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PRIMER PERIODO

Estudia las características impresas en el ADN, mecanismos moleculares que regulan


su expresión y los resultados de los mismos.
Dogma central: Replicación (ADN) - transcripción (RNA) retrotranscripción -
Traducción (PROTEÍNA)

ADN polimeraza se equivoca 1 cada 1,200 veces

VIH es un retrovirus (antiretrovirales)

1. Elementos químicos

2. Moléculas

3. Biomoleculas (compuestos)

4. Célula: Comienzan a sensear (humedad, presión, evaluar el pH, generar alimentos,


migrar, dividirse). Primeros unicelulares fueron las levaduras.

5. Tejidos: multicelular

6. Órgano

7. Sistemas

Gregorio Mendel (1868-1880)= Ley Mendoliana.

1. Fredich Mischener: Por el lente de Lewen Hook vio una hebra blanca en una gasa
y dice “En el núcleo de la célula existe un compuesto que se llama nucleína”

2. Kossel: Utiliza la nucleína y la degrada con calor para hacer tinciones básicas
(Tenía un alto contenido de PO4) y ácidas (Tenía un alto contenido de NH3).
Encontró A, T, C y G. El dijo: “La nucleina es un ácido”.

3. Richard Altman (estudiante de Mischener): Acuñó el término de Ácido Nucleico.

4. Theodore Leavan (1920´s): Desarrolla la técnica “Cristaligrafia” hacer incidir rayos


laser sobre las superficies en diferentes ángulos. A una levadura le quita el ácido
nucléico y obtiene la figura tridimencional y aporta que la nucleina esta compuesta

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por fosfato, una base nitrogenada y una pentosa. Las proteínas son las
responsables de la herencia (eso se creía ya que el DNA está compactado por
ellas).

5. Griffith (1940): Cepa de neumococo. Cepa S encapsulada/virulenta y Cepa R no


encapsulada. La cápsula tiene en su membrana proteínas y carbohidratos Lectina,
Fucosa y Manosa que no están en nuestro microorganismo provocando que las
células presentadoras de antígenos secreten Citocinas (inflamatorias) y llegan las
células del sistema inmune rompiendo tus tejidos, causando la muerte.

a. Cepa S———ratón muerto

b. Cepa R———ratón vivo

c. Cepa S muerta (por calentarla) + Cepa R———ratón vivo. Al calentarlo


destruye Prote, Carbos y Lípidos para sólo dejar ADN

d. Cepa S muerta (por calentarla) + Cepa R + Cepa R——— ratón muerto

Demostró que el ADN formaba la cápsula de la bacteria. El ERROR del


experimento es que no era el mismo ratón, estaba mezclando especies. Principio
transformante. Se transfirió el código genético de la encapsulada a la no
encapsulada AGENTE TRANSFORMANTE

6. McArty:

a. Toma la cepa S y la centrifuga para quitar lípidos y carbos. El resultante lo


divide en tres:

i. Incluye proteinasa y RNAsa = Cepa R se encapsuló. ADN libre

ii. DNAsa y RNAsa = Cepa R quedó igual

iii. Incluye proteinasa y DNAsa= Cepa R no se encapsuló

En dónde se destruye el DNA queda igual la cepa y en donde no se encapsula.

7. Martha Chase (1945): Trabajó con la bacteria E.coli (bacteria por excelencia
utilizada en los experimentos). Hay tres tipos bacterioforos, plasmidos y cosmidos.
Los bacteriofagos están compuesto por dos biomoléculas (proteína y ADN) y su
funcionamiento es mata a las bacterias incorporando el material genético
(embarazo molecular).

a. Marcaron la proteína con azufre 35 (S35)

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b. Marcaron el DNA con fosforo 32 (P32)

Ponen en contacto a la Ecoli y al bacteriofago. Le inyecta su material genético


(P32) quedando la proteína (S35) por fuera. Pasan las 16 horas y ven que el
fosfato dentro de la E.coli incrementó. Pasó mas tiempo y descubrieron nuevos
bacteriofagos. se llega a la conclusión que el ADN TIENE LA INFORMACIÓN
GENÉTICA.

Procarionte Eucarionte

Núcleo no definido porque no hay membrana Núcleo

Organelos no definidos Organelos definidos

Más eficiente en la reproducción por ser


asexual por fisión y división. Como no hay Menos eficiente en la reproducción por ser
membranas hace todo más rápido. Sólo asexual/sexual y contener membrana
piensan en comer y reproducirse.

1-10 micrómetros. 10-100 micrómetros

Cantidad, hay mas Cantidad, hay menos

Se prefieren para hacer un experimento en


biología molecular. Se puso el gen de la
insulina en la maquinaria del procarionta.

Macrófago: célula compleja

1. Fagocita

2. Respuesta inmune: secreta citocinas que activan el sistema inmunológico,


regula la activación de otros macrófagos, NK, Linfocitos.

3. Remodelación de tejido: secreta colágeno tipo 1-3

4. Célula presentadora de antígenos: cuando los reconoce por receptores de


membrana hace una invaginación de su membrana, la cierra, le envía un
lisosoma, se funcionan las membranas y se llama fagolisosoma, descarga sus
enzimas (lisosima), lo degrada y presenta los antígenos en la membrana para
que lleguen otras células y se reconozcan para que cuando vuelva a entrar ya
estén listos para atacar.

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Fibroblasto: Célula sencilla. Se encarga de secretar los compuestos de la
matriz extracelular (heparán sulfato, laminina, fibronectina, perlecán, colágeno),
que son la malla donde descansan las células residentes.
GAP juntion: Cuando dos células se juntan, abren su pared y se intercambian
fluidos. Se cree que así los procariontes evloucionan.

Acidos nucleicos:
ADN: RNA:

A deshidratada RNAm: Mensajero lleva el código genético

RNAt: lleva animoácidos al ribosomas.


B watson y crick el fisiológio
(1)miRNA, (2)siRNA y (3) hn

Z da vurlta a la izquierda y tiene eun surco


RNAr: Ayuda a la construcción de ribosomas
mayor y menor

Bases nitrogenadas:

1. Purinas: Adenina y Guanina. Tienen dos anillos. Tienen 9 aminas. Su enlace más
importante es el 9 para el enlace N-Glicosidico.

2. Pirimidinas: Citocina, Uracilo y Timina. Tienen un sólo anillo. Tienen 6 aminas. Su


enlace mas importante es el 1 para el enlace N-Glicosidico (amina y pentosa)

Nucleótido: Base nitrogenada, Fosfato en la posición 5 y Pentosa.

Nucleósido: Base nitrogenada y Pentosa.

Cuando se tiene el 1er nucleotido de cada secuencia siempre es trifosfatado (ATP,


GTP, TTP, UTP, CTP), se rompen dos fosfatos para formar un fosfato inorgánico (o
pirofosfato) y hace que ADN polimerasa se ponga a trabajar (la activa).
La elongación (pegar otro nucleótido) del ADN va del 5´a 3´ para identificarnos en la
pentosa.

Enlace fosfodiester: CH2 (fórmula química del ester), CH2-PO4-CH2. Se de unen


dos nucleótidos.

Enlace N-Glicosódico: base nitrogenada y glucosa se libera agua

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REPETIR 5-6 VECES DE LAS PURINAS Y PIRIMIDINAS

Fase G0 o de quiescencia

OH SE ENLACE
FOSFATO SE ACTIVE

CICLO CELULAR
El ciclo celular se activa ante una respuesta a un estímulo o que ya esté impreso en su
ADN (que esté en su código genético).

Se divide en interfase (90%) y la mitosis (10%). Dura aproximadamente 30 horas

INTERFASE
1. Fase G0 QUIACENTE (gap): células que permanecen en reposo tras fase M hasta
que sean estimuladas y entren a G1 REPOSO

2. Fase G1: CRECER se da por la replicación de proteínas y de RNA. Llega a un


punto de control en dónde las revisa, participan complejos de proteínas que actúan
en cada una de las etapas y permiten, o no, el avance del ciclo. Estas proteínas se
denominan ciclinas y cinasas dependientes de ciclinas (Cdk). Cliclina D
dependiente de CDK4/6 (regula la fosforilacion o desforsforilacion de los dominios
de serinas o treoninas, las cinasas son las que se encargan de eso, fosforilan
proteínas en las serinas o treoninas).

3. Fase S: Síntesis del ADN. Replicación del material genético. Ya llevo el doble de
DNA y el doble de Proteínas. Esta fase es regulada por la Ciclina E dependiente de
CDK2 (regula la fosforilacion o desforsforilacion de los dominios de serinas o
troninas)

4. Fase G2: Condensación de la cromatina y la célula vuelve a crecer. Se siguen


incrementando proteínas y RNA (ARN ribosomal para la producción de ribosomas).
Regulada por la ciclina A/B dependiente de CDK1 y después entra a la Mitosis.

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Unas de las características del cáncer es estar fuera del ciclo
porque sino no avanzaría el ciclo.

📢 P53 y P21 SUPRESORES DE TUMORES reguladores que no son del


check point: proteínas supresoras de tumores, regulan a los
protooncogenes que sepueden convertir a oncogen. Cuando no se produde
por eso se da por TNF-alfa (apóptosis por infección o inflamación), se da una
cascada dada por fosforilaciones (externo, intercelular e intracelular ) las que
se fosforilan son las terosinas y serinas, despues de muchas cosas se
libreran las caspasas degradan DNA asegurando de que la célula no se
replique.

MITOSIS
Cromatina: combinación de ADN con proteína (histonas)

Heterocromatina: ADN/Proteína en exceso (histonas)

periferia del nucleo, fase s tardía

constitutiva

facultiva: bajo ciertas condiciones se puede transcribirse

Eucromatina: estado más laxo del ADN. Aquí se da la replicacion para que entre la
enzima (DNA polimeraza).

Dispersa por el núcleo, fase s temprana

1. Profase: condensación máxima de material genético.

2. Metafase: Se alinean los cromosomas en la placa ecuatorial, formación de huso


mitótico (o acromático), se unen en el cinetocoros (están detras del centrómero)

3. Anafase: Separación de las cromátidas hermanas

4. Telofase: Crecimiento de toda la membrana y en ese crecimiento hay una


deformación, es el inicio de la citosinesis.

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PLEGAMIENTO DE PROTEÍNAS
Primaria: Cadena lineal de aminoácidos

Secundaria: L-B plegada y Alfa hélice

Super secundaria: Unión de B plegada y Alfa hélice. Está la llave griega y


Meandro beta (barril)

Terciaria:

Se hacen dobleces por puentes di-sulfuro (por que lo tiene la histidina)

La proteína es una estructura globular tridimensional

Es la mas funcional porque está mas compactada y permite una mayor


interacción, pueden pasar por las barreras mas fácilmente

Para tener actividad biológica debe de estar plegada ya que tienen mayor
interacción con otras sustancias

Cuaternaria: Forma regiones o dominios, varias terciarias

PLEGAMIENTO DE ARN
La regla principal para formar un RNA es que es de una sola cadena, por lo tanto el
RNA sólo se considera que tiene una estructura primaria.

1. El mensajero es lineal

2. El de transferencia tiene forma de bucle pero nunca se cruza la cadena, cuando


se cruza sobre sí mismo se considera un error. SE CONSIDERA SECUNDARIA

3. El ribosomal, las proteínas son las que lo hacen tocarse

PLEGAMIENTO DE ADN
Todos tenemos el mismo genoma. Un genoma tiene 3mil millones de pares de base, lo
diferente es el acomodo.

Primaria: Una sola hebra o cadena de nucleótidos

Secundaria: La doble hebra

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Terciaria o compactación:

Nucleosoma: octámero de histona, es una proteína enorme que tienen carga


positiva porque tiene alto contenido de lisina y arginina por lo tanto el DNA y la
proteína se atraen. H2A, H2B, H3 y H4 de cada una se necesitan dos, le da 1.6
vueltas al octámero. Cuando el ADN da la vuelta sale a otro octámero
formando un collar de perlas. La H1 funciona a modo de sandwich, apachurra
el octámero y el DNA para que no se descompacte. La H5 está en las aves.
CORE DE HISTONA

Collar de perlas:

Solenoide: Estructura compuesta entre 6-8 nucleosomas y detrás de cada


nucleosoma va otro nucleosoma, crea un túnel.

Asa cromatínica: el solenoide se enreda tanto que forma una estructura de


roseta.

Cromosoma: 100,000 veces compactado, 700 nm aprox. El cromosoma tiene


muchos genes.

Un DNA (carga negativa) se pesa en pares de bases (T-A) o dos pares de bases (T-A ,
C-G) y en el genoma hay tres mil millones. Las proteínas se pesan un kilodaltones
Locus: ubicación

Locis: “locus en plural”


Modelo de la doble hélice: Modelo propuesto por Watson y Crick. Para establecer la
FORMA BETA del ADN, la más compatible con la vida.

1. Dicta que el DNA es una doble hebra

2. La doble hebra es complementaria

3. Antiparalela

4. dextrogiro (a la derecha) por los fosfato porque tiene cargas negativas y en la


parte mas externa (esqueleto y los puentes de hidrógeno son positivos, se
atraen y giran.

a. Surco mayor: se une a la histona para compactarlo

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b. Surco menor: para descompactarlo con proteínas tipo no histona, RNA de
tipo heteronuclear (no pasa de las 10 bases)

5. Helicoidal

6. 1 vuelta es igual a 10.6 pares de bases

7. Entre base y base hay 3.4 amstrons en la cadena

8. En su parte mas ancha es de 23.7 amstrons.

FORMA A: surge del modelo BETA pero deshidratada, cuando se lleva a cabo la
división celular, si tu vas a deformar el núcleo hay un intercambio de agua, puede hacer
que el citoplasma tome el agua del núcleo y se deshidrate así que solamente dura 30
min,

N DE
GIRO DE NM POR PLANO ENTRE
TIPO DE ADN NUCLEOTIDOS
HELICE VUELTA BASES
POR VUELTA
A DEXTRÓGIRO 2.8 11 INCLINADO

B DEXTRÓGIRO 3.4 10 PERMENDICULAR

Z LEVÓGIRO 4.5 12 ZIG-ZAG

FORMA Z (C o S): no sucede en vivo, la forma de deshidratación mas extrema. No se


puede estar en vida porque es una mutación cuando se junta con la timina. Se cree que
los Tardigrados tienen este ADN (osos de agua, micro orugas).

Interferon gamma: enfermedad, gripe ç

REPLICACIÓN
1. Semiconservadora: siempre se hereda la mitad de una cadena a las hijas

2. Bidirecional: en el adn circular se termina la replicación cuando se unen las


cadenas

3. Monofocal/multifocal: replicación monofocal (bacterias), ORICE (origen de la


replicación). Cuando es multifocal es en varios puntos (eucariontes) eso se debe a
la extención del DNA.

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4. Discontinua: porque el resultado de la replicación me genera una cadena lineal,
sin cortes pero la otra no, se forman partes (fragmentos de okasaki) ambas
cadenas se generan al mismo tiempo. La cadena lider es la que está completa y la
otra es la retrasada o discontinua que despues se rellena y se ligan nucleótidos por
las (ligasas, enlace fosfodiester)

Bases nitrogenadas son positivas porque están aminadas


cromosoma: cuerpo que genera color

el primer enlace debe de ser trifosfatado para que comience la and polimeraza

PLAYERS

1. Topoisomerasa: cortar enlaces fosfodiester cerca del ORICE, hace que la cadena
pierda la torsión NO FORMA PARTE DEL REPLISOMA (come y se va). GIRASAS
EN LAS PROCARIONTAS

Replisoma

1. Helicasa: rompe los puentes de hidrógeno conforme va avanzando comenzando


por timina y adenina

2. Proteínas eucariontas RPA/ procariontas SSB: aisla las cargas para que no se
junten las cadenas, de forma aleatorea pero juntas, de forma de capuchón para
que quede desnaturalizada. En el laboratorio se aplica calor al 50%

3. Primasa: iniciador, oligonucleótido, cebador, primer. Pone un primer primer que es


de RNA. Se necesita para cada fragmento de okazaki, se pone RNA porque tiene
un OH con carga negativa y me sirve para apoyar a que sobre el molde se
ensamble la dna polimeraza. La DNA pol es la que degrada. Debe de ser lo
suficientemente grande, entre 8 a 10 nucleítidos (incritro 16-24)

4. La DNA pol: PRIMERO LA SUBUNIDAD ALFA. 1 VEZ 1200 pares de bases se


equivoca una vez

alfa actividad de primasa. Exonucleasa


(sólo corrige en los extremos,
mayormente en la 3´ porqué hay

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mas posibilidad de equivocarse y se
pueden poner los nucleótidos).
Corrección errores y elongación
beta
(endonucleasa y exonucleasa)
Y GAMMA elongación mitocondrial

Delta elongación en ambas hebras

se dice que es la que tiene mayor


poder de elongación, tiene mayor
epsilon procesividad (es capaz de poner
mayor cantidad de nucleótidos por
unidad de tiempo MINUTOS)

5. Ligasas: Crea enlaces fosfodiester entre nucleotidos. Tanto en la cadena líder


como en los espacios que queden en los fragmentos de okazaki

1. INICIACION (ORICE): El orice ser rico en adenina y timina, que la primasa genere
moldes (complementario al orice de RNA con uracilo ALINEACIÓN ) para cuado
llegue DNA por lo quite.

2. ELONGACIÓN: Reconocer cual es la frecuencia para poner los nucleotidos que


necesita pero de ADN

3. TERMINACIÓN:

a. Invitro: se satura la reacción

b. célula:

i. cuando llega al extremo

ii. PCNA gen que regula la actividad de la enzima, delimita (etiquetadas),


junto con grupos metilo (se descarrila la DNA pol), la secuencia a replicar.

Burbujas de replicación: delimitada por las horquillas de replicación conjunto


(replisoma)
Replicon: fragmento de DNA o molde que se está replicando, delimitado por la burbuja
de replicación.

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Telómero: secuencia repetida en tandem (TTAGGG, en vertebrados y eucariontes).
Sirve por si se pierde una última parte por las enzimas endonucleasa y exonucleasa (3
´y 5´). Depende de que tan grande tengas el telómero para ver cuánto vas a vivir
Telomerasa: de tipo DNA que sólamente sintetiza las secuencias de tandem tomando
como molde a un RNA heteronuclear, creando una función de transcriptasa inversa, se
da en cada división celular. Sólo lo hace un 30%.
Gen policistrónico: codifica muchas proteínas. Un ejemplo es la GFAP (diferente
tamaño y diferentes funciones ISOFORMAS), vienen codificadas por un mismo gen. A
la hora de hacer la transcrioción la RNApol me genera mensajeros de diferentes
tamaños cada que arranca va dejando fragmentos porque no avanza bien, cuando
avanza bien deja una secuencia mas larga.

ALINEACION PRIMERS SE JUNTAN CON SU CADENA MOLDER

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