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5) Investiga sobre las técnicas Southern blot, Westhern blot y Northern blot ¿En
qué consisten? ¿Cómo se utilizan? Buscar animación que las representan para
poder usarlas en la resolución de casos
Southern blot
es una técnica utilizada para detectar y analizar secuencias específicas de ADN
en una muestra. Consiste en los siguientes pasos:
1° Digestión del ADN: Se digiere el ADN de la muestra utilizando enzimas
de restricción específicas que cortan el ADN en fragmentos más
pequeños.
2° Electroforesis en gel: Los fragmentos de ADN se separan según su
tamaño mediante electroforesis en gel de agarosa.
3° Transferencia a una membrana: Los fragmentos de ADN se transfieren
desde el gel a una membrana de nitrocelulosa o nylon mediante una
técnica llamada "transferencia de Southern blot".
4° Hibridación de la sonda: La membrana se hibrida con una sonda de ADN
complementaria a la secuencia de interés marcada con una etiqueta. La
sonda se une específicamente a la secuencia de ADN objetivo en la
membrana.
5° Detección de la sonda: La presencia de la sonda marcada se detecta
mediante auto radiografía o utilizando métodos de detección
fluorescente.
Western blot
se utiliza para detectar y analizar proteínas específicas en una muestra. Los
pasos principales son los siguientes:
1° Electroforesis en gel de poliacrilamida (SDS-PAGE): Las proteínas se
separan según su tamaño y carga eléctrica mediante electroforesis en
gel de poliacrilamida en presencia de un detergente llamado SDS
(dodecilsulfato de sodio).
2° Transferencia a una membrana: Las proteínas se transfieren desde el gel
a una membrana de nitrocelulosa o PVDF mediante una técnica de
transferencia electroforética llamada "transferencia de Western blot".
3° Bloqueo y anticuerpos: La membrana se bloquea para evitar la unión
inespecífica y luego se incuba con anticuerpos específicos que se unen a
la proteína de interés.
4° Detección de los anticuerpos: Los anticuerpos unidos a la proteína se
detectan utilizando una variedad de métodos, como la conjugación de
los anticuerpos con enzimas que producen una señal colorimétrica o
quimio luminiscente.
Northern blot
se utiliza para detectar y analizar ARN específicos en una muestra. Los pasos
principales son similares al Southern blot, pero con algunas diferencias:
1° Electroforesis en gel de agarosa: Los ARN se separan según su tamaño
mediante electroforesis en gel de agarosa.
2° Transferencia a una membrana: Los ARN se transfieren desde el gel a
una membrana de nitrocelulosa o nylon mediante una técnica de
transferencia electroforética llamada "transferencia de Northern blot".
3° Hibridación de la sonda: La membrana se hibrida con una sonda de ARN
complementaria a la secuencia de interés marcada con una etiqueta.
4° Detección de la sonda: La presencia de la sonda marcada se detecta
utilizando técnicas similares a las utilizadas en el Southern blot.
6) ¿En qué consistía la técnica fingerprint descripta por Jeffreys y sirvió como
inicio para usar el ADN como huella genética forense?
La técnica de fingerprint o huella genética, descrita por el científico británico Sir
Alec Jeffreys, fue un avance fundamental en el uso del ADN como herramienta
de identificación en genética forense. Esta técnica permitió demostrar que el
ADN es único para cada individuo, lo que llevó al desarrollo de los perfiles de
ADN utilizados en la actualidad en investigaciones criminales y casos de
identificación. Esta técnica se basa en la variabilidad de las secuencias
repetitivas de ADN conocidas como microsatélites o STRs (Short Tandem
Repeats). Estas secuencias consisten en repeticiones cortas de 2 a 6 nucleótidos
que se encuentran dispersas en todo el genoma.
El proceso de fingerprinting se lleva a cabo de la siguiente manera:
1° Extracción de ADN: Se extrae el ADN de la muestra biológica, como
sangre, saliva o tejido.
2° Amplificación por PCR: Se amplifican específicamente las regiones de
microsatélites mediante la técnica de reacción en cadena de la
polimerasa (PCR). Se utilizan cebadores diseñados para flanquear los
sitios de microsatélites de interés.
3° Electroforesis capilar: Los productos de PCR amplificados se separan por
tamaño mediante electroforesis capilar. Esta técnica permite medir con
precisión la longitud de las secuencias de microsatélites amplificadas.
4° Análisis de los perfiles de ADN: Los patrones de bandas resultantes en el
gel de electroforesis capilar se visualizan y se crean los perfiles de ADN.
Cada banda en el perfil representa una variante de longitud de los
microsatélites.
5° Comparación de perfiles: Los perfiles de ADN obtenidos de diferentes
individuos se comparan para determinar si hay coincidencia o exclusión.
Si los perfiles coinciden en múltiples microsatélites, se puede inferir que
provienen del mismo individuo.
7) ¿En qué consiste la técnica PCR, reacción en cadena de polimerasa tan
nombrada en estos días?
La técnica de PCR (reacción en cadena de la polimerasa) es una herramienta
fundamental en la biología molecular que permite amplificar y generar
múltiples copias de una región específica de ADN in vitro. El proceso de PCR se
lleva a cabo en ciclos repetidos de temperaturas controladas y consta de los
siguientes pasos:
1° Desnaturalización: La muestra de ADN que contiene la región objetivo
se calienta a una temperatura elevada (alrededor de 95-98 °C). Esta
etapa permite que las dos cadenas de ADN se separen, rompiendo los
puentes de hidrógeno entre las bases complementarias y generando
hebras individuales.
2° Anillamiento: La temperatura se reduce a alrededor de 50-65 °C para
permitir que los cebadores específicos (oligonucleótidos cortos) se unan
a las secuencias complementarias en las hebras de ADN molde. Los
cebadores son diseñados para unirse a las regiones flanqueantes de la
secuencia objetivo.
3° Extensión: La temperatura se aumenta a aproximadamente 72 °C y una
enzima llamada ADN polimerasa, termoestable y termofílica (como la
Taq polimerasa), utiliza los cebadores como punto de inicio y sintetiza
nuevas cadenas de ADN utilizando nucleótidos complementarios. La
ADN polimerasa lee las hebras individuales de ADN molde y sintetiza las
hebras complementarias.
La técnica de PCR ha sido fundamental para la realización de pruebas de
detección de COVID-19, ya que permite amplificar y detectar el material
genético del virus de manera rápida y precisa.
8) ¿En qué consiste la técnica de secuenciación del ADN? Desarrollada por Sanger
en 1977
La secuenciación de Sanger se basa en la síntesis in vitro del ADN utilizando
dideoxinucleótidos (ddNTPs), que son nucleótidos modificados que carecen del
grupo 3'-OH. Esto detiene la elongación de la cadena de ADN en el sitio donde
se incorpora el ddNTP, lo que permite la generación de fragmentos de
diferentes longitudes.
1° Preparación de la reacción de secuenciación: Se prepara una mezcla de
reacción que contiene una hebra de ADN molde, una pequeña cantidad
de un iniciador específico (cebador) que se une a la secuencia a
secuenciar, nucleótidos normales (dNTPs), ddNTPs marcados con
fluorocromos o radioisótopos, y una enzima ADN polimerasa.
2° Extensión de la cadena: La ADN polimerasa comienza a sintetizar una
nueva cadena de ADN complementaria utilizando el iniciador y los
dNTPs. A medida que la polimerasa incorpora los ddNTPs, la elongación
se detiene aleatoriamente en diferentes posiciones, generando
fragmentos de diferentes longitudes.
3° Separación por electroforesis: Los fragmentos de ADN resultantes se
separan por tamaño mediante electroforesis en gel de poliacrilamida o
gel de poliacrilamida-urea. El gel contiene una matriz porosa que
retarda el movimiento de los fragmentos cargados eléctricamente. Los
fragmentos más cortos se mueven más rápido y llegan antes a la
posición final.
4° Detección y lectura de la secuencia: Los fragmentos de ADN separados
se detectan mediante métodos de marcado, como la radiación o la
fluorescencia. Se utiliza una técnica de lectura secuencial de los
fragmentos, donde cada fragmento se detecta y se registra la señal de
su ddNTP correspondiente. Estas señales se registran en un gel o en un
secuenciador automatizado.
5° Análisis de los resultados: Los datos obtenidos se analizan y se
ensamblan para obtener la secuencia completa de la cadena de ADN
original. Esto implica la alineación de los fragmentos en función de las
superposiciones y la identificación de la secuencia completa.
La secuenciación de Sanger fue utilizada en los primeros proyectos de
secuenciación del genoma humano y ha sido una técnica ampliamente
adoptada en la investigación genética y molecular. Aunque actualmente se han
desarrollado técnicas de secuenciación de nueva generación más rápidas y
eficientes, la secuenciación de Sanger sentó las bases para el campo de la
genómica y sigue siendo utilizada en aplicaciones específicas donde se requiere
alta precisión y para la validación de resultados obtenidos por otras técnicas.