1. ¿Qué es una cascada de genes regulatorios? Los genes del desarrollo codifican proteínas que regulan otros genes, los que a su vez codifican otras proteínas; estas últimas a su vez pueden regular otros genes o simplemente funcionar, como paso final, en el citoplasma. De esta manera, se constituyen cascadas regulatorias en las que en cada nivel un gen maneja la función de otro gen, activándolo o reprimiéndolo. 2. ¿Qué son los elementos reguladores en trans? Funcionan sobre otros genes, que a su vez codifican otros factores de transcripción. 3. ¿Qué es un motivo hélice-vuelta-hélice? Es el motivo más común y se halla presente tanto en los procariontes (represor del operón lac, represor del fago lambda) como en los eucariontes; los productos de los genes homeóticos, entre otros, tienen este motivo, que está formado por dos regiones de α-hélice separadas por un segmento no helicoidal que permite que las dos hélices sean perpendiculares entre sí. Una hélice se ubica en la ranura mayor del ADN y se fija allí en forma específica; la segunda hélice está dirigida en el sentido de la molécula de ADN, pero se encuentra más lejos que la primera y no se une al ADN. 4. ¿Qué es un dedo de zinc? Es un pliegue de la cadena polipeptídica que abarca alrededor de 30 aminoácidos; en la base del pliegue hay un átomo de zinc coordinado en una estructura tetraédrica formada por cuatro uniones con aminoácidos que generalmente son cisteína y dos histidinas (también puede estar formado por cuatro cisteínas). Por lo común, estas proteínas reguladoras tienen varios “dedos de zinc”; su número varía entre dos y nueve. Cada “dedo” establece contacto con una secuencia de ADN y al haber varios “dedos” de establece una unión específica para una secuencia definida de ADN. Los dedos de zinc se encuentran en factores de transcripción y muchos otros productos de genes reguladores. 5. ¿Qué es zipper de leucina? Es una región rica en leucinas en una α-hélice, dispuestas de tal modo que las leucinas están espaciadas regularmente y separadas una de otras por siete aminoácidos. Esto determina que todas las leucinas estén en registro y orientadas hacia la misma cara externa. Dos cremalleras de leucinas pertenecientes a dos proteínas reguladoras interactúan entre sí por interdigitación y por interacción hidrofóbica para formar un dímero de proteínas ligantes al ADN. La región adyacente a la cremallera es muy básica en cada una de las proteínas y constituye la región de asociación al ADN. Las cremalleras de leucinas son “motivos” en homodímeros o heterodímeros de proteínas de asociación al ADN, como ciertos factores de transcripción y ciertos productos de oncogenes. 6. ¿Cuáles son los ejes principales del embrión? El eje dorsoventral y el eje anteroposterior. 7. ¿En la mosca Drosophila melanogaster cuál es el primer eje que se forma? El eje anteroposterior. 8. ¿En el humano y en los mamíferos en general cuál es el primer eje que se forma? El eje dorsoventral. 9. ¿Qué es la asimetría en la embriogenesis? Estudios tempranos de desarrollo podía influir en la calidad del embrión en fases posteriores (desarrollo de blastocito). 10. ¿Experimentalmente cómo se estudia la asimetría en el embrión? Analizando a los embriones en estadio de blastocitos y se emplea un software especifico. Realizar análisis genético. 11. Menciona dos genes implicados en la formación de los ejes embrionarios Genes “HOX” humanos Genes “PAX” 12. ¿Qué son los morfogenes? Es el proceso biológico que lleva a que un organismo desarrolle su forma. El proceso controla la distribución espacial organizada de células durante el desarrollo embrionario de un organismo. 13. Menciona algunos morfogenes SHH (Sonic hedgehog/erizo sónico) IHH (erizo índico) DHH (erizo del desierto) N-SHH Wnt7a 14. Inserta un esquema de un gen Hox indicando sus dominios hélice-vuelta-hélice
15. ¿Cuántas familias de morfogenes HOX hay en los humanos?
Cuatro familias de morfogenes 16. ¿A que se refiere el orden espacio temporal de los morfogenes? Se refiere a que punto del desarrollo y en que parte del cuerpo se van a expresar estos genes. 17. Inserta una imagen del gen PAX3 en humanos e indica las regiones de caja apareada, octapéptido y homeodomino
18. ¿Qué es un homeodominio?
Es la parte que reconoce y se relaciona con una secuencia determinada de ADN (en especial la tercera de las alfa-hélices), conformada por 60 aminoácidos, forma alfa-hélice. 19. ¿Qué es la aniridia? Es una malformación consistente en la falta de desarrollo del iris, que da como resultado ya sea la ausencia total de esa estructura o la presencia de un vestigio. Se acompaña de otros defectos oculares, como cataratas congénitas, vascularización de la córnea y un grado variable de pérdida de la visión. 20. ¿Qué morfogen está asociado a la aniridia? El Gen PAX 6 21. Menciona los eventos y orden en que sucede la morfogénesis de los miembros del embrión Primer nivel: segmentación. Segundo nivel: el papel de los genes homeóticos. Tercer nivel: el papel de genes cuyo producto es una proteína segregada o una proteína citoplasmática. 22. Menciona qué genes están relacionados con los ejes Proximal Distal (P-D), Anteroposterior (A-P), y el dorsoventral (D-V) en la formación de la mano. Proximal-distal: interviene un factor de crecimiento fibroblástico (FCF) que puede ser uno entre varios (FCF-10, FCF-4, FCF-8). Anteroposterior: interviene el producto del importante gen erizo sónico (SHH, Sonic hedgehog). Dorsoventral: interviene el producto del gen Wnt7a. 23. ¿Qué gen es causa de acondroplasia? El receptor 3 del factor de crecimiento fibroblástico (R3FCF).
Más allá del ADN: La Revolución Epigenética: Desde Mecanismos Celulares hasta Factores Ambientales: Cómo la Epigenética Moldea Nuestro Destino Biológico y las Implicaciones para la Salud, el Comportamiento y el Futuro de la Investigación