 200 millones de clústeres de ADN en la célula de flujo.

TheoryLabster. (2021). Generación de clústeres. Recuperado de: https://theory.labster.com/cluster-generation-es/

Pureza y calidad: el ADN aislado debe estar libre de contaminantes como proteínas, ARN y productos químicos que puedan interferir con
los procesos posteriores. La calidad se puede evaluar midiendo la relación A260/A280 y la relación A260/A230 con un
espectrofotómetro.
Cantidad: El ADN aislado debe producir una cantidad suficiente para la posterior reacción de amplificación. La cantidad se puede medir
mediante espectrofotometría o ensayos fluorométricos.
Integridad: El ADN debe estar intacto sin una degradación significativa. La electroforesis en gel de agarosa o la electroforesis capilar se
pueden utilizar para evaluar la integridad del ADN.
Especificidad: el ADN aislado debe ser específico para el organismo diana o el gen de interés. Se debe minimizar la contaminación con
ADN de otras fuentes.
Disrupción celular: dependiendo de la fuente de ADN (p. ej., células, tejidos), se deben elegir métodos apropiados para la disrupción
celular/tejida, como métodos mecánicos, químicos o enzimáticos.
Método de extracción de ADN: se encuentran disponibles diferentes métodos de extracción de ADN, como fenol-cloroformo,
purificación en columna basada en sílice y métodos basados en perlas magnéticas. Elija un método adecuado para su tipo de muestra y
aplicación posterior.
Inhibidores: Algunas muestras pueden contener inhibidores de PCR. Asegúrese de que el ADN aislado esté libre de sustancias que
puedan dificultar la posterior amplificación por PCR.
Almacenamiento: Se deben considerar las condiciones de almacenamiento adecuadas (generalmente a -20 °C o -80 °C) para evitar la
degradación del ADN.
Fuente de la muestra: dependiendo de la fuente (sangre, tejidos, células), puede ser necesaria la optimización del método de
extracción.

Jakubowski, H. y Flatt, P. (2023). DNA Isolation. Sequencing, and Synthesis. Recuperado de:
https://bio.libretexts.org/Bookshelves/Biochemistry/Fundamentals_of_Biochemistry_(Jakubowski_and_Flatt)/01%3A_Unit_I-
_Structure_and_Catalysis/09%3A_Investigating_DNA/9.01%3A_DNA_Isolation_Sequencing_and_Synthesis
Referencias:

 ISPM. (2020). Material genético. Recuperado de:

https://www.ispm.cl/doc/2020/2medio/biologia/BIOLOGÍA%20SEGUNDO%20MEDIO.pdf
 Gleichmann, N. (2023). Prokaryotes vs Eukaryotes: What Are the Key Differences?
Recuperado de: https://www.technologynetworks.com/cell-science/articles/prokaryotes-
vs-eukaryotes-what-are-the-key-differences-336095
 Wu, J., Cunanan, J., Kim, L., Kulatunga, T., Huang, C. y Anekella, B. (s.f.). Stability of
Genomic DNA at Various Storage Conditions. Recuperado de:
https://www.colorado.edu/ecenter/sites/default/files/attached-files/
seracare_stability_of_genomic_dna_at_various_storage_conditions_isber2009.pdf
 Ryding, S. (2023). How to Store DNA. Recuperado de: https://www.news-medical.net/life-
sciences/How-to-Store-DNA.aspx#:~:text=Some%20studies%20indicate%20that
%20DNA,for%20DNA%20concentration%20and%20evaporation
 TheoryLabster. (2021). Generación de clústeres. Recuperado de:
https://theory.labster.com/cluster-generation-es/
 Jakubowski, H. y Flatt, P. (2023). DNA Isolation. Sequencing, and Synthesis. Recuperado de:
https://bio.libretexts.org/Bookshelves/Biochemistry/Fundamentals_of_Biochemistry_(Jak
ubowski_and_Flatt)/01%3A_Unit_I-_Structure_and_Catalysis/09%3A_Investigating_DNA/
9.01%3A_DNA_Isolation_Sequencing_and_Synthesis