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DAG-3-P DAG-3-P
NOTAS IMPORTANTES:
El DAG-3-P (diacilglicerol-3-fosfato) también se llama fosfatidato y ácido fosfatídico
En la movilización de las grasas al final se obtienen un glicerol y 3 ácidos grasos. Además, a
partir del glicerol de obtienen intermediarios (dihidroxiacetona fosfato) de la
gluconeogénesis y de la glicolisis, pero también es posible formar triglicéridos y fosfolípidos.
Los componentes que participan en la lanzadera glicerol-3-P, y dihidroxiacetona-3-P, Por lo
tanto, a partir de esta molécula también es posible generar energía no sólo por el mismo
ciclo de Kbres, y sino que tambien por la lanzaderas ya que permite el paso de NADH del
citoplasma a la matriz mitocondrial para que esta se convierta en ATP.
Entonces a partir de la movilización de triglicéridos es posible formar glucosa, ATP,
fosfolípidos, triglicéridos.
Acetil-CoA: Participa en la lipogénesis, cuerpos cetónicos, colesterol, ATP.
NANA = ácido neuraminico
ADN
martes, 7 de diciembre de 2021
02:08
DOGMA CENTRAL DE LA BIOLOGIA MOLECULAR
Replicación --> ADN ---------Transcripción -------> ARN----------Traducción ----------> Proteínas
ADN: Guarda la información genética
ARN: Necesario para expresar la información contenida en el ADN
MONOMERO: nucleótidos (pentosa + base nitrogenada+ grupo fosfato)
5': Es donde está el grupo fosfato
3': significa que está libre el hidroxilo OH del C3 de la pentosa
Si la cadena está completa siempre está en sentido 5'-3', pero la unión de un nucleótido con otro es
en dirección 3'-5'
EUCARIOTAS
El ADN y el ARN se forma en el núcleo, entonces la replicación y la transcripción ocurre en el núcleo
La traducción ocurre en el citosol, para ello se agrega CAP (5') y la cola Poli A (3') al ARNm evitando
que las bases nitrogenadas se expongan a moléculas del citoplasma.
Cada diez pares alcanzan para dar un giro completo en la escalera de caracol
ENLACES
Base Nitrogenada + C1 de la Pentosa --> enlace N-glucosídics
Grupo Fosfato + C5 de la pentosa ------> enlace fosfodiester
BASES NITROGENEDAS
PURINAS : Dos anillos, Adenina y Guanina. El Nitrógeno número 9 es el que forma el enlace N-
glucosídico
PIRIMIDINAS: Un anillo, Timina, Uracilo y Citocina. El nitrógeno número 1 es el que forma el enlace N
glucosídico.
ADN: Adenina // Timina
Guanina ///Citosina
Pentosa: Desoxirribosa, con un H en el C2. Esto aumenta la resistencia de la molécula a la
hidrólisis, dándole más estabilidad
ARN: Adenina // Uracilo
Guanina ///Citosina
Pentosa: Ribosa, con un OH en el carbono 2.
NUCLEOSIDO: base nitrogenada + pentosa
La unidad incluida en la polimerización es el nucleótido monofosfato, pero para que la ADN
polimerasa o la ARN polimerasa incluya a la molécula en el proceso de elongación del ADN o ARN
deben estar en su forma de nucleótido trifosfato. La ADN pol o ARN pol clivan los dos grupos fosfatos
sobrantes PPi y permiten que el nucleotido monofosfato se una a la cadena en sentido 3' -5'.
REPLICACIÓN DEL ADN
Se realiza en la fase S del ciclo celular, la replicación es semiconservativa y bidireccional
FASES
1. INICIACIÓN : Se reconoce ORC, helicasa separa hebras formando una burbuja de replicación
o replicones, cada una de estas contiene dos orquillas de replicación. Para evita el
enrollamiento participa la proteína SSB, girasas y topoisomerasas
2. ELONGACIÓN: Es bidireccional, Inicia síntesis, llevada a cabo por la ADN pol III (proca). Pero
antes el ARNpolimerasa/primasa genera los primer o cebadores de 10 nucleotidos de ARN y
deja un extremo 3', a estos se uniran los desoxirribonucleótidos. La ADN polimerasa III,
añade los desoxirribonucleótidos al extremo 3' en sentido 5´-3'. En las orquillas habrá una
hebra conductora/lider/continua (sintetizada continuamente) y otra
seguidora/tardía/discontinua (sintetizada en fragmentos de Okazaki). En la hebra discontinua
la enzima que elonga es el ADN polimerasa I, luego deben quitarse los cebadores por lo que
viene la ADN polimersa II (que tiene actividad exonucleasa) y quita los fragmentos de
Okazaqui y la elonga con desoxirribonucelotidos, finalmente llega la ligasa que unirá a todos
los fragmentos.
3. Terminación
TRANSCRIPCIÓN: SÍNTESIS DE ARN
Se sintetiza ARN a partir de un molde de ADN. Reacción es catalizada por la ARN polimerasa
SUSTRATOS:
Molde, ADN de doble hebra
Precursores activados, 4 ribonucleótidos trifosfato
Un ion metálico divalente Mg, Mn
PASOS
1. Separación de hebras del ADN, el ADN molde tiene centros promotores que es donde se une
la ARN pol e inicia la transcripción
2. Dirección de sintesis 5'-3'
3. La ARN pol no necesita un iniciador
4. La ARN pol sintetiza ARNm, ARNt, ARNr
La ARN polimerasa recorre la hebra molde, hasta llegar a la región promotora y cuando termina de
pasar por la región promotora llega al sitio de iniciación entonces la subunidad sigma se disocia e
inicia con la transcripción, lo primero en sinterizar es el extremo CAP (metil guanosina trifosfato)
Terminación: Ocurre cuando se llega a la secuencia de STOP y cuando la ARN pol termina de
recorrerlo libera el ARNm y la ARN pol se asocia nuevamente a su subunidad sigma
PROCESAMIENTO DE ARNm en eucariotas
Se agrega CAP en el extremo 5' cuando la cadena tenga de 20-30 nucleótidos y esto forma al
transcripto primario.
transcripto primario -----clivaje----> que deja libre un OH en el extremo 3'
Luego se adiciona Poli A en el extremo 3' lo que llega a conformar Pre-ARNm
Pre-ARNm --------splicing-------> ARNm maduro (se quitan los intrones y se empalman los exones
realizado por el splisosoma)
REACCIONES CON NUCLEÓTIDOS
Los nucleótidos participan en fosforilaciones, adenilaciones, citidilaciones, uridilaciones, segundos
mensajeros
FUNCIONES DE LOS NUCLEOTIDOS
2dos mensajeros: AMPc y GMPc
Activación de sustrato (UDP-glucosa en la gluconeogénesis)
Síntesis de almidón- adenilación- ADP-glucosa
Síntesis de ácidos nucleicos
Estrategias regulatorias (fosforilación)
Coenzimas FAD,NAD,NADPH (oxidación) tansporte de e-
1. Glicolisis y Ck: fosforilación a nivel de sustrato
2. Ck: Nadh y FADH
3. CK: CoA-SH
4. Glucogénesis : uridilación
5. Glucogenolisis: fosforilación (glugogeno fosfatasa)
6. Fotosintesis: Fase oscura-formación del Almidón: adenilación
7. Sintesis de Fosfolipidos: citidilación
8. Sintesis de proteinas
9. Aspararragina adenilación para su gormación
10. Regulación de la glutamina sintasa : adenilación
11. Replicación y transcripción
12. Sintesis de purina y pirimidina
FUNCIÓN DE LA DESNATURALIZACIÓN DE LOS ÁCIDOS NUCLEICOS
Para realizar PCR (reacción de cadena de la polimerasa)
Separación de las cadenas por el aumento de temperatura (desnaturalización)
La desnaturalización en vitro se da por efecto de calor, alcalis o valores extremos de pH
PASOS DE LA PCR
1. DESNATURALIZACIÓN : Rompe puentes de hidrógeno a 96°C
Esta fase depende de la cantidad de timina-adenina o de citocina-guanosina que se tenga, ya
que a mayor nucleótidos de timina-adenina se necesitara de menor temperatura para
desnaturalizar ya que solo se unen por dos puentes de hidrogeno en comparación a la citosina-
guanina que se unen por tres. Lo óptimo es utilizar la temperatura de melting (Tm) que es un
punto medio respecto a los enlaces triples y dobles. Con muchas A-T Tm disminuye y con C-G
Tm aumenta.
2. HIBRIDACIÓN : Cebadores 45 segundo a 54°C
3. EXTENSIÓN/ELONGACIÓN : Taq polimerasa (enzima termoestable) su sustrato son los
nucleotidos, dos minutos a 72°C
SUSTRATOS: Cebadores+ nucleótidos +polimerasa
RIBOZIMA
Es una enzima de ARN que permiten que ocurra el mecanismo del splicesoma que retira
intrones.
Tienen cofactores como el imidazol y se regula alostéricamente.
Tienen una estrategia catalitica de ión metalico Mg.
CLASIFICACIÓN
RIBOZIMAS NATURALES
GRUPO I INTRÓN: Remueve intrones, involucra el ataque nucleofílico 3'OH de una guanosina
exógena, clivan
GRUPO II INTRÓN: Remueve intrones, involucra el ataque nucleofílico por una 2'OH de una
adenosina, crean loop
Rnasa: Cataliza la hidrólisis
Cabeza de martillo: